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Red/ET同源重组介导的基因克隆载体pBACS的构建、鉴定与应用
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作者 侯少阳 李岚芳 +5 位作者 杜丽霞 孙林慧 李典 禚惠荣 姜莉莉 张大虎 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2024年第5期590-597,共8页
目的通过Red/ET同源重组技术构建pBACS基因克隆及测序质粒载体。方法以质粒pBAC2015、pET28a为模板设计四对引物,PCR扩增得到四段彼此间有50 bp同源区域的基因片段,分别命名为bac-sop、bac-ori、bac-kan和bac-T7。利用Red/ET同源重组技... 目的通过Red/ET同源重组技术构建pBACS基因克隆及测序质粒载体。方法以质粒pBAC2015、pET28a为模板设计四对引物,PCR扩增得到四段彼此间有50 bp同源区域的基因片段,分别命名为bac-sop、bac-ori、bac-kan和bac-T7。利用Red/ET同源重组技术,将四段基因片段电转至E.coli GB05-dir感受态中进行线线重组。经酶切、测序验证阳性克隆质粒。此外,对重组质粒pBACS进行稳定性鉴定;利用pBACS分别进行细菌16S rDNA和真菌ITS基因克隆和基因测序。结果酶切和测序的验证结果显示,质粒的大小、元件方向及序列正确;pBACS具有较强的稳定性,适用于作为基因工程的克隆载体;可高效用于细菌16S rDNA和真菌ITS序列的克隆,阳性率为100%。结论成功利用Red/ET技术构建克隆载体pBACS,质粒载体具有稳定性强、重组效率高的特点,在基因克隆和基因测序等方面具有良好的应用潜力。 展开更多
关键词 pBACS 克隆 red/et技术 同源重组
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重组人生长激素辅助治疗对高龄不孕IVF⁃ET患者血清FSH、E_(2)及LH水平的影响
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作者 张皙卉 卢静 和伟 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第8期1437-1440,共4页
目的探讨在实施体外受精⁃胚胎移植(IVF⁃ET)治疗过程中使用重组人生长激素(rhGH)辅助治疗对高龄不孕症女性患者血清卵泡刺激素(FSH)、雌二醇(E_(2))及促黄体生成素(LH)水平的影响。方法回顾性选取2021年1月至2023年8月邯郸市中心医院收... 目的探讨在实施体外受精⁃胚胎移植(IVF⁃ET)治疗过程中使用重组人生长激素(rhGH)辅助治疗对高龄不孕症女性患者血清卵泡刺激素(FSH)、雌二醇(E_(2))及促黄体生成素(LH)水平的影响。方法回顾性选取2021年1月至2023年8月邯郸市中心医院收治的高龄不孕女性102例,依据治疗方案分为对照组[予促性腺激素释放激素(GnRH)拮抗剂方案治疗,n=50]、试验组(予GnRH拮抗剂方案+rhGH辅助治疗方案,n=52);比较两组促排卵结果、性激素水平(FSH、E_(2)、LH)、妊娠结局及不良反应情况。结果试验组Gn总用量、Gn使用天数比对照组少,差异有统计学意义(P<0.05);试验组获卵总个数、可移植胚胎数及优质胚胎数比对照组高,但差异无统计学意义(P>0.05)。两组治疗后的FSH、E_(2)、LH水平均下降,且试验组治疗后的FSH、E_(2)、LH水平均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。试验组治疗后取消周期率、流产率低于对照组,临床妊娠率、活产率高于对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。试验组、对照组不良反应发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论相较于GnRH拮抗剂方案单独治疗,GnRH拮抗剂+rhGH辅助治疗方案可进一步调节高龄不孕女性FSH、LH、E_(2)水平,提高获卵数、优胚率及临床妊娠率。 展开更多
关键词 重组人生长激素 不孕 IVF⁃et FSH E_(2) LH
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Preparation of Red Component in Secondary Metabolites of Recombinant Hansenula anomala N6076 and Its GC-MS Detection
3
作者 Yonghong FAN Xiang JIN Peihong MAO 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2012年第4期58-60,共3页
