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求解蛋白质折叠问题的改进PERM算法
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作者 黄文奇 程念华 吕志鹏 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第7期1-3,共3页
在学习PERM算法的基础上 ,指出了影响PERM算法效率的关键因素 ,进而提出了一种改进的PERM算法———IPERM (ImprovedPERM ) .计算结果表明 ,IPERM的计算效率优于PERM算法 。
关键词 蛋白质折叠 perm Iperm 门限 裁减
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求解HP模型蛋白质折叠问题的改进PERM算法 被引量:7
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作者 陈矛 黄文奇 吕志鹏 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2007年第9期1456-1461,共6页
pERM是一种用来求解基于HP模型的蛋白质折叠问题的高效算法.在介绍PERM算法核心思想的基础上,对影响算法效率的因素做了改进:重新定义了权重和权重预测公式,并对选择动作时不同情况下的权重计算公式进行了统一,得到了改进的PERM算法.对... pERM是一种用来求解基于HP模型的蛋白质折叠问题的高效算法.在介绍PERM算法核心思想的基础上,对影响算法效率的因素做了改进:重新定义了权重和权重预测公式,并对选择动作时不同情况下的权重计算公式进行了统一,得到了改进的PERM算法.对当前文献中的多个典型算例进行了测试,并与Monte Carlo算法和PERM进行了比较.结果表明,改进后的PERM算法在计算速度上比PERM有明显提高,在速度和优度上远高于Monte Carlo算法.特别是对链长为46的算例,找到了比文献中报道的结果能量更低的构形. 展开更多
关键词 NP难 蛋白质折叠 HP模型 增长型算法 perm算法
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求解蛋白质折叠构形预测问题的PERM改进算法 被引量:1
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作者 黄文奇 崔茂林 《微计算机应用》 2004年第3期268-273,共6页
PERM算法用来求解蛋白质折叠构形预测问题具有非常高的效率。本文介绍了PERM算法的思想 ,并详细介绍了一种我们改进的PERM算法。
关键词 蛋白质折叠 NP HARD perm算法 HP格点模型 生物学 数学模型
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蛋白质在格子模型中改进的PERM算法
4
作者 李小妹 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2007年第7期197-199,共3页
PERM算法是当前蛋白质结构预测的格子模型优化算法中最为有效的一种算法,在该算法的基础上,我们提出了一种改进的增长算法IPERM。该方法简化了PERM算法中的权重计算公式,在遇到不同类型的残基时选用不同的上下限阈值以提高算法的有效性... PERM算法是当前蛋白质结构预测的格子模型优化算法中最为有效的一种算法,在该算法的基础上,我们提出了一种改进的增长算法IPERM。该方法简化了PERM算法中的权重计算公式,在遇到不同类型的残基时选用不同的上下限阈值以提高算法的有效性,并根据链长的大小使用不同的网格尺寸。实验结果表明,改进的增长算法使得HP序列在格子模型中能更快地找到其能量最低构象。 展开更多
关键词 蛋白质折叠 格子模型 perm
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利用强启动子PermE^*提高4"-异戊酰基转移酶基因在变铅青链霉菌TK24中对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平 被引量:8
5
作者 杨永红 赫卫清 +4 位作者 李瑞芬 戴剑漉 杨劭 王以光 武临专 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期826-830,共5页
目的提高螺旋霉素生物转化为4"-异戊酰螺旋霉素的水平,为构建以4"-异戊酰螺旋霉素为主要组分的必特螺旋霉素新一代基因工程菌提供指导。方法构建重组质粒pKC1139-e-ist-ist和pKC1139-ist-ist,它们分别含有5'-上游插入红... 目的提高螺旋霉素生物转化为4"-异戊酰螺旋霉素的水平,为构建以4"-异戊酰螺旋霉素为主要组分的必特螺旋霉素新一代基因工程菌提供指导。方法构建重组质粒pKC1139-e-ist-ist和pKC1139-ist-ist,它们分别含有5'-上游插入红霉素抗性基因强启动子PermE*的4"-异戊酰基转移酶基因串连双拷贝,和4"-异戊酰基转移酶基因串连双拷贝;将它们分别导入到变铅青链霉菌TK24中,比较它们对螺旋霉素的4"-异戊酰化能力。结果在加入终浓度为50μg/mL螺旋霉素时,变铅青链霉菌TK24[pKC1139-e-ist-ist]比变铅青链霉菌TK24[pKC1139-ist-ist]对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平提高近4倍。结论在变铅青链霉菌TK24中,PermE*可以增强4"-异戊酰基转移酶基因表达,明显提高对螺旋霉素的4"-异戊酰化水平。 展开更多
关键词 螺旋霉素 4"-异戊酰基转移酶基因 变铅青链霉菌TK24 permE* 生物转化 必特螺旋霉素
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Monovalent cation perm-selective membranes(MCPMs)"New developments and perspectives 被引量:9
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作者 Liang Ge Bin Wu +7 位作者 Dongbo Yu Abhishek N.Mondal Linxiao Hou Noor U1 Afsar Qiuhua Li Tingting Xu Jibin Miao Tongwen Xu 《Chinese Journal of Chemical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2017年第11期1606-1615,共10页
