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RNA结合蛋白ELAVL1的功能及其调控病毒复制的研究进展
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作者 余祖华 高梦茹 +4 位作者 齐志颖 张静雨 何雷 陈建 丁轲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1914-1925,共12页
胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU... 胚胎致死异常视觉蛋白1(embryonic lethal abnormal vision like 1, ELAVL1),又被称为人类抗原R(human antigen R, HuR),是一种典型的RNA结合蛋白(RNA binding protein, RBP),通过与3′非翻译区(3′untranslated element, 3′UTR)的AU富含元件(AU-rich element, ARE)结合,在mRNA转录和翻译过程中发挥重要作用。ELAVL1的作用十分广泛,可调控肿瘤的发生发展、凋亡、迁移与侵袭,是许多癌症治疗的关键靶点,还能参与调节编码器官发育和组织稳态的蛋白质和mRNA的水平,也有许多研究表明,ELAVL1通过转录后调控和翻译后修饰来调节病毒复制。本文主要综述了ELAVL1的生物学特点、功能、调控机制及其在病毒复制过程中的调控作用,旨在为进一步研究ELAVL1与畜禽病毒复制之间互作的机制提供理论参考。 展开更多
关键词 ELAVL1 rna结合蛋白 病毒 调控机制
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冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因的筛选及验证
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作者 多力昆·木台力甫 阿布都乃比·麦麦提艾力 伊加提·司马义 《山东医药》 CAS 2024年第30期34-38,共5页
目的筛选冠状动脉粥样硬化患者外周血单个核细胞关键RNA结合蛋白基因,并对其进行验证。方法①冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因筛选选择冠状动脉粥样硬化患者5例(观察组)、健康志愿者5例(对照组),采用转录组测序技术... 目的筛选冠状动脉粥样硬化患者外周血单个核细胞关键RNA结合蛋白基因,并对其进行验证。方法①冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因筛选选择冠状动脉粥样硬化患者5例(观察组)、健康志愿者5例(对照组),采用转录组测序技术检测外周血单个核细胞RNA转录组,运用R软件“edgeR”包筛选P<0.05、|logFC|>1、错误发现率<0.05的单个核细胞差异表达基因。从RNA结合蛋白数据库中下载人单个核细胞的RNA结合蛋白相关基因资料,与外周血单个核细胞差异表达基因取交集后获得冠状动脉粥样硬化单个核细胞RNA结合蛋白相关差异表达基因。运用TopHat2、ABLas软件筛选冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞差异表达RNA结合蛋白相关基因的可变剪接事件。筛选相对表达量最高的单个核细胞RNA结合蛋白相关差异表达基因为关键RNA结合蛋白基因。②冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因验证另选取冠状动脉粥样硬化患者10例(一组)、健康志愿者10例(二组),抽取外周静脉血后分离外周血单个核细胞,采用qRT-PCR法检测2组RNA结合蛋白关键基因。从GEO数据库(GSE40231、GSE43292、GSE100927、GSE27034)数据集中,检索冠状动脉粥样硬化患者、健康志愿者外周血单个核细胞RNA结合蛋白关键基因表达资料。结果冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞的差异RNA结合蛋白相关基因有:过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1α、锌指RNA结合蛋白2、SAM域、SH3域和核定位信号1(SAMSN1)、肝配蛋白A型受体2、RNA结合基序蛋白24、多种剪接形式的RNA结合蛋白2、SH3和多个锚蛋白重复结构域1。与对照组相比,观察组患者单个核细胞RNA结合蛋白相关基因的可变剪接事件多(P<0.05)。关键RNA结合蛋白基因为SAMSN1。与二组相比,一组患者外周血单个核细胞SAMSN1相对表达量升高(P<0.05)。GEO数据库数据结果显示,相比于健康志愿者,冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞单个核细胞SAMSN1相对表达量升高(P<0.05)。结论冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞关键RNA结合蛋白基因为SAMSN1基因。相比于健康志愿者,冠状动脉粥样硬化患者单个核细胞SAMSN1基因表达升高,可变剪接事件增多。SAMSN1基因可能通过调控RNA结合蛋白相关基因的可变剪接事件,参与冠状动脉粥样硬化的发生发展。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 rna结合蛋白基因 SH3域和核定位信号1基因 SH3域和核定位信号1 可变剪接 冠状动脉粥样硬化
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RNA结合蛋白HuR调控lncRNA DLEU2促进食管鳞癌细胞增殖、侵袭的机制
