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Analysis of isocitrate dehydrogenase-1/2 gene mutations in gliomas
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作者 YU Lei QI Song-tao LI Zhi-yong 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2010年第24期3697-3705,共9页
Objective To highlight recent researches which may show promise for histomolecular classification and new treatments for gliomas.Data sources All articles cited in this review were mainly searched from PubMed, which w... Objective To highlight recent researches which may show promise for histomolecular classification and new treatments for gliomas.Data sources All articles cited in this review were mainly searched from PubMed, which were published in English from 1996 to 2010.Study selection Original articles and critical reviews selected were relevant to the isocitrate dehydrogenase-1/2 mutation in gliomas and other tumors.Results Extraordinary high rates of somatic mutations in isocitrate dehydrogenase-1/2 occur in the majority of World Health Organization grade Ⅱ and grade Ⅲ gliomas as well as grade Ⅳ secondary glioblastomas. Isocitrate dehydrogenase-1/2 mutations are associated with younger age at diagnosis and a better prognosis in patients with mutated tumors. The functional role of isocitrate dehydrogenase-1/2 mutations in the pathogenesis of gliomas is still unclear.Conclusion Isocitrate dehydrogenase-1/2 mutations define a specific subtype of gliomas and may have great significance in the diagnosis, prognosis, and treatment of patients with these tumors. 展开更多
关键词 isocitrate dehydrogenase-1 mutation GLIOMA a-ketoglutarate 2-hydroxyglutarate hypoxia-inducible factor
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IDH1基因在肝内胆管癌细胞HuCCT1增殖与迁移中的作用及其初步机制
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作者 林美佳 雷宇清 +3 位作者 叶洲杰 朱丽萍 王心睿 黄雄飞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期194-203,共10页
目的探讨异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)在肝内胆管癌(iCCA)细胞HuCCT1增殖与迁移中的作用及其可能的分子机制。方法采用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建IDH1基因敲除的HuCCT1细胞(HuCCT1^(IDH1-/-));CCK-8法和克隆形成实验检测IDH1野生型HuCCT1(Hu... 目的探讨异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)在肝内胆管癌(iCCA)细胞HuCCT1增殖与迁移中的作用及其可能的分子机制。方法采用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建IDH1基因敲除的HuCCT1细胞(HuCCT1^(IDH1-/-));CCK-8法和克隆形成实验检测IDH1野生型HuCCT1(HuCCT1^(WT))细胞和HuCCT1^(IDH1-/-)细胞的增殖能力;细胞划痕和Transwell实验检测细胞的迁移和侵袭能力;Western blotting检测细胞上皮间质转化(EMT)相关蛋白E-钙黏蛋白(E-cadherin)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、Wnt3a、β-连环蛋白(β-catenin)的表达水平。生物信息学方法分析上述两种HuCCT1细胞的转录组测序结果,Western blotting验证转录组信息通路相关蛋白的表达。结果与HuCCT1细胞比较,HuCCT1^(IDH1-/-)细胞增殖和克隆形成数目明显减少(P<0.05),阻滞在G_(2)/M期细胞的比例明显增加(P<0.01),划痕愈合率明显降低(P<0.01),迁移细胞数目(P<0.001)和侵袭细胞数目(P<0.05)明显减少;q RT-PCR检测结果显示,HuCCT1^(IDH1-/-)细胞IDH1、Vimentin、MMP-9和调控G_(2)/M期增殖相关基因Cyclin A2、Cyclin B1及CDK1 mRNA表达水平降低(P<0.05),编码E-cadherin的CDH1 mRNA表达水平升高(P<0.01);Western blotting检测结果显示,HuCCT1^(IDH1-/-)细胞中E-cadherin表达水平升高(P<0.05),N-cadherin、Vimentin及MMP-9蛋白表达水平降低(P<0.05)。转录组测序结果显示,HuCCT1^(WT)与HuCCT1^(IDH1-/-)存在1476个差异表达基因(DEGs);基因本体论(GO)分析显示上述DEGs显著富集在炎症反应、细胞信号转导和细胞代谢等生物学过程;KEGG通路分析显示上述DEGs显著富集在Wnt、MAPK、Rap1、Hippo、TNF等与肿瘤细胞增殖和侵袭转移密切相关的信号通路。Western blotting验证结果显示,与HuCCT1^(WT)比较,HuCCT1^(IDH1-/-)细胞Wnt信号通路的Wnt3a和β-catenin蛋白表达水平降低(P<0.05)。结论IDH1基因参与调控iCCA细胞HuCCT1的迁移、侵袭及EMT过程,其机制可能与激活Wnt/β-catenin信号通路有关。 展开更多
