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新疆株细粒棘球绦虫不同发育阶段95抗原基因克隆及序列分析 被引量:23
1
作者 林仁勇 丁剑冰 +3 位作者 温浩 张文宝 李君 卢晓梅 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期170-172,共3页
目的 研究细粒棘球绦虫95抗原(Eg95)基因在新疆株细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达及其基因序列差异。方法 根据Eg95基因序列设计引物,用PCR方法分别从新疆株细粒棘球绦虫3个不同发育阶段(原头蚴、六钩蚴和成虫)所构建的cDNA文库中克隆获... 目的 研究细粒棘球绦虫95抗原(Eg95)基因在新疆株细粒棘球绦虫不同发育阶段的表达及其基因序列差异。方法 根据Eg95基因序列设计引物,用PCR方法分别从新疆株细粒棘球绦虫3个不同发育阶段(原头蚴、六钩蚴和成虫)所构建的cDNA文库中克隆获得Eg95目的基因,将其克隆至pUCm-T载体、测序并进行序列分析。结果从3个不同发育阶段的新疆株细粒棘球绦虫cDNA文库中均克隆出Eg95基因,其基因片段长度为402bp,同源性比对分析(BLAST)结果表明,所克隆的新疆株Eg95基因与GenBank中的Eg95基因序列一致。结论 Eg95基因在新疆株细粒棘球绦虫不同发育阶段均有表达,其基因序列无差异。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 95抗原基因 克隆 序列分析 棘球蚴病
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细粒棘球绦虫EG95基因的克隆和序列分析 被引量:5
2
作者 郭中敏 陆家海 +2 位作者 陈慧红 徐劲 余新炳 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2003年第6期35-37,13,共4页
目的 获得细粒棘球蚴EG95基因序列资料 ,进行序列分析 ,为研究包虫病疫苗候选抗原基因奠定基础。方法 从包囊内获取细粒棘球蚴原头蚴 (protoscoleces) ,提取RNA和DNA ,用特异引物分别以基因组DNA和cDNA为模板扩增EG95基因 ;并将其克隆... 目的 获得细粒棘球蚴EG95基因序列资料 ,进行序列分析 ,为研究包虫病疫苗候选抗原基因奠定基础。方法 从包囊内获取细粒棘球蚴原头蚴 (protoscoleces) ,提取RNA和DNA ,用特异引物分别以基因组DNA和cDNA为模板扩增EG95基因 ;并将其克隆到T载体后进行序列测定和分析。结果 以基因组为模板获得一个基因 ,长度为 12 5 3bp ,以cDNA为模板获得两个基因 ,长度分别为 112 1bp和 833bp ;同源性比较结果表明 :来自新疆羊源EG95基因序列和澳大利亚羊源EG95 2基因同源性为 98% ,有 13个碱基变异 ;从cDNA获得的EG95基因 (EG95 -like)和DNA来源的EG95相同 ,只是EG95序列的一部分 ;从cDNA获得的另一个EG95基因 (mEG95 )和澳大利亚源EG95 2同源性为 99% ,有 2个碱基不同。分析表明EG95是一个基因家族 ,可能是虫体发育到六沟蚴阶段特定表达的基因。结论 EG95是一个基因家族 ,进一步研究该基因家族的结构和功能对包虫病的免疫预防具有重要意义。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 eg95 基因克隆 基因序列 包虫病
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青海省羊源细粒棘球蚴EG95基因的克隆与序列分析 被引量:8
3
作者 韩秀敏 史大中 +2 位作者 贾万忠 杨永海 王虎 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2004年第1期17-21,共5页
从青海省羊源细粒棘球蚴中提取基因组DNA ,用EG95特异性引物进行PCR扩增 ,并克隆至 pGEM TEasy载体上 ,经PCR、EcoRⅠ酶切和测序鉴定后 ,用DNAstar软件对 3个克隆的DNA序列进行同源性分析。结果表明 ,EG95基因的 3个序列 (EG95 QH 1、E... 从青海省羊源细粒棘球蚴中提取基因组DNA ,用EG95特异性引物进行PCR扩增 ,并克隆至 pGEM TEasy载体上 ,经PCR、EcoRⅠ酶切和测序鉴定后 ,用DNAstar软件对 3个克隆的DNA序列进行同源性分析。结果表明 ,EG95基因的 3个序列 (EG95 QH 1、EG95 QH 2和EG95 QH 3)的片段大小为 14 35~ 14 37bp ,与GenBank中的EG95基因同源性为 73.2 %~99.2 % ,差异集中在内含子区域。其中EG95 QH 1、EG95 QH 3与GenBankEG95XJ ag、EG95 4序列的同源性较高 ;EG95 QH 2与GenBank中EG95 1、EG95 2、EG95 3序列的同源性较高。研究结果表明 ,青海羊源细粒棘球蚴EG95基因的 3个序列为EG95基因家族的成员。 展开更多
