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基于EST指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果
1
作者 洪杨 秦芝霞 《淮海医药》 CAS 2024年第1期88-92,共5页
目的:探究基于生态系统理论(EST)指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果。方法:以某院推行基于EST指导的家庭管理模式的延续性护理方案时间(2022年7月)为分界线,将推行前(2022年1月—2022年6月)的105例手外伤修复... 目的:探究基于生态系统理论(EST)指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中的应用效果。方法:以某院推行基于EST指导的家庭管理模式的延续性护理方案时间(2022年7月)为分界线,将推行前(2022年1月—2022年6月)的105例手外伤修复术后患者列为对照组,予以常规出院指导及延续性护理,推行后(2022年7月—2023年1月)的103例患者列为观察组,予以基于EST指导的家庭管理的延续性护理。比较2组心理状况[心理弹性量表(CD-RISC)]评分、自我护理能力[自我护理能力量表(ESCA)]评分、自我效能[一般自我效能感量表(GSES)]、日常活动能力[改良Barthel指数(MBI)]及手功能运动情况[手指总主动活动度(TAM)、Jamar握力]。结果:干预6个月后,观察组CD-RISC评分中能力[(20.56±2.79)分]、坚韧性[(17.18±1.47)分]、接受改变[(17.62±1.41)分]、控制[(9.87±1.51)分]、精神影响[(6.98±1.25)分]5个维度评分及总分[(72.21±5.41)分]均高于对照组[(19.23±2.57)分、(16.37±1.71)分、(16.44±1.38)分、(8.18±1.34)分、(5.49±1.28)分、(65.71±5.38)分](P<0.05);观察组ESCA评分中自我护理技能[(36.01±3.18)分]、自我护理责任感[(20.23±2.23)分]、自我护理概念[(25.68±1.91)分]、健康知识水平[(37.11±4.73)分]4个维度评分及总分[(119.03±11.35)分]均高于对照组[(31.58±2.74)分、(17.87±2.17)分、(22.02±2.03)分、(32.99±4.81)分、(104.46±13.38)分](P<0.05);观察组GSES、MBI评分分别为(35.43±4.18)分、(90.05±10.24)分,高于对照组的(32.13±4.44)分、(82.79±10.59)分;观察组TAM和Jamar握力分别为(77.01±12.23)°、(38.23±5.23)kg,高于对照组的(65.58±12.44)°、(30.87±5.17)kg,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:基于EST指导的家庭管理模式在手外伤修复术后延续性护理中应用效果显著,可有效改善患者心理状况、自我护理能力、自我效能及日常活动能力,对手功能运动的恢复具有积极意义。 展开更多
关键词 手术后医护 est 家庭管理 手外伤
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基于EST-SSR分子标记的萱草亲缘关系分析
2
作者 赵玉帆 储博彦 +3 位作者 刘素素 赵丽红 李金霞 尹新彦 《天津农业科学》 CAS 2024年第2期1-4,10,共5页
萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩... 萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩增。结果显示:11对引物共获得40个多态性位点,样本平均有效等位基因数为2.58个,平均Shannon多样性指数为1.00,平均期望杂合度为0.57,平均观察杂合度为0.52;以遗传距离矩阵为分析对象,36个萱草品种间的遗传距离为0.05~0.70,利用NTSYS软件按UPGMA法聚类结果显示,遗传距离0.48为阈值时,36种萱草品种分为2个大类,遗传距离0.414为阈值时,可进一步将第1大类分为4个亚类。综上,供试的36个萱草品种之间具有较高的遗传多样性和较为丰富的遗传背景,为今后培养萱草优良新品种提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 萱草 est-SSR分子标记 亲缘关系
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基于EST理念的中职《成本会计》课程混合式教学策略研究
3
作者 高志鑫 《学周刊》 2024年第15期7-9,共3页
