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PTBP1通过调控FGFR2的可变剪接促进肝癌的发展
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作者 陈昱颖 张倩 +3 位作者 桂梦会 冯岚 曹鹏博 周钢桥 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期46-62,共17页
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是原发性肝癌的主要类型,是一种早期无明显症状、易发生转移、存活率低的恶性肿瘤。多聚嘧啶区结合蛋白1 (polypyrimidine tract binding protein 1,PTBP1)是一种重要的RNA结合蛋白,可诱导促癌... 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是原发性肝癌的主要类型,是一种早期无明显症状、易发生转移、存活率低的恶性肿瘤。多聚嘧啶区结合蛋白1 (polypyrimidine tract binding protein 1,PTBP1)是一种重要的RNA结合蛋白,可诱导促癌剪接事件的发生。虽然PTBP1在肝癌细胞中的促癌功能已被证实,但是其介导的促癌可变剪接事件及作用机制尚未得到完全解析。本文利用免疫共沉淀联合质谱分析发现与PTBP1结合的蛋白复合体显著富集于编码成纤维细胞生长因子受体2(fibroblast growth factor receptor 2,FGFR2)的基因可变剪接调控过程。通过RNA免疫共沉淀和定量PCR实验,证实PTBP1可显著下调肝癌细胞中FGFR2-IIIb异构体的水平,上调FGFR2-IIIc异构体的水平,促进FGFR2-IIIb向FGFR2-IIIc的异构体转换。随后,通过CCK-8、transwell和平板克隆实验,在肝癌细胞系HepG2和Huh7中评价了FGFR2-IIIb和FGFR2-IIIc的肿瘤生物学功能。结果显示FGFR2-IIIb发挥抑癌功能,而FGFR2-IIIc发挥促癌功能。机制研究证实,FGFR2-IIIb向FGFR2-IIIc异构体的转换显著促进肝癌细胞的上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymaltransformation,EMT)及FGFR下游ERK和AKT信号通路的活化。本研究揭示了PTBP1促进肝癌进展的分子调控机制,为肝癌的防治提供了新的理论依据。 展开更多
关键词 肝细胞癌 ptbp1 可变剪接 FGFR2 上皮-间充质转化
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环状RNA Circ_0000291/miR-326/PTBP1轴影响肝细胞癌进展
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作者 庞敏 邓芳 李珊珊 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1210-1216,共7页
目的:探讨Circ_0000291作为miR-326的分子海绵调控多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖、凋亡和免疫逃逸的影响。方法:qRT-PCR检测Circ_0000291、miR-326、PTBP1在组织标本和细胞中的表达。双荧光素酶报告实验检测Circ_0... 目的:探讨Circ_0000291作为miR-326的分子海绵调控多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖、凋亡和免疫逃逸的影响。方法:qRT-PCR检测Circ_0000291、miR-326、PTBP1在组织标本和细胞中的表达。双荧光素酶报告实验检测Circ_0000291和miR-326以及miR-326和PTBP1的靶向调控关系。CCK-8、Transwell、流式细胞术和ELISA分别检测细胞的增殖、侵袭、凋亡以及免疫调控相关因子TNF-α、IFN-γ的表达。结果:相对于正常组织和肝细胞,Circ_0000291和PTBP1在HCC组织标本和细胞中表达升高,而miR-326表达水平显著降低(均P<0.05)。下调Circ_0000291可以抑制细胞的增殖、侵袭和免疫逃逸,诱导细胞凋亡(均P<0.05),转染miR-326后观察到与下调Circ_0000291类似的结果,但是上调Circ_0000291可以部分拮抗miR-326对细胞的作用(均P<0.05)。在HCC中,Circ_0000291作为分子海绵调控miR-326表达,促进PTBP1表达。结论:Circ_0000291可以吸附miR-326从而上调PTBP1,促进HCC细胞的增殖、侵袭和免疫逃逸,抑制凋亡,从而促进HCC的发展。 展开更多
关键词 Circ_0000291 miR-326 ptbp1 肝细胞癌 增殖 凋亡 免疫逃逸
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剪接因子PTBP1在消化道肿瘤中作用的研究进展
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作者 周雅静 李东宝 周进 《中国临床新医学》 2024年第8期941-945,共5页
RNA剪接失调是肿瘤重要的分子病理特征之一,与剪接因子异常表达密切相关。多聚嘧啶串结合蛋白1(PTBP1)是剪接因子不均一核糖核蛋白家族成员之一,可通过调控增殖、迁移、侵袭、自噬、凋亡、免疫监视及代谢重编程等环节参与多种肿瘤的发... RNA剪接失调是肿瘤重要的分子病理特征之一,与剪接因子异常表达密切相关。多聚嘧啶串结合蛋白1(PTBP1)是剪接因子不均一核糖核蛋白家族成员之一,可通过调控增殖、迁移、侵袭、自噬、凋亡、免疫监视及代谢重编程等环节参与多种肿瘤的发生与发展,是消化道肿瘤的潜在临床应用靶点。PTBP1作为关键的剪接因子调节靶基因前体mRNA的剪接及mRNA稳定性等,其调控可变剪接的新型分子机制在消化道肿瘤中也得到了进一步阐述。该文对剪接因子PTBP1在消化道肿瘤中作用的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 剪接因子 多聚嘧啶串结合蛋白1 消化道肿瘤 免疫 靶向药物