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作者 王伟 何天乐 +1 位作者 李扬 杨素清 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期883-888,共6页
目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、K... 目的探讨RNA结合蛋白人抗原(Hu)R对食管鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及其与长链非编码RNA(lncRNA)淋巴细胞白血病缺失基因(DLEU)2的调控关系。方法收集食管鳞癌组织样本并在体外培养正常人食管鳞状上皮细胞Het-1A及食管鳞癌细胞系KYSE30、KYSE70、KYSE270,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)实验检测HuR mRNA与DLEU2表达水平。利用Lipofectamime2000试剂对KYSE30细胞进行转染,并随机分组为对照组、pcDNA组、pc-HuR组、sh-NC组、sh-HuR组、sh-HuR+si-NC组和sh-HuR+si-DLEU2组。CCK-8法检测各组KYSE30细胞活性;平板克隆形成实验检测各组KYSE30细胞增殖能力;荷瘤裸鼠实验观察体内肿瘤生长情况;Transwell小室检测各组KYSE30细胞侵袭能力;Western印迹检测各组KYSE30细胞中HuR蛋白表达水平;RNA免疫沉淀(RIP)实验分析HuR与DLEU2的结合关系。结果在食管鳞癌组织和细胞系中,HuR mRNA和蛋白表达及DLEU2水平均显著升高(P<0.05),其中KYSE30细胞系中HuR基因与DLEU2表达水平最高,故选择KYSE30细胞进行转染实验。转染pc-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显上调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著增加(P<0.05);转染sh-HuR的细胞中HuR蛋白表达明显下调,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均显著降低(P<0.05)。RIP实验和qRT-PCR检测发现HuR与DLEU2有相互作用关系。同时转染sh-HuR和si-DLEU2的细胞中DLEU2水平明显降低,细胞活性、克隆形成率及细胞侵袭数均比转染sh-HuR明显更低(P<0.05)。过表达HuR显著增加移植瘤体积和重量,抑制HuR明显减小移植瘤的体积和重量,而同时抑制HuR和DLEU2时移植瘤的体积和重量比单独抑制HuR时明显更小(P<0.05)。结论HuR通过与DLEU2结合,促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和移植瘤的体内生长。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 人抗原R 食管鳞癌 淋巴细胞白血病缺失基因2 增殖 侵袭
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RNA结合蛋白ZCCHC17在肝细胞癌中的研究进展
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作者 梁家东 刘肸琳 +2 位作者 黄云美 杨伟鹏 罗春英 《中国现代医生》 2024年第23期132-134,139,共4页
肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究... 肝细胞癌是人类最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁人类生命健康。肝细胞癌常见的治疗手段包括手术治疗、放疗和化疗等。受肿瘤复发和转移等多种因素影响,肝细胞癌患者的预后及5年生存率并不理想。探索早期诊断的生物标志物是肝细胞癌研究的热点之一。多项研究证实,RNA结合蛋白功能异常可使多种肿瘤相关标志物发生改变,进而影响肿瘤的发生发展。本文对RNA结合蛋白ZCCHC17的生物学功能、ZCCHC17与DNA甲基化的相关性及ZCCHC17与肝细胞癌的相关性等研究进展进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白ZCCHC17 肝细胞癌 生物学功能 甲基化 预后
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RNA结合蛋白FMRP在实体瘤中作用的研究进展
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作者 韩宜倩 周康杰 +3 位作者 蒋薇薇 张淼 毛晨曦 吴风雷 《山东医药》 CAS 2024年第25期99-102,共4页
迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效... 迄今为止,绝大部分恶性肿瘤的病因和发病机制尚不完全清楚。基因表达调控能够从多个层面影响RNA分子结构并改变其稳定性,还能使其获得更多的生物学功能,从而对肿瘤的发生、发展产生重要影响。RNA结合蛋白(RBPs)是基因表达调控的关键效应因子,能够参与人体多种重要的生理过程,其表达缺陷可导致多种疾病的发生,包括癌症。脆性X智力低下蛋白(FMRP)是由脆性X智力低下1(FMR1)基因编码的一种RBP。有研究报道,FMRP在多种肿瘤组织中过表达,可通过调控不同的信号通路,参与肿瘤细胞增殖、侵袭、迁移等生物学过程。但由于肿瘤的发生、发展机制极其复杂,往往存在多条信号通路的交叉重叠,许多信号通路中上下游分子和转录因子的作用尚不完全清楚。因此,FMRP在实体瘤中的作用机制仍需进一步探索。 展开更多