《成本会计》作为中职会计电算化专业中理论性较高、理解力较难的课程,在学生学习、教师教学等诸多方面都存在一定的问题,一直是教学改革的重点。文章借助EST教学理念和方法,在教学目标、教学方法、课程考核、课程评价等方面提出了实践... 《成本会计》作为中职会计电算化专业中理论性较高、理解力较难的课程,在学生学习、教师教学等诸多方面都存在一定的问题,一直是教学改革的重点。文章借助EST教学理念和方法,在教学目标、教学方法、课程考核、课程评价等方面提出了实践性较强的教学策略,重在深化课程深度、课堂饱和度和学业紧张度持续改革,以构建《成本会计》课程混合式教学实践能力创新模式。 展开更多
关键词 中职 成本会计 est理念 混合式教学
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基于EST-SSR标记的沙棘品种鉴定及指纹图谱构建
4
作者 赵雨欣 张哲文 +5 位作者 考惠霞 孙永江 辛智鸣 赵喆 董树斌 程瑾 《生态与农村环境学报》 CAS CSCD 2024年第3期374-385,共12页
以沙棘(Hippophae rhamnoides)优良品种“实优1号”为材料,对其叶片进行转录组测序,利用微卫星识别软件(microsatellite identification tool,MISA)和Primer 3(version 2.3.4)对获得的序列进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR... 以沙棘(Hippophae rhamnoides)优良品种“实优1号”为材料,对其叶片进行转录组测序,利用微卫星识别软件(microsatellite identification tool,MISA)和Primer 3(version 2.3.4)对获得的序列进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点挖掘和引物设计,以收集的42份沙棘品种为研究材料,开展聚合酶链式反应(PCR)和毛细管电泳检测,旨在开发一套多态性高、稳定性好和通用性强的表达序列标签微卫星(express sequence tags from simple sequence repeat,EST-SSR)引物,构建沙棘指纹图谱,从而实现沙棘品种的快速准确鉴定,并对沙棘品种间亲缘关系进行分析。“实优1号”转录组测序共获得6196个SSR位点,其中,重复基元类型为182种,SSR基序长度主要分布在10~21 bp区间,占全部SSR的81.58%,主要SSR重复类型为单核苷酸重复(48.72%)、二核苷酸重复(22.68%)和三核苷酸重复(18.85%)。利用筛选出的28对引物在42份沙棘品种中共检测出193个等位基因,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和Shannon信息指数(I)等遗传多样性参数的均值分别为6.964、3.495、0.617、0.671、0.623和1.384。UPGMA聚类分析表明,42份沙棘品种间的遗传相似性系数为0.601~0.990,当遗传相似性系数为0.694时,供试品种可分为2组;当遗传相似性系数约为0.7402时,供试品种可分为3组。优选6对引物构建指纹图谱,可以实现沙棘品种的快速准确鉴定。该研究可为沙棘的良种鉴定、指纹图谱构建以及遗传多样性和亲缘关系分析等提供分子水平的理论基础和数据支撑。 展开更多
关键词 沙棘 表达序列标签微卫星 指纹图谱 遗传多样性
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ERCP/EST联合LC微创治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床应用 被引量：3
5
作者 王学新 聂晓辉 +3 位作者 凌传江 郭新文 胡德军 马文颖 《肝胆外科杂志》 2023年第1期30-32,共3页
目的探讨经内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)/经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效和手术时机选择.方法选取我科2020年6月至2022年10月收治的胆囊结石合并胆总管结石的患者38例,所有患者均先行ER... 目的探讨经内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)/经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效和手术时机选择.方法选取我科2020年6月至2022年10月收治的胆囊结石合并胆总管结石的患者38例,所有患者均先行ERCP/EST取石,胆总管无结石残留,病情稳定,术后1~5天行LC,1例术后1周LC.结果ERCP/EST术后部分患者感腹胀、恶心、呕吐,6例出现高淀粉酶血症,1例并发胰腺炎,LC术中中转2例,所有患者无损伤、出血、胆漏等并发症.结论ERCP/EST联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石具有创伤小、恢复快、瘢痕小、无需放置T管等,值得临床应用. 展开更多