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PTBP1通过PTEN/Akt通路调节结肠癌细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移
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作者 孙龙军 李盟森 荆威 《中国现代普通外科进展》 CAS 2023年第11期841-846,共6页
目的:探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)通过蛋白激酶B(Akt)/磷酸酶与张力蛋白同源物(PTEN)通路调节结肠癌(CRC)细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移的影响。方法:将SW620细胞分为SW620组、si-NC组、si-PTBP1组、bpV(PTEN抑制剂)组、si-PTBP1+bpV... 目的:探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)通过蛋白激酶B(Akt)/磷酸酶与张力蛋白同源物(PTEN)通路调节结肠癌(CRC)细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移的影响。方法:将SW620细胞分为SW620组、si-NC组、si-PTBP1组、bpV(PTEN抑制剂)组、si-PTBP1+bpV组;检测SW620细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭情况及PTBP1、PTEN/Akt通路蛋白、凋亡蛋白、自噬蛋白表达;检测正常的结肠上皮细胞(FHC)以及SW620、SW480、HT29细胞PTBP1、PIK3、Akt、PTEN蛋白水平。结果:与FHC细胞相比,SW620、SW480、HT29细胞PTBP1、p-PI3K/PIK3、p-Akt/Akt蛋白水平显著上调,PTEN蛋白显著下调;与SW620组、si-NC组相比,si-PTBP1组PTBP1、p-PI3K/PIK3、p-Akt/Akt、Bcl-2蛋白水平、48 h吸光度值、细胞迁移和侵袭数量显著降低(P<0.05),细胞凋亡率、Bax、cleaved-Caspase-3、Beclin1、LC3-II/I、PTEN蛋白水平显著升高(P<0.05),而bpV组与si-PTBP1组趋势相反,bpV可消除沉默PTBP1的有利影响。结论:沉默PTBP1可能通过调控PTEN/Akt通路,抑制SW620细胞增殖、侵袭和迁移,促进细胞凋亡、自噬。 展开更多
关键词 ptbp1 磷酸酶与张力蛋白同源/蛋白激酶B通路 结肠肿瘤 增殖 凋亡 侵袭 迁移
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KHSRP,NOVA1,PTBP1在宫颈癌中的作用和预后关系
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作者 陶玲 努尔孜燕·力提甫 董志红 《实用妇科内分泌电子杂志》 2020年第4期77-77,100,共2页
目的探讨KHSRP,NOVA1,PTBP1在宫颈癌组织中的表达及其与预后的关系。方法应用医学实验统计分析法,在我院资料库中选取2019年1月-2020年1月收治的156例早期宫颈癌患者为研究对象,依照研究需要,分为实验组(早期宫颈癌组,n=78例)和参照组(... 目的探讨KHSRP,NOVA1,PTBP1在宫颈癌组织中的表达及其与预后的关系。方法应用医学实验统计分析法,在我院资料库中选取2019年1月-2020年1月收治的156例早期宫颈癌患者为研究对象,依照研究需要,分为实验组(早期宫颈癌组,n=78例)和参照组(进展期宫颈癌组,n=78例),分别实施一般检测和基因分子生物学检测(KHSRP,NOVA1,PTBP1),临床对两组的组织表达情况及其预后结果进行分析。结果实验组的组织表达情况符合率94.87%(74/78)显著高于参照组的64.10%(50/78),有统计学意义(P<0.05)。实验组在组织表达情况结果一致率、敏感度、特异性、阳性预测值上数值对均优于参照组,数值对比分别为(67.12±0.36)和(81.12±0.51)、(53.42±0.51)和(70.37±0.12)、(75.26±0.31)和(82.01±0.47)、(65.41±0.23)和(81.12±0.19),有统计学意义(P<0.05)。参照组和实验组在KHSRP,NOVA1,PTBP1中数值对比分别为(24.35±0.62)和(9.43±0.87)、(9.10±0.71)和(2.00±0.19)、(89.51±5.62)和(31.60±2.13),有统计学意义(P<0.05)。结论早期宫颈癌中的KHSRP,NOVA1,PTBP1在宫颈癌组织表达中的情况不高,但后续随着患者疾病的进一步恶化和进展,提示患者预后较差的关联性极大,临床将三项检测作为有效依据,可为患者疾病诊断和预后提供可行性借鉴,值得临床大力推广实施。 展开更多
关键词 KHSRP NOVA1 ptbp1 宫颈癌 作用 预后
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PTBP1与肿瘤发展和治疗关系的研究进展 被引量:3
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作者 辛彤 孙悦 胡晶 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2022年第7期715-720,共6页
多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1,也被称为hnRNP I)是一种研究广泛的RNA结合蛋白,参与调控mRNA剪接、翻译、稳定性和定位。PTBP1可参与多种非编码RNA的作用过程,影响肿瘤的发生与发展。在肿瘤治疗方面,PTBP1可能作为关键因子影响靶向药物作... 多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1,也被称为hnRNP I)是一种研究广泛的RNA结合蛋白,参与调控mRNA剪接、翻译、稳定性和定位。PTBP1可参与多种非编码RNA的作用过程,影响肿瘤的发生与发展。在肿瘤治疗方面,PTBP1可能作为关键因子影响靶向药物作用靶点以及肿瘤耐药性。本文就PTBP1在肿瘤中的作用及其在肿瘤治疗中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 ptbp1 分子机制 非编码RNA 耐药
