期刊文献+
共找到197篇文章
< 1 2 10 >
每页显示 20 50 100
大白菜F-BOX基因家族的鉴定与核盘菌诱导应答分析
1
作者 冯冬林 钟开勤 +1 位作者 丁玲 刘美琴 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期294-301,共8页
【目的】筛选参与菌核病应答反应的F-BOX基因,为大白菜抗菌核病基因的功能研究及抗病品种的选育提供基础。【方法】基于核盘菌侵染大白菜转录组测序数据,对大白菜F-BOX基因家族进行鉴定,进行亚细胞定位、染色体定位、保守结构域等生物... 【目的】筛选参与菌核病应答反应的F-BOX基因,为大白菜抗菌核病基因的功能研究及抗病品种的选育提供基础。【方法】基于核盘菌侵染大白菜转录组测序数据,对大白菜F-BOX基因家族进行鉴定,进行亚细胞定位、染色体定位、保守结构域等生物信息学分析。分析F-BOX基因在核盘菌侵染下的差异表达,并采用q-PCR技术检测F-BOX基因在0 h和36 h的表达情况。【结果】共鉴定32个BraF-BOX基因,分子量介于34 751.13~105 942.22Da;亚细胞定位表明,26个F-BOX基因定位在细胞核和细胞质中,6个定位在叶绿体中;系统进化树分析将BraFBOX分为4个亚族;基因结构分析结果表明,每个BraF-BOX家族成员均含有Motif 1,序列中均含有外显子;组织特异性表达分析结果表明在不同大白菜部位,表达量有差异;在核盘菌处理36 h时,q-PCR检测6个基因的相对表达量趋势与转录组数据一致,其中Bra037120、Bra011427、Bra009835等3个基因表达上调,核盘菌侵染时间越长,表达量越大。【结论】综合BraF-BOX基因生物信息学及转录组数据分析,Bra037120、Bra011427、Bra009835基因可能参与大白菜菌核病抗性功能,为后续基因功能研究提供研究基础。 展开更多
关键词 大白菜 f-box基因家族 菌核病 基因表达
下载PDF
黄瓜F-box基因家族的鉴定与生物信息学分析
2
作者 史艳 肖雅茹 +1 位作者 李丽霞 李梅兰 《山西农业科学》 2023年第4期366-374,共9页
F-box蛋白是泛素连接酶E3的核心成分,在植物的生长发育和抵御胁迫方面起着重要作用。为探讨黄瓜F-box基因家族的分子特征与表达模式,通过同源序列比对,共鉴定出22个黄瓜F-box基因家族成员,在7条染色体上均有分布,依次命名为CsF-box01~Cs... F-box蛋白是泛素连接酶E3的核心成分,在植物的生长发育和抵御胁迫方面起着重要作用。为探讨黄瓜F-box基因家族的分子特征与表达模式,通过同源序列比对,共鉴定出22个黄瓜F-box基因家族成员,在7条染色体上均有分布,依次命名为CsF-box01~CsF-box22。然后对该家族基因结构、染色体定位、理化性质、保守基序、顺式作用元件、进化关系和表达模式进行分析。结果表明,黄瓜F-box基因家族编码蛋白大多为不稳定亲水蛋白,55%的成员为酸性蛋白;保守基序分析发现,95%的成员含有Motif1,Motif1在该蛋白家族中最为保守;基因结构分析发现,该家族有8个基因为断裂基因,外显子数目在2~10个;亚细胞定位显示,F-box蛋白主要被定位到细胞质中,其次是细胞核中;启动子顺式作用元件分析发现,黄瓜F-box基因家族富含大量胁迫响应、生长发育调控、激素响应和光响应等作用元件,说明F-box基因可能广泛参与黄瓜生长发育和胁迫响应过程。基因表达分析结果发现,分别有8、2个F-box基因在霜霉菌和丁香假单胞菌胁迫下差异性表达,说明黄瓜F-box家族基因参与了生物胁迫响应途径。 展开更多
关键词 黄瓜 f-box基因家族 生物信息学 表达分析
下载PDF
F-box and leucine-rich repeat 6 promotes gastric cancer progression via the promotion of epithelial-mesenchymal transition
3
作者 Lei Meng Yu-Ting Hu A-Man Xu 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2023年第3期490-503,共14页