As one of the most typical and promising membrane processes, electrodialysis(ED) technique plays a more and more significant role in industrial separation. Especially, the separation of monovalent cations and multival... As one of the most typical and promising membrane processes, electrodialysis(ED) technique plays a more and more significant role in industrial separation. Especially, the separation of monovalent cations and multivalent cations is currently a hot topic, which is not only desirable for many industries but also challenging for academic explorations. The main aim of the present contribution is to view the advances of a wide variety of monovalent cation perm-selective membranes(MCPMs) and their preparation technologies including(1) covalent crosslinking,(2) surface modification,(3) polymer blending,(4) electrospinning,(5) nanofiltration alike membrane,and(6) organic–inorganic hybrid. The relevant advantages and disadvantages with respect to some specific cases have been discussed and compared in detail. Furthermore, we elaborately discuss the opportunities and challenges of MCPMs, the fabricating strategies to take and the future perspectives. 展开更多
关键词 Ion exchange membranes Monovalent cation perm-selective membranes ELECTRODIALYSIS Ion separation Electro-nanofiltration
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Morphology and possible origins of the Perm anomaly in the lowermost mantle of Earth 被引量:1
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作者 YuMei He LianXing Wen Yann Capdeville 《Earth and Planetary Physics》 CSCD 2021年第1期105-116,共12页
We have constrained a small-scale,dome-shaped low-velocity structure near the core-mantle boundary(CMB)of Earth beneath Perm(the Perm anomaly)using travel-time analysis and three-dimensional(3-D)forward waveform model... We have constrained a small-scale,dome-shaped low-velocity structure near the core-mantle boundary(CMB)of Earth beneath Perm(the Perm anomaly)using travel-time analysis and three-dimensional(3-D)forward waveform modeling of seismic data sampling of the mantle.The best-fitting dome-shaped model centers at 60.0°E,50.5°N,and has a height of 400 km and a radius that increases from 200 km at the top to 450 km at the CMB.Its velocity reduction varies from 0%at the top to–3.0%at 240km above the CMB to–3.5%at the CMB.A surrounding 240-km-thick high-velocity D''structure has also been detected.The Perm anomaly may represent a stable smallscale chemical pile in the lowermost mantle,although the hypothesis of a developing mantle plume cannot be ruled out. 展开更多
关键词 seismic velocity structure core-mantle boundary perm anomaly chemical pile
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Use of Wild-Growing Mushrooms for Therapeutic Purposes in the Perm Territory, Russia
8
作者 Lydia Perevedentseva 《Journal of Environmental Science and Engineering(A)》 2013年第4期236-242,共7页
On the Penn Territory (Prikamie), Russia, a systematic study of agarics and aphyllophoroid mushrooms has been conducted since 1975. The territory belongs to taiga. At present about 900 species of agarics and about 3... On the Penn Territory (Prikamie), Russia, a systematic study of agarics and aphyllophoroid mushrooms has been conducted since 1975. The territory belongs to taiga. At present about 900 species of agarics and about 300 species ofaphyllophoroid mushrooms have been discovered. 139 species of Phylum Basidiomycota (131 species) and Phylum Ascomycota (eight species) can be used for therapeutic purposes. The most common are mushrooms from families Russulaceae (15 species), Agaricaceae (11 species), Polyporaceae, Strophariaceae (10 species each). A considerable part of mushrooms (31 species) has bactericidal properties and 26 species can be used for treating malignant tumors. 展开更多
关键词 RUSSIA perm Territory TAIGA medicinal mushrooms.
