期刊文献+
共找到4,242篇文章
< 1 2 213 >
每页显示 20 50 100
Overexpression of DNA methyltransferase 1 and its biological significance in primary hepatocellular carcinoma 被引量:11
1
作者 Hong Fan Zhu-Jiang Zhao +3 位作者 Jian Cheng Xian-Wei Su Qing-Xiang Wu Yun-Feng Shan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第16期2020-2026,共7页
AIM:To explore the relationship between DNA methyltransferase 1 (DNMT1) and hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC) and its biological significance in primary HCC.METHODS: We carried out an immu... AIM:To explore the relationship between DNA methyltransferase 1 (DNMT1) and hepatitis B virus (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC) and its biological significance in primary HCC.METHODS: We carried out an immunohistochemical examination of DNMT1 in both HCC and paired non-neoplastic liver tissues from Chinese subjects. DNMT1 mRNA was further examined in HCC cell lines by real-time PCR. We inhibited DNMT1 using siRNA and detected the effect of depletion of DNMT1 on cell proliferation ability and cell apoptosis in the HCC cell line SMMC-7721.RESULTS: DNMT1 protein expression was increased in HCCs compared to histologically normal non-neoplastic liver tissues and the incidence of DNMT1 immunoreactivity in HCCs correlated signifi cantly with poor tumor differentiation (P=0.014). There were more cases with DNMT1 overexpression in HCC with HBV (42.85%) than in HCC without HBV (28.57%). However, no signif icant difference in DNMT1 expression was found in HBV-positive and HBV-negative cases in the Chinese HCC group. There was a trend that DNMT1 RNA expression increased more in HCC cell lines than in pericarcinoma cell lines and normal liver cell lines. In addition, we inhibited DNMT1 using siRNA in the SMMC-7721 HCC cell line and found depletion of DNMT1 suppressed cells growth independent of expression of proliferating cell nuclear antigen (PCNA), even in HCC cell lines where DNMT1 was stably decreased.CONCLUSION: The f indings implied that DNMT1 plays a key role in HBV-related hepatocellular tumorigenesis. Depletion of DNMT1 mediates growth suppression in SMMC-7721 cells. 展开更多
关键词 dna甲基转移酶1 原发性肝癌 生物学意义 DNMT1 肝癌细胞株 免疫组织化学检查 乙型肝炎病毒 乙肝病毒阳性
下载PDF
Aberrant DNA methyltransferase 1 expression in clear cell renal cell carcinoma development and progression 被引量:3
2
作者 Ming Li Ying Wang +5 位作者 Yongsheng Song Renge Bu Bo Yin Xiang Fei Qizhen Guo Bin Wu 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2014年第4期371-381,共11页
Objective: To better understand the contribution of dysregulated DNA methyltransferase 1(DNMT1) expression to the progression and biology of clear cell renal cell carcinoma(ccRCC).Methods: We examined the differences ... Objective: To better understand the contribution of dysregulated DNA methyltransferase 1(DNMT1) expression to the progression and biology of clear cell renal cell carcinoma(ccRCC).Methods: We examined the differences in the expression of DNMT1 in 89 ccRCC and 22 normal tissue samples by immunohistochemistry. In addition, changes in cell viability, apoptosis, colony formation and invading ability of ccRCC cell lines(786-0 and Caki-1) were assessed after