BACKGROUND F-box and leucine-rich repeat 6(FBXL6)have reportedly been associated with several cancer types.However,the role and mechanisms of FBXL6 in gastric cancer(GC)require further elucidation.AIM To investigate t... BACKGROUND F-box and leucine-rich repeat 6(FBXL6)have reportedly been associated with several cancer types.However,the role and mechanisms of FBXL6 in gastric cancer(GC)require further elucidation.AIM To investigate the effect of FBXL6 in GC tissues and cells and the underlying mechanisms.METHODS TCGA and GEO database analysis was performed to evaluate the expression of FBXL6 in GC tissues and adjacent normal tissues.Reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,immunofluorescence,and western blotting were used to detect the expression of FBXL6 in GC tissue and cell lines.Cell clone formation,5-ethynyl-2’-deoxyuridine(EdU)assays,CCK-8,transwell migration assay,and wound healing assays were performed to evaluate the malignant biological behavior in GC cell lines after transfection with FBXL6-shRNA and the overexpression of FBXL6 plasmids.Furthermore,in vivo tumor assays were performed to prove whether FBXL6 promoted cell proliferation in vivo.RESULTS FBXL6 expression was upregulated more in tumor tissues than in adjacent normal tissues and positively associated with clinicopathological characteristics.The outcomes of CCK-8,clone formation,and Edu assays demonstrated that FBXL6 knockdown inhibited cell proliferation,whereas upregulation of FBXL6 promoted proliferation in GC cells.Additionally,the transwell migration assay revealed that FBXL6 knockdown suppressed migration and invasion,whereas the overex pression of FBXL6 showed the opposite results.Through the subcutaneous tumor implantation assay,it was evident that the knockdown of FBXL6 inhibited GC graft tumor growth in vivo.Western blotting showed that the effects of FBXL6 on the expression of the proteins associated with the epithelial-mesenchymal transition-associated proteins in GC cells.CONCLUSION Silencing of FBXL6 inactivated the EMT pathway to suppress GC malignancy in vitro.FBXL6 can potentially be used for the diagnosis and targeted therapy of patients with GC. 展开更多
关键词 Gastric cancer f-box and leucine-rich repeat 6 INVASION Epithelial-mesenchymal transition METASTASIS
下载PDF
F-box only protein 2 exacerbates non-alcoholic fatty liver disease by targeting the hydroxyl CoA dehydrogenase alpha subunit
4