关键词 胆囊结石 胆总管结石 ERCP/est LC
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ERCP/EST联合LC微创治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床应用
6
作者 王学新 聂晓辉 +3 位作者 凌传江 郭新文 胡德军 马文颖 《肝胆外科杂志》 2023年第2期113-115,共3页
目的探讨经内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)/经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效和手术时机选择。方法选取我科2020年6月至2022年10月收治的胆囊结石合并胆总管结石的患者38例,所有患者均先行E... 目的探讨经内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)/经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石的临床疗效和手术时机选择。方法选取我科2020年6月至2022年10月收治的胆囊结石合并胆总管结石的患者38例,所有患者均先行ERCP/EST取石,胆总管无结石残留,病情稳定,术后1~5天行LC,1例术后1周LC。结果ERCP/EST术后部分患者感腹胀、恶心呕吐,6例出现高淀粉酶血症,1例并发胰腺炎,LC术中中转2例,所有患者无损伤、出血、胆漏等并发症。结论ERCP/EST联合LC治疗胆囊结石合并胆总管结石具有创伤小、恢复快、瘢痕小、无需放置T管等,值得临床应用。 展开更多
关键词 胆囊结石 胆总管结石 ERCP/est LC
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CBDE与EST+LC术对胆囊结石合并胆管结石患者术后康复、胆汁糖蛋白的影响及经济性
7
作者 杜强 王刚 樊林 《贵州医药》 CAS 2023年第1期98-100,共3页
目的对比分析CBDE+LC与EST+LC术对胆囊结石合并胆管结石患者术后康复影响及经济性。方法将80例胆囊结石合并胆管结石患者根据治疗方式分为CBDE+LC组(n=38)和EST+LC组(n=42)。对两组的手术指标、术后康复指标、医疗经济学指标进行统计并... 目的对比分析CBDE+LC与EST+LC术对胆囊结石合并胆管结石患者术后康复影响及经济性。方法将80例胆囊结石合并胆管结石患者根据治疗方式分为CBDE+LC组(n=38)和EST+LC组(n=42)。对两组的手术指标、术后康复指标、医疗经济学指标进行统计并比较。结果CBDE+LC组手术耗时较EST+LC组患者短、术中出血量低于EST+LC组(P<0.05);CBDE+LC组术后排气期时间、进食时间明显低于EST+LC组,术后并发症率低于EST+LC组(P<0.05);CBDE+LC组术后总住院时间较EST+LC组短,治疗总费用较EST+LC组低(P<0.05)。结论腹腔镜下胆总管探查联合LC手术治疗胆管结石合并胆囊结石患者在手术耗时、术中出血量及术后康复、医疗经济学指标方面均明显优于EST联合LC手术方案。 展开更多
关键词 胆囊结石并胆管结石 CBDE LC est 术后康复指标 经济学指标
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黍稷高基元EST-SSR标记开发及200份核心种质资源遗传多样性分析 被引量：3
8
作者 王倩 张立媛 +6 位作者 许月 李海 刘少雄 薛亚鹏 陆平 王瑞云 刘敏轩 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2308-2318,共11页