关键词 肝内胆管癌 异柠檬酸脱氢酶1 细胞迁移 细胞侵袭 转录组
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组蛋白去乙酰化酶抑制剂ACY1215通过调控能量代谢酶保护脂多糖/D-氨基半乳糖诱导的急性肝衰竭小鼠机制研究
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作者 张小雅 石春霞 +4 位作者 郭金 王钰鲲 张丹眉 沈起艳 龚作炯 《实用肝脏病杂志》 CAS 2024年第6期812-815,共4页
目的探讨组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂ACY1215对急性肝衰竭(ALF)小鼠的保护作用及其可能的作用机制。方法将30只小鼠随机分为对照组、模型组和ACY1215处理组,采用脂多糖和D-氨基半乳糖联合腹腔注射诱导小鼠ALF模型,常规行血生化和组织... 目的探讨组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂ACY1215对急性肝衰竭(ALF)小鼠的保护作用及其可能的作用机制。方法将30只小鼠随机分为对照组、模型组和ACY1215处理组,采用脂多糖和D-氨基半乳糖联合腹腔注射诱导小鼠ALF模型,常规行血生化和组织病理学检查,采用Western blot法检测肝组织苹果酸脱氢酶1(MDH1)、异柠檬酸脱氢酶(IDH1)和果糖-2,6-二磷酸酶2(PFKFB2)及白介素-1β(IL-1β)和IL-18分子蛋白的表达。结果肝组织病理学检查显示,ALF模型制备成功,而ACY1215干预组肝组织病理学损害显著减轻;模型组血清ALT、AST和TBIL水平分别为(3743.5±655.9)U/L、(2539.4±488.1)U/L和(89.56±7.2)μmol/L,显著高于对照组【分别为(34.5±7.6)U/L、(32.3±9.3)U/L和(6.2±2.4)μmol/L,P<0.05】,而ACY1215处理组各项指标均显著降低【分别为(951.5±328.9)U/L、(475.3±131.24)U/L和(38.41±9.5)μmol/L,P<0.05】;模型组小鼠肝组织MDH1和IDH1表达较对照组显著减弱,PFKFB2、IL-18和IL-1β表达较对照组显著增强,而ACY1215干预组肝组织MDH1和IDH1表达较模型组显著增强,而PFKFB2、IL-18和IL-1β表达较模型组显著减弱。结论组蛋白去乙酰化酶抑制剂ACY1215可以通过对能量代谢酶的调节发挥保护ALF小鼠的作用。 展开更多
关键词 急性肝衰竭 组蛋白去乙酰化酶抑制剂 脂多糖和D-氨基半乳糖 苹果酸脱氢酶1 异柠檬酸脱氢酶1 果糖-2 6-二磷酸酶2 小鼠
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低级别胶质瘤异柠檬酸脱氢酶-1基因分型与磁共振表观弥散系数、血管内皮生长因子表达的关系
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作者 杜山别克·克孜 《安徽医药》 CAS 2024年第11期2187-2191,共5页
目的探讨低级别胶质瘤病人异柠檬酸脱氢酶-1(IDH-1)基因分型与磁共振表观弥散系数(ADC)、血管内皮生长因子(VEGF)表达的关系。方法纳入新疆医科大学附属肿瘤医院2021年6月至2023年5月收治的低级别脑胶质瘤病人52例开展回顾性研究,病人... 目的探讨低级别胶质瘤病人异柠檬酸脱氢酶-1(IDH-1)基因分型与磁共振表观弥散系数(ADC)、血管内皮生长因子(VEGF)表达的关系。方法纳入新疆医科大学附属肿瘤医院2021年6月至2023年5月收治的低级别脑胶质瘤病人52例开展回顾性研究,病人术前均接受磁共振弥散加权成像检查,经手术病理与WHO中枢神经系统肿瘤分级标准证实为低级别脑胶质瘤,根据IDH-1分型结果分成突变型组29例、野生型组23例。比较两组最小ADC值(ADC_(min))、平均ADC值(ADC_(mean))、最小相对ADC值(rADC_(min))、平均相对ADC值(rADC_(mean))。绘制受试者操作特征曲线(ROC曲线)分析ADC值对IDH-1分型的鉴别价值。分析病人IDH-1分型与VEGF表达的关系,比较不同VEGF表达病人的ADC值。结果突变型组ADC_(min)、ADC_(mean)、rADC_(min)、rADC_(mean)较野生型组增高(P<0.05)。ADC_(min)、ADC_(mean)、rADC_(min)、rADC_(mean)鉴别IDH-1分型的曲线下面积(AUC)分别为0.77(灵敏度75.86%,特异度73.91%)、0.79(灵敏度82.76%,特异度78.26%)、0.76(灵敏度79.31%,特异度78.26%)、0.77(灵敏度79.31%,特异度82.61%)。突变型组VEGF阳性率为13.79%,低于野生型组的47.83%(P<0.05)。VEGF阴性/弱阳性组ADC_(min)、ADC_(mean)、rADC_(min)、rADC_(mean)高于阳性组(P<0.05)。结论低级别脑胶质瘤IDH-1突变者的ADC_(min)、ADC_(mean)、rADC_(min)、rADC_(mean)相对高,ADC参数对其IDH-1分型具有鉴别价值,且IDH-1分型与VEGF表达相关。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 肿瘤分级 磁共振表观弥散系数 异柠檬酸脱氢酶-1 突变型 野生型
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常规MRI分形参数预测成人2~3级弥漫性胶质瘤IDH1突变状态的研究
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作者 王玉瑶 张瑾 +4 位作者 乔书琪 杨洋 胡玉川 颜林枫 崔光彬 《影像诊断与介入放射学》 2024年第2期120-127,共8页