作者 Zhi Liu Ning-Yuan Chen +2 位作者 Zhao Zhang Sai Zhou San-Yuan Hu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2023年第28期4433-4450,共18页
BACKGROUND Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is a major health burden with an increasing global incidence.Unfortunately,the unavailability of knowledge underlying NAFLD pathogenesis inhibits effective preventive... BACKGROUND Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is a major health burden with an increasing global incidence.Unfortunately,the unavailability of knowledge underlying NAFLD pathogenesis inhibits effective preventive and therapeutic measures.AIM To explore the molecular mechanism of NAFLD.METHODS Whole genome sequencing(WGS)analysis was performed on liver tissues from patients with NAFLD(n=6)and patients with normal metabolic conditions(n=6)to identify the target genes.A NAFLD C57BL6/J mouse model induced by 16 wk of high-fat diet feeding and a hepatocyte-specific F-box only protein 2(FBXO2)overexpression mouse model were used for in vivo studies.Plasmid transfection,co-immunoprecipitation-based mass spectrometry assays,and ubiquitination in HepG2 cells and HEK293T cells were used for in vitro studies.RESULTS A total of 30982 genes were detected in WGS analysis,with 649 up-regulated and 178 down-regulated.Expression of FBXO2,an E3 ligase,was upregulated in the liver tissues of patients with NAFLD.Hepatocyte-specific FBXO2 overexpression facilitated NAFLD-associated phenotypes in mice.Overexpression of FBXO2 aggravated odium oleate(OA)-induced lipid accumulation in HepG2 cells,resulting in an abnormal expression of genes related to lipid metabolism,such as fatty acid synthase,peroxisome proliferator-activated receptor alpha,and so on.In contrast,knocking down FBXO2 in HepG2 cells significantly alleviated the OA-induced lipid accumulation and aberrant expression of lipid metabolism genes.The hydroxyl CoA dehydrogenase alpha subunit(HADHA),a protein involved in oxidative stress,was a target of FBXO2-mediated ubiquitination.FBXO2 directly bound to HADHA and facilitated its proteasomal degradation in HepG2 and HEK293T cells.Supplementation with HADHA alleviated lipid accumulation caused by FBXO2 overexpression in HepG2 cells.CONCLUSION FBXO2 exacerbates lipid accumulation by targeting HADHA and is a potential therapeutic target for NAFLD。 展开更多
