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人NPTX1相关H3K27ac富集的非保守性增强子鉴定
1
作者 陈旭东 张琦 +5 位作者 张颖蓝 林佳 王凤 桂怡婷 刘婷 李强 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期487-493,501,共8页
目的探索和鉴定人NPTX1相关H3K27ac富集的非保守性的增强子,完善NPTX1相关调控区的注释,为NPTX1相关疾病及非编码区突变的研究提供相应的理论基础。方法从CistromeDB数据库下载和分析涉及7种组织的39个H3K27ac ChIP-seq数据,选择NPTX1两... 目的探索和鉴定人NPTX1相关H3K27ac富集的非保守性的增强子,完善NPTX1相关调控区的注释,为NPTX1相关疾病及非编码区突变的研究提供相应的理论基础。方法从CistromeDB数据库下载和分析涉及7种组织的39个H3K27ac ChIP-seq数据,选择NPTX1两侧100 kb范围内的峰。通过ECR浏览器分析各片段在人、小鼠和斑马鱼之间的序列保守性。将相应DNA片段插入双荧光素酶验证载体中,在人神经源细胞系SH-SY5Y和人肾源细胞系293T行双荧光素酶实验,以检测增强子活性。结果分析获得5个H3K27ac富集片段,各片段在人、小鼠和斑马鱼之间DNA序列不保守。NPTX1-E1-P在SH-SY5Y中双荧光素酶活性比值明显高于阴性对照组,但在293T细胞中其增强子活性下降约40%。结论NPTX1附近的H3K27ac富集片段中,NPTX1-E1-P在人神经细胞系SH-SY5Y中具有增强子活性,且在物种间序列保守性低。相对于人神经源细胞系SH-SY5Y,其在人肾源细胞系293T中增强子活性下降。 展开更多
关键词 nptx1 增强子 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq) H3K27ac
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血清NPTX1在不同病理类型胸腺瘤患者中的表达及诊断价值
2
作者 李建亮 《中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生》 2022年第4期7-9,共3页
研究血清NPTX1在不同病理类型胸腺瘤患者中的表达及诊断价值。方法:选取2018年9月~2021年9月期间在我院进行手术治疗的30例胸腺瘤患者作为观察组对象,同时选取同期本医院收治的非胸腺瘤30例作为对照组。对各组患者的NPTX1 mRNA转录水平... 研究血清NPTX1在不同病理类型胸腺瘤患者中的表达及诊断价值。方法:选取2018年9月~2021年9月期间在我院进行手术治疗的30例胸腺瘤患者作为观察组对象,同时选取同期本医院收治的非胸腺瘤30例作为对照组。对各组患者的NPTX1 mRNA转录水平、手术前后NPTX1蛋白含量水平以及血清NPTX1在胸腺瘤中的诊断价值进行比较分析。结果:相较于对照组,观察组的NPTX1 mRNA转录水平更高(P<0.05)。观察组在术前、术后时的NPTX1蛋白含量均高于对照组(P<0.05)。观察组术后的NPTX1蛋白含量均低于术前水平(P<0.05)。三种亚型在术前、术后时的血清NPTX1表达均无统计学差异(P>0.05)。术后各亚型的血清NPTX1表达相较于术前均更低(P<0.05)。在胸腺瘤诊断中,血清NPTX1的诊断准确性、敏感性、特异性以及阴、阳性预测值分别为94.29%、96.55%、83.33%、83.33%、95.55%。结论:血清NPTX1在不同病理类型胸腺瘤患者中高表达,具有较高的临床诊断价值。 展开更多
关键词 胸腺瘤 血清nptx1 诊断价值
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多浪羊NPTX 1基因克隆、生物信息学分析及在初情期的表达研究
3
作者 张永杰 隋志远 +3 位作者 张志帅 王晨光 李孝君 邢凤 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1048-1058,共11页
【目的】试验旨在克隆多浪羊神经元正五聚体蛋白1(neuronal pentraxin 1,NPTX1)基因CDS序列,利用生物信息学分析NPTX1蛋白的结构和功能,并研究其在多浪羊初情期启动过程中性腺轴不同组织中的表达规律。【方法】采集初情期前、初情期、... 【目的】试验旨在克隆多浪羊神经元正五聚体蛋白1(neuronal pentraxin 1,NPTX1)基因CDS序列,利用生物信息学分析NPTX1蛋白的结构和功能,并研究其在多浪羊初情期启动过程中性腺轴不同组织中的表达规律。【方法】采集初情期前、初情期、初情期后健康雌性多浪羊的下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫组织,提取总RNA并反转录成cDNA,以初情期前下丘脑cDNA为模板,PCR扩增多浪羊NPTX 1基因并克隆测序,对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR分析NPTX 1基因在多浪羊下丘脑、垂体、卵巢、子宫、输卵管5个组织中的表达水平。