目的评估常规MRI分形参数预测成人2~3级弥漫性胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)突变状态的效能。方法回顾性分析我院2017年2月—2019年4月经手术及活检病理证实为2~3级弥漫性胶质瘤且IDH1突变状态明确的151例患者临床及影像资料,其中IDH1突... 目的评估常规MRI分形参数预测成人2~3级弥漫性胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)突变状态的效能。方法回顾性分析我院2017年2月—2019年4月经手术及活检病理证实为2~3级弥漫性胶质瘤且IDH1突变状态明确的151例患者临床及影像资料,其中IDH1突变型(IDH1mut)118例,IDH1野生型(IDH1wt)33例。所有患者术前两周内采集平扫MRI。两名放射科医师基于液体衰减反转恢复(FLAIR)图像完成全肿瘤兴趣区勾画,利用Image J及FracLac插件提取该区域的分形维数(FD)及空隙度(LAC)参数,并采用Mann-Whitney U检验比较两组间分形参数差异。采用组内相关系数(ICC)评价两名医师提取定量参数的观察者内及观察者间一致性。二元Logistic回归用于构建联合参数(FD+LAC)诊断模型。利用受试者工作特征(ROC)曲线评价不同参数/模型诊断效能。不同参数/模型效能比较采用DeLong检验。结果FD、LAC参数的观察者内及观察者间一致性均较好(ICC均>0.8)。IDH1wt组FD值(1.274)及LAC值(0.434)中位数均高于IDH1mut组(FD:1.192;LAC:0.370),差异具有统计学意义(P均<0.001)。ROC分析结果显示,FD、LAC及联合参数模型(FD+LAC)在预测成人2~3级弥漫性胶质瘤IDH1突变状态曲线下面积为0.818、0.860、0.903,敏感度为0.780、0.822、0.805,特异度为0.818、0.788、0.849。结论基于常规MRI的分形分析参数有助于预测成人2~3级弥漫性胶质瘤IDH1突变状态。联合参数模型(FD+LAC)具有良好的诊断效能。 展开更多
关键词 磁共振成像 分形维数 空隙度 弥漫性胶质瘤 异柠檬酸脱氢酶1
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动脉自旋标记和扩散张量成像评估脑胶质瘤IDH1基因表型的价值研究 被引量:2
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作者 张萌 耿瑞雯 +1 位作者 白源 董洋 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期58-64,共7页
目的 探讨常规MRI联合动脉自旋标记(arterial spin labeling,ASL)成像、扩散张量成像(diffusion tensor imaging,DTI)在评估胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)表型中的价值。材料与方法 回顾性分析2019年9月至202... 目的 探讨常规MRI联合动脉自旋标记(arterial spin labeling,ASL)成像、扩散张量成像(diffusion tensor imaging,DTI)在评估胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)表型中的价值。材料与方法 回顾性分析2019年9月至2021年12月经病理证实为胶质瘤患者病例61例,根据基因或免疫组化检测IDH1表型,分为IDH1突变型(IDH1_(mutant),IDH1_(mut))组和IDH1野生型(IDH1 wild,IDH1_(wt))组,术前行颅脑MRI常规检查及ASL、DTI检查。评估IDH1_(mut)、IDH1_(wt)胶质瘤常规MRI特征(大小、位置、边缘、坏死囊变、出血、水肿和强化),测量肿瘤实性区、瘤周区的各向异性分数(anisotropy fraction,FA)、表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)、脑血流量最大值(_(max)imum cerebral blood flow,CBF_(max))、平均值(_(mean) cerebral blood flow,CBF_(mean)),计算相对脑血流量最大值(relativer CBF_(max),r CBF_(max))、相对脑血流量平均值(relativer CBF_(mean),r CBF_(mean))。采用SPSS 25.0进行统计学分析。所有样本组间分析采用独立样本t检验或非参数检验进行分析,建立多因素logistic回归模型并绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线预测其诊断效能。结果 本研究共纳入胶质瘤患者病例61例:IDH_(mut)19例、IDH1_(wt)42例。IDH1_(mut)与IDHwt胶质瘤的位置、强化、水肿、肿瘤实性区CBF、瘤周区ADC具有显著性差异(P<0.05);IDH1_(wt)肿瘤实性区CBF_(max)、CBF_(mean)、r CBF_(max)、r CBF_(mean)高于IDH1_(mut)型(P<0.05),曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.879、0.832、0.806、0.875;IDH1_(wt)瘤周ADC值高于IDH1_(mut)(P<0.05)。肿瘤实质区CBF_(mean)联合瘤周ADC诊断IDH1表型的效能最高(AUC=0.892)。多因素logistic回归显示肿瘤实体区CBF是胶质瘤IDH1表型预测的独立风险因素。结论 常规MRI特征、ASL及DTI对胶质瘤IDH1表型评估具有重要临床价值,联合肿瘤实质区CBF、瘤周ADC值可进一步提高胶质瘤IDH1表型的诊断效能。 展开更多
关键词 胶质瘤 磁共振成像 动脉自旋标记 扩散张量成像 异柠檬酸脱氢酶1 瘤周
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多序列影像组学结合临床及影像学特征预测脑胶质瘤IDH1基因突变 被引量:1
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作者 何金龙 高阳 +2 位作者 吴琼 李波 王鹏 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期27-33,134,共8页
目的探讨脑胶质瘤的多序列影像组学特征及临床相关参数预测脑胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1 (isocitrate dehydrogenase, IDH1)基因突变的价值。材料与方法 回顾性分析81例经组织病理学证实并有IDH1基因突变状态信息的脑胶质瘤患者。应用T2WI、... 目的探讨脑胶质瘤的多序列影像组学特征及临床相关参数预测脑胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1 (isocitrate dehydrogenase, IDH1)基因突变的价值。材料与方法 回顾性分析81例经组织病理学证实并有IDH1基因突变状态信息的脑胶质瘤患者。应用T2WI、T1WI、扩散加权成像(diffusion weighted imaging, DWI)、表观扩散系数(apparent diffusion coefficient, ADC)和对比增强MRI(contrast enhancement MRI, CE-MRI)五种图像进行影像组学特征提取,每个序列可提取107个影像组学特征,以上特征经单因素秩和检验、相关性分析及最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage selection operator, LASSO)降维筛选后,剩余特征采用多因素logistic回归分别建立各序列模型及多序列融合模型,包括T2WI模型、T1WI模型、DWI模型、ADC模型、CE-MRI模型和多序列影像组学模型。最后将多序列影像组学模型输出的组学分数与临床多因素模型结合建立联合模型。