transfection with DNMT1 siRNA.Results: We found DNMT1 protein was significantly higher expressed in ccRCC than that of in no-tumor tissues(56.2% and 27.3%, respectively, P=0.018). The expression of DNMT1 was strongly associated with ccRCC tumor size, tumor pathology stage, histological grading, lymph node metastasis, vascular invasion, recurrence and prognosis. Moreover, knockdown of DNMT1 expression significantly inhibited ccRCC cell viability, induced apoptosis, decreased colony formation and invading ability.Conclusions: Expression of DNMT1 protein is increased in ccRCC tissues, and DNMT1 expression is associated with poor prognosis of patients. Experiments in vitro further showed DNMT1 played an essential role in proliferation and invasion of renal cancer cells. Moreover, targeting this enzyme could be a promising strategy for treating ccRCC, as evidenced by inhibited cell viability, increased apoptosis, decreased colony formation and invading ability. 展开更多
关键词 dna甲基转移酶 细胞活力 癌组织 入侵能力 肿瘤组织 异常 集落形成
下载PDF
cDNA Cloning of Goat DNA Methyltransferase 1,Screening of shRNA Vectors and Influences to Development of Nuclear Transfer Embryos 被引量:1
3
作者 LAN Jie,SONG Yong-li,HUA Song,LIU Yong-gang,LIU Jun,ZHANG Hai-lin and ZHANG Yong Key Laboratory of Animal Reproductive Physiology & Embryo Technology,Institution of Biotechnology,College of Veterinary Medicine,Northwest A&F University,Yangling 712100,P.R.China 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2010年第7期1035-1040,共6页
This study was designed to clone cDNA of goat DNA methyltransferase 1(DNMT1) gene,to screen an effective shRNAproducing vector targeting goat DNA methyltransferase 1 and to improve the developmental competence of goat... This study was designed to clone cDNA of goat DNA methyltransferase 1(DNMT1) gene,to screen an effective shRNAproducing vector targeting goat DNA methyltransferase 1 and to improve the developmental competence of goat nuclear transfer embryos by decreasing the DNMT1 expression in donor cells.In this study,PCR primers were designed against regions of high homology between bovine and sheep sequences and then used to amplify the larger portions of the coding regions.Next,3 RNAi oligonucleotides were designed based on the cloned sequences and inserted into pRNAT-U6.1/Neo vector,acquiring 3 new vectors,respectively termed pRNAD1,pRNAD2 and pRNAD3.Then the positive cells were sorted by flow cytometry after transfection and detected by real-time PCR analysis and sodium bisulfite genomic sequencing.Finally,the developmental rates of nuclear transfer(NT) embryos generated using donor cells with and without the effective shRNA vector respectively,as well as in vitro fertilization(IVF) embryos were observed and recorded.The results showed that the coding regions of goat DNA methyltransferase 1 gene was successfully cloned(GenBank no.FJ617538).Furthermore,an effective interfering shRNA(pRNAD2) was obtained,with its interference effect being 47.88%.Finally,NT embryos with shRNA vector harbored better developmental competence during morula and blastocyst stage compared to controls(P < 0.05),reaching the similar rates to IVF embryos(P > 0.05).In conclusion,goat DNA methyltransferase 1 gene cDNA was cloned and sequenced,an effective shRNA vector responsible for inhibiting DNA methyltransferase 1 expression was developed and the developmental competence of goat nuclear transfer morulae and blastcysts was significantly improved,which provided a feasible pathway for improving goat nuclear transfer embryo development competence by decreasing the methylation level in donor cells through RNAi-mediated manner. 展开更多
