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题名水稻Osp39基因的组织表达和亚细胞定位分析
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作者
腾海艳
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机构
宜春学院化学与生物工程学院
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期10-17,共8页
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基金
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ211619)。
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文摘
为研究Osp39基因在水稻叶绿体蛋白质输入调控过程中的作用,采用生物信息学方法对水稻的Osp39基因进行了序列搜索和启动子上游元件分析,对其编码的OsP39蛋白进行了同源性比对、结构和性质预测,并分别通过定量PCR和瞬时表达进行了基因的组织表达分析和蛋白质亚细胞定位分析。结果显示,Osp39基因位于水稻5号染色体,基因编码区含11个外显子,无可变剪切方式。Osp39启动子中含有I box、ATCT-motif等多种光响应和叶绿体调节元件,转录分析也显示,在苗期和扬花期,Osp39基因在水稻叶、叶鞘等绿色组织中的转录水平均极显著高于根、花等非绿色组织。OsP39蛋白稳定性好,耐热,分子量约38.7 ku,理论等电点pH值8.64,共含有361个氨基酸残基,富含甘氨酸,第245—271氨基酸残基形成高度保守的L6 loop区,为OMP85蛋白家族的特征性结构域,空间结构预测显示,OsP39蛋白是富含β-折叠片的β-桶状膜蛋白,亚细胞定位结果显示,OsP39蛋白定位于水稻叶绿体膜。上述结果表明,Osp39是一个叶绿体膜功能相关基因,参与水稻的光响应和叶绿体功能调节。
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关键词
水稻
osp39基因
生物信息学
组织表达
亚细胞定位
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Keywords
Rice
osp39 gene
Bioinformatics
Tissue expression
Subcellular localization
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分类号
S511.03
[农业科学—作物学]
Q78
[生物学—分子生物学]
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