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2个印记的基因间lncRNAs位于牛Dlk1-Dio3印记区域 被引量:3
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作者 杨文志 张明月 +3 位作者 王冠楠 赵宇鹏 张巍巍 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1848-1852,共5页
旨在鉴别牛Dlk1-Dio3印记区域内的新印记lncRNAs。本研究选取位于Meg8与Meg9基因间的2组表达序列标签(EST),通过RT-PCR克隆序列并进行分析,结果发现其具有lncRNA的特征,命名为Linc24062和Linc24063。分析Linc24062和Linc24063在牛8个组... 旨在鉴别牛Dlk1-Dio3印记区域内的新印记lncRNAs。本研究选取位于Meg8与Meg9基因间的2组表达序列标签(EST),通过RT-PCR克隆序列并进行分析,结果发现其具有lncRNA的特征,命名为Linc24062和Linc24063。分析Linc24062和Linc24063在牛8个组织(心、肝、脾、肺、肾、骨骼肌、皮下脂肪和大脑)中的表达,发现2个lncRNAs在被检测的组织中均表达。利用基于单核苷酸多态性(SNP)位点的直接测序法,通过比较杂合子牛中SNP位点处基因组PCR扩增产物与RT-PCR扩增产物的测序峰图分析Linc24062和Linc24063的印记状态,发现Linc24062和Linc24063在牛被检测组织中均为单等位基因表达,说明Linc24062和Linc24063在牛中是印记的。 展开更多
关键词 基因组印记 基因间长非编码RNA dlk1-dio3印记域 单核苷酸多态性
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哺乳动物印记域DLK1-DIO3的研究进展 被引量:9
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作者 赵丽霞 赵高平 周欢敏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期769-778,共10页
DLK1-DIO3印记域定位于人14号染色体、小鼠12号染色体及绵羊18号染色体远端,在真哺乳亚纲动物中印记保守。该印记域包含3个编码蛋白的父系表达基因Dlk1、Rtl1和Dio3以及若干大小不同的母系表达印记非编码RNA,如miRNAs、snoRNAs和大型非... DLK1-DIO3印记域定位于人14号染色体、小鼠12号染色体及绵羊18号染色体远端,在真哺乳亚纲动物中印记保守。该印记域包含3个编码蛋白的父系表达基因Dlk1、Rtl1和Dio3以及若干大小不同的母系表达印记非编码RNA,如miRNAs、snoRNAs和大型非编码RNA Gtl2等。人和小鼠该印记域内印记基因剂量的改变将导致严重的表型异常甚至胚胎致死,暗示正常的发育需要域内印记基因的正常表达。文章重点论述了哺乳动物DLK1-DIO3印记域的印记调控机制和域内印记基因及其功能的研究进展。 展开更多
关键词 dlk1-dio3 印记 印记调控区(ICR) DNA甲基化 非编码RNA
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DLK1-DIO3印记区域的miRNAs与疾病的发生
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作者 王冠楠 李冬杰 +3 位作者 陈玮娜 张萃 杨文志 李世杰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第4期316-325,共10页
哺乳动物的基因组以发育调控模式进行转录,生成长的和短的非编码RNAs(non-coding RNA,ncRNAs).ncRNAs占到人类转录组的98%,与生物体进化复杂程度显著相关.MicroRNAs(miRNAs)是目前研究比较透彻的,长度大约为20~24个核苷酸的ncRNAs,其通... 哺乳动物的基因组以发育调控模式进行转录,生成长的和短的非编码RNAs(non-coding RNA,ncRNAs).ncRNAs占到人类转录组的98%,与生物体进化复杂程度显著相关.MicroRNAs(miRNAs)是目前研究比较透彻的,长度大约为20~24个核苷酸的ncRNAs,其通过与靶基因mRNA的结合在转录后水平负调控基因的表达.人类基因组中一个最大的miRNA簇位于14号染色体(14q32)的DLK1-DIO3印记区域,包括了54个miRNAs.这些miRNAs通过参与调节重要的信号通路在许多病理过程中发挥作用.充分了解DLK1-DIO3印记区域中这个大的miRNA簇,在病理生理过程中的重要性将有助于为相关疾病的治疗提供新的策略.本文比较深入地分析了DLK1-DIO3印记区域中的miRNAs在调控组织动态平衡以及多种癌症发生中的作用,同时对其潜在的临床应用价值进行了讨论. 展开更多
关键词 dlk1-dio3印记 MIRNA 转录调控通路 肿瘤 潜在的生物学标记
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Reprogramming somatic cells by fusion with embryonic stem cells does not cause silencing of the Dlk1-Dio3 region in mice
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作者 Nariman R Battulin Anna A Khabarova +3 位作者 Ul’yana A Boyarskikh Aleksey G Menzorov Maxim L Filipenko Oleg L Serov 《World Journal of Stem Cells》 SCIE CAS 2012年第8期87-93,共7页