关键词 青海 细粒棘球蚴 eg95基因 克隆 序列分析 DNA 同源性分析 包虫病 棘球蚴病
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新疆棘球蚴Eg95基因的克隆与序列分析
4
作者 朱维 简子健 《新疆农业大学学报》 CAS 2007年第4期41-45,共5页
从新疆地区细粒棘球蚴原头节中提取基因组DNA,以细粒棘球蚴原头节DNA为模板,用Eg95特异性引物进行PCR扩增,获得Eg95-XJ-1基因,并将其克隆至pGM-T载体,经PCR、酶切和测序鉴定后,发现新疆株Eg95-XJ-1基因片段为1304 bp。与Gene Bank中已知... 从新疆地区细粒棘球蚴原头节中提取基因组DNA,以细粒棘球蚴原头节DNA为模板,用Eg95特异性引物进行PCR扩增,获得Eg95-XJ-1基因,并将其克隆至pGM-T载体,经PCR、酶切和测序鉴定后,发现新疆株Eg95-XJ-1基因片段为1304 bp。与Gene Bank中已知的Eg95基因有86%-99%的同源性,其差异大都集中在内含子区;与青海株Eg95基因家族成员同源性最高达97%-99%。这些结果表明,这一新疆地区的Eg95-XJ-1基因为Eg95基因家族成员之一。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 eg95基因 克隆及序列分析
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新城疫病毒B_(95)株HN蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:6
5
作者 田兴华 陈燕军 +1 位作者 郝勤宗 裘孝良 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2003年第10期7-10,共4页
根据 NDV  HN蛋白已知基因序列设计一对引物 ,以提取的澳大利亚布里斯班 NDV分离株 B95基因组 RNA为模板 ,利用 RT- PCR技术扩增得到一条约 1.9kb的条带。将扩增产物克隆到 PGEM- T- easy载体中 ,并对重组质粒进行酶切分析、PCR鉴定 ,... 根据 NDV  HN蛋白已知基因序列设计一对引物 ,以提取的澳大利亚布里斯班 NDV分离株 B95基因组 RNA为模板 ,利用 RT- PCR技术扩增得到一条约 1.9kb的条带。将扩增产物克隆到 PGEM- T- easy载体中 ,并对重组质粒进行酶切分析、PCR鉴定 ,结果证明我们得到了 HN基因的阳性重组子 ,随后采用 Sanger's双脱氧末端终止法对阳性重组子进行核苷酸序列测定 ,获得该基因全长序列 ,并进行同源性分析。 B95株与其他毒株核苷酸同源性为 95 .1%~ 87% ,氨基酸同源性为96 .1%~ 92 .1%。 展开更多
关键词 新城疫病毒 B95 HN蛋白基因 克隆 序列分析 NDV RT—PCR 重组质粒 氨基酸 同源性分析 核苷酸
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细粒棘球蚴内蒙株疫苗候选基因EG95克隆 被引量:4
6
作者 李志伟 王志钢 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期56-57,共2页
目的克隆细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,并进行序列分析。方法根据GenBank中细粒棘球蚴EG95-1基因DNA序列设计引物,提取细粒棘球蚴基因组DNA,PCR扩增目的基因,目的基因克隆到pMD19-T载体,经PCR、酶切及测序鉴定后,进行序列分析。结果克隆到... 目的克隆细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,并进行序列分析。方法根据GenBank中细粒棘球蚴EG95-1基因DNA序列设计引物,提取细粒棘球蚴基因组DNA,PCR扩增目的基因,目的基因克隆到pMD19-T载体,经PCR、酶切及测序鉴定后,进行序列分析。结果克隆到的EG95-NM基因序列长1262bp,与EG95-1基因DNA序列同源性为98%。结论克隆到细粒棘球蚴内蒙株EG95基因,序列分析表明,EG95-NM基因属于EG95基因家族并具有地理株特点。 展开更多
关键词 细粒棘球蚴 eg95基因 序列分析
