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Interactive Study between Two Types of 1-[2-(Hydroxyethoxy)methyl] -6-naphthylmethylthymines and HIV-1 Reverse Transcriptase 被引量:4
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作者 孟歌 陈芬儿 +1 位作者 De Clercq Erik 戴惠芳 《过程工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期24-28,共5页
Two different types of 1-[2-(hydroxyethoxy)methyl]-6-naphthylmethylthymines have been designed, synthesized and evaluated for their anti-HIV-1 activities in different cells lines. The binding free energy (DG) includin... Two different types of 1-[2-(hydroxyethoxy)methyl]-6-naphthylmethylthymines have been designed, synthesized and evaluated for their anti-HIV-1 activities in different cells lines. The binding free energy (DG) including steric and electrostatic between the two different ligands and reverse transcriptase Non-Nucleoside Binding Pocket (NNBP) have been docked and calculated to evaluate their accommodation circumstance on a SGI work station. The DG and anti-HIV-1 activity has been correlated in order to guide further drug design, which showed that the steric binding effect dominated in the whole binding action between the compounds and reverse transcriptase (RT). The results showed that more negative DG led to higher activity of compounds. 展开更多
关键词 艾滋病毒 hiv-1 逆转录敏 6萘基HEPT类似物 自由结合能 抗病毒活性
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Docking and field-based QSAR studies of S-DABOs as HIV-1 reverse transcriptase inhibitors 被引量:1
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作者 樊宁宁 刘振明 +1 位作者 王孝伟 刘俊义 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2017年第7期512-520,共9页
HIV-1 reverse transcriptase(RT) inhibitors are major components of HAART(highly active antiviral therapy). The S-DABOs(dihydro-alkylthio-benzyl-oxopyrimidines) series and their similar skeletons have exhibited p... HIV-1 reverse transcriptase(RT) inhibitors are major components of HAART(highly active antiviral therapy). The S-DABOs(dihydro-alkylthio-benzyl-oxopyrimidines) series and their similar skeletons have exhibited preferable activities to inhibit HIV-1 RT. In the present study, we generated field-based QSAR models using common structure alignment, which was characterized by Gaussian steric, electrostatic, hydrophobic, hydrogen bond donor, hydrogen bond acceptor and aromatic ring fields(R2 = 0.8421, RCV2 = 0.5949 for the training set, Q2 = 0.5486, Pearson-r = 0.7460 for the test set). Docking, pocket surface and contour map analyses were carried out. Key pharmacophore features were investigated, including(i) π-π interaction with residue Tyr181, Tyr188 and Trp229, σ-π interaction with His236,(ii) hydrogen bond with residue Lys101 and halogen bond with residue Tyr188. The docking analysis and field-based QSAR models could provide reasonable guidance in the rational design of potent HIV-1 RT inhibitors. 展开更多
关键词 hiv-1 reverse transcriptase S-DABOs Molecular docking Field-based QSAR