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Permabit宣布推出业内首个提供主数据重复删除的嵌入式解决方案
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《计算机与网络》 2010年第11期69-69,共1页
Permabit公司近日宣布推出一款新品-Albireo高性能数据优化软件。截止目前,Permabit已经有多个产品设计赢得了领先的OEM厂商青睐,而Albireo,这个业内首款也是唯一一款OEM嵌入式数据优化解决方案。将于2010年底通过这些OEM厂商正式上... Permabit公司近日宣布推出一款新品-Albireo高性能数据优化软件。截止目前,Permabit已经有多个产品设计赢得了领先的OEM厂商青睐,而Albireo,这个业内首款也是唯一一款OEM嵌入式数据优化解决方案。将于2010年底通过这些OEM厂商正式上市。Albireo作为新一代数据优化解决方案, 展开更多
关键词 嵌入式 删除 abit公司 OEM 优化软件 性能数据 perm 产品设计
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Rare Earth Perm anentMagnets Application toElectrical Machinery
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《China Rare Earth Information》 2001年第3期2-2,共1页
关键词 Rare Earth perm anentMagnets Application toElectrical Machinery
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Pohar Perme法估算净生存率的应用实践与评价
11
作者 付瑞瑛 梅丹 +12 位作者 王晓锋 安澜 冉显会 张思维 李荔 王少明 陈茹 孙可欣 韩冰峰 徐梦圆 单天昊 曾红梅 魏文强 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期98-103,共6页
[目的]分别利用辽宁省大连市癌症患者数据和芬兰肿瘤登记处的结肠癌患者数据,应用Pohar Perme法估算癌症患者净生存率,并与Ederer Ⅱ法进行比较,评价Pohar Perme法在估算癌症患者净生存率时的应用价值。[方法]介绍Pohar Perme法估算净... [目的]分别利用辽宁省大连市癌症患者数据和芬兰肿瘤登记处的结肠癌患者数据,应用Pohar Perme法估算癌症患者净生存率,并与Ederer Ⅱ法进行比较,评价Pohar Perme法在估算癌症患者净生存率时的应用价值。[方法]介绍Pohar Perme法估算净生存率的概念、方法及原理。基于辽宁省大连市肿瘤登记处2015年诊断的癌症患者随访至2020年12月31日的数据信息,估算患者5年净生存率;基于芬兰肿瘤登记处1975—1980年诊断的结肠癌患者随访至1995年12月31日的数据信息,估算患者10年和15年净生存率。比较Pohar Perme法和Ederer Ⅱ法的结果,并绘制生存曲线。[结果]研究纳入辽宁省大连市肿瘤登记处癌症患者11 320例,芬兰肿瘤登记处癌症患者3 471例。Pohar Perme法和Ederer Ⅱ法估算大连市癌症患者总体5年净生存率分别为53.1%和54.1%,标准误均为0.5%。Pohar Perme法和Ederer Ⅱ法估算芬兰结肠癌患者10年净生存率分别为36.7%、36.5%,标准误分别为1.4%和1.2%;Pohar Perme法和Ederer Ⅱ法估算芬兰结肠癌患者15年净生存率分别为37.0%和36.0%,标准误分别为2.6%和1.4%。净生存率曲线显示随访5年时,两种方法结果相近。[结论] Pohar Perme法在估算5年净生存率时与Ederer Ⅱ法结果极为接近。在估算长期净生存率(≥10年)时,Pohar Perme法的标准误比Ederer Ⅱ法大。 展开更多
关键词 肿瘤登记 生存分析 净生存率 Pohar perme法
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中国和欧洲精准医疗发展现状研究 被引量:5
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作者 王闻雅 王丽丽 +4 位作者 黄慧瑶 周童心 章颖 杜利 俞悦 《中国医药导刊》 2024年第1期2-43,共42页
随着精准医学相关技术不断成熟,精准医学体系逐渐成熟走向应用。全球精准医学处于高速发展阶段,其科学和社会价值日益凸显,但整体也面临多方面发展瓶颈,个体化诊疗体系尚未形成。本项目组采用科学文献检索、灰色文献搜索、咨询“地平线2... 随着精准医学相关技术不断成熟,精准医学体系逐渐成熟走向应用。全球精准医学处于高速发展阶段,其科学和社会价值日益凸显,但整体也面临多方面发展瓶颈,个体化诊疗体系尚未形成。本项目组采用科学文献检索、灰色文献搜索、咨询“地平线2020”国家咨询联络点、中国-欧盟精准医疗合作支持计划(IC2PerMed)专家调查等方法,系统梳理了中国、欧盟精准医疗有关的政策措施、规划方案和行动计划等资料和信息,对各种信息进行标准化、结构化处理并进行对比分析,形成本报告。报告内容涵盖:精准医疗概念演变过程;国际精准医疗联盟介绍;中欧精准医疗领域政策措施、规划方案和行动计划相关性的详细信息;中欧精准医疗模式下医疗健康研究的重点方向;全球精准医疗发展目标。本报告深入分析中欧精准医疗战略,找出双方战略、计划和行动的共同点、差异和差距;明确了各自的PM创新重点;指明了中欧医疗健康研究资助机制各自的优势与不足;探寻了未来全球卫生领域合作的热点。该报告一方面为IC2PerMed的专家小组在精准医疗国际标准、可转移性和扩大合作研究领域提供信息支撑,另一方面,也为促进欧盟和中国之间精准医疗领域合作指引方向,为促进中欧精准医疗合作奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 精准医学 个体化医疗 中国-欧盟国际精准医疗领域合作支持计划(IC2permed) 国际精准医疗联盟 科技创新合作