关键词 dna甲基转移酶 胚胎发育能力 cdna克隆 SHRNA 克隆山羊 核移植 载体 筛选
下载PDF
miR-214-5p通过DNMT1介导的AXIN2基因DNA甲基化修饰在皮肤基底细胞癌中的作用机制
4
作者 熊斯颖 邵蕾 +2 位作者 杨艳 高爱莉 揭丽云 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第1期27-32,共6页
目的探讨皮肤基底细胞癌中轴抑制蛋白2(Axis inhibition protein 2,AXIN2)基因启动子甲基化对基因转录的影响及miR-214-5p通过靶向DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase1,DNMT1)对AXIN2甲基化率的调控机制。方法收集2022年1月-2023年6... 目的探讨皮肤基底细胞癌中轴抑制蛋白2(Axis inhibition protein 2,AXIN2)基因启动子甲基化对基因转录的影响及miR-214-5p通过靶向DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase1,DNMT1)对AXIN2甲基化率的调控机制。方法收集2022年1月-2023年6月在广州市皮肤病防治所就诊治疗的102例皮肤基底细胞癌(Cutaneous basal cell carcinoma,BCC)患者作为研究对象,提取癌组织和癌旁正常组织标本及基线资料。焦磷酸测序法检测AXIN2基因启动子区甲基化率。实时荧光定量PCR检测AXIN2、DNMT1基因mRNA和miR-214-5p的表达水平。将miR-214-5p模拟物(mimic)、抑制物(inhibitor)及其阴性对照(mimic NC和inhibitor NC)分别对基底细胞癌A431细胞进行转染,48 h后检测DNMT1基因mRNA表达水平和AXIN2基因甲基化率。结果BCC癌组织的AXIN2基因甲基化率显著高于癌旁正常组织(t=5.128,P<0.001),AXIN2基因mRNA相对表达水平显著低于癌旁正常组织(t=7.826,P<0.001),DNMT1基因mRNA表达水平显著高于癌旁正常组织(t=4.838,P<0.001),miR-214-5p表达水平显著低于癌旁正常组织(t=5.426,P<0.001)。BCC癌组织的AXIN2基因甲基化率与其mRNA表达水平呈负相关(r=-0.793,P<0.001),DNMT1基因mRNA水平与AXIN2基因甲基化率呈正相关(r=0.814,P<0.001),miR-214-5p表达水平与DNMT1基因mRNA水平呈负相关(r=-0.747,P<0.001)。双荧光素酶报告基因实验结果证实,DNMT1是miR-214-5p的靶基因。细胞转染后,与mimic NC、inhibitor和inhibitor NC比较,mimic的DNMT1基因mRNA水平、AXIN2基因甲基化率显著降低(P<0.001);而inhibitor的DNMT1基因mRNA水平和AXIN2基因甲基化率相较于其他三组明显上升(P<0.001)。结论miR-214-5p可通过调控下游靶蛋白DNMT1表达,影响AXIN2基因的DNA甲基化率,调控AXIN2基因的表达水平,参与皮肤基底细胞癌的发生机制。 展开更多
关键词 基底细胞癌 miR-214-5p dna甲基化转移酶1 轴抑制蛋白2 启动子区甲基化
下载PDF
结直肠癌p53和DNA损伤调节基因1的表达及临床意义
5
作者 张丽静 贾彦彦 +3 位作者 胡波 李晓慧 张倩倩 周长江 《实用肿瘤杂志》 CAS 2024年第2期149-154,共6页
目的 分析p53和DNA损伤调节基因1(p53 and DNA damage regulated gene 1,PDRG1)在结直肠癌中的表达及其临床意义。方法 检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中结直肠癌数据集,比较PDRG1 mRNA在结直肠癌组织和正常... 目的 分析p53和DNA损伤调节基因1(p53 and DNA damage regulated gene 1,PDRG1)在结直肠癌中的表达及其临床意义。方法 检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中结直肠癌数据集,比较PDRG1 mRNA在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达差异,分析其表达与临床病理特征及预后的关系。DNA甲基化交互可视化数据库(DNA methylation interactive visualization database,DNMIVD)分析PDRG1基因甲基化与m RNA表达水平的关系。另选取本院2019年2月至2020年5月存档的102例结直肠癌组织及其癌旁正常结直肠组织石蜡标本进行验证,采用免疫组织化学法检测PDRG1蛋白的表达。结果 TCGA数据库分析发现,PDRG1 mRNA在结直肠癌组织(n=284)中的表达较正常结直肠组织(n=41)增高(P<0.01),且结直肠癌PDRG1 mRNA表达与拷贝数变异呈正相关(n=273;r=0.792,P<0.01)。DNMIVD分析显示,PDRG1启动子甲基化β值与基因表达水平呈负相关(r=-0.34,P<0.01)。TCGA数据库分析显示,结直肠癌患者(n=273)PDRG1 mRNA表达在肿瘤位置、TNM分期及远处转移方面比较,差异均具有统计学意义(均P<0.05);对245例结直肠癌患者进行Kaplan-Meier生存分析发现,PDRG1 mRNA高表达患者(以中位数为分界值,大于中位数为高表达)无瘤生存期较短(P=0.019)。免疫组织化学检测显示,结直肠癌组织中PDRG1蛋白表达阳性率高于正常结直肠癌组织[87.3%(89/102) vs32.4%(33/102),P<0.01]。结论 PDRG1在结直肠癌中高表达,且与肿瘤位置、远处转移和无瘤生存期有关,可能成为结直肠癌潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 p53和dna损伤调节基因1 癌症基因组图谱 甲基化 预后 标志物
