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PC Linux集群系统量子化学从头计算性能研究
被引量:
4
1
作者
何禹
王一波
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期587-592,共6页
个人计算机性能的提高与Linux操作系统的发展使基于PC的Linux集群系统成为量子化学高性能计算的平台。本文研究了Gaussian 98程序在Pentium Ⅲ与Pentium 4计算机建立的两组小型集群系统中的运算性能。通过设计的5个计算样例,对Hartree-F...
个人计算机性能的提高与Linux操作系统的发展使基于PC的Linux集群系统成为量子化学高性能计算的平台。本文研究了Gaussian 98程序在Pentium Ⅲ与Pentium 4计算机建立的两组小型集群系统中的运算性能。通过设计的5个计算样例,对Hartree-Fork、DFT、MP2级别的单点能量计算、几何结构优化、频率和NMR等化学性质计算在16个并行节点内的速度增长性与扩展性进行了分析和讨论,指出了主节点计算能力对整个集群系统效益的影响,结果表明各类计算作业在8-12节点内有着较好加速性,频率与MP2作业超过12节点后并行效益迅速下降,NMR计算在16节点时仍有较高速度增长性。
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关键词
pclinux
集群系统
量子化学
从头计算
性能
计算化学
化学结构
并行结构
原文传递
题名
PC Linux集群系统量子化学从头计算性能研究
被引量:
4
1
作者
何禹
王一波
机构
贵州大学化学系贵州省高性能计算化学重点实验室
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期587-592,共6页
基金
国家自然科学基金(29763001)
贵州省自然科学基金(20033007)
文摘
个人计算机性能的提高与Linux操作系统的发展使基于PC的Linux集群系统成为量子化学高性能计算的平台。本文研究了Gaussian 98程序在Pentium Ⅲ与Pentium 4计算机建立的两组小型集群系统中的运算性能。通过设计的5个计算样例,对Hartree-Fork、DFT、MP2级别的单点能量计算、几何结构优化、频率和NMR等化学性质计算在16个并行节点内的速度增长性与扩展性进行了分析和讨论,指出了主节点计算能力对整个集群系统效益的影响,结果表明各类计算作业在8-12节点内有着较好加速性,频率与MP2作业超过12节点后并行效益迅速下降,NMR计算在16节点时仍有较高速度增长性。
关键词
pclinux
集群系统
量子化学
从头计算
性能
计算化学
化学结构
并行结构
Keywords
computational chemistry, cluster, Gaussian98 , Linux
分类号
O641.121 [理学—物理化学]
O6-04 [理学—化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PC Linux集群系统量子化学从头计算性能研究
何禹
王一波
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2003
4
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