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PTBP1介导长链非编码RNA RP11-879F14.2发挥抑制心肌纤维化的作用 被引量:2
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作者 杨莹 郭晶 +5 位作者 温艺红 黄宇晴 易芷瑶 朱杰宁 方咸宏 单志新 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期33-41,共9页
【目的】研究长链非编码RNA(lncRNA)RP11-879F14.2调控心肌成纤维细胞纤维化表型的作用及机制。【方法】对心衰患者及健康对照者心肌组织进行Masson染色检测心肌胶原水平。lncRNA表达谱芯片检测心衰患者及健康对照者心肌中lncRNAs的表... 【目的】研究长链非编码RNA(lncRNA)RP11-879F14.2调控心肌成纤维细胞纤维化表型的作用及机制。【方法】对心衰患者及健康对照者心肌组织进行Masson染色检测心肌胶原水平。lncRNA表达谱芯片检测心衰患者及健康对照者心肌中lncRNAs的表达变化,实时定量荧光PCR(RT-qPCR)验证RP11-879F14.2在心衰患者心肌中的表达。利用重组RP11-879F14.2腺病毒(rAd-RP11-879F14.2)感染人心房肌成纤维细胞(HAFs),检测纤维化相关基因Col1a1,Col3a1和Acta2表达。RT-qPCR检测HAFs的核/质组分中RP11-879F14.2的水平。基于生物信息学预测和双荧光素酶报告基因实验鉴定RP11-879F14.2与多聚嘧啶区结合蛋白(PTBP1)的结合作用。检测敲低HAFs中PTBP1表达对RP11-879F14.2调控心肌纤维化相关基因表达的影响。【结果】Masson染色结果显示,心衰病人心肌组织发生明显纤维化。RT-qPCR结果证实RP11-879F14.2在心衰患者心肌组织中表达增加(P<0.01)。过表达RP11-879F14.2可在RNA及蛋白水平显著抑制心肌纤维化相关基因表达。核质分离及RT-qPCR检测结果证实RP11-879F14.2主要分布于细胞核中。RP11-879F14.2可与PTBP1结合,并促进HAFs中PTBP1表达,而敲低PTBP1可逆转RP11-879F14.2抑制HAFs中纤维化相关基因表达的作用。【结论】PTBP1可介导RP11-879F14.2发挥抑制心肌纤维化的作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA lncRNA RP11-879F14.2 ptbp1 心肌纤维化 心肌成纤维细胞
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PTBP1在胶质瘤进展中的作用研究
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作者 王克朕 兰春根 +1 位作者 谷峰 马勇杰 《天津医科大学学报》 2021年第6期580-585,共6页
目的:探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)在胶质瘤进展中的作用。方法:利用多个数据库分析PTBP1在胶质瘤组织和正常脑组织中的表达水平及其与胶质瘤的组织学级别和患者预后的关系。构建稳定敲低PTBP1的LN229细胞系,通过Western印迹和RT-qPC... 目的:探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)在胶质瘤进展中的作用。方法:利用多个数据库分析PTBP1在胶质瘤组织和正常脑组织中的表达水平及其与胶质瘤的组织学级别和患者预后的关系。构建稳定敲低PTBP1的LN229细胞系,通过Western印迹和RT-qPCR技术验证细胞中PTBP1的敲低效率。通过EdU实验检测细胞的增殖能力。利用Transwell实验检测细胞的迁移和侵袭能力。结果:PTBP1在胶质瘤组织中较正常脑组织表达更高(P<0.0001),其表达水平随组织学级别的升高而升高(P<0.0001);PTBP1高表达的胶质瘤患者总生存期(OS)明显缩短(P<0.0001);稳定敲低PTBP1的LN229细胞系,细胞的增殖速度变慢(t=3.579,P=0.0373),迁移(t=13.16,P<0.0001)和侵袭能力(t=3.111,P=0.0358)显著下降。结论:PTBP1在胶质瘤中高表达且与胶质瘤的组织学级别和患者不良预后呈正相关;PTBP1促进胶质瘤细胞的增殖、迁移、侵袭。 展开更多
关键词 胶质瘤 ptbp1 增殖 迁移 侵袭
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PTBP1结合CDC5L对胃癌细胞增殖活动的影响 被引量:3
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作者 郭应伟 刘通 《解剖学研究》 CAS 2022年第5期429-436,共8页
目的为探索胃癌细胞增殖的分子机制,研究多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)和细胞分裂周期5样(裂殖酵母)(CDC5L)基因结合促进胃癌细胞增殖凋亡的影响。方法GEPIA2数据库预测PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中的表达;RT⁃qPCR和Western blot检测PTBP1和C... 目的为探索胃癌细胞增殖的分子机制,研究多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)和细胞分裂周期5样(裂殖酵母)(CDC5L)基因结合促进胃癌细胞增殖凋亡的影响。方法GEPIA2数据库预测PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中的表达;RT⁃qPCR和Western blot检测PTBP1和CDC5L的表达水平;GEPIA2数据库预测CDC5L和PTBP1之间的相关性,并通过免疫蛋白沉淀实验检测验证。通过转染,干扰PTBP1和CDC5L的表达。随后,克隆实验检测细胞增殖;流式细胞术检测细胞周期;TUNEL荧光染色检测细胞凋亡;Western blot检测凋亡蛋白Bax、Bcl⁃2和caspase3的表达。结果GEPIA2数据库预测所示PTBP1和CDC5L在胃癌中表达差异有统计学意义(P<0.05),且高表达。