下载PDF
Uhrf1基因重组腺病毒载体构建及其在小鼠心肌细胞DNA损伤修复中的作用研究
6
作者 江南 王驰寅 +1 位作者 聂宇 王珏 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期238-243,共6页
目的:构建携带小鼠泛素样同源域和环指结构域1(Uhrf1)基因的重组腺病毒载体,验证Uhrf1基因在原代乳鼠心肌细胞中的表达情况,并探究其在过氧化氢(H_(2)O2)诱导的心肌细胞DNA损伤中的作用。方法:利用PCR扩增小鼠Uhrf1基因的编码序列,将其... 目的:构建携带小鼠泛素样同源域和环指结构域1(Uhrf1)基因的重组腺病毒载体,验证Uhrf1基因在原代乳鼠心肌细胞中的表达情况,并探究其在过氧化氢(H_(2)O2)诱导的心肌细胞DNA损伤中的作用。方法:利用PCR扩增小鼠Uhrf1基因的编码序列,将其酶切后插入pADM-CMV-C-FH载体,获得重组腺病毒质粒ADM-Uhrf1。将该质粒转染至HEK293T细胞包装成重组腺病毒颗粒,数代扩增后进行腺病毒的纯化及滴度检测。分离25只1日龄ICR小鼠原代心肌细胞,分为两组,以感染复数(MOI)为50的比例分别感染ADM-Uhrf1及ADM-control(ADMCtrl),通过Western blot及免疫荧光染色验证重组腺病毒介导的UHRF1蛋白的表达,并利用H_(2)O2诱导心肌细胞DNA损伤,进而探究Uhrf1在DNA损伤修复过程中的作用。结果:通过壳蛋白免疫法检测得到的ADM-Uhrf1病毒滴度为1.8×10^(13) pfu/L。Western blot验证显示UHRF1蛋白表达水平显著升高(P<0.05),免疫荧光染色显示UHRF1主要表达在细胞核内,且Uhrf1的过表达能够显著抑制DNA损伤标志物磷酸化组蛋白H_(2)A变异体(γH_(2)AX)蛋白的表达(P<0.01)。结论:成功构建了携带小鼠Uhrf1基因的重组过表达腺病毒载体,并通过腺病毒递送系统在心肌细胞中实现了Uhrf1的过表达,且Uhrf1的过表达有效减轻了H_(2)O2诱导的心肌细胞DNA损伤。 展开更多
关键词 Uhrf1基因 腺病毒载体 质粒 心肌细胞 dna损伤
下载PDF
DNA高甲基化介导FOXO1转录表达下调促进鼻咽癌细胞增殖和侵袭能力
7
作者 于鹏 金金欣 +3 位作者 冀火金 黄兰川 刘进 蔡永林 《广西医科大学学报》 CAS 2024年第3期364-372,共9页
目的:探索叉头盒O1(FOXO1)在鼻咽癌(NPC)中异常表达的分子机制,及其对NPC细胞恶性生物学行为的影响。方法:采用GEO数据集分析NPC中FOXO1表达水平,采用R4.2.1软件进行基因集富集分析。构建FOXO1过表达的NPC细胞系5-8F、HONE1(FOXO1-5-8F... 目的:探索叉头盒O1(FOXO1)在鼻咽癌(NPC)中异常表达的分子机制,及其对NPC细胞恶性生物学行为的影响。方法:采用GEO数据集分析NPC中FOXO1表达水平,采用R4.2.1软件进行基因集富集分析。构建FOXO1过表达的NPC细胞系5-8F、HONE1(FOXO1-5-8F、Ctrl-5-8F、FOXO1-HONE1、Ctrl-HONE1)。分别通过CCK-8法、划痕实验、Transwell侵袭实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力,流式细胞术分析细胞周期。通过重亚硫酸氢盐基因测序技术进行DNA甲基化测序。结果:FOXO1 mRNA在NPC细胞和组织中表达下调。FOXO1过表达组的细胞增殖能力和细胞迁移能力明显低于对照组(P<0.05),相同时间内,空白对照组的细胞侵袭数量高于FOXO1过表达组(P<0.05),FOXO1过表达抑制细胞周期(P<0.05)。在NPC组织中,FOXO1 DNA启动子区域存在甲基化位点,其甲基化水平明显高于非癌组织(P<0.05)。结论:NPC中FOXO1基因DNA高甲基化导致其转录下调,由此促进肿瘤细胞的增殖和侵袭。FOXO1可能是NPC的肿瘤抑制基因。 展开更多
关键词 鼻咽癌 叉头盒O1 dna甲基化 增殖 侵袭
下载PDF
DNA甲基化修饰对金钱鱼卵巢Cyp17a1表达水平的影响
8
作者 周一帆 江政霆 +5 位作者 李雨 焦开智 潘书慧 许芮 李广丽 江东能 《广东海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期46-53,共8页
【目的】分析DNA甲基化修饰对金钱鱼(Scatophagus argus)卵巢Cyp17a1表达的影响,进一步认识卵巢发育成熟相关基因表达的调控机制。【方法】分别取卵巢发育III、IV期的金钱鱼,以及投喂添加0(对照)、50、100μg/g雌二醇饲料30 d的2龄雌鱼,... 【目的】分析DNA甲基化修饰对金钱鱼(Scatophagus argus)卵巢Cyp17a1表达的影响,进一步认识卵巢发育成熟相关基因表达的调控机制。【方法】分别取卵巢发育III、IV期的金钱鱼,以及投喂添加0(对照)、50、100μg/g雌二醇饲料30 d的2龄雌鱼,用MethPrimer软件分析其Cyp17a1基因CpG二核苷酸位点分布特征,并预测CpG岛;采用亚硫酸氢盐测序法检测不同发育时期卵巢以及投喂雌二醇个体卵巢中的Cyp17a1的DNA甲基化修饰水平,并用实时荧光定量PCR分析Cyp17a1基因表达水平。【结果】金钱鱼Cyp17a1翻译起始位点2000 bp后无CpG岛,取第1外显子含有5个CpG位点(翻译起始位点后106、116、129、148和203 bp处)的区域用于DNA甲基化水平检测。金钱鱼III期卵巢Cyp17a1外显子1的DNA甲基化修饰水平显著高于IV期卵巢(P<0.05),与其mRNA表达水平呈负相关。116、129和203 bp处DNA甲基化存在发育时期差异,但106和148 bp处差异不显著(P>0.05)。投喂雌二醇后,金钱鱼卵巢Cyp17a1 mRNA表达水平和第1外显子CpG富集区域整体DNA甲基化修饰水平无显著变化(P>0.05),但雌激素处理雌鱼翻译起始位点后148、203 bp处甲基化水平明显上升(P<0.05)。【结论】金钱鱼卵巢Cyp17a1第一个外显子CpG富集区的整体甲基化水平与基因表达呈负相关,饲料E2可上调Cyp17a1第一个外显子148、205 bp处甲基化水平,表明甲基化修饰参与金钱鱼Cyp17a1的表达调控。 展开更多
关键词 金钱鱼 Cyp17a1 基因表达 亚硫酸氢盐测序法 dna甲基化
下载PDF
血清高迁移率族蛋白B1、糖类抗原125、人乳头瘤病毒DNA与早期宫颈癌及术后复发的关系及联合预测效果
9
作者 贾萍 蹇国 +1 位作者 罗清松 何梦婷 《中国临床医生杂志》 2024年第5期599-602,共4页