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头发曲折变形记
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作者 徐冬梅 《大学化学》 CAS 2024年第9期81-84,共4页
烫发是人类追求美好的一种方式,也是现代流行的一种美发技术。本文通过虚拟参观美发展览介绍了烫发简史,头发的化学组成,以及化学烫发的原理,旨在展示化学对人类的重要性,帮助人们辩证理解烫发的利弊,并以正确的态度对待烫发。
关键词 烫发简史 头发化学组成 化学烫发
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体育领域用超纤革制备及其性能研究
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作者 张琳 《中国皮革》 CAS 2024年第10期99-101,106,共4页
为改善体育领域用超纤革综合应用性能,提高超纤革手感与质感,本文以高收缩纤维切片与聚酰胺切片混合制备了体育领域用高收缩聚酯纤维超纤革基布与成革,并与聚酯纤维超纤革基布与成革进行了性能对比分析。结果发现,体育领域用高收缩聚酯... 为改善体育领域用超纤革综合应用性能,提高超纤革手感与质感,本文以高收缩纤维切片与聚酰胺切片混合制备了体育领域用高收缩聚酯纤维超纤革基布与成革,并与聚酯纤维超纤革基布与成革进行了性能对比分析。结果发现,体育领域用高收缩聚酯纤维超纤革力学性能与卫生性能存在显著性差异;相比聚酯纤维超纤革基布,高收缩聚酯纤维超纤革基布纤维间孔径较小;相较于聚酯纤维超纤革,高收缩聚酯纤维超纤革纵向与横向断裂强力偏低,而纵向与横向断裂伸长率较大,柔软度更大,透气率和透湿率更高,吸水量更大,表明其力学性能相对较优,且卫生性能整体更佳。 展开更多
关键词 体育器械 超纤革基布 柔软性能 断裂伸长率 透气性能
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某酸法地浸铀矿山氡释放特征研究
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作者 王亚兰 徐乐昌 +1 位作者 张辉 周磊 《铀矿冶》 CAS 2024年第3期93-99,共7页
以某酸法地浸铀矿山为对象,开展了酸法地浸采铀源项氡浓度、氡释放量,以及环境氡迁移扩散趋势等释放特征研究。采用E-Perm驻极体探测器法、固体径迹探测器法、RAD7静电收集测氡法,对地浸铀矿山抽液孔、集液罐、水冶厂通风口、蒸发池源... 以某酸法地浸铀矿山为对象,开展了酸法地浸采铀源项氡浓度、氡释放量,以及环境氡迁移扩散趋势等释放特征研究。采用E-Perm驻极体探测器法、固体径迹探测器法、RAD7静电收集测氡法,对地浸铀矿山抽液孔、集液罐、水冶厂通风口、蒸发池源项及周边环境的氡浓度进行了监测。结果表明,该地浸铀矿山氡释放量约为1.75 TBq/a,水冶厂通风口和集液罐是重要的氡释放源项,其年氡释放量分别占地浸铀矿山年氡释放量的58%和39%;抽液孔和蒸发池的年氡释放量约占地浸铀矿山年氡释放量的3%;集液罐开口处氡浓度水平最高,其对环境影响范围不超过500 m;抽液孔氡浓度水平最低。该酸法地浸矿山归一化氡释放量远小于地下矿山排风井的归一化氡释放量。 展开更多
关键词 地浸采铀 氡释放 氡浓度 酸法 驻极体探测器 固体径迹探测器 RAD7静电收集探测器
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Personification algorithm for protein folding problem:Improvements in PERM 被引量:10
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作者 HUANGWenqi LUZhipeng 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2004年第19期2092-2096,共5页
PERM is the most efficient approach for solv- ing protein folding problem based on simple lattice model. In this article a personification explanation of PERM is pro- posed. A new version of PERM, population control a... PERM is the most efficient approach for solv- ing protein folding problem based on simple lattice model. In this article a personification explanation of PERM is pro- posed. A