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生殖支原体MG_095蛋白的生物信息学分析及抗原表位预测
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作者 陈列松 易希阳 +1 位作者 曾麒霖 吴移谋 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第4期411-416,423,共7页
目的本研究旨在应用生物信息学方法对生殖支原体MG_095蛋白的理化性质进行分析,并预测其结构和表位,以探讨其作为潜在疫苗候选抗原的可能性。方法首先,利用DEG数据库分析MG_095基因是否为生殖支原体必需基因;其次,采用Prot-Param、ProtS... 目的本研究旨在应用生物信息学方法对生殖支原体MG_095蛋白的理化性质进行分析,并预测其结构和表位,以探讨其作为潜在疫苗候选抗原的可能性。方法首先,利用DEG数据库分析MG_095基因是否为生殖支原体必需基因;其次,采用Prot-Param、ProtScale、BUSCA、SOPMA、DeepTMHMM、SignalP 6.0、Motif Scan、STRING等在线软件预测生殖支原体MG_095蛋白的氨基酸组成、理化性质、亲/疏水性、亚细胞定位、二级结构、跨膜区、信号肽、修饰位点和互作蛋白;最后,使用IEDB、ABCpred、SYFPEITHI和NetMHCIIpan 4.1软件预测靶蛋白的B、T细胞抗原表位。结果靶蛋白MG_095为生殖支原体必需基因MG_095所编码,是由398个氨基酸构成的稳定亲水性蛋白,其分子式为C_(2018)H_(3127)N_(527)O_(632)S_(6),分子质量为44.93154 ku,理论等电点为8.80。该蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲组成,其亚细胞定位于细胞外,无跨膜区,含有信号肽,存在19个磷酸化位点、4个糖基化位点和2个N-豆蔻酰化位点,并与多个核糖体蛋白有互作关系。此外,靶蛋白MG_095含6个优势B细胞抗原表位和3个优势T细胞抗原表位。结论假定表面暴露分子MG_095具有良好的免疫原性,可作为生殖支原体潜在的疫苗候选分子。 展开更多
关键词 生殖支原体 mg_095 生物信息学分析 抗原表位
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