目的探讨血清高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、糖类抗原125(CA125)、人乳头瘤病毒-脱氧核糖核酸(human papillomavirus-deoxyribonucleic acid,HPV-DNA)与早期宫颈癌及术后复发的关系及联合预测效果。方法选取2018年1月至2020年1月四川省广元... 目的探讨血清高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、糖类抗原125(CA125)、人乳头瘤病毒-脱氧核糖核酸(human papillomavirus-deoxyribonucleic acid,HPV-DNA)与早期宫颈癌及术后复发的关系及联合预测效果。方法选取2018年1月至2020年1月四川省广元市中心医院收治的111例宫颈癌患者为宫颈癌组、50例宫颈上皮内瘤变Ⅲ期患者为宫颈上皮内病变组。对比两组治疗前血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA阳性率,分析宫颈癌患者血清HMGB1、CA125水平、HPV-DNA表达与临床病理特征及术后复发的关系。结果宫颈癌组血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA阳性率高于宫颈上皮内病变组(P<0.05)。宫颈癌组中不同肿瘤直径、临床分期、分化程度、浸润深度、是否存在淋巴结转移患者血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA阳性率差异有显著性(P<0.05)。111例宫颈癌患者术后3年内肿瘤复发患者26例,复发率为23.42%。复发组血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA阳性率显著高于未复发组(P<0.05)。HMGB1、CA125与HPV-DNA串联检测预测宫颈癌复发的ROC曲线下面积为0.950(95%CI为0.911~0.989),联合预测敏感度为88.5%,特异度为89.4%。结论宫颈癌患者血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA阳性率异常升高,其与临床病理特征有关,测定血清HMGB1、CA125水平及HPV-DNA分型对预测宫颈癌术后复发具有一定参考价值。 展开更多
关键词 宫颈癌 高迁移率族蛋白B1 糖类抗原125 人乳头瘤病毒dna 复发 病理特征
下载PDF
1,25(OH)2D3通过稳定线粒体DNA对GCDC诱导的HiBECs凋亡的作用研究
10
作者 李永新 王战 +2 位作者 高炜泽 鲁文龙 刘明军 《临床医学进展》 2024年第4期2256-2266,共11页
目的:探讨骨化三醇(1,25(OH)2D3)对甘氨鹅脱氧胆酸盐(GCDC)诱导的人肝内胆管上皮细胞(HiBECs)凋亡的影响,并初步阐明其潜在的作用机制。方法:采用1 nM GCDC处理HiBECs建立原发性胆汁性胆管炎细胞模型,并采用不同浓度(0.1 nM、1 nM、10 n... 目的:探讨骨化三醇(1,25(OH)2D3)对甘氨鹅脱氧胆酸盐(GCDC)诱导的人肝内胆管上皮细胞(HiBECs)凋亡的影响,并初步阐明其潜在的作用机制。方法:采用1 nM GCDC处理HiBECs建立原发性胆汁性胆管炎细胞模型,并采用不同浓度(0.1 nM、1 nM、10 nM、100 nM) 1,25(OH)2D3处理12 h。流式细胞术检测细胞凋亡水平,ELISA检测细胞培养液中炎症因子IL-6和IL-8水平,qPCR检测PDC-E2、PGC-1α、NrF-1和NrF-2的mRNA相对表达水平,Western blot检测细胞内Bcl-2、PDC-E2表达水平。结果:1 mM GCDC可以降低HiBECs细胞增殖活性,诱导HiBECs凋亡,提高细胞培养液中IL-6和IL-8水平,上调PDC-E2蛋白表达,下调Bcl-2蛋白表达,抑制COX-1、PGC-1α、NrF-1和NrF-2 mRNA相对表达水平。可以提高GCDC诱导的HiBECs细胞增殖活性,抑制GCDC诱导HiBECs细胞凋亡,降低细胞培养液中IL-6和IL-8水平,下调PDC-E2蛋白表达水平,提高COX-1、PGC-1α、NrF-1和NrF-2 mRNA相对表达水平。结论:1,25(OH)2D3可抑制诱导HiBECs细胞凋亡,其作用机制可能与线粒体DNA稳定有关。 展开更多
关键词 原发性胆汁性胆管炎 1 25(OH)2D3 线粒体dna 细胞凋亡
下载PDF
基于DNA链置换反应网络求解0-1背包问题
11
作者 杨静 郑雅雯 +1 位作者 张彤彤 蒋天怿 《安徽理工大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期78-88,共11页
目的基于DNA链置换的化学反应网络可以作为一种有效的编程语言来解决各种数学问题,而0-1背包问题是一个经典的NP问题。为了求解0-1背包问题。方法提出利用DNA链置换反应网络,并利用Visual DSD设计仿真实验。结果通过加权、求和和阈值3... 目的基于DNA链置换的化学反应网络可以作为一种有效的编程语言来解决各种数学问题,而0-1背包问题是一个经典的NP问题。为了求解0-1背包问题。方法提出利用DNA链置换反应网络,并利用Visual DSD设计仿真实验。结果通过加权、求和和阈值3个反应模块进行求解,最后由输出的单链DNA来表达结果。由于浓度的检测存在一定误差,使用带有荧光分子的单链DNA输出表达操作结果。最后,使用DSD仿真软件得到变量转换模块相对应的链置换反应网络图、变量仿真图以及阈值比较图。模型表明,该算法能够有效降低0-1背包问题的复杂度,并且具有较高的求解精度和稳定性。结论所提出的模型进一步丰富了DNA计算,并拓宽了DNA链位移的计算宽度。 展开更多
关键词 dna链置换 0-1背包问题 NP问题 dna计算
下载PDF
HPV-DNA分型联合血清NLR、DCLK1对宫颈癌的早期诊断价值
12
作者 倪红妙 曾慧 丁利胜 《中国现代医生》 2024年第8期12-16,共5页
目的探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)-DNA分型联合血清中性粒细胞-淋巴细胞比值(lymphocyte ratio,NLR)、双皮质素样激酶1(bicorticoid kinase,DCLK1)水平对宫颈癌的早期诊断价值。方法随机纳入2018年8月至2022年6月在笔... 目的探讨人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)-DNA分型联合血清中性粒细胞-淋巴细胞比值(lymphocyte ratio,NLR)、双皮质素样激酶1(bicorticoid kinase,DCLK1)水平对宫颈癌的早期诊断价值。方法随机纳入2018年8月至2022年6月在笔者医院妇科确诊的120例早期宫颈癌患者为宫颈癌组,120例良性病变患者为良性组。采用ELISA法检测DCLK1水平;采用自动血细胞分析仪检测NLR;采用HPV分型基因芯片检测系统检测宫颈分泌物的HPV亚型;采用受试者操作特征(receiver operator curve,ROC)曲线来分析血清NLR、DCLK1水平诊断宫颈癌的截断值;采用四表格分析HPV-DNA分型、血清NLR、DCLK1水平单独及联合对宫颈癌的诊断价值。结果与良性组相比,宫颈癌组血清NLR、DCLK1水平显著升高(P<0.05)。宫颈癌组的各类型HR-HPV阳性率均显著高于良性组(P<0.05)。以血清NLR、DCLK1水平为检验变量绘制ROC曲线,血清NLR、DCLK1预测早期宫颈癌的曲线下面积(areaundercurve,AUC)分别为0.724、0.718,截断值分别为3.08、3.32。HPV-DNA分型联合血清NLR、DCLK1检出假阳性18例,假阴性17例,Kappa值为0.725,与病理结果一致性较高。HPV-DNA分型联合血清NLR、DCLK1水平诊断早期宫颈癌的敏感度、阴性预测值及准确度均明显高于HPV-DNA分型、血清NLR、DCLK1水平单独诊断(P<0.05)。结论HPV-DNA分型联合NLR、DCLK1对早期宫颈癌的诊断结果与病理结果具有较高的一致性,且敏感度、准确度明显提高。 展开更多