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Synthesis and anti-HIV-1 activity evaluation of N-1-alkyl-5-halogeno-6-alkylamino uracils as novel non-nucleoside HIV-1 reverse transcriptase inhibitors
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作者 闫寒 王孝伟 +2 位作者 郭盈 张志丽 刘俊义 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2011年第2X期146-153,共8页
N-1-alkyl-5-halogeno-6-alkylamino uracils,which are novel 1-[(2-hydroxyethoxy) methyl]-6-(phenylthio) thymine (HEPT) analogues,were synthesized as the selective and potent non-nucleoside human immunodeficiency virus(H... N-1-alkyl-5-halogeno-6-alkylamino uracils,which are novel 1-[(2-hydroxyethoxy) methyl]-6-(phenylthio) thymine (HEPT) analogues,were synthesized as the selective and potent non-nucleoside human immunodeficiency virus(HIV)-1 reverse transcriptase inhibitors.Some of the compounds showed potent inhibitory activity against HIV-1 reverse transcriptase.For instance,compounds 1d,1m and 1n exhibited potent anti-HTV-1 activity with the IC_(50) values of 13.3,11.7 and 3.15μM,respectively, which are comparable to that of nevirapine(IC_(50) 8.38μM). 展开更多
关键词 hiv-1 reverse transcriptase Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors HEPT analogues
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Similar pyridinone compounds with different activities of anti-HIV-1 reverse transcriptase 被引量:1
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作者 Yunqi Liu Xixi Li +4 位作者 Xiaodong Dou Chao Tian Zhili Zhang Junyi Liu Xiaowei Wang 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2018年第7期469-477,共9页
Among the structurally diverse NNRTIs, pyridinone scaffolds demonstrate high potency against HIV-1 wild type and drug-resistant strains. During the optimization of our pyridinone compound 1(LAM-trans), we found that... Among the structurally diverse NNRTIs, pyridinone scaffolds demonstrate high potency against HIV-1 wild type and drug-resistant strains. During the optimization of our pyridinone compound 1(LAM-trans), we found that the introduction of the N atoms in the C-4 position could dramatically improve the water solubility(7b), whereas protonation of the piperidine N atom resulted in a decrease in its hydrophobic interaction with the binding pocket. In particular, protonation altered the orientation of the alicyclic rings in the hydrophobic pocket, thus impeding the formation of key halogen bond and eventually leading to a huge change in anti-HIV-1 RT activity. These results provided theoretical and experimental basis for the subsequent structural modification of pyridinone compounds. 展开更多
关键词 Pyridinone derivatives hiv-1 reverse transcriptase Halogen bond Molecular docking study
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Synthesis and biological evaluation of novel 2-arylalkylthio-5-iodo-6-benzyl S-DABOs as potent non-nucleoside HIV-1 reverse transcriptase inhibitors 被引量:1