关键词 实体瘤 rna结合蛋白 脆性X智力低下蛋白 信号通路
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慢性阻塞性肺疾病患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白和髓样细胞触发受体-1的表达水平及其临床意义 被引量:1
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作者 张政 陈雪儿 卢献灵 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第7期1275-1280,共6页
目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同... 目的探讨慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者外周血中冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)和髓样细胞触发受体-1(TREM-1)的表达水平及其临床意义。方法选取2022年10月—2023年6月40例住院的COPD患者为急性加重期组,其经过治疗进入稳定期后纳入稳定期组,同期40例健康体检者为对照组。收集各组一般资料,采集外周血,通过酶联免疫吸附法测定血浆中CIRBP、TREM-1水平,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法测定CIRBP mRNA和TREM-1 mRNA的相对表达量,并检测COPD患者和健康体检者的肺功能。结果COPD急性加重期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于稳定期组,差异有统计学意义(均P<0.001);急性加重期和稳定期外周血中的CIRBP、TREM-1表达水平均高于对照组,差异有统计学意义(均P<0.001);在急性加重期和稳定期,CIRBP水平均与TREM-1水平呈正相关;急性加重期CIRBP、TREM-1水平与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关;稳定期CIRBP、TREM-1水平与第1秒用力呼气容积占预计值百分比、第1秒用力呼气容积/用力肺活量比值呈负相关,与白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞/淋巴细胞比率呈正相关。结论CIRBP和TREM-1的表达水平在COPD患者外周血中升高,CIRBP的表达与TREM-1表达具有相关性,并且与肺功能、白细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞与淋巴细胞比率、单核细胞与高密度脂蛋白比率等临床指标相关,提示CIRBP和TREM-1可能共同参与COPD的发生发展。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 冷诱导rna结合蛋白 髓样细胞触发受体-1
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RNA结合蛋白在慢性肾脏病中的研究进展 被引量:1
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作者 张佳慧 张雪琴 +1 位作者 朱国强 陆晨 《中国现代医生》 2024年第3期115-118,共4页
当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的... 当前慢性肾脏病已成为一个全球的公共健康问题而受到关注。我国慢性肾脏病的发病率呈逐年升高趋势,其发病机制复杂、病情缓慢迁延、并发症多等因素成为临床诊治的难题,如不能有效防治将成为沉重的社会和经济负担。随着对RNA结合蛋白的研究不断深入,发现其与慢性肾脏病的发生、发展密切相关。本文对RNA结合蛋白与各种慢性肾脏病间的作用机制进行综述,以期为慢性肾脏病的临床诊断、治疗及预后提供新的方向。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 慢性肾脏病 基因调控 细胞凋亡
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RNA结合蛋白QKI可通过调节EMT相关基因转录物的切割形成circRNA促进胃癌的发生发展
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作者 崔逸爽 郑璇 +4 位作者 吴亚男 么艺涵 王珺 刘子情 孙国贵 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1462-1473,共12页
目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白... 目的通过生物信息学分析震颤响应蛋白(quaking,QKI)参与胃癌(gastric cancer,GC)发生和发展的可能分子机制。研究QKI在GC细胞中的增殖、侵袭和迁移能力。方法联合TCGA和GTEx数据库分析QKI在常见人类癌症样本中的差异表达。分析QKI蛋白表达与肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)评分、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)评分以及ESTIMATE评分的相关性,并分析QKI蛋白表达与总生存期(overall survival,OS)、无病生存期(disease free survival,DFS)及无进展生存期(progression free survival,PFS)的相关性。