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题名不同物种Dock7基因编码区生物信息学分析
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作者
刘小辉
李祥龙
周荣艳
李兰会
张天
王建涛
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机构
河北农业大学动物科技学院
河北科技师范学院动物科技学院
唐山市畜牧工作站
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出处
《家畜生态学报》
北大核心
2013年第12期12-17,共6页
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基金
国家自然科学基金(31172196)
河北省高等学校创新团队领军人才培育计划(LJRC004)
河北省现代农业产业技术体系蛋鸡产业创新团队资助
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文摘
为了研究不同物种Dock7基因的遗传多样性,采用生物信息学的方法分析了人、倭黑猩猩、大猩猩、毛猩猩、东非狒狒、玻利维亚的灰鼠猴子、虎鲸、家马、白犀牛、雪貂、家牛、大熊猫、佛罗里达海牛、海象、欧洲兔、家猫、家绵羊、星鼻鼹鼠、北美鼠兔、裸鼢鼠、非洲跳鼠、八齿鼠、褐家鼠、小家鼠、袋獾、原鸡、爪蟾27个物种Dock7基因编码区(CDS),并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构进行了分析和预测。结果表明,在27个物种68条基因序列中共检测到1855个多态位点,生成28种单倍型,Dock7基因序列编码区种间存在丰富的遗传多样性,而种内变异极小,只在原鸡中发现一个变异位点。在所研究27个物种中,原鸡Dock7基因的氨基酸序列存在信号肽,其他26个物种Dock7基因的氨基酸序列均无信号肽。27个物种都没有跨膜结构域,表现为亲水性,蛋白质二级结构主要结构元件是自由卷曲和α-螺旋,Dock7蛋白呈酸性。
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关键词
物种
dock7基因
生物信息学分析
遗传多样性
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Keywords
species
dock7 gene
Bioinformatics
genetic diversity
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分类号
S811.6
[农业科学—畜牧学]
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