关键词 f-box only protein 2 Nonalcoholic fatty liver disease The hydroxyl CoA dehydrogenase alpha subunit Liver steatosis Ubiquitination Lipid accumulation
下载PDF
F-box蛋白在植物生长发育中的功能研究进展 被引量:19
5
作者 吴丹 唐冬英 +3 位作者 李新梅 李丽 赵小英 刘选明 《生命科学研究》 CAS CSCD 2015年第4期362-367,共6页
在真核生物中,由泛素介导的蛋白降解途径与植物生长发育密切相关。F-box蛋白家族是一类含有Fbox基序(motif),在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。目前,从各种植物中已鉴定出大量的F-box蛋白质,这类蛋白质在植... 在真核生物中,由泛素介导的蛋白降解途径与植物生长发育密切相关。F-box蛋白家族是一类含有Fbox基序(motif),在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。目前,从各种植物中已鉴定出大量的F-box蛋白质,这类蛋白质在植物激素的信号转导、光信号转导、自交不亲和以及花器官发育等许多生理过程中都具有重要功能。研究发现F-box蛋白在调控植物生长发育过程中所发挥的功能与其结构及泛素蛋白酶体途径密切相关。 展开更多
关键词 f-box蛋白 SKP1-CUL1-f-box(SCF)复合体 泛素蛋白酶体途径(UPS)
下载PDF
谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应 被引量:23
6
作者 霍冬英 郑炜君 +6 位作者 李盼松 徐兆师 周永斌 陈明 马有志 闵东红 张小红 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1585-1594,共10页
F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个... F-box蛋白参与细胞周期调控、细胞凋亡及信号转导等多种生命活动,对维持植物正常生长发育a和介导非生物胁迫响应等过程发挥重要作用。谷子具有显著的耐旱耐瘠薄等特性,本研究根据谷子转录组分析结果,从525个F-box家族成员中鉴定出19个在干旱胁迫下表达量上调的F-box基因,根据序列相似性将其分为6类,同一类基因具有相似的内含子-外显子结构。染色体定位分析发现,这些基因分别分布在谷子的8条染色体上,其中,第2条染色体上含F-box基因最多,有6个。结构域分析结果表明,19个F-box蛋白均含保守的F-box结构域,而C端含FBD、WD40、FBA、ZnF、Kelch和LRR等结构域。启动子元件分析表明,谷子19个F-box基因均含逆境应答元件,其中,MYB和MYC元件的数量最多(9-78个),说明这些基因对干旱应答反应可能主要受MYB、MYC转录因子调控。转录组分析结果表明,SiF-box18基因对干旱胁迫的响应远远高于其他F-box成员,对干旱、高盐、ABA、SA和JA都有响应;亚细胞定位结果显示,SiF-box18蛋白定位在细胞核中。本研究为进一步深入了解SiF-box18基因的功能提供了依据。 展开更多
关键词 谷子 f-box蛋白 亚细胞定位 干旱响应 诱导机制
下载PDF
F-box蛋白质在植物生长发育中的功能 被引量:41
7
作者 秘彩莉 刘旭 张学勇 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1337-1342,共6页
在真核生物中,泛素介导的蛋白降解途径参与了许多生物学过程。SCF复合体是一种非常重要的E3泛素连接酶,在植物中研究的最为深入。F-box蛋白包含一个F-box基序,是SCF复合体的一个亚基,它决定了底物识别的特异性。目前,从各种植物中已鉴... 在真核生物中,泛素介导的蛋白降解途径参与了许多生物学过程。SCF复合体是一种非常重要的E3泛素连接酶,在植物中研究的最为深入。F-box蛋白包含一个F-box基序,是SCF复合体的一个亚基,它决定了底物识别的特异性。目前,从各种植物中已鉴定出大量的F-box蛋白质,它们参与了植物激素(乙烯,生长素,GA,JA)的信号传导以及自交不亲和、花器官发育等生物学过程,F-box蛋白还参与了植物的胁迫反应。最新研究结果显示,一个F-box蛋白TIR1是生长素的受体。因此,F-box蛋白质介导的泛素化蛋白质降解途径可能是植物基因表达调控的重要机制。 展开更多