关键词 宫颈癌 中性粒细胞/淋巴细胞 双皮质素样激酶1 HPV-dna分型 诊断
下载PDF
聚ADP-核糖聚合酶-1在喉鳞状细胞癌细胞DNA氧化损伤及凋亡中的作用
13
作者 宿伟鹏 赵化荣 +2 位作者 刘攀 张洋 王松 《局解手术学杂志》 2023年第8期666-672,共7页
目的探究聚ADP-核糖聚合酶-1(PARP1)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达及其对LSCC细胞DNA氧化损伤与凋亡的影响。方法收集40例患者的LSCC组织及癌旁组织样本,采用免疫组化染色和qRT-PCR检测LSCC组织与癌旁组织中PARP1的表达。采用不同浓度Me... 目的探究聚ADP-核糖聚合酶-1(PARP1)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达及其对LSCC细胞DNA氧化损伤与凋亡的影响。方法收集40例患者的LSCC组织及癌旁组织样本,采用免疫组化染色和qRT-PCR检测LSCC组织与癌旁组织中PARP1的表达。采用不同浓度Menadione诱导LSCC细胞系Hep-2,MTT法检测不同浓度诱导下细胞增殖抑制率。将Hep-2细胞随机分为对照组(正常培养)、Men组(20μmol/L Menadione处理)、Men+PARP1抑制剂组(20μmol/L Menadione+10μmol/L PARP1抑制剂Olaparib共处理)。MTT法计算各组细胞增殖抑制率;流式细胞术检测各组细胞内活性氧(ROS)水平;细胞免疫荧光染色观察各组细胞DNA损伤标记分子γ-H2AX焦点生成情况;Western blot测定各组细胞γ-H2AX、DNA-PKcs、BRCA1、LIG4、Caspase-3及Caspase-9蛋白表达;Hoechst33258染色观察各组细胞凋亡情况。结果LSCC组织中PARP1阳性表达率及PARP1 mRNA表达均明显高于癌旁组织(P<0.01)。Hep-2细胞经不同浓度Menadione诱导后,细胞增殖抑制率均升高(P<0.05)。与对照组比较,Men组和Men+PARP1抑制剂组的细胞增殖抑制率升高,细胞ROS水平升高,γ-H2AX焦点形成明显增加,γ-H2AX蛋白表达上调,DNA-PKcs、BRCA1、LIG4蛋白表达均下调,细胞出现浓缩、碎裂的蓝色凋亡体,Caspase-3和Caspase-9蛋白表达上调,差异均有统计学意义(P<0.05),且Men+PARP1抑制剂组以上变化较Men组更明显(P<0.05)。结论PARP1在LSCC组织中高表达,抑制其表达能够进一步加重Menadione诱导的Hep-2细胞DNA氧化损伤,并促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 聚ADP-核糖聚合酶-1 dna氧化损伤 凋亡
下载PDF
结直肠癌组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白的表达变化及其意义
14
作者 周婵 冼丽英 +3 位作者 李娜 卢碧燕 袁锦玉 徐咏强 《山东医药》 CAS 2024年第9期82-85,共4页
目的观察结直肠癌(CRC)组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DNA损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7(DCAF7)蛋白的表达变化,并探讨其临床意义。方法CRC患者98例,均接受手术治疗,术中留取CRC组织和癌旁组织,采用Real-time PCR法检测CRC组织和癌旁... 目的观察结直肠癌(CRC)组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DNA损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7(DCAF7)蛋白的表达变化,并探讨其临床意义。方法CRC患者98例,均接受手术治疗,术中留取CRC组织和癌旁组织,采用Real-time PCR法检测CRC组织和癌旁组织中miR-138-5p、miR-876-5p,采用蛋白印迹法检测CRC组织和癌旁组织中DCAF7蛋白,分析miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者临床病理参数的关系。以CRC组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量的中位数为临界值,将CRC患者分为miR-138-5p高表达组和miR-138-5p低表达组、miR-876-5p高表达组和miR-876-5p低表达组、DCAF7蛋白高表达组和DCAF7蛋白低表达组,并分析miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者预后的关系。结果CRC组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量分别为1.36±0.29、1.41±0.36、0.59±0.19,癌旁组织中miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量分别为2.15±0.48、2.08±0.44、0.20±0.08,两者相比,P均<0.05。miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者是否合并淋巴结转移、TNM分期、浸润深度有关(P均<0.05)。miR-138-5p低表达组3年总体生存率为67.3%,miR-138-5p高表达组3年总体生存率为86.6%,两组相比,P<0.05。miR-876-5p低表达组3年总体生存率为66.7%,miR-876-5p高表达组3年总体生存率为85.1%,两组相比,P<0.05。DCAF7蛋白高表达组3年总体生存率为67.2%,DCAF7蛋白低表达组3年总体生存率为87.5%,两组相比,P<0.05。结论CRC组织中miR-138-5p低表达、miR-876-5p低表达、DCAF7蛋白高表达,miR-138-5p、miR-876-5p、DCAF7蛋白相对表达量与CRC患者是否合并淋巴结转移、TNM分期、浸润深度有关。与miR-138-5p高表达、miR-876-5p高表达、DCAF7蛋白低表达的CRC患者相比,miR-138-5p低表达、miR-876-5p低表达、DCAF7蛋白高表达的CRC患者术后3年总体生存率低。 展开更多
关键词 微小RNA-138-5p 微小RNA-876-5p dna损伤结合蛋白1和CUL4相关因子7 结直肠癌
下载PDF
DVC1在氮芥致人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用
15
