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猪圆环病毒2型诱发肠炎与非编码RNA的研究
1
作者 张莉 方满新 +2 位作者 钟可欣 谭思敏 邓治邦 《上海畜牧兽医通讯》 2024年第1期1-5,共5页
本文综述了PCV 2诱发肠炎的研究现状,阐述了miRNA、circRNA和lncRNA等作用机制及在炎症性疾病中的作用,进一步介绍了PCV 2感染对非编码RNA表达影响的相关研究,以期为探索PCV 2相关性肠炎的发病机制提供思路。
关键词 猪圆环病毒2型 非编码rna 肠炎
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非编码RNA在传染性法氏囊病病毒感染中的研究进展
2
作者 刘伟烨 黄雪伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1488-1498,共11页
传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“... 传染性法氏囊病(infectious bursal disease, IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBD virus, IBDV)引起的急性、高度传染性和免疫抑制性禽类疾病。近年来,随着新型变异毒株的出现,IBDV仍然威胁着全球家禽养殖业的健康发展,宿主和IBDV之间的“战役”似乎永不停息。因此,迫切需要制定一种更全面和更有效的策略来控制该疾病,而深入了解IBDV与宿主之间的相互作用,将有助于开发新型疫苗。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNAs)是一类丰富的不编码蛋白质的RNA分子,其中包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)和环状RNA(circular RNA,circRNAs)。近年来,研究发现ncRNAs广泛参与IBDV与宿主的相互作用过程,在IBDV感染中发挥重要的调控作用。本文阐述了宿主miRNAs、lncRNAs和circRNAs在IBDV感染中的作用,以期为IBDV的感染与致病机制研究提供理论参考和新思路。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 非编码rna MIrna lncrna circrna
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血清长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8与微小RNA-21水平在高危型人乳头瘤病毒阳性患者中的表达及对宫颈癌的诊断价值
3
作者 李云宝 底琳 +1 位作者 孙艳 程志 《中国临床保健杂志》 CAS 2024年第4期538-542,共5页
目的探析血清长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8(lncRNA SNHG8)、微小RNA-21(miR-21)在高危型人乳头瘤病毒(HPV)阳性患者对宫颈癌的诊断价值及经扶正清毒颗粒治疗后的表达变化。方法回顾性分析2021年1月至2022年11月枣庄市妇幼保健院收治... 目的探析血清长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因8(lncRNA SNHG8)、微小RNA-21(miR-21)在高危型人乳头瘤病毒(HPV)阳性患者对宫颈癌的诊断价值及经扶正清毒颗粒治疗后的表达变化。方法回顾性分析2021年1月至2022年11月枣庄市妇幼保健院收治的160例高危型HPV阳性患者病历资料,收集患者临床资料,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测血清lncRNA SNHG8、miR-21表达水平。所有患者均接受扶正清毒颗粒治疗,停药6月后随访,根据预后结局分为宫颈癌组(34例)、非宫颈癌组(126例)。对比高危型HPV阳性患者治疗前后血清lncRNA SNHG8、miR-21水平和不同预后结局高危型HPV阳性患者临床特征;多因素logistic分析高危型HPV阳性患者治疗后发生宫颈癌的独立影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA SNHG8、miR-21对高危型HPV阳性患者发生宫颈癌的预测价值。结果治疗后高危型HPV阳性患者血清lncRNA SNHG8、miR-21水平均低于治疗前(P<0.05)。对比不同预后结局患者高危型HPV阳性患者的绝经情况、分娩史、HPV分型资料,差异无统计学意义(P>0.05);而年龄、血清lncRNA SNHG8、miR-21表达,差异有统计学意义(P<0.05)。logistic回归分析结果显示年龄、血清lncRNA SNHG8、miR-21均为高危型HPV阳性患者治疗后发生宫颈癌的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线结果显示,血清lncRNA SNHG8、miR-21联合预测高危型HPV阳性患者发生宫颈癌的曲线下面积为0.847,高于单一生物标志物(lncRNA SNHG8、miR-21),P<0.05,其灵敏度、特异度分别为83.52%、86.41%。结论血清lncRNA SNHG8、miR-21为高危型HPV阳性患者宫颈癌独立影响因素,可用于高危型HPV阳性患者疗效及宫颈癌发病风险的评估,且联合应用效能更高。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 宫颈肿瘤 rna 长链非编码 危险因素