上述模型采用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线分析各模型的预测效能,并采用DeLong非参数检验比较曲线下面积(area under the curve, AUC)的差异。此外,采用决策曲线分析(decision curve analysis, DCA)评估多序列影像组学模型和联合模型鉴别IDH1基因突变状态的临床收益。结果 联合模型在胶质瘤IDH1基因突变预测中表现出最佳的效能(AUC为0.928)。多序列影像组学模型的AUC值均高于T2WI、DWI和ADC模型(分别为0.865 vs. 0.752、0.656、0.631,P值均<0.05);联合模型的AUC值高于T2WI、T1WI、T1增强和多序列影像组学模型(分别为0.928 vs. 0.752、0.827、0.829、0.865,P值均<0.05);但联合模型和临床模型之间的AUC值差异无统计学意义(分别为0.928和0.880,P>0.05)。决策曲线分析表明,联合模型较多序列影像组学模型鉴别IDH1基因突变的临床收益高。结论 多序列影像组学特征、临床及MRI影像学特征的结合对术前鉴别脑胶质瘤IDH1基因突变有重要价值。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 异柠檬酸脱氢酶1基因突变 影像组学 模型预测 磁共振成像
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多参数弥散磁共振成像评估胶质瘤IDH1基因型及肿瘤增殖活性 被引量:11
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作者 高璐月 李元昊 +6 位作者 李丽 申楠茜 李诗卉 张佳璇 刘宇飞 朱虹全 朱文珍 《放射学实践》 CSCD 北大核心 2023年第1期39-46,共8页
目的:探讨多参数弥散磁共振成像在评估胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因型以及肿瘤细胞增殖活性中的应用价值。方法:回顾性分析106例胶质瘤患者的病例资料及术前高端弥散磁共振扫描数据。在评估IDH1基因型时,将其分成58例IDH1野生型和48... 目的:探讨多参数弥散磁共振成像在评估胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因型以及肿瘤细胞增殖活性中的应用价值。方法:回顾性分析106例胶质瘤患者的病例资料及术前高端弥散磁共振扫描数据。在评估IDH1基因型时,将其分成58例IDH1野生型和48例IDH1突变型两组。由于部分数据缺失,在评估肿瘤细胞增殖活性时,纳入94例患者,将其分为包括31例WHOⅡ级、20例Ⅲ级以及43例Ⅳ级三组。构建不同重建模型,包括弥散张量成像(DTI)、弥散峰度成像(DKI)、神经突方向离散与密度成像(NODDI)以及标准模型成像(SMI)。比较各模型衍生参数的组间差异及鉴别诊断效能。评价ki67标记指数(Ki67 LI)与各参数的相关性。结果:各模型各参数在IDH1野生型与突变型胶质瘤之间的差异均有统计学意义。其中SMI模型的轴突信号分数(f)具有最佳的诊断效能,AUC值为0.788,灵敏度为70.8%,特异度为75.9%。在较低级别胶质瘤(LrGG)亚组中,f具有最佳的诊断效能,AUC值为0.772,灵敏度为77.5%,特异度为70.6%。在胶质母细胞瘤(GBM)亚组中,各参数的组间差异均不具有统计学意义。随着病理级别升高,Ki67 LI显著升高。NODDI模型的细胞内体积分数(ICVF)具有最大的相关系数(0.579),与Ki67 LI呈显著正相关。结论:多参数弥散磁共振成像在评估胶质瘤IDH1基因型方面表现出良好的效能,其中SMI模型的f参数显著优于其他参数。ICVF在评估肿瘤细胞增殖活性方面表现出较大的潜力。 展开更多
关键词 胶质瘤 异柠檬酸脱氢酶1 弥散磁共振成像 磁共振成像 细胞增殖
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异柠檬酸脱氢酶-1突变对胶质瘤血管生成的影响
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作者 阮建桥 王晶 +1 位作者 徐辉 曹相玫 《宁夏医科大学学报》 2023年第9期885-891,共7页
目的研究异柠檬酸脱氢酶-1(IDH-1)突变与胶质瘤血管生成的关系。方法收集宁夏医科大学总医院病理科确诊为胶质瘤的病理组织标本,根据免疫组化法(IHC)检测是否表达IDH-1突变,将组织标本分为突变型和野生型;用IHC法检测胶质瘤组织Ki-67、... 目的研究异柠檬酸脱氢酶-1(IDH-1)突变与胶质瘤血管生成的关系。方法收集宁夏医科大学总医院病理科确诊为胶质瘤的病理组织标本,根据免疫组化法(IHC)检测是否表达IDH-1突变,将组织标本分为突变型和野生型;用IHC法检测胶质瘤组织Ki-67、胶质原纤维酸性蛋白(GFAP)、血管内皮生长因子(VEGF)、血管内皮生长因子受体-2(VEGFR-2)、CD34的表达情况;CD34、PAS双重染色判断血管生成拟态(VM)现象。培养人胶质瘤U87细胞系,用强力霉素(doxycycline)诱导表达突变IDH-1,实验分为doxycycline诱导表达(dox+)组和非doxycycline诱导表达(dox-)组;Western blot检测细胞内IDH-1、VEGF、VEGFR-2的表达水平;细胞划痕实验检测细胞的迁移能力。结果IHC结果显示,Ki-67增殖指数与性别及病理分级存在关联,与IDH-1突变无相关性;GFAP在突变型及高级别胶质瘤中高表达;VEGF、VEGFR-2、CD34在突变型中表达水平均高于野生型(P均<0.05);VM在突变型和野生型胶质瘤中均有表达。Western blot检测结果显示VEGF、VEGFR-2在U87细胞内dox+组中表达水平均高于dox-组。细胞划痕实验结果显示,dox-组在24 h和48 h细胞划痕愈合率均低于dox+组。结论IDH-1突变与胶质瘤血管生成存在关联。 展开更多
关键词 异柠檬酸脱氢酶-1 胶质瘤 血管生成 血管生成拟态
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异柠檬酸脱氢酶1及其产物在肝衰竭患者的表达与临床意义
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作者 邓威 陈倩 +3 位作者 石春霞 郭金 张璐懿 龚作炯 《中国肝脏病杂志(电子版)》 CAS 2023年第3期50-55,共6页