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细粒棘球绦虫重组CTxB-Eg95(TP)融合蛋白的原核表达 被引量:2
7
作者 王志力 王亚军 +2 位作者 谢忠奎 郭志鸿 张玉宝 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期360-364,共5页
目的构建CTxB-Eg95(TP)融合基因原核表达载体,并诱导表达CTxB-Eg95(TP)融合蛋白。方法采用PCR技术分别克隆CTxB基因和141bp的Eg95基因片段序列Eg95(TP)并鉴定。分别将两个基因片段定向克隆到大肠杆菌表达载体pET28a(+)中,构建pET-CTxB-E... 目的构建CTxB-Eg95(TP)融合基因原核表达载体,并诱导表达CTxB-Eg95(TP)融合蛋白。方法采用PCR技术分别克隆CTxB基因和141bp的Eg95基因片段序列Eg95(TP)并鉴定。分别将两个基因片段定向克隆到大肠杆菌表达载体pET28a(+)中,构建pET-CTxB-Eg95(TP)重组质粒。将鉴定为阳性的重组质粒转化E.coliBL21(DE3)感受态细胞,经IPTG诱导后,进行SDS-PAGE电泳鉴定。结果测序结果表明已成功构建CTxB-Eg95(TP)融合基因的原核表达载体,SDS-PAGE电泳结果显示,转染pET-CTxB-Eg95(TP)的E.coliBL21(DE3)菌经IPTG诱导可表达大小约23.5kDa的特异蛋白条带,与预期结果一致。结论CTxB-Eg95(TP)融合基因获得了高水平的表达,为Eg95的表位研究和应用于口服疫苗奠定了基础。 展开更多
关键词 eg95(tp)基因序列 霍乱毒素B亚单位 融合基因 原核表达
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TP-M13自动荧光检测法在高粱SSR基因型鉴定中的应用 被引量:27
8
作者 李会勇 王天宇 +3 位作者 黎裕 石云素 宋燕春 陆平 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第1期68-70,共3页
研究利用TP-M13自动荧光检测法对48份高粱材料进行了简单序列重复(SSR)标记的基因型鉴定。在这个方法中,需要合成一个普适性的用荧光(如FAM)标记的M13引物,并把M13的正向引物和一个SSR反向引物相连(称为TP-M13引物),利用3条引物序列进行... 研究利用TP-M13自动荧光检测法对48份高粱材料进行了简单序列重复(SSR)标记的基因型鉴定。在这个方法中,需要合成一个普适性的用荧光(如FAM)标记的M13引物,并把M13的正向引物和一个SSR反向引物相连(称为TP-M13引物),利用3条引物序列进行PCR扩增,其PCR产物在DNA测序仪(如ABI3700仪)上进行自动荧光检测。结果表明,这种方法和其他的传统方法相比,具有经济、灵敏、高效的优点。建议在利用数量很多的SSR标记对数量有限的基因组较小的材料进行基因型鉴定时,使用TP-M13自动荧光检测系统。 展开更多
关键词 荧光检测法 自动 应用 定中 高梁 简单序列重复 DNA测序仪 荧光检测系统 基因型鉴定 PCR扩增 PCR产物 SSR标记 研究利用 引物序列 传统方法 tp 普适性 基因 材料
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TP53基因突变参与成人肝脏未分化(胚胎)肉瘤的生成,不同于Wnt和端粒酶途径:3例病例的免疫组化研究及2例病例的基因相关研究 被引量:5
9
作者 Lepreux S. Rebouissou S. +2 位作者 Le Bail B. P. Bioulac- Sage 王铮 《世界核心医学期刊文摘(胃肠病学分册)》 2005年第7期54-54,共1页
Background/Aims: Hepatic undifferentiated (embryonal) sarcoma (HUS) is an exc eptional hepatic malignant tumor in adults. Genetic studies were never reported in adult cases. Methods: In this study concerning three cas... Background/Aims: Hepatic undifferentiated (embryonal) sarcoma (HUS) is an exc eptional hepatic malignant tumor in adults. Genetic studies were never reported in adult cases. Methods: In this study concerning three cases of