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人乳头瘤病毒16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA表达水平及其与乳腺癌分子分型和预后关系
4
作者 钱烨 张燕 +3 位作者 鲁小敏 吉浩明 徐榕蔓 储建华 《肿瘤综合治疗电子杂志》 2024年第1期122-127,共6页
目的 分析人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA(NF-κB interacting long non-coding RNA,NKILA)表达情况及其与乳腺癌分子分型、预后的相关性。方法 选取2016年1月至2... 目的 分析人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16/18型感染乳腺癌患者病灶核因子κB相互作用的长链非编码RNA(NF-κB interacting long non-coding RNA,NKILA)表达情况及其与乳腺癌分子分型、预后的相关性。方法 选取2016年1月至2018年1月南通大学附属海安医院收治的334例乳腺癌患者(观察组)和50例乳腺良性疾病患者(对照组)作为研究对象,对观察组患者肿瘤组织、癌旁组织和对照组患者病灶组织标本进行NKILA表达检测,并检测血清指标水平。分析两组NKILA表达情况与血清学指标的相关性,比较不同HPV分型感染情况、不同分子分型、不同预后患者病灶NKILA表达差异。结果 观察组患者肿瘤组织NKILA相对表达量显著低于癌旁组织(P <0.05),癌旁组织NKILA相对表达量显著低于对照组(P <0.05)。HPV 16/18型感染组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著低于非HPV16/18型感染组(均P <0.05)。Luminal A型组、Luminal B型组患者肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均显著高于人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor-2,HER-2)过表达型组(均P <0.05),HER-2过表达型组肿瘤组织NKILA相对表达量显著高于三阴性组(P <0.05)。复发转移组肿瘤组织NKILA相对表达量、NKILA高表达率均低于未复发转移组(均P <0.05)。NKILA低表达组3年无复发转移率显著低于NKILA高表达组[24.7%(36/146)∶40.0%(58/145),P <0.05]。结论 相比乳腺癌旁组织和良性疾病病灶,乳腺癌患者病灶NKILA表达下降,且HPV 16/18型感染者、三阴性乳腺癌者和术后复发转移者病灶NKILA表达下降更为明显,NKILA低表达与患者术后复发转移相关。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 乳腺癌 核因子κB相互作用的长非编码rna 分子分型 预后
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局部复发鼻咽癌患者的临床特征及癌组织Ki-67与Epstein-Barr病毒编码小RNA的表达水平 被引量：3
5
作者 李冰 翁敬锦 +2 位作者 韦嘉章 兰桂萍 司勇锋 《广西医学》 CAS 2018年第11期1164-1167,共4页
目的探讨局部复发鼻咽癌患者的临床特征及癌组织Ki-67与Epstein-Barr病毒编码小RNA(EBER)的表达水平。方法纳入53例局部复发的鼻咽癌患者,比较其初治及复发时的临床特征,分别用免疫组织化学和原位杂交技术检测初治及复发时组织标本中Ki... 目的探讨局部复发鼻咽癌患者的临床特征及癌组织Ki-67与Epstein-Barr病毒编码小RNA(EBER)的表达水平。方法纳入53例局部复发的鼻咽癌患者,比较其初治及复发时的临床特征,分别用免疫组织化学和原位杂交技术检测初治及复发时组织标本中Ki-67和EBER的表达情况,并观察组织病理特征。结果局部复发和初治时鼻咽癌的原发肿瘤-区域淋巴结-远处转移(TNM)分期及T分期比较差异无统计学意义(P>0.05),患者复发时N1+N2+N3期比例低于初治时比例(P<0.05);初治及局部复发性鼻咽癌组织Ki-67的表达比较差异无统计学意义(P>0.05);Ki-67阳性的局部复发性鼻咽癌患者,不同复发时间其Ki-67表达差异无统计学意义(P>0.05)。局部复发性鼻咽癌组织中EBER表达强度弱于初治鼻咽癌(P<0.01)。结论与初发时相比,局部复发鼻咽癌患者远处转移倾向小,肿瘤细胞增殖能力相似,但EBER表达下降,应考虑手术治疗。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 局部复发 临床特征 epstein-barr病毒编码的小rna KI-67