new version of PERM, population control algorithm with two main improvements is presented: one is that it is able to redefine the weight and its predicted value in PERM, and the other is that it is able to unify the calculation of weight when choosing possible branches. The improved PERM is more efficient than the previous version; specifi- cally it can find the known lowest energy states for the four well-known difficult instances and is generally several to hundreds times faster than PERM. It is noteworthy that with the improved PERM we found new lowest energy configura- tions of three of the four difficult problems missed in previ- ous papers. 展开更多
关键词 蛋白质折叠 结构研究 拟人化算法 perm 点阵模型 种群控制算法
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Thermal boundary layer in stagnation-point flow past a permeable shrinking sheet with variable surface temperature 被引量:1
17
作者 MdSharif Uddin Krishnendu Bhattacharyya 《Propulsion and Power Research》 SCIE 2017年第3期186-194,共9页
An investigation is made to study the heat transfer in boundary layer stagnationpoint flow over a non-isothermal permeable shrinking sheet with suction/injection.In this study,power-law variation of sheet temperature... An investigation is made to study the heat transfer in boundary layer stagnationpoint flow over a non-isothermal permeable shrinking sheet with suction/injection.In this study,power-law variation of sheet temperature is considered.By similarity transformation,the governing equations with the boundary conditions are transformed to self-similar nonlinear ordinary differential equations and then those are solved numerically by shooting method.In presence of variable sheet temperature,the variation of temperature is analysed.For larger shrinking rate compared to that of straining rate,dual solutions for velocity and temperature are obtained.It is found that for positive value of power-law exponent of variable sheet temperature heat transfer at the sheet as well as heat absorption at the sheet with temperature overshoot near the sheet occur and for negative value heat transfer from the sheet occurs though there is overshoot away from the sheet.With increasing positive power-law exponent heat transfer reduces for first solution and heat absorption enhances for second solution.Whereas,with increasing magnitude of negative power-law exponent heat transfer increases for second solution and for first solution the heat transfer increases for larger shrinking rate and it