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微生物培养体系预处理在MALDI-TOF MS快速鉴定血培养阳性病原菌的应用价值
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作者 杨献飞 李晓燕 《临床研究》 2024年第4期12-15,共4页
目的分析微生物培养仪(HB&L)微生物培养体系预处理在基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)快速鉴定血培养阳性样本病原菌的临床应用价值。方法收集2022年1月至2022年12月安阳市人民医院实验室常规方法鉴定的120份血... 目的分析微生物培养仪(HB&L)微生物培养体系预处理在基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)快速鉴定血培养阳性样本病原菌的临床应用价值。方法收集2022年1月至2022年12月安阳市人民医院实验室常规方法鉴定的120份血培养报警后单一细菌感染的阳性样本,所有样本均接受HB&L微生物培养体系预处理、分离胶促凝管法预处理,将传统方法的鉴定结果作为“金标准”对照,运用MALDI-TOF MS鉴定。对比HB&L微生物培养体系预处理、分离胶促凝管法预处理下MALDI-TOF MS快速鉴定的鉴定率;另外对比HB&L微生物培养体系预处理、分离胶促凝管法在不同分值下MALDI-TOF MS样本细菌菌属快速鉴定结果。结果HB&L微生物培养体系预处理下MALDI-TOF MS快速鉴定例数为116例,鉴定率为96.67%;分离胶促凝管法预处理下MALDI-TOF MS快速鉴定例数为92例,鉴定率为76.67%,两种预处理方法鉴定率对比差异有统计学意义(P<0.05);在3.000~2.300分值下HB&L微生物培养体系MALDI-TOF MS样本细菌菌属快速鉴定率均高于分离胶促凝管法,差异有统计学意义(P<0.05);在2.299~2.000、1.999~1.700、<1.700分值下两种预处理方法菌属鉴定率对比差异无统计学意义(P>0.05)。结论HB&L微生物培养体系是MALDI-TOF MS快速鉴定血培养阳性样本病原菌优质的预处理方法,可大幅提升鉴定率,值得应用。 展开更多
关键词 HB&L微生物培养体系预处理 maldi-tof MS快速鉴定 阳性样本病原菌 血流感染 分离胶促凝管法预处理
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MALDI-TOF MS在鲍曼不动杆菌同源性分析中的临床应用评估
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作者 郑恬 周柯 +4 位作者 周磊 杨玉琪 陈潇 白露 刘家云 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 2024年第1期104-111,共8页
目的评估基质辅助激光解析电离飞行质谱(MALDI-TOF MS)分析鲍曼不动杆菌(AB)同源性的临床应用价值。方法剔除同一患者或环境多次送检标本中的重复菌株,收集某三甲综合医院2020年5月—2021年2月神经内科重症监护病房(ICU)住院患者痰标本... 目的评估基质辅助激光解析电离飞行质谱(MALDI-TOF MS)分析鲍曼不动杆菌(AB)同源性的临床应用价值。方法剔除同一患者或环境多次送检标本中的重复菌株,收集某三甲综合医院2020年5月—2021年2月神经内科重症监护病房(ICU)住院患者痰标本及环境标本分离的46株AB,使用VITEK-MS质谱仪检测菌株,应用SARAMIS Premium软件进行聚类分析,并采用多位点序列分型(MLST)的方法进行验证。结果通过MALDI-TOF MS和MLST聚类分析和比较,46株AB中,39株为MALDI-TOF MS的MS-a型,其中,22株为MLST的MT-A簇,包括ST208型3株,ST540型3株,ST195型8株,ST369型5株,以及ST136、ST436、ST1893型各1株;16株为MT-B簇,包括ST381型4株、ST469型11株和ST938型1株;1株为MT-C簇(ST1821);MS-b型1株为ST381;MS-c型2株为ST369;MS-d型1株为ST195;MS-e型2株分别为ST540、ST369;MS-f型1株为STN1。结论作为AB同源性分析工具,MALDI-TOF MS具有一定的局限性,其菌株同源性分析结果与MLST结果一致性低,分辨特异性低,不可取代MLST技术。 展开更多
关键词 maldi-tof MS 鲍曼不动杆菌 MLST 同源性
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MALDI-TOF MS法快速鉴定散装即食食品中3种食源性致病菌
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作者 崔洁 林吉恒 +3 位作者 孙瑛 严卓彦 夏瑛瑛 黄朱梁 《食品工业科技》 CAS 2024年第5期253-270,共18页