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猪繁殖与呼吸综合征病毒感染Marc-145细胞的长链非编码RNA和mRNA转录组分析 被引量：1
6
作者 张小霞 杨艳青 +3 位作者 王秋云 杜俊阳 曹瀚文 梁振普 《河南农业科学》 北大核心 2023年第4期127-136,共10页
为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析。生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差... 为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析。生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差异表达lncRNA(DElncRNA)和1320个差异表达mRNA(DEG)。进一步的富集分析结果显示,这些DElncRNA和DEG主要富集在氧化磷酸化信号通路。DElncRNA和DEG的联合分析结果显示,与lncRNA共表达的mRNA主要富集在MAPK信号通路、胰岛素信号通路、神经营养素信号通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路、内质网中的蛋白质加工和碳代谢相关的信号通路,这些通路主要与宿主免疫有关。综上,PRRSV感染导致Marc-145细胞的lncRNA和mRNA表达谱均发生了改变,经生物信息学分析,推测差异表达产物可能在宿主对PRRSV感染的先天免疫反应中发挥重要作用。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 长链非编码rna Mrna MARC-145细胞 转录组
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禽传染性支气管炎病毒非编码RNA调控芳烃受体及其信号通路相关基因的表达
7
作者 方守国 张明静 《长江大学学报（自然科学版）》 2023年第2期130-134,共5页
为了探究禽传染性支气管炎病毒非编码RNA对芳烃受体(AhR)及其信号通路相关基因表达的调控作用,将rIBV和rIBV-C27107G分别感染H1299细胞16 h后,用qRT-PCR检测AhR及其通路相关基因的表达水平,并用Western blot检测AhR蛋白的丰度。结果显示... 为了探究禽传染性支气管炎病毒非编码RNA对芳烃受体(AhR)及其信号通路相关基因表达的调控作用,将rIBV和rIBV-C27107G分别感染H1299细胞16 h后,用qRT-PCR检测AhR及其通路相关基因的表达水平,并用Western blot检测AhR蛋白的丰度。结果显示,不产生ncRNA的IBV感染可激活AhR信号通路,诱导H1299细胞产生抗病毒反应,而IBV编码的ncRNA抑制AhR信号通路的激活,从而抑制细胞因子IL-6、IL-8和IL-12β的上调表达,利于病毒的复制。 展开更多
关键词 禽传染性支气管炎病毒 非编码rna 芳烃受体(AhR) 基因表达
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长链非编码RNA(lncRNA)-MSTRG.22610.1对BHV-1体外复制影响的研究
8
作者 姜坤生 王禹淳 +2 位作者 马金柱 于立权 宋佰芬 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期278-284,299,共8页
本研究室前期将牛疱疹病毒Ⅰ型(BHV-1)感染牛肾细胞(MDBK),通过转录组测序筛选到了转录显著差异的长链非编码RNA-MSTRG.22610.1(lncRNA-MSTRG.22610.1),为了探究其在MDBK中对BHV-1复制的影响,本研究采用CCK-8法筛选对细胞无毒性的聚凝... 本研究室前期将牛疱疹病毒Ⅰ型(BHV-1)感染牛肾细胞(MDBK),通过转录组测序筛选到了转录显著差异的长链非编码RNA-MSTRG.22610.1(lncRNA-MSTRG.22610.1),为了探究其在MDBK中对BHV-1复制的影响,本研究采用CCK-8法筛选对细胞无毒性的聚凝胺、嘌呤霉素的最佳浓度;将重组慢病毒r ZHLV-U6-Zs Green1-puro-MSTRG.22610.1和r ZHLV-U6-Zs Green1-puro(对照慢病毒)按照不同的MOI分别感染MDBK细胞,48 h后观察荧光,采用Image J软件检测并计算各慢病毒感染细胞后出现绿色荧光细胞的比率,出现绿色荧光细胞的比率达80%的细胞对应的MOI即为最佳MOI。