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梨20个品种S基因型的鉴定及新S-RNases基因的克隆 被引量:14
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作者 衡伟 张绍铃 +2 位作者 方成泉 吴华清 吴俊 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期313-318,共6页
为了鉴定我国梨品种和一些野生类型个体的S基因型,应用S-RNases特异PCR扩增、克隆和测序,对其S-RNases基因核苷酸序列进行分析,鉴定了20个梨品种和野生类型个体的S基因型。起源于我国的‘奥连’(SpS32)、‘吊蛋’(SdSe)、‘沙疙瘩’(S36... 为了鉴定我国梨品种和一些野生类型个体的S基因型,应用S-RNases特异PCR扩增、克隆和测序,对其S-RNases基因核苷酸序列进行分析,鉴定了20个梨品种和野生类型个体的S基因型。起源于我国的‘奥连’(SpS32)、‘吊蛋’(SdSe)、‘沙疙瘩’(S36Sd)品种和杏叶梨的一个类型(S22Sc)个体中存在西洋梨的S-RNases基因,证明S-RNases基因分化是在东方梨种群和西方梨种群的各个种形成之前。在秋子梨‘麦梨’、‘内蒙古山梨’中发现了2个新S-RNases基因,命名为S40-、S41-RNase(DQ903313、DQ988687)。S40-和S41-RNase基因推导的部分氨基酸序列分别与苹果属S11-和S6-RNase的同源性为100%和94.4%,这表明S-RNases的存在可能在梨属和苹果属形成之前。 展开更多
关键词 自交不亲和性 S基因型 s-rnases基因
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新疆扁桃品种自交不亲和S-Rnases基因型的分析鉴定 被引量:6
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作者 曾斌 高启明 +1 位作者 田嘉 李疆 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1400-1408,共9页
【目的】利用特异性PCR扩增、DNA测序和生物信息学方法鉴定新疆扁桃品种的S-Rnases基因型,对新疆扁桃授粉品种配置、人工授粉、遗传改良以及栽培利用都具有重要的理论意义和实践价值。【方法】以新疆24个栽培扁桃品种的叶片为试材,选用... 【目的】利用特异性PCR扩增、DNA测序和生物信息学方法鉴定新疆扁桃品种的S-Rnases基因型,对新疆扁桃授粉品种配置、人工授粉、遗传改良以及栽培利用都具有重要的理论意义和实践价值。【方法】以新疆24个栽培扁桃品种的叶片为试材,选用目前蔷薇科通用的引物组合对扁桃叶片基因组DNA进行自交不亲和S-RNases基因特异性PCR扩增,克隆测序结果比对分析,综合进行S-Rnases基因型的鉴定。【结果】利用引物组合AmyC5R+AS1Ⅱ对24个新疆栽培扁桃品种的基因组DNA进行S-Rnases基因特异性PCR,共扩增出32条清晰可辨的片段,克隆测序后,通过DNAMAN多重序列比对,发现共包括11个核苷酸序列,大小分别为1 688 bp(Sn1)、1 404 bp(S19)、1 330 bp(S61)、1 222 bp(S24)、1 141 bp(S25)、1 087 bp(S17)、979 bp(S10)、785 bp(S63)、777 bp(S6)、690 bp(S50)、602 bp(S15)。【结论】鉴定出了新疆扁桃品种的10个S-Rnases基因型,分别为阿买提(S15S17S63)、红宝石(S15S17)、莎舟(S15S17)、鹰嘴(S10S24)、矮丰(Sn1S25)、扁石头(Sn1S25)、桃扁桃(S6Sn1)、开心果(S6S61)、双果(S63Sn1)、纸皮(S50S61)。 展开更多
关键词 扁桃 自交不亲和 s-rnases 基因型
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Transcript and Sequence Analysis of S-RNases in Self-Compatible Tetraploid Chinese Cherry (Prunus pseudocerasus L.) 被引量:1
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作者 ZHANG Xiao-yan CHEN Xue-sen +3 位作者 MENG Qing-wei JIANG Yuan-mao ZHENG Yang CHEN Xiao-liu 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2010年第6期792-798,共7页
Chinese cherry (Prunus pseudocerasus L.) is an allotetraploid species and exhibits natural self-compatibility.However,the full-length cDNA sequences,functional analysis and the transcripts of S-RNase alleles in Chin... Chinese cherry (Prunus pseudocerasus L.) is an allotetraploid species and exhibits natural self-compatibility.However,the full-length cDNA sequences,functional analysis and the transcripts of S-RNase alleles in Chinese cherry cultivars are not known.In the two cultivars Taixiaohongying and Laiyang Short Cherry with S1S2S3S4 genotypes,two S-RNases were transcribed in Northern blotting,and the two full-length cDNAs of S-RNase were cloned and analyzed.As the result,the transcribed S-RNases were S1-RNase and S2-RNase.The two complete cDNA sequences of S1-RNase and S2-RNase were registered as EU073938 and EU073939,respectively,and had characteristic structure of rosaceous S-RNases based on their sequences indicating that they had normal function for S-RNase in the style.The S3-RNase and S4-RNase were not transcribed in the style and were nonfunctional for S-RNase,so S3m and S4m could be used to represent the nonfunctional S3-RNase and S4-RNase.The phylogenetic analysis implied that the S-RNases of Prunus,including Chinese cherry,had lower intra-specific similarity and diverged earlier than the divergence of species in Prunus. 展开更多
关键词 Chinese cherry SELF-COMPATIBILITY s-rnase PRUNUS TETRAPLOID