decreases for smaller shrinking rate.Due to suction heat transfer/absorption increases in all cases and for injection heat transfer/absorption increases for first solution and decreases for second solution.Also,interesting effects of suction/injection and Prandtl number on temperature distribution are observed when the sheet temperature varies(directly/inversely)along the sheet. 展开更多
关键词 Dual solutions Heat transfer Boundary layer Stagnation-point flow Non-isothermal permeable shrinking sheet Suction/injection Variable surface temperature
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煤层气开发L型井水平井排采工程的研究
18
作者 陶占盛 吉耘君 许超 《中国煤层气》 CAS 2024年第1期12-16,共5页
研究L型水平井的举升系统选型以及排采生产制度的设计,形成举升系统选型的方法,建立排采生产制度的设计模型;以在排采的L型水平井生产工程、煤粉形态为依据,总结L型井各排采举升系统的优劣势;从排采过程管控的重点与难点进行分析,研究L... 研究L型水平井的举升系统选型以及排采生产制度的设计,形成举升系统选型的方法,建立排采生产制度的设计模型;以在排采的L型水平井生产工程、煤粉形态为依据,总结L型井各排采举升系统的优劣势;从排采过程管控的重点与难点进行分析,研究L型水平井排采生产制度的动态设计,建立“区块生产制度”,单井“差异化生产制度”实现区块产能目标最大化。 展开更多
关键词 排采举升系统 产能模拟 拟合预测 单位流压降幅产水量 应力与渗透率平衡
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一种频率-相位混合编码的MIMO雷达波形设计 被引量:1
19
作者 廖正龚 任渊 毕井章 《现代防御技术》 北大核心 2023年第6期112-122,共11页
针对MIMO雷达中常规单载频子脉冲相位编码信号的频带较窄、距离分辨率不高,以及线性调频-相位编码信号模糊函数有“栅瓣”的问题,提出了一种基于置换矩阵时频分布的线性调频-相位编码(perm-LFM-PC,PLP)混合波形的正交波形集设计方法。... 针对MIMO雷达中常规单载频子脉冲相位编码信号的频带较窄、距离分辨率不高,以及线性调频-相位编码信号模糊函数有“栅瓣”的问题,提出了一种基于置换矩阵时频分布的线性调频-相位编码(perm-LFM-PC,PLP)混合波形的正交波形集设计方法。由于置换矩阵时频分布调制方法引入置换序列调频编码,使得PLP波形的峰值旁瓣(ASP)和互相关峰值(CP)有所升高。为此,以ASP和CP的总和为代价函数,建立PLP波形集优化模型,并提出一种多种群优化遗传算法(MSO-GA),对调频编码序列和相位编码序列进行联合优化。仿真结果表明,PLP波形具有易于实现宽频带的优点和图钉状模糊函数,经过算法优化后的PLP波形集的ASP和CP较低,适用于MIMO雷达系统。 展开更多
关键词 MIMO雷达 perm-LFM-PC波形 频率编码 相位编码 多种群优化遗传算法
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Fe^(3+)诱导聚多巴胺-聚乙烯亚胺电沉积制备单价选择性膜 被引量:1
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作者 赵王瑞 刘燕 +1 位作者 张伟 邓会宁 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1508-1514,共7页
仿生黏合剂聚多巴胺(polydopamine,PDA)与聚乙烯亚胺(polyethyleneimine,PEI)共沉积是构建单价选择性分离层的有效方法。本实验通过浸泡预处理将Fe^(3+)引入阳离子交换膜,并利用电场作用和Fe^(3+)诱导PDA-PEI在膜面沉积改性。结果表明,... 仿生黏合剂聚多巴胺(polydopamine,PDA)与聚乙烯亚胺(polyethyleneimine,PEI)共沉积是构建单价选择性分离层的有效方法。本实验通过浸泡预处理将Fe^(3+)引入阳离子交换膜,并利用电场作用和Fe^(3+)诱导PDA-PEI在膜面沉积改性。结果表明,该方法大大缩短了单价选择性膜的改性时间,制备了单价选择性阳离子交换膜。利用扫描电子显微镜、紫外可见分光光度计、红外光谱仪、zeta电位对制得的膜进行表征和性能测试,探讨了Fe^(3+)浓度对改性膜性能的影响。表明随着Fe^(3+)浓度的增加改性膜的膜电阻呈上升趋势,而表面荷正电性和选择性均呈先增加后降低的趋势。由于电场和Fe^(3+)对多巴胺聚合过程的共同影响,当Fe^(3+)的浓度为0.001mol/L时,改性膜Na^(+)/Mg^(2+)选择性高达12.8,并且具有较低的膜电阻和优异的稳定性。 展开更多
关键词 离子交换 聚合 电沉积 单价离子选择性
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