作者 程晋 余文珮 +4 位作者 叶枫 董训虎 赵远鹏 但国蓉 邹仲敏 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第21期2214-2221,共8页
目的探讨蛋白水解酶DVC1在氮芥诱导人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用。方法利用siRNA干预DVC1表达,50μmol/L氮芥染毒细胞后,采用Western blot检测DNA损伤修复蛋白的表达;荧光酶标仪测定1~24 h DNA-蛋白交联总量;Slot blo... 目的探讨蛋白水解酶DVC1在氮芥诱导人支气管上皮细胞DNA-蛋白交联损伤修复中的作用。方法利用siRNA干预DVC1表达,50μmol/L氮芥染毒细胞后,采用Western blot检测DNA损伤修复蛋白的表达;荧光酶标仪测定1~24 h DNA-蛋白交联总量;Slot blot检测DNA与O 6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)的共价交联;免疫沉淀检测MGMT泛素化水平。构建GST-DVC1融合蛋白,GST下拉实验检测DVC1与MGMT、泛素的结合。结果si-DVC1干预后,DNA-蛋白交联总量升高。氮芥降低交联蛋白MGMT原型的水平,但增强其泛素化水平;DVC1可结合泛素,si-DVC1可进一步增强MGMT的泛素化及DNA-MGMT的交联量,与泛素结合酶抑制剂NSC697923和蛋白酶体抑制剂MG132引起的交联结果类似。si-DVC1引起DNA损伤修复蛋白Rad51表达降低、Ku70表达升高。结论DNA-蛋白交联的清除依赖于交联蛋白的泛素化;DVC1通过与泛素相互作用,促进氮芥诱导的DNA-蛋白交联的清除,并维持DNA以同源重组方式修复损伤的能力。 展开更多
关键词 氮芥 DVC1 dna蛋白交联 O 6-甲基鸟嘌呤-dna甲基转移酶 人支气管上皮细胞
原文传递
一贯煎通过调节Parp-1的翻译后修饰保护肝细胞DNA
16
作者 张宇佳 叶杰 +3 位作者 卢艳琳 闫晓风 李华 王晓玲 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期373-379,共7页
目的观察一贯煎(Yiguanjian decoction,YGJ)影响Parp-1修复H_(2)O_(2)诱导肝细胞DNA损伤的机制。方法培养小鼠胚胎肝细胞BNL CL.2,建立H_(2)O_(2)细胞损伤模型并用YGJ预处理,CCK-8检测细胞活力,Annexin V/PI流式细胞术检测细胞死亡,EDU... 目的观察一贯煎(Yiguanjian decoction,YGJ)影响Parp-1修复H_(2)O_(2)诱导肝细胞DNA损伤的机制。方法培养小鼠胚胎肝细胞BNL CL.2,建立H_(2)O_(2)细胞损伤模型并用YGJ预处理,CCK-8检测细胞活力,Annexin V/PI流式细胞术检测细胞死亡,EDU掺入检测细胞增殖,8-羟基脱氧鸟苷比色法和γ-H_(2)AX细胞荧光染色检测DNA损伤。免疫印迹法检测Parp-1、Parp-1的Par化和乙酰化。结果H_(2)O_(2)作用后,肝细胞凋亡率增加;细胞增殖被明显抑制;DNA损伤持续存在于整个实验过程。Parp-1在6 h升高后维持高表达,Parp-1的Par化和乙酰化均先升高随后降低。Sirt-1的抑制剂EX527可明显提高Parp-1的Par化,而其激动剂SRT1720可明显降低Parp-1的Par化。YGJ作用后细胞凋亡率和DNA损伤明显减少,增殖细胞数明显增加,Parp-1高表达时间点提前,Parp-1的Par化明显提高,乙酰化时间点推迟,且持续时间更长。结论YGJ可降低H_(2)O_(2)诱导的肝细胞DNA损伤,其作用机制与Sirt-1对Parp-1去乙酰化维持其含量、负调控Parp-1的Par化维持一定的活性有关。 展开更多
关键词 肝细胞 PARP-1 Sirt-1 翻译后修饰 dna损伤 H_(2)O_(2)
下载PDF
基于X型结构的DNA荧光传感器检测黄曲霉毒素B_(1)
17
作者 乔梦想 白天 +1 位作者 吕泽平 卫敏 《河南工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第5期100-108,共9页
设计一种X型结构的DNA荧光传感器体系用于高灵敏检测黄曲霉毒素B_(1)(AFB_(1))。在该体系中,用DNA1和DNA2构成了X型骨架并固定在磁珠上,以荧光基团标记的适配体链作为荧光探针(FAM-Apt),根据上清液中荧光信号强度的变化实现对AFB_(1)的... 设计一种X型结构的DNA荧光传感器体系用于高灵敏检测黄曲霉毒素B_(1)(AFB_(1))。在该体系中,用DNA1和DNA2构成了X型骨架并固定在磁珠上,以荧光基团标记的适配体链作为荧光探针(FAM-Apt),根据上清液中荧光信号强度的变化实现对AFB_(1)的快速检测。结果表明:当AFB_(1)不存在时,FAM-Apt可以与X型骨架的4条末端通过碱基互补配对形成双链,经过磁分离后吸取上清液进行检测得到较弱的背景信号;当AFB_(1)存在时,FAM-Apt优先与AFB_(1)结合,游离在上清液中,经过磁分离后得到较强的荧光信号;在最佳试验条件磁珠体积1.5μL、AFB_(1)孵育时间40 min、X型结构中FAM-Apt与X骨架浓度比为4∶1时,传感器的相对荧光强度与lg(ρ_(AFB_(1)))在0.05~100 ng/mL范围内存在良好的线性关系(R^(2)=0.99),检测限低至9 pg/mL。应用所设计的传感器对实际样品进行加标回收测试取得了较为满意的结果。 展开更多
关键词 黄曲霉毒素B_(1) dna纳米结构 适配体 荧光传感器
下载PDF
血清抗Jo-1抗体、抗dsDNA抗体与复发性流产的相关性 被引量:1
18
作者 何末琴 邵瑾 《中国计划生育学杂志》 2023年第1期159-162,共4页
目的:检测复发性流产患者血清抗双链DNA抗体(dsDNA)、抗Jo-1抗体的表达并探究其与复发性流产关系。方法:选取2019年1月-2020年2月本院收治的复发性流产患者100例为复发性流产组,无不良孕产史且已正常生育的女性100例作为对照组。采用酶... 目的:检测复发性流产患者血清抗双链DNA抗体(dsDNA)、抗Jo-1抗体的表达并探究其与复发性流产关系。方法:选取2019年1月-2020年2月本院收治的复发性流产患者100例为复发性流产组,无不良孕产史且已正常生育的女性100例作为对照组。采用酶联免疫吸附法检测两组血清抗Jo-1抗体、抗dsDNA抗体及抗心磷脂抗体(ACA)表达水平及对复发性流产的诊断价值,logistic回归分析复发性流产发生的相关影响因素。结果:复发性流产组血清抗Jo-1抗体(23.0%)、抗dsDNA抗体(17.0%)、ACA阳性(22.0%)表达率均高于对照组(5.0%、4.0%、8.0%)(均P<0.05);复发性流产组中抗Jo-1抗体和抗dsDNA抗体联合检测阳性率较抗Jo-1抗体、抗dsDNA抗体、ACA单独检测及抗Jo-1抗体和ACA抗体联合检测和抗dsDNA抗体和ACA抗体联合检测阳性率高(P<0.05)。受试者工作特征曲线分析显示,抗Jo-1抗体、抗dsDNA抗体及二者联合诊断复发性流产的曲线下面积分别为0.590、0.570、0.660,敏感度分别为95.0%、97.0%、94.0%,特异度分别为23.0%、17.0%、38.0%。血清抗Jo-1抗体阳性表达、抗dsDNA抗体阳性表达、ACA阳性表达是影响复发性流产发生的独立危险因素。结论:复发性流产患者血清中抗Jo-1抗体、抗dsDNA抗体呈高表达,二者异常高表达是复发性流产发生的危险因素,可作为复发性流产的早期诊断生物学指标。 展开更多