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作者 Liang Zhang Xiao-Wei Wang Jun-Yi Liu 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2012年第1期28-32,共5页
A series of novel dihydro-alkylthio-benzyl-oxopyrimidines (S-DABOs) 7a-f have been designed and synthesized with an efficient method. Biological evaluation of their HIV-1 reverse transcriptase inhibitory activities ... A series of novel dihydro-alkylthio-benzyl-oxopyrimidines (S-DABOs) 7a-f have been designed and synthesized with an efficient method. Biological evaluation of their HIV-1 reverse transcriptase inhibitory activities was performed using Nevirapine (NVP) as a reference compound. Among the series, compound 7d shows the highest reverse transcriptase inhibitory activity, which is better than Nevirapine. 展开更多
关键词 hiv-1 RT Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors S-DABOs
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Unique case of oligoastrocytoma with recurrence and grade progression:Exhibiting differential expression of high mobility group-A1 and human telomerase reverse transcriptase 被引量:3
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作者 Puneet Gandhi Richa Khare +3 位作者 Kavita Niraj Nitin Garg Sandeep K Sorte Hanni Gulwani 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2016年第9期296-301,共6页
Mixed gliomas, primarily oligoastrocytomas, account for about 5%-10% of all gliomas. Distinguishing oligoastrocytoma based on histological features alone has limitations in predicting the exact biological behavior, ne... Mixed gliomas, primarily oligoastrocytomas, account for about 5%-10% of all gliomas. Distinguishing oligoastrocytoma based on histological features alone has limitations in predicting the exact biological behavior, necessitating ancillary markers for greater specificity. In this case report, human telomerase reverse transcriptase(hT ERT) and high mobility group-A1(HMGA1); markers of proliferation and stemness, have been quantitatively analyzed in formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples of a 34 years old patient with oligoastrocytoma. Customized florescence-based immunohistochemistry protocol with enhanced sensitivity and specificity is used in the study. The patient presented with a history of generalized seizures and his magnetic resonance imaging scans revealed infiltrative ill-defined mass lesion with calcified foci within the left frontal white matter, suggestive of glioma. He was surgically treated at our center for four consecutive clinical events. Histopathologically, the tumor was identified as oligoastrocytoma-grade Ⅱ followed by two recurrence events and final progression to grade Ⅲ. Overall survival of the patient without adjuvant therapy was more than 9 years. Glial fibrillary acidic protein, p53, Ki-67, nuclear atypia index, pre-operative neutrophillymphocyte ratio, are the other parameters assessed. Findings suggest that hT ERT and HMGA1 are linked to tumor recurrence and progression. Established markers can assist in defining precise histopathological grade in conjuction with conventional markers in clinical setup. 展开更多
