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不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究
被引量：
2
1
作者
康颖倩
陈玉如
+4 位作者
王梅竹
赵亮
李小玲
金方
刘涛华
《中国真菌学杂志》
CSCD
2014年第5期264-267,共4页
目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环...
目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环境和临床的各10株新生隐球菌格鲁比变种的基因型,并鉴定实验菌株交配型,与多位点微卫星分型(MLMT)结果对比,比较不同基因分型方法在分类中的稳定性和可靠性。结果在微卫星分型中为MLMT-36的10株环境分离株,MLST分型为ST-15,而在微卫星分型中为MLMT-13型的10株临床分离株,MLST分型为ST-32,所有菌株交配型均为MAT-α。结论 MLST分型结果与MLMT分型结果高度一致,提示以上两种分子分型技术在真菌分类鉴定研究中可显示对于其分离背景及进化来源的高分辨率及稳定性。
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关键词
新生隐球菌
MLST
分型
mlmt分型
交配型鉴定
下载PDF
职称材料
新生隐球菌格鲁比变种国内菌株的多位点微卫星灶分型
被引量：
3
2
作者
朱键
刘莹
+1 位作者
大楠悦子
三上襄
《基础医学与临床》
CSCD
北大核心
2009年第10期1054-1058,共5页
目的应用多位点微卫星灶分型(MLMT)对国内6个城市分离出的新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neo-formans var.grubii)进行基因分型,了解该变种的国内基因型分布特征。方法提取已鉴定的43株新生隐球菌格鲁比变种DNA,用PCR对3个微卫星位...
目的应用多位点微卫星灶分型(MLMT)对国内6个城市分离出的新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neo-formans var.grubii)进行基因分型,了解该变种的国内基因型分布特征。方法提取已鉴定的43株新生隐球菌格鲁比变种DNA,用PCR对3个微卫星位点(CNG1,CNG2,CNG3)的基因片段进行扩增后测序。再计算每一菌株位点基序重复数(CNG1对应TA重复,CNG2对应GA重复,CNG3对应CAT重复);据基序重复数判定各菌株的基因型。结果所有43株菌中,MLMT-17型占83.72%,该型在临床和环境的菌株中分别占86.67%和70%。MLMT-39、-40是新发现的基因型。结论在我国,MLMT-17是最常见的新生隐球菌格鲁比变种基因型,普遍存在于临床和环境菌株中,表明国内临床新生隐球菌病的感染菌株主要源于本土环境菌株。
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关键词
新生隐球菌变种格鲁比
多位点微卫星灶
分型
(
mlmt
)
下载PDF
职称材料
题名
不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究
被引量：
2
1
作者
康颖倩
陈玉如
王梅竹
赵亮
李小玲
金方
刘涛华
机构
贵阳医学院微生物教研室
出处
《中国真菌学杂志》
CSCD
2014年第5期264-267,共4页
基金
国家自然基金地方项目(31060006
31260029)
+2 种基金
贵州省科技厅国际合作项目(黔科合外G字[2009]700114号)
贵州省社会发展科技攻关项目(黔科合SY字[2011]3017号)
贵阳市科技局社会发展与民生计划(筑科合同[2011103]16号)
文摘
目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环境和临床的各10株新生隐球菌格鲁比变种的基因型,并鉴定实验菌株交配型,与多位点微卫星分型(MLMT)结果对比,比较不同基因分型方法在分类中的稳定性和可靠性。结果在微卫星分型中为MLMT-36的10株环境分离株,MLST分型为ST-15,而在微卫星分型中为MLMT-13型的10株临床分离株,MLST分型为ST-32,所有菌株交配型均为MAT-α。结论 MLST分型结果与MLMT分型结果高度一致,提示以上两种分子分型技术在真菌分类鉴定研究中可显示对于其分离背景及进化来源的高分辨率及稳定性。
关键词
新生隐球菌
MLST
分型
mlmt分型
交配型鉴定
Keywords
Cryptococcus neoformance
MLST
mlmt
mating type
分类号
R379.5 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
新生隐球菌格鲁比变种国内菌株的多位点微卫星灶分型
被引量：
3
2
作者
朱键
刘莹
大楠悦子
三上襄
机构
贵阳医学院附属医院消化内科
日本千叶大学真菌医学研究中心
出处
《基础医学与临床》
CSCD
北大核心
2009年第10期1054-1058,共5页
基金
日本文部省资助项目"Special Coordination Funds for Promoting Science and Technology"的一部分
文摘
目的应用多位点微卫星灶分型(MLMT)对国内6个城市分离出的新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neo-formans var.grubii)进行基因分型,了解该变种的国内基因型分布特征。方法提取已鉴定的43株新生隐球菌格鲁比变种DNA,用PCR对3个微卫星位点(CNG1,CNG2,CNG3)的基因片段进行扩增后测序。再计算每一菌株位点基序重复数(CNG1对应TA重复,CNG2对应GA重复,CNG3对应CAT重复);据基序重复数判定各菌株的基因型。结果所有43株菌中,MLMT-17型占83.72%,该型在临床和环境的菌株中分别占86.67%和70%。MLMT-39、-40是新发现的基因型。结论在我国,MLMT-17是最常见的新生隐球菌格鲁比变种基因型,普遍存在于临床和环境菌株中,表明国内临床新生隐球菌病的感染菌株主要源于本土环境菌株。
关键词
新生隐球菌变种格鲁比
多位点微卫星灶
分型
(
mlmt
)
Keywords
Cryptococcus neoformans var. grubii
muhilocus microsatellite type
分类号
R379.5 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究
康颖倩
陈玉如
王梅竹
赵亮
李小玲
金方
刘涛华
《中国真菌学杂志》
CSCD
2014
2
下载PDF
职称材料
2
新生隐球菌格鲁比变种国内菌株的多位点微卫星灶分型
朱键
刘莹
大楠悦子
三上襄
《基础医学与临床》
CSCD
北大核心
2009
3
下载PDF
职称材料
已选择
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