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Investigation of Plasmodium falciparum Resistance Biomarkers among Primary School Children in Western Kenya
1
作者 Otilmoi Poul Stephen Tonny Teya Nyandwaro +11 位作者 Robinson Mugasiali Irekwa Rebecca Wanjiku Waihenya Matthew Mutinda Munyao Peter Kipkemboi Rotich Caroline Wangui Njoroge Anne Wanjiru Mwangi Joanne Jepkemei Yego Nicole Sian Tanchu Dawala Koromtili Oumar Grace Ngendo Kanyita Primrose Muthoni Ndungu Samson Muuo Nzou 《American Journal of Molecular Biology》 2022年第2期43-53,共11页
Background: A marked decrease in malaria-related deaths worldwide has been attributed to the administration of effective antimalarials against Plasmodium falciparum. However, the continuous spread of P. falciparum res... Background: A marked decrease in malaria-related deaths worldwide has been attributed to the administration of effective antimalarials against Plasmodium falciparum. However, the continuous spread of P. falciparum resistance to anti-malarial drugs is raising a serious problem in controlling Malaria to the vulnerable children’s immune system. In recent studies, Plasmodium falciparum Kelch 13 propeller gene (Pfk13) has been reported to develop resistance to artemisinin in South Asia. In this study, we checked Plasmodium falciparum chloroquine resistance transporter gene (Pfcrt) involved in chloroquine (CQ) resistance. Method: In this study, archived 280 samples were collected from Alupe primary school children in Busia, Western Kenya from May, 2016 to November, 2016. Genomic DNA was extracted using the MightyPrep reagent. The samples were investigated for P. falciparum positivity out of which 67 of them tested positive giving a prevalence rate of 24%. The sixty-seven were subjected to PCR amplification for the molecular marker resistance to Pfcrt. After PCR amplification, the amplicons were purified and sequenced using Sanger Sequencing. The sequence data were analyzed using BioEdit software to identify point mutations. Results: 14 samples sequences were analyzed on Bioedit software giving the following amino acid changes F76C, Y66H, L70A, Y58C, T59V, V65I, P67L, T81L, Y60S, Y66S, P67T and I71F). New mutations have been reported