筛选结果显示聚凝胺与嘌呤霉素的最佳工作浓度分别为5μg/mL及3μg/m L,慢病毒感染的最适MOI为80。将r ZHLV-U6-Zs Green1-puro-MSTRG.22610.1和对照慢病毒分别以最佳条件感染MDBK细胞并培养及传代,传至8~10代,每代均观察细胞形态及细胞中的绿色荧光,并通过RT-q PCR检测第6、8、10代细胞中lncRNA-MSTRG.22610.1的转录水平,以构建并鉴定稳定表达lncRNA-MSTRG.22610.1的MDBK细胞系1T及对照细胞系1NC。结果显示,每代1T细胞、1NC细胞的状态均良好并均与阴性对照MDBK细胞的形态无差别,且每代1T及1NC细胞均出现绿色荧光。RT-q PCR结果显示,与1NC及阴性对照细胞相比,1T细胞系中lncRNA-MSTRG.22610.1的转录水平极显著升高(P<0.0001)。表明获得了高水平表达lncRNA-MSTRG.22610.1却不影响细胞增殖的细胞系,且该细胞系的遗传稳定性较强。将BHV-110倍倍比稀释后分别感染传至10代的1T与1NC细胞,24 h后采用Reed-Muench法计算各组细胞中的病毒滴度。结果显示,1T、1NC及MB细胞(感染BHV-1的MDBK细胞)的病毒滴度分别为105.15 TCID50/0.1 m L、104.41TCID50/0.1 m L及104.58 TCID50/0.1 m L。与MB和1NC细胞相比,1T细胞中的病毒滴度显著升高(P<0.05),表明lnc RNA-MSTRG.22610.1表达后促进BHV-1在MDBK细胞中的复制。本研究为进一步探究lncRNA-MSTRG.22610.1促进病毒复制的分子机制及深入了解BHV-1感染的分子机制提供参考依据。 展开更多
关键词 长链非编码rna 牛肾细胞 牛疱疹病毒I型 慢病毒过表达 病毒增殖
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牦牛“海绵吸附”bta-miR-125b的lncRNA筛选验证及慢病毒载体构建
9
作者 贺鸿世 姚一龙 +5 位作者 索朗斯珠 孟朝轶 孔庆辉 席广银 郭敏 徐业芬 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第9期1-8,共8页
旨在筛选在牦牛卵泡发育过程中可能吸附bta-miR-125b的长链非编码RNA(lncRNA),并构建双荧光素酶载体与慢病毒过表达载体,为研究调控牦牛生殖相关lncRNA的功能及机制提供基础。利用miRanda与RNAhybrid数据库预测可能靶向牦牛bta-miR-125b... 旨在筛选在牦牛卵泡发育过程中可能吸附bta-miR-125b的长链非编码RNA(lncRNA),并构建双荧光素酶载体与慢病毒过表达载体,为研究调控牦牛生殖相关lncRNA的功能及机制提供基础。利用miRanda与RNAhybrid数据库预测可能靶向牦牛bta-miR-125b的lncRNAs,筛选出bta-miR-125b具有“海绵吸附”作用的lncRNAs,由RNAhybrid进行结合位点预测,筛选出最优的lncRNA;采集牦牛卵巢分离卵泡并提取总RNA构建cDNA池,以RT-PCR技术扩增筛选所得lncRNA;在此基础上利用pmir-GLO载体构建技术构建该lncRNA野生型及突变型双荧光素酶报告载体,并将其与bta-miR-125b mimics共转染至293T细胞,检测双荧光素酶活性;最后利用慢病毒载体构建技术将测序正确的lncRNA与pHBLV-CMV-MCS-EF1-ZsGreen-T2A-puro载体同源区的片段同源重组,通过慢病毒包装系统(psPAX2:pMD2G)包装后感染293T细胞,计算感染效率及滴度。结果:两个数据库中的lncRNA-ARS-UCD1.2与bta-miR-125b存在紧密结合位点,扩增出lncRNA-ARS-UCD1.2的序列全长为1552 bp;双荧光素酶活性检测表明牦牛lncRNA-ARS-UCD1.2与bta-miR-125b mimic具有靶向关系(P<0.01);同源重组后经酶切鉴定及测序验证表明成功构建了重组质粒,感染效率达(61.520±0.875)%,感染滴度为4×10^(8)TU/mL,表明lncRNA-ARS-UCD1.2过表达慢病毒载体成功构建。综上,本试验筛选出牦牛“海绵吸附”bta-miR-125b的lncRNA,并验证了两者的靶向结合关系,同时成功构建了该lncRNA的过表达慢病毒载体,为下一步深入研究lncRNA在细胞中的功能机制奠定了基础。 展开更多
关键词 牦牛 长链非编码rna bta-miR-125b 海绵吸附 慢病毒载体
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外泌体LncRNA SFTA1P和miR-483-3p诊断乙型肝炎病毒相关性肝癌的价值研究
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作者 叶开 李莉 +2 位作者 徐雪莹 高俊杰 吴竞 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第11期1007-1011,共5页
