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基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
被引量：
5
1
作者
张晓龙
李婷婷
芦进
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008年第10期230-235,共6页
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种...
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种群的局部开采能力和全局勘探能力来提高算法的性能。分别采用Fibonacci蛋白质测试序列和真实蛋白质序列进行了折叠结构预测的仿真实验。实验结果表明该算法能够更精确地进行蛋白质折叠结构预测,为生物科学研究提供了一条有效途径。
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关键词
蛋白质折叠
toy
模型
多种群微粒群优化算法(
mpso
)
下载PDF
职称材料
题名
基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
被引量：
5
1
作者
张晓龙
李婷婷
芦进
机构
武汉科技大学计算机学院
华中科技大学CAD中心
出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008年第10期230-235,共6页
基金
国家自然科学基金(No.60674115)
教育部回国人员科研启动基金(2005-2007)
文摘
基于Toy模型的蛋白质折叠结构预测问题是一个典型的NP问题。提出了多种群微粒群优化算法用于计算蛋白质能量最小值。该算法采用了一种新的算法结构,在该结构中,每一代的种群被分为精英子种群、开采子种群和勘探子种群三部分,通过改善种群的局部开采能力和全局勘探能力来提高算法的性能。分别采用Fibonacci蛋白质测试序列和真实蛋白质序列进行了折叠结构预测的仿真实验。实验结果表明该算法能够更精确地进行蛋白质折叠结构预测,为生物科学研究提供了一条有效途径。
关键词
蛋白质折叠
toy
模型
多种群微粒群优化算法(
mpso
)
Keywords
protein folding
,
toy model
,
multi particle swarm optimization （mpso）
分类号
TP24 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
O171 [理学—基础数学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Toy模型蛋白质折叠预测的多种群微粒群优化算法研究
张晓龙
李婷婷
芦进
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2008
5
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