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Identification of S-RNase genotype and analysis of its origin and evolutionary patterns in Malus plants
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作者 Zhao Liu Yuan Gao +10 位作者 Kun Wang Jianrong Feng Simiao Sun Xiang Lu Lin Wang Wen Tian Guangyi Wang Zichen Li Qingshan Li Lianwen Li Dajiang Wang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第4期1205-1221,共17页
Identification of the S genotype of Malus plants will greatly promote the discovery of new genes,the cultivation and production of apple,the breeding of new varieties,and the origin and evolution of self-incompatibili... Identification of the S genotype of Malus plants will greatly promote the discovery of new genes,the cultivation and production of apple,the breeding of new varieties,and the origin and evolution of self-incompatibility in Malus plants.In this experiment,88 Malus germplasm resources,such as Aihuahong,Xishuhaitang,and Reguanzi,were used as materials.Seven gene-specific primer combinations were used in the genotype identification.PCR amplification using leaf DNA produced a single S-RNase gene fragment in all materials.The results revealed that 70 of the identified materials obtained a complete S-RNase genotype,while only one S-RNase gene was found in 18 of them.Through homology comparison and analysis,13 S-RNase genotypes were obtained:S_(1)S_(2)(Aihuahong,etc.),S_(1)S_(28)(Xixian Haitang,etc.),S_(1)S_(51)(Hebei Pingdinghaitang),S_(1)S_(3)(Xiangyangcun Daguo,etc.),S_(2)S_(3)(Zhaiyehaitang,etc.),S_(3)S_(51)(Xishan 1),S_(3)S_(28)(Huangselihaerde,etc.),S_(2)S_(28)(Honghaitang,etc.),S_(4)S_(28)(Bo 11),S_(7)S_(28)(Jiuquan Shaguo),S_(10)S_e(Dongchengguan 13),S_(10)S_(21)(Dongxiangjiao)and S_(3)S_(51)(Xiongyue Haitang).Simultaneously,the frequency of the S gene in the tested materials was analyzed.The findings revealed that different S genes had varying frequencies in Malus resources,as well as varying frequencies between intraspecific and interspecific.S_(3) had the highest frequency of 68.18%,followed by S_(1)(42.04%).In addition,the phylogenetic tree and origin evolution analysis revealed that the S gene differentiation was completed prior to the formation of various apple species,that cultivated species also evolved new S genes,and that the S_(50) gene is the oldest S allele in Malus plants.The S_(1),S_(29),and S_(33) genes in apple-cultivated species,on the other hand,may have originated in M.sieversii,M.hupehensis,and M.kansuensis,respectively.In addition to M.sieversii,M.kansuensis and M.sikkimensis may have also played a role in the origin and evolution of some Chinese apples. 展开更多
关键词 MALUS s-rnase genotype SELF-INCOMPATIBILITY origin and evolution
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20个中国李品种自交不亲和S-RNase基因型的鉴定 被引量:2
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作者 赵雅楠 郑乾明 +2 位作者 张敏 马玉华 赵德刚 《中国果树》 北大核心 2023年第11期37-42,共6页
利用蔷薇科S-RNase通用引物Pru-C2/PruCE-R以及12对特异性引物,对贵州省栽培的20个中国李(Prunus salicina Lindl.)品种叶片DNA进行PCR扩增,鉴定其S基因型。结果表明:采用S-RNase通用引物,仅11个李品种扩增出2个条带;采用12对S-RNase特... 利用蔷薇科S-RNase通用引物Pru-C2/PruCE-R以及12对特异性引物,对贵州省栽培的20个中国李(Prunus salicina Lindl.)品种叶片DNA进行PCR扩增,鉴定其S基因型。结果表明:采用S-RNase通用引物,仅11个李品种扩增出2个条带;采用12对S-RNase特异性引物,既扩增出与通用引物一样的结果,又鉴定出2个品种的S基因型。共鉴定了13个中国李品种完整的S基因型:红心李S_(h)S_(10),姜黄李S_(10)S_(20),南方李S_(i)S_(9),柰李S_(h)S_(f),槜李S_(h)S_(7),幸运S_(b)S_(c),芙蓉李S_(b)S_(i),大红袍S_(d)S_(20),前卫红S_(e)S_(h),玫瑰皇后、澳得罗达、黑宝石和秋姬李S_(b)S_(h);其余7个李品种仅鉴定出1个S基因,另1个S基因还有待进一步研究。 展开更多
关键词 自交不亲和 s-rnase基因型
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9个欧洲李品种自交不亲和S-RNase 基因的克隆及序列分析