关键词 Human TELOMERASE reverse transcriptase High mobility group-A1 Oligoastrocytoma RECURRENCE Tumor GRADE
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A convenient synthesis of 1-alkyl-5-amino-6-phenylethyluracils as potential non-nucleoside HIV-1RT inhibitors
7
作者 马小艳 程志坚 +4 位作者 陈艳丽 李阿敏 张志丽 王孝伟 刘俊义 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2008年第4期281-284,共4页
1-Alkyl-5-amino-6-phenylethyluracils (1a, 1b) were synthesized as potential non-nucleoside HIV-1RT inhibitors. A convenient synthetic procedure was developed for the preparation of 1-alkyl-5-amino or 5-aminosubstitu... 1-Alkyl-5-amino-6-phenylethyluracils (1a, 1b) were synthesized as potential non-nucleoside HIV-1RT inhibitors. A convenient synthetic procedure was developed for the preparation of 1-alkyl-5-amino or 5-aminosubstituted-6-phenylethyluracils, which were synthesized in three or four steps from 6-methyluracil in good yield. The development of a one-pot reaction that simultaneously removed the benzyl protection group and reduced the nitro group greatly improved the yield of the synthesis. Compounds 1a and 1b are analogs of MKC-442, which is an efficient inhibitor of HIV-1 reverse transcriptase, 1a and 1b were tested for their inhibition of HIV-1RT, and moderate activity was found for 1a. 展开更多
关键词 hiv-1 reverse transcriptase 1-Alkyl-5-amino-6-phenylethyluracils Uracil derivatives
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Synthesis and biological evaluation of novel 1-aryl-5-iodo-6-benzyluracils as potent HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors
8
作者 王惟 李立 +5 位作者 刘畅 张亮 闫寒 张志丽 王孝伟 刘俊义 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2010年第4期312-317,共6页
We have synthesized the novel compounds 1a-1i,which are a series of hybrid analogues to 6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)- 5-iodouracil,a compound showing strong activity against HIV-1.We also evaluated the activity of t... We have synthesized the novel compounds 1a-1i,which are a series of hybrid analogues to 6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)- 5-iodouracil,a compound showing strong activity against HIV-1.We also evaluated the activity of these compounds as the inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase(HIV-1 RT),and they have demonstrated moderate activity. 展开更多
关键词 hiv-1 reverse transcriptase Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors l-[(2-Hydroxyethoxy)methyl]-6-phenylthiothymine
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应用HIV-1耐药性基因型检测广东部分地区HIV耐药株 被引量:13
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作者 万卓越 李杰 +3 位作者 付笑冰 林萍 鄢心革 刁丽梅 《中国艾滋病性病》 CAS 2006年第3期204-206,共3页