目的分析血浆外泌体长链非编码RNA(LncRNA)SFTA1P和miR-483-3p在乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝癌(HCC)的表达水平,评估其诊断价值。方法选择2022年1月—2024年1月本院收治的58例HBV相关性HCC患者作为HCC组;将同期收治的55例HBV患者作为HBV... 目的分析血浆外泌体长链非编码RNA(LncRNA)SFTA1P和miR-483-3p在乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝癌(HCC)的表达水平,评估其诊断价值。方法选择2022年1月—2024年1月本院收治的58例HBV相关性HCC患者作为HCC组;将同期收治的55例HBV患者作为HBV组;另选同期50名体检健康者作为对照组。运用纳米颗粒跟踪分析系统和蛋白质印迹分析鉴定血浆外泌体,并采用RT-qPCR检测外泌体LncRNA SFTA1P和miR-483-3p水平,分析二者水平分别与HCC临床病理特征之间的关系,Pearson法分析LncRNA SFTA1P和miR-483-3p表达水平的相关性,受试者工作特征(ROC)曲线分析LncRNA SFTA1P和miR-483-3p对HCC患者诊断的敏感性和特异性。结果外泌体LncRNA SFTA1P与miR-483-3p表达水平呈负相关(r=-0.7277,P<0.001)。与对照组相比,HBV、HCC组LncRNA SFTA1P水平依次增高,而miR-483-3p水平依次降低,差异均有统计学意义(P<0.05)。LncRNA SFTA1P、miR-483-3p表达水平与TNM分期,肿瘤分化程度、淋巴结转移、AFP及AST有关(P<0.05),而与年龄、肿瘤大小、ALT、γ-GGT无关(P>0.05)。LncRNA SFTA1P和miR-483-3p单独诊断HCC时的曲线下面积(AUC)分别为0.886、0.851,敏感度分别为86.20%、89.70%,特异度分别为78.00%、70.00%;联合诊断的AUC为0.957,敏感度和特异度分别为94.80%、82.00%。结论血浆外泌体LncRNA SFTA1P和miR-483-3p的联合诊断可提高HBV相关性HCC的诊断率,为其诊断及后续治疗提供新的研究思路。 展开更多
关键词 长链非编码rna SFTA1P miR-483-3p 乙型肝炎病毒相关性肝癌 联合诊断
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呼吸道合胞病毒感染相关的lncRNA研究进展
11
作者 刘艺 李竹 刘代顺 《遵义医科大学学报》 2024年第5期540-546,共7页
呼吸道合胞病毒(RSV)引起的肺部感染是人类健康的一大负担,至今无特异的疫苗和(或)抗病毒药物进行有效的防治,并且发病机制不完全清楚。长链非编码RNA(1ncRNA)是病毒感染过程中宿主-病毒相互作用的关键调节分子,有研究发现lncRNA在RSV... 呼吸道合胞病毒(RSV)引起的肺部感染是人类健康的一大负担,至今无特异的疫苗和(或)抗病毒药物进行有效的防治,并且发病机制不完全清楚。长链非编码RNA(1ncRNA)是病毒感染过程中宿主-病毒相互作用的关键调节分子,有研究发现lncRNA在RSV感染后出现差异性表达,部分通过促进宿主的免疫细胞成熟、调控免疫分子、调控RSV的基因或蛋白表达来影响RSV的复制,很可能是RSV感染诊断的潜在生物标记和(或)治疗靶点。本文对RSV感染进程中可能有重要作用的lncRNA进行综述,以加深对lncRNA参与的RSV感染机制的理解。 展开更多
关键词 长链非编码rna 感染 免疫 呼吸道合胞病毒
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长链非编码RNA PCGEM1、microRNA-642a-5p表达与HPV阳性宫颈癌根治术术后复发的关系研究 被引量：3
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作者 谭立凤 赵萌 祝愿 《中国现代医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期6-12,共7页
目的 探讨长链非编码RNA PCGEM1(LncRNA PCGEM1)、microRNA-642a-5p(miR-642a-5p)表达与人乳头状瘤病毒(HPV)阳性宫颈癌根治术术后复发的关系。方法 选取2018年2月-2020年4月淄博市妇幼保健院184例HPV阳性宫颈癌患者为研究对象,所有患者... 目的 探讨长链非编码RNA PCGEM1(LncRNA PCGEM1)、microRNA-642a-5p(miR-642a-5p)表达与人乳头状瘤病毒(HPV)阳性宫颈癌根治术术后复发的关系。方法 选取2018年2月-2020年4月淄博市妇幼保健院184例HPV阳性宫颈癌患者为研究对象,所有患者行HPV阳性宫颈癌根治术。比较不同临床分期HPV阳性宫颈癌LncRNA PCGEM1、miR-642a-5p的表达。统计HPV阳性宫颈癌患者术后2年复发情况,并依据术后是否复发分为复发组和未复发组,比较复发组与未复发组患者的临床资料。