通过生物信息学分析获得可编码DEcircRNAs的EMT相关基因,构建QKI-EMT-circRNAs调控网络。在TMK1细胞中对差异表达的circRNAs和EMT相关基因进行表达验证,并验证敲降QKI后对TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力的影响。结果QKI在绝大多数肿瘤中差异表达,且与TMB、MSI以及肿瘤微环境(tumour microenvironment,TME)密切相关;QKI可作为高风险因子预测常见人类癌症患者的OS、DFS和PFS。QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成8个circRNAs,它们均与胃癌患者预后明显相关。细胞实验表明,相对于正常胃上皮细胞,只有hsa_ccirc_0004015、CALD1和CDK14在TMK1细胞中表达下调。敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。结论QKI通过调控6个EMT相关基因转录本剪切形成circRNAs,从而促进GC发生和发展。QKI在TMK1细胞中高表达,敲降QKI可抑制TMK1细胞的增殖、侵袭和迁移能力。 展开更多
关键词 胃癌 QKI rna结合蛋白 上皮间充质转化 circrna 生物信息学分析
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RNA结合蛋白在心血管疾病中作用机制的研究进展
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作者 刘嘉欣 杨五小 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第8期1437-1441,共5页
综述RNA结合蛋白的生物学意义,重点介绍其在心房颤动、急性冠脉综合征及特殊类型心脏病方面的作用机制及研究进展,展望RNA结合蛋白转导蛋白β样蛋白2在心肌梗死疾病中的作用。
关键词 心血管疾病 rna结合蛋白 转导蛋白β样蛋白2 心肌梗死 综述
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创伤性颅脑损伤后冷诱导RNA结合蛋白的改变及其临床意义
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作者 吉慧军 曹阳 +4 位作者 李泽 刘远扬 高兵兵 于洋 刘竞鹏 《创伤外科杂志》 2024年第11期817-823,共7页
目的 研究细胞外冷诱导RNA结合蛋白(eCIRP)在创伤性颅脑损伤(TBI)患者及TBI动物模型大脑和血清中的表达变化,探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)是否可作为TBI的生物标志物。方法 12只健康雄性C57BL/6J小鼠(24~26g)随机分为假手术组和TBI组,... 目的 研究细胞外冷诱导RNA结合蛋白(eCIRP)在创伤性颅脑损伤(TBI)患者及TBI动物模型大脑和血清中的表达变化,探讨冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)是否可作为TBI的生物标志物。方法 12只健康雄性C57BL/6J小鼠(24~26g)随机分为假手术组和TBI组,每组各6只。通过液压打击法构建小鼠TBI动物模型,假手术组打击力度为0个大气压,TBI组打击力度为1.1~1.3个大气压,利用HE染色法观察小鼠损伤侧脑组织病理形态学变化及病变体积,利用Western blot法检测小鼠脑组织CIRP蛋白的表达强度,ELISA法测定小鼠血清中CIRP、S100钙结合蛋白B(S100B)、TNF-α、IL-1β的分泌量。前瞻性选择2022年12月-2024年1月中国人民解放军总医院第一医学中心神经外科收治的中重度TBI患者(GCS 3~12分)及健康志愿者作为研究对象,其中中重度TBI患者8例,男性6例,女性2例;年龄30~66岁,平均49.1岁。健康志愿者10例,男性7例,女性3例;年龄26~64岁,平均45.3岁。采集血液后通过ELISA法测定血清中S100B、TNF-α、IL-1β的分泌量,利用统计学软件分析ELISA法测定的血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平的相关性。结果 与假手术组相比,TBI组小鼠24 h脑皮层有明显受损,半球体积损失百分比为(3.1±0.5)%,TBI组小鼠24 h大脑损伤部位中CIRP蛋白的相对表达量显著高于假手术组(P<0.001)。假手术组和TBI组小鼠血清中CIRP、S100B、TNF-α、IL-1β分泌量分别为(223.8±38.5)pg/mL vs.(516.5±93.9)pg/mL(P<0.001)、(34.7±7.7)pg/mL vs.(132.7±34.7)pg/mL(P<0.001)、(22.9±5.2)pg/mL vs.(41.2±7.3)pg/mL(P<0.001)、(59.5±8.1)pg/mL vs.(114.7±26.4) pg/mL(P<0.01);健康志愿者和TBI患者血清中CIRP、S100B、TNF-α、IL-1β分泌量分别为(11.4±4.7)pg/mL vs.(36.1±8.2)pg/mL、(82.3±10.6)pg/mL vs.(120.5±16.3)pg/mL、(41.9±7.7)pg/mL vs.(146.0±37.4)pg/mL、(82.9±17.8)pg/mL vs.(155.3±26.9)pg/mL,P均<0.001。TBI小鼠血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平呈正相关(r值分别为0.923、0.958、0.984);TBI患者人体血清中CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β水平呈正相关(r值分别为0.740、0.664、0.662)。结论 CIRP在TBI后损伤皮层及血清中表达均升高,且CIRP与S100B、TNF-α、IL-1β表达水平呈正相关,可作为TBI的生物标志物。 展开更多