[ Objective] This study aimed to investigate the preparation of red component in secondary metabolites of recombinant Hansenula anomala strain N6076 and its GC-MS detection. [ Method] Thin-layer chromatography method ... [ Objective] This study aimed to investigate the preparation of red component in secondary metabolites of recombinant Hansenula anomala strain N6076 and its GC-MS detection. [ Method] Thin-layer chromatography method was applied for large-scale preparation of red component in the secondary metabolites of re- combinant H. anomala strain N6076. The red component was dissolved in anhydrous ethanol for GC-MS detection and chemical structure comparison in the data- base to identify its type. [ Resultl The red component is preliminarily identified as a quinane compound, while no compound with exactly the same structure as the red component has been found in WILEY, Nist and Nbs compound libraries. [ Conclusion] This study laid the foundation for further NMR structure identification of the obtained red component and investigation of the relationship between its structure and biolo#cal effects. 展开更多
关键词 recombinant yeast Metabolitcs red component Thin-layer chromatography GC-MS
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用Red/ET重组酶构建基因打靶载体 被引量:11
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作者 杨建岭 顾淑萍 +4 位作者 陈臣 王铸钢 许燕 费俭 YANG Jian-Ling1, GU Shu-Pir 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期919-924,共6页
基因敲除的小鼠模型是研究基因功能的一种重要资源。采用常规分子克隆的方法建立基因敲除的打靶载体存在构建效率低和难以获得长片段同源臂的缺点。因此快速高效地构建打靶载体,已成为获得特定基因敲除动物模型的关键环节。为研究Resp1... 基因敲除的小鼠模型是研究基因功能的一种重要资源。采用常规分子克隆的方法建立基因敲除的打靶载体存在构建效率低和难以获得长片段同源臂的缺点。因此快速高效地构建打靶载体,已成为获得特定基因敲除动物模型的关键环节。为研究Resp18未知功能分泌肽基因,应用一种新的DNA工程平台——Red/ET同源重组技术来构建其打靶载体,并比较了这一方法在构建不同长度同源臂中的效率。研究表明,Red/ET重组方法构建打靶载体具有很高的效率,可以获得较长的同源臂,并且不会引入突变,有助于获得更高的打靶效率。因此Red/ET重组为构建打靶载体提供了一种新的可靠的方法。 展开更多
关键词 red/et重组 基因打靶 载体
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Red/ET同源重组介导细菌人工染色体的快速修饰 被引量:4
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作者 王军平 张友明 粟永萍 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期468-473,共6页