多因素Logistic逐步回归分析影响HPV阳性宫颈癌患者术后复发的因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,以ROC曲线下面积(AUC)评价宫颈癌组织LncRNA PCGEM1、miR-642a-5p表达及两者联合对HPV阳性宫颈癌患者术后复发的预测价值。结果 临床分期Ⅲ期和Ⅱ期宫颈癌组织LncRNAPCGEM1mRNA相对表达量高于Ⅰ期(P <0.05),miR-642a-5p mRNA相对表达量低于Ⅰ期(P <0.05);临床分期Ⅲ期宫颈癌组织LncRNA PCGEM1 mRNA相对表达量高于Ⅱ期(P <0.05),miR-642a-5p mRNA相对表达量低于Ⅱ期(P <0.05)。HPV阳性宫颈癌患者术后复发率为15.22%。复发组与未复发组临床分期、分化程度、宫颈浸润深度、盆腔淋巴结转移、肿瘤最大直径比较,差异有统计学意义(P <0.05),复发组宫颈癌组织LncRNA PCGEM1 mRNA相对表达量高于未复发组(P <0.05),miR-642a-5p mRNA相对表达量低于未复发组(P <0.05)。多因素Logistic逐步回归分析显示,临床分期为Ⅲ期[■=2.815(95%CI:1.226,6.462)、盆腔淋巴结转移■[=2.892(95%CI:1.202,6.968)、宫颈癌组织LncRNA PCGEM1表达■[=3.267(95%CI:1.642,8.754)、miR-642a-5p表达[■=3.337(95%CI:2.031,9.846)为影响HPV阳性宫颈癌患者术后复发的危险因素(P <0.05)。ROC曲线分析结果显示,宫颈癌组织LncRNA PCGEM1、miR-642a-5p及两者联合预测HPV阳性宫颈癌患者术后复发的敏感性分别为75.00%(95%CI:0.548,0.886)、78.57%(95%CI:0.586,0.910)和75.00%(95%CI:0.548,0.886),特异性分别为78.21%(95%CI:0.708,0.842)、73.08%(95%CI:0.653,0.797)和96.15%(95%CI:0.914,0.984),AUC分别为0.724(95%CI:0.653,0.787)、0.796(95%CI:0.730,0.851)和0.856(95%CI:0.797,0.904)。结论 宫颈癌组织LncRNA PCGEM1、miR-642a-5p与HPV阳性宫颈癌根治术术后复发相关,且两者联合对宫颈癌根治术术后复发的预测效能较高。 展开更多
关键词 宫颈癌 人乳头状瘤病毒 宫颈癌根治术 长链非编码rna PCGEM1 microrna-642a-5p
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SARS冠状病毒RNA聚合酶编码区分析 被引量：3
13
作者 芮伟 张其鹏 +4 位作者 石磊 卢铭 景霞 国强华 尚彤 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第B05期137-138,共2页
关键词 SARS 冠状病毒 rna 聚合酶编码区分析
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在树突状细胞中筛选与呼吸道合胞病毒诱发哮喘相关的长链非编码RNAs 被引量：5
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作者 孙淑宁 乔建瓯 韩肇庆 《广东医学》 CAS 北大核心 2017年第21期3229-3234,共6页
目的使用人类全转录组芯片检测呼吸道合胞病毒(RSV)诱发哮喘中的树突状细胞(DCs),以筛选差异表达的长链非编码RNAs(lncRNAs)。在lncRNAs转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制。方法设立HDC-BEAS+RSV组、HDC-RSV组和HDC-CONTROL组3组,其中H... 目的使用人类全转录组芯片检测呼吸道合胞病毒(RSV)诱发哮喘中的树突状细胞(DCs),以筛选差异表达的长链非编码RNAs(lncRNAs)。在lncRNAs转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制。方法设立HDC-BEAS+RSV组、HDC-RSV组和HDC-CONTROL组3组,其中HDC-BEAS+RSV组是将RSV感染的人支气管上皮细胞BEAS-2B和未成熟DCs通过Transwell共培养,HDC-RSV组是将RSV感染未成熟DCs,HDCCONTROL组是将RSV对照液感染未成熟DCs。使用affymatrix的HTA2.0芯片检测3组DCs中基因和lncRNAs的表达差异,并对其进行聚类分析、GO分析和Pathway分析。结果筛选出有差异表达的25个基因和29个lncRNAs,其中20个基因表达上调,5个基因表达下调,27个lncRNAs表达上调,2个lncRNAs表达下调。上调的基因主要涉及促炎免疫反应,例如信号转导、趋化因子信号传导途径、细胞因子受体相互作用等。结论我们筛选出了RSV诱发哮喘中差异表达的lncRNAs,为进一步在lncRNA转录调控层面研究RSV诱发哮喘的机制奠定基础。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 哮喘 树突状细胞 长链非编码rna