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作者 王亚铜 玉米提·玉素甫 +5 位作者 耿文娟 章世奎 孙召展 王绍鹏 王尚栋 樊国全 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1162-1169,共8页
【目的】鉴定9个欧洲李品种自交不亲和S-RNase基因型,为提高生产效率和高效育种提供理论依据。【方法】利用2对蔷薇科通用引物对9个欧洲李品种的叶片基因组DNA进行特异性PCR扩增,片段回收,将克隆测序的结果在GenBank数据库中进行同源性... 【目的】鉴定9个欧洲李品种自交不亲和S-RNase基因型,为提高生产效率和高效育种提供理论依据。【方法】利用2对蔷薇科通用引物对9个欧洲李品种的叶片基因组DNA进行特异性PCR扩增,片段回收,将克隆测序的结果在GenBank数据库中进行同源性比对并分析序列。【结果】9个欧洲李品种均扩增出2条带,鉴定出9个样品中的8个欧洲李品种的S基因型,其中理查德早生和斯泰勒的S基因型相同为S1S9,法兰西和Silvia的S基因型相同为S1S5,乌孜干1号、总统、Decbrowice和女神的S基因型分别为S1S11、S6SSJ、S1SSJ、SSAS11,塔城酸梅仅鉴定出具有一条S1-RNase等位基因,未能确定出其S基因型。基因频率分析发现S1-RNase基因出现频率最高,S6-RNase和SSA-RNase基因频率最低。欧洲李SSA、S6、S9、SSJ和S5亲缘关系较近,参试李亚科树种的S-RNase基因不能单独聚成一个亚类,而是彼此交错分布在李亚科各个分支中。【结论】欧洲李的S基因型是由2种不同的S等位基因组成,鉴定的9个样品中,有8个欧洲李品种得到完整的S基因型,其中S1-RNase基因出现频率最高,李亚科植物S基因的分化早于各个种形成之前,而S基因种内的进化发生在各自单独的系统中。 展开更多
关键词 欧洲李 自交不亲和 s-rnase基因 克隆
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Rapid evolution of T2/S-RNase genes in Fragaria linked to multiple transitions from self-incompatibility to self-compatibility 被引量:1
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作者 Wu Chen Hong Wan +4 位作者 Fang Liu Haiyuan Du Chengjun Zhang Weishu Fan Andan Zhu 《Plant Diversity》 SCIE CAS CSCD 2023年第2期219-228,共10页
The T2/RNase gene family is widespread in eukaryotes,and particular members of this family play critical roles in the gametophytic self-incompatibility(GSI) system in plants.Wild diploid strawberry(Fragaria)species ha... The T2/RNase gene family is widespread in eukaryotes,and particular members of this family play critical roles in the gametophytic self-incompatibility(GSI) system in plants.Wild diploid strawberry(Fragaria)species have diversified their sexual systems via self-incompatible and self-compatible traits,yet how these traits evolved in Fragaria remains elusive.By integrating the published and de novo assembled genomes and the newly generated RNA-seq data,members of the RNase T2 gene family were systematically identified in six Fragaria species,including three self-incompatible species(Fragaria nipponica,Fragaria nubicola,and Fragaria viridis) and three self-compatible species(Fragaria nilgerrensis,Fragaria vesca,and Fragaria iinumae).In total,115 RNase T2 genes were identified in the six Fragaria genomes and can be classified into three classes(Ⅰ-Ⅲ) according to phylogenetic analysis.The identified RNase T2 genes could be divided into 22 homologous gene sets according to amino acid sequence similarity and phylogenetic and syntenic relationships.We found that extensive gene loss and pseudogenization coupled with small-scale duplications mainly accounted for variations in the RNase T2 gene numbers in Fragaria.Multiple copies of homologous genes were mainly generated from tandem and segmental duplication events.Furthermore,we newly identified five S-RNase genes in three self-incompatible Fragaria genomes,including two in F.nipponica,two in F.viridis,and one in F.nubicola,which fit for typical features of a pistil determinant,including highly pistil-specific expression,highly polymorphic proteins and alkaline isoelectric point(pI),while no S-RNase genes were found in all three selfcompatible Fragaria species.Surprisingly,these T2/S-RNase genes contain at least one large intron(>10 kb).This study revealed that the rapid evolution of T2/S-RNase genes within the Fragaria genus could be associated with its sexual mode,and repeated evolution of the self-compatible traits in Fragaria was convergent via losses of S-RNase. 展开更多
关键词 FRAGARIA RNase T2 Self-(in)compatibility s-rnase
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Petunia Germinating Pollen S/D3 Interacts with S-RNases in Petunia hybrida Vilm.
