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基于大豆叶枕响应叶柄角变化转录组的MYB基因分析
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作者 常玮 王娟 +2 位作者 郑清岭 张彦威 陈吉宝 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第2期60-69,共10页
【目的】阐明MYB基因家族成员是否参与大豆叶柄角(leaf petioles angle,LPA)变化的调控过程,为大豆理想株型育种研究奠定基础。【方法】以郑196为材料,利用大豆叶枕响应叶片向光运动转录组挖掘差异表达大豆MYB基因(GmMYB);利用ProtComp ... 【目的】阐明MYB基因家族成员是否参与大豆叶柄角(leaf petioles angle,LPA)变化的调控过程,为大豆理想株型育种研究奠定基础。【方法】以郑196为材料,利用大豆叶枕响应叶片向光运动转录组挖掘差异表达大豆MYB基因(GmMYB);利用ProtComp 9.0进行亚细胞定位预测;以拟南芥MYB蛋白序列为参考,采用MEGA v5.0软件进行系统进化分析;分别利用在线程序MEME和PlantPAN3.0分析差异表达MYB基因保守基序(motif)和启动子序列的顺式作用元件;以NCBI数据库中大豆转录组数据及RNA-seq数据为基础,采用TBtools进行表达模式分析,并在此基础上进行候选基因的精准定量检测。【结果】①鉴定出13个差异表达GmMYB,其中上调表达9个,下调表达4个;亚细胞定位结果表明,11个MYB蛋白位于细胞核,2个位于细胞外基质。②基于MYB蛋白序列构建系统进化树,可将13个差异表达GmMYB分为6组。③对13个差异表达GmMYB基因结构进行分析,结果共鉴定到10个基序,其中基序1和基序2是MYB保守结构域的一部分。④在启动子区域鉴定获得脱落酸响应元件、参与干旱响应元件、响应光照的顺式作用元件、分生组织表达和生长素响应等多个响应逆境胁迫及光照的顺式作用元件。⑤表达模式分析结果表明,13个差异表达GmMYB基因在大豆不同组织器官中存在表达差异,其中Glyma.01G190100和Glyma.08G042100在叶枕处表达。⑥对Glyma.01G190100和Glyma.08G042100进行精准定量检测,结果显示其相对表达量在叶片向光运动前后变化剧烈,可作为大豆叶柄角调控候选基因用于进一步研究。【结论】鉴定出13个与大豆叶柄角调控相关的MYB基因,其中Glyma.01G190100和Glyma.08G042100可作为大豆叶柄角调控候选基因用于大豆理想株型育种研究。 展开更多
关键词 大豆 叶柄角 叶枕 转录组 myb转录因子
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兰州百合鳞茎花青素合成相关MYB与bHLH转录因子的筛选分析
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作者 范文广 李保豫 +6 位作者 田辉 李欣 任海伟 曹莹莹 姜欣彤 柴佳靖 陈少青 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期57-66,共10页
百合鳞茎在采后贮藏过程中,由于花青素的积累导致鳞茎变紫红色,进而影响其价值。该文基于兰州百合鳞茎转录组数据,利用生物信息学技术分析花青素相关转录因子,共分析了50个MYB转录因子与73个bHLH转录因子,包括序列的比对、理化性质分析... 百合鳞茎在采后贮藏过程中,由于花青素的积累导致鳞茎变紫红色,进而影响其价值。该文基于兰州百合鳞茎转录组数据,利用生物信息学技术分析花青素相关转录因子,共分析了50个MYB转录因子与73个bHLH转录因子,包括序列的比对、理化性质分析、亚细胞定位、系统进化关系以及保守结构域预测。MYB分类结果显示,50个MYB转录因子中有2个属于1R-MYB类,44个属于R2R3-MYB类,3个属于3R-MYB类,1个属于4R-MYB类。50个MYB不稳定蛋白均为亲水性蛋白,亚细胞定位表明48个MYB定位于细胞核。73个bHLH均为不稳定蛋白,且72个都为亲水性,亚细胞定位显示58个bHLH定位于细胞核。通过与模式植物拟南芥MYB和bHLH转录因子构建进化树分析、保守结构域预测、基因表达量分析以及转录因子与结构基因的相关性分析,初步筛选出3个MYB基因和1个bHLH基因可促进兰州百合鳞茎花青素合成,为进一步深入研究兰州百合鳞茎花青素调控基因提供了理论支持。 展开更多
关键词 兰州百合(Lilium davidii var.unicolor) 鳞茎 myb转录因子 bHLH转录因子 花青素合成
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双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
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作者 刘翔 赵紫璇 +5 位作者 赵月盈 赵诗睿 贾子怡 姜含越 袁帅 孟德梅 《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页
MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)... MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 myb转录因子 基因克隆 生物信息学分析 保守结构域
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葡萄MYB转录因子基因VvMYB30的克隆及其耐盐性分析
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作者 解振强 许桓瑜 +3 位作者 黄金霞 蔡善亚 李刚 赵鹏程 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2024年第1期20-27,共8页
