DMP(domain of unknown function 679 membrane protein)基因家族在调控植物生长发育中起着重要作用,特别是在生殖发育和衰老等方面。西瓜营养成分丰富、味道鲜美,是我国重要的经济作物之一,在蔬菜生产和消费中具有重要地位。采用生物...DMP(domain of unknown function 679 membrane protein)基因家族在调控植物生长发育中起着重要作用,特别是在生殖发育和衰老等方面。西瓜营养成分丰富、味道鲜美,是我国重要的经济作物之一,在蔬菜生产和消费中具有重要地位。采用生物信息学技术系统挖掘了西瓜DMP基因家族成员,并对其理化特征、系统进化、染色体定位、保守基序等进行了研究。同时,利用转录组数据明确了DMP家族成员在果实不同发育时期及干旱胁迫处理下的表达模式。利用西瓜基因组数据共鉴定到6个ClaDMPs基因,命名为ClaDMP1-ClaDMP6,分布在1、2、5、6共4条染色体上。系统进化分析将西瓜DMP蛋白分为4个亚族,第Ⅲ亚族中的ClaDMP6与拟南芥单倍体诱导基因亲缘关系最高,位于同一进化分支,推测其为西瓜单倍体诱导的候选基因。表达水平分析表明,部分ClaDMPs基因在果实中呈现高表达,干旱胁迫可以诱导或下调DMP基因的表达。本研究为揭示西瓜DMP基因生物学功能奠定了一定基础,并为西瓜单倍体育种提供了靶标基因。展开更多
邻苯二甲酸二甲酯(DMP)作为一种在环境中广泛存在的有毒化合物,已被中国列为优先控制污染物。采用无机盐培养基从长期覆盖农膜的黑土中分离鉴定了一株能够以DMP为碳源的菌株QD-9-10,根据菌落的形态特征及16S r DNA碱基序列同源性分析,鉴...邻苯二甲酸二甲酯(DMP)作为一种在环境中广泛存在的有毒化合物,已被中国列为优先控制污染物。采用无机盐培养基从长期覆盖农膜的黑土中分离鉴定了一株能够以DMP为碳源的菌株QD-9-10,根据菌落的形态特征及16S r DNA碱基序列同源性分析,鉴定QD-9-10为Bacillus sp.。正交实验结果表明,菌株QD-9-10的最优降解条件为p H 8.0,温度35.0℃,摇床转速124.0 r·min-1,DMP初始浓度100.4 mg·L-1,在32 h时内可将DMP完全降解。底物利用能力测试表明,菌种QD-9-10具有可降解多种邻苯二甲酸酯(PAE)的能力。由此可见,Bacillus sp.QD-9-10在修复PAEs污染环境方面有一定应用前景。展开更多
文摘DMP(domain of unknown function 679 membrane protein)基因家族在调控植物生长发育中起着重要作用,特别是在生殖发育和衰老等方面。西瓜营养成分丰富、味道鲜美,是我国重要的经济作物之一,在蔬菜生产和消费中具有重要地位。采用生物信息学技术系统挖掘了西瓜DMP基因家族成员,并对其理化特征、系统进化、染色体定位、保守基序等进行了研究。同时,利用转录组数据明确了DMP家族成员在果实不同发育时期及干旱胁迫处理下的表达模式。利用西瓜基因组数据共鉴定到6个ClaDMPs基因,命名为ClaDMP1-ClaDMP6,分布在1、2、5、6共4条染色体上。系统进化分析将西瓜DMP蛋白分为4个亚族,第Ⅲ亚族中的ClaDMP6与拟南芥单倍体诱导基因亲缘关系最高,位于同一进化分支,推测其为西瓜单倍体诱导的候选基因。表达水平分析表明,部分ClaDMPs基因在果实中呈现高表达,干旱胁迫可以诱导或下调DMP基因的表达。本研究为揭示西瓜DMP基因生物学功能奠定了一定基础,并为西瓜单倍体育种提供了靶标基因。
文摘邻苯二甲酸二甲酯(DMP)作为一种在环境中广泛存在的有毒化合物,已被中国列为优先控制污染物。采用无机盐培养基从长期覆盖农膜的黑土中分离鉴定了一株能够以DMP为碳源的菌株QD-9-10,根据菌落的形态特征及16S r DNA碱基序列同源性分析,鉴定QD-9-10为Bacillus sp.。正交实验结果表明,菌株QD-9-10的最优降解条件为p H 8.0,温度35.0℃,摇床转速124.0 r·min-1,DMP初始浓度100.4 mg·L-1,在32 h时内可将DMP完全降解。底物利用能力测试表明,菌种QD-9-10具有可降解多种邻苯二甲酸酯(PAE)的能力。由此可见,Bacillus sp.QD-9-10在修复PAEs污染环境方面有一定应用前景。
