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火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析
被引量:
1
1
作者
陈翠
王卓
+5 位作者
谢碧玉
任陪娣
徐碧玉
金志强
黄绵佳
从心黎
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第23期7706-7713,共8页
本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用ICE序列3’端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条HuICE1序列,其cDNA序列全长1673 bp,具有一个1596 bp的完整开放阅读框,生物信息学...
本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用ICE序列3’端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条HuICE1序列,其cDNA序列全长1673 bp,具有一个1596 bp的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现,HuICE1蛋白属MYC2型转录因子,在3’端第340~384个氨基酸含有高度保守的bHLH结构域,表明HuICE1基因属bHLH家族,还有核定位信号(NLS)区、富S区、转膜区、类泛素化(SUMO)结合位点各1个。同源性分析表明,火龙果与甜菜(Beta vulgaris)的核苷酸序列相似度最高,为85.10%。qRT-PCR表达分析表明,在火龙果各个组织中HuICE1均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。
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关键词
火龙果(Hylocereus
undatus)
huice1
基因克隆
表达分析
原文传递
题名
火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析
被引量:
1
1
作者
陈翠
王卓
谢碧玉
任陪娣
徐碧玉
金志强
黄绵佳
从心黎
机构
海南大学园艺学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
海南大学生命科学与药学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第23期7706-7713,共8页
基金
海南省重点研发计划项目(ZDYF2016090)资助
文摘
本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用ICE序列3’端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条HuICE1序列,其cDNA序列全长1673 bp,具有一个1596 bp的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现,HuICE1蛋白属MYC2型转录因子,在3’端第340~384个氨基酸含有高度保守的bHLH结构域,表明HuICE1基因属bHLH家族,还有核定位信号(NLS)区、富S区、转膜区、类泛素化(SUMO)结合位点各1个。同源性分析表明,火龙果与甜菜(Beta vulgaris)的核苷酸序列相似度最高,为85.10%。qRT-PCR表达分析表明,在火龙果各个组织中HuICE1均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。
关键词
火龙果(Hylocereus
undatus)
huice1
基因克隆
表达分析
Keywords
Pitaya(Hylocereus undatus)
huice1
Gene cloning
Expression analysis
分类号
S66 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析
陈翠
王卓
谢碧玉
任陪娣
徐碧玉
金志强
黄绵佳
从心黎
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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