关键词 创伤性颅脑损伤 冷诱导rna结合蛋白 生物标志物
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冷诱导RNA结合蛋白介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的机制研究
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作者 范阳 张西安 +3 位作者 豆涛涛 刘立承 皇甫慧源 刘展会 《临床医学进展》 2024年第8期1633-1644,共12页
目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性... 目的:探究冷诱导RNA结合蛋白(cold-inducible RNA-binding protein, CIRP)是否能通过TLR4/MyD88途径介导氧化应激促进脑缺血再灌注损伤的发生发展过程,目前尚无报道。本研究将为脑缺血再灌注损伤的治疗提供新的靶点,亦为临床急性缺血性脑卒中(acute ischemic stroke, AIS)患者术后缺血再灌注损伤的治疗应用提供了理论依据。方法:首先通过检测AIS患者术后外周血、构建HMC3细胞缺氧/复氧模型,观察缺血再灌注损伤对CIRP表达水平的影响;其次通过培养SH-SY5Y细胞,使用人重组CIRP蛋白(Recombinant human CIRP protein, rhCIRP)及C23干预,观察CIRP的表达及氧化应激水平。最后利用慢病毒敲减HMC3细胞的CIRP基因,再次构建细胞缺氧/复氧模型,探究CIRP通过TLR4/MyD88途径激活NADPH氧化酶,释放ROS上调Drp-1水平,进而促进线粒体分裂的分子机制。结果:AIS患者脑缺血再灌注后血清CIRP表达较术前显著升高。在人小胶质细胞HMC3缺氧/复氧模型中,细胞内CIRP表达水平显著升高且8小时后CIRP表达水平达到巅峰,并分泌到细胞外,激活炎症因子TNF-α、IL-6表达。rhCIRP可以作用于SH-SY5Y细胞促进TLR4、GP91、P47、DRP-1、MFN-2、Cleaved-caspase-3、TNF-α、IL-6的表达,介导氧化应激。而使用C23和敲减CIRP后则可以抑制上述蛋白和炎症因子的表达,保护组织细胞。结论:缺血再灌注损伤使小胶质细胞释放大量CIRP,分泌到细胞外,TLR-4/MyD88通路介导氧化应激,引起神经细胞缺血再灌注损伤。Objective: To explore whether CIRP can promote the occurrence and development of cerebral ischemia-reperfusion injury through TLR4/MyD88 pathway through oxidative stress, there is no report at present. This study will provide a new target for cerebral ischemia-reperfusion injury, and also provide a theoretical basis for the treatment and application of ischemia-reperfusion injury after acute ischemic stroke surgery. Methods: The effect of ischemia reperfusion injury on the expression of CIRP was observed by detecting the peripheral blood of patients with acute ischemic stroke after operation and constructing the hypoxia/reoxygenation model of HMC3 cells. Secondly, SH-SY5Y was cultured, and human recombinant CIRP protein (rhCIRP) and CIRP inhibitor (C23) were used to observe the level of CIRP and oxidative stress. Finally, the CIRP gene of HMC3 cells was knocked down by lentivirus, and the cell hypoxia/reoxygenation model was constructed again to explore the molecular mechanism of CIRP activating NADPH oxidase through TLR4/MyD88 pathway, releasing ROS to up-regulate the level of Drp-1, and promoting mitochondrial division. Results: The expression of serum CIRP in AIS patients after cerebral ischemia reperfusion was significantly higher than that before operation. In the hypoxia/reoxygenation model of human microglial cell HMC3, the expression level