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基于细胞焦亡PCR芯片分析负重跑训练对增龄大鼠骨骼肌丢失的影响 被引量:2
1
作者 付鹏宇 杨璐瑶 +2 位作者 唐舒宁 苏浩 龚丽景 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期208-216,共9页
目的 采用PCR芯片研究细胞焦亡在32周负重跑训练对增龄大鼠趾长伸肌(EDL)丢失进程中的作用。方法 90只SD大鼠分为3组:对照组(C0组,n=10)、增龄不运动组(C组,n=40)和增龄负重跑组(R组,n=40)(着负重袋的跑台训练),C组和R组分别干预8、16... 目的 采用PCR芯片研究细胞焦亡在32周负重跑训练对增龄大鼠趾长伸肌(EDL)丢失进程中的作用。方法 90只SD大鼠分为3组:对照组(C0组,n=10)、增龄不运动组(C组,n=40)和增龄负重跑组(R组,n=40)(着负重袋的跑台训练),C组和R组分别干预8、16、24和32周后取材,即分为C8组、C16组、C24组、C32组、R8组、R16组、R24组和R32组(n=10)。干预后测量大鼠体重和肌肉总量;取EDL称量湿重,HE染色观察肌纤维形态,测试横截面积(FCSA);Western Blot测试细胞焦亡关键蛋白NF-κB、ASC、GSDMD和Caspase1的表达;PCR芯片筛选EDL中的细胞焦亡差异表达基因,qPCR验证芯片结果准确性。结果 (1)C组大鼠体重持续增加,R组大鼠体重相对平稳;C32组肌肉总量及其百分比显著低于C0组;R8组、R24组和R32组肌肉总量百分比显著高于其相应的C组(P<0.05)。(2)R24组和R32组EDL湿重和FCSA分别显著高于C24组和C32组;C组各组FCSA均低于C0组(P<0.05)。(3)C16组和C24组NF-κB、GSDMD,R16组ASC,C8组、C16组、C24组和R8组Caspase1蛋白含量显著高于C0组(P<0.05);R16组和R24组NF-κB、R16组的ASC和GSDMD以及R各组Caspase1蛋白含量分别低于其对应的C组(P<0.05)。(4)R组随训练时间的延长,细胞焦亡基因表达逐渐减少。对R16/C16和R32/C32组下调的差异基因Naip6和焦亡关键基因Casp1进行qPCR验证,与芯片结果一致。结论 32周负重跑训练可通过抑制骨骼肌细胞焦亡水平而缓解增龄大鼠肌肉丢失进程。 展开更多
关键词 增龄 骨骼肌 负重跑 细胞焦亡 pcr芯片 大鼠
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PCR芯片及其应用研究进展 被引量:3
2
作者 徐一冉 程肖蕊 +1 位作者 周文霞 张永祥 《生物技术通讯》 CAS 2012年第6期904-908,共5页
PCR芯片实质上就是固定有与研究对象有关的许多已知基因的引物阵列并可用于PCR检测的固相载体,其制作时最关键的是目的基因的引物设计。与基于杂交的芯片技术不同,PCR芯片技术是一种高通量的,准确、灵敏的定量检测基因表达的技术,它将... PCR芯片实质上就是固定有与研究对象有关的许多已知基因的引物阵列并可用于PCR检测的固相载体,其制作时最关键的是目的基因的引物设计。与基于杂交的芯片技术不同,PCR芯片技术是一种高通量的,准确、灵敏的定量检测基因表达的技术,它将待测基因的引物固定于固相载体上,通过简单的、经过优化的定量PCR体系和荧光定量PCR仪,实现待检样品中已知基因的扩增,用于定量检测待检样品中已知基因的表达情况。PCR芯片由于其操作简单、结果准确、数据产出快而多等特点,已应用于疾病发病机制、药物作用机理和细菌分型等研究领域,并将在生命科学研究领域得到更为广泛的应用。 展开更多
关键词 基因表达 pcr芯片 pcr芯片实验室
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PCR芯片控温系统研究 被引量:9
3
作者 徐静平 黎沛涛 +1 位作者 甘侠林 钟德刚 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第12期45-47,共3页
通过采用以单片机为核心的数字电路控温技术、PWM技术以及PID控温算法 ,研制出成本低、控温精度高。
关键词 pcr芯片 体外扩增基因 单片机 温度控制系统 数字电路控温技术 PWM技术
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利用功能基因PCR芯片探讨过表达Slit2基因与老年小鼠淀粉样蛋白产生沉积的关系 被引量:4
4