为搞清黍稷核心种质资源的遗传背景,开发新的高基元EST-SSR标记用以评估国内不同生态区资源的遗传多样性,为加快黍稷育种进程和挖掘优异种质提供依据。本研究基于转录组测序开发了200个高基元EST-SSR标记并进行多态性筛选,利用筛选到的... 为搞清黍稷核心种质资源的遗传背景,开发新的高基元EST-SSR标记用以评估国内不同生态区资源的遗传多样性,为加快黍稷育种进程和挖掘优异种质提供依据。本研究基于转录组测序开发了200个高基元EST-SSR标记并进行多态性筛选,利用筛选到的多态性标记评价200份黍稷核心种质资源的遗传多样性。结果表明,200个标记在6份地理来源差异显著的黍稷材料中有52个呈多态性,开发效率为26%,其中四、五和六碱基重复多态性标记分别为17个(32.7%)、17个(32.7%)和18个(34.6%)。利用52个高基元EST-SSR多态性标记对200份核心资源进行检测,共得到129个观测等位变异,每个位点检测到2~3个;Shannon多样性指数为0.3093~1.0910,平均为0.7277;多态性信息含量为0.1948~0.8211,平均为0.5104。基于UPGMA将200份资源划分为6个群组。基于Structure的遗传结构(K=7)将资源划分为7个类群,黍稷资源主要来自4个(东北地区、华北地区、黄土高原和北方地区)基因库。基于主成分分析将材料聚为6个类群,与其地理来源一致。构建了52个四–六碱基重复EST-SSR标记,开发率为26%;用其分析材料的遗传差异发现黍稷地方核心种质遗传多样性较为丰富。 展开更多
关键词 黍稷 核心种质 高基元est-SSR 遗传多样性 群体结构
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从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究 被引量：22
9
作者 李华盛 范术丽 沈法富 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2005年第4期211-216,共6页
利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。... 利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物25对,其中24对引物有扩增产物,17对产物条带比较清晰,对这些条带比较清晰的产物作了一系列的分析。 展开更多
关键词 微卫星标记 estS 棉花 est数据库 微卫星序列 est序列 生物信息学 标记筛选 重复序列 碱基序列 序列设计 扩增产物 引物 清晰 条带
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基于EST-SSR标记的60份苇状羊茅遗传多样性分析 被引量：1
10
作者 伊然 王子玥 +1 位作者 刘凌云 常智慧 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2041-2048,共8页
苇状羊茅(Festuca arundinacea Schred)是多年生冷季型禾草,作为草坪草、牧草、生态修复草种在温带有着广泛的应用。本研究以60份不同来源的苇状羊茅种质为材料,利用表达序列标签-简单序列重复(EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析,对... 苇状羊茅(Festuca arundinacea Schred)是多年生冷季型禾草,作为草坪草、牧草、生态修复草种在温带有着广泛的应用。本研究以60份不同来源的苇状羊茅种质为材料,利用表达序列标签-简单序列重复(EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析,对其构建指纹图谱,对种质资源进行鉴定与评价。结果表明:20对EST-SSR引物共扩增出173条带,多态性条带163条,多态性位点百分率94.220%;所有引物均可识别种质,不同的引物组合可以区分60份种质;聚类结果与地理区划有一定的关联,但不明显;60份参试材料最佳亚群数为3。研究结果表明:60份种质的遗传多样性处于中等水平;SSR标记可以有效地鉴定苇状羊茅种质并评价其遗传差异,为苇状羊茅核心种质的构建、新品种的选育奠定基础。 展开更多
关键词 苇状羊茅 est-SSR 遗传多样性 聚类分析
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大麻EST-SSR遗传结构分析及指纹图谱构建
11
作者 边境 王晓楠 +4 位作者 曹焜 赵越 王云云 张晓艳 孙宇峰 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1794-1804,共11页
大麻是一年生草本植物,一种多用途、可持续的作物。迄今为止,关于大麻遗传结构的研究还很少。本研究通过EST-SSR分子标记分析大麻的遗传多样性和种群结构。结果表明,20对引物共扩增出113个清晰条带,其中113个(100%)是多态性的;共检测到... 大麻是一年生草本植物,一种多用途、可持续的作物。迄今为止,关于大麻遗传结构的研究还很少。本研究通过EST-SSR分子标记分析大麻的遗传多样性和种群结构。结果表明,20对引物共扩增出113个清晰条带,其中113个(100%)是多态性的;共检测到232个等位基因,平均每对引物检测到4.0176个等位基因;观测杂合度(Ho)平均为0.7102,期望杂合度(He)平均为0.6935;200个个体香农信息指数介于0.7204~2.4625之间,平均值为1.5368;多态信息含量(PIC)变化范围为0.3519~0.8801,平均为0.6558;平均基因流(Nm)平均值为13.6525。基于种群遗传结构、主成分分析和未加权的算术平均对组法(UPGMA)分析,将大麻材料聚类为3组。不同聚类方法之间结果相似,但3种模型的少数个体植株分布不同。聚类结果、基因多样性和遗传相似系数表明,大麻个体总体亲缘关系较为密切。同时用5对核心引物能够区分参试种质,并为每份种质构建了指纹图谱。研究结果为今后的大麻育种、遗传改良和核心种质资源收集提供了参考。 展开更多