at position 76 leading to an amino acid change, one of Pfcrt gold standard biomarkers. However, amino acid changes Y66H, L70A, Y58C, T59V, V65I, P67L, T81L, Y60S, Y66S, P67T and I71F are newly reported giving an increase in Pfcrt prevalence of concern from zero to 5.0%. A phylogenetic evolutionary relationship was constructed as shown below. Generally, the results showed a continuous resistance of P.falciparum to Pfcrt which calls for robust continuous monitoring and surveillance. Conclusion: Due to the increase of the resistant Pfcrt gene prevalence, continuous development of new mutants against chloroquine indicates that there is need to repurpose anti-malarial drugs for future partner drugs. 展开更多
关键词 p. falciparum chloroquine Drug Resistance MALARIA p. falciparum chloroquine Resistance transporter gene MUTATIONS
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用pfcrt点突变基因检测技术检测恶性疟原虫氯喹抗药性的初步研究 被引量:10
2
作者 王安平 高琪 +5 位作者 顾亚萍 周华云 王善青 王光泽 林世干 蒙锋 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2005年第2期120-123,共4页
目的 建立一种恶性疟原虫氯喹抗药性基因pfcrt点突变的检测方法,以判断是否存在氯喹抗药性。方法 根据恶性疟原虫pfcrt基因序列设计巢式PCR引物,以恶性疟原虫DNA为模板扩增出一条包含第76位密码子的DNA片段;扩增产物经限制性内切酶Ap... 目的 建立一种恶性疟原虫氯喹抗药性基因pfcrt点突变的检测方法,以判断是否存在氯喹抗药性。方法 根据恶性疟原虫pfcrt基因序列设计巢式PCR引物,以恶性疟原虫DNA为模板扩增出一条包含第76位密码子的DNA片段;扩增产物经限制性内切酶Apo I消化,用琼脂糖凝胶电泳观察恶性疟原虫pfcrt等位基因是否为突变型。结果 31份样本经巢式PCR扩增均出现14 0 bp左右的特异性片段。酶切消化后,9份滤纸血样本中有4例出现1条14 0 bp左右的片段,为突变型pfcrt等位基因,其余5份出现97bp与4 8bp两种酶切片段,为野生型pfcrt等位基因;2 2份血涂片样本中有10份突变型,突变率为4 5 .16 %。14例突变样本中,有1例体内实验氯喹治疗有效。结论 巢式PCR- RFL P法可以快速、高效的检测恶性疟原虫pfcrt基因76位密码子的点突变,并且能够初步应用于恶性疟原虫氯喹抗药性的鉴别。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 氯喹抗药性 pfcrt基因 巢式pCR
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氯喹抗性相关基因pfmdrl两个突变点的初步研究 被引量:6
3
作者 杨亚明 Adagu +3 位作者 I.S 高百荷 刘慧 张国森 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2001年第11期1058-1060,共3页
目的 对氯喹抗性相关基因 pfmdrl两突变点进行研究。方法 用新颖的等位基因特异PCR和限制性酶切分析技术 (AS -PCR/RFLP)检测云南恶性疟的与氯喹抗性相关的pfmdrl基因Asn86 Tyr和Asp12 46 Tyr的突变点 ,了解其与氯喹抗性表现型的相关... 目的 对氯喹抗性相关基因 pfmdrl两突变点进行研究。方法 用新颖的等位基因特异PCR和限制性酶切分析技术 (AS -PCR/RFLP)检测云南恶性疟的与氯喹抗性相关的pfmdrl基因Asn86 Tyr和Asp12 46 Tyr的突变点 ,了解其与氯喹抗性表现型的相关性。结果 在 10个氯喹抗性分离株未检测 pfmdrl基因 86位氨基酸编码子的突变 (Asn86型 ) ;而在 9个氯喹抗性分离株中检测 pfmdrl基因 86位氨基酸编码子由A变为T ,即86 Tyr型。未检测到 pfmdrl基因Asn12 46 Tyr的突变。结论 提示在云南恶性疟氯喹抗性流行区 ,氯喹抗性表现型与pfmdrl基因 86 Tyr的位点突变符合性仅 47 4% ,似无明显关系 ;而基因Asn12 46 Tyr的位点突变似乎是不存在。这支持除Asn86 Tyr突变外 。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 氯喹抗性 等位基因特异pCR pfmdrl基因