本研究旨在利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF MS)快速检测并鉴定散装即食食品中的沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌3种食源性... 本研究旨在利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF MS)快速检测并鉴定散装即食食品中的沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和蜡样芽孢杆菌3种食源性致病菌。通过对点样方式、前处理方式、不同培养基及培养时间等各项实验条件的优化筛选确定最佳方法,并考察其检测限和稳定性,同时用所建立的方法与多重PCR法、VITEK 2等生化鉴定法进行结果比对,比较三者鉴定结果的一致性,最后进行批量食品样本检测来探寻MALDI-TOF MS鉴定法在散装即食食品中的适用性。结果表明,三种目标菌同一批次及不同传代次数的鉴定得分均大于95%,变异系数均小于2%,所建立的方法重复性和稳定性良好,且检测限为10^(5)CFU/mL,MALDI-TOF MS菌株鉴定结果与多重PCR法、生化鉴定法结果高度一致,且比二者检测用时更短,更加特异高效;在点样方式上,相较于夹心法与混合干滴法,三种覆盖法点样平均鉴定得分更高,均为99.9%,其中1μL+1μL覆盖法点样可获得的平均峰数目更多,特征峰更复杂且强度更高;而在前处理方式上,甲酸乙腈法与其他两种菌体处理方法相比可获得更多的出峰量和更高的峰强度,平均鉴定得分均在98%以上,且与数据库中图谱匹配度更高。综上所述,MALDI-TOF MS法在致病菌鉴定方面不仅灵敏特异、准确快速,且操作简便、结果直观,作为国标法的有力补充,为食源性致病菌的分析鉴定与分型溯源提供了新思路。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof MS) 散装即食食品 沙门氏菌 黄色葡萄球菌 蜡样芽孢杆菌
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Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight(MALDI-TOF)-Mass Spectrometry and^(13)C-NMR-Identified New Compounds in Paraberlinia bifoliolata(Ekop-Beli)Bark Tannins
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作者 Liliane Nga Benoit Ndiwe +3 位作者 Achille Bernard Biwolé Antonio Pizzi Jean Jalin Eyinga Biwole Joseph Zobo Mfomo 《Journal of Renewable Materials》 EI CAS 2024年第3期553-568,共16页
Extracts of plant origin,particularly tannins,are attracting growing interest for the sustainable development of materials in the industrial sector.The discovery of new tannins is therefore necessary.The aim of this w... Extracts of plant origin,particularly tannins,are attracting growing interest for the sustainable development of materials in the industrial sector.The discovery of new tannins is therefore necessary.The aim of this work was to contribute to the understanding of the properties of Paraberlinia bifoliolata tannin by Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight Mass Spectroscopy MALDI-TOF/MS and Carbon 13 Nuclear Magnetic Resonance(13C NMR).The chemical composition of tannin extracted from Paraberlinia bifoliolata bark was determined,as was the mechanical strength of the resin hardened with Acacia nilotica extracts.Yield by successive water extraction was 35%.MALDI-TOF/MS analysis revealed the presence of three new compounds in this tannin,previously unknown in this family of extracts.These are 3-hydroxyproline acid,N-methyl-4-hydroxypipecolic acid and N-methyl-5-dihydroxypipecolic acid.The identification of the above molecules means that this tannin can be used for industrial applications,as a resin in