目的探讨肝衰竭患者血清异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)及其产物的水平变化,分析其作用及潜在作用机制。方法回顾性分析2019年2月至2019年12月在武汉大学人民医院就诊的肝硬化患者(40例)、肝衰竭患者(30例)、肝衰竭... 目的探讨肝衰竭患者血清异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)及其产物的水平变化,分析其作用及潜在作用机制。方法回顾性分析2019年2月至2019年12月在武汉大学人民医院就诊的肝硬化患者(40例)、肝衰竭患者(30例)、肝衰竭合并感染者(30例)及健康体检者(20例)的临床资料。采集各组血清,检测各组IDH1水平、活化部分凝血活酶时间(activated partial thromboplastin time,APTT)、凝血酶原时间(prothrombin time,PT)、凝血酶原活动度(prothrombin time activity,PTA)、丙氨酸氨基转移酶(alanine transaminase,ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(aspartate amino transferase,AST)、白蛋白(albumin,ALB)、总胆红素(total bilirubin,TBil)、白细胞计数(white blood cell count,WBC)、中性粒细胞比例(neutrophil ratio,Neu%)、血小板计数(platelet count,PLT)、红细胞计数(red blood cell count,RBC)、血红蛋白(hemoglobin,Hb)及超敏C-反应蛋白(hs C-reactive protein,hs-CRP)水平,检测血清异柠檬酸、α-酮戊二酸及NADPH丰度。采用Spearman相关分析探究临床生物化学指标与IDH1的相关性,采用二元Logistic回归分析肝衰竭患者发生感染的影响因素,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估影响因素对肝衰竭患者发生感染的价值。结果对照组、肝硬化组、肝衰竭组及肝衰竭合并感染组血清IDH1水平依次升高(中位数:15.35 U/L vs 34.69 U/L vs 75.26 U/L vs 135.82 U/L),差异有统计学意义(H=105.70,P<0.001)。血清IDH1水平与ALT、AST及TBil呈正相关(r值分别为0.884、0.876、0.830,P均<0.001),与PTA呈负相关(r=-0.626,P<0.001)。肝衰竭组IDH1底物异柠檬酸丰度较对照组增加(929982.67±187082.79 vs 261854.12±116906.79),产物α-酮戊二酸丰度较对照组降低(1375241.56±235207.2 vs 4362813.42±635864.95),肝衰竭组NADPH丰度较对照组降低(495.99±48.83 vs 916.13±101.16),差异均有统计学意义(t=-3.029,P=0.009;t=4.407,P=0.001;t=3.740,P=0.002)。Logistic多因素回归分析表明,IDH1和hs-CRP为肝衰竭患者发生感染的独立危险因素(OR=1.088,95%CI:1.042~1.136,P<0.001;OR=1.059,95%CI:1.042~1.136,P=0.049)。IDH1预测肝衰竭患者发生感染的ROC曲线下面积为0.847,显著高于hs-CRP(0.651;z=2.107,P=0.035)。结论IDH1在肝衰竭诊断中具有一定价值,与肝衰竭发展具有一定关系,是评估肝衰竭患者发生感染的独立危险因素。 展开更多
关键词 肝衰竭 异柠檬酸脱氢酶1 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
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苯并[a]芘恶性转化细胞THBEc1中miR-584-5p/miR-211-5p/叉头框蛋白A1轴参与IDH1和HSPB1转录调控
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作者 马雪 刘芷毓 +3 位作者 邢云昆 姚碧云 傅娟玲 赵鹏 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第11期841-852,共12页
目的探索苯并[a]芘(BaP)恶性转化人支气管上皮细胞T-16HBE-C1(THBEc1)中微RNA(miRNA)调控叉头框蛋白A1(FOXA1)表达上调的机制,并筛选和验证FOXA1的潜在靶基因。方法利用TargetScan,ENCORI数据库和THBEc1细胞与非转化细胞16HBE间miRNA的... 目的探索苯并[a]芘(BaP)恶性转化人支气管上皮细胞T-16HBE-C1(THBEc1)中微RNA(miRNA)调控叉头框蛋白A1(FOXA1)表达上调的机制,并筛选和验证FOXA1的潜在靶基因。方法利用TargetScan,ENCORI数据库和THBEc1细胞与非转化细胞16HBE间miRNA的二代测序(NGS)结果,综合预测靶向调控FOXA1的miRNA,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)进一步筛选预测的miRNA。采用miRNA模拟物(mimics)转染THBEc1细胞,Western印迹法测定FOXA1蛋白表达水平,对靶向调控FOXA1的miRNA进行鉴定。利用hTF,JASPAR和ENCODE数据库结合FOXA1敲除细胞THBEc1-ΔFOXA1-c34和对照细胞THBEc1-ctrl间mRNA的NGS结果,综合预测FOXA1的潜在靶基因。利用RT-qPCR进一步对预测的靶基因[跨膜蛋白98(TMEM98)、IKAROS家族锌指2(IKZF2)、异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)、肿瘤坏死因子受体相关因子5(TRAF5)、骨形态发生蛋白2型受体(BMPR2)、热休克蛋白B1(HSPB1)、Runt相关转录因子2(RUNX2)、golgin A7家族成员B(GOLGA7B)和维甲酸相关孤核受体A(RORA)]进行筛选。通过转染过表达质粒构建稳定表达FOXA1的细胞模型THBEc1-ΔFOXA1-c34-oe,即FOXA1功能回补,并利用RT-qPCR和Western印迹法验证FOXA1的潜在靶基因。结果TargetScan和ENCORI数据库分别预测到213和145个可能靶向调控FOXA1的miRNA。NGS共发现351个miRNA在THBEc1细胞中表达下调(差异倍数<0.5,且错误发现率<0.05),其中hsa-miR-584-5p(miR-584-5p),hsa-miR-142-5p(miR-142-5p)和hsa-miR-211-5p(miR-211-5p)在上述2个数据库中均被预测可靶向调控FOXA1。RT-qPCR结果证实,THBEc1细胞中miR-584-5p,miR-142-5p和miR-211-5p表达水平显著低于16HBE细胞(P<0.01)。转染miR-584-5p模拟物或miR-211-5p模拟物均可显著下调THBEc1细胞FOXA1蛋白表达水平(P<0.01),而转染miR-142-5p模拟物对THBEc1细胞FOXA1蛋白表达水平无明显影响。THBEc1-ΔFOXA1-c34和THBEc1-ctrl细胞间的20个差异表达基因(差异倍数<0.5或>2,且错误发现率<0.05)被hTF,JASPAR和ENCODE数据库均预测为FOXA1的潜在靶基因。RT-qPCR结果显示,在THBEc1-ΔFOXA1-c34中,TMEM98,IKZF2,IDH1,TRAF5,BMPR2,HSPB1和RUNX2 mRNA表达水平显著下调(P<0.05,P<0.01),GOLGA7B和RORA mRNA表达水平显著上调(P<0.05,P<0.01);在THBEc1-ΔFOXA1-c34-oe中,IDH1和HSPB1的mRNA表达水平显著上调(P<0.01),余7个基因mRNA表达水平未见改变。Western印迹结果显示,THBEc1-ΔFOXA1-c34细胞中IDH1和HSPB1表达水平较THBEc1-ctrl均显著下调(P<0.01);而恢复FOXA1表达的THBEc1-ΔFOXA1-c34-oe细胞中IDH1和HSPB1表达水平较对照细胞THBEc1-ΔFOXA1-c34-ctrl均显著上调(P<0.01)。结论BaP恶性转化细胞THBEc1中miR-584-5p/miR-211-5p/FOXA1轴参与IDH1和HSPB1转录调控。 展开更多