AIM:To examine the imprinted Dlk1-Dio3 locus in pluripotent embryonic stem(ES)cell/fibroblast hybrid cells.METHODS:Gtl2,Rian,and Mirg mRNA expression in mouse pluripotent ES cell/fibroblast hybrid cells was examined b... AIM:To examine the imprinted Dlk1-Dio3 locus in pluripotent embryonic stem(ES)cell/fibroblast hybrid cells.METHODS:Gtl2,Rian,and Mirg mRNA expression in mouse pluripotent ES cell/fibroblast hybrid cells was examined by real-time reverse transcription-polymerase chain reaction.Pyrosequencing and bisulfate sequencing were used to determine the DNA methylation level of the Dlk1-Dio3 locus imprinting control region. RESULTS:The selected hybrid clones had a near-tetraploid karyotype and were highly pluripotent judging from their capacity to generate chimeric embryos and adult chimeras.Our data clearly demonstrate that Gtl2,Rian,and Mirg,which are imprinted genes within the Dlk1-Dio3 locus,are active in all examined ES cell/fibroblast hybrid clones.In spite of interclonal variability,the expression of the imprinted genes is comparable to that of ES cells and fibroblasts.Quantitative analysis of the DNA methylation status of the intergenic differentially methylated region(IG DMR)within the Dlk1-Dio3 locus by pyrosequencing and bisulfite sequencing clearly showed that the DNA methylation status of the imprinted region in the tested hybrid clones was comparable to that of both ES cells and fibroblasts.CONCLUSION:Reprogramming process in a hybrid cell system is achieved without marked alteration of the imprinted Dlk1-Dio3 locus. 展开更多
关键词 Cell FUSION EMBRYONIC stem cells REPROGRAMMING PLURIPOTENCY Imprinted dlk1-dio3 REGION DNA methylation
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LINC24065在体细胞核移植牛中的异常表达 被引量:1
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作者 张萃 陈玮娜 +4 位作者 李俊良 谷书凯 徐达 李冬杰 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期44-51,共8页
旨在揭示DLK1-DIO3印记域上一个新的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)LINC24065在自然繁殖牛(natural reproduction,NR)与体细胞核移植牛(somatic cell nuclear transfer,SCNT)中的组织表达与印记状态,对进一步了解DLK1-DIO3... 旨在揭示DLK1-DIO3印记域上一个新的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)LINC24065在自然繁殖牛(natural reproduction,NR)与体细胞核移植牛(somatic cell nuclear transfer,SCNT)中的组织表达与印记状态,对进一步了解DLK1-DIO3印记域在供体核重编程中的作用提供一定的理论基础。本研究以自然繁殖牛的大脑组织为试验材料,利用RACE和RT-PCR技术,在牛的DLK1-DIO3印记域内鉴定了一个新的印记的lncRNA基因,命名为LINC24065。用基于SNP(single nucleotide polymopisms)的RT-PCR产物直接测序方法分析LINC24065在自然繁殖牛和体细胞核移植牛组织中的表达及印记状态。序列分析发现,LINC24065编码6个可变剪接体,并在自然繁殖牛被检测的7个组织中都表达,而在体细胞核移植牛组织中没有检测到可变剪接体LINC24065-V3,且其它5个剪接体呈现组织特异性表达。印记状态分析发现,LINC24065在自然繁殖牛和体细胞核移植牛的7个组织中均为单等位基因表达,但在体细胞核移植牛的大脑组织中出现了与其他组织亲本来源不同的单等位基因表达。研究结果说明,LINC24065基因在体细胞核移植牛的大脑中出现了印记紊乱,并且剪接体在组织中的表达也发生了改变。以上研究结果说明LINC24065基因与体细胞核移植牛的发育异常有关。 展开更多
关键词 dlk1-dio3印记域 表观重编程 体细胞核移植 长非编码RNA
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妊娠期全氟辛酸染毒对子代雄鼠发育毒性的研究 被引量:5
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作者 宋鹏琰 马双 +3 位作者 翟福展 李丹阳 王晓丹 钟秀会 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期4033-4038,共6页