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茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析 被引量：1
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作者 王小纯 张珈敏 +3 位作者 蒋洪 俞海洋 谭莉 胡远扬 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期573-578,共6页
用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编... 用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。 展开更多
关键词 茶尺蠖小rna病毒 哺乳动物小rna病毒 5’端非编码区 结构分析
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单股正链RNA病毒基因组非编码区结构与功能研究进展 被引量：2
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作者 哲名家 陈宗艳 +1 位作者 李传峰 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 2012年第4期79-86,共8页
单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区(non-coding region,NCR)不仅参与RNA-RNA间相互作用,还可以通过与反式作用因子(trans-acting factor)结合,发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用。本文对近年来一些关于单股正链RN... 单股正链RNA病毒基因组末端的非编码区(non-coding region,NCR)不仅参与RNA-RNA间相互作用,还可以通过与反式作用因子(trans-acting factor)结合,发挥对病毒基因组的复制、转录和组装等过程的调控作用。本文对近年来一些关于单股正链RNA病毒基因组非编码区的结构与功能研究进展情况进行综述。 展开更多
关键词 单股正链rna病毒 非编码区 结构 功能
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用3'非编码区通用引物通过RT-PCR检测登革1～4型病毒RNA 被引量：1
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作者 段鸿元 杨佩英 +2 位作者 秦鄂德 于曼 欧武 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2000年第3期5-8,共4页
目的 　根据登革病毒 (DEN) 3 端非编码区的一段高度保守序列 ,设计登革 1～ 4型通用引物 ,采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测登革病毒 1～ 4型RNA。方法　用C6/ 3 6细胞培养登革病毒。用热酚法提取病毒RNA ,进行RT PCR扩增 ,并对... 目的 　根据登革病毒 (DEN) 3 端非编码区的一段高度保守序列 ,设计登革 1～ 4型通用引物 ,采用逆转录聚合酶链反应 (RT PCR)检测登革病毒 1～ 4型RNA。方法　用C6/ 3 6细胞培养登革病毒。用热酚法提取病毒RNA ,进行RT PCR扩增 ,并对扩增产物测序。结果　DEN 2 NGC株可扩增出至少 10TCID5 0 的病毒 ,测序结果与已知序列一致。DEN 1～ 4型标准株和DEN -2 -0 4与DEN 2 4 3株均能够扩增出唯一的一条特异条带。结论　应用通用引物RT PCR法可从病毒浓度少至 10TCID5 0 的感染细胞培养液中检出DEN 2 NGC株病毒 ,并且该对通用引物对于其他 3型登革病毒亦具有很好的通用性 ,其方法的特异性和敏感性亦较强。 展开更多
关键词 登革热病毒 RT-PCR rna 3'非编码区 序列分析
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病毒编码miRNA与宿主免疫 被引量：1
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作者 李登云 张德礼 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期558-561,569,共5页
