安捷伦科技公司日前宣布其SureSelect靶向序列捕获系统已支持454 Life Sciences公司的下一代测序平台,借助该系统,用户可以仅测序目标基因组区域而非整个基因组,从而提高效率，节省成本。SureSelect系列产品包括针对用户指定的基因组区...安捷伦科技公司日前宣布其SureSelect靶向序列捕获系统已支持454 Life Sciences公司的下一代测序平台,借助该系统,用户可以仅测序目标基因组区域而非整个基因组,从而提高效率，节省成本。SureSelect系列产品包括针对用户指定的基因组区域、人类激酶组、人类X染色体以及人全外显子的靶向测序试剂盒。展开更多
目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因...目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因表达差异情况,重点检测热点基因突变情况。结果:两组所有入选者DNA提取体积>40μl,浓度>1ng/μl,总量>55ng,<200nt比例<5%,都符合质控要求,两组对比差异无统计学意义(P>0.05)。两组筛选出显著差异表达的基因共1245个,其中肺癌组表达上调652个,表达下调593个。基因测序与实时荧光定量PCR显示肺癌组的鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α基因(Phosphoinositide-3-kinase,catalytic,alpha gene,PIK3CA)、肿瘤蛋白P53(Tumor protein P53,TP53)表达水平都高于对照组(P<0.05)。基因测序显示肺癌组的KRAS、PIK3CA、TP53基因突变率分别为30.0%、22.7%、17.3%,高于对照组的3.6%、1.8%和0.9%(P<0.05)。结论:高通量测序平台能有效检出非小细胞肺癌热点基因突变情况,具有很好的应用可行性,值得推广应用。展开更多
文摘安捷伦科技公司日前宣布其SureSelect靶向序列捕获系统已支持454 Life Sciences公司的下一代测序平台,借助该系统,用户可以仅测序目标基因组区域而非整个基因组,从而提高效率，节省成本。SureSelect系列产品包括针对用户指定的基因组区域、人类激酶组、人类X染色体以及人全外显子的靶向测序试剂盒。
文摘目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因表达差异情况,重点检测热点基因突变情况。结果:两组所有入选者DNA提取体积>40μl,浓度>1ng/μl,总量>55ng,<200nt比例<5%,都符合质控要求,两组对比差异无统计学意义(P>0.05)。两组筛选出显著差异表达的基因共1245个,其中肺癌组表达上调652个,表达下调593个。基因测序与实时荧光定量PCR显示肺癌组的鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α基因(Phosphoinositide-3-kinase,catalytic,alpha gene,PIK3CA)、肿瘤蛋白P53(Tumor protein P53,TP53)表达水平都高于对照组(P<0.05)。基因测序显示肺癌组的KRAS、PIK3CA、TP53基因突变率分别为30.0%、22.7%、17.3%,高于对照组的3.6%、1.8%和0.9%(P<0.05)。结论:高通量测序平台能有效检出非小细胞肺癌热点基因突变情况,具有很好的应用可行性,值得推广应用。