作者 李舸 李航 +5 位作者 刘书华 李韵峰 关雅伦 李雪娇 黄韧 张钰 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期272-279,共8页
目的通过对比老年Tg-Slit2小鼠与AD小鼠Tg-2567淀粉样蛋白产生和清除相关基因表达差异,初步探讨过表达Slit2基因与老年小鼠淀粉样蛋白产生沉积的关系。方法选取14月龄雄性C5BL/6小鼠、TgSlit2小鼠和Tg-2576小鼠作为实验研究对象,利用Aβ... 目的通过对比老年Tg-Slit2小鼠与AD小鼠Tg-2567淀粉样蛋白产生和清除相关基因表达差异,初步探讨过表达Slit2基因与老年小鼠淀粉样蛋白产生沉积的关系。方法选取14月龄雄性C5BL/6小鼠、TgSlit2小鼠和Tg-2576小鼠作为实验研究对象,利用Aβ1-40和Aβ1-42抗体对小鼠脑组织进行免疫组化染色,同时通过脑总RNA提取、RNA质量鉴定、c DNA合成以及PCR芯片检测,获得功能基因表达情况,并对两种转基因小鼠与野生型小鼠AD基因表达进行差异化比较分析。结果 Tg-Slit2小鼠相比与同年龄的Tg-2576小鼠,脑组织中并未发现典型的Aβ沉积表型,脑组织功能基因芯片分析发现,与同年龄的C57BL/6小鼠相比,Tg-Slit2有16个基因显著上调,8个基因显著下调,而Tg-2576小鼠14个基因显著上调,17个基因显著下调。进一步对差异基因分析发现,三种小鼠鼠源的淀粉样蛋白前体基因APP表达无差异,而与Aβ产生相关的Psen2基因在Tg-2576小鼠中显著上调,与Aβ清除相关的LRP6和LRP8则发生显著下调,但这些基因在Tg-Slit2老年小鼠中并未发现显著改变。结论14月龄过表达Slit2小鼠未产生Aβ的沉积,Aβ相关基因也未显示出与Tg2576小鼠相似的改变。 展开更多
关键词 Tg-Slit2小鼠 Tg-2576小鼠 功能基因pcr芯片 Β淀粉样蛋白
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模糊PID控制用于PCR芯片实验室温控系统 被引量:3
5
作者 徐平 余威 +1 位作者 王健桦 姚骏恩 《华东理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期267-270,共4页
介绍了一种采用自校正模糊PID控制算法的PCR芯片实验室温度控制系统。该系统将模糊推理控制与PID控制相结合,利用PCR芯片上溅射的Pt电阻获取温度信号,通过PID精确输出控制在芯片背面直接制备的微加热器和外加的半导体致冷器件,实现了PC... 介绍了一种采用自校正模糊PID控制算法的PCR芯片实验室温度控制系统。该系统将模糊推理控制与PID控制相结合,利用PCR芯片上溅射的Pt电阻获取温度信号,通过PID精确输出控制在芯片背面直接制备的微加热器和外加的半导体致冷器件,实现了PCR芯片的高精度快速变温控制,可用于近场光学显微镜实时探测PCR扩增反应过程中荧光信号的近场分布,为实现高灵敏度DNA定量检测提供了必要条件。 展开更多
关键词 pcr芯片 自校正模糊控制 PID控制 近场光学显微镜
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微腔型PCR芯片的多体系集总热容法分析 被引量:3
6
作者 王玮 李志信 过增元 《工程热物理学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第2期308-310,共3页
本文采用多体系集总热容法分析了微腔型PCR芯片的热循环过程,研究了芯片的温度变化规律,并提出了芯片功耗的预测方法。数值模拟表明,多体系集总热容法可以被用来估计微腔型PCR芯片的温度变化,并能够准确地预测芯片所需功耗。
关键词 多体系集总热容法 微腔型pcr芯片 温度变化 功耗 热循环
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连续流动式PCR芯片相关技术研究进展 被引量:7
7
作者 章春笋 徐进良 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期114-118,123,共6页
微电子机械系统 (microeletromechanicalsystem,MEMS)技术的兴起及其在生物化学领域的广泛应用 ,推动了聚合酶链式反应 (polymerasechainreaction,PCR)热循环装置越来越微型化 ,各种PCR微芯片/装置被开发。本文主要介绍了基于MEMS技术... 微电子机械系统 (microeletromechanicalsystem,MEMS)技术的兴起及其在生物化学领域的广泛应用 ,推动了聚合酶链式反应 (polymerasechainreaction,PCR)热循环装置越来越微型化 ,各种PCR微芯片/装置被开发。本文主要介绍了基于MEMS技术的连续流动式PCR(continuous_flowPCR)芯片/微装置的相关技术 ,包括基底材料的选择、通道表面钝化技术、微细加工技术、封接技术以及系统检测技术等 。 展开更多