MYB转录因子在响应各类非生物胁迫中发挥着重要作用。本研究以‘阳光玫瑰’葡萄为材料,鉴定了1个盐胁迫响应MYB转录因子基因VvMYB30,并对其特性及功能进行研究。该基因cDNA全长为984 bp,编码327个氨基酸。生物信息学分析发现,VvMYB30含... MYB转录因子在响应各类非生物胁迫中发挥着重要作用。本研究以‘阳光玫瑰’葡萄为材料,鉴定了1个盐胁迫响应MYB转录因子基因VvMYB30,并对其特性及功能进行研究。该基因cDNA全长为984 bp,编码327个氨基酸。生物信息学分析发现,VvMYB30含有1个保守的R2R3蛋白结构域,与甜橙CsMYB30转录因子的同源性最高,相似度为64.75%,归属于SubgroupⅠ亚类。亚细胞定位及转录激活分析表明,VvMYB30定位于细胞核,且具有转录激活活性。qRT-PCR结果表明,VvMYB30受盐胁迫诱导,处理24 h表达量达到最高,为对照的6.86倍。将VvMYB30基因转化拟南芥,盐胁迫下VvMYB30转基因拟南芥种子萌发率和幼苗的成活率均显著高于野生型,表明过表达VvMYB30可增强转基因拟南芥的耐盐性。 展开更多
关键词 阳光玫瑰 myb转录因子 盐胁迫 功能分析
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猕猴桃AcMYB88的鉴定及功能研究
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作者 苑馨予 钟彩虹 +3 位作者 张龙 郑浩 李吉涛 张琼 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期183-196,共14页
【目的】MYB转录因子在猕猴桃花青苷积累中发挥着重要作用,挖掘调控花青苷生物合成的MYB家族转录因子并验证其功能,可进一步明晰花青苷积累的分子机制。【方法】AcMYB110是猕猴桃花青苷生物合成的关键转录因子,通过系统发育树分析猕猴桃... 【目的】MYB转录因子在猕猴桃花青苷积累中发挥着重要作用,挖掘调控花青苷生物合成的MYB家族转录因子并验证其功能,可进一步明晰花青苷积累的分子机制。【方法】AcMYB110是猕猴桃花青苷生物合成的关键转录因子,通过系统发育树分析猕猴桃中97个MYB家族转录因子,筛选出与AcMYB110高度同源的12个MYB转录因子,采用生物信息学方法分析它们的理化性质、亲疏水性、蛋白磷酸化位点、蛋白质二级结构及其与其他物种的系统进化关系。【结果】12个MYB转录因子编码的氨基酸数目为200-423个;分子量范围为22.3-45.5 kD,均为定位于细胞核的亲水性蛋白。12个候选MYB蛋白的潜在磷酸化位点大多位于丝氨酸残基处;其二级结构以无规则卷曲为主,α-螺旋为辅。在12个候选MYB转录因子中筛选得到1个花青素积累相关的转录因子AcMYB88,在猕猴桃果实发育过程中AcMYB88基因与AcMYB110基因表达模式非常相似。【结论】烟草瞬时过表达研究表明,AcMYB88为花青苷积累的正向调控因子,且能与AcMYB110和AcbHLH42协同作用从而促进花青苷的积累。该研究为猕猴桃花青素生物合成以及育种研究等方面提供理论基础。 展开更多
关键词 猕猴桃 myb 家族分析 花青苷
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转录因子NbMYB1R1通过促进活性氧积累抑制病毒侵染
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作者 姜兴林 于连伟 +8 位作者 付涵 艾妞 崔荧钧 李好海 夏子豪 袁虹霞 李洪连 杨雪 施艳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1490-1505,共16页
[背景]黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是我国重要的检疫性植物病毒,严重降低了世界范围内蔬菜以及瓜类的产量。MYB蛋白家族庞大,功能多样,存在于所有真核生物中。大多数MYB作为转录因子控制植物的发育... [背景]黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是我国重要的检疫性植物病毒,严重降低了世界范围内蔬菜以及瓜类的产量。MYB蛋白家族庞大,功能多样,存在于所有真核生物中。大多数MYB作为转录因子控制植物的发育和代谢,并对植物应对生物和非生物胁迫反应起重要的调控作用。前期研究显示CGMMV侵染后可以显著上调寄主转录因子基因NbMYB1R1的表达。[目的]明确NbMYB1R1参与CGMMV侵染的机制,为CGMMV病害防控提供理论依据。[方法]运用MEGA 7.0构建系统进化树,对NbMYB1R1的氨基酸序列进行系统进化分析;通过构建NbMYB1R1的荧光表达载体,转化GV3101农杆菌后浸润本氏烟叶片,激光共聚焦显微镜观察其亚细胞定位;利用qRT-PCR技术分析NbMYB1R1在CGMMV侵染不同时期的转录水平及NbMYB1R1沉默烟草植株中活性氧(reactive oxygen species,ROS)相关基因的转录变化;通过沉默NbMYB1R1及下游调控基因NbAOX1a和NbAOX1b,分析NbMYB1R1及下游调控基因NbAOX1a和NbAOX1b在CGMMV侵染过程中的作用;瞬时过表达NbMYB1R1和NbMYB1R1关键氨基酸突变体,分析NbMYB1R1对CGMMV侵染的影响;使用台盼蓝染色以及DAB染色观察瞬时过表达NbMYB1R1造成的细胞死亡是否与程序性细胞死亡(programmed cell death,PCD)以及ROS的积累有关;运用酵母双杂交技术验证NbMYB1R1是否与CGMMV相关蛋白互作。