为建立快速特异的西尼罗河病毒(WNV)检测方法,本研究根据WNV基因保守区域基因序列,采用Primer Explorer Version 4设计特异性的重组酶聚合酶扩增(RPA)引物和探针。经过引物筛选和条件优化,建立了在39℃恒温条件下15 min内即可完成的实...为建立快速特异的西尼罗河病毒(WNV)检测方法,本研究根据WNV基因保守区域基因序列,采用Primer Explorer Version 4设计特异性的重组酶聚合酶扩增(RPA)引物和探针。经过引物筛选和条件优化,建立了在39℃恒温条件下15 min内即可完成的实时荧光RT-RPA方法。本方法能特异性检测出WNV,且与蓝舌病毒(BTV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪乙型脑炎病毒(JEV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)核酸检测没有交叉反应。本方法灵敏性强,最小检出量为5.25×10^(2)拷贝/μL。采用创建的RT-RPA方法检测72份牛或猪的临床样品,结果与实时荧光定量PCR方法相符。说明本试验创建的WNV RT-RPA方法操作简便、灵敏度和特异性高,适用于WNV监测、基层实验室或出入境口岸对WNV的现场快速检测。展开更多
文摘为建立快速特异的西尼罗河病毒(WNV)检测方法,本研究根据WNV基因保守区域基因序列,采用Primer Explorer Version 4设计特异性的重组酶聚合酶扩增(RPA)引物和探针。经过引物筛选和条件优化,建立了在39℃恒温条件下15 min内即可完成的实时荧光RT-RPA方法。本方法能特异性检测出WNV,且与蓝舌病毒(BTV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪乙型脑炎病毒(JEV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)核酸检测没有交叉反应。本方法灵敏性强,最小检出量为5.25×10^(2)拷贝/μL。采用创建的RT-RPA方法检测72份牛或猪的临床样品,结果与实时荧光定量PCR方法相符。说明本试验创建的WNV RT-RPA方法操作简便、灵敏度和特异性高,适用于WNV监测、基层实验室或出入境口岸对WNV的现场快速检测。
文摘为了保障食品公共卫生安全,基于实时荧光重组酶聚合酶扩增技术(RT-RPA),针对鼠伤寒沙门菌、沙门菌血清型4,[5],12:i:-共同携带的STM4495基因以及鼠伤寒沙门菌携带的flj B1,2基因,设计2条探针和一系列候选引物,并进行引物筛选、特异性试验、敏感性试验、各种方法比较检测和人工污染试验,建立一种快速检测鼠伤寒沙门菌与沙门菌血清型4,[5],12:i:-的双重RT-RPA方法。结果显示,该方法在39℃条件下20 min内完成检测,鼠伤寒沙门菌与沙门菌血清型4,[5],12:i:-的检测下限分别为25.6和251CFU/0.1 m L,不能检出其他肠道致病菌,针对猪产业链及临床样品来源的99株沙门菌与PCR、RT-PCR方法的检测结果一致,针对人工污染样品的检测结果与传统培养法一致。本研究成功建立了一种快速检测鼠伤寒沙门菌与沙门菌血清型4,[5],12:i:-的双重RT-RPA方法,具有特异性高、敏感性强的特点,快速简便,20min获取检测结果,在新鲜猪肉、临床病猪肝样品中得到初步应用。