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海南恶性疟原虫pfcrt等位基因多态性的单体型研究 被引量:2
4
作者 王安平 高琪 +4 位作者 顾亚萍 王善青 王光泽 林世干 蒙锋 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期106-108,113,共4页
目的建立恶性疟原虫pfcrt(Plasmodium falciparum chloroquine resistant transporter)等位基因多态性的单体型的研究疗法,比较我国海南省与东南亚及非洲地区恶性疟原虫的pfcrt等位基因多态性的单体型的特征。方法来自海南省19份恶性疟... 目的建立恶性疟原虫pfcrt(Plasmodium falciparum chloroquine resistant transporter)等位基因多态性的单体型的研究疗法,比较我国海南省与东南亚及非洲地区恶性疟原虫的pfcrt等位基因多态性的单体型的特征。方法来自海南省19份恶性疟滤纸血样提取DNA,通过巢式PCR反应,扩增出包含第72~76、97位密码子的基因片段,根据限制性片段长度多态性(RFLP)分析结果,各选取6份突变型和野生型PCR产物进行DNA测序,检测第72~76、97位密码子序列,从而建立并分析我国海南省恶性疟prcrt等位基因的单体型。结果19份滤纸血样本提取的DNA全部扩增出1条195 bp的片段,酶切消化后,有11份出现1条100 bp左右的酶切片段,为野生型pfcrt等位基因,其余8份为1条195 bp的片段,为突变型。基因序列分析发现,野生型pfcrt等位基因的第72~76位密码子单体型为CVMNK,突变型为CVIET,第97位密码子未发现突变。结论我国海南省氯喹抗药性恶性疟原虫pfcrt等位基因第72~76位密码子的单体型与东南亚和非洲地区抗氯喹恶性疟原虫相应单体型一致。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 氯喹抗药性 pfcn基因 巢式pCR 单体型
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恶性疟原虫海南分离株pfmdr1基因与氯喹抗性的相关性分析 被引量:3
5
作者 于丹 江钢锋 陈沛泉 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1143-1146,共4页
目的了解海南省恶性疟原虫pfmdr1基因同氯喹抗性的关系。方法采用套式PCR技术特异性扩增pfmdr1基因含有编码第86位、1042位和1246位氨基酸的基因片段,并对扩增产物进行RFLP分析。结果42个样本中,pfmdr1第86位氨基酸均未发生突变,即86位... 目的了解海南省恶性疟原虫pfmdr1基因同氯喹抗性的关系。方法采用套式PCR技术特异性扩增pfmdr1基因含有编码第86位、1042位和1246位氨基酸的基因片段,并对扩增产物进行RFLP分析。结果42个样本中,pfmdr1第86位氨基酸均未发生突变,即86位氨基酸是野生型的Asn,而不是突变型的Tyr。第1246位氨基酸发生突变的样本共有7个,全部为抗性虫株。第1042位点PCR扩增结果阳性的37个样本中突变的样本共有10个,其中9个为抗性虫株,一个为敏感虫株。结论我国海南省恶性疟原虫氯喹抗性产生与pfmdr186位氨基酸基因多态性无关,但第1042和1246位氨基酸的突变更易在抗性虫株中检出。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 pfmdr1基因 氯喹抗性
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海南省恶性疟原虫氯喹抗性相关基因Pfmdr1多态性分析 被引量:2
6
作者 宋杰 江钢锋 陈沛泉 《热带医学杂志》 CAS 2005年第1期26-29,共4页
目的了解海南省恶性疟原虫Pfmdr1基因中的关键性点突变是否与海南株恶性疟原虫产生氯喹抗性有关。方法采用套式PCR法分别扩增Pfmdr1基因中含有第86位和1246位氨基酸的多态性片段,并对扩增产物进行限制性内切酶酶切分析,观察是否存在突... 目的了解海南省恶性疟原虫Pfmdr1基因中的关键性点突变是否与海南株恶性疟原虫产生氯喹抗性有关。方法采用套式PCR法分别扩增Pfmdr1基因中含有第86位和1246位氨基酸的多态性片段,并对扩增产物进行限制性内切酶酶切分析,观察是否存在突变位点。结果45个样本中,Pfmdr1基因第86位氨基酸均未发生点突变,即86位密码子是Asn而非突变型的Tyr;Pfmdr1基因发生D1246Y突变的样本有3个,其中1个是抗性株,2个为敏感株。结论我国海南株恶性疟原虫产生氯喹抗性与Pfmdr1基因的多态性无显著关系。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 pfmdrl基因 氯喹抗性
