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新型平均势函数在蛋白质反向折叠中的应用 被引量：1
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作者 王彦力 来鲁华 +2 位作者 韩玉真 徐筱杰 唐有祺 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期67-74,共8页
利用蛋白质主链的极性分数及主链二面角为参量，构建了一种基于蛋白质结构数据库的势函数。将该势函数应用于蛋白质反向折叠研究中，发现该函数可成功地将蛋白质分子的天然构象从构建的构象库中识别出来：将一目标序列与构象库的每一可... 利用蛋白质主链的极性分数及主链二面角为参量，构建了一种基于蛋白质结构数据库的势函数。将该势函数应用于蛋白质反向折叠研究中，发现该函数可成功地将蛋白质分子的天然构象从构建的构象库中识别出来：将一目标序列与构象库的每一可能的构象匹配，并用该势函数计算相应的能量，结果表明对绝大多数蛋白质分子来说，天然构象的能量值总是最低。此外，该函数还将一些序列相似性较低，而结构相似性较高的蛋白质分子识别出来。我们认为该函数从一个侧面表征了蛋白质分子的折叠特征，并对其在蛋白质结构预测研究中的应用进行了讨论。 展开更多
关键词 蛋白质 蛋白质结构 预测 反向折叠 平均势
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基于结构分类的蛋白质折叠模式识别方法
2
作者 刘伟华 毛凤楼 +1 位作者 来鲁华 韩玉真 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期126-136,共11页
对用于折叠模式识别的蛋白质结构数据库进行结构分类，构建了四个分类库：Ａｌ－α库，Ａｌ－β库，α／β库，α＋β库和一个总库，然后分别统计出不同灵敏度的匹配评估函数（平均势）。对不同的平均势，不同结构类型的蛋白进行的检验... 对用于折叠模式识别的蛋白质结构数据库进行结构分类，构建了四个分类库：Ａｌ－α库，Ａｌ－β库，α／β库，α＋β库和一个总库，然后分别统计出不同灵敏度的匹配评估函数（平均势）。对不同的平均势，不同结构类型的蛋白进行的检验发现：来源于α／β库的平均势预测能力最强，来源于Ａｌ－α库的平均势预测能力最弱；对α／β蛋白的预测成功率最高，对Ａｌ－α蛋白的预测成功率最低。这与α／β蛋白结构最规则。 展开更多
关键词 蛋白质 折叠模式识别 结构分类 平均势
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