the manufacture of particleboard and in the formulation of green corrosion inhibitors.This information is reinforced by 13C NMR spectrometry,which indicates the presence of several polyflavonoid units,confirming the condensed nature of the tannin.Thermomechanical analysis of the resin formed by the purified tannin of Paraberlinia bifoliolata to which a vegetal biohardener has been added provided a Modulus of Elasticity(MOE)value of 4840 MPa at 150°C,confirming its possible use as a binder resin in the manufacture of wood panels as well as for the formulation of a corrosion inhibitor. 展开更多
关键词 TANNIN Paraberlinia bifoliolata Central African wood species maldi-tof/MS 13C NMR bark extracts thermomechanical behaviour wood-binder
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MALDI-TOF-MS鉴定成人颅内感染人型支原体1例
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作者 李艳梅 谭积善 +2 位作者 唐璐 王琴 刘媛 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期978-982,共5页
人型支原体是一类没有细胞壁、具有多形性、可通过滤菌器的已知最小原核型微生物。在人体中,其主要引起泌尿生殖系统感染,而在成人颅内感染中极为少见,且引起的颅内感染在诊断、治疗、预后管理等方面尚缺乏统一的共识。本文报告1例成人... 人型支原体是一类没有细胞壁、具有多形性、可通过滤菌器的已知最小原核型微生物。在人体中,其主要引起泌尿生殖系统感染,而在成人颅内感染中极为少见,且引起的颅内感染在诊断、治疗、预后管理等方面尚缺乏统一的共识。本文报告1例成人因车祸伤行神经外科手术后出现人型支原体颅内感染的病例,旨在为临床此类疾病诊治提供参考。 展开更多
关键词 人型支原体 支原体 颅内感染 质谱分析 maldi-tof-MS
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MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用
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作者 金秀秀 张亚彬 《中国当代医药》 CAS 2023年第8期167-172,共6页
目的评估MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用,探究MALDI-TOF质谱仪对血培养阳性报告时间(TTP)的影响,尽可能缩短TTP,及早终止临床错误用药,提供正确治疗方案。方法收集2021年12月至2022年4月中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院的104... 目的评估MALDI-TOF质谱仪在血培养中的应用,探究MALDI-TOF质谱仪对血培养阳性报告时间(TTP)的影响,尽可能缩短TTP,及早终止临床错误用药,提供正确治疗方案。方法收集2021年12月至2022年4月中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院的104份标本,统计TTP以及标本周转时间(TAT),同时进行MALDI-TOF质谱仪和WalkAway96plus仪细菌鉴定结果比对。另对2022年3月和5月共53份阳性血培养瓶原液,利用十二烷基硫酸钠(SDS)和皂素进行标本前处理,直接比对两者的优势,选最优试剂。结果与WalkAway96plus仪鉴定相比,MALDI-TOF质谱仪鉴定的共104株菌株(57株革兰氏阴性菌和47株革兰氏阳性菌)的属种水平完全相符,每个样本的置信度均大于99.9%,无错误鉴定,总得阳性符合率是100%(104/104)。WalkAway96plus仪正确的属鉴定率为84.6%(88/104),正确的种鉴定率为68.3%(71/104)。MALDI-TOF质谱仪对菌株的属、种鉴定水平均优于WalkAway96plus仪,差异有统计学意义(P<0.05)。结论用SDS进行标本前处理,结合MALDI-TOF质谱仪,使得TTP大大缩短及血培养鉴定流程更加优化,为临床提供更好服务。 展开更多
关键词 maldi-tof质谱仪 应用评估 血培养阳性报告时间 标本前处理
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MALDI-TOF-MS高灵敏度分析EGFR基因多位点突变方法的建立与应用