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海南省恶性疟原虫氯喹抗性相关基因pfcrt多态性分析 被引量:3
7
作者 宋杰 江钢锋 陈沛泉 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2005年第3期175-177,共3页
目的了解海南省恶性疟原虫产生氯喹抗性是否与pfcrt基因中的关键性点突变有关。方法对45份采自海南省恶性疟患者血样,采用套式PCR法分别扩增pfcrt基因中含有第76位和220位氨基酸的多态性片段,并对扩增产物进行限制性内切酶酶切分析,观... 目的了解海南省恶性疟原虫产生氯喹抗性是否与pfcrt基因中的关键性点突变有关。方法对45份采自海南省恶性疟患者血样,采用套式PCR法分别扩增pfcrt基因中含有第76位和220位氨基酸的多态性片段,并对扩增产物进行限制性内切酶酶切分析,观察是否存在突变位点。结果45个样本中,pfcrt基因发生K76T点突变的样本有28个,其中20个是抗性株,8个是敏感株;全部样本的pfcrt基因第220位氨基酸均发生A220S点突变。结论我国海南株恶性疟原虫产生氯喹抗性与发生在pfcrt基因中的K76T点突变有一定的关联。 展开更多
关键词 疟原虫 恶性 pfcrt基因 氯喹抗性
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云南恶性疟原虫氯喹抗药性基因76位点突变研究 被引量:5
8
作者 杨亚明 IS.Adagu +3 位作者 张再兴 周升 刘慧 David Warhurst 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2005年第5期365-367,共3页
目的研究云南恶性疟原虫氯喹抗药性基因(pfcrt)76位点突变的情况,以及与抗药性表现型的关系。方法应用PCR和限制性酶切片段长度分析方法,检测现症病人干滤纸血样的恶性疟原虫pfcrt基因点突变。结果云南省恶性疟原虫pfcrt基因76位点的突... 目的研究云南恶性疟原虫氯喹抗药性基因(pfcrt)76位点突变的情况,以及与抗药性表现型的关系。方法应用PCR和限制性酶切片段长度分析方法,检测现症病人干滤纸血样的恶性疟原虫pfcrt基因点突变。结果云南省恶性疟原虫pfcrt基因76位点的突变型很高,占85.0%(51/60);野生型和混合型较少,分别占8.3%(5/60)和6.7%(4/60)。体内法测定的氯喹抗性和敏感样本均有pfcrt76突变型;体外法测定的17份氯喹抗性样本中,有13份带有pf-crt76突变型。结论云南省恶性疟原虫pfcrt基因氨基酸编码76位点突变频度很高。体内和体外法测定的氯喹抗性表现与pfcrt76突变型有较高的一致性。 展开更多
关键词 云南 疟原虫 恶性 氯喹抗药性基因pfcrt 基因突变
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多药耐药基因MDR1多态性的研究进展 被引量:7
9
作者 徐萍 李焕德 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期464-467,共4页
MDR1所编码的P-糖蛋白是ABC蛋白家族成员之一,它在体内药物的转运和处置中发挥着重要作用。本文就近几年有关MDR1基因多态性对P-糖蛋白在组织中表达的影响、以及MDR1多态性对药物处置、临床疗效以及疾病风险等影响进行综述。
关键词 多药耐药基因 p-糖蛋白 单核苷酸多态性 药物转运体
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云南省恶性疟原虫多药抗性基因^(Asn)86^(Tyr)多态性调查 被引量:1
10
作者 杨亚明 Adagu IS 高白荷 《实用寄生虫病杂志》 2001年第2期52-54,共3页
目的检测云南恶性疟原虫多药抗性基因 (Pfmdr1 ) Asn 86Tyr的多态性 ,探索其与氯喹敏感性表现型的关系。方法用等位基因特异 PCR和限制性酶切片段长度分析技术 (AS-PCR/RFLP)。结果在 86% (1 9/2 2 )的氯喹抗性分离株中检测到 Pfmdr1基... 目的检测云南恶性疟原虫多药抗性基因 (Pfmdr1 ) Asn 86Tyr的多态性 ,探索其与氯喹敏感性表现型的关系。方法用等位基因特异 PCR和限制性酶切片段长度分析技术 (AS-PCR/RFLP)。结果在 86% (1 9/2 2 )的氯喹抗性分离株中检测到 Pfmdr1基因的 Asn86Tyr两种多态性 ,携带编码 86Tyr多态变异的占 50 % ,而含编码 Asn86多态的也是 50 %。结论在云南氯喹抗性高度流行区 ,Pfmdr1基因 展开更多
