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细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
李莎莎
陶佳
+4 位作者
吕咏雪
朱亚洲
赵殷奇
赵嘉庆
赵巍
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2022年第1期71-74,113,共5页
目的分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原Eg-00512的生物信息学特征。方法通过NCBI数据库获取Eg-00512蛋白的氨基酸序列;使用ProtParam在线软件分析Eg-00512蛋白的理化性质;采用SOMPA在线软件分析蛋白的二级结构;使用IEDB在线软件预测Eg-0...
目的分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原Eg-00512的生物信息学特征。方法通过NCBI数据库获取Eg-00512蛋白的氨基酸序列;使用ProtParam在线软件分析Eg-00512蛋白的理化性质;采用SOMPA在线软件分析蛋白的二级结构;使用IEDB在线软件预测Eg-00512蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性、β-转角;应用SWISS-MODEL在线服务器分析蛋白氨基酸序列并组合模板和Eg-00512蛋白的三级结构;B细胞表位采用在线软件IEDB及BcePred综合预测,T细胞表位采用在线预测软件SYFPEITHI分析确定。结果Eg-00512蛋白由1254个氨基酸组成,理论pI值6.15;归类于稳定蛋白质,属于亲水性蛋白。Eg-00512蛋白的二级结构中α螺旋占51.28%,延伸链占17.22%,β-转角占4.78%,无规卷曲占26.71%。Eg-00512蛋白B细胞表位数量各为8个;有13个CTL和14个Th细胞优势表位。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫原头节含有多个优势B、T细胞抗原表位,为包虫病的诊断和疫苗的研究奠定了理论基础。
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关键词
细粒棘球绦虫
eg-00512蛋白
生物信息学分析
抗原表位
原文传递
包虫病诊断抗原分子Eg-00512的筛选、重组表达及抗原性鉴定
被引量：
5
2
作者
佟雪琪
赵殷奇
+7 位作者
李子华
朱明星
王浩
赵嘉庆
宋佳卉
牛楠
徐士梅
赵巍
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第1期46-50,共5页
目的筛选细粒棘球绦虫原头蚴抗原分子Eg-00512,并进行重组表达、纯化及免疫特性鉴定,以期作为棘球蚴病特异性诊断抗原。方法对国家人类基因组南方研究中心(CHGCS)发表的细粒棘球绦虫4个不同发育阶段的表达谱数据进行差异比较分析,筛选...
目的筛选细粒棘球绦虫原头蚴抗原分子Eg-00512,并进行重组表达、纯化及免疫特性鉴定,以期作为棘球蚴病特异性诊断抗原。方法对国家人类基因组南方研究中心(CHGCS)发表的细粒棘球绦虫4个不同发育阶段的表达谱数据进行差异比较分析,筛选仅在原头蚴阶段特异表达的基因Eg-00512;利用DNAStar软件包对其编码蛋白Eg-00512进行抗原表位分析;选取合适的序列片段作为目的片段,构建基因工程菌株Eg-00512/pET-24a/BL-21,经诱导表达、纯化获得重组蛋白rEg-00512。将BALB/c小鼠随机分为免疫组、佐剂对照组、PBS对照组,分别经皮下多点注射重组蛋白、PBS+弗氏佐剂和PBS,2周后加强免疫一次。分别于免疫前,第一次免疫后2、4周每组小鼠尾静脉采血,免疫后5周摘眼球法采血,采用ELISA检测各时间点血清中特异性IgG抗体水平变化;以该血清为一抗,采用Western blot分析重组蛋白的免疫反应性。结果筛选出仅在细粒棘球蚴原头蚴阶段高表达的Eg-00512基因。该基因编码203个氨基酸,分子质量单位为23ku,其抗原表位主要位于1-15、55-93、111-119、126-149、166-194和199-202氨基酸残基及其附近。成功构建基因工程菌株Eg-00512/pET-24a/BL-21,经IPTG诱导表达重组蛋白rEg-00512。重组蛋白rEg-00512纯化后免疫小鼠诱导产生特异性IgG抗体,其中免疫5周时抗体达最高水平A450值为1.807±0.767,与佐剂对照组0.111±0.014和PBS对照组0.132±0.0246比较差异有统计学意义(P<0.01)。Western blot显示,该重组抗原可被免疫鼠抗血清及细粒棘球蚴原头蚴感染鼠血清识别,而不与正常小鼠血清反应。结论成功筛选并获得重组蛋白rEg-00512,该蛋白具有较好的抗原性,可作为棘球蚴病免疫诊断候选抗原。
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关键词
细粒棘球绦虫
生物信息学
重组
蛋白
r
eg-
00512
免疫原性
原文传递
题名
细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
李莎莎
陶佳
吕咏雪
朱亚洲
赵殷奇
赵嘉庆
赵巍
机构
宁夏医科大学基础医学院
宁夏医科大学总医院
宁夏常见传染病防治重点实验室
宁夏医学科学研究所
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2022年第1期71-74,113,共5页
