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SARS-CoV-2合并感染患者的病原微生物分布特征及耐药性分析
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作者 吉金山 赵娜 +2 位作者 王莉 谷秀娟 赵菊梅 《延安大学学报(医学科学版)》 2024年第1期24-28,共5页
目的分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)合并感染患者病原微生物分布特点及耐药情况,为临床诊治提供依据。方法收集2022年12月至2023年2月延安大学附属医院收治的2019冠状... 目的分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)合并感染患者病原微生物分布特点及耐药情况,为临床诊治提供依据。方法收集2022年12月至2023年2月延安大学附属医院收治的2019冠状病毒病(corona virus disease 2019,COVID-19)患者637例的临床资料,回顾性分析其临床特征及合并感染病原微生物情况。结果COVID-19患者以老年人为主,合并基础疾病患者占79.59%,好转及痊愈患者高达91.05%。培养阳性标本来源于呼吸道、血液和尿液,合并感染的病原微生物分别以肺炎克雷伯杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌(coagulase negative staphylococci,CNS)和真菌为主。药敏试验结果显示,肺炎克雷伯杆菌对β内酰胺类抗生素及三代、四代头孢菌素类抗生素耐药率较低(14%~20%),鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类抗生素和β内酰胺类复合物较为耐药(均>45%),大肠埃希菌对β内酰胺类抗生素及其复合物耐药率较低(14%~19%)。金黄色葡萄球菌、CNS、屎肠球菌、粪肠球菌均未发现对万古霉素、利奈唑胺、替加环素耐药。结论COVID-19合并感染病原体以革兰阴性菌及真菌为主,感染部位以呼吸道为主,主要病原菌为肺炎克雷伯杆菌。鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类抗生素和β内酰胺类复合物耐药率高于全国细菌耐药平均水平,提示临床上应根据COVID-19患者的微生物鉴定和药敏试验结果,选择对症药物治疗,以改善患者预后。 展开更多
关键词 sars-cov-2 COVID-19 细菌感染 真菌感染 耐药性
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糖尿病患者接种SARS-Cov-2疫苗后的免疫反应:系统评价
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作者 王婧 刘艳 +1 位作者 陈雅菲 苗茂华 《中国现代医生》 2024年第6期6-11,共6页
目的系统评价糖尿病患者在接种SARS-CoV-2疫苗后的体液和细胞免疫反应。方法检索Web of Science、PubMed、中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊全文数据库和中国生物医学文献数据库,获取国内外于2019年12月1日至2022年5... 目的系统评价糖尿病患者在接种SARS-CoV-2疫苗后的体液和细胞免疫反应。方法检索Web of Science、PubMed、中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文科技期刊全文数据库和中国生物医学文献数据库,获取国内外于2019年12月1日至2022年5月12日公开发表的有关糖尿病患者接种SARS-CoV-2疫苗后的体液和细胞免疫反应的观察性研究,经由2名研究者独立筛选文献和提取资料后,采用美国国立卫生研究质量评价工具对纳入文献进行偏倚风险评价,使用描述性统计方法进行汇总分析。结果13篇文献共纳入66651例研究对象,其中5874例(7.9%)患有糖尿病。7篇文献报道了接种第1剂疫苗后糖尿病患者和对照组的免疫反应,其中3篇文献表明,接种1剂SARS-CoV-2疫苗后,糖尿病患者血清抗体水平和阳性率低于对照组;11篇涉及接种2剂SARS-CoV-2疫苗后的免疫反应的文献中,2篇报道了糖尿病患者可产生与对照组相似的抗体反应,9篇报道了糖尿病患者的血清抗体水平、阳性率或细胞免疫反应低于对照组。结论接种SARS-CoV-2疫苗后糖尿病患者和对照组体液和细胞免疫反应均有所增加,但糖尿病患者增加幅度普遍低于对照组。 展开更多
关键词 sars-cov-2疫苗 体液免疫 细胞免疫 糖尿病
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SARS-CoV-2重组痘苗病毒疫苗rVTT△TK-RBD的构建、筛选及免疫原性研究
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作者 赵仁双 朱羿龙 +10 位作者 尚超 韩继成 刘子睿 修志儒 李善智 李雅茹 杨霞 李霄 金宁一 金鑫 李一权 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期19-25,共7页