[结果]系统进化树分析表明,NbMYB1R1属于1R MYB大类并与多种烟草的MYB转录因子同源性极高;亚细胞定位结果显示NbMYB1R1定位于细胞核;在CGMMV侵染的烟草植株中,NbMYB1R1的转录水平对比健康植株有明显变化,在CGMMV侵染8、12 d时NbMYB1R1的转录水平显著上调;在沉默内源基因NbMYB1R1的植株上接种CGMMV,3 d后NbMYB1R1沉默植株系统叶出现斑驳、卷曲症状,而对照植株在3.5 d时才出现症状;同时CGMMV CP mRNA水平和蛋白水平检测结果也表明沉默NbMYB1R1可以有效促进CGMMV的积累;在本氏烟叶片瞬时过表达NbMYB1R1及其突变体3 d时检测CGMMV蛋白水平表达量,结果显示过表达NbMYB1R1可以有效抑制CGMMV的侵染,DNA结合结构域缺失后会减轻NbMYB1R1对CGMMV的抑制;台盼蓝和DAB染色结果表明,在瞬时过表达NbMYB1R1蛋白后导致ROS积累并引起细胞死亡;在沉默内源基因NbMYB1R1的植株叶片上检测ROS相关基因的转录水平,发现交替氧化酶基因AOX1a、AOX1b转录水平显著上调;在沉默内源基因NbAOX1a和NbAOX1b的植株上接种CGMMV,4 d后NbAOX1a和NbAOX1b沉默植株系统叶出现斑驳、卷曲症状,而对照植株在3.5 d时就出现症状;同时CGMMV CP mRNA水平和蛋白水平检测结果也表明沉默NbAOX1a和NbAOX1b可以有效抑制CGMMV的积累;酵母双杂交结果显示NbMYB1R1不与CGMMV编码蛋白直接相互作用。[结论]随着CGMMV侵染,防御相关基因NbMYB1R1表达上调,从而抑制下游基因AOX1a、AOX1b的表达并激活细胞内产生ROS抑制病毒侵染,但NbMYB1R1不是通过与CGMMV病毒蛋白直接互作而产生此作用。由此可见,NbMYB1R1在CGMMV侵染过程中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 Nb myb1R1 转录因子 致病机制 活性氧
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百香果(Passiflora edulis)R2R3-MYB基因家族的结构和功能分析
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作者 张丹 郑平 +8 位作者 邓彪 柴改凤 安昌 邓考 张文斌 陆宇明 卢翔宇 王小媚 秦源 《果树学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期12-29,共18页
【目的】探究R2R3-MYB转录因子在代谢、发育等多种生物学过程中发挥的调控作用。对百香果R2R3-MYB基因家族进行表达分析并探究其在花果发育过程中的调控机制,对深入研究R2R3-MYB转录因子在百香果中的生物学作用中具有重要意义。【方法... 【目的】探究R2R3-MYB转录因子在代谢、发育等多种生物学过程中发挥的调控作用。对百香果R2R3-MYB基因家族进行表达分析并探究其在花果发育过程中的调控机制,对深入研究R2R3-MYB转录因子在百香果中的生物学作用中具有重要意义。【方法】基于百香果全基因组数据,通过HMM搜索对R2R3-MYB家族成员进行筛选鉴定,并利用实时荧光定量PCR分析其在百香果花不同组织中的表达模式。【结果】从百香果基因组中鉴定出99个R2R3-MYB基因,根据系统进化分析将其分为36个亚组。99个R2R3-PeMYB基因随机分布在9条百香果染色体上。基序和基因结构分析表明,R2R3-PeMYB在同一亚组中具有相对保守的结构特征。共线性分析表明,片段复制事件促进了百香果R2R3-MYB家族的扩张。基于转录组数据和qRT-PCR分析,发现R2R3-PeMYB基因在百香果花的不同组织的不同发育阶段中表现出差异的表达模式,说明R2R3-PeMYB基因在花不同组织和果实的发育过程中发挥重要作用,尤其是PeMYB62和PeMYB63在百香果果皮转色期的高表达,说明其可能参与百香果花青素的合成。同时8个R2R3-PeMYB基因在非生物胁迫(冷、热、盐和渗透压)下也表现出不同的反应,说明R2R3-PeMYB基因还受到非生物胁迫的诱导。【结论】鉴定了99个R2R3-PeMYB基因家族成员,发现其在百香果花果发育和胁迫诱导方面发挥重要作用,为今后研究百香果R2R3-MYB基因在花果发育中的功能和进化提供了有价值的线索。 展开更多
关键词 百香果 R2R3-myb转录因子 系统发育分析 花果发育
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球茎甘蓝MYB62转录因子的克隆与表达特征分析
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作者 王鑫淼 赵孟良 +2 位作者 邵登魁 尕桑 任延靖 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期62-70,共9页
为了明晰球茎甘蓝MYB62转录因子的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索球茎甘蓝MYB62转录因子的生物学功能,为后续MYB62转录因子功能鉴定提供理论依据,以球茎甘蓝为研究对象,采用同源克隆的方法获得球茎甘蓝MYB62转录因子基... 为了明晰球茎甘蓝MYB62转录因子的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索球茎甘蓝MYB62转录因子的生物学功能,为后续MYB62转录因子功能鉴定提供理论依据,以球茎甘蓝为研究对象,采用同源克隆的方法获得球茎甘蓝MYB62转录因子基因,并对其进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR的方法分析MYB62在球茎甘蓝不同组织间以及逆境胁迫后的表达特征。基因克隆结果表明,BocMYB62基因gDNA全长1353 bp,CDS为837 bp,包括4个外显子和3个内含子,编码278个氨基酸。序列结构分析结果显示,BocMYB62为亲水性蛋白,具有2个SANT-MYB结构域,属于R2R3-MYB型MYB转录因子;空间结构预测显示其具有典型的α-螺旋结构;系统发育分析表明,BocMYB62与甘蓝型油菜MYB62亲缘关系最近。时空表达结果显示,BocMYB62在绿色球茎甘蓝中的表达量始终高于在紫色球茎甘蓝中,且存在明显的组织特异性,在干旱胁迫后BocMYB62表达量显著升高,胁迫12 h表达量最高,低温胁迫后BocMYB62表达量显著低于对照,在4℃低温胁迫时表达量最低,推断BocMYB62可能参与花青素生物合成调控,并可能参与逆境胁迫的调控作用。 展开更多