HUS occurring i n adult, we studied the three classical ways of carcinogenesis i.e. the TP53 (p5 3), Wnt (CTNNB1/β - catenin and AXIN1) and telomerase (hTERT) pathways. We stu died the expression of p53, β - catenin and telomerase catalytic subunit hTERT by immunohistochemistry in the three cases; we determined TP53 gene mutation in two cases and the genome- wide allelotype, AXIN1, and CTNNB1/β - catenin gen e mutation in one case. Results: Immunohistochemistry showed an overexpression o f p53 in more than 80% of tumoral cells; furthermore, mutations of TP53 were o bserved in two cases, involving the sequence- specific DNA binding domain. In c ontrast, no mutation was found in CTNNB1/β - catenin and AXIN1 genes. Tumoral cells did not show hTERT staining nor nuclear expression of β - catenin. In ad dition, allelotype analysis in one case showed loss of heterozygosity of chromos ome 7p, 11p, 17p, 22q, and allelic imbalance of 1p, 8p, 20q. Conclusions: In thi s report of HUS in three adult patients, we emphasize the role of TP53 pathway i n carcinogenesis of this rare tumor. This point could be of interest for therape utic strategies. 展开更多
关键词 端粒酶途径 tp53基因 WNT 成人肝脏 基因突变 免疫组化研究 肝脏恶性肿瘤 β-连环蛋白 等位基因失衡 序列特异性
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牛Fas基因的组织表达分析及其功能预测 被引量:1
10
作者 杨润军 张小辉 +2 位作者 李俊雅 高雪 许尚忠 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2009年第19期1-6,共6页
采用RT-PCR技术从中国西门塔尔牛睾丸组织总RNA中反转录FascDNA,将其克隆于pMD19-Tvector后进行测序分析,并对其表达的蛋白结构功能进行预测、分析。结果表明:牛的FascDNA序列为1109bp,编码323个氨基酸残基,在氨基酸序列上与羊、猪、人... 采用RT-PCR技术从中国西门塔尔牛睾丸组织总RNA中反转录FascDNA,将其克隆于pMD19-Tvector后进行测序分析,并对其表达的蛋白结构功能进行预测、分析。结果表明:牛的FascDNA序列为1109bp,编码323个氨基酸残基,在氨基酸序列上与羊、猪、人、小鼠的相似性分别为90.5%、65.3%、56.7%和48.6%。Fas蛋白的胞外区有2个糖基化位点和3个富含半胱氨酸残基的结构亚域,对Fas蛋白的定位及凋亡信号识别有重要作用。牛与羊、猪、人、小鼠Fas的死亡结构域(Death domain,DD)氨基酸序列的相似性分别为94.3%、68.5%、59.6%和70.8%,体现了该结构在各物种间较强的保守性及接受凋亡信号诱导靶细胞凋亡的重要性。组织表达谱发现,Fas不仅表达于牛的淋巴、脾等淋巴系统,而且高表达于牛生殖系统的睾丸中,这对于进一步阐明Fas在公牛精子发生过程中的调控作用奠定基础。 展开更多
关键词 Fas/APO-1/CD95 基因克隆 序列分析
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新城疫病毒B_(95)株的RT-PCR检测