关键词 苯并[A]芘 叉头框蛋白A1 miR-584-5p miR-211-5p 异柠檬酸脱氢酶1 热休克蛋白B1
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Crispr-Cas12a法快速检测脑胶质瘤异柠檬酸脱氢酶1基因突变的效能研究
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作者 冯哲斌 孔东生 +1 位作者 冯世宇 余新光 《临床神经病学杂志》 CAS 2023年第4期283-288,共6页
目的运用Crispr-Cas12a法快速检测冰冻脑胶质瘤组织样本中异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因R132H单核苷酸多态性,初步评价该方法的检测效能及其与直接测序方法的一致性。方法选择30例脑胶质瘤冰冻组织样本,分别使用Crispr-Cas12a法、免疫组织... 目的运用Crispr-Cas12a法快速检测冰冻脑胶质瘤组织样本中异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因R132H单核苷酸多态性,初步评价该方法的检测效能及其与直接测序方法的一致性。方法选择30例脑胶质瘤冰冻组织样本,分别使用Crispr-Cas12a法、免疫组织化学法(IHC)以及直接测序法对样本IDH1-R132H位点突变情况进行检测,计算Crispr-Cas12a法的灵敏度、特异性等效能指标,并利用配对χ^(2)检验(McNemar检验)及Kappa一致性检验分析Crispr-Cas12a法、IHC法与金标准(直接测序方法)的一致性。结果利用Crispr-Cas12a法初步实现了60 min内对冰冻脑胶质瘤组织样本IDH1-R132H位点突变的快速检测。以直接测序为金标准,Crispr-Cas12a法的灵敏度为87.7%,特异性为97.0%,一致性为91.1%,Kappa一致性检验显示两种方法一致性较好(k=0.816)。结论Crispr-Cas12a法能快速、准确地对冰冻脑胶质瘤组织样本IDH1-R132H突变进行检测,且稳定性较好,有望成为一种检测IDH1突变的术中检测方法。 展开更多
关键词 异柠檬酸脱氢酶1 Crispr-Cas12a 即时检测
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基于常规MRI影像组学无创性诊断胶质细胞瘤IDH1基因型的研究
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作者 徐慰幸子 周维燕 +1 位作者 文剑波 黎元 《中国CT和MRI杂志》 2023年第10期1-4,共4页
目的探讨胶质细胞瘤IDH1基因突变型与野生型的常规MRI特征,评价常规影像对胶质瘤IDH1基因状态的无创性预测的价值。方法回顾性分析2014年1月至2018年12月期间华山医院胶质瘤共305例。收集强化均匀性等24个特征。根据2018版WHQ胶质瘤病... 目的探讨胶质细胞瘤IDH1基因突变型与野生型的常规MRI特征,评价常规影像对胶质瘤IDH1基因状态的无创性预测的价值。方法回顾性分析2014年1月至2018年12月期间华山医院胶质瘤共305例。收集强化均匀性等24个特征。根据2018版WHQ胶质瘤病理分级,将入组患者分为低级别(WHOⅠ和Ⅱ级)胶质瘤I DH1基因野生型与突变型组;高级别(WHOⅢ和Ⅳ级)胶质瘤IDH1基因野生型与突变型四组。采用Feature Selection Library(FSLib)中的mrmr等十种特征选择方法,筛出与IDH1基因相关的影像学及临床特征,计算特征的P值。结果在低级别胶质瘤组中,选择的6个有效特征集为(年龄、脑干、块状强化、左侧额叶、岛叶、T_(2)WI信号),诊断正确率为79%。在高级别胶质瘤组中,筛出的6个有效特征集为(强化程度、水肿均匀性、坏死、强化均匀性、环形强化、钙化),诊断正确率为8.2%。结论基于常规影像学特征选择数据分析有助于术前无创性诊断胶质瘤IDH1基因状态。 展开更多
关键词 胶质细胞瘤 影像特征集 异柠檬酸盐脱氢酶1(IDH1) 特征集选择
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实验小鼠肾匀浆中苹果酸酶-1和异柠檬酸脱氢酶-1实验室检测能力验证结果评价 被引量:6
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作者 王洪 魏杰 +2 位作者 于鹏丽 巩薇 岳秉飞 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期199-203,共5页
目的通过实验小鼠肾匀浆中苹果酸酶-1和异柠檬酸脱氢酶-1检测能力验证计划,了解实验动物检测机构检验能力,提高实验动物质量检测水平。方法按照CNAS批准的能力验证方案,通过样品制备,经过稳定性和均匀性检验合格,作为能力验证样品。采... 目的通过实验小鼠肾匀浆中苹果酸酶-1和异柠檬酸脱氢酶-1检测能力验证计划,了解实验动物检测机构检验能力,提高实验动物质量检测水平。方法按照CNAS批准的能力验证方案,通过样品制备,经过稳定性和均匀性检验合格,作为能力验证样品。采用随机编号,发样给参加单位,并附作业指导书。在规定时限提交检验报告和原始记录复印件,其结果与样品预检结果一致的判为满意结果,不一致或未能提交结果的判为不满意结果。结果共有10个实验室参加本次能力验证项目,其中满意结果的实验室8个,占总参加机构的80%,不满意的实验室有2个,占20%。结论实验动物质量检测机构在实验小鼠肾匀浆中苹果酸酶-1和异柠檬酸脱氢酶-1的检测能力较高,实施能力验证计划能够反映实验室的检测水平。 展开更多
关键词 能力验证 实验动物 苹果酸酶-1 异柠檬酸脱氢酶-1
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不同病理类型和级别胶质瘤细胞IDH1基因突变情况分析 被引量:4
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作者 王国良 赛克 +3 位作者 高寒 王卓才 杨群英 陈忠平 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 2014年第8期364-367,共4页