关键词 复发性流产 抗JO-1抗体 抗双链dna抗体 诊断价值 影响因素
下载PDF
DNA甲基化调控p16表达在替格瑞洛改善血管内皮功能中的作用及机制
19
作者 朱伯谦 宋兵战 +2 位作者 陈凯 姜旭 王振兴 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第2期169-178,共10页
目的:探讨替格瑞洛对氧化型低密度脂蛋白(oxidized low-density lipoprotein,ox-LDL)诱导内皮损伤的影响及机制。方法:采用ELISA法检测人血清内皮素-1、一氧化氮含量,CCK-8法、EdU法、Transwell法检测细胞活力、增殖及迁移能力,流式细... 目的:探讨替格瑞洛对氧化型低密度脂蛋白(oxidized low-density lipoprotein,ox-LDL)诱导内皮损伤的影响及机制。方法:采用ELISA法检测人血清内皮素-1、一氧化氮含量,CCK-8法、EdU法、Transwell法检测细胞活力、增殖及迁移能力,流式细胞术检测细胞凋亡,real-time PCR法、Western blot法检测DNA甲基化转移酶1(DNA Methyltransferase 1,DNMT1)、p16表达,慢病毒过表达载体构建p16的过表达系统,慢病毒敲除载体构建DNMT1和p16的敲除系统,甲基化特异性PCR法测定p16启动子区甲基化水平。结果:替格瑞洛促进ox-LDL诱导的人脐静脉内皮细胞(human umbilical endothelial cell,HUVEC)活力、增殖及迁移能力,并显著抑制ox-LDL诱导的细胞凋亡;替格瑞洛抑制ox-LDL诱导的HUVEC中p16表达,而过表达p16可逆转替格瑞洛对ox-LDL诱导HUVEC损伤的保护作用;DNMT1通过影响p16启动子区的甲基化水平抑制p16表达。结论:替格瑞洛可通过DNMT1介导的DNA甲基化调控p16表达,进而减轻ox-LDL诱导的HUVEC损伤,改善血管内皮功能。 展开更多
关键词 替格瑞洛 氧化型低密度脂蛋白 人脐静脉内皮细胞 P16 dna甲基化转移酶1
原文传递
Development of a rapid and sensitivity magnetic chemiluminescence immunoassay for DNA methyltransferase 1 in human serum 被引量:4
20
作者 Sitian He Leiliang He +9 位作者 Beibei Liu Songcheng Yu Li'e Liu Yongmei Tian Jia Wang Lihua Ding Yilin Wang Lingbo Qu Fei Yu Yongjun Wu 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2019年第5期1031-1034,共4页
DNA methyltransferase 1(DNMT1)is a useful biomarker for lung cancer in early clinical diagnosis.A rapid magnetic chemiluminescence immunoassay(MCLIA)for DNMT1 in human serum has been developed.Horseradish peroxidase(H... DNA methyltransferase 1(DNMT1)is a useful biomarker for lung cancer in early clinical diagnosis.A rapid magnetic chemiluminescence immunoassay(MCLIA)for DNMT1 in human serum has been developed.Horseradish peroxidase(HRP)-second-Ab was used to labeled polyclonal antibodies of anti-DNMT1.DNMT1 in sample integrates with specific immunomagnetic beads and can constitute a supersandwiched immunoreaction.In magnetic field,nonspecific materials can be separated.After luminescent substrate luminol-H2O2-BIP was added,the relative light unit(RLU)of HRP was detected and was discovered to be directly proportional to the content of DNMT1 in sample.The correlative variables involved in the MCLIA value were optimized and the methodological evaluation was carried out.After optimization,in the range of0.5–128 ng/mL,the linear regression equation was y=0.5014 x+1.769(x was logCDNMT1,y was relative luminescence units(RLU)/RLU0),and the limit of detection was 0.01 ng/mL.The RSD of intra-and interassays were 15.8%–16.9%and 14.3%–18.1%,respectively.The recovery was from 70.0%to 106.2%.Furthermore,paralleled with purchasable enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA)kits,MCLEIA had lower detection limit,wider linear range and shorter detection time.Therefore,the MCLEIA established in this study could be used for the sensitive detection of DNMT1 in serum sample. 展开更多
关键词 dna methyltransferase 1 BIOMARKER CHEMILUMINESCENCE IMMUNOASSAY MAGNETIC particles Human SERUM
原文传递
上一页 1 2 213 下一页 到第
使用帮助 返回顶部