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作者 申之义 苗儒 +3 位作者 王俊平 焦静波 信洪一 李平安 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期8-9,共2页
根据文献发表的 F基因序列 ,设计了 1对新城疫病毒 B95株的特异引物 NDV- P1 / P2 ,探讨了以其进行 RT- PCR检测的可行性。结果证明 ,用该引物可以扩增出 1条 310 bp的特异核酸带 ,敏感性为 0 .0 0 4 3mg/ L。
关键词 新城疫病毒 B95 RT—PCR检测 特异核酸带 F基因序列
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基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法 被引量:2
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作者 魏然 柯吴坚 +8 位作者 陈文韬 谭玲俏 刘雅慧 吕萍 黄涛 张君 张晓辉 王柳苑 车雅敏 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期546-550,共5页
目的基于苍白密螺旋体属(TP)TP0136蛋白的异质性,建立一种新的TP分子分型方法。方法从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体(TPA)、3株雅司苍白密螺旋体(TPE)、1株未分类的类人猿密螺旋体(FB)和1株地方密螺旋体(TEN)的TP0136开放阅读框(ORF... 目的基于苍白密螺旋体属(TP)TP0136蛋白的异质性,建立一种新的TP分子分型方法。方法从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体(TPA)、3株雅司苍白密螺旋体(TPE)、1株未分类的类人猿密螺旋体(FB)和1株地方密螺旋体(TEN)的TP0136开放阅读框(ORF)氨基酸序列并进行多重序列比对,得出TP0136蛋白分子分型结果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法,对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类,并将分型结果与传统的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法进行比较。结果TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性,根据TP0136氨基酸序列,TPE、FB和TEN分为Ⅰ~Ⅳ4个亚型,TPA分为Ⅴ~Ⅹ6个亚型,TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ4个亚型。通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。将TP0136分型法与传统分型法相结合,可将上述临床株进一步细分为10型,其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型。结论TP0136分子分型方法可用于TP种的区分,有助于传统TPA分子分型的进一步完善。 展开更多
关键词 密螺旋体属 梅毒 基因分型技术 序列分析 蛋白质 tp0136
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梅毒螺旋体Gpd重组蛋白的表达 被引量:3
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作者 严加林 吴移谋 +1 位作者 赵飞骏 刘双全 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期301-302,共2页
随着基因工程技术的迅速发展和梅毒螺旋体(TP)全基因序列的解析,通过重组技术已制备多种重组Tp抗原,并被广泛应用于梅毒血清学检测的研究和试剂盒的开发,但对于哪一种Tp蛋白抗原亿临床各期梅毒的血清学诊断中具有更高的特异性和敏... 随着基因工程技术的迅速发展和梅毒螺旋体(TP)全基因序列的解析,通过重组技术已制备多种重组Tp抗原,并被广泛应用于梅毒血清学检测的研究和试剂盒的开发,但对于哪一种Tp蛋白抗原亿临床各期梅毒的血清学诊断中具有更高的特异性和敏感性尚无一致观点。我们应用软件筛选分析,选取抗原性较啦的Tp外膜蛋白Gpd进行克隆表达。并以重组蛋白为包被抗原,建立间接ELISA法,评价其在悔毒血清学诊断中的应用价值。 展开更多
关键词 梅毒螺旋体 重组蛋白 间接ELISA法 梅毒血清学检测 血清学诊断 基因工程技术 重组tp抗原 基因序列
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