MicroRNA（miRNA）是一类不编码的,长度为19～25nt的小RNA分子,通过与靶基因形成完全或者不完全互补的双链来抑制靶基因的翻译或者降解靶蛋白,也可通过调控促进蛋白表达.MiRNA首次于1993年由Ambros及其同事在模式生物线虫中发现[1],通... MicroRNA（miRNA）是一类不编码的,长度为19～25nt的小RNA分子,通过与靶基因形成完全或者不完全互补的双链来抑制靶基因的翻译或者降解靶蛋白,也可通过调控促进蛋白表达.MiRNA首次于1993年由Ambros及其同事在模式生物线虫中发现[1],通过基因组研究,证实miRNA为一种具有发卡结构的小RNA,通过与其靶标转录本3‘UTR结合抑制靶标的转录后翻译[2].本来miRNA被认为只在线虫特异性存在,后来证实这些线虫miRNA在其他的多细胞生物比如人体内保守存在[3]. 展开更多
关键词 MIrna 病毒编码 宿主免疫 rna分子 多细胞生物 模式生物 蛋白表达 小rna
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长链非编码RNA ENSMUST00000127391重组慢病毒载体的构建与鉴定 被引量：1
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作者 王敏 陆卫平 +2 位作者 姚迪 王苏雨 卢春 《解放军预防医学杂志》 CAS 2016年第S2期12-12,55,共2页
目的构建表达长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)ENSMUST00000127391(LINC127391)的重组慢病毒载体,并感染小鼠肾小球系膜细胞(mice mesangial cells,MMCs)使LINC127391在高糖的MMCs中表达。方法以MMCs的cDNA为模板利用PCR法扩... 目的构建表达长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)ENSMUST00000127391(LINC127391)的重组慢病毒载体,并感染小鼠肾小球系膜细胞(mice mesangial cells,MMCs)使LINC127391在高糖的MMCs中表达。方法以MMCs的cDNA为模板利用PCR法扩增LINC127391全长,将其插入pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP载体,构建重组慢病毒载体pCDH-LINC127391。将重组目的质粒pCDH-LINC127391与包装质粒psPAX2和包膜质粒pMD2.G共转染到293T细胞,收获表达LINC127391的重组慢病毒上清液,检测病毒滴度。病毒液感染MMCs,通过实时定量PCR法检测LINC127391的表达情况。结果质粒酶切以及测序鉴定结果证明重组质粒pCDH-LINC127391构建成功,并测得病毒液滴度约为2×10~7efu/mL。病毒液感染MMCs后实时定量PCR检测发现LINC127391表达明显增加。结论成功构建了重组质粒pCDH-LINC127391。 展开更多
关键词 长链非编码rna 肾小球系膜细胞 转染 慢病毒
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长链非编码RNA BRE-AS1慢病毒表达载体的构建与鉴定 被引量：1
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作者 周辉 余淦 +1 位作者 徐华 叶章群 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2018年第5期295-300,共6页
目的构建长链非编码RNA BRE-AS1的慢病毒表达载体。方法利用重叠延伸PCR法构建出BRE-AS1的全长目的片段,将全长目的片段及慢病毒载体质粒pCDH-CMV-MCSEF1分别双酶切后进行连接,转化到感受态大肠杆菌后,通过DNA测序鉴定筛选出阳性菌落,... 目的构建长链非编码RNA BRE-AS1的慢病毒表达载体。方法利用重叠延伸PCR法构建出BRE-AS1的全长目的片段,将全长目的片段及慢病毒载体质粒pCDH-CMV-MCSEF1分别双酶切后进行连接,转化到感受态大肠杆菌后,通过DNA测序鉴定筛选出阳性菌落,提取目的质粒。利用目的质粒制备包装慢病毒,并感染肾细胞癌细胞系OS-RC-2,分别利用荧光显微镜和荧光实时定量PCR检测细胞中BRE-AS1是否过表达。结果重叠延伸PCR得到正确的BRE-AS1全长序列,经过双酶切、连接、转化、筛选及DNA测序,成功构建重组慢病毒载体质粒pCDHBRE-AS1。通过荧光显微镜检测,几乎所有经过嘌呤霉素筛选的OS-RC-2细胞均具有绿色荧光,显示其被重组慢病毒感染;荧光实时定量PCR显示,感染了pCDH-BRE-AS1慢病毒的OS-RC-2细胞中,BRE-AS1的表达水平上升了38.5倍。EdU插入实验显示BRE-AS1抑制肾癌细胞的增殖。结论本研究成功构建了BRE-AS1的慢病毒表达载体,并证明BRE-AS1能抑制肾癌细胞增殖。 展开更多
关键词 BRE-AS1 慢病毒载体 肾细胞癌 长链非编码rna
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