关键词 疟原虫 氯喹 等位基因 特异 pfmdr1 多态性 多药抗药性
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海南省恶性疟原虫cg2基因ω重复区多态性与氯喹抗性关系分析
11
作者 李小波 江钢锋 陈沛泉 《广东药学院学报》 CAS 2004年第5期530-532,538,共4页
目的了解海南省恶性疟原虫cg2基因ω重复区多态性与氯喹抗性的关系。方法采用套式PCR技术特异扩增恶性疟原虫海南分离株cg2基因ω重复区 ,并对部分目的基因片段进行直接测序和序列分析。结果氯喹抗性株和敏感株均可扩增得到cg2基因ω重... 目的了解海南省恶性疟原虫cg2基因ω重复区多态性与氯喹抗性的关系。方法采用套式PCR技术特异扩增恶性疟原虫海南分离株cg2基因ω重复区 ,并对部分目的基因片段进行直接测序和序列分析。结果氯喹抗性株和敏感株均可扩增得到cg2基因ω重复区 ,大小约在 180bp至 5 5 0bp之间。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 氯喹抗性 cg2基因多态性 套式pCR
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酮替芬和赛庚啶增强体外培养的恶性疟原虫氯喹抗性株对氯喹反应性的研究
12
作者 权红 汤林华 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期338-342,共5页
目的研究酮替芬和赛庚啶增强体外培养的恶性疟原虫氯喹抗性株对氯喹反应性,及其增效机制。方法恶性疟原虫氯喹抗性株(FccSM1/yN株)取自云南省思茅地区恶性疟患者静脉血,经同步化处理,用新鲜血将红细胞感染率调至0.5%~1.0%,红细胞压积... 目的研究酮替芬和赛庚啶增强体外培养的恶性疟原虫氯喹抗性株对氯喹反应性,及其增效机制。方法恶性疟原虫氯喹抗性株(FccSM1/yN株)取自云南省思茅地区恶性疟患者静脉血,经同步化处理,用新鲜血将红细胞感染率调至0.5%~1.0%,红细胞压积与培养基体积比(红细胞比容)为1∶9,混匀。制备氯喹药板及氯喹/酮替芬(或氯喹/赛庚啶)组合药板。氯喹药板自上而下每行氯喹终浓度依次为0.3125~2560nmol/L,呈2倍递增。氯喹/酮替芬(或氯喹/赛庚啶)组合药板,是在氯喹药板基础上加入酮替芬(或赛庚啶),每行10孔自左至右终浓度依次为9.77~5000nmol/L,呈2倍递增,每块药板均设A行空白对照。每孔加混匀血样50μl,37℃培养34h,镜检计数每200个疟原虫中含3个核以上裂殖体数,计算氯喹单药及各配伍组对恶性疟原虫的半数抑制浓度(IC50),以及酮替芬(或赛庚啶)提高氯喹活性的指数(AEI)。选择AEI值较高的配伍组,进行增效时序性研究。当氯喹对虫体作用0~10h分别加入酮替芬(或赛庚啶),34h后检测和计算各时间段IC50及AEI。选择氯喹/酮替芬(或氯喹/赛庚啶)最佳配伍剂量,培养恶性疟原虫20h,提取总RNA,用实时荧光定量PCR(real-timePCR)分析药物作用前后恶性疟原虫氯喹抗性转移基因(pfcrt)和多药抗性基因(pfmdr1)表达水平。结果0.3125~2560nmol/L氯喹与625nmol/L酮替芬(或赛庚啶)配伍,增效作用显著,氯喹/酮替芬的IC50为74.53nmol/L,AEI为0.42;氯喹/赛庚啶的IC50为89.70nmol/L、AEI为0.30。5nmol/L氯喹作用6~7h加入625nmol/L酮替芬(或赛庚啶),增效作用显著,氯喹/酮替芬的IC50为67.70nmol/L、AEI为0.47;氯喹/赛庚啶的IC50为81.53nmol/L、AEI为0.37。5nmol/L氯喹与625nmol/L酮替芬(或赛庚啶)配伍,作用20h,氯喹/酮替芬可使pfcrt基因表达水平升高91%,而氯喹/赛庚啶可使pfmdr1基因表达水平下降14%。结论体外氯喹与适量的酮替芬(或赛庚啶)配伍,能增强恶性疟原虫氯喹抗性株对氯喹的反应性。氯喹对虫体作用6~7h加入酮替芬(或赛庚啶)增效作用显著。该增效作用与pfcrt基因和pfmdr1基因的表达水平有关。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 抗性 氯喹 酮替芬 赛庚啶 pfcrt基因 pfmdr1基因 基因表达
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2015年河南省输入性恶性疟原虫Pfcrt基因的多态性分析 被引量:5
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作者 周瑞敏 王轶楠 +6 位作者 钱丹 李素华 刘颖 杨成运 赵玉玲 许汴利 张红卫 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期399-404,共6页