关键词 球茎甘蓝 myb62 序列分析 保守基序 亲缘关系 荧光定量PCR
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玉米转录因子ZmMYB12提高植物抗旱性和低磷耐受性的功能鉴定
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作者 王丽平 王晓钰 +1 位作者 傅竞也 王强 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期76-88,共13页
玉米生长发育过程中会遭受干旱、高温、高盐及营养元素匮乏等多种非生物胁迫,导致其产量和品质下降,造成严重的农业减产。MYB类转录因子在植物中广泛分布,参与植物生长发育和环境响应,筛选及鉴定出具有抗逆功能的MYB类转录因子能为玉米... 玉米生长发育过程中会遭受干旱、高温、高盐及营养元素匮乏等多种非生物胁迫,导致其产量和品质下降,造成严重的农业减产。MYB类转录因子在植物中广泛分布,参与植物生长发育和环境响应,筛选及鉴定出具有抗逆功能的MYB类转录因子能为玉米抗逆遗传改良提供理论依据。本研究从玉米干旱处理的材料中克隆了一个R2R3-MYB家族转录因子基因ZmMYB12,其响应自然干旱、ABA及PEG处理,基因表达被诱导上调。病毒诱导沉默ZmMYB12后的玉米植株对干旱更加敏感,活性氧积累更多,根系更小;复水后ZmMYB12沉默植株存活率更低,表明ZmMYB12是干旱正调控因子。进一步构建ZmMYB12稳定过表达拟南芥,干旱处理后ZmMYB12过表达株系活性氧积累更少,侧根更多,抗旱能力增强。同时,发现ZmMYB12过表达拟南芥在低磷胁迫下侧根数量更多,根系酸化程度增加,叶绿素及花青素含量更多,体内无机磷含量高于野生型,表明ZmMYB12参与到低磷胁迫过程中,并且提高了植株对磷元素的吸收及利用率。研究表明ZmMYB12调控干旱抗性并响应低磷胁迫,为作物抗旱及耐低磷育种提供了一个良好的基因资源。 展开更多
关键词 玉米 myb转录因子 干旱胁迫 低磷胁迫 根系
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黄瓜R2R3-MYB亚家族鉴定及生物信息学分析
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作者 郭玉婷 杜长霞 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期286-296,共11页
【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质... 【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质互作进行分析。【结果】黄瓜全基因组中含99个具有典型结构域的R2R3-MYB转录因子,蛋白序列含195~552个氨基酸,有保守基序及氨基酸位点;基因在染色体上分布不均匀;大部分亚家族成员蛋白质的不稳定指数大于40,属于不稳定蛋白。顺式作用调控元件分析发现:大部分基因启动子区所含元件与激素调节、MYB结合位点、胁迫密切相关。【结论】通过黄瓜全基因组鉴定,获得黄瓜基因组99个R2R3-MYB家族成员,分为30个亚组,映射于7条染色体上,该家族成员的上游启动子区含逆境相关作用元件。 展开更多
关键词 黄瓜 R2R3-myb 转录因子 全基因组鉴定
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野菊黄酮醇合成途径调控因子CiMYB3基因启动子的克隆与表达分析
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作者 孙亚辉 姜天华 +3 位作者 高康 陈东亮 黄丛林 罗昌 《现代园艺》 2024年第11期64-66,74,162,共5页
为深入研究菊花CiMYB3转录因子参与调控黄酮醇合成响应非生物胁迫应答提供科学依据,以野菊为材料,克隆了一个MYB转录因子家族基因,命名为CiMYB3,并对CiMYB3基因进行生物信息学分析,通过RT-qPCR技术分析了其在低温(10℃)处理下的表达模... 为深入研究菊花CiMYB3转录因子参与调控黄酮醇合成响应非生物胁迫应答提供科学依据,以野菊为材料,克隆了一个MYB转录因子家族基因,命名为CiMYB3,并对CiMYB3基因进行生物信息学分析,通过RT-qPCR技术分析了其在低温(10℃)处理下的表达模式。结果表明,CiMYB3基因编码区长度为954 bp,编码317个氨基酸,编码蛋白的相对分子量为36.08 k D,等电点为6.27,为不稳定、亲水性蛋白。氨基酸序列比对分析表明野菊CiMYB3是R2R3-MYB SG7成员,多重进化树分析表明,野菊CiMYB3与栽培种‘杭菊’Cm MYB3亲缘关系最近,说明该基因可能参与野菊黄酮醇合成的调控。此外,亚细胞定位结果显示CiMYB3主要存在于细胞核中;RT-qPCR结果表明,CiMYB3在叶片中的表达量最高;在低温胁迫24 h后,野菊幼苗中CiMYB3显著受到低温胁迫的诱导表达,且在第6天达到峰值。表明菊花黄酮醇合成调控因子CiMYB3参与了野菊低温胁迫的响应,可能在低温调控黄酮醇合成中具有潜在功能。 展开更多
关键词 野菊 myb 转录因子 低温胁迫
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蓖麻MYB转录因子家族的鉴定和生物信息学分析
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作者 莫海英 李智昊 +5 位作者 蔡国磊 陈鑫 吉巧琳 曹亚璞 杨海英 杜刚 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期63-70,共8页