关键词 大麻 est-SSR 遗传多样性 种群结构
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基于EST-SSR分子标记的广西海伦兜兰遗传多样性研究
12
作者 朱舒靖 邹蓉 +4 位作者 柴胜丰 唐健民 唐凤鸾 陈泰国 韦霄 《广西科学》 CAS 北大核心 2023年第6期1060-1067,共8页
海伦兜兰(Paphiopedilum helenae)具有极高的观赏价值,为国家一级重点保护野生植物。本研究利用EST-SSR分子标记技术对广西海伦兜兰的5个居群(71个样品)的遗传多样性和遗传结构进行分析,旨在为该种质资源的有效保护与利用提供参考依据... 海伦兜兰(Paphiopedilum helenae)具有极高的观赏价值,为国家一级重点保护野生植物。本研究利用EST-SSR分子标记技术对广西海伦兜兰的5个居群(71个样品)的遗传多样性和遗传结构进行分析,旨在为该种质资源的有效保护与利用提供参考依据。结果表明:海伦兜兰具有中等遗传多样性,多态位点百分比(PPB)为90%-100%,期望杂合度(H_(e))平均值为0.451,香农信息指数(I)平均值为0.801。海伦兜兰绝大多数(93%)遗传变异存在于居群内,仅有7%遗传变异存在于居群间,居群内的遗传变异大于居群间的变异,基因流(N_(m))平均值为4.916。非加权组平均法(UPGMA)、主坐标分析(PCoA)和Structure分析结果表明,聚类并未严格按照地理位置划分,广西邦亮长臂猿国家级自然保护区靖西市(JX)和龙州县下冻镇春秀村(LZ)居群的遗传多样性较高,应作为海伦兜兰重点保护单元进行保护。 展开更多
关键词 海伦兜兰 est-SSR 分子标记 遗传多样性 遗传结构
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绵羊EST-SSR分子标记的鉴定及特异性分析
13
作者 马小梅 宋亚倩 罗瑞明 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第2期330-340,共11页
通过SSR Finder软件及MISA技术从NCBI系统中的绵羊表达序列标签(EST)数据库中筛查SSR位点,利用Primer 3.0设计绵羊EST-SSR荧光引物,对宁夏滩羊肉、新疆细毛羊肉和藏绵羊肉进行区分。以3种绵羊的肝脏DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行PC... 通过SSR Finder软件及MISA技术从NCBI系统中的绵羊表达序列标签(EST)数据库中筛查SSR位点,利用Primer 3.0设计绵羊EST-SSR荧光引物,对宁夏滩羊肉、新疆细毛羊肉和藏绵羊肉进行区分。以3种绵羊的肝脏DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行PCR扩增并使用毛细管电泳检测SSR分型。结果显示,通过EST-SSR标记设计的荧光引物p2105.1:248-559、p2025.1:896-1059和p2104.1:704-1015在宁夏滩羊肉、新疆细毛羊肉和藏绵羊肉中具有良好特异性,可实现3个绵羊品种的区分。通过EST-SSR标记技术可准确判断3个纯种绵羊肉的品种,这对绵羊遗传资源的开发利用、品种鉴别以及丰富分子标记类型具有重要的意义。 展开更多
关键词 绵羊 est-SSR 引物设计 特异性分析
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水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及EST-SSR标记开发
14
作者 田怀志 郭豪 +3 位作者 田浩 熊兴伟 张素勤 耿广东 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2052-2064,共13页