目的 对河南省2015年输入性恶性疟患者血样的恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白(Plasmodium falciparum chloroquine resistant transporter,Pfcrt)基因进行检测,分析其基因多态性。 方法 采集河南省2015年132例输入性恶性疟患者的血样,... 目的 对河南省2015年输入性恶性疟患者血样的恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白(Plasmodium falciparum chloroquine resistant transporter,Pfcrt)基因进行检测,分析其基因多态性。 方法 采集河南省2015年132例输入性恶性疟患者的血样,并收集患者相关信息。提取患者血样中恶性疟原虫基因组DNA,采用已有的Pfcrt基因序列引物,进行巢式PCR扩增,扩增产物经ApolⅠ酶切和测序,分析输入性恶性疟原虫Pfcrt基因多态性及其分布情况。 结果 132例输入性恶性疟患者以男性青壮年为主,均为自非洲19个国家的劳务返乡人员,其中以西非居多,占38.6%(51/132),其他依次为中非(占26.5%,35/132)、南非(25.0%,33/132),东非(占8.3%,11/132)和北非(占1.5%,2/132)。患者血样DNA经巢式PCR扩增,均获得约145 bp的特异性片段。扩增产物经ApolⅠ酶切,66.7%(88/132)患者血样的扩增产物被完全酶切,出现114 bp和31 bp两个片段;32.6%(43/132)不能被酶切,仅出现145 bp单个片段;0.8%(1/132)则酶切不完全,产生145 bp、114 bp和31 bp等3个片段。测序结果显示,132份患者血样的扩增产物经测序获得的Pfcrt基因序列,与氯喹敏感株3D7序列比对,其中43份血样(占32.6%)的Pfcrt基因序列编码的74、75和76位氨基酸碱基由ATG、AAT和AAA突变为ATT、GAA和ACA,即M74I、N75E和K76T,为突变型(CVIET);1份血样(占0.8%)的Pfcrt基因序列编码的74~76位氨基酸碱基则突变为ATG/T、A/GAA/T和AA/CA,为混合型(CVM/I、N/E/D/K、T/K);88份血样(占66.7%)的Pfcrt基因序列未发生改变,为野生型(CVMNK)。自西非输入的恶性疟病例突变型所占比例最多,为41.2%(21/51),其他依次为东非(4/11)、南非(30.3%,10/33)和中非(22.9%,8/27),三者比较差异无统计学意义(χ^2=4.07,P>0.05)。自北非输入的2例均为野生型;1例基因混合型自西非输入。 结论 2015年河南省自非洲19个国家输入的恶性疟原虫Pfcrt基因存在3种类型,野生型(CVMNK)、突变型(CVIET)和混合型(CVM/I、N/E/D/K、T/K),野生型(CVMNK)所占比例最高(66.7%);自西非地区输入的突变型(CVIET)所占比例最多(41.2%)。 展开更多
关键词 输入性疟疾 恶性疟原虫 氯喹抗性转运蛋白基因 多态性
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恶性疟原虫pfcrt基因K76T与氯喹抗性的相关分析-Meta分析 被引量:2
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作者 田斌 张兵 +2 位作者 何靖 严利民 文岚 《实用预防医学》 CAS 2013年第1期32-34,共3页
目的采用meta分析的方法探讨pfcrt K76T、与恶性疟氯喹抗性相关性。方法检索主要的医学数据库,按一定的人选和排除标准筛选相关文献,共纳入11项研究结果,采用Rev Man5对pfcrt K76T与恶性疟原虫氯喹抗性的关系进行meLa分析。结果pfcrt... 目的采用meta分析的方法探讨pfcrt K76T、与恶性疟氯喹抗性相关性。方法检索主要的医学数据库,按一定的人选和排除标准筛选相关文献,共纳入11项研究结果,采用Rev Man5对pfcrt K76T与恶性疟原虫氯喹抗性的关系进行meLa分析。结果pfcrt K76T与恶性疟氯喹抗性具有明显相关性,有统计学意义(OR=6.60,95%(CI=3.46~12.59,Z=5.73,P〈0.00001)。结论pfcrt K76T与恶性疟氯喹抗性具有明显相关性,应进一步研究,为抗疟疫苗、抗疟药物的研究和分子诊断提供科学依据。 展开更多
关键词 恶性疟 pfcrt基因 K76T 氯喹抗性
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输入性恶性疟原虫Pfcrt和pfmdr1基因突变关联性分析 被引量:1
15
作者 周水茂 李联军 +3 位作者 贾西帅 杨燕 徐明星 陈芳 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2018年第3期242-245,共4页