MYB是植物中最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和逆境胁迫响应等多个生理生化过程中具有重要作用,但目前缺乏对蓖麻的MYB转录因子的系统分析.首先基于基因组挖掘出32个转录因子,并对其进行蛋白基序、功能注释、系统进化以及理化性... MYB是植物中最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和逆境胁迫响应等多个生理生化过程中具有重要作用,但目前缺乏对蓖麻的MYB转录因子的系统分析.首先基于基因组挖掘出32个转录因子,并对其进行蛋白基序、功能注释、系统进化以及理化性质的分类鉴定;其次基于转录组数据分析了胁迫条件下这些转录因子的表达谱,分析其对胁迫条件的响应.结果表明蓖麻在盐胁迫下和热胁迫下MYB蛋白表达量蓖麻的生长有影响.研究结果为进一步研究MYB转录因子在蓖麻非生物胁迫中的功能提供参考. 展开更多
关键词 myb转录因子 蓖麻 盐胁迫 非生物胁迫
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Unraveling the regulatory network of flower coloration in soybean:Insights into roles of GmMYBA3 and GmMYBR1
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作者 Ruifang Gao Yueqing Li +8 位作者 Yanan Wang Xiaotong Shan Siqi Yang Ye Zhang Saiyu Ma Chunbao Zhang Jianchun Qin Li Wang Xiang Gao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第2期443-455,共13页
Anthocyanins play crucial roles in pollen protection and pollinator attraction in flowering plants.However,the mechanisms underlying flower color determination and whether floral anthocyanin regulators participate in ... Anthocyanins play crucial roles in pollen protection and pollinator attraction in flowering plants.However,the mechanisms underlying flower color determination and whether floral anthocyanin regulators participate in other processes remain largely unresolved in soybeans(Glycine max).In this study,we investigated the genetic components and mechanisms governing anthocyanin biosynthesis in soybean flowers.Molecular and genetic studies have characterized two antagonistic regulators,the positive activator GmMYBA3 and the negative repressor GmMYBR1,that modulate the gene expression of anthocyanin biosynthesis in soybean flowers.Further findings revealed a regulatory interplay between GmMYBA3 and GmMYBR1 bridged by GmTT8a,highlighting the complexity of anthocyanin regulation in different soybean organs.Exploration of additional soybean cultivars demonstrated the universality of GmMYBA3 and GmMYBR1 in regulating floral anthocyanin biosynthesis-related genes,with GmF3’5’H identified as a crucial determinant of white flower color.This study provides a molecular mechanism underlying soybean flower color determination,paving the way for the molecular modification of soybean flowers to probably enhance their resistance to abiotic stresses and attractiveness to pollinators. 展开更多
关键词 ANTHOCYANIN Flower color determination MBW complex myb repressor Pleiotropic regulator
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北美鹅掌楸LtMYB305基因的克隆及功能分析
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作者 刘换换 杨立春 李火根 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期179-188,共10页