关键词 泛素 SCF复合体 f-box蛋白质 蛋白质降解 信号传导
下载PDF
樱桃自交不亲和S9-单元型特异的F-box基因克隆及其表达分析 被引量:13
8
作者 成建红 白松龄 +2 位作者 韩振海 许雪峰 李天忠 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期976-983,共8页
目的克隆李属甜樱桃自交不亲和性花粉S-决定子基因,为今后果树配子体自交不亲和性机理研究奠定理论基础。方法根据GenBank登录的16个S-locusF-box同源基因保守区设计兼并引物,利用RT-PCR、RACE等手段,从甜樱桃品种红灯花粉cDNA中克隆到... 目的克隆李属甜樱桃自交不亲和性花粉S-决定子基因,为今后果树配子体自交不亲和性机理研究奠定理论基础。方法根据GenBank登录的16个S-locusF-box同源基因保守区设计兼并引物,利用RT-PCR、RACE等手段,从甜樱桃品种红灯花粉cDNA中克隆到两个编码376-氨基酸多肽的全长基因。结果GenBankBlast分析显示,克隆的两个基因中一个基因编码的蛋白产物与数据库甜樱桃自交不亲和性S3-单元型特异的PaSFB3(AB096857)编码的氨基酸序列完全一致。另一个基因编码一新的PaSFB同源序列,其推测的氨基酸序列N-端同SFB3一样具有明显的F-box基序,与PaSFB1~6的一致性为76%~82%。研究显示该基因在花粉组织中特异性表达,并表现出S9-单元型特异的连锁信号。结论新基因为甜樱桃自交不亲和性花粉S-决定子候选基因PaSFB家族中一新成员,命名为PaSFB9(GenBank登录号:DQ422809),红灯自交不亲和基因型确定为S3S9。 展开更多
关键词 樱桃(Prunus avium) 自交不亲和性 花粉 f-box基因 克隆
下载PDF
OsCOI1,水稻中一个受茉莉酸甲酯和脱落酸诱导表达的F-box家族基因 被引量:6
9
作者 胡廷章 王维平 +1 位作者 曹凯鸣 王喜萍 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第4期388-393,共6页
利用Blast检索、EST分析和RT-PCR,在水稻中分离到一个与拟南芥COI1同源的新基因,命名为OsCOI1.OsCOI1编码595个氨基酸.推测的OsCOI1编码蛋白有一个F-boxmotif和16个富含亮氨酸的重复序列,这与拟南芥COI1相似.OsCOI1在氨基酸水平上和COI... 利用Blast检索、EST分析和RT-PCR,在水稻中分离到一个与拟南芥COI1同源的新基因,命名为OsCOI1.OsCOI1编码595个氨基酸.推测的OsCOI1编码蛋白有一个F-boxmotif和16个富含亮氨酸的重复序列,这与拟南芥COI1相似.OsCOI1在氨基酸水平上和COI1有很高的同源性(74%).经半定量RT-PCR法和RNA印迹分析,表明水稻中OsCOI1表达水平在经茉莉酸甲酯和脱落酸处理后呈明显变化,但不受水杨酸和乙烯的影响,说明OsCOI1可能在茉莉酸信号途径和脱落酸途径中具有特定功能. 展开更多
关键词 水稻 f-box MOTIF 半定量RT-PCR RNA印迹 茉莉酸信号途径 脱落酸途径
下载PDF
拟南芥F-box基因At3g16740的表达分析 被引量:7
10
作者 段桂芳 王利群 +4 位作者 李新梅 赵福 罗俊 赵小英 刘选明 《生命科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期486-492,共7页
拟南芥At3g16740基因为F-box基因家族成员,其功能尚不清楚.通过连续和瞬时光照处理分析,发现蓝光、红光和远红光都诱导At3g16740基因的表达,其中远红光的诱导作用最明显.蓝光受体cry1、cry2,红光受体phyB或远红光受体phyA突变导致At3g16... 拟南芥At3g16740基因为F-box基因家族成员,其功能尚不清楚.通过连续和瞬时光照处理分析,发现蓝光、红光和远红光都诱导At3g16740基因的表达,其中远红光的诱导作用最明显.蓝光受体cry1、cry2,红光受体phyB或远红光受体phyA突变导致At3g16740基因表达的光诱导作用减弱或者消失,表明该基因为光信号通路相关基因.通过实时荧光定量PCR分析At3g16740基因在拟南芥不同组织器官中的表达,发现其在拟南芥根、茎、叶、花和果荚中都有表达,花和果荚中的表达量最高,推测该基因可能参与植物花和/或果荚的发育.酵母双杂交分析发现,At3g16740蛋白通过F-box结构域与拟南芥ASK(arabidopsis-SKP1-like)家族成员ASK1、ASK2和ASK11相互作用,表明At3g16740是SCF(Skp、Cullin、F-box)复合物的成员. 展开更多
关键词 拟南芥 f-box基因 At3g16740 基因表达
下载PDF
F-box蛋白家族的功能研究进展 被引量:10
11