与癌旁组织中蛋白表达相比,PTBP1和CDC5L在胃癌组织中表达提高(P<0.01);比正常细胞中蛋白表达相比,PTBP1和CDC5L在胃癌细胞中表达均上调(P<0.01);GEPIA2数据库显示PTBP1与CDC5L具有正向线性相关性;免疫沉淀实验结果表明PTBP1和CDC5L可相互结合。细胞克隆实验表明PTBP1和(或)CDC5L被抑制后,胃癌细胞增殖水平下降(P<0.05);且敲低PTBP1和/或CDC5L后胃癌细胞周期G0/G1期受阻滞(P<0.001)。细胞凋亡水平检测显示,与对照组相比,干扰PTBP1和/或CDC5L后,胃癌细胞凋亡增多(P<0.01);相关凋亡蛋白差异具有统计学变化(Bcl⁃2,P<0.05;Bac,P<0.01;cleaved⁃caspase3/caspase3,P<0.05)。结论PTBP1和CDC5L具有结合关系,敲低PTBP1和CDC5L的表达具有抑制胃癌细胞增殖,促进细胞凋亡作用。 展开更多
关键词 胃癌细胞 多聚嘧啶区结合蛋白1 细胞分裂周期5样(裂殖酵母)基因 增殖 凋亡
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miR-330-5p靶向PTBP1调控结肠癌凋亡的机制 被引量:1
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作者 王磊 林明刚 +2 位作者 王荣荣 张宏岩 陈洁 《生物技术》 CAS 2023年第3期341-347,共7页
[目的]探讨miR-330-5p/PTBP1/CTTN轴调控结肠癌细胞凋亡的潜在机制。[方法]纳入接受根治性结肠切除术的结肠癌患者113例,分析miR-330-5p在结肠癌组织和癌旁组织中的表达水平以及其对总生存率的影响。[结果]miR-330-5p在结肠癌组织中的... [目的]探讨miR-330-5p/PTBP1/CTTN轴调控结肠癌细胞凋亡的潜在机制。[方法]纳入接受根治性结肠切除术的结肠癌患者113例,分析miR-330-5p在结肠癌组织和癌旁组织中的表达水平以及其对总生存率的影响。[结果]miR-330-5p在结肠癌组织中的表达水平较低(0.48±0.22 vs 0.16±0.09,P<0.05)。miR-330-5p高表达的结肠癌患者具有更高的总生存率。过表达miR-330-5p及敲低PTBP1,HCT116细胞的凋亡水平上升(13.02±2.11 vs 68.41±11.08, 12.84±2.16 vs 59.12±10.53,P<0.05)。过表达miR-330-5p后,HCT116细胞中PTBP1的mRNA水平和蛋白水平均下降(0.39±0.04 vs 0.05±0.01,P<0.05)。敲低CTTN后,HCTT6细胞的凋亡水平显著上升(11.70±2.05 vs 55.73±10.19,P<0.05)。过表达miR-330-5p或PTBP1敲低后,CTTN isoform a的表达水平下降。[结论]miR-330-5p能够靶向降解PTBP1 mRNA,减少PTBP1的表达水平,促进结肠癌细胞凋亡。miR-330-5p/PTBP1轴能够调控CTTN外显子的选择性剪接,抑制CTTN isoform a的表达水平并促进结肠癌细胞凋亡。 展开更多
关键词 miR-330-5p ptbp1 CTTN 结肠癌 细胞凋亡 选择性剪接
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Dual-targeting AAV9P1-mediated neuronal reprogramming in a mouse model of traumatic brain injury 被引量:1
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作者 Jingzhou Liu Xin Xin +8 位作者 Jiejie Sun Yueyue Fan Xun Zhou Wei Gong Meiyan Yang Zhiping Li Yuli Wang Yang Yang Chunsheng Gao 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第3期629-635,共7页
Traumatic brain injury results in neuronal loss and glial scar formation.Replenishing neurons and eliminating the consequences of glial scar formation are essential for treating traumatic brain injury.Neuronal reprogr... Traumatic brain injury results in neuronal loss and glial scar formation.Replenishing neurons and eliminating the consequences of glial scar formation are essential for treating traumatic brain injury.Neuronal reprogramming is a promising strategy to convert glial scars to neural tissue.However,previous studies have reported inconsistent results.In this study,an AAV9P1 vector incorporating an astrocyte-targeting P1 peptide and glial fibrillary acidic protein promoter was used to achieve dual-targeting of astrocytes and the glial scar while minimizing off-target effects.The results demonstrate that AAV9P1 provides high selectivity of astrocytes and reactive astrocytes.Moreover,neuronal reprogramming was induced by downregulating the polypyrimidine tract-binding protein 1 gene via systemic administration of AAV9P1 in a mouse model of traumatic brain injury.In summary,this approach provides an improved gene delivery vehicle to study neuronal programming and evidence of its applications for traumatic brain injury. 展开更多