【结果】克隆得到NPTX 1基因长1576 bp,其中CDS区序列为1299 bp,与GenBank上预测的绵羊mRNA序列(登录号:XM_005683183.3)相似性达99.85%。系统进化树分析得出,多浪羊NPTX 1基因与绵羊的遗传距离最近,与鸡的遗传距离最远。生物信息学分析发现,NPTX1蛋白为不稳定的亲水性酸性蛋白,具有1个信号肽,属于分泌蛋白;二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比分别为41.90%和40.73%,与三级结构预测结果一致。实时荧光定量PCR结果显示,NPTX 1基因在多浪羊3个时期5个不同性腺组织中均有表达,在初情期下丘脑中表达量最高,显著高于初情期前和初情期后(P<0.05)。【结论】试验成功克隆了多浪羊NPTX 1基因CDS全长序列,并揭示了NPTX 1基因在多浪羊初情期不同阶段性腺轴组织中的表达差异性,为进一步探究NPTX 1基因在多浪羊初情期启动过程中的调控机制提供依据。 展开更多
关键词 多浪羊 NPTX 1基因 克隆 初情期 组织表达
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七氟烷通过调控miRNA表达影响人脑胶质瘤的生物学特性
4
作者 韩劲松 姜崇发 +3 位作者 李印玉 侯俊锋 谢宏伟 李治松 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2021年第24期5744-5748,共5页
目的探讨七氟烷对胶质瘤细胞生物学特性的影响及其作用机制。方法实验分为七氟烷组和对照(NC)组,七氟烷组分别通入1.25%、2.50%、5.00%的七氟烷和5%CO_(2)+95%O_(2)培养细胞,气流量均为1 L/min;对照(NC)组只通入5%CO_(2)+95%O_(2)。将pc... 目的探讨七氟烷对胶质瘤细胞生物学特性的影响及其作用机制。方法实验分为七氟烷组和对照(NC)组,七氟烷组分别通入1.25%、2.50%、5.00%的七氟烷和5%CO_(2)+95%O_(2)培养细胞,气流量均为1 L/min;对照(NC)组只通入5%CO_(2)+95%O_(2)。将pcDNA和pcDNA-NPTX1质粒分别转染至A172细胞中再用5.00%的七氟烷处理,分别记为Sevoflurane+pcDNA组、Sevoflurane+pcDNA-NPTX1组;转染均采用脂质体法。四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;Transwell检测细胞迁移和侵袭;Western印迹检测基质金属蛋白酶(MMP)-9、MMP-2、神经元五聚蛋白(NPTX)1、上皮钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、神经钙黏蛋白(N-cadherin)表达水平;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测miR-139-5p和NPTX1 mRNA表达水平;双荧光素酶报告基因检测miR-139-5p和NPTX1的靶向关系。结果一定浓度的七氟烷处理A172细胞后,细胞存活率、迁移和侵袭数量显著降低,NPTX1、MMP-2、MMP-9、Vimentin、N-cadherin表达水平显著降低,miR-139-5p、E-cadherin表达水平显著升高。miR-139-5p靶向调控NPTX1,过表达NPTX1逆转了七氟烷对胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭和上皮间质转化(EMT)的抑制作用。结论七氟烷可抑制胶质瘤细胞增殖、迁移、侵袭和EMT,其机制可能是与miR-139-5p、NPTX1相关。 展开更多
关键词 七氟烷 miR-139-5p nptx1 胶质瘤
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MKRN3基因与儿童中枢性性早熟 被引量：9
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作者 石玉兰 贵子豪 +2 位作者 郭冰冰 徐高生 莫中成 《中南医学科学杂志》 CAS 2019年第6期566-570,556,共5页
中枢性性早熟是一种常见的儿童性发育异常性疾病,其发病机制暂不明确。环指蛋白3基因的功能丧失性突变是中枢性性早熟的重要致病因素。在目前已证实的中枢性性早熟相关致病基因中,环指蛋白3基因所致性早熟的发病率相对较高。本文综述了... 中枢性性早熟是一种常见的儿童性发育异常性疾病,其发病机制暂不明确。环指蛋白3基因的功能丧失性突变是中枢性性早熟的重要致病因素。在目前已证实的中枢性性早熟相关致病基因中,环指蛋白3基因所致性早熟的发病率相对较高。本文综述了环指蛋白3基因的结构,突变,以及对于青春期时间可能的影响。 展开更多
关键词 环指蛋白3基因 LIN28B基因 促性腺激素释放激素 nptx1神经元
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