作者 吴静 彭小忠 +1 位作者 袁建刚 强伯勤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期503-505,共3页
F box蛋白是一类含有F box基序 (motif) ,在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族 .这类蛋白质在细胞时相转换、信号传导、发育等多种生理过程中都具有重要功能 .
关键词 f-box蛋白家族 功能 研究进展 底物识别特异性
下载PDF
F-box蛋白家族及其功能 被引量:17
12
作者 王秀燕 孙莉萍 +3 位作者 张建锋 李辉 吕文清 张其清 《生命科学》 CSCD 2008年第5期807-811,共5页
F-box蛋白是一类广泛存在于真核生物中,含有F-box结构域的蛋白家族,在泛素-蛋白酶体途径(ubiquitin-protcasomc pathway,UPP)中因特异识别底物蛋白而参与细胞周期调控、转录调控、细胞凋亡、细胞信号转导等生命活动。另外,F-box蛋白还... F-box蛋白是一类广泛存在于真核生物中,含有F-box结构域的蛋白家族,在泛素-蛋白酶体途径(ubiquitin-protcasomc pathway,UPP)中因特异识别底物蛋白而参与细胞周期调控、转录调控、细胞凋亡、细胞信号转导等生命活动。另外,F-box蛋白还通过其他作用方式参与了体内众多生化过程。本文综述了F-box蛋白的结构和作用途径,以及该蛋白参与的多种生理功能,展示了F-box蛋白家族在生命活动中具有广泛而重要的作用,并指出了F-box蛋白将为阐明疾病发生机制提供新的线索,可望成为疾病治疗中药物作用的靶向位点。 展开更多
关键词 f-box蛋白 泛素-蛋白酶体途径 SCF复合体
下载PDF
拟南芥F-box基因At5g22700的功能初步分析 被引量:7
13
作者 王利群 唐冬英 +4 位作者 李新梅 段桂芳 吴丹 赵小英 刘选明 《激光生物学报》 CAS CSCD 2014年第2期140-146,共7页
F-box蛋白作为SCF(Skp1,Cullin and an F-box protein)复合体的成员,参与调节植物的生长发育过程。At5g22700为功能未知的F-box基因家族成员。本研究通过酵母双杂交分析At5g22700蛋白与ASK(Arabidopsis-SKP1-like)家族蛋白的相互作用,发... F-box蛋白作为SCF(Skp1,Cullin and an F-box protein)复合体的成员,参与调节植物的生长发育过程。At5g22700为功能未知的F-box基因家族成员。本研究通过酵母双杂交分析At5g22700蛋白与ASK(Arabidopsis-SKP1-like)家族蛋白的相互作用,发现At5g22700蛋白的F-box结构域与ASK4蛋白相互作用。实时定量PCR分析该基因在不同组织器官中的表达,发现该基因在根和花中的表达量最高,说明At5g22700可能在根和花的发育中具有重要作用。以At5g22700基因的T-DNA插入突变体和过量表达转基因株系为材料,分析不同光照条件下幼苗的表型,发现蓝光下At5g22700过量表达转基因幼苗的主根比野生型长。这些研究结果表明,At5g22700在植物体内可能形成SCF复合体,并在植物幼苗主根伸长生长中起促进作用。 展开更多
关键词 拟南芥 f-box基因 At5g22700 主根伸长
下载PDF
一个快速响应干旱的F-box基因的克隆和表达分析 被引量:7
14
作者 尹恒 余琴鸯 +1 位作者 安利佳 李文利 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1027-1034,共8页
F-box是Skp1-Cullin1-F-box(SCF)型泛素连接酶E3的重要组成部分,在泛素化介导的蛋白质降解中选择性识别靶蛋白。本文从谷子苗期干旱胁迫条件下构建的转录组文库中克隆了与耐旱早期响应相关的F-box基因,命名为SiFBX(GenBank登录号为KC252... F-box是Skp1-Cullin1-F-box(SCF)型泛素连接酶E3的重要组成部分,在泛素化介导的蛋白质降解中选择性识别靶蛋白。本文从谷子苗期干旱胁迫条件下构建的转录组文库中克隆了与耐旱早期响应相关的F-box基因,命名为SiFBX(GenBank登录号为KC252635.1)。该基因全长510 bp,编码170个氨基酸。蛋白质结构预测表明,该蛋白含有丰富的精氨酸、亮氨酸、丝氨酸,缺少跨膜结构域及信号肽序列。系统进化分析表明,该基因与已报道的EID1和FBW4亲缘关系较近。在该基因上游1.9 kb序列处,预测到启动子的核心序列及与多种逆境胁迫相关的调控序列。荧光定量PCR分析表明,该基因分别在正常干旱、PEG和ABA诱导下,表达量出现显著变化。 展开更多
关键词 谷子 干旱响应 f-box gRT-PCR
下载PDF
植物F-Box蛋白及其生物学功能研究 被引量:5
15