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作者 Yan-Xia Guo Yan-Sheng Zhang Yong-Biao Xue 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第5期584-590,共7页
Self-Incompatibility (SI) Is a genetic mechanism of self/non-self pollen recognition to prevent self-fertilization In many flowering plants and, In most cases, this is controlled by a multl-allellc S-locus. S-RNase ... Self-Incompatibility (SI) Is a genetic mechanism of self/non-self pollen recognition to prevent self-fertilization In many flowering plants and, In most cases, this is controlled by a multl-allellc S-locus. S-RNase and Slocus F box (SLF) proteins have been shown to be the female and male determinants of gametophytlc selfIncompatibility (GSI), respectively, In the Solanaceae, Scrophulariaceae and Rosaceae. Nevertheless, It is thought that additional factors are required for the SI response. Herein, we constructed a mature anther cDNA library from a self-Incompatible Petunia hybrida Vllm. line of the S3S3 haplotype. Using AhS2-RNase from Antirrhinum hispanicum as a bait for yeast two-hybrid screening, we found that petunia germinating pollen (PGP) S/D3 was capable of Interacting physically with the bait. However, the Interaction lacked haplotype specificity. The PGPS/D3 gene Is a single copy gene that Is expressed In tissues such as the style, ovary, pollen, and leaf. The PGPS/D3::GFP (green fluorescence protein) construct was detected In both the membrane and cytoplasm. The Implications of these findings In the operation of S-RNase-based SI are discussed. 展开更多
关键词 petunia germinating pollen (PGP) S/D3 Petunia hybrida SELF-INCOMPATIBILITY s-rnase.
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四川地区甜樱桃S基因型及SFB4'基因的分子鉴定
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作者 张号楠 李沛华 +2 位作者 梁东 王进 吕秀兰 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期418-426,共9页
【目的】甜樱桃(Cerasus avium L.)的S基因决定其自交的亲和性。为鉴定四川地区甜樱桃品种的S基因型和高自交亲和性品种,本研究对收集到的39份甜樱桃材料进行S基因型鉴定,并比较SFB4与其自交亲和突变体SFB4'基因的差异。【方法】利... 【目的】甜樱桃(Cerasus avium L.)的S基因决定其自交的亲和性。为鉴定四川地区甜樱桃品种的S基因型和高自交亲和性品种,本研究对收集到的39份甜樱桃材料进行S基因型鉴定,并比较SFB4与其自交亲和突变体SFB4'基因的差异。【方法】利用S基因通用引物和特异引物对四川地区种植的39份甜樱桃叶片DNA进行PCR扩增,并对含有SFB4/SFB4'基因的扩增片段进行测序。【结果】39份甜樱桃材料共鉴定出S1、S2、S3、S4、S6、S9等6个基因型,其中27份材料含有S3基因,19份材料含有S9基因,12份材料含有S1基因,11份材料含有S4基因,7份材料含有S6基因,3份材料含有S2基因。根据鉴定得到的S基因型结果,扩增得到含有S4基因的11份材料中的SFB基因的ORF序列,比对结果显示,相比于SFB4,SFB4'在903 bp处存在4个碱基缺失;本研究设计了SFB4'特异引物,测序结果显示,有7份材料的SFB基因型为SFB4'。【结论】共鉴定得到S1、S2、S3、S4、S6、S9等6个基因型,对含有S4基因的11份材料的S4基因全长进行测序,确定7份材料为突变基因SFB4'。本研究为四川地区甜樱桃授粉树配置提供了数据支撑,并为甜樱桃新品种的选育奠定了理论基础。 展开更多
关键词 甜樱桃 自交亲和性 s-rnase SFB
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11个中国杏品种S-RNase基因的检测与序列分析 被引量:13
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作者 吴俊 谷超 +4 位作者 张绍铃 张树军 宋宏峰 赵习平 刘铁铮 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期37-42,共6页