【目的】MYB305作为MYB家族R2R3亚族成员,对植物花蜜腺发育、花蜜蛋白表达、淀粉积累和水解、类黄酮合成发挥重要作用。因此,研究MYB305的表达模式及功能对于北美鹅掌楸花蜜腺调控分子机理研究具有重要意义。【方法】本文以蜜源植物北... 【目的】MYB305作为MYB家族R2R3亚族成员,对植物花蜜腺发育、花蜜蛋白表达、淀粉积累和水解、类黄酮合成发挥重要作用。因此,研究MYB305的表达模式及功能对于北美鹅掌楸花蜜腺调控分子机理研究具有重要意义。【方法】本文以蜜源植物北美鹅掌楸的花蜜腺为材料,通过分光光度计法测定5个时期花蜜腺的花青素含量,采用RACE技术克隆LtMYB305基因,利用RT-qPCR技术检测了该基因在北美鹅掌楸不同组织间相对表达量,以烟草叶片为材料验证LtMYB305蛋白定位,并以野生型拟南芥为材料进行遗传转化实验,研究LtMYB305基因功能。【结果】北美鹅掌楸花蜜腺的花青素从膨大后期开始积累,初放期含量急剧增加,败花期含量最高,达27.14μg/g,与花蜜分泌、着色过程相一致。LtMYB305基因全长为931 bp,编码了198个氨基酸,其蛋白为亲水性蛋白和非跨膜蛋白;LtMYB305仅在北美鹅掌楸盛花期花蜜腺中高水平表达,在其他组织中几乎不表达。LtMYB305蛋白定位于细胞核。过表达LtMYB305基因的拟南芥出现侧蜜腺的“蜜腺沟”消失和加深表型,与花蜜腺相关基因AtMYB305、AtPIN6和AtSWEET9表达量上调,AtCRC、AtBOP1/2、AtMYB21、AtSWEET3/4/7基因表达量下调。【结论】LtMYB305具有典型转录因子特征,并且参与调控拟南芥花蜜腺的发育。 展开更多
关键词 北美鹅掌楸 蜜腺 myb305 基因克隆 功能分析
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OsMYB80下游基因鉴定及其在调控花粉育性中的作用分析
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作者 李挚爱 黄小燕 +9 位作者 王昌健 李永红 杨晓怀 李平东 丘式浚 陈舒静 吴建新 许纯珏 唐晓艳 陈子晟 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第1期78-91,共14页
OsMYB80是水稻花药和花粉发育过程中的重要转录因子,其下游靶标基因的相关研究仍有待补充。该研究从可能受OsMYB80直接调控的基因中筛选出24个可能参与信号转导、泛素化修饰、囊泡运输和未知功能的候选基因,利用qRT-PCR验证其表达模式,... OsMYB80是水稻花药和花粉发育过程中的重要转录因子,其下游靶标基因的相关研究仍有待补充。该研究从可能受OsMYB80直接调控的基因中筛选出24个可能参与信号转导、泛素化修饰、囊泡运输和未知功能的候选基因,利用qRT-PCR验证其表达模式,并通过CRISPR/Cas9基因编辑技术对其中7个基因(LOC_Os06g11930、LOC_Os09g26470、LOC_Os01g04409、LOC_Os06g35160、LOC_Os06g11135、LOC_Os05g13650、LOC_Os01g14880)加以敲除。经I2-KI花粉染色分析和结实情况考察发现,上述7个基因敲除后对植株育性影响都不显著,说明上述7个基因并非OsMYB80下游调控花粉育性的关键基因。这些结果也暗示某些受OsMYB80调控的下游基因及其参与的生物化学反应可能在花药花粉发育过程中功能冗余或者只发挥微效作用。 展开更多
关键词 myb80 水稻 花粉 育性
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Analysis and Verification of the Conserved MYB Binding Element in the DFR Promoter in Compositae
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作者 Jialei Guo Fengzhen Li +2 位作者 Guomin Shi Weimin Zhao Tao He 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2024年第2期343-353,共11页
Anthocyanins,ubiquitous in the Compositae family,are regulated by MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog),playing an important role in anthocyanin synthesis.In this study,we analyzed the regulation path... Anthocyanins,ubiquitous in the Compositae family,are regulated by MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog),playing an important role in anthocyanin synthesis.In this study,we analyzed the regulation pathway in which the MYB protein of subgroup 6 promotes dihydroflavonol reductase(DFR)expression in Compositae,and validated this law in Saussurea medusa through yeast one-hybrid experiments.Our results showed that MYB and DFR underwent purification selection,DFR promoter analysis revealed the presence of MYB binding site(GAGTTGAATGG)and bHLH binding site(CANNTG)at the sense strand of 84–116 nucleotide residues from the start codon.These two motifs were separated by 9–10 nucleotide residues,as existed in the DFR promoters of many Compositae plants.Furthermore,the yeast one-hybrid experiment demonstrated that SmMYB1 can activate the promoter of SmDFR.Our results provide a reference for further functional study of DFR in Compositae. 展开更多