of CIRP in the cell increased significantly and reached the peak after 8 hours, and secreted to the outside of the cell to activate the inflammatory factor TNF-α, IL-6 expression. rhCIRP can be used as SH-SY5Y cells to promote TLR4, GP91, P47, DRP-1, MFN-2, Cleved-caspase-3, TNF-α, IL-6 expression, and mediate oxidative stress. C23 and knockdown of CIRP can inhibit the expression of the above proteins and inflammatory factors, and protect the tissue cells. Conclusion: Ischemia reperfusion injury causes microglia to release a large amount of CIRP, which is secreted into the extracellular space. The TLR-4/MyD88 pathway mediates oxidative stress, leading to neuronal ischemia-reperfusion injury. 展开更多
关键词 冷诱导rna结合蛋白 缺血再灌注损伤 急性缺血性中风 氧化应激 线粒体分裂
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小鼠RNA结合蛋白QKI-5的生物信息学和组织表达分析及其过表达对癌症相关基因表达的影响 被引量:1
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作者 王逢博 高登科 +6 位作者 李超 李丹 刘薇 张海森 杨王浩 靳亚平 陈华涛 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期453-466,共14页
【目的】旨在构建小鼠Quaking基因的主要转录本Quaking-5(Qki-5)的真核表达载体,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能特征,检测该基因的组织表达谱,并在小鼠AML12肝细胞系中探究Qki-5过表达对癌症相关基因表达的影响。【方法】提取... 【目的】旨在构建小鼠Quaking基因的主要转录本Quaking-5(Qki-5)的真核表达载体,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能特征,检测该基因的组织表达谱,并在小鼠AML12肝细胞系中探究Qki-5过表达对癌症相关基因表达的影响。【方法】提取小鼠肝脏组织的总RNA,反转录为cDNA,通过PCR扩增Qki-5转录本的蛋白编码区(Coding Sequence,CDS)全长,将获得的目的片段与线性化载体pcDNA3.1-Puro-N-3HA进行同源重组连接以获得pcDNA3.1-mQki-5。通过在线软件对Qki-5基因序列及其编码蛋白进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Qki-5基因在小鼠不同组织中的表达谱,同时使用免疫组织化学技术检测QKI-5蛋白在小鼠肝脏组织的表达分布。之后,将pcDNA3.1-mQki-5重组质粒和pcDNA3.1-Puro-N-3HA空质粒分别转染至AML12细胞,通过qPCR和Western Blotting(WB)检测Qki-5基因在mRNA和蛋白水平的表达,并进一步检测Qki-5基因在AML12细胞中过表达后对癌症相关基因表达的影响。【结果】成功构建了pcDNA3.1-mQki-5真核表达载体;小鼠Qki-5基因的CDS区长度为1026 bp,共编码341个氨基酸;小鼠QKI-5蛋白为亲水性蛋白,不含跨膜结构和信号肽,存在26个磷酸化位点,且小鼠QKI-5蛋白的三级结构与人和大鼠完全一致;在检测的12个组织中,Qki-5在小鼠全脑的表达量最高,在十二指肠的表达量最低;QKI-5在小鼠肝脏组织中主要表达于肝细胞细胞核中;在AML12细胞过表达QKI-5后,会引起癌症相关基因P53和Ccnd1的mRNA表达水平显著升高。【结论】研究成功构建了小鼠Qki-5基因真核表达载体;Qki-5基因在小鼠全脑、肺脏等组织中表达量较高;QKI-5主要表达分布于小鼠肝细胞细胞核内;此外,在AML12细胞中QKI-5的过表达会引起P53和Ccnd1的表达水平升高。研究为进一步探究小鼠Qki-5基因的功能提供了关键材料。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 QKI 表达谱 哺乳动物 癌症
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冷诱导RNA结合蛋白在大鼠低体温性急性肺损伤中的表达变化
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作者 徐耀迪 王佳新 +6 位作者 陈旭昕 张春阳 王凡 丁毅伟 彭聪 肖漓 韩志海 《解放军医学院学报》 CAS 北大核心 2023年第4期380-387,共8页