目的探讨国人不同病理类型和级别胶质瘤细胞中异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因突变情况及其临床意义。方法应用mIDH1 R132H免疫组化学法检测87例国人不同病理类型和级别的胶质瘤标本中IDH1基因突变发生率,分析不同病理类型、不同WHO级别和不... 目的探讨国人不同病理类型和级别胶质瘤细胞中异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因突变情况及其临床意义。方法应用mIDH1 R132H免疫组化学法检测87例国人不同病理类型和级别的胶质瘤标本中IDH1基因突变发生率,分析不同病理类型、不同WHO级别和不同年龄的IDH1基因突变情况。结果 87例国人胶质瘤标本中有45例(51.7%)检出IDH1基因突变,并与胶质瘤的病理类型、WHO分级以及年龄等具有相关性。结论 IDH1基因突变在WHOⅡ、Ⅲ级胶质瘤中的发生率较高,并在胶质瘤的发生、发展过程中起重要作用。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 病理分型 异柠檬酸脱氢酶1 基因突变
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异柠檬酸脱氢酶1基因突变对替莫唑胺干预下脑胶质瘤U87细胞凋亡的影响 被引量:6
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作者 罗刚 喻坚柏 +2 位作者 陈涛 唐宁 李春辉 《安徽医药》 CAS 2021年第8期1492-1496,共5页
目的研究异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)基因突变对替莫唑胺干预下脑胶质瘤U87细胞凋亡的影响,以期深入了解其生物学特性及其化疗敏感性。方法通过DNA重组技术构建携带野生IDH1基因(wIDH1)或突变的IDH1基因(mIDH1)... 目的研究异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)基因突变对替莫唑胺干预下脑胶质瘤U87细胞凋亡的影响,以期深入了解其生物学特性及其化疗敏感性。方法通过DNA重组技术构建携带野生IDH1基因(wIDH1)或突变的IDH1基因(mIDH1)的真核表达载体;通过CCK-8检测三种稳定细胞系的增殖能力和细胞活力;利用流式细胞仪技术检测稳转细胞系细胞凋亡率及替莫唑胺干预后细胞凋亡率的变化;构建裸鼠移植瘤模型,替莫唑胺干预,ELISA技术和蛋白质免疫印迹检测细胞相关凋亡蛋白[半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-9(Caspase-9)、B淋巴细胞瘤-2相关蛋白(Bax)和B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)]的表达情况;测量肿瘤大小为宽和长度,计算肿瘤大小;统计不同处理组肿瘤形成抑制率和总有效率。结果wIDH1组(100.37±10.24),对照组(102.45±13.57)和mIDH1组(100.63±12.42)之间细胞增殖差异无统计学意义(P>0.05)。mIDH1组U87细胞在CCK-8测定中显示出对替莫唑胺的敏感性,mIDH1组(36.84±3.55)细胞增殖和细胞活力较wIDH1组(98.17±8.54)和对照组(73.26±5.37)低(P<0.05);mIDH1组(62.18±3.47)%细胞的凋亡率高于对照组(33.16±6.54)%和wIDH1组(15.36±2.33)%;蛋白质免疫印迹和酶联免疫吸附测定(ELISA)结果显示,三组不同处理中,mIDH1组在Caspase-3,Caspase-9和Bax中的蛋白表达水平最高,Bcl-2的蛋白表达水平最低(P<0.05),wIDH1的异位过表达诱导Bcl-2蛋白表达水平的上调及Caspase-3,Caspase-9和Bax蛋白水平的下调(P<0.05);与其余两组相比,mIDH1组(220.17±12.15)mm^(3)的肿瘤体积最小(P<0.05)。wIDH1组(624.36±33.54)mm^(3)与对照组(601.17±36.18)mm^(3)差异无统计学意义(P>0.05);在替莫唑胺治疗组中,mIDH1组的总有效率为(73.15±8.46)%,wIDH1组的总有效率为(22.16±3.96)%。对照组的结果为(42.25±3.17)%。结论mIDH1通过上调替莫唑胺后胶质瘤细胞Caspase-3、Caspase-9、Bax表达并下调Bcl-2表达提高胶质瘤细胞凋亡率,增强治疗敏感性。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 人异柠檬酸脱氢酶1 替莫唑胺 胶质瘤细胞 凋亡率
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Updates on management of gliomas in the molecular age 被引量:2
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作者 Ali Ahmed Mohamed Rakan Alshaibi +2 位作者 Steven Faragalla Youssef Mohamed Brandon Lucke-Wold 《World Journal of Clinical Oncology》 2024年第2期178-194,共17页
Gliomas are primary brain tumors derived from glial cells of the central nervous system,afflicting both adults and children with distinct characteristics and therapeutic challenges.Recent developments have ushered in ... Gliomas are primary brain tumors derived from glial cells of the central nervous system,afflicting both adults and children with distinct characteristics and therapeutic challenges.Recent developments have ushered in novel clinical and molecular prognostic factors,reshaping treatment paradigms based on classi-fication and grading,determined by histological attributes and cellular lineage.This review article delves into the diverse treatment modalities tailored to the specific grades and molecular classifications of gliomas that are currently being discussed and used clinically in the year 2023.For adults,the therapeutic triad typically consists of surgical resection,chemotherapy,and radiotherapy.In contrast,pediatric