以11个未知基因型的中国杏品种为试材,根据李属植物S-RNase基因保守区设计2对引物组合检测各品种S-RNase基因,共获得22条等位扩增片段,电泳检测表明所有品种的扩增条带集中在300-1100bp的范围内,且表现出一定的长度多态性。序列分析进... 以11个未知基因型的中国杏品种为试材,根据李属植物S-RNase基因保守区设计2对引物组合检测各品种S-RNase基因,共获得22条等位扩增片段,电泳检测表明所有品种的扩增条带集中在300-1100bp的范围内,且表现出一定的长度多态性。序列分析进一步确定22个S-RNase基因为10个不同的等位基因,其中6个为首次发现,根据Gen-Bank中已登陆的杏S-RNase基因的顺序,分别命名为S19、S20、S23、S24、S25、S26,序列登陆号为:EF185300、EF185301、EU037262、EU037263、EU037264、EU037265。推导氨基酸序列的同源分析表明,杏的S-RNase与李属植物的S-RNase表现较高的同源性,为59.3%-100%;与苹果和梨的S-RNase同源性较低,为19.6%-31.6%。试验确定11个中国杏品种资源的自交不亲和基因型分别为:‘大果杏’S19/S20,‘张公园’S24/S25,‘二红’S9/S11,‘黄口外’S11/S26,‘植丸子’S11/S17,‘宇宙红’、‘大丰’S17/S23,‘超仁’、‘虹桥’S8/S11,‘冀光’、‘中华大杏梅’S8/S9;部分品种的田间杂交授粉座果与花粉管荧光显微镜观察证实了所鉴定基因型的可靠性。 展开更多
关键词 自交不亲和性 s-rnase 等位PCR扩增 基因型
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扁桃SLF基因和S-RNase基因的克隆及表达分析 被引量:11
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作者 郭振宇 常凤启 +2 位作者 谢华 徐勇 马荣才 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1185-1192,共8页
以扁桃‘Pioneer’品种为材料,利用RT-PCR及RACE技术,克隆了1个新的SLF(SLocusF-box)基因(PdSLF1)和两个新的S-RNase基因(PdSm和PdSn)的cDNA。PdSLF1全长1331bp,编码376个氨基酸;PdSm全长826bp,编码228个氨基酸;PdSn基因全长878bp,编码... 以扁桃‘Pioneer’品种为材料,利用RT-PCR及RACE技术,克隆了1个新的SLF(SLocusF-box)基因(PdSLF1)和两个新的S-RNase基因(PdSm和PdSn)的cDNA。PdSLF1全长1331bp,编码376个氨基酸;PdSm全长826bp,编码228个氨基酸;PdSn基因全长878bp,编码227个氨基酸。与公共数据库中的序列进行相似性比较,发现这3个基因所编码的氨基酸序列与其它蔷薇科植物相应基因的氨基酸序列均具有较高的一致性,PdSLF1为70.2%~84.8%,S-RNase为59%~83.9%。PdSLF1基因在花药中专一性表达,而PdSm和PdSn基因在雌蕊中专一性表达。 展开更多
关键词 扁桃 自交不亲和 基因 克隆 s-rnase
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南疆杏品种自交不亲和S-RNase基因型的鉴定 被引量:10
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作者 姜新 曹晓艳 +3 位作者 王大江 冯建荣 刘月霞 樊新民 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期569-576,共8页
【目的】为鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和S-RNase基因型,【方法】以新疆27个主栽杏品种的叶片为试材,利用蔷薇科通用引物组合:EM-PC2consFD+EM-PC3consRD、PaConsⅡ-F+PaConsⅡ-R和PruC2+PruC5对其基因组DNA进行了特异等位PCR扩增,将克... 【目的】为鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和S-RNase基因型,【方法】以新疆27个主栽杏品种的叶片为试材,利用蔷薇科通用引物组合:EM-PC2consFD+EM-PC3consRD、PaConsⅡ-F+PaConsⅡ-R和PruC2+PruC5对其基因组DNA进行了特异等位PCR扩增,将克隆测序结果在GenBank上进行同源性比对。【结果】结果表明,27个新疆杏品种成功扩增出54个基因片段,其核苷酸序列共包括19个不同的S-RNase基因,其中4个为GenBank上登陆的已知杏属S-RNase基因,分别定名为S24(588 bp)、S14(708 bp)、S23(972 bp)、S21(971bp),15个为新的S-RNase基因,暂时分别命名为S40(572 bp,登陆号:HQ342870、S41(401 bp,登陆号:HQ342871)、S42(357 bp,登陆号:HQ342872)、S43(493bp,登陆号:HQ342873)、S44(657 bp,登陆号:HQ342874)、S45(1 294 bp,登陆号:HQ342875)、S46(830 bp,登陆号:HQ342876)、S47(575 bp,登陆号:HQ342877)、S48(594 bp)(登陆号:HQ342878)、S49(653 bp,登陆号:HQ342879)、S50(659 bp,登陆号:HQ342880)、S51(768 bp,登陆号:HQ342881)、S52(1 520 bp,登陆号:HQ342882)、‘赛买提’S65(594 bp,登陆号:JQ327151)、‘小白杏’S66(709 bp,登陆号:JQ327152)。鉴定的27个新疆杏品种的S-RNase基因型分别为:S23S14(‘晚熟胡安娜’、‘何谢克’、‘贝新纳尔’);S52S14(‘乔尔胖’、‘馒头玉吕克’);S14S47(‘克孜阿恰’、‘元旦杏’、‘辣椒杏’);S23S4(‘莎车黑叶杏’、‘库车托咏’、‘安江胡安娜’);S52S23(‘索格佳娜丽’);S52S51(‘冬杏’);S52S50(‘苏陆克’);S52S40(‘卡巴克胡安娜’);S43S41(‘贾格达玛依桑’、‘洪得克’、‘脆佳娜丽’、‘拉胡安娜’、‘克孜佳娜丽’);S45S42(‘毛拉肖’);S45S46(‘托乎提’);S45S44(‘赛来玉吕克’);S49S24(‘库尔勒托咏’、‘黄肉油杏’);S21S65(‘赛买提’);S52S66(‘小白杏’)。【结论】研究鉴定出27个新疆杏品种自交不亲和雌蕊的S基因型,为杏品种商业化栽培配置适宜授粉树提供了理论依据。 展开更多