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作者 黄海燕 孙杰 +8 位作者 徐炜新 王姜琳 孙亚蒙 汪国庆 叶绍云 蒋峻峰 聂芳芳 徐军 王纯 《检验医学与临床》 CAS 2023年第3期334-338,共5页
目的以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)为分析平台,建立表皮生长因子受体(EGFR)基因多位点突变的高灵敏度同步检测方法,用于辅助临床伴随诊断。方法使用MALDI-TOF-MS推荐的网站设计引物和单碱基延伸引物(UEP),设计添加... 目的以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)为分析平台,建立表皮生长因子受体(EGFR)基因多位点突变的高灵敏度同步检测方法,用于辅助临床伴随诊断。方法使用MALDI-TOF-MS推荐的网站设计引物和单碱基延伸引物(UEP),设计添加针对野生型基因组的blocker,以减少野生型模板对突变位点检测的干扰。用数字PCR定量标准品,使用定量后的标准品验证检测体系的灵敏度。收集228例非小细胞肺癌(NSCLC)患者的血液标本,比较MALDI-TOF-MS平台与微滴式数字PCR(ddPCR)平台检测结果的特异度、灵敏度。结果MALDI-TOF-MS检测E746_A750del位点、T790M位点突变灵敏度达0.1%,最小突变检出拷贝数达2.8;L858R位点突变灵敏度达0.5%,最小突变检出拷贝数达12。与ddPCR检测相比,MALDI-TOF-MS检测E746_A750del、L858R和T790M位点的灵敏度、特异度、Kappa值分别为94.4%(34/36)、99.5%(191/192)、0.95,94.6%(35/37)、100.0%(191/191)、0.97,83.3%(15/18)、99.5%(209/210)、0.87。结论MALDI-TOF-MS建立的检测方法具有很高的灵敏度,与ddPCR检测具有非常高的一致性,有广阔的临床应用前景。 展开更多
关键词 maldi-tof-MS ddPCR EGFR基因 液态活检
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氮掺杂芦丁基碳点作为MALDI-TOF-MS基质对氨基酸的检测
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作者 赵亚男 牛晓雪 燕子红 《微纳电子技术》 CAS 北大核心 2023年第7期1115-1123,共9页
以芦丁为碳源、乙二胺为氮源,采用水热法制备氮掺杂芦丁基碳点(N-CD)。通过优化温度、时间、碳源质量等反应条件得到N-CD荧光最大值。将N-CD作为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)基质对氨基酸进行检测。结果显示:氮原子... 以芦丁为碳源、乙二胺为氮源,采用水热法制备氮掺杂芦丁基碳点(N-CD)。通过优化温度、时间、碳源质量等反应条件得到N-CD荧光最大值。将N-CD作为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)基质对氨基酸进行检测。结果显示:氮原子在N-CD中主要以吡啶氮形式存在,氮原子的孤电子对与碳点的sP2芳香体系以垂直形式构成的共轭结构,增大了共结晶电子解吸/电离效率。使用N-CD对谷氨酸、组氨酸、苯丙氨酸和天冬氨酸进行检测。检测结果表明氨基酸离子信号强度最高可达30382。N-CD溶液作为基质最佳质量浓度为0.5 mg/mL,最大耐盐度为1 mol/L,初步实现对人体血清中氨基酸进行高通量检测。N-CD作为MALDI-TOF-MS新型基质材料在分析化学检测、环境检测以及生物小分子检测中具有良好的应用潜力,也为多元素掺杂生物质碳点材料作为MALDI-TOF-MS基质提供了参考。 展开更多
关键词 碳点(CD) 芦丁 氮掺杂 水热法 氨基酸 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-MS)
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MALDI-TOF MS技术在微生物检验中的应用效果
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作者 吴奇福 《中国医药指南》 2023年第16期121-124,共4页
目的探讨MALDI-TOF MS技术在微生物检验中的应用效果。方法选取2021年7月至2022年7月进行检验的540例血培养阳性样本为研究对象,每份样本分为2份,1份540例直接应用MALDI-TOF MS技术实施微生物检验,另1份540例进行标本接种后细菌鉴定,前... 目的探讨MALDI-TOF MS技术在微生物检验中的应用效果。方法选取2021年7月至2022年7月进行检验的540例血培养阳性样本为研究对象,每份样本分为2份,1份540例直接应用MALDI-TOF MS技术实施微生物检验,另1份540例进行标本接种后细菌鉴定,前者设为微生物检验组,后者设为细菌鉴定组,比较两组病原菌检出情况与感染检出情况。结果540份样本共分离出540株病原菌,革兰阳性菌分布如下,凝固酶阴性葡萄球菌有183例,金黄色葡萄球菌有37例,肠球菌有36例,链球菌有32例,革兰阳性杆菌9例,其他17例;革兰阴性菌分布如下,肠杆菌科细菌160株,革兰阴性非发酵菌44株,其他8株;酵母样真菌分布如下,白念9株,其他5株。细菌鉴定组的革兰阳性菌、革兰阴性菌、酵母样真菌检出率高于微生物检验组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在微生物检验中应用MALDI-TOF MS技术可检出病原菌与感染性疾病,但检出价值低于细菌鉴定,如有必要可联合应用细菌鉴定,进一步明确患者的病原菌类型。 展开更多