关键词 AAV9P1 ASTROCYTES astrocyte-to-neuron conversion GFAP promoter glial scar induced neurons neuronal reprogramming P1 peptide ptbp1 traumatic brain injury
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circLARP4对宫颈癌细胞中PTBP1/Wnt/β-catenin通路的影响 被引量:1
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作者 张可可 刘智慧 +1 位作者 曾友玲 黄翀 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2021年第24期1874-1881,共8页
目的探讨circLARP4在宫颈癌中的作用及其对PTBP1/Wnt/β-catenin通路的调控作用。方法采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测circLARP4在正常宫颈细胞Ect1/E6E7和宫颈癌细胞(SiHa、HeLa、CaSki、MS751、ME180和C33A)中的表达水平。将... 目的探讨circLARP4在宫颈癌中的作用及其对PTBP1/Wnt/β-catenin通路的调控作用。方法采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)法检测circLARP4在正常宫颈细胞Ect1/E6E7和宫颈癌细胞(SiHa、HeLa、CaSki、MS751、ME180和C33A)中的表达水平。将SiHa细胞随机分成control组、pcDNA-NC组、pcDNA-circLARP4组、pcDNA-circLARP4+pcDNA-NC组以及pcDNA-circLARP4+pcDNA-PTBP1组,通过qRT-PCR检测circLARP4的表达;细胞计数试剂(CCK-8)和克隆形成实验检测细胞增殖能力;划痕实验检测细胞迁移能力;RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)验证circLARP4与PTBP1之间的结合关系;蛋白质印迹法检测蛋白表达。结果相比较正常宫颈细胞Ect1/E6E7(1.00±0.10),circLARP4在宫颈癌细胞SiHa(0.30±0.05)、HeLa(0.50±0.09)、CaSki(0.36±0.09)、MS751(0.50±0.05)、ME180(0.60±0.03)和C33A(0.35±0.07)中低表达,差异有统计学意义,F=32.7,P<0.001。CCK-8实验和克隆形成实验结果显示,pcDNA-circLARP4组(0.82±0.07,217.00±25.00)细胞增殖能力,相较pcDNA-NC组(1.18±0.08,326.00±30.00)和control组(1.23±0.09,315.00±28.00)降低,差异均有统计学意义,F值分别为61.9和14.3,P值分别为<0.001和0.008。划痕实验结果显示,pcDNA-circLARP4组(64.00±8.00)细胞相对迁移率相较pcDNA-NC组(100.00±9.00)降低,t=5.3,P=0.006。蛋白质印迹法结果显示,pcDNA-circLARP4组MMP-2(t=8.3,P<0.001)和MMP-9(t=6.0,P=0.004)表达相较pcDNA-NC组均降低;Snail(F=79.9,P<0.001)、ZEB1(F=79.3,P<0.001)、N-cad(F=14.7,P=0.008)和Vimentin(F=31.4,P=0.003)表达相较pcDNA-NC组和control组均降低,E-cadherin表达升高,F=61.8,P<0.001。RIP实验结果显示,相较IgG抗体(1.00±0.23),circLARP4主要富集在PTBP1(21.37±1.48)抗体上,F=42.0,P<0.001。相较pcDNA-circLARP4+pcDNA-NC组,同时过表达PTBP1后,β-actin(F=17.2,P=0.038)、c-Myc(F=42.5,P<0.001)和Cyclin D1(F=52.7,P<0.001)的表达均升高。结论 circLARP4靶向负调控PTBP1表达,抑制Wnt/β-catenin通路,进而抑制SiHa细胞的增殖、侵袭及迁移。 展开更多
关键词 circLARP4 宫颈癌 ptbp1 上皮间质转化 WNT/Β-CATENIN通路
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Roles of PTBP1 in alternative splicing, glycolysis, and oncogensis 被引量:10
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作者 Wei ZHU Bo-lun ZHOU +9 位作者 Li-juan RONG Li YE Hong-juan XU Yao ZHOU Xue-jun YAN Wei-dong LIU Bin ZHU Lei WANG Xing-jun JIANG Cai-ping REN 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期122-136,共15页