为开发适当的生物学工具以探索辣椒对水涝胁迫应答的分子机制,该研究对不同淹水处理的辣椒样本进行转录组分析,获得了丰富的序列数据,并在此基础上对SSR分子标记进行挖掘。结果表明:(1)辣椒转录组检测共获得128939个Unigene,其总长度、... 为开发适当的生物学工具以探索辣椒对水涝胁迫应答的分子机制,该研究对不同淹水处理的辣椒样本进行转录组分析,获得了丰富的序列数据,并在此基础上对SSR分子标记进行挖掘。结果表明:(1)辣椒转录组检测共获得128939个Unigene,其总长度、平均长度和GC含量分别是55082725、1101 bp和40.57%。与七大功能数据库进行比较,分别有102123个(NR,79.20%)、110157个(NT,85.43%)、70203个(SwissProt,54.45%)、73539个(KOG,57.03%)、77646个(KEGG,60.22%)、77442个(GO,60.06%)以及68216个(Pfam,52.91%)Unigene获得功能注释。发现脂质代谢、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、环境适应、次级代谢物生物合成、信号转导和翻译等途径在辣椒水涝胁迫应答中起重要作用。(2)从辣椒转录组数据中发掘到26574个SSR位点分布在24889个Unigene中。SSR的出现频率为20.61%,其中单核苷酸重复所占比例(37.26%)最高,其次是三核苷酸(31.00%)和二核苷酸(25.44%)重复类型,三者占EST-SSR总数的93.70%。在单核苷酸与二核苷酸中最多的基序类型为A/T、AG/CT和TC/GA,其次是AT和TA;三核苷酸中最常见的基序类型是TTG/CAA和ACA/TGT。(3)用Primer 3在线工具设计了10002对EST-SSR引物,随机选择30对引物进行PCR扩增,均可获得有效扩增。对3份辣椒材料进行扩增,其中7对引物可以扩增出目标条带。综上所述,在辣椒中优势SSR重复类型的基序结构和其他品种基本相近,并初步探索了辣椒水涝胁迫应答的分子机制,开发了EST-SSR标记,为辣椒耐涝遗传育种提供了参考。 展开更多
关键词 辣椒 水涝胁迫 响应机制 转录组 est-SSR
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基于转录组数据的芦笋EST-SSR标记的开发及通用性分析
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作者 仪泽会 赵婧 毛丽萍 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第22期4490-4505,共16页
【目的】明确芦笋转录组中SSR位点的分布规律,开发高信息量的EST-SSR标记并分析通用性,为天门冬属植物系统进化分析、功能基因挖掘及分子标记辅助育种提供工具。【方法】以笔者课题组前期获得的15个芦笋根系RNA-seq数据为基础,采用MISA... 【目的】明确芦笋转录组中SSR位点的分布规律,开发高信息量的EST-SSR标记并分析通用性,为天门冬属植物系统进化分析、功能基因挖掘及分子标记辅助育种提供工具。【方法】以笔者课题组前期获得的15个芦笋根系RNA-seq数据为基础,采用MISA软件检索SSR位点、Primer 3.0软件批量设计引物及TB-tools软件批量e-PCR与Primer-blast程序逐一e-PCR相结合的方法剔除非有效引物。通过与基因组序列比对,获取标记所属基因ID、物理位置、潜在功能等信息。随机合成引物50对,以9份芦笋、7份天门冬、5份文竹和3份蓬莱松种质为材料,检测引物有效性、多态性和通用性。【结果】共检索出SSR位点36590个,分布于30229条Unigene,发生频率为4.78%,平均间距为9.17 kb。SSR位点非均匀分布于10条染色体,7号染色体数量最多(4642个),3号染色体密度最高(37.86 SSR/Mb)。SRR位点从单核苷酸至六核苷酸均有分布,以三核苷酸(46.92%)类型最丰富,AG/CT(16.58%)基序最具优势。成功设计EST-SSR引物19695对,经e-PCR检测共剔除非有效引物15147对,其中,3085对无扩增产物、10102对扩增产物条带大小与预期严重不符、1289对物理位置未知、402对存在与目的条带大小相似的其他扩增产物、269对扩增产物无SSR序列。以位于基因区域的2517个EST-SSR标记为基础,构建染色体密度分布图,总覆盖长度1125.51 Mb,平均图距447.16 kb,潜在功能涉及产量、品质及抗逆性等多方面。随机合成的50对引物均可扩增出清晰目标条带,其中36对具有多态性,平均多态性信息含量为0.330,在天门冬、文竹和蓬莱松中的通用性分别达到100.00%、92.00%和88.00%。基于EST-SSR鉴定结果的聚类分析,可将24份材料分为芦笋、天门冬、文竹和蓬莱松4类,与植物学分类完全一致。【结论】成功开发出高信息量的芦笋EST-SSR标记2517个,有效扩增率100%,总覆盖长度1125.51 Mb,平均图距447.16 kb,可用于芦笋及其近缘物种的系统进化分析。同时,可为其他物种的EST-SSR标记开发提供借鉴。 展开更多
关键词 转录组 芦笋 est-SSR 染色体密度分布图 功能注释