目的利用艾滋病病毒1型(HIV-1)耐药性基因型检测法,在HIV-1感染者中监测HIV-1耐药性病毒株,掌握广东省HIV-1感染者在利用抗病毒药物治疗前是否存在耐药突变及其流行情况。方法从未接受高效抗逆转录病毒联合疗法(HAART)治疗的HIV-1感染... 目的利用艾滋病病毒1型(HIV-1)耐药性基因型检测法,在HIV-1感染者中监测HIV-1耐药性病毒株,掌握广东省HIV-1感染者在利用抗病毒药物治疗前是否存在耐药突变及其流行情况。方法从未接受高效抗逆转录病毒联合疗法(HAART)治疗的HIV-1感染者血浆中提取病毒RNA,采用套式PCR扩增目的基因片断,并对扩增片断进行序列测定和分析。结果HIV-1耐药性基因型检测法能够从HIV-1感染者血浆病毒载量大于1 000拷贝/ml以上、CD4低于400以下的样本中扩增到目的片断。在广东省50例未治疗对象中,低中度耐药相关突变例数为2例,占4%;高度耐药相关突变例数为0;总耐药相关突变例数为2例,占4%。结论HIV-1耐药性基因型检测法能有效地监测HIV-1感染者血浆中的耐药性病毒株的存在,并且方法提供的结果准确、可靠。对广东省未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者中耐药突变的检测表明,HIV-1感染者中存在病毒的耐药性突变,也反应了HIV毒株自然变异情况的存在。 展开更多
关键词 艾滋病病毒1 耐药性 蛋白酶基因 逆转录酶基因 RT—PCR 序列测定
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深圳地区HIV-1感染者的本底耐药水平调查初探 被引量:5
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作者 吴永胜 马贞丽 +6 位作者 赵锦 赵广录 王晓辉 陈琳 甘永霞 张燕 冯铁建 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2008年第17期3388-3390,3393,共4页
[目的]建立一套完善,可靠,适合深圳人群的HIV-1耐药性基因型检测方法,调查分析深圳地区未接受抗病毒治疗的HIV感染者/AIDS患者的病毒株耐药突变及其本底流行情况。[方法]从未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆中提取病毒RNA,采用RT-PCR... [目的]建立一套完善,可靠,适合深圳人群的HIV-1耐药性基因型检测方法,调查分析深圳地区未接受抗病毒治疗的HIV感染者/AIDS患者的病毒株耐药突变及其本底流行情况。[方法]从未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆中提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增目的基因片断,并对扩增片断进行序列测定和分析。[结果]通过HIV-1耐药性基因型检测法能够获得1300bp长度的目的基因片断。经序列分析所得的21份RT基因结果中有8份对NRTI产生耐药突变(38.5%),5份对NNRTI产生耐药突变(23.81%);另外分析所得的12份PR基因结果中1份产生对蛋白酶抑制剂主要耐药突变(8.33%),5份产生对蛋白酶抑制剂次要耐药突变(41.67%)。[结论]HIV-1耐药性基因型检测法能有效地监测HIV-1感染者血浆中的耐药性病毒株的存在,并且检测结果表明,深圳地区未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者中已经存在耐药突变株。 展开更多
关键词 hiv-1 RT—PCR 序列测定 蛋白酶基因 逆转录酶基因 耐药性
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天然产物中的HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂 被引量:7
11
作者 王茜 杨柳萌 郑永唐1 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期381-382,U001,U002,共4页
综述了天然产物中对 HIV- 1逆转录酶具有抑制活性的化合物的来源和分类。重点介绍了几种 HIV - 1非核苷类逆转录酶抑制剂 ( NNRTIs)的性质、特点、抗 HIV- 1活性及其构效关系。从天然资源和传统中草药发现具有新结构、新作用机制的天然 ... 综述了天然产物中对 HIV- 1逆转录酶具有抑制活性的化合物的来源和分类。重点介绍了几种 HIV - 1非核苷类逆转录酶抑制剂 ( NNRTIs)的性质、特点、抗 HIV- 1活性及其构效关系。从天然资源和传统中草药发现具有新结构、新作用机制的天然 NNRTIs是开发研制抗 HIV- 1药物的一条极有希望的途径。 展开更多
关键词 天然产物 hiv-1 非核昔类逆转录酶抑制剂 化合物 逆转录酶
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分子动力学模拟别构抑制剂Efavirenz对HIV-1逆转录酶的作用 被引量:2
12
作者 孟现美 张少龙 张庆刚 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第2期436-444,共9页
为了理解非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)与HIV-1逆转录酶(RT)的相互作用机制,利用新力场ff12SB对未结合和结合Efavirenz(EFV)逆转录酶的三种RT大分子体系分别进行了100 ns的长时间动力学模拟。通过分析EFV对RT结构的影响、不同残基柔... 为了理解非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)与HIV-1逆转录酶(RT)的相互作用机制,利用新力场ff12SB对未结合和结合Efavirenz(EFV)逆转录酶的三种RT大分子体系分别进行了100 ns的长时间动力学模拟。通过分析EFV对RT结构的影响、不同残基柔性和不同体系构象的动力学行为等,发现EFV的结合会导致RT结构变化,从而影响RT的活性;证实了EFV的"分子楔"作用;还发现EFV的结合不但引起"拇指关节炎",而且引起轻度"手指关节炎";整个模拟过程中没有出现不同构象间的跃迁,但是无别构分子时的RT张开构象表现出明显的闭合倾向。这些结果有助于理解NNRTIs的抑制机制和RT构象变化的动力学性质。另外,还比较分析了模拟方法对计算结果的影响,对大分子体系的动力学模拟具有重要借鉴意义。 展开更多
关键词 hiv-I逆转录酶 逆转录酶抑制剂 别构抑制剂 分子动力学模拟 构象
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湖南省未经抗病毒治疗的HIV-1感染者耐药基因变异研究 被引量:7
13
作者 袁宏丽 郑煜煌 +2 位作者 周华英 李瑛 王敏 《中国感染控制杂志》 CAS 2008年第1期5-8,共4页