Polypyrimidine tract-binding protein 1(PTBP1)plays an essential role in splicing and is expressed in almost all cell types in humans,unlike the other proteins of the PTBP family.PTBP1 mediates several cellular process... Polypyrimidine tract-binding protein 1(PTBP1)plays an essential role in splicing and is expressed in almost all cell types in humans,unlike the other proteins of the PTBP family.PTBP1 mediates several cellular processes in certain types of cells,including the growth and differentiation of neuronal cells and activation of immune cells.Its function is regulated by various molecules,including micro RNAs(mi RNAs),long non-coding RNAs(lnc RNAs),and RNA-binding proteins.PTBP1 plays roles in various diseases,particularly in some cancers,including colorectal cancer,renal cell cancer,breast cancer,and glioma.In cancers,it acts mainly as a regulator of glycolysis,apoptosis,proliferation,tumorigenesis,invasion,and migration.The role of PTBP1 in cancer has become a popular research topic in recent years,and this research has contributed greatly to the formulation of a useful therapeutic strategy for cancer.In this review,we summarize recent findings related to PTBP1 and discuss how it regulates the development of cancer cells. 展开更多
关键词 Polypyrimidine tract-binding protein 1(ptbp1) Alternative splicing GLYCOLYSIS M2 isoform of pyruvate kinase(PKM2) CANCER
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剪接因子PTBP1生物学功能研究进展 被引量:3
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作者 张倩 曹鹏博 +1 位作者 金倩 周钢桥 《生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第2期184-191,共8页
多聚嘧啶区结合蛋白1 (polypyrimidine tract-binding protein 1, PTBP1)是一种常见的RNA结合蛋白,在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。PTBP1的一个主要功能是作为剪接因子(splicing factor, SF)。它通过结合靶基因前体mRNA的特定序... 多聚嘧啶区结合蛋白1 (polypyrimidine tract-binding protein 1, PTBP1)是一种常见的RNA结合蛋白,在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。PTBP1的一个主要功能是作为剪接因子(splicing factor, SF)。它通过结合靶基因前体mRNA的特定序列,选择性地剪接外显子或内含子从而产生不同的mRNA亚型,进而在细胞分化、细胞周期与凋亡、细胞运动、细胞代谢和免疫响应等多个生物学过程中发挥重要的调控作用。 展开更多
关键词 ptbp1 可变剪接 生物学功能 临床应用
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长链非编码RNA对神经干细胞的调控作用及其机制 被引量:4
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作者 尚进 孙逸贤 +4 位作者 曹秀丽 郭辰峻 张毓飞 韩骅 郑敏化 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期761-765,共5页
长链非编码RNA(LncRNA)作为一种重要的细胞功能调控因子引起越来越多广泛的关注。它是一种长度在200—100000 nt之间的RNA分子,位于细胞核或细胞质内,不编码蛋白质。在基因组转录产物中,lncRNA所占数量比例远远超过编码RNA的比例,与DNA... 长链非编码RNA(LncRNA)作为一种重要的细胞功能调控因子引起越来越多广泛的关注。它是一种长度在200—100000 nt之间的RNA分子,位于细胞核或细胞质内,不编码蛋白质。在基因组转录产物中,lncRNA所占数量比例远远超过编码RNA的比例,与DNA、RNA、蛋白质相互作用参与细胞内多种调控过程,在生命活动调控网络中有极其重要的作用。IncRNA目前是遗传学研究的热点之一。 展开更多
关键词 LncRNA 神经干细胞 TUNA PNKY RMST NOTCH ptbp1
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多聚嘧啶区结合蛋白1通过调控基因的可变剪接促进胆管癌细胞的生长、迁移及侵袭能力 被引量:2
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作者 张静 程敏 +2 位作者 金倩 曹鹏博 周钢桥 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期899-910,共12页