目的了解输入性恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白基因(Pfcrt)和恶性疟原虫多药抗性基因1(pfmdr1)相关位点突变情况及其关联性。方法 2009-2016年,采集武汉市从非洲和东南亚等回国人员恶性疟患者血样,利用巢式PCR扩增恶性疟原虫Pfcrt和pfmdr1... 目的了解输入性恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白基因(Pfcrt)和恶性疟原虫多药抗性基因1(pfmdr1)相关位点突变情况及其关联性。方法 2009-2016年,采集武汉市从非洲和东南亚等回国人员恶性疟患者血样,利用巢式PCR扩增恶性疟原虫Pfcrt和pfmdr1基因,分别用限制性内切酶ApoⅠ、AseⅠ和EcoRv对产物进行酶切,分析相关位点的突变性。结果 232例输入性恶性疟患者Pfcrt76和pfmdr186、1042、1246位点的突变率分别为55.2%、17.2%、5.2%和8.6%,pfmdr1总突变率为26.3%;东南亚患者血样未检出pfmdr186和pfmdr11246位点突变;非洲输入性恶性疟患者Pfcrt76突变和未突变中pfmdr186、1042、1246位点及pfmdr1总突变率分别为28.6%、3.8%、12.4%、36.2%和10.4%、2.1%、7.3%、17.7%。患者症状与Pfcrt76、pfmdr186、1042、1246位点突变连锁不平衡分析,D′和r^2分别为0.230和0.018、0.290和0.004、0.996和0.012、0.150和0.035。结论输入地为非洲和东南亚缅甸的恶性疟原虫pfmdr1基因突变位点存在差异,Pfcrt76突变与pfmdr1突变和pfmdr186点突变呈正相关。 展开更多
关键词 输入病例 恶性疟原虫 恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白基因 恶性疟原虫多药抗性基因1 基因突变
原文传递
2012年和2018年我国输入性恶性疟原虫氯喹抗性基因多态性分析
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作者 燕贺 王笑笑 +5 位作者 丰俊 张丽 尹建海 李美 夏志贵 黄芳 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期174-180,共7页
目的对2012年和2018年我国输入性恶性疟原虫样本氯喹抗性分子标记位点基因多态性进行检测,分析恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白基因(Plasmodium falciparum chloroquine re sistant transporter,Pfcrt)第72~76位密码子抗性相关位点突变类型... 目的对2012年和2018年我国输入性恶性疟原虫样本氯喹抗性分子标记位点基因多态性进行检测,分析恶性疟原虫氯喹抗性转运蛋白基因(Plasmodium falciparum chloroquine re sistant transporter,Pfcrt)第72~76位密码子抗性相关位点突变类型,并分析不同输入来源样本的特异性。方法收集2012年和2018年国家疟疾诊断参比实验室674例输入性恶性疟病例滤纸血样本,以样本中恶性疟原虫7号染色体上Pfcrt基因第72~76位点为扩增片段,采用巢式PCR法进行扩增并测序,对目的产物片段测序结果、地理分布等特征进行统计分析。结果2012年和2018年我国674例输入性恶性疟病例中,95.5%(644/674)来自非洲,其余4.5%(30/674)来自东南亚和大洋洲(巴布亚新几内亚);非洲又以西非和中非为主(占非洲样本的80.4%,518/644)。共检测到C72S、M74I、N75E、K76T 4个位点突变和5种单体型类型(CVMNK、CVIET、SVMNT和两种混合型),其中CVMNK与CVIET为非洲和东南亚地区恶性疟原虫共有的单体型类型,SVMNT仅在东南亚(缅甸)和巴布亚新几内亚输入样本中检测出;2种混合型为CVMNK/CVIET和CVMNK/SVMNT,前者在非洲和东南亚输入样本中分布,后者仅在东南亚缅甸来源样本中检出。自非洲输入的样本野生型较多,占77.7%(478/615);而自东南亚和巴布亚新几内亚输入的样本中,抗性分子标记样本占68.0%(17/25),两者差异有统计学意义(χ^2=28.5,P<0.05)。非洲不同地区来源样本中,抗性基因比例和野生型构成差异有统计学意义(P<0.01),西非野生型所占比例最低。结论2012年和2018年我国674例输入性恶性疟病例样本中,自东南亚输入的恶性疟原虫Pfcrt基因第72~76位点抗性基因比例和分子多态性均较非洲来源样本高。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 输入性疟疾 氯喹抗性转运蛋白 基因多态性
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