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ERCP联合EST序贯中药治疗肝外胆管结石术后肝阴亏虚型患者60例临床观察
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作者 汪玲虎 张琦 +4 位作者 于庆生 齐伟 梁久银 刘海韦 舒亚倩 《中医药临床杂志》 2023年第10期2024-2029,共6页
目的:观察ERCP联合EST序贯应用一贯煎加减治疗肝外胆管结石术后肝阴亏虚型患者的临床疗效。方法:选择符合标准的2019年1月—2021年12月因诊断为肝外胆管结石就诊于安徽中医药大学第一附属医院普外科的60例患者,并按随机数字表法分为观... 目的:观察ERCP联合EST序贯应用一贯煎加减治疗肝外胆管结石术后肝阴亏虚型患者的临床疗效。方法:选择符合标准的2019年1月—2021年12月因诊断为肝外胆管结石就诊于安徽中医药大学第一附属医院普外科的60例患者,并按随机数字表法分为观察组和对照组,每组各30例,对照组予以ERCP联合EST治疗,术后常规予西药治疗;观察组在对照组的基础上,予一贯煎加减口服。观察对比2组患者治疗后的疗效及鼻胆管引流量、胆汁细菌培养结果;炎性指标、肝功能指标、血清胆汁生化指标改善程度及术后复发率。结果:2组患者无临床疗效差异(P>0.05)。治疗前2组患者的炎性指标、肝功能指标及血清胆汁生化指标比较无差异(P>0.05),治疗后2组患者各项指标均改善,观察组改善程度显著优于对照组(P<0.05)。观察组术后第5、7天鼻胆管引流量分别为(336.50±91.06)mL和(456.23±110.02)mL,与对照组比较有统计学意义(P<0.05)。治疗后对照组细菌培养阴性率63.33%,观察组86.67%,比较有统计学意义(P<0.05)。观察组术后结石复发率(6.67%)与对照组(26.67%)比较有统计学意义(P<0.05)。结论:ERCP、EST联合一贯煎加减治疗能够提高手术成功率,起到抑制术后胆道炎症、加快肝功能恢复、调节胆汁成分、防治术后结石复发的作用。 展开更多
关键词 ERCP est 肝阴亏虚 肝外胆管结石
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水稻抗白叶枯病基因Xa23的EST标记及其在分子育种上的利用 被引量：49
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作者 王春连 戚华雄 +4 位作者 潘海军 李进波 樊颖伦 章琦 赵开军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1996-2001,共6页
用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多... 用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多态性检测,找到2个在CBB23与JG30间有多态性的EST标记,C189和CP02662。用该标记对F2群体中的571个感病单株进行分子检测和连锁分析,结果表明这两个EST标记位于Xa23基因的两侧,C189靠着丝粒一侧,与Xa23的遗传距离为0.8cM;CP02662靠端粒一侧,与Xa23的遗传距离为1.3cM。将C189成功用于水稻分子育种实践,标记辅助选择的正确率接近100%,已培育出3个将Xa23基因与高产、优质、抗褐飞虱等性状聚合的水稻恢复系。 展开更多
关键词 水稻 XA23 水稻白叶枯病 est标记 分子育种 标记辅助选择 近等基因系 日本水稻 抗白叶枯病 est
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从小麦EST序列中开发新的SSR引物 被引量：66
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作者 陈军方 任正隆 +1 位作者 高丽锋 贾继增 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期154-158,共5页
小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs... 小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs分别为 34条 (7 7% )和 347条 (78 0 % )。利用这些SSR ESTs序列共设计 135对cSSR引物 ,其中 82对在小麦上有扩增产物 ,占所设计引物总数的 6 0 8%。利用小麦缺体 四体 ,32对cSSR引物被定位到小麦除 2D、4B和 4D外的 18条染色体上。 展开更多
关键词 est SSR-ests cSSR引物 小麦
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香蕉EST-SSRs标记的开发与应用 被引量：38