背景海上遇难者落水后常死于海水长时间浸泡后的低体温及相关并发症,肺是低体温损伤的重要器官之一,但目前针对低体温造成急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的研究相对匮乏。目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(coldinducible RNA-binding prot... 背景海上遇难者落水后常死于海水长时间浸泡后的低体温及相关并发症,肺是低体温损伤的重要器官之一,但目前针对低体温造成急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的研究相对匮乏。目的探讨冷诱导RNA结合蛋白(coldinducible RNA-binding protein,CIRP)在低体温性ALI大鼠模型中的变化及其可能的作用机制。方法将40只雄性成年SD大鼠随机分为0 h组(0 h,8只)和实验组(32只)。实验组分别用低温海水浸泡12 h、16 h、20 h、24 h(每组8只),构建低体温性ALI动物模型。ELISA检测白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、IL-1β、细胞外CIRP的含量,对肺组织进行HE染色、TUNEL染色和CIRP免疫组织化学染色,qRT-PCR检测CIRP mRNA的表达。结果与0 h组相比,实验组出现不同程度肺损伤,病理切片可见肺泡壁增厚或结构破坏,肺泡腔内出血,伴中性粒细胞和淋巴细胞浸润等;16 h、20 h、24 h实验组血清中IL-6的表达显著增加,20 h、24 h实验组血清中IL-1β表达显著增加,差异均有统计学意义(P<0.01);各实验组大鼠血清中CIRP表达增加均有统计学差异(12 h、16 h、20 h组,P<0.05;24 h组,P<0.01)。TUNEL结果显示,各实验组的大鼠肺组织出现不同程度的细胞凋亡现象(P<0.01);通过炎症因子的表达水平、肺组织病理改变以及细胞凋亡情况选择低温海水浸泡24 h为最佳构建模型时间,免疫组织化学染色和qRT-PCR观察到24 h组肺组织内CIRP的表达增加。结论肺组织和外周血清的CIRP在低体温性ALI大鼠模型中随时间延长而表达增高,提示其可能与低体温致ALI相关,同时与炎症因子IL-1β、IL-6水平呈现一致性趋势变化,因此推测CIRP可能通过促进炎症因子释放发挥作用,本研究初步证实了CIRP在肺组织区域和整体与低体温ALI的相关性。 展开更多
关键词 低体温 肺损伤 大鼠 冷诱导rna结合蛋白 炎症因子
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RNA结合蛋白与肿瘤生物治疗:新机遇与新策略 被引量:4
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作者 朱哈 刘娟 曹雪涛 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期1-9,共9页
RNA结合蛋白(RBP)由于其独特的生物学功能,目前已经成为肿瘤生物治疗相关靶点筛选的宠儿,很可能为肿瘤生物治疗带来新的机遇。RBP能调控肿瘤细胞及肿瘤微环境免疫细胞和间质细胞的DNA-RNA-蛋白质相互作用网络,进而广泛影响肿瘤发生发展... RNA结合蛋白(RBP)由于其独特的生物学功能,目前已经成为肿瘤生物治疗相关靶点筛选的宠儿,很可能为肿瘤生物治疗带来新的机遇。RBP能调控肿瘤细胞及肿瘤微环境免疫细胞和间质细胞的DNA-RNA-蛋白质相互作用网络,进而广泛影响肿瘤发生发展、抗肿瘤免疫应答及肿瘤免疫逃逸过程,目前RBP相关肿瘤生物治疗的研发,主要聚焦在治疗性疫苗、免疫细胞治疗、表观调控治疗等方面,部分研发成果已处于临床试验阶段。随着新理论、新技术的发展以及研究模式的创新,靶向RBP的治疗逐渐摆脱了既往靶向难、疗效欠佳的困局,迎来了新的机遇,通过改良精准靶向和优化组合用药等新策略,为肿瘤生物治疗注入了新的活力,对精准个体化医疗的发展具有重要意义。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 肿瘤生物治疗 肿瘤免疫治疗 肿瘤 精准医疗 转录后修饰
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RNA结合蛋白Aly/REF输出因子通过上调Yes相关蛋白表达促进胃癌细胞的增殖和迁移
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作者 李睿 邵爽 +2 位作者 孟玮 金丹 郭纪伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期622-630,共9页
胃癌是一种常见的发病率高、起病隐匿、侵袭性强的消化道恶性肿瘤,其发病机制错综复杂。RNA结合蛋白Aly/REF输出因子(RNAbinding protein Aly/REF export factor, ALYREF)作为一种RNA胞嘧啶的5-甲基化修饰(m~5C)后的结合蛋白质,在调控RN... 胃癌是一种常见的发病率高、起病隐匿、侵袭性强的消化道恶性肿瘤,其发病机制错综复杂。RNA结合蛋白Aly/REF输出因子(RNAbinding protein Aly/REF export factor, ALYREF)作为一种RNA胞嘧啶的5-甲基化修饰(m~5C)后的结合蛋白质,在调控RNA出核及稳定其表达的过程中具有关键作用;Yes相关蛋白(yes-associated protein, YAP)作为Hippo-YAP信号通路中的关键分子,调控各种恶性肿瘤的生长和转移。本文旨在探讨ALYREF与YAP在促进胃癌细胞增殖和迁移中是否存在相关性,并初步探索这两者之间的作用机制。本文在胃癌细胞AGS和MKN-45中运用RT-PCR和Western印迹方法检测相关基因表达;CCK8试验检测细胞增殖;划痕试验和Trans-well试验分别检测细胞迁移和侵袭。结果显示,过表达ALYREF后YAP的表达增加(P<0.05),并且促进细胞的增殖、迁移和上皮细胞-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)(P<0.05);靶向敲低YAP,细胞的增殖、迁移和EMT能力显著抑制(P<0.05);过表达ALYREF且靶向敲除YAP与单独过表达ALYREF相比,YAP的表达显著降低(P<0.05),且细胞的增殖、迁移和EMT能力同样得到抑制(P<0.05);靶向敲低ALYREF,细胞的增殖、克隆形成和侵袭能力显著抑制(P<0.01)。综上所述,ALYREF通过上调YAP表达进而促进胃癌细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 胃癌 增殖和迁移 rna结合蛋白Aly/REF输出因子 Yes相关蛋白