目的研究湖南省未经抗逆转录病毒治疗的人免疫缺陷病毒(HIV)/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者的HIV蛋白酶和逆转录酶区耐药基因变异情况,为更有效地开展高效抗逆转录病毒治疗提供参考。方法从184例研究对象的血浆中提取HIV-1RNA,采用套... 目的研究湖南省未经抗逆转录病毒治疗的人免疫缺陷病毒(HIV)/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)患者的HIV蛋白酶和逆转录酶区耐药基因变异情况,为更有效地开展高效抗逆转录病毒治疗提供参考。方法从184例研究对象的血浆中提取HIV-1RNA,采用套式逆转录-聚合酶链反应扩增HIV-1POL基因片段,并对扩增片段进行序列测定直接分析。结果获得阳性结果的106例感染者中,蛋白酶基因区次要耐药变异以M36I、H69K、I13V和I93L为多,它们的累积可引起蛋白酶抑制剂的耐药。逆转录酶区的耐药变异较少见,但发现1例同时存在多个与核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)耐药基因相关的基因位点变异的HIV感染者。结论湖南省未经抗病毒治疗的HIV感染者中存在原发耐药相关基因位点变异,耐药基因变异处于较低水平的流行状态,感染者在抗病毒治疗开始前和后均应定期检测耐药基因突变情况以指导用药。 展开更多
关键词 AIDS hiv-1 耐药突变 蛋白酶基因 逆转录酶基因 抗药性 微生物
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基于分子对接的6-萘甲基取代HEPT类HIV-1逆转录酶抑制剂构效关系研究 被引量:8
14
作者 何严萍 胡海荣 +3 位作者 许辽萨 孟歌 范康年 陈芬儿 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第2期254-258,共5页
采用分子对接方法得到了一系列 6-萘甲基取代 HEPT类逆转录酶抑制剂分子与 HIV-1逆转录酶复合物模型 ,从中抽取出抑制剂分子的活性构象 ,进一步应用 Co MFA和 Co MSIA方法建立了具有较好预测能力的 3 D-QSAR模型 ,深入探讨了这些化合物... 采用分子对接方法得到了一系列 6-萘甲基取代 HEPT类逆转录酶抑制剂分子与 HIV-1逆转录酶复合物模型 ,从中抽取出抑制剂分子的活性构象 ,进一步应用 Co MFA和 Co MSIA方法建立了具有较好预测能力的 3 D-QSAR模型 ,深入探讨了这些化合物的定量构效关系 ,为进一步的药物设计奠定了良好的基础 .另外 ,以化合物 1 3及其相应的 β异构体 2 4为代表 ,结合量子化学从头算分子轨道理论方法考察了它们的前线轨道 ,为阐明 α和 β系列化合物的活性差异提供了理论依据 . 展开更多
关键词 键词hiv-1逆转录酶抑制剂 HEPT类似物 分子对接 比较分子力场分析(CoMFA) 比较分子相似因 子分析(CoMSIA) 量子化学从头算
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3,4-二取代香豆素类衍生物的合成及其对HIV-1逆转录酶的抑制活性 被引量:4
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作者 黎文海 侯金明 尤启冬 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期28-34,共7页
苯并六元杂环类化合物是重要的逆转录酶抑制剂,目前报道的活性较好的化合物在结构上都有一个疏水的苯环和与苯环相连的酰胺部分。通过对酰胺部分进行结构改造,探索其对HIV-1逆转录酶活性的影响。合成了一系列未见文献报道的3,4-二取代... 苯并六元杂环类化合物是重要的逆转录酶抑制剂,目前报道的活性较好的化合物在结构上都有一个疏水的苯环和与苯环相连的酰胺部分。通过对酰胺部分进行结构改造,探索其对HIV-1逆转录酶活性的影响。合成了一系列未见文献报道的3,4-二取代香豆素类化合物,其结构经IR,1H NMR,MS及元素分析确证。初步的药理活性实验表明,23个化合物中有7个化合物具有一定的HIV-1逆转录酶抑制活性。 展开更多
关键词 3 4-二取代香豆素 hiv-1逆转录酶抑制剂 合成 抑制活性
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非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂Ⅱ6-(1-萘甲基)胸腺嘧啶类化合物三维定量构效关系 被引量:8
16
作者 孟歌 陈芬儿 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2003年第5期254-259,共6页
目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(... 目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(NNBP)作用情况进行了对接(Dock)研究;并建立了回归方程。结果用模型预测了2个6-(1-萘甲基)取代HEPT类化合物的-logEC50值,结果得以验证。空间立体效应占85.7%,静电立场效应占14.3%。结论对接结果显示:在NNBP中,化合物以蝴蝶双翅形的构象伸展开来,并以芳环与结合腔表面的芳香性氨基酸残基产生疏水性相互作用。6-位引入(1-萘甲基)可显著提高化合物的生物活性,空间效应是影响活性的主要因素,此模型可为进一步的结构优化提供理论指导。 展开更多
关键词 药物化学 构效关系 比较分子力场分析 Dock分析 6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物 hiv-1逆转录酶抑制剂
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取代基物化参数用于HEPT类HIV-1逆转录酶抑制剂的QSAR研究 被引量:2
17
作者 周原 梅虎 +2 位作者 梁桂兆 杨善彬 李志良 《精细化工》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第9期907-911,920,共6页