胆管癌是一种起病隐匿、侵袭性强、致死率高的原发性恶性肿瘤。多聚嘧啶区结合蛋白1(polypyrimidine tract-binding protein 1,PTBP1)已被报道,在多种类型肿瘤组织中异常高表达并参与癌症进展,但其在胆管癌中的作用仍未见报道。该研究... 胆管癌是一种起病隐匿、侵袭性强、致死率高的原发性恶性肿瘤。多聚嘧啶区结合蛋白1(polypyrimidine tract-binding protein 1,PTBP1)已被报道,在多种类型肿瘤组织中异常高表达并参与癌症进展,但其在胆管癌中的作用仍未见报道。该研究旨在探讨PTBP1在胆管癌中的生物学功能,并初步解析其分子机制。本文利用公开的癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据,分析了胆管癌及癌旁组织中的PTBP1 mRNA表达水平。结果显示,PTBP1在胆管癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织(P<0.05)。随后,在胆管癌细胞系RBE和HuH28中,通过CCK-8和细胞平板克隆实验,评价了PTBP1对胆管癌细胞生长能力的影响。结果显示,过表达PTBP1可显著促进胆管癌细胞的生长(P<0.01),而敲低PTBP1显著抑制胆管癌细胞的生长(P<0.001)。Transwell和Invasion实验结果显示,过表达PTBP1可显著促进胆管癌细胞的迁移和侵袭(P<0.001),而敲低PTBP1显著抑制胆管癌细胞的迁移和侵袭(P<0.001)。转录物组测序和通路富集分析结果显示,在胆管癌细胞中,敲低PTBP1后上调表达的基因显著富集于p53信号通路;而下调表达的基因显著富集于胆固醇代谢、Rho GTPase和TGF-β等信号通路。基于上述转录物组测序数据,本文还分析发现,敲低PTBP1可导致一系列基因发生异常的mRNA可变剪接事件,例如参与TGF-β调控的TGIF1及与p53活性相关的GNAS基因等。综上所述,PTBP1可能通过调控一系列基因的可变剪接而影响多个癌症相关的信号通路,从而促进胆管癌的进展。 展开更多
关键词 胆管癌 多聚嘧啶区结合蛋白1 转录物组测序 可变剪接 TGIF1 GNAS
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选择性剪接与无义介导的mRNA降解机制研究进展 被引量:3
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作者 陈彬 孙珏 +2 位作者 谢曼丽 赵爱光 陈伟霞 《实用医药杂志》 2017年第11期1039-1043,共5页
mRNA的选择性剪接(alternative splicing,AS)是基因转录后的重要调节机制,也是增加蛋白质种类和数量,使有限的基因表达出更多蛋白质的主要机制。无义介导的m RNA降解(nonsense mediated m RNA decay,NMD)机制是一种存在于细胞内的m RNA... mRNA的选择性剪接(alternative splicing,AS)是基因转录后的重要调节机制,也是增加蛋白质种类和数量,使有限的基因表达出更多蛋白质的主要机制。无义介导的m RNA降解(nonsense mediated m RNA decay,NMD)机制是一种存在于细胞内的m RNA监控机制,能检测并快速降解突变的m RNA。研究表明AS常与NMD机制相偶联,当某种基因表达异常升高时,通过AS产生可以被NMD降解的m RNA剪接异构体而下调该基因的表达,从而使基因表达维持在正常范围。AS和NMD机制的异常与人类多种遗传病和癌症的发生机制密切相关。故综述选择性剪接与无义介导的m RNA降解机制的机理及研究进展。 展开更多
关键词 选择性剪接 无义介导的mRNA降解机制 多聚嘧啶区域结合蛋白1
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长链非编码RNA FTX对慢性髓细胞白血病细胞伊马替尼抵抗的机制研究
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作者 王瑾 马肖容 +2 位作者 刘海玲 姚欢 张卉 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第24期3193-3196,共4页
目的 探究长链非编码RNA(LncRNA) FTX对慢性髓细胞白血病(CML)细胞伊马替尼抵抗的作用机制。方法 用梯度诱导CML细胞K562伊马替尼抵抗的形成,作为抵抗组;用等体积0. 9%Na Cl处理CML细胞,作为敏感组。待抵抗组细胞处于生长对数期时,用Lnc... 目的 探究长链非编码RNA(LncRNA) FTX对慢性髓细胞白血病(CML)细胞伊马替尼抵抗的作用机制。方法 用梯度诱导CML细胞K562伊马替尼抵抗的形成,作为抵抗组;用等体积0. 9%Na Cl处理CML细胞,作为敏感组。待抵抗组细胞处于生长对数期时,用LncRNA FTX-siRNA对其进行转染,作为转染组;用空白对照载体进行转染的作为对照组。继续培养48 h,待细胞状态稳定后,用CCK-8法检测伊马替尼的半抑制浓度(IC50),用Western Blot检测PTBP1蛋白的表达水平,用实时荧光聚合酶链反应检测LncRNA FTX和PTBP1 mRNA的表达水平。结果 转染组、对照组、敏感组和抵抗组的伊马替尼IC50分别为(3. 70±0. 29),(7. 28±0. 84),(1. 41±0. 10)和(7. 06±0. 64)μmol·L-1,PTBP1蛋白分别为(0. 59±0. 02),(1. 37±0. 06),(0. 52±0. 01)和(1. 02±0. 05),LncRNA FTX分别为(0. 03±0. 01),(0. 18±0. 01),(0. 03±0. 01)和(0. 17±0. 01)。转染组的上述指标和对照组比较、敏感组的上述指标和抵抗组比较,差异均有统计学意义(均P <0. 01)。转染组和对照组的PTBP1 mRNA分别为(2. 09±0. 22)和(1. 96±0. 18),差异无统计学意义(P> 0. 05)。结论 LncRNA FTX可通过调控PTBP1蛋白的表达,从而提高CML细胞对伊马替尼的敏感性。 展开更多
关键词 伊马替尼 慢性髓细胞白血病 长链非编码RNA FTX ptbp1
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多聚嘧啶区结合蛋白1对胃癌细胞增殖和转移的作用机制 被引量:6
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作者 李雅睿 任牡丹 +5 位作者 卢桂芳 卢新兰 赵倩 郭丹 马文慧 和水祥 《中华消化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期100-106,共7页