随着基因组测序工程的实施与完成,如何对包含完整基因信息的特定细菌人工染色体(BAC)进行有目的修饰,已成为功能基因组学研究的一个重要环节.应用新近优化的Red/ET同源重组技术对目标BAC进行修饰,以pSC101-BAD-gbaA为依托质粒,采用rpsL... 随着基因组测序工程的实施与完成,如何对包含完整基因信息的特定细菌人工染色体(BAC)进行有目的修饰,已成为功能基因组学研究的一个重要环节.应用新近优化的Red/ET同源重组技术对目标BAC进行修饰,以pSC101-BAD-gbaA为依托质粒,采用rpsL鄄neo为正/反向筛选系统,可以快速、高效地对BAC进行剪切、插入、替换等操作,其中能够进行抗性筛选的一步BAC修饰只需一周时间,以插入非抗性标记基因Cre为代表的两步BAC修饰在两周内即可完成.通过阿拉伯多糖诱导调控和简单地变化培养温度,能使pSC101-BAD-gbaA依托质粒在发挥完Red/ET同源重组作用后自然消失,最终获得完整而纯净的修饰后BAC,为加快功能基因组学研究提供了一个可靠的实验平台. 展开更多
关键词 red/et同源重组 BAC修饰 功能基因组
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Red/ET重组AHBA生物合成基因簇打靶载体的构建与鉴定 被引量:1
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作者 王广林 张会图 +1 位作者 张金池 王以光 《安徽师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2009年第6期569-574,共6页
为确定3-氨基-5-羟基-苯甲酸(AHBA)生物合成基因簇在链霉菌中与次生代谢产物的关系,运用PCR技术,从33株AHBA合酶基因阳性菌株扩增与AHBA生物合成基因簇中编码AHBA合酶(A)、氧化还原酶(O)、磷酸化酶(P)基因,获得24株AOP基因阳性菌株.根... 为确定3-氨基-5-羟基-苯甲酸(AHBA)生物合成基因簇在链霉菌中与次生代谢产物的关系,运用PCR技术,从33株AHBA合酶基因阳性菌株扩增与AHBA生物合成基因簇中编码AHBA合酶(A)、氧化还原酶(O)、磷酸化酶(P)基因,获得24株AOP基因阳性菌株.根据靶基因A基因下游和P基因上游同源序列设计50 bp引物,中间插入卡那霉素抗性基因的DNA片段,进行PCR,获得外源DNA片段.经过电转化,将外源DNA片段和pKC1139-AOP重组质粒共转入含重组酶质粒大肠杆菌HS996/pSC101-BAD-gba-(Tet).在Red重组酶的作用下,外源DNA片段与重组质粒pKC1139-AOP上的AHBA基因簇的同源区域重组,构建了AHBA基因簇打靶载体.研究显示了Red/ET重组工作效率高、操作简单、精确的优点,可大大缩短构建打靶载体的时间. 展开更多
关键词 red/et重组 AHBA基因簇 打靶载体 链霉菌
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通过减毒和Red/ET同源重组构建跨界基因沉默菌株 被引量:1
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作者 杨朝霞 杨霄旭 +2 位作者 李苗苗 石小亚 向双林 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第3期208-213,共6页
"跨界基因沉默"技术是一种全新的、跨原核界与真核界的小分子RNA干扰传递技术。该技术构建了一种大肠杆菌,在这种大肠杆菌中转录的短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)能够引发真核细胞内特异性基因的RNA干扰(RNA interferenc... "跨界基因沉默"技术是一种全新的、跨原核界与真核界的小分子RNA干扰传递技术。该技术构建了一种大肠杆菌,在这种大肠杆菌中转录的短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)能够引发真核细胞内特异性基因的RNA干扰(RNA interference,RNAi),所以此大肠杆菌又被称为"跨界基因沉默菌株"。"跨界基因沉默菌株"具有RNA干扰传递功能,主要得益于"跨界干扰质粒"(trans-kingdom RNAi plasmid,TRIP)。TRIP质粒主要包含inv基因、hly基因以及能够转录shRNA的基因片段。hly基因表达的listeriolysin O蛋白可以帮助细菌逃离真核细胞的吞噬体,但listeriolysin O蛋白是一种重要的毒力因子,对宿主细胞具有一定的损害。为了克服这种缺陷,在hly基因上设计了△PEST和G486D两种减毒突变。同时,为了使减毒后的TRIP质粒能够在"跨界基因沉默菌株"中稳定存在,进一步利用Red/ET同源重组将该质粒整合进大肠杆菌的基因组中。实验结果表明,减毒、整合后的"跨界基因沉默菌株"能更好地发挥RNAi作用。该技术的完善将推进工程菌的研发和利用。 展开更多
关键词 跨界基因沉默菌株 跨界干扰质粒 hly red/et同源重组