关键词 连续流动式pcr芯片技术 微电子机械系统技术 基底材料选择 表面钝化 微细加工 封接技术
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自然对流型PCR芯片的热分析与设计 被引量:2
8
作者 薛辉 王玮 +1 位作者 李志信 过增元 《工程热物理学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第z1期140-142,共3页
在分析了现有自然对流型PCR芯片的热性能的基础上,提出了采用薄圆盘腔体内Rayleigh-Benard对流实现PCR过程,并通过数值模拟研究了几何尺寸对自然对流稳定性的影响以及腔体内不同位置处流体温度随时间的变化。模拟结果表明通过几何尺寸... 在分析了现有自然对流型PCR芯片的热性能的基础上,提出了采用薄圆盘腔体内Rayleigh-Benard对流实现PCR过程,并通过数值模拟研究了几何尺寸对自然对流稳定性的影响以及腔体内不同位置处流体温度随时间的变化。模拟结果表明通过几何尺寸的优化能够实现稳定的Rayleigh-Benard对流和PCR过程。 展开更多
关键词 pcr芯片 自然对流 瑞利数
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基于亚像素边缘检测的PCR芯片参数测量系统 被引量:1
9
作者 刘勇 王卫华 +4 位作者 李志刚 张文 夏营威 孙淼 张龙 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2014年第2期65-67,89,共4页
针对PCR芯片几何参数的高精度测量需求,设计了基于亚像素边缘检测的PCR芯片参数测量系统。该系统以机器视觉系统为硬件平台,首先采用LOG算子对采集图像进行像素级初定位,通过Hough变换获得图像边缘方向;然后建立坐标系模型,利用灰度插... 针对PCR芯片几何参数的高精度测量需求,设计了基于亚像素边缘检测的PCR芯片参数测量系统。该系统以机器视觉系统为硬件平台,首先采用LOG算子对采集图像进行像素级初定位,通过Hough变换获得图像边缘方向;然后建立坐标系模型,利用灰度插值法获取新的亚像素边缘点;最后在亚像素边缘方向上进行高斯拟合精确定位。试验结果表明:该系统边缘定位精度高,且具有方向不变性,能够满足PCR芯片的检测要求。 展开更多
关键词 机器视觉 pcr芯片 边缘检测 亚像素 高斯拟合
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集成PCR芯片温控系统的设计 被引量:2
10
作者 何文波 闫卫平 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2005年第7期33-35,共3页
针对自行研制的集成PCR芯片,以AT89C51单片机为核心,利用A/D转换器构成数据采集输入通道,采用修正的PID算法以及事件驱动编程模型,设计出升降温迅速、控温准确的集成PCR芯片温控系统。
关键词 pcr芯片 温控系统 PID算法
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PCR芯片中微腔室高度及加热器结构优化设计 被引量:1
11
作者 廖红华 廖宇 +1 位作者 易金桥 徐建 《湖北民族学院学报(自然科学版)》 CAS 2009年第4期403-407,共5页
对PCR扩增芯片中微加热器的传热及微腔(DNA反应液腔)室的高度优化问题进行了有限元分析,通过ANSYS软件模拟分析了单蛇形、双蛇形以及双螺旋形等典型结构微加热器的温度场分布,分析了不同腔室高度PCR芯片的温度场分布,重点探讨了不同微... 对PCR扩增芯片中微加热器的传热及微腔(DNA反应液腔)室的高度优化问题进行了有限元分析,通过ANSYS软件模拟分析了单蛇形、双蛇形以及双螺旋形等典型结构微加热器的温度场分布,分析了不同腔室高度PCR芯片的温度场分布,重点探讨了不同微加热器结构、不同布线规律对PCR芯片微腔室温度分布均匀性的影响,PCR芯片中DNA反应液厚度与芯片上下表面温差的关系.仿真结果表明:均匀加热器比非均匀加热器温度分布均匀性更好;双螺旋形加热器较单蛇形与双蛇形加热器更能满足实际需要;DNA反应液厚度与芯片上下表面温度差之间具有良好的线性关系.同时根据分析结果得到了所设计的具有电极均匀分布双螺旋微加热器的PCR芯片微腔室最佳高度为340μm,能很好满足片上PCR芯片扩增所需的温度环境条件. 展开更多