用描述取代基电性、立体性和疏水性的物化参数对6-苯硫基取代胸腺嘧啶HETP类化合物进行了结构表征,并对化合物抑制H IV-1逆转录酶的活性进行了QSAR研究。经逐步回归筛选变量后,所建多元线性回归方程复相关系数R2及留一法交互检验R2cv分... 用描述取代基电性、立体性和疏水性的物化参数对6-苯硫基取代胸腺嘧啶HETP类化合物进行了结构表征,并对化合物抑制H IV-1逆转录酶的活性进行了QSAR研究。经逐步回归筛选变量后,所建多元线性回归方程复相关系数R2及留一法交互检验R2cv分别为0.904和0.848 7。用预测集样本进行外部预测所得R2ext和Q2ext分别为0.928 9和0.929 4。结果表明,影响化合物活性的主要因素是嘧啶环5位X取代基,其电性和疏水性参数值越小,阻抑能力越强。 展开更多
关键词 取代基物化参数 6-苯硫基胸腺嘧啶类化合物 hiv-1逆转录酶抑制剂 定量构效关系
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应用高通量测序方法研究CRF01-AE亚型HIV-1毒株耐药突变的分子进化规律 被引量:4
18
作者 邓永岳 吴守丽 +1 位作者 邱丽君 严延生 《实用临床医药杂志》 CAS 2021年第19期1-6,共6页
目的探讨CRF01-AE亚型人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株在药物选择压力下耐药突变发生和演变的规律。方法选取5例一线方案治疗失败的CRF01-AE亚型HIV-1患者,收集其6~8年抗病毒治疗过程中的系列血样,应用高通量测序方法进行基因型耐药突... 目的探讨CRF01-AE亚型人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株在药物选择压力下耐药突变发生和演变的规律。方法选取5例一线方案治疗失败的CRF01-AE亚型HIV-1患者,收集其6~8年抗病毒治疗过程中的系列血样,应用高通量测序方法进行基因型耐药突变分析。结果①5例患者在启动治疗后早期即出现M184V突变以及非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)类耐药突变,常见的有K101E、G190A和K103N,其中M184V+G190A+TAMs是常见突变组合,停药或更换二线药物,这些突变也始终存在。②胸腺嘧啶脱氧核苷类似物变异(TAMs)突变形成过程中,有3例患者表现为TAM2路径,1例患者为TAM1途径,还有1例患者前期只有TAM2路径的突变,后期累加上TAM1途径的突变。③有3例患者在治疗过程中分别形成TAMs、Q151M复合体和T69插入复合物等多重耐药突变,更换二线方案后仍然治疗失败。结论①CRF01-AE亚型耐药患者在用药早期即开始出现耐药突变,数种突变逐渐累加,最终导致临床耐药,应尽早进行耐药突变监测。②TAMs突变通过2种途径竞争性发展,CRF01-AE亚型更偏向于TAM2途径,但随着治疗时间延长,2种途径可以产生融合。③更换二线方案前应排查针对替诺福韦(TDF)的耐药突变,其可能会导致二线方案无效。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1 耐药突变 高通量测序 分子进化规律 非核苷类逆转录酶抑制剂
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核酸适配体类抗HIV-1药物的研究进展 被引量:5
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作者 刘涛 缪有盼 +1 位作者 吴可柱 李爱秀 《药学进展》 CAS 2009年第1期1-6,共6页
核酸适配体是指能特异结合蛋白质或其它小分子物质的寡核苷酸片段,可通过对某些酶或蛋白因子的抑制达到抗病毒的目的。近年来,核酸适配体类药物的研发已经取得了进展,尤其是在抗艾滋病病毒方面,此类药物展现出了广阔的临床应用前景。目... 核酸适配体是指能特异结合蛋白质或其它小分子物质的寡核苷酸片段,可通过对某些酶或蛋白因子的抑制达到抗病毒的目的。近年来,核酸适配体类药物的研发已经取得了进展,尤其是在抗艾滋病病毒方面,此类药物展现出了广阔的临床应用前景。目前,核酸适配体类抗HIV-1药物按作用机制可分为抑制HIV-1逆转录酶的适配体、抑制HIV-1核糖核酸酶H的适配体和抑制HIV-1Tat蛋白介导的反式激活的适配体。介绍这3种核酸适配体类抗HIV-1药物的有关研究情况。 展开更多
关键词 核酸适配体 hiv-1逆转录酶 核糖核酸酶H 反式激活因子
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102例HIV-1感染者病毒株反转录酶基因多态性及耐药性变异研究 被引量:5
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作者 刘莉 张云智 +2 位作者 卢洪洲 Mireille Henry Catherine Tamalet 《诊断学理论与实践》 2007年第3期197-202,共6页
目的:目前中国未接受或已接受反转录酶抑制剂(RTI)治疗的HIV感染者的HIV反转录酶基因类型的数据较少。本研究探讨了HIV-1反转录酶的基因多态性,及在RTI选择性压力下出现的已知和未知变异位点。方法:分析研究21例未接受治疗及81例接受RT... 目的:目前中国未接受或已接受反转录酶抑制剂(RTI)治疗的HIV感染者的HIV反转录酶基因类型的数据较少。本研究探讨了HIV-1反转录酶的基因多态性,及在RTI选择性压力下出现的已知和未知变异位点。方法:分析研究21例未接受治疗及81例接受RTI治疗的HIV感染者的RT基因。大部分感染者(>80%)应用司他夫定(d4T)+地达诺新(ddI)+奈韦拉平(NVP)或d4T+拉米夫定(3TC)+依菲韦仑(EFV)三联HAART治疗方案。结果:在未接受治疗的患者中,发现了4个高度多态性位点(122、200、207和211)。在接受RTI治疗的患者中,发现了2种耐药相关变异(RAMs):①接受ddI+d4T+NVP治疗方案的患者中发现,K65R(9.8%)、L74V(7.4%)、M184V(7.4%)、Q151M(5%)和胸腺嘧啶类似物变异(TAMs)(9.3%),包括T215Y(5.5%);②接受d4T+3TC+EFV治疗方案的患者中发现,T215Y(23%)、M184V(20%)和TAMs(15.4%)。在所有病例中,非核苷反转录酶抑制剂(NNRTI)RAM的出现率很高(41.9%),而在142、221、224和228位点发现了4种可疑的新RAMs。结论:目前中国非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药相关变异十分普遍,本研究描述了RTI选择性变异的基因模式,提出了新的一些变异与RTI治疗的相关性。 展开更多
关键词 hiv-1 反转录酶抑制剂 药物相关变异 自然多态性 反转录酶
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