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Red/ET重组在基因打靶载体快速构建中的应用 被引量:11
8
作者 王军平 张友明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期953-958,共6页
通过合理应用Red/ET重组技术实现基因打靶载体的快速构建。在Red/ET重组介导下,首先从基因组DNA中将靶基因片段亚克隆至打靶质粒载体中,随后将两端带有50 bp同源臂的抗性筛选基因插入并替换靶基因上的目标序列,如此两步操作即可完成一... 通过合理应用Red/ET重组技术实现基因打靶载体的快速构建。在Red/ET重组介导下,首先从基因组DNA中将靶基因片段亚克隆至打靶质粒载体中,随后将两端带有50 bp同源臂的抗性筛选基因插入并替换靶基因上的目标序列,如此两步操作即可完成一个传统型基因敲除打靶载体的构建;结合Cre-loxP系统,在传统型基因敲除打靶载体的基础上,经过再一轮的Red/ET重组就能够成功实现条件性基因敲除打靶载体的构建。整个实验过程不需要PCR扩增长、短臂序列,也不涉及酶切、连接反应,因此,不仅省时、省力,而且所构建的基因打靶载体序列准确,无突变。实验方法的建立为加速后基因组时代的基因功能研究提供了一条捷径。 展开更多
关键词 基因打靶载体构建 red/et重组 基因敲除
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Red/ET重组及其在生物医学中的应用 被引量:13
9
作者 王军平 张友明 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期502-506,共5页
通过应用Rac噬菌体的RecE RecT和λ噬菌体的RedαRedβ系统而建立的DNA工程平台———Red ET重组,是一种不依赖于限制性内切酶的分子克隆新技术。运用该技术能够介导PCR产物或寡核苷酸对目标基因进行剪切、插入、融合及突变等多种操作,... 通过应用Rac噬菌体的RecE RecT和λ噬菌体的RedαRedβ系统而建立的DNA工程平台———Red ET重组,是一种不依赖于限制性内切酶的分子克隆新技术。运用该技术能够介导PCR产物或寡核苷酸对目标基因进行剪切、插入、融合及突变等多种操作,在生物医学领域里具有广阔的应用前景,尤其在基因组功能研究中对BACs、PACs和细菌染色体的打靶修饰以及基因敲除动物DNA靶分子的快速构建等方面最有效。随着Red ET重组的推广与应用,该技术本身也在不断被改进,在工作效率得到显著提高的同时,其操作也变得更加简单、省时、省力。结合自身的一些研究结果,对Red ET重组的技术特点、发展现状和在生物医学中的应用进行了详细阐述。 展开更多
关键词 red/et重组 DNA修饰 BACs 噬菌体
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Red/ET同源重组技术在载体构建中的应用 被引量:1
10
作者 郭善军 张晓林 +1 位作者 陈章宝 曾吉 《科教导刊(电子版)》 2017年第1期168-169,共2页
Red/ET同源重组技术是以原有的重组技术为基础,利用Rac噬菌体ET系统或者噬菌体的Red系统进行外源基因重组的重组方法。该方法使同源重组过程变得更方便快捷。本文对Red/ET同源重组技术的原理,改进和载体构建方面的应用做了综述。
关键词 red/et 同源重组 噬菌体 载体构建
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Red/ET同源重组技术在载体构建中的应用 被引量:2
11
作者 曾吉祥 《生物技术世界》 2015年第7期232-233,共2页
Red/ET同源重组技术是以原有的重组技术为基础,利用Rac噬菌体ET系统或者λ噬菌体的Red系统进行外源基因重组的重组方法。该方法使同源重组过程变得更方便快捷。本文对Red/ET同源重组技术的原理,改进和载体构建方面的应用做了综述。
关键词 red/et同源重组 噬菌体载体构建
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Red/ET系统研究进展及在微生物研究中的应用 被引量:1
12
作者 徐飞 张宜平 奚涛 《药物生物技术》 CAS CSCD 2007年第3期221-224,共4页
传统的基因工程技术现已经不满足于后基因组时代的生命科学研究。新的同源重组系统-Red/ET系统具有所需同源臂短(35—60 bp),重组效率高等特点,通过诱导recE/recT或redα/redβ完成重组,可以采用各种策略对目标基因进行插入、敲除、点... 传统的基因工程技术现已经不满足于后基因组时代的生命科学研究。新的同源重组系统-Red/ET系统具有所需同源臂短(35—60 bp),重组效率高等特点,通过诱导recE/recT或redα/redβ完成重组,可以采用各种策略对目标基因进行插入、敲除、点突变等一系列修饰操作,并且不需限制性内切酶和连接酶的作用。文章针对Red/ET系统的产生背景、原理、系统改进和应用作一阐述,并对Red/ET在微生物研究中的应用作了举例。 展开更多