关键词 微生物学检验 细菌鉴定 maldi-tof MS技术 病原菌
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MALDI-TOF MS在NTM临床分离株快速鉴定中的应用研究 被引量:1
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作者 黄琨波 陈桂春 +3 位作者 林玉玲 陈清清 李科 张建明 《检验医学与临床》 CAS 2023年第15期2162-2165,2169,共5页
目的 建立临床非结核分枝杆菌(NTM)分离株的快速鉴定方法,为临床NTM病的诊断和治疗提供参考。方法 收集2018-2020年泉州某三甲医院的临床疑似NTM感染患者的痰液、肺泡灌洗液、胸部穿刺液和脑脊液等标本,借助基质辅助激光解析/电离飞行... 目的 建立临床非结核分枝杆菌(NTM)分离株的快速鉴定方法,为临床NTM病的诊断和治疗提供参考。方法 收集2018-2020年泉州某三甲医院的临床疑似NTM感染患者的痰液、肺泡灌洗液、胸部穿刺液和脑脊液等标本,借助基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,通过改良前处理方法(甲酸提取法),摸索上机检测条件,建立临床NTM分离株的快速鉴定方法,并以16S rRNA测序为金标准,验证鉴定的准确性。结果 收集的50株临床NTM菌株,采用传统(常规)处理方法进行质谱鉴定,仅鉴定出4株,检出率为8.0%,而采用甲酸提取法共鉴定出24株,检出率为48.0%,两种方法检出率比较,差异有统计学意义(P<0.01),且改良处理后鉴定出的24株鉴定结果与PCR测序结果完全一致,符合率为100.0%。结论 初步建立的NTM甲酸提取前处理的质谱鉴定方法检出率明显提高,具有一定的临床应用价值。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱 非结核分枝杆菌 鉴定
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基于MALDI-TOF-MS技术筛选及鉴定大曲中芽孢杆菌
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作者 李丹 张文学 《中国酿造》 CAS 北大核心 2023年第7期121-125,共5页
该研究对基质辅助激光解吸电离-飞行时间-质谱(MALDI-TOF-MS)技术体系进行改进与优化,创新性地引入浓香型大曲中芽孢杆菌(Bacillus)的筛选及鉴定,并结合分子生物学技术对该技术鉴定结果进行验证。结果表明,采用传统微生物培养分离法从... 该研究对基质辅助激光解吸电离-飞行时间-质谱(MALDI-TOF-MS)技术体系进行改进与优化,创新性地引入浓香型大曲中芽孢杆菌(Bacillus)的筛选及鉴定,并结合分子生物学技术对该技术鉴定结果进行验证。结果表明,采用传统微生物培养分离法从大曲中分离得到126株菌株,其中125株通过MALDI-TOF-MS技术筛选鉴定获得9.0以上可信度分值,其中目标菌株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)的鉴定结果与分子生物学鉴定结果一致,说明该技术历经5~6 d可以准确地完成大曲样品中目标菌株的筛选鉴定,比传统微生物筛选鉴定方法至少节约1~2周时间。因此,基于MALDI-TOF-MS技术参与复杂样品中目标菌株的筛选与鉴定是一条高效的、可行的路径。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 大曲 芽孢杆菌 蛋白指纹图谱 筛选 鉴定
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HPLC与MALDI-TOFMS联用技术分析蛋黄中的磷脂 被引量:11
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作者 李国琛 王颜红 +1 位作者 吴仁安 王世成 《分析试验室》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期30-33,共4页
蛋黄中含有大量磷脂,其中磷脂酰胆碱(PC)和磷脂酰乙醇胺(PE)最为丰富。本研究采用高效液相色谱法(HPLC)与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)联用技术分析了蛋黄中磷脂粗提物。将从蛋黄中提取的多种磷脂通过HPLC预先分离,... 蛋黄中含有大量磷脂,其中磷脂酰胆碱(PC)和磷脂酰乙醇胺(PE)最为丰富。本研究采用高效液相色谱法(HPLC)与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)联用技术分析了蛋黄中磷脂粗提物。将从蛋黄中提取的多种磷脂通过HPLC预先分离,收集各组分后分别进行MALDI-TOF MS分析得到比较清晰的质谱图。通过质谱图解析确定了蛋黄中磷脂酰胆碱、神经鞘磷脂(SM)的脂肪酸组成。 展开更多
关键词 磷脂 磷脂酰胆碱 磷脂酰乙醇胺 神经鞘磷脂 HPLC maldi-tof MS