基金
宁夏回族自治区重点研发计划项目(No.2019BCG01001)
宁夏自然科学基金项目(No.2020AAC02039)。
文摘
目的分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原Eg-00512的生物信息学特征。方法通过NCBI数据库获取Eg-00512蛋白的氨基酸序列;使用ProtParam在线软件分析Eg-00512蛋白的理化性质;采用SOMPA在线软件分析蛋白的二级结构;使用IEDB在线软件预测Eg-00512蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性、β-转角;应用SWISS-MODEL在线服务器分析蛋白氨基酸序列并组合模板和Eg-00512蛋白的三级结构;B细胞表位采用在线软件IEDB及BcePred综合预测,T细胞表位采用在线预测软件SYFPEITHI分析确定。结果Eg-00512蛋白由1254个氨基酸组成,理论pI值6.15;归类于稳定蛋白质,属于亲水性蛋白。Eg-00512蛋白的二级结构中α螺旋占51.28%,延伸链占17.22%,β-转角占4.78%,无规卷曲占26.71%。Eg-00512蛋白B细胞表位数量各为8个;有13个CTL和14个Th细胞优势表位。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫原头节含有多个优势B、T细胞抗原表位,为包虫病的诊断和疫苗的研究奠定了理论基础。
关键词
细粒棘球绦虫
eg-00512蛋白
生物信息学分析
抗原表位
Keywords
Echinococcus granulosus
eg-
00512
protein
bioinformatics analysis
epitope
分类号
R383.3 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
包虫病诊断抗原分子Eg-00512的筛选、重组表达及抗原性鉴定
被引量：
5
2
作者
佟雪琪
赵殷奇
李子华
朱明星
王浩
赵嘉庆
宋佳卉
牛楠
徐士梅
赵巍
机构
宁夏医科大学临床医学院检验系
宁夏医科大学包虫病实验室
宁夏医科大学科技中心
宁夏医科大学基础医学院
宁夏医科大学基础医学院病原与免疫教研室
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第1期46-50,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.81360249)
文摘
目的筛选细粒棘球绦虫原头蚴抗原分子Eg-00512,并进行重组表达、纯化及免疫特性鉴定,以期作为棘球蚴病特异性诊断抗原。方法对国家人类基因组南方研究中心(CHGCS)发表的细粒棘球绦虫4个不同发育阶段的表达谱数据进行差异比较分析,筛选仅在原头蚴阶段特异表达的基因Eg-00512;利用DNAStar软件包对其编码蛋白Eg-00512进行抗原表位分析;选取合适的序列片段作为目的片段,构建基因工程菌株Eg-00512/pET-24a/BL-21,经诱导表达、纯化获得重组蛋白rEg-00512。将BALB/c小鼠随机分为免疫组、佐剂对照组、PBS对照组,分别经皮下多点注射重组蛋白、PBS+弗氏佐剂和PBS,2周后加强免疫一次。分别于免疫前,第一次免疫后2、4周每组小鼠尾静脉采血,免疫后5周摘眼球法采血,采用ELISA检测各时间点血清中特异性IgG抗体水平变化;以该血清为一抗,采用Western blot分析重组蛋白的免疫反应性。结果筛选出仅在细粒棘球蚴原头蚴阶段高表达的Eg-00512基因。该基因编码203个氨基酸,分子质量单位为23ku,其抗原表位主要位于1-15、55-93、111-119、126-149、166-194和199-202氨基酸残基及其附近。成功构建基因工程菌株Eg-00512/pET-24a/BL-21,经IPTG诱导表达重组蛋白rEg-00512。重组蛋白rEg-00512纯化后免疫小鼠诱导产生特异性IgG抗体,其中免疫5周时抗体达最高水平A450值为1.807±0.767,与佐剂对照组0.111±0.014和PBS对照组0.132±0.0246比较差异有统计学意义(P<0.01)。Western blot显示,该重组抗原可被免疫鼠抗血清及细粒棘球蚴原头蚴感染鼠血清识别,而不与正常小鼠血清反应。结论成功筛选并获得重组蛋白rEg-00512,该蛋白具有较好的抗原性,可作为棘球蚴病免疫诊断候选抗原。
关键词
细粒棘球绦虫
生物信息学
重组
蛋白
r
eg-
00512
免疫原性
Keywords
Echinococcus granulosus
bioinformatics
recombinant protein r
eg-
00512
immunogenicity
分类号
R532.32 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析
李莎莎
陶佳
吕咏雪
朱亚洲
赵殷奇
赵嘉庆
赵巍
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2022
3
原文传递
2
包虫病诊断抗原分子Eg-00512的筛选、重组表达及抗原性鉴定
佟雪琪
赵殷奇
李子华
朱明星
王浩
赵嘉庆
宋佳卉
牛楠
徐士梅
赵巍
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017
5
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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