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RNA结合蛋白在肾癌发生发展中作用机制及生物学功能的研究进展
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作者 王渤文 倪少滨 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第11期2155-2160,共6页
RNA结合蛋白(RBPs)是基因调控的重要组成部分,其涉及与rRNA、ncRNA、snRNA、miRNA、mRNA和tRNA等各种类型RNA的相互作用。其表达失调可能会促进细胞增殖、促进血管生成、抑制凋亡,在多种疾病尤其是恶性肿瘤的发生发展中扮演着关键角色... RNA结合蛋白(RBPs)是基因调控的重要组成部分,其涉及与rRNA、ncRNA、snRNA、miRNA、mRNA和tRNA等各种类型RNA的相互作用。其表达失调可能会促进细胞增殖、促进血管生成、抑制凋亡,在多种疾病尤其是恶性肿瘤的发生发展中扮演着关键角色。随着对肾癌分子机制研究的逐渐深入,人们发现RBPs的异常表达与肾癌的增殖、侵袭和转移密切相关,这些研究对肾癌的诊断、治疗和预后评价提供了一些新思路。本文就RNA结合蛋白在肾癌发生发展中作用机制及生物学功能的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 肾癌 分子标志物 综述
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RNA结合蛋白参与肝癌转移过程的研究进展
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作者 袁漳辰 徐锋 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第20期3884-3888,共5页
RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)是在细胞的一系列生理过程中与RNA分子相结合、伴随RNA代谢调控的一类功能十分重要的蛋白。在肝癌的转移过程中常伴有RBP的功能异常。基于最新的相关研究,本文总结了与肝癌转移相关的RBP,并就其... RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)是在细胞的一系列生理过程中与RNA分子相结合、伴随RNA代谢调控的一类功能十分重要的蛋白。在肝癌的转移过程中常伴有RBP的功能异常。基于最新的相关研究,本文总结了与肝癌转移相关的RBP,并就其参与该过程的具体作用机制进行综述,以期为癌症治疗的新靶点提供新思路或新方法。 展开更多
关键词 肝癌 转移 rna结合蛋白
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多房棘球蚴RNA结合蛋白EWS的原核表达及其细胞定位与功能的初步鉴定
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作者 严玉婷 郭小腊 +3 位作者 孙玥 何学东 丁军涛 郑亚东 《动物医学进展》 北大核心 2023年第12期29-35,共7页
通过对多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)RNA结合蛋白EWS(EmEWS)基因的原核表达、抗体制备、细胞定位等研究,初步探究EmEWS基因特征以及与RNA的结合能力。根据Wormbase数据库中EmEWS基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增EmEWS基因... 通过对多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)RNA结合蛋白EWS(EmEWS)基因的原核表达、抗体制备、细胞定位等研究,初步探究EmEWS基因特征以及与RNA的结合能力。根据Wormbase数据库中EmEWS基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增EmEWS基因并构建重组表达质粒,诱导表达、纯化重组蛋白,制备EmEWS多克隆抗体后进行Western blot、实时荧光定量PCR、免疫荧光定位、双荧光测定。结果表明,EmEWS基因长度为1485 bp,编码495个氨基酸,在多房棘球蚴原代细胞中表达量较高,在原头蚴中最低。生物信息学分析表明,细粒棘球蚴EWS与EmEWS相似性高达98.3%,且EmEWS的RBD结构域在绦虫中高度保守。EmEWS重组蛋白大小约为54 ku,制备的多克隆抗体可识别多房棘球绦虫中天然EmEWS蛋白。细胞定位显示EmEWS主要分布在细胞膜上。双荧光试验证明EmEWS可以与结合富含UG的RNA序列结合。综合上述结果,推测EmEWS可能作为转录调控因子参与小RNA的形成,同时有助于核蛋白的运输。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 rna结合蛋白EWS基因 原核表达 多克隆抗体 免疫荧光
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