关键词 COMPOSITAE ANTHOCYANIN DFR gene myb gene
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基于百脉根两代基因组的LjR2R3-MYB家族比较鉴定
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作者 罗雪 黄友闻 +2 位作者 王一凡 杨仕梅 宋莉 《贵州农业科学》 CAS 2024年第3期109-120,共12页
【目的】探明LjR2R3-MYB转录因子家族的结构和功能,为二代测序与三代测序的差异研究、百脉根转录因子发掘鉴定及LjR2R3-MYBs的调控功能鉴定提供参考。【方法】对二代测序(SGS)与三代测序(TGS)2个版本百脉根全基因组数据的LjR2R3-MYB转... 【目的】探明LjR2R3-MYB转录因子家族的结构和功能,为二代测序与三代测序的差异研究、百脉根转录因子发掘鉴定及LjR2R3-MYBs的调控功能鉴定提供参考。【方法】对二代测序(SGS)与三代测序(TGS)2个版本百脉根全基因组数据的LjR2R3-MYB转录因子进行鉴定分析,研究其成员组成、进化特征、基因结构、蛋白性质、空间结构、染色体定位、顺式作用元件等。【结果】在SGS和TGS版本中,LjR2R3-MYB家族分别有96个和135个成员,TGS的基因序列比SGS多3条保守基序;家族成员均属于14个亚族,TGS获得的独有序列比SGS多39条;SGS中有86条基因含有UTR,TGS中有78条,二者的LjR2R3-MYB成员motif类型存在差异;所有LjR2R3-MYB基因编码蛋白均为亲水性蛋白,不含信号肽,定位于细胞核,二级结构组成基本一致;SGS的0号染色体上分布有25条R2R3-MYB基因,TGS含有6条染色体且无0号染色体;LjR2R3-MYB基因启动子含有逆境胁迫、防御、激素以及生长发育响应等顺式作用元件。【结论】同SGS相比较,从TGS数据中获得的基因信息量更完整丰富,百脉根TGS组装质量高于SGS。 展开更多
关键词 百脉根 LjR2R3-myb转录因子 基因特征 功能预测 二代测序 三代测序
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低温胁迫下番茄SlMYB44-like基因的功能分析
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作者 张琴林 张佳蕊 +1 位作者 郭仰东 张喜春 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第19期24-29,共6页
为探究SlMYB44-like基因在低温胁迫下的功能,为番茄抗寒育种提供理论基础。利用病毒诱导的基因沉默技术(VIGS),以烟草脆裂病毒(TRV2)为载体,构建pTRV2-SlMYB44-like沉默载体并侵染番茄幼苗,对野生型(WT)、空载组(CK)以及基因沉默组(TRV-... 为探究SlMYB44-like基因在低温胁迫下的功能,为番茄抗寒育种提供理论基础。利用病毒诱导的基因沉默技术(VIGS),以烟草脆裂病毒(TRV2)为载体,构建pTRV2-SlMYB44-like沉默载体并侵染番茄幼苗,对野生型(WT)、空载组(CK)以及基因沉默组(TRV-SlMYB44-like)3组番茄植株进行低温处理,并对植株的表型、脯氨酸含量、可溶性蛋白含量、可溶性糖含量、丙二醛含量及抗氧化酶活性等生理指标进行测定。植株表型结果显示,低温胁迫下,基因沉默植株表现受冷害程度更明显;抗寒生理指标结果显示,低温胁迫下,基因沉默组的脯氨酸含量、可溶性蛋白含量、过氧化氢酶活性和过氧化物酶活性比野生型的低,而可溶性糖含量、丙二醛含量以及超氧化物歧化酶活性明显比野生型的高,说明低温胁迫后基因沉默组植株的细胞受损更严重。通过对沉默植株的抗寒性分析,结果显示SlMYB44-like基因沉默降低了番茄植株的抗寒性。表明SlMYB44-like基因响应低温胁迫,参与了调控过程,将SlMYB44-like基因瞬时沉默后,番茄植株的抗寒性下降。 展开更多
关键词 番茄 myb转录因子 Slmyb44-like基因 低温胁迫 VIGS 基因功能
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乳腺癌组织中Cyclin D1、MYBL2表达及其对预后影响的研究
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作者 顾蓓 郭斌 +2 位作者 苏群学 荣鸣 朱启明 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2023年第3期411-418,共8页