作者 李莉 李懿星 +2 位作者 夏凯 宋书锋 周在为 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第35期19879-19881,19892,共4页
F-box蛋白是一类含有F-box结构域,在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。这类蛋白质在细胞循环、信号传导、基因转录、雄性不育和细胞程序化死亡等多种生理过程中发挥重要作用。介绍了已知的植物F-box蛋白质的生... F-box蛋白是一类含有F-box结构域,在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。这类蛋白质在细胞循环、信号传导、基因转录、雄性不育和细胞程序化死亡等多种生理过程中发挥重要作用。介绍了已知的植物F-box蛋白质的生物学功能并对F-box基因的系统进化进行了分析。 展开更多
关键词 f-box蛋白 生物学功能 系统发育
下载PDF
枳2个F-box基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析 被引量:2
16
作者 张演义 王化坤 +2 位作者 宋长年 孙欣 王西成 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期1-7,共7页
利用生物信息学方法,以拟南芥TIR1和F-box cDNA序列为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索,筛选出柑橘TIR1和F-box基因的cDNA序列,并以枳花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计5'末端和3'末端扩增的特异引物,利用5'RACE和3'R... 利用生物信息学方法,以拟南芥TIR1和F-box cDNA序列为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索,筛选出柑橘TIR1和F-box基因的cDNA序列,并以枳花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计5'末端和3'末端扩增的特异引物,利用5'RACE和3'RACE技术,分别获得该基因的5'和3'末端,序列拼接后获得枳的TIR1和F-box cDNA全长。分别命名Pt-TIR1和Pt-F-box,大小分别是2 048,1 695 bp,在GenBank的登录号分别是FJ502240和FJ502241,其分别编码569和468个氨基酸全长。生物信息学分析表明,Pt-TIR1和Pt-F-box的cDNA序列中分别有microRNA393和microRNA394的识别位点,其与其他植物的F-box一样有着高度保守的序列即F-box结构域。构建Pt-TIR1和Pt-F-box亚细胞定位载体35S-GW-GFP-FJ502237/FJ502238,基因枪转化洋葱表皮细胞,暗培养24 h后激光共聚焦显微镜下观察。亚细胞定位结果表明Pt-TIR1和Pt-F-box均定位于细胞核中。转录因子Pt-TIR1和Pt-F-box均具有核定位功能。 展开更多
关键词 TIR1和f-box 基因克隆 亚细胞定位
下载PDF
F-box蛋白家族在植物抗逆响应中的作用机制 被引量:13
17
作者 贾琪 孙松 +1 位作者 孙天昊 林文雄 《中国生态农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1125-1136,共12页
SCF复合体泛素连接酶E3介导的泛素化蛋白降解是翻译后水平上对生命进程进行调控的一个重要方式。它的关键组分F-box蛋白负责识别被降解的靶底物蛋白。植物F-box基因家族成员众多,极具多样性。F-box蛋白N端常含F-box基序,C端常为蛋白互... SCF复合体泛素连接酶E3介导的泛素化蛋白降解是翻译后水平上对生命进程进行调控的一个重要方式。它的关键组分F-box蛋白负责识别被降解的靶底物蛋白。植物F-box基因家族成员众多,极具多样性。F-box蛋白N端常含F-box基序,C端常为蛋白互作保守结构域,该结构具多样性,可识别不同底物,是F-box蛋白分类的依据。研究表明,F-box蛋白参与调控植物的许多生命进程,包括抗逆反应。本文就近年来F-box蛋白在植物抗逆反应中的作用机制进行总结。F-box蛋白大多以SCF复合体泛素连接酶E3介导的泛素化蛋白降解目标蛋白的方式调控抗逆反应,也有不依赖形成SCF复合体的方式行使功能,不少F-box蛋白参与了植物激素信号传导,通过调控转录因子活性而改变下游基因的表达,由此影响了植物的抗逆反应。基因表达谱的生物信息学预测表明,大多数F-box基因参与了植物抗逆反应,目前只有其中一小部分已报道了其抗逆调节功能。在此综述了这些F-box蛋白在植物抗逆胁迫中的研究进展。在干旱和盐碱胁迫反应中,F-box基因常通过影响植物激素脱落酸、乙烯等植物激素信号传导而调控抗逆。由于干旱和盐碱胁迫具协同性,不少F-box基因同时参与抗旱和抗盐碱胁迫,但调节方式有所不同,一些F-box基因对抗干旱和盐碱的反应具协同性,从总体上调控植物的渗透胁迫和离子毒害反应;而另一些F-box基因对干旱和盐胁迫反应的调节作用相反,它们可能在植物抗逆的精细调节中起作用。在低温胁迫反应中,F-box蛋白可调节植物抗低温的CBF信号途径。在生物胁迫反应中,F-box基因常通过影响植物激素茉莉酸和水杨酸途径来调控抗病,病原菌也以攻击植物SCF复合体使植物致病。此外,植物激素信号途径之间相互作用,共同影响抗逆反应。 展开更多