关键词 自交不亲和 s-rnase基因 S-基因型
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‘凯特’与‘新世纪’杏自交不亲和S-RNase基因的检测及克隆 被引量:10
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作者 冯建荣 陈学森 吴燕 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期129-132,共4页
Frozen young leaves of apricot(Armeniaca vulgaris) ‘Katy’ and ‘Xinshiji’ were used for isolation of total DNA. Total RNA was isolated from their styles at the balloon stage. DNA and cDNA were amplified through PCR... Frozen young leaves of apricot(Armeniaca vulgaris) ‘Katy’ and ‘Xinshiji’ were used for isolation of total DNA. Total RNA was isolated from their styles at the balloon stage. DNA and cDNA were amplified through PCR using AS1 Ⅱ and ArmyC5R as primers designed according to the conserved (C1,C5) sequences of Rosaceae S-RNases. Three S-RNase genes,P.a S8 from ‘Katy’ and P.a S9,P.a S10 from ‘Xinshiji’,were amplified and cloned. Amplified DNA bands were different sizes: P.a S8 of 927 bp,P.a S9 of 992 bp,P.a S10 of 583 bp,and cDNA bands were 521 bp,521 bp,479 bp,respectively. The results of Blastn in GenBank showed that they were novel S-RNase genes and they have been deposited in GenBank (Accession No.: AY884212,AY864826,AY864825,AY853594 and AY846872). Genomic sequences showed an intron structure between C1 and C5 region. The introns of P.a S8,P.a S9,and P.a S10 were 406 bp,471 bp,104 bp and lay in the hypervariable region (RHV) between C2 and C3. Three genes were compared and displayed similarity at the nucleotide and deduced amino acid level. Most of amino acid sequences of S-RNase gene in Prunoideae (Rosaceae) were used to form their phyligenetic tree. The evolutionary relationships showed S-RNase genes did not form a distinct cluster within species. Intra-species similarity was not higher than inter-species one. Therefore,we speculated that the evolutionary of S-RNase genes in Prunoideae was not consisted with that of species. 展开更多
关键词 自交不亲和 s-rnase基因 序列
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基于cDNA芯片的梨品种S基因型鉴定及新S-RNase基因进化分析 被引量:5
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作者 江南 张琳 +2 位作者 谭晓风 谭慧 张靖国 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期520-529,共10页
梨品种S基因型鉴定对梨栽培中授粉品种选择和遗传育种都具有重要意义。本研究利用梨S-RNase基因荧光标记的特异引物PCR扩增获得梨品种荧光标记的cDNA特异产物;进一步完善梨S-RNase基因cDNA芯片,以被检测梨品种cDNA特异序列与梨S-RNase基... 梨品种S基因型鉴定对梨栽培中授粉品种选择和遗传育种都具有重要意义。本研究利用梨S-RNase基因荧光标记的特异引物PCR扩增获得梨品种荧光标记的cDNA特异产物;进一步完善梨S-RNase基因cDNA芯片,以被检测梨品种cDNA特异序列与梨S-RNase基因cDNA芯片杂交检测不同梨品种S基因型,并发现新的S-RNase基因。结果表明:利用梨S-RNase基因cDNA芯片鉴定了泸定王皮梨、兴山24号、弥渡百合等35个未知S基因型梨品种,确定了各品种的S基因型。结合PCRRFLP及DNA克隆和测序等技术,发现了7个新的S-RNase基因资源,获得了新S-RNase基因序列。序列分析表明各新S-RNase基因均具有S-RNase基因特异区域序列的典型特征;进化分析显示7个新S-RNase基因主要属于蔷薇科苹果亚科S-RNase类群,且存在种间和属间比种内和属内进化关系更近的现象。7个新的S基因分别命名为:PpS_(53)(Pyrus pyrifolia S53)、PpS_(54)、PpS_(55)、PpS_(56)、PpS_(57)、PpS_(58)和PpS_(59),GenBank登录号分别为:KX581753、KX581754、KX581755、KX581756、KX581757、KX581751和KX581752。 展开更多