关键词 pcr芯片 微加热器 微腔室最佳高度 温度场分布 有限元分析
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PCR芯片和生化微分析系统 被引量:1
12
作者 庄贵生 赵建龙 《微纳电子技术》 CAS 2004年第12期16-21,共6页
介绍了PCR微芯片的最新研究进展,给出了不同结构的PCR芯片设计原理以及特点,介绍由PCR芯片为主要单元的集成微全分析系统的相关研究,同时简要介绍了对PCR的仿真模拟等。
关键词 微电机系统 pcr芯片 微流控 仿真模拟
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微流控PCR芯片研究进展及其在法医DNA检验中的应用 被引量:2
13
作者 董军磊 欧元 +2 位作者 李彩霞 徐建栋 叶健 《生命科学仪器》 2012年第3期45-51,共7页
微流控PCR芯片技术是芯片研究领域的热点,具有较高的基础研究价值和市场价值。本文介绍了微流控PCR芯片技术的概况、研究进展及其在法医DNA检验中的应用。
关键词 法医学DNA分型微流控 pcr芯片
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电极优化的PCR芯片及其扩增实验
14
作者 陈伟 崔峰 +4 位作者 郭兆鑫 陈文元 吴校生 刘武 张卫平 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2016年第8期75-76,80,共3页
对传统的蛇形加热电极结构进行了优化,提升PCR芯片反应的温度分布均匀性。设计了一种电极片可重复使用且和反应腔室片可分离的PCR芯片。利用红外热像测温仪对优化前后的电极片进行了温度场分布测量,结果表明优化后的加热电极在反应腔室... 对传统的蛇形加热电极结构进行了优化,提升PCR芯片反应的温度分布均匀性。设计了一种电极片可重复使用且和反应腔室片可分离的PCR芯片。利用红外热像测温仪对优化前后的电极片进行了温度场分布测量,结果表明优化后的加热电极在反应腔室范围内的温度均匀性小于1℃。与大型PCR仪的扩增实验结果对比表明,该PCR芯片实现了239 bp的DNA片段的高效扩增。 展开更多
关键词 MEMS pcr芯片 PDMS 温度场 扩增
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实时定量RT-PCR芯片技术筛选乳腺癌术后复发相关基因
15
作者 唐金海 吴建中 +2 位作者 冯继锋 李苏平 赵建华 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2009年第6期327-332,336,共7页
目的筛选并建立与乳腺癌术后复发转移相关的基因表达谱,初步探讨其与疾病发展的关系。方法 81例乳腺癌患者入选,其中41例术后5年随访期内出现复发者为研究组,40例未复发仍存活者为对照组。提取所有病例石蜡包埋组织RNA,质量鉴定后,应用... 目的筛选并建立与乳腺癌术后复发转移相关的基因表达谱,初步探讨其与疾病发展的关系。方法 81例乳腺癌患者入选,其中41例术后5年随访期内出现复发者为研究组,40例未复发仍存活者为对照组。提取所有病例石蜡包埋组织RNA,质量鉴定后,应用实时定量RT-PCR芯片技术平行检测84个已知的与乳腺癌转移特性相关的基因以及5个管家基因和7个质控对照,分析两组间差异表达基因。结果研究组与对照组相比较,12个基因表达有差异,其中9个基因表达上调,3个基因表达下调(P<0.05)。表达异常的基因与细胞周期调控,细胞内激素信号传导,细胞增殖、分化和凋亡以及细胞迁移和粘附等功能相关。结论 RT-PCR芯片技术能快速、准确地提供肿瘤相关特性基因表达谱的信息;乳腺癌术后复发相关基因差异表达分析可为预防和控制该病的复发提供新线索。 展开更多
关键词 乳腺癌 复发转移 差异表达基因 RT—pcr芯片技术
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微腔型PCR芯片用于法医DNA分析的初步研究
16
作者 董军磊 欧元 +5 位作者 李彩霞 秦奎伟 刘琳 姜伯伟 赵兴春 叶健 《刑事技术》 2013年第5期22-24,共3页