关键词 red/et重组系统 同源重组 DNA修饰作用 基因打靶
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利用Red/ET系统结合rpsL反向筛选敲除AcMNPV lef-10基因 被引量:1
13
作者 白玉 许晓东 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第12期181-190,198,共11页
【目的】利用Red/ET系统结合rpsL反向筛选建立苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)晚期表达因子lef-10点突变载体,为进一步研究AcMNPVlef-10的功能奠定基础。【方法】利用Red/ET系统结合rpsL反向筛选BAC修饰系统对AcMNPV lef-10进行点突... 【目的】利用Red/ET系统结合rpsL反向筛选建立苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)晚期表达因子lef-10点突变载体,为进一步研究AcMNPVlef-10的功能奠定基础。【方法】利用Red/ET系统结合rpsL反向筛选BAC修饰系统对AcMNPV lef-10进行点突变,由于lef-10和必需基因vp1054有重叠,所以在敲除lef-10时只能通过引进点突变使lef-10失活,避免影响vp1054的正常表达。首先,构建rpsL-AMP筛选盒,然后在野生型AcBacmid中引进点突变(方法是通过2次Red/ET重组:第1次重组在野生型AcBacmid lef-10中引进rpsL-AMP抗性筛选标记,形成一次重组Bacmid,第2次重组是在一次重组Bacmid中引进含点突变的lef-10片段),再利用链霉素反向筛选去除rpsL-AMP抗性筛选标记,同时引入相应的点突变。将从lef-10基因点突变重组菌中提取得到的AcBacmid与质粒pTriEx1.1和pTriEx-innateP-lef10分别共转染草地贪夜蛾Sf9细胞,同时用野生型AcBacmid与质粒pTriEx1.1共转染Sf9细胞作为对照,显微镜下观察病毒的复制情况,确定lef-10基因是否为AcMNPV的必需基因。【结果】通过对重组Bacmid的PCR鉴定和点突变序列的测定,证明AcMNPVlef-10基因已经发生点突变;通过共转染试验发现,随着转染时间的延长,lef-10补回型病毒和野生型病毒一样,均能在Sf9细胞中复制产生具有感染性的子代病毒粒子BV,从而对邻近细胞造成二次感染,使得细胞死亡,且lef-10补回型重组病毒产生感染性病毒粒子的能力与野生型基本一致;而由于lef-10缺失型重组病毒不能产生有感染性的病毒粒子,所以在被lef-10缺失型重组病毒转染的细胞中,细胞数目不会随着转染时间的增加而发生明显改变。【结论】利用Red/ET重组系统结合rpsL反向筛选系统可以在Ac MNPVlef-10基因中引入点突变,且lef-10是杆状病毒生活周期中的一个必需基因,其缺失会影响杆状病毒的复制。 展开更多
关键词 苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV) lef-10 red/et重组系统 rpsL反向筛选系统 基因敲除
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Red/ET同源重组系统介导的质粒载体快速构建
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作者 苏春 余佳 +1 位作者 邱荣国 唐莉 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期12-17,共6页
Red/ET重组技术是近年来建立的一种基于高效率体内同源重组的新型遗传工程技术,该技术简便、快速.首先,通过一步融合的方法将链霉素抗性基因和氯霉素抗性基因同时克隆至pUC19上,从而构建出含有正反选择标记的载体pRC;其次,用安普霉素抗... Red/ET重组技术是近年来建立的一种基于高效率体内同源重组的新型遗传工程技术,该技术简便、快速.首先,通过一步融合的方法将链霉素抗性基因和氯霉素抗性基因同时克隆至pUC19上,从而构建出含有正反选择标记的载体pRC;其次,用安普霉素抗性基因或者氯霉素抗性基因替换了常用表达载体pET-28b上的卡那霉素抗性基因,改变了其抗性选择标记,得到的表达载体pMT和pCT可以更广泛地应用于不同宿主中;最后,还将启动和终止表达的区域定点插入pACYC184载体中,使其成为可以独立表达蛋白的表达载体p184.本研究所得到的载体为大肠杆菌宿主菌中的基因克隆和蛋白表达提供了基础. 展开更多
关键词 red et技术 同源重组 抗性基因 一步融合 正反选择标记 克隆