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作者 王静毅 陈业渊 +1 位作者 刘伟良 武耀廷 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期933-940,共8页
从NCBI搜索的2282条香蕉EST中，发掘出含有SSR的EST序列110条，共有122个SSR位点，检出率为5.3％。SSR位点可分为37种重复单元，平均长度为20bp，其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位，分别占总SSR的33．1％和47．6％。GA和GAA是... 从NCBI搜索的2282条香蕉EST中，发掘出含有SSR的EST序列110条，共有122个SSR位点，检出率为5.3％。SSR位点可分为37种重复单元，平均长度为20bp，其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位，分别占总SSR的33．1％和47．6％。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型，分别占二、三核苷酸重复类型的75．7％和36．0％；其他重复类型所占比例均不足10％，而四核苷酸重复类型最少，为4．0％。设计的63对EST-SSRs引物中，有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物，占总引物数的65．1％。应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种（系）进行PCR扩增。每对51物扩增的多态性带数目为4～12个，平均7．58个；引物多态信息量变化范围为0．3572．0．8744，平均0．7324。在相似系数为0．63的水平可将49个品种聚为2个类群：一类为含B基因组香蕉品种；另一类为不合B基因组的香蕉品种，表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究。 展开更多
关键词 香蕉 est est-SSR 遗传多样性 聚类分析
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川党参转录组EST-SSR位点分析
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作者 蒋小刚 周武先 +2 位作者 王华 由金文 张美德 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期1132-1140,共9页
[目的]探究川党参转录组SSR位点信息和分布特征。[方法]对川党参叶片进行转录组测序,通过MISA软件鉴定川党参转录组序列SSR位点,并对含有SSR位点的Unigenes进行功能注释。采用Primer3.0设计EST-SSR引物,基于不同产地的川党参种质DNA模板... [目的]探究川党参转录组SSR位点信息和分布特征。[方法]对川党参叶片进行转录组测序,通过MISA软件鉴定川党参转录组序列SSR位点,并对含有SSR位点的Unigenes进行功能注释。采用Primer3.0设计EST-SSR引物,基于不同产地的川党参种质DNA模板,验证EST-SSR引物的扩增稳定性。[结果]从川党参转录组序列中共鉴定124179个Unigene,其中26084个Uni-gene序列包含35827个SSR位点,SSR发生频率为21.01%。这些SSR位点共有165种SSR重复基元类型,从重复基元分布比例来看,单核苷酸重复基元A/T占SSR位点总数比例最高,为37.59%;从核苷酸重复基元平均距离来看,五核苷酸平均距离最大,为1288.54kb;从基元重复次数比例来看,重复10次的最多,有7722个,占SSR总数的21.55%。川党参转录组SSR序列长度集中在12~19bp,共19628个,频率为54.79%,SSR长度在20bp以上的潜在多态性位点有6933个,占总数的19.35%。筛选出27对扩增稳定的SSR引物,对川党参基因组DNA进行扩增,扩增片段大小范围为124~393bp。基于不同产地川党参种质资源的基因组DNA模板,筛选了部分多态性标记,扩增条带清晰,多态性较好。此外对26084个含有SSR序列的Unigenes进行Go和KEGG注释,这些Unigenes极显著富集于转录调控、DNA结合、催化、信号转导等生物过程。[结论]川党参转录组SSR序列具有较高的潜能多态性,挖掘的潜能SSR标记将为川党参遗传多样性分析、种质鉴定、辅助育种等提供研究基础。 展开更多
关键词 川党参 转录组 功能注释 est-SSR 分子标记
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