gliomas,due to their diversity,require a more tailored approach.Although complete tumor excision can be curative based on the location and grade of the glioma,certain non-resectable cases demand a chemotherapy approach usually involving,vincristine and carboplatin.Addi-tionally,if surgery or chemotherapy strategies are unsuccessful,Vinblastine can be used.Despite recent advancements in treatment methodologies,there remains a need of exploration in the literature,particularly concerning the efficacy of treatment regimens for isocitrate dehydrogenase type mutant astrocytomas and fine-tuned therapeutic approaches tailored for pediatric cohorts.This review article explores into the therapeutic modalities employed for both adult and pediatric gliomas in the context of their molecular classification. 展开更多
关键词 GLIOMAS Chemotherapy RADIOTHERAPY isocitrate dehydrogenase type mutant Pediatric gliomas ASTROCYTOMA OLIGODENDROGLIOMA 1p/19q-codeleted
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异柠檬酸脱氢酶1基因突变焦磷酸测序检测方法的建立 被引量:2
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作者 王丹慧 蔡彦宁 +2 位作者 张燕莉 高杰 杨彩侠 《首都医科大学学报》 CAS 2014年第2期219-224,共6页
目的建立异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)基因突变的焦磷酸测序检测方法,确定该方法的检测灵敏度。分析焦磷酸测序法与直接测序法对于鉴定IDH1突变的差异。方法构建携带野生型和突变型IDH1基因的质粒,使用质粒优化焦... 目的建立异柠檬酸脱氢酶1(isocitrate dehydrogenase 1,IDH1)基因突变的焦磷酸测序检测方法,确定该方法的检测灵敏度。分析焦磷酸测序法与直接测序法对于鉴定IDH1突变的差异。方法构建携带野生型和突变型IDH1基因的质粒,使用质粒优化焦磷酸测序方法。使用已知比例的野生型和突变型质粒作为模版,确定突变的检测灵敏度。针对96例胶质瘤患者手术切除标本的基因组DNA,分别使用直接测序法和焦磷酸测序法,鉴定IDH1基因突变类型,并比较。结果使用焦磷酸测序能够检测到低至2%的IDH1突变。直接测序检出突变阳性率为32.3%、焦磷酸测序检出突变阳性率为74.0%。结论焦磷酸测序法检测IDH1基因突变灵敏可靠,适合临床分子诊断。 展开更多
关键词 异柠檬酸脱氢酶1 焦磷酸测序法 突变
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血清肿瘤标记物异柠檬酸脱氢酶1对肺癌的辅助诊断价值 被引量:4
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作者 谢昊 孔祥溢 张强 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期813-817,共5页
目的探讨血清肿瘤标记物异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)对肺癌辅助诊断的临床价值。方法收集一般资料,应用酶联免疫法检测肺癌患者、非肺癌人群血清中IDH1的浓度水平,并分析其在肺癌诊断中的临床意义。结果肺癌患者血清中IDH1的浓度水平明显高... 目的探讨血清肿瘤标记物异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)对肺癌辅助诊断的临床价值。方法收集一般资料,应用酶联免疫法检测肺癌患者、非肺癌人群血清中IDH1的浓度水平,并分析其在肺癌诊断中的临床意义。结果肺癌患者血清中IDH1的浓度水平明显高于非肺癌人群[(7.12±6.98)ng/ml比(2.09±1.83)ng/ml,t=11.540,P<0.001];血清IDH1在腺癌和鳞癌中的浓度水平显著高于小细胞肺癌[(7.91±7.26)ng/ml比(2.76±2.27)ng/ml,t=6.345,P<0.001];血清IDH1在肺癌、Ⅰ+Ⅱ期肺癌、Ⅲ+Ⅳ期肺癌中检测的敏感度分别为47.4%、49.1%和46.3%。结论血清IDH1的检测对于非小细胞肺癌(鳞癌和腺癌)和小细胞肺癌的诊断、鉴别诊断以及对Ⅰ和Ⅱ期肺癌的辅助诊断具有较高的敏感度和特异性,血液IDH1在肺癌的辅助诊断中具有良好的临床应用价值。 展开更多
关键词 肺癌 异柠檬酸脱氢酶1 辅助诊断
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不同运动方式对大鼠异柠檬酸脱氢酶和磷酸果糖激酶-1的影响 被引量:5
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作者 王丽艳 张敏 +4 位作者 赵晓丽 郭彦青 曹颖 于公元 康英姿 《天津医科大学学报》 2011年第2期170-172,共3页
目的:探讨不同运动形式对大鼠有氧氧化关键酶-异柠檬酸脱氢酶和酵解关键酶-磷酸果糖激酶-1的影响。方法:72只SD雄性大鼠采用Bedford TG标准的跑台运动方式建立对照组(C)、无氧(E1)和有氧(E2)运动3组模型;每组模型的大鼠随机分为3组:运动... 目的:探讨不同运动形式对大鼠有氧氧化关键酶-异柠檬酸脱氢酶和酵解关键酶-磷酸果糖激酶-1的影响。方法:72只SD雄性大鼠采用Bedford TG标准的跑台运动方式建立对照组(C)、无氧(E1)和有氧(E2)运动3组模型;每组模型的大鼠随机分为3组:运动2周组、运动4周组和运动6周组。采用酶联法测定异柠檬酸脱氢酶(IDH),6-磷酸果糖激酶-1(PFK)的活性。结果:无氧组IDH和PFK的活性随运动时间的延长均逐步增加,有氧组IDH活性增加,PFK活性降低。IDH活性在运动4周组酶活性最高。结论:与有氧组相比,无氧运动更能有效提高糖酵解和有氧氧化代谢能力,可以作为一种有效方式来指导人们训练。 展开更多
关键词 大鼠 异柠檬酸脱氢酶 磷酸果糖激酶-1
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