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The Prokaryotic Expression and Bioactivity of the Recombinant Red Fire Ant Venom Allergen Sol i 4 被引量:3
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作者 HAN Xue-qing LIN Xiang-mei CHEN Hong-jun ZHANG Yong-guo YE Gui-sheng WU Shao-qiang LI Jian CHEN Nai-zhong CHEN Yan ZHU Shui-fang 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2009年第2期182-187,共6页
The sting of red imported fire ant (RIFA) could cause serious allergic response in fraction of people. These allergic reactions are mainly caused by its venom, especially venom allergen Sol i 1-4. To produce large a... The sting of red imported fire ant (RIFA) could cause serious allergic response in fraction of people. These allergic reactions are mainly caused by its venom, especially venom allergen Sol i 1-4. To produce large amount of RIFA venom allergen Sol i 4 for diagnosis of RIFA allergy and allergen-specific immunotherapy, the gene encoding this protein was amplified and cloned into the prokaryotic expression vector pET43, la. The recombinant plasmid was used to transform competent cells and the recombinant proteins were expressed in E. coll. SDS-PAGE and Western blotting analysis indicated that high-level expression of Sol i 4 protein was successfully achieved. Allergenic activity analysis of the recombinant allergen Sol i 4 was then performed on rabbit. The result showed that the recombinant protein obtained had significant allergenic activity. It indicated that the recombinant allergen Sol i 4 of RIFA venom was successfully expressed in E. coli, which provided foundation for further developing therapeutic and diagnosis reagents of RIFA allergy. 展开更多
关键词 red imported fire ant recombinant allergen Sol i 4 expression activity
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一种利用λRed重组技术在杀鱼爱德华氏菌基因组添加标签的方法
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作者 张淑雅 李端友 +3 位作者 刘莹莉 贺甜甜 聂品 谢海侠 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期895-902,共8页