关键词 s-rnase基因 CDNA芯片 S基因型 进化分析
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2个中亚杏S-RNase基因全长的克隆与序列分析 被引量:4
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作者 李亚兰 刘小芳 +2 位作者 刘海楠 李文慧 冯建荣 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1047-1054,共8页
【目的】克隆中亚杏(Prunus armeniaca)品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列,为分子手段调控杏自交不亲和性状奠定基础。【方法】以新疆栽培杏品种‘索格佳娜丽’和‘赛买提’为试材,利用RT-PCR克隆2个品种的花柱SRNase基因c DNA片段... 【目的】克隆中亚杏(Prunus armeniaca)品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列,为分子手段调控杏自交不亲和性状奠定基础。【方法】以新疆栽培杏品种‘索格佳娜丽’和‘赛买提’为试材,利用RT-PCR克隆2个品种的花柱SRNase基因c DNA片段,RACE技术进行c DNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam软件分析2个基因的编码蛋白特性,MEGA 5.0构建进化树。【结果】从‘索格佳娜丽’中克隆了S_(52)-RNase(KF951503)基因,从‘赛买提’中克隆了一个新的S_(53)-RNase(KF975455)基因DNA和c DNA全长序列。S_(52)-RNase的DNA全长2 200 bp,c DNA全长765 bp,ORF(开放阅读框)长681 bp,编码226个氨基酸;S_(53)-RNase的DNA全长1 664 bp,c DNA全长907 bp,ORF长732 bp,编码242个氨基酸。BLASTP比对显示:这2个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族。预测相对分子质量分别为26.5 ku和27.5 ku,等电点为9.36和9.03,都属于亲水性蛋白。进化分析表明,S_(52)与李(Prunus salicina,S_7)、S_(53)与大岛樱(Prunus speciosa,S_(13))亲缘关系最近,S_(52)和S_(53)处在2个不同的分支上,表现出较高的序列多态性,表明2个基因亲缘关系较远。【结论】获得了2个中亚杏品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列。 展开更多
关键词 自交不亲和 s-rnase基因 RACE
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杏自交不亲和性S-RNase基因型的检测 被引量:5
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作者 冯建荣 陈学森 +2 位作者 吴燕 杨献科 王华磊 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第2期168-171,共4页
以凯特、新世纪以及凯特×新世纪杏杂交后代群体(F1)株系为试材,进行自花授粉,利用荧光显微镜观察授粉后花粉管生长动态,进行S基因特异PCR扩增,并对花柱中RNA进行RT-PCR。研究结果表明:自交亲和的花粉管能顺利进入子房,而自交不亲... 以凯特、新世纪以及凯特×新世纪杏杂交后代群体(F1)株系为试材,进行自花授粉,利用荧光显微镜观察授粉后花粉管生长动态,进行S基因特异PCR扩增,并对花柱中RNA进行RT-PCR。研究结果表明:自交亲和的花粉管能顺利进入子房,而自交不亲和的花粉管顶端膨大呈球形,停止向下生长;发现凯特×新世纪的杂种后代群体中有4种S基因型,杂种后代相同S基因型中存在自交亲和与自交不亲和的分化;田间杂交坐果率符合S基因检测的预测。 展开更多
关键词 授粉 结实 自交亲和性 s-rnase基因
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苹果属S-RNase基因的进化研究 被引量:3
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作者 唐亮 马香 +1 位作者 李明霞 周志钦 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第13期2717-2729,共13页
【目的】通过分析苹果属植物自交不亲合性位点S-RNase基因的序列,研究S-RNase基因在苹果属的进化历史,序列分歧特点和遗传多态性。【方法】利用栽培苹果的S-RNase基因序列在GenBank数据库中检索和鉴定所有已知的苹果属植物的S-RNase基因... 【目的】通过分析苹果属植物自交不亲合性位点S-RNase基因的序列,研究S-RNase基因在苹果属的进化历史,序列分歧特点和遗传多态性。【方法】利用栽培苹果的S-RNase基因序列在GenBank数据库中检索和鉴定所有已知的苹果属植物的S-RNase基因,同时利用S-RNase基因的保守引物获得陇东海棠和变叶海棠的S-RNase基因序列。通过系统发育分析研究S-RNase基因的进化历史,进而计算dN/dS比值揭示S-RNase基因序列分歧的特点,最后估计并比较苹果属不同类群S-RNase基因的遗传多态性及其遗传分化。【结果】苹果属植物的S-RNase基因可以分为16个亚类,同一亚类S-RNase基因的序列分歧较小,亚类之间的分歧很大。S-RNase基因的成对dN/dS比值中有50%的大于1,并且滑动窗分析显示S-RNase基因具有多个dN/dS比值显著大于1的区域。栽培苹果和野生苹果在S-RNase基因的遗传多态性上没有明显差异。在所涉及的苹果属野生类群中,栽培苹果与塞威士苹果在S-RNase基因上的遗传分化最小。【结论】适应性氨基酸替换在苹果属植物S-RNase基因的序列分歧上发挥了重要作用。现有的S-RNase基因数据显示栽培驯化没有导致栽培苹果S-RNase基因遗传多态性的降低,基于S-RNase基因的遗传分化支持栽培苹果是由塞威士苹果驯化而来的观点。 展开更多