探讨妊娠期染毒全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA)对子代雄鼠发育毒性的影响.将50只妊娠0 d小鼠随机分5组,每组10只,妊娠0~17 d每天按0、1、2.5、5和12.5 mg·kg^(-1)BW饲喂PFOA,产后仔鼠正常饲养,记录仔鼠存活数.产后21 d,检... 探讨妊娠期染毒全氟辛酸(perfluorooctanoic acid,PFOA)对子代雄鼠发育毒性的影响.将50只妊娠0 d小鼠随机分5组,每组10只,妊娠0~17 d每天按0、1、2.5、5和12.5 mg·kg^(-1)BW饲喂PFOA,产后仔鼠正常饲养,记录仔鼠存活数.产后21 d,检测仔鼠血清睾酮水平并计算睾丸指数;HE染色观察睾丸组织结构变化;RT-PCR法检测睾丸组织Dlk1-Dio3印记基因簇各目的基因mRNA的表达情况.结果显示,随PFOA染毒剂量增加,仔鼠存活数显著降低,血清睾酮含量极显著性降低(p<0.01);睾丸指数无统计学意义;睾丸组织有不同程度的损伤并呈剂量依赖性;Dlk1-Dio3印记基因簇各目的基因的表达量都有降低趋势,其中Gtl2、Rian、Dio3均显著性降低(p<0.05).结果表明,妊娠期染毒PFOA能够降低仔鼠存活数,损伤睾丸组织结构,并能够扰乱生殖激素,降低睾丸组织Dlk1-Dio3印记基因簇各目的基因mRNA的表达. 展开更多
关键词 全氟辛酸 小鼠 子代 睾酮 dlk1-dio3印记基因簇
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Temporal regulation of prenatal embryonic development by paternal imprinted loci 被引量:6
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作者 Qing Li Yuanyuan Li +6 位作者 Qi Yin Shuo Huang Kai Wang Liangchai Zhuo Wei Li Boran Chang Jinsong Li 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期1-17,共17页
Paternal imprinted genes(H19 and Gtl2)are pivotal for prenatal embryonic development in mice.Nongrowing oocytes and sperm-or oocyte-originated haploid embryonic stem cells(ha ESCs)carrying both H19-DMR(differentially ... Paternal imprinted genes(H19 and Gtl2)are pivotal for prenatal embryonic development in mice.Nongrowing oocytes and sperm-or oocyte-originated haploid embryonic stem cells(ha ESCs)carrying both H19-DMR(differentially DNA-methylated region)and IG(intergenic)-DMR deletions that partially mimic paternal imprinting of H19-Igf2 and Dlk1-Dio3 can be employed as sperm replacement to efficiently support full-term embryonic development.However,how H19-DMR and IG-DMR act together to regulate embryonic development is still largely unknown.Here,using androgenetic ha ESC(AG-ha ESC)-mediated semi-cloned(SC)technology,we showed that paternal H19-DMR and IG-DMR are not essential for pre-implantation development of SC embryos generated through injection of AG-ha ESCs into oocytes.H19-DMR plays critical roles before 12.5 days of gestation while IG-DMR is essential for late-gestation of SC embryos.Interestingly,we found that combined deletions of H19 and H19-DMR can further improve the efficiency of normal development of SC embryos at mid-gestation compared to DKO SC embryos.Transcriptome and histology analyses revealed that H19 and H19-DMR combined deletions rescue the placental defects.Furthermore,we showed that H19,H19-DMR and IG-DMR deletions(TKO)give rise to better prenatal and postnatal embryonic development of SC embryos compared to DKO.Together,our results indicate the temporal regulation of paternal imprinted loci during embryonic development. 展开更多
关键词 imprinted loci semi-cloned technology temporal regulation H19-Igf2 dlk1-dio3 embryonic development
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