在杀鱼爱德华氏菌病原学研究中,在动物中制备杀鱼爱德华氏菌蛋白抗体耗时长,且获得的多克隆或多肽抗体在宿主细胞中特异性差,背景信号强。为解决这一问题,对在大肠杆菌(Escherichia coli)和沙门氏菌(Salmonella)中建立起来的λRed基因... 在杀鱼爱德华氏菌病原学研究中,在动物中制备杀鱼爱德华氏菌蛋白抗体耗时长,且获得的多克隆或多肽抗体在宿主细胞中特异性差,背景信号强。为解决这一问题,对在大肠杆菌(Escherichia coli)和沙门氏菌(Salmonella)中建立起来的λRed基因编辑方法进行调整和优化,建立了在杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)基因组基因上添加HA标签序列的方法,为使用标签抗体研究杀鱼爱德华氏菌基因功能提供便利。λRed重组系统利用同源线性DNA片段与基因组DNA进行重组。即以质粒pSU315为模板,在引物上引入目的基因的特异性序列,扩增FRT序列和抗生素抗性基因;以获得的PCR产物转化携带pKD46的杀鱼爱德华氏菌,在pKD46表达的λ噬菌体的3个重组蛋白(Exo、Beta和Gam)作用下,PCR产物与杀鱼爱德华氏菌基因组发生同源重组,获得引入了抗生素抗性的靶基因缺失或靶基因携带标签序列的菌株;接着利用pKD46的温敏型特性,消除引入的pKD46;最后向杀鱼爱德华氏菌引入文章构建的表达Flp重组酶的质粒pKD46-flp,在FLP作用下,两个FRT位点之间发生重组,消除抗生素抗性基因和一个FRT位点,获得携带一个FRT位点序列、靶基因缺失或靶基因添加标签序列的杀鱼爱德华氏菌菌株。该遗传操作平台的建立为杀鱼爱德华氏菌基因功能研究提供便利条件,亦为其他水产病原细菌遗传操作方法的建立提供借鉴。 展开更多
关键词 λred重组 基因组基因标签序列添加 pKD46-flp 杀鱼爱德华氏菌
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基于代谢组和转录组的银缕梅叶片退红机制初探
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作者 周谦 黄犀 +3 位作者 罗会婷 王欢利 严灵君 汤诗杰 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1-11,共11页
为了探究银缕梅〔Parrotia subaequalis(H.T.Chang)R.M.Hao et H.T.Wei〕叶片在春季由红转绿的物质基础和分子机制,采用代谢组和转录组联合分析对银缕梅幼叶和成熟叶中差异花色苷类成分含量及差异表达基因进行比较分析,并对花色苷合成... 为了探究银缕梅〔Parrotia subaequalis(H.T.Chang)R.M.Hao et H.T.Wei〕叶片在春季由红转绿的物质基础和分子机制,采用代谢组和转录组联合分析对银缕梅幼叶和成熟叶中差异花色苷类成分含量及差异表达基因进行比较分析,并对花色苷合成关键酶基因进行生物信息学分析。结果表明:幼叶中花色苷类成分的总相对含量约为成熟叶的27倍;幼叶中锦葵色素3-O-葡萄糖苷、锦葵色素3-O-半乳糖苷和芍药花素3-O-葡萄糖苷的相对含量明显高于其他花色苷类成分,且极显著(p<0.01)高于成熟叶中对应成分的相对含量。比较幼叶和成熟叶的转录组数据,共筛选出11000个差异表达基因。GO功能富集结果显示富集到催化活性的差异表达基因最多(3000个);KEGG富集分析结果显示差异表达基因显著富集在植物激素信号转导通路和苯丙烷生物合成通路。通过与葡萄(Vitis vinifera Linn.)中已知的花色苷合成关键酶氨基酸序列进行比对,共筛选出9个银缕梅花色苷合成酶基因,并且这9个基因在幼叶中的相对表达量明显高于成熟叶。qRT-PCR结果表明:PsCHS1、PsF3′H、Ps3GT和PsAOMT的相对表达量极显著高于成熟叶。PsCHS1、PsF3′H、Ps3GT和PsAOMT分别包含393、528、461和323个氨基酸残基;4个蛋白的二级结构均以α螺旋和无规卷曲为主,其中,PsF3′H不含β转角,其余3个蛋白均由α螺旋、β转角、延伸链和无规卷曲构成;4个蛋白的三级结构均含有相应蛋白家族的保守结构。系统进化树显示:PsCHS1与红花檵木(Loropetalum chinense var.rubrum Yieh)的LcCHS,PsF3′H与枫香树(Liquidambar formosana Hance)的LfF3′H,Ps3GT与可可(Theobroma cacao Linn.)的Tc3GT,以及PsAOMT与枫香树的LfAOMT分别首先聚在一起。综上所述,锦葵色素3-O-葡萄糖苷、锦葵色素3-O-半乳糖苷和芍药花素3-O-葡萄糖苷可能是银缕梅叶片退红的主效花色苷类成分,PsCHS1、PsF3′H、Ps3GT和PsAOMT可能是银缕梅叶片退红的关键基因。 展开更多
关键词 银缕梅 叶色 退红机制 代谢组 转录组
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利用Rde/ET技术构建表达H5亚型禽流感病毒HA基因的重组火鸡疱疹病毒 被引量:10
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作者 兰德松 石星明 +6 位作者 王云峰 刘长军 王玫 崔红玉 田国彬 李继松 童光志 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期78-84,共7页