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MALDI-TOFMS测定高聚合度葡聚糖及不同基体在测定中的作用比较 被引量:9
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作者 邓慧敏 张珍英 +2 位作者 查庆民 邓芹英 赵善楷 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第6期996-999,共4页
应用基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOFMS)直接对未经分级的高聚合度 (n>1 0 0 )葡聚糖样品进行了测定 ,检测到的葡聚糖最大分子量达 1 80 0 0以上 .对 2 ,5 -二羟基苯甲酸 (DHB)、 1 -羟基异喹啉 (1 -HIQ)及 3,4 -二羟... 应用基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOFMS)直接对未经分级的高聚合度 (n>1 0 0 )葡聚糖样品进行了测定 ,检测到的葡聚糖最大分子量达 1 80 0 0以上 .对 2 ,5 -二羟基苯甲酸 (DHB)、 1 -羟基异喹啉 (1 -HIQ)及 3,4 -二羟基肉桂酸 (咖啡酸 ,CA) 3种一元基体以及 DHB与 1 -HIQ,DHB与 CA两种二元基体在测定中的作用进行了比较 .结果表明 ,DHB基体测定的质量范围较大 ;DHB+ 1 -HIQ和 DHB+ CA二元混合基体对样品的解吸电离效果及谱图重现性好 ;DHB+ 1 -HIQ基体获得的谱图分辨率高 . 展开更多
关键词 maldi-tofMS 测定 葡聚糖 基体 基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱 多糖
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克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库的建立及应用 被引量:14
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作者 赵贵明 刘洋 +3 位作者 陈颖 杨海荣 赵勇胜 王娉 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第8期105-110,共6页
应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术建立了克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库,用于该菌属内种和亚种的高通量鉴定及菌株分型。在优化... 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术建立了克罗诺杆菌MALDI-TOF-MS数据库,用于该菌属内种和亚种的高通量鉴定及菌株分型。在优化培养条件、样品处理方法及确定MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱采集参数的基础上,将采集的8种参考菌株蛋白质质谱数据通过Biotyper软件构建克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库,再用相近肠杆菌及该属分离株验证数据库的准确性。结果表明:应用建立的克罗诺杆菌的MALDI-TOF-MS数据库对135株克罗诺杆菌分离株进行分析,鉴定分值均不小于2.0,达到了种水平鉴定要求,通过聚类分析,可进一步分型。构建的MALDI-TOF-MS数据库为克罗诺杆菌高通量鉴定与分型提供了一种新的手段。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌 maldi-tof-MS 数据库 鉴定 分型
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MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析 被引量:15
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作者 魏超 代晓航 +2 位作者 郭灵安 刘炜 赵欢 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期209-215,共7页
为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定... 为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析。结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大。MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof MS) 16SrDNA 肠杆菌科微生物 系统进化
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金黄色葡萄球菌及其甲氧苯青霉素耐药性的MALDI-TOF MS鉴定 被引量:11