目的为了克服传统PCR热循环仪体积大,运行电压高,耗时长,只能在实验室中应用的缺点,研究了一种微腔型PCR芯片,以期实现现场对STR片段的复合扩增。方法采用在PCR反应缓冲液中加入不同浓度的BSA溶液对芯片进行表面优化处理的方法及不同酶... 目的为了克服传统PCR热循环仪体积大,运行电压高,耗时长,只能在实验室中应用的缺点,研究了一种微腔型PCR芯片,以期实现现场对STR片段的复合扩增。方法采用在PCR反应缓冲液中加入不同浓度的BSA溶液对芯片进行表面优化处理的方法及不同酶量优化实现对STR片段的有效扩增。结果使用浓度为0.5mg/mL的BSA可得到清晰完整的STR分型结果;加大酶量有益于扩增效率的提高。结论该种微腔型PCR芯片经初步优化后可有效地对STR片段进行复合扩增,经进一步优化可真正实现法医DNA分析的更加微量化和快速化。 展开更多
关键词 法医遗传学 pcr芯片 DNA分析
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一种高分子聚合物PCR芯片的设计及有限元分析
17
作者 牛志强 贾晓宇 +2 位作者 张卫平 李建华 陈文元 《微细加工技术》 2004年第3期76-80,共5页
设计了一种以PDMS为基底的微型PCR芯片,并用有限元软件对芯片做了详细的温度场分析,主要分析了微型PCR芯片温度场的均匀性和分布以及芯片升、降温的效率。分析结果表明设计的聚合物芯片温度分布均匀,有较高的升、降温速率,可以满足PCR... 设计了一种以PDMS为基底的微型PCR芯片,并用有限元软件对芯片做了详细的温度场分析,主要分析了微型PCR芯片温度场的均匀性和分布以及芯片升、降温的效率。分析结果表明设计的聚合物芯片温度分布均匀,有较高的升、降温速率,可以满足PCR反应的要求。通过一维热传导理论分析,得到的结论与有限元分析的结果是一致的。 展开更多
关键词 pcr芯片 PDMS 有限元 模拟
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快速建立PCR芯片恒温场的设计
18
作者 罗伟栋 《仪表技术与传感器》 CSCD 北大核心 2005年第10期32-34,共3页
通过对PCR芯片工作所需的恒温场进行分析研究,使用半导体致冷片为温度控制部件,设计了一种新型的主动式恒温控制系统。温控系统通过改变半导体致冷片工作电流的极性来瞬时切换系统的升、降温状态,通过改变其工作电压来精确调整系统的工... 通过对PCR芯片工作所需的恒温场进行分析研究,使用半导体致冷片为温度控制部件,设计了一种新型的主动式恒温控制系统。温控系统通过改变半导体致冷片工作电流的极性来瞬时切换系统的升、降温状态,通过改变其工作电压来精确调整系统的工作温度,同时利用半导体致冷片的面加热特性,能够快速建立所需的恒温场,且恒温特性好。与其它PCR芯片温控系统相比,由于系统采用了主动式致冷措施,系统的降温速度很快,约为-17℃/s,较大地缩短了降温过程,改善PCR扩增质量。 展开更多
关键词 pcr芯片 恒温控制 半导体
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基于LabVIEW的PCR芯片温度控制系统 被引量:2
19
作者 李金凤 张卫平 +3 位作者 伍择希 陈俊杰 陈文元 吴校生 《传感器与微系统》 CSCD 北大核心 2012年第6期122-124,127,共4页
针对实验室自主研制的胃癌检测PCR芯片,以LabVIEW作为处理核心,以Pt作为加热丝和温度传感器,设计出PCR芯片温度控制系统。介绍了温控系统的硬件、软件和实验调试。系统采用恒流源流经Pt电阻器。当温度变化时,Pt阻值变化,从而电阻器上的... 针对实验室自主研制的胃癌检测PCR芯片,以LabVIEW作为处理核心,以Pt作为加热丝和温度传感器,设计出PCR芯片温度控制系统。介绍了温控系统的硬件、软件和实验调试。系统采用恒流源流经Pt电阻器。当温度变化时,Pt阻值变化,从而电阻器上的电压变化,检测读数,与设定温度比对,采用BANG—BANG与PID控制相结合和预设积分器,实现控温。与其他PCR温控系统相比,该系统升温迅速为1 s,波动范围为±0.5℃。 展开更多
关键词 pcr芯片 LABVIEW PID算法 BANG—BANG控制 恒流源 线性拟合 温度采集
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基于PID技术的PCR芯片温度控制系统硬件设计 被引量:3
20
作者 施兴慧 闫卫平 马灵芝 《仪器仪表学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第z3期1836-1837,共2页
本文利用集成芯片上的金属薄膜加热器和温度传感器,设计了以单片机和PC机为智能控制核心,以PWM技术以及PID控温算法为依托的连续流动式PCR芯片控温系统。
关键词 pcr芯片 单片机 PID算法
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