目的:检测乳腺癌组织中细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、Myb相关蛋白B(MYBL2)表达,并分析其对预后的影响。方法:回顾性选取2015年1月至2019年12月本院确诊为乳腺癌且进行初次乳腺癌手术切除患者的乳腺癌石蜡组织标本185例,取癌组织和癌旁正... 目的:检测乳腺癌组织中细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、Myb相关蛋白B(MYBL2)表达,并分析其对预后的影响。方法:回顾性选取2015年1月至2019年12月本院确诊为乳腺癌且进行初次乳腺癌手术切除患者的乳腺癌石蜡组织标本185例,取癌组织和癌旁正常组织采用免疫组化二步法测定Cyclin D1、MYBL2表达并比较,分析癌组织中二者的相关性以及蛋白表达与临床病理特征的关系,进行Kaplan-Meier生存分析,Cox回归分析预后不良的影响因素。结果:癌组织Cyclin D1、MYBL2阳性表达率、二者同时阳性表达率均高于癌旁正常组织(P<0.05);癌组织Cyclin D1、MYBL2表达呈正相关(P<0.001);双侧患病、Ⅲ~Ⅳ期、未/低分化患者的癌组织Cyclin D1、MYBL2阳性表达率、二者同时阳性表达率均分别高于单侧患病、Ⅰ~Ⅱ期、中/高分化患者(P<0.05);患者随访期间死亡率为20.00%,且癌组织Cyclin D1、MYBL2阳性表达患者无病生存时间(DFS)和总生存时间(OS)均短于阴性表达患者(P<0.05),二者同时阳性表达患者的DFS和OS均短于二者非同时阳性表达患者(P<0.05);癌组织Cyclin D1、MYBL2阳性表达者死亡率均高于Cyclin D1、MYBL2阴性表达者(P<0.05),二者同时阳性表达患者死亡率高于二者非同时阳性表达者(P<0.05);随访期间患者的预后不良发生率为60.54%,双侧患病、Ⅲ~Ⅳ期、未/低分化、三阴性乳腺癌、癌组织Cyclin D1和MYBL2阳性表达均为患者预后不良的危险因素(P<0.05)。结论:乳腺癌组织Cyclin D1、MYBL2蛋白阳性表达率、二者同时阳性表达率高,与临床病理特征及预后均有关。 展开更多
关键词 乳腺癌 细胞周期蛋白D1 myb相关蛋白B 预后
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Systematic analysis of MYB transcription factors and the role of LuMYB216 in regulating anthocyanin biosynthesis in the flowers of flax(Linum usitatissimum L.) 被引量:1
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作者 XIE Dong-wei LI Jing +4 位作者 ZHANG Xiao-yu DAI Zhi-gang ZHOU Wen-zhi SU Jian-guang SUN Jian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第8期2335-2345,共11页
Anthocyanin is an important pigment that affects plant color and nutritional quality.MYBs play an important role in plant anthocyanin synthesis and accumulation.However,the regulatory function of MYB transcription fac... Anthocyanin is an important pigment that affects plant color and nutritional quality.MYBs play an important role in plant anthocyanin synthesis and accumulation.However,the regulatory function of MYB transcription factors in anthocyanin synthesis in flax flowers is still unclear.In this study,402 MYB transcription factors were identified in the flax genome.These MYB members are unevenly distributed on 15 chromosomes.The R2R3-LuMYB members were divided into 32phylogenetic subfamilies.qRT-PCR analysis showed that seven R2R3-LuMYB genes in the adjacent subfamily of the evolutionary tree had similar expression patterns,among which Lu MYB216 was highly expressed in the petals of different colors.Moreover,gene editing of LuMYB216 in flax showed that the petal color,anther color and seed coat color of mutant plants were significantly lighter than those of wild-type plants,and the anthocyanin content of lumyb216 mutant plants was significantly reduced.Correlation analysis indicated that LuMYB216 was significantly positively correlated with the upstream regulator bHLH30.This study systematically analyzed the MYB gene family in flax,laying a foundation for studying the regulation of LuMYB216 in flax flower anthocyanin synthesis. 展开更多
关键词 FLAX myb gene family anthocyanin biosynthesis Lumyb216 functional characterization
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