目的探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)在胃癌组织和人胃癌细胞株中的表达,以及PTBP1对胃癌细胞增殖与转移的作用机制。方法收集2019年1至6月于西安交通大学第一附属医院行外科手术切除的胃癌患者的癌组织与对应的癌旁组织。运用Kaplan-Me... 目的探讨多聚嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)在胃癌组织和人胃癌细胞株中的表达,以及PTBP1对胃癌细胞增殖与转移的作用机制。方法收集2019年1至6月于西安交通大学第一附属医院行外科手术切除的胃癌患者的癌组织与对应的癌旁组织。运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析胃癌患者的生存情况。选择PTBP1表达水平相对较高的人胃癌细胞株SGC7901和AGS进行小干扰RNA(siRNA)转染下调PTBP1表达,实验分为空白对照组、阴性对照组和PTBP1敲低组。分别运用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测胃癌细胞中PTBP1 mRNA和PTBP1的表达。通过MTT法转染24、48、72、96 h后,观察PTBP1对胃癌细胞增殖的作用;Transwell实验检测下调PTBP1后胃癌细胞侵袭和迁移的变化,蛋白质印迹法检测下调PTBP1后胃癌细胞上皮-间质转化(EMT)标志物E-钙黏蛋白、N-钙黏蛋白和波形蛋白的改变。采用独立样本t检验、方差分析和秩和检验进行统计学分析。结果Kaplan-Meier Plotter预后分析显示,高表达PTBP1胃癌患者总生存期短于低表达PTBP1胃癌患者[9.2个月(6.2个月,17.2个月)比19.0个月(14.5个月,28.4个月)],差异有统计学意义(Z=5.31,P<0.05)。实时荧光定量PCR检测结果显示,人胃癌细胞株SGC7901和AGS中,PTBP1敲低组PTBP1 mRNA表达水平均低于空白对照组和阴性对照组(SGC7901:0.78±0.11比3.10±0.19、2.99±0.23。AGS:0.80±0.09比3.55±0.24、3.50±0.18),差异均有统计学意义(tSGC7901=10.57、8.08,tAGS=10.91、13.42;P均<0.01)。蛋白质印迹结果显示,人胃癌细胞株SGC7901和AGS中,PTBP1敲低组PTBP1表达水平均低于空白对照组和阴性对照组(SGC7901:0.38±0.04比1.42±0.05、1.35±0.09。AGS:0.17±0.02比1.52±0.08、1.38±0.45),差异均有统计学意义(tSGC7901=15.94、10.57,tAGS=16.60、20.80;P均<0.01)。MTT结果显示,转染48、72、96 h后,PTBP1敲低组的吸光度值较阴性对照组分别下降了0.25±0.01、0.38±0.02、0.84±0.04,其中转染96 h后的差值最显著,差异有统计学意义(t=10.21、14.32,P均<0.01)。Transwell实验结果显示,人胃癌细胞株SGC7901和AGS中,PTBP1敲低组发生侵袭和迁移的细胞数均少于空白对照组和阴性对照组(SGC7901:42.00±5.91比116.40±10.23、114.40±10.43;39.60±6.77比125.80±11.51、122.40±5.90。AGS:40.20±7.25比115.60±14.63、117.40±9.12;36.00±5.20比122.40±12.10、125.40±12.74),差异均有统计学意义(tSGC7901=14.07、13.50、14.43、20.62,tAGS=10.27、14.75、14.68、16.76;P均<0.01)。蛋白质印迹结果显示,PTBP1敲低组E-钙黏蛋白表达水平均高于空白对照组和阴性对照组(SGC7901:1.42±0.05比0.53±0.05、0.57±0.03。AGS:1.34±0.04比0.54±0.03、0.61±0.01),而N-钙黏蛋白和波形蛋白的表达水平均低于空白对照组和阴性对照组(SGC7901:0.50±0.03比1.64±0.05、1.46±0.07,0.32±0.07比1.42±0.07、1.33±0.07。AGS:0.37±0.06比1.47±0.04、1.36±0.04,0.41±0.04比1.53±0.06、1.37±0.04),差异均有统计学意义(tSGC7901=11.63、13.19、18.83、11.68、11.43、10.43,tAGS=15.02、16.23、14.67、12.97、14.45、17.18;P均<0.01)。结论胃癌组织和细胞中PTBP1表达水平均升高,并且参与调控胃癌细胞的增殖、转移和EMT。 展开更多
关键词 胃肿瘤 多聚嘧啶区结合蛋白1 细胞增殖 侵袭和迁移 上皮-间质转化
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多聚嘧啶区结合蛋白1基因及其相关疾病的研究进展
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作者 车运诚 曾琼瑶(综述) 张文静(审校) 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2020年第12期1445-1449,共5页
多聚嘧啶区结合蛋白1(polyrimidine tract binding protein 1,PTBP1)是一种选择性剪接蛋白,通过对Pre-mRNA的选择性剪接以产生多样化的mRNA,从而参与多基因表达的转录调控过程,在肿瘤细胞存活、增殖、转移等过程中发挥重要作用。在不同... 多聚嘧啶区结合蛋白1(polyrimidine tract binding protein 1,PTBP1)是一种选择性剪接蛋白,通过对Pre-mRNA的选择性剪接以产生多样化的mRNA,从而参与多基因表达的转录调控过程,在肿瘤细胞存活、增殖、转移等过程中发挥重要作用。在不同肿瘤中,PTBP1的表达水平及生物学功能不同,机制之一可能在于其结合的相互作用蛋白不同。另外,PTBP1与神经系统退行性病变、高血压的发病有关,还参与机体免疫及细胞衰老。本文就PTBP1的结构、功能及其与疾病的相关性等方面作一综述。 展开更多
关键词 多聚嘧啶区结合蛋白1 选择性剪接 肿瘤
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