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作者 杜宗敏 杨瑞馥 +2 位作者 郭兆彪 宋亚军 王津 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期62-67,共6页
用MALDI_TOFMS细菌指纹图谱鉴定细菌 ,建立区分金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株的MALDI_TOFMS分析方法,检测了76株从临床标本中分离得到的金黄色葡萄球菌 ,用软件进行聚类分析,以nuc(耐热核酸酶)基因和mecA(耐药)基因聚合酶... 用MALDI_TOFMS细菌指纹图谱鉴定细菌 ,建立区分金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株的MALDI_TOFMS分析方法,检测了76株从临床标本中分离得到的金黄色葡萄球菌 ,用软件进行聚类分析,以nuc(耐热核酸酶)基因和mecA(耐药)基因聚合酶链反应(PCR)检测结果为参照 ,74 %的菌株经MALDI_TOFMS给出了正确的鉴定结果;金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株的质谱图有很大差别 ,各自有其特征峰;经过软件聚类分析 ,76株实验菌株划分为敏感群和耐药群;与PCR检测结果对照 ,有7株菌PCR检测mecA基因为阴性 ,而经MALDI_TOFMS鉴定为耐药株 ,表型鉴定表明其中有5株为敏感株;利用细菌指纹图谱和数据库检索对大多数菌株实现了正确鉴定;MALDI_TOFMS分辨率高 ,甚至可以区分株间的差异 ,实现了区分金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株; 展开更多
关键词 maldi-tofMS 鉴定 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱 金黄色葡萄球菌 甲氧苯青霉素 耐药性
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MALDI-TOF MS磷脂质组学快速分析三文鱼肌肉组织 被引量:8
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作者 沈清 冯俊丽 +3 位作者 金仁耀 薛静 郑振霄 戴志远 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第2期211-216,共6页
建立了基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速分析三文鱼肌肉组织磷脂质组学的方法。以非自然磷脂酰胆碱DMPC(14∶0/14∶0)和磷脂酰乙醇胺DPPE(15∶0/15∶0)为标准品,分析其在正离子模式下的主要分子峰与干扰峰,并进行... 建立了基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速分析三文鱼肌肉组织磷脂质组学的方法。以非自然磷脂酰胆碱DMPC(14∶0/14∶0)和磷脂酰乙醇胺DPPE(15∶0/15∶0)为标准品,分析其在正离子模式下的主要分子峰与干扰峰,并进行方法学验证。实验结果表明,各化合物平均加标回收率在74%~83%之间,相对标准偏差小于7%,日内和日间精密度的相对标准偏差均低于8.5%。将三文鱼磷脂提取物进样分析,共鉴定出28种磷脂分子,其中m/z806.40([PC38:6+H]^+和[PE38:4+K]^+)信号最强。三文鱼中多不饱和磷脂种类丰富,如m/z 824.38([PC38:8+Na]^+和[PE42:5+H]^+),m/z832.41([PC40:7+H]^+,[PC38:4+Na]^+和[PE40:5+H]^+),部分磷脂分子的脂肪酸链达到了满不饱和,如[PC42:11+H]^+,其sn-1和sn-2上两条脂肪酸链分别为二十碳五烯酸链(EPA-)和二十二碳六烯酸链(DHA-)。该方法稳定可靠,可用于鉴定三文鱼肌肉组织中的磷脂分子结构,并从脂质组学角度为三文鱼营养评价提供理论依据。 展开更多
关键词 三文鱼 脂质组学 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(maldi-tof MS) 磷脂
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单增李斯特氏菌MALDI-TOF-MS鉴定与分型研究 被引量:20
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作者 王耀 曹际娟 +5 位作者 赵昕 郑秋月 王刚 田卓 史媛媛 曹远银 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第3期194-198,共5页
为建立单增李斯特氏菌的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)快速鉴定与分型方法,实验收集37株单增李斯特氏菌分离株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质指纹图谱,汇总成标准图谱,建立单增李斯特氏菌鉴定数据库。... 为建立单增李斯特氏菌的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)快速鉴定与分型方法,实验收集37株单增李斯特氏菌分离株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质指纹图谱,汇总成标准图谱,建立单增李斯特氏菌鉴定数据库。采用单增李斯特氏菌标准菌株进行验证,表明鉴定结果的可信度很高。在数据库信息的基础上,对37株单增李斯特氏菌分离株进行聚类分型。分型结果表明,在蛋白质水平上,MALDI-TOF-MS可把37株单增李斯特氏菌分成9个型别。 展开更多