关键词 f-box蛋白家族 SCF复合体 植物 环境胁迫 抗逆反应
下载PDF
拟南芥F-box蛋白家族的功能研究进展 被引量:2
18
作者 魏春茹 李虎滢 +2 位作者 田苗苗 于秀梅 刘大群 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2300-2308,共9页
F-box蛋白是一类含有F-box基序、在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质。该文对国内外近年来有关F-box家族在拟南芥中的数量、种类以及在生长发育、细胞信号转导、生物及非生物逆境胁迫等多种生理过程中的作用等方面... F-box蛋白是一类含有F-box基序、在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质。该文对国内外近年来有关F-box家族在拟南芥中的数量、种类以及在生长发育、细胞信号转导、生物及非生物逆境胁迫等多种生理过程中的作用等方面的研究进展进行综述,以期促进该家族基因在拟南芥和其他重要农作物中的功能研究,尽快描绘出该家族在植物中的代谢网络图谱。 展开更多
关键词 拟南芥 f-box蛋白 结构 功能
下载PDF
葡萄F-box基因VvSLY1的克隆与表达分析 被引量:1
19
作者 王西成 吴伟民 +3 位作者 王壮伟 赵密珍 周蓓蓓 钱亚明 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期959-966,共8页
SLEEPY1(SLY1)属于F-box蛋白,是SCF复合体的主要组成元件之一,在赤霉素信号转导过程中发挥着重要的调节作用。本研究以夏黑葡萄为试材,利用电子克隆和RT-PCR技术克隆获得一个F-box蛋白基因全长c DNA序列,命名为VvSLY1。该基因全长为1096... SLEEPY1(SLY1)属于F-box蛋白,是SCF复合体的主要组成元件之一,在赤霉素信号转导过程中发挥着重要的调节作用。本研究以夏黑葡萄为试材,利用电子克隆和RT-PCR技术克隆获得一个F-box蛋白基因全长c DNA序列,命名为VvSLY1。该基因全长为1096 bp,包含1个555 bp的完整开放阅读框(ORF),编码184个氨基酸。序列比对和结构域分析结果表明,该VvSLY1包含F-box蛋白家族的LGG和LSL保守结构域。进化树分析结果显示,VvSLY1与可可亲缘关系最近。qRTPCR分析结果表明,在果实快速膨大发育阶段,外源赤霉素GA3处理会促进该基因的上调表达。 展开更多
关键词 葡萄 f-box蛋白 VvSLY1基因 克隆 基因表达
原文传递
沙田柚F-box蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:2
20
作者 郭丹妮 刘玉洁 +4 位作者 张渝 顾金燕 覃信梅 李惠敏 秦新民 《湖北农业科学》 2016年第14期3723-3726,3729,共5页
采用生物信息学方法,对沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因全长为1 427 bp(Gen Bank登录号为KR36... 采用生物信息学方法,对沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因全长为1 427 bp(Gen Bank登录号为KR363148),开放阅读框(ORF)全长为1 101 bp,共编码366个氨基酸,编码蛋白质的分子质量43.09 ku,理论等电点5.15。沙田柚F-box蛋白基因编码蛋白含有一个植物F-box蛋白家族的保守结构域,为亲水性非分泌不稳定蛋白,不跨膜运动,共有30个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)F-box蛋白的同源性分别为99%、98%。系统进化树表明,沙田柚F-box蛋白基因与与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)亲缘关系很近,属于同一进化分支。 展开更多
关键词 沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.] f-box蛋白基因 序列分析
下载PDF
上一页 1 2 10 下一页 到第
使用帮助 返回顶部