【目的】本研究以火鸡疱疹病毒(HVT)BAC分子克隆为平台,构建表达禽流感HA基因的重组火鸡疱疹病毒,以开发新型病毒活载体疫苗。【方法】利用Red/ET重组技术,经过两步法重组:第一步,用两端带有50bp大小左、右同源臂a和b的选择标记基因rpsL... 【目的】本研究以火鸡疱疹病毒(HVT)BAC分子克隆为平台,构建表达禽流感HA基因的重组火鸡疱疹病毒,以开发新型病毒活载体疫苗。【方法】利用Red/ET重组技术,经过两步法重组:第一步,用两端带有50bp大小左、右同源臂a和b的选择标记基因rpsL-neo表达盒替换HVT基因组US2区;第二步,用两端带有同样的50 bp左、右同源臂a和b的HA基因表达盒替换选择标记基因rpsL-neo表达盒。在含有氯霉素和链霉素双抗性的平板上筛选阳性克隆,经卡那霉素抗性反向筛选和PCR进一步鉴定,鉴定正确的克隆命名为pHVT-HA。提取并纯化pHVT-HA DNA,转染原代鸡胚成纤维细胞(CEF),以完成重组病毒的拯救。【结果】命名为pHVT-HA3的BAC克隆转染CEF后第4天,出现病毒噬斑,噬斑形态与野生型HVT相似,获得拯救的重组病毒,命名为rHVT-HA3,将重组病毒rHVT-HA3在CEF上连续传代培养,经PCR和间接免疫荧光检测表明,重组病毒在连续传代过程中仍能稳定表达HA蛋白。【结论】本研究以HVT BAC为平台,利用Red/ET重组技术,构建了表达禽流感A/Goose/Guangdong/3/96(H5N1)毒株的血凝素(HA)基因的重组火鸡疱疹病毒,为新型禽流感重组活载体疫苗开发奠定基础。 展开更多
关键词 火鸡疱疹病毒 细菌人工染色体 red/et克隆 禽流感病毒 HA基因
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双组分因子LiaRS调控短短芽胞杆菌X23伊短菌素生物合成的研究
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作者 邱丽婷 张亮 +5 位作者 刘天波 巢进 蔡海林 易克 刘清术 陈武 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期1036-1044,共9页
双组分系统(two-component system,TCS)参与多种芽胞杆菌次级代谢产物生物合成的调控,但调控伊短菌素生物合成的TCS鲜见报道。前期转录组测序分析发现,在短短芽胞杆菌X23中,双组分因子LiaRS与伊短菌素生物合成基因簇(edeBGC)的表达趋势... 双组分系统(two-component system,TCS)参与多种芽胞杆菌次级代谢产物生物合成的调控,但调控伊短菌素生物合成的TCS鲜见报道。前期转录组测序分析发现,在短短芽胞杆菌X23中,双组分因子LiaRS与伊短菌素生物合成基因簇(edeBGC)的表达趋势一致,推测其可能参与伊短菌素生物合成的调控,通过Red/ET同源重组法敲除野生型X23的liaS和liaR基因,构建了突变体菌株,平皿对峙培养、qRT-PCR定量分析和HPLC-MS靶向代谢分析等结果表明,在相同培养条件下,突变菌株的抑菌圈直径较野生型显著增加,伊短菌素生物合成基因簇的表达量显著上调,且伊短菌素的峰面积是野生型的1.3倍。本研究发现LiaRS是伊短菌素生物合成的负调控因子,为伊短菌素的代谢工程改造提供了候选基因元件。 展开更多
关键词 短短芽胞杆菌 伊短菌素 双组分系统 LiaRS red/et同源重组
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Gap-Repair方式建立一种基于pBR322-Red的新型重组工程系统 被引量:5
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作者 李山虎 洪鑫 +3 位作者 于梅 陈伟 黄翠芬 周建光 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期533-537,共5页
应用Gap-Repair新技术,以pBR322为载体,在λ噬菌体Red重组酶的作用下,通过同源重组直接从大肠杆菌DY330染色体上亚克隆了长度为6.7kb的包含Red重组酶基因的λ噬菌体左向操纵子基因序列。建立了一种能够随意在不同细菌宿主中转移的基于pB... 应用Gap-Repair新技术,以pBR322为载体,在λ噬菌体Red重组酶的作用下,通过同源重组直接从大肠杆菌DY330染色体上亚克隆了长度为6.7kb的包含Red重组酶基因的λ噬菌体左向操纵子基因序列。建立了一种能够随意在不同细菌宿主中转移的基于pBR32-2Red的重组工程系统。为了验证pBR32-2Red的生物功能,以大肠杆菌染色体上的galk基因为靶标,用Red介导的单链DNA重组技术敲入T→G单碱基突变,使galk基因内编码第145位氨基酸的密码子由TAT转变成TAG,产生了一个琥珀突变。确定了pBR322Red系统的重组功能。 展开更多
关键词 Gap—Repair red重组酶 重组工程
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