关键词 单增李斯特氏菌 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof-MS) 鉴定 分型
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MALDI-TOF-MS鉴定布鲁氏菌方法建立和评价 被引量:12
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作者 汤旭 肖迪 +5 位作者 张慧芳 陈经雕 毛玲玲 崔步云 张建中 姜海 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期772-778,共7页
目的为了快速、准确、便捷的检测和鉴定布鲁氏菌,本研究拟建立鉴定布鲁氏菌属的MALDI-TOF-MS方法,利用现场分离菌株对该方法进行特异性和敏感性评价。方法收集布鲁氏菌标准菌株和地方流行株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质... 目的为了快速、准确、便捷的检测和鉴定布鲁氏菌,本研究拟建立鉴定布鲁氏菌属的MALDI-TOF-MS方法,利用现场分离菌株对该方法进行特异性和敏感性评价。方法收集布鲁氏菌标准菌株和地方流行株,应用MALDI-TOF-MS采集图谱,获取独特的蛋白质指纹图谱,汇总成标准图谱,建立布鲁氏菌鉴定数据库。并用39株布鲁氏菌菌株,对建立的数据库进行验证。结果经数据库鉴定,39株布鲁氏菌菌株与数据库中布鲁氏菌的匹配分数全部大于2.300,均报告为布鲁氏菌,表明鉴定结果的可信度很高。聚类分型结果表明,在蛋白质水平,MALDI-TOF-MS将测试的布鲁氏菌分成3大类。结论MALDI-TOF-MS对布鲁氏菌进行鉴定,具有快速、准确、灵敏等优点,可以实现对布鲁氏菌属的准确鉴定,对布鲁氏菌病的临床诊断具有较高的使用价值。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 maldi-tof-MS 鉴定
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基质中加入少量盐类改善MALDI-TOF MS的谱图信噪比 被引量:6
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作者 方彩云 翟建军 +1 位作者 刘锋 杨芃原 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第4期660-662,共3页
CHCA as a matrix facilitates the ionization of proteins and peptides in a matrix-assisted laser desorption/ionization(MALDI) time-of-flight(TOF) mass spectrometer. The matrix itself also ionizes and so do its adducts.... CHCA as a matrix facilitates the ionization of proteins and peptides in a matrix-assisted laser desorption/ionization(MALDI) time-of-flight(TOF) mass spectrometer. The matrix itself also ionizes and so do its adducts. Matrix clusters and adducts interfere with peptide ionization and peptide mass spectrum interpretation, especially at low sample concentrations and within m/z 500-1 000 range. These matrix adducts, especially within m/z 500-1 000, are significantly reduced with addition of ammonium citrate, ammonium sulfate, ammonium benzoate, ammonium bicarbonate, ammonium citrate and potassium dihydrogen phosphate to the matrix and the samples were deposited onto the MALDI target. The reduction of matrix adducts improves peptide ionization and signal-to-noise ratio, which enhances the reliability of database searching. 展开更多
关键词 基质加合物 信噪比 maldi-tof MS
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