关键词 苹果属 s-rnase基因 进化历史 序列分歧 遗传多态性
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梨花柱S-RNase对花粉管内CaM分布的影响 被引量:3
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作者 周建涛 姜雪婷 +1 位作者 王春雷 张绍铃 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1134-1138,共5页
采用免疫胶体金定位和电子显微技术研究了离体条件下梨花柱S-RNase对自花、异花花粉管中钙调素(CaM)分布的影响.结果显示:(1)花粉管中CaM主要分布在质膜附近,在细胞壁上也有少量分布.(2)不亲和(自花)花柱S-RNase处理后花粉管远离质膜的... 采用免疫胶体金定位和电子显微技术研究了离体条件下梨花柱S-RNase对自花、异花花粉管中钙调素(CaM)分布的影响.结果显示:(1)花粉管中CaM主要分布在质膜附近,在细胞壁上也有少量分布.(2)不亲和(自花)花柱S-RNase处理后花粉管远离质膜的位置发现CaM,处理24h后在花粉管中部出现CaM,且CaM位置向花粉管内部移动;而亲和(异花)S-RNase处理后花粉管的CaM分布没有明显变化.研究表明,CaM参与了自交不亲和反应过程. 展开更多
关键词 花柱s-rnase 钙调素 免疫胶体金 透射电镜技术
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2个野扁桃自交不亲和S-RNase基因全长的克隆与序列分析 被引量:3
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作者 关鹏 曾斌 +5 位作者 李疆 罗淑萍 王建友 李伟阳 田嘉 李鹏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期905-916,共12页
【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采... 【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因SRNase全长序列,为自交不亲和性的分子调控奠定基础。【方法】以新疆野扁桃花柱为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆S-RNase基因全长,采用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun对推导的氨基酸序列进行分析。【结果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均属于RNase T2基因家族,与其他多种植物的S-RNase基因的序列相似度为83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型结构。Pt S16-RNase基因ORF长690 bp,编码229个氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸。预测2个S-RNase蛋白均为亲水性、不稳定的分泌蛋白,二级结构均以α-螺旋、延伸链和无规卷曲为主,在蔷薇科李属植物中具有较高的系统进化一致性,可能的主要功能为水解酶和激素。【结论】获得2个新疆野扁桃自交不亲和性花柱特异性决定因子编码基因S-RNase全长序列。 展开更多
关键词 野扁桃 自交不亲和性 s-rnase基因 生物信息学 RACE
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离体梨花柱S-RNase对自体花粉管超微结构变化的影响 被引量:3
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作者 刘珠琴 张绍铃 徐国华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期841-846,共6页
采用透射电子显微镜研究了离体条件下‘今村秋’、‘丰水’梨花柱S-RNase对‘今村秋’花粉管生长过程中花粉管超微结构的影响。‘丰水’花柱S-RNase处理的‘今村秋’花粉管(异体,亲和)和对照花粉管结构在生长过程中表现正常,即花粉管顶... 采用透射电子显微镜研究了离体条件下‘今村秋’、‘丰水’梨花柱S-RNase对‘今村秋’花粉管生长过程中花粉管超微结构的影响。‘丰水’花柱S-RNase处理的‘今村秋’花粉管(异体,亲和)和对照花粉管结构在生长过程中表现正常,即花粉管顶端生长区域充满细胞质和细胞器,结构完整,花粉管壁上没有胼胝质层分布。而‘今村秋’花柱S-RNase处理的‘今村秋’花粉管(自体,不亲和)超微结构随时间的延长出现衰退现象。处理3h时,自体花粉管内充满细胞质和细胞器,结构完整,但在花粉管的极顶端分泌小泡融合,并且此区域的细胞壁比后部的薄;处理8h后,细胞器出现一定程度的衰退现象,线粒体膨大,嵴减少或消失,内质网膨大并包围在液泡和其它细胞器周围,液泡融合并侵蚀周围的细胞质和细胞器;到24h时,自体花粉管内线粒体、内质网等细胞器消失,只有靠近花粉管前端有少量细胞质存在,细胞壁增厚,并且有一层厚厚的胼胝质层紧靠细胞壁。结果表明,花柱S-RNase能引起自体花粉管的衰退,从而抑制自体花粉管生长。 展开更多
关键词 自交不亲和性 s-rnase 花粉管 超微结构
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