目的 构建重组痘苗病毒载体疫苗rVTT△TK-RBD,并评价其安全性和免疫原性。方法 参考严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因序列合成受体结合域(RBD)基因,并将其插入自主构建的重组质粒pSTKE的多克隆位点上,构建重组痘苗病毒穿梭... 目的 构建重组痘苗病毒载体疫苗rVTT△TK-RBD,并评价其安全性和免疫原性。方法 参考严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因序列合成受体结合域(RBD)基因,并将其插入自主构建的重组质粒pSTKE的多克隆位点上,构建重组痘苗病毒穿梭载体pSTKE-RBD,并转染到预先感染天坛株痘苗病毒(VTT)的BHK-21细胞内,经多轮的荧光噬斑筛选成功获得重组痘苗病毒rVTT△TK-RBD;通过滴鼻方式免疫小鼠后,检测rVTT△TK-RBD对BALB/c小鼠体质量的影响;通过肌肉免疫小鼠后,分析rVTT△TK-RBD对BALB/c小鼠产生的特异性抗体和中和抗体的水平;通过流式细胞术检测rVTT△TK-RBD对BALB/c小鼠T细胞亚群的影响。结果 利用同源重组、增强型绿色荧光蛋白(EGFP)筛选标记和多次荧光噬斑筛选,成功筛选获得了表达RBD的胸腺激酶(TK)基因缺失型重组痘苗病毒rVTT△TK-RBD,且PCR验证成功。BALB/c小鼠体内实验表明rVTT△TK-RBD具有较好的抗SARS-CoV-2的免疫原性且相比于亲本株VTT明显降低了对机体的毒性作用。结论 成功构建并获得SARS-CoV-2重组痘苗病毒疫苗rVTT△TK-RBD并通过各项试验证明其安全性和免疫原性。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(sars-cov-2) 天坛株痘苗病毒 TK基因 同源重组
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基于双核酸适配体的磁珠-SERS标签三明治结构用于SARS-CoV-2病毒表面S蛋白的快速检测
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作者 田先敏 许珊珊 +4 位作者 关鹏程 冯笛 王甜 张月皎 李剑锋 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-7,共7页
面对新型冠状病毒2019(COVID-19)传播速度极快的情况,发展快速、准确和低成本的诊断方法以检测SARS-CoV-2病毒的特定抗原非常必要。基于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的COVID-19检测需要特定的实验室,耗时较长。本文针对SARS-CoV-2刺突蛋... 面对新型冠状病毒2019(COVID-19)传播速度极快的情况,发展快速、准确和低成本的诊断方法以检测SARS-CoV-2病毒的特定抗原非常必要。基于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的COVID-19检测需要特定的实验室,耗时较长。本文针对SARS-CoV-2刺突蛋白,提出了一种基于核酸适配体特异性识别的一步捕获底物和检测探针的表面增强拉曼光谱(SERS)检测平台。利用模拟病毒(PSV)进行实验,不经预处理,在5 min内用便携式拉曼光谱仪检测SARS-CoV-2病毒及其变异株。实验结果表明,针对模拟病毒的检出限为200 TU/mL。此外,该方法可以检测另外5种SARS-CoV-2的变异病毒株,咽拭子体系中的极限检测限可以达到5000 TU/mL。实际大批量咽拭子的实验结果可以达到特异性为100%的效果。因此,该平台在SARS-CoV-2的医护点快速诊断中具有很大的应用潜力。 展开更多
关键词 SERS sars-cov-2 刺突蛋白 模拟病毒(PSV) 便携式拉曼光谱仪
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SARS-CoV-2 ORF7a通过靶向IKKβ激活NF-κB信号通路促进细胞炎症因子释放
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作者 牟露敏 龙启舟 +3 位作者 邓东青 程金芝 聂映 吴家红 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期714-719,共6页
目的:探究SARS-CoV-2辅助蛋白ORF7a介导NF-κB激活,进而诱导炎症因子产生的分子机制。方法:双荧光素酶报告基因试验检测ORF7a对NF-κB激活的影响,qRT-PCR检测ORF7a对细胞中炎症因子表达的影响,Western blot、核质分离及免疫荧光技术检测... 目的:探究SARS-CoV-2辅助蛋白ORF7a介导NF-κB激活,进而诱导炎症因子产生的分子机制。方法:双荧光素酶报告基因试验检测ORF7a对NF-κB激活的影响,qRT-PCR检测ORF7a对细胞中炎症因子表达的影响,Western blot、核质分离及免疫荧光技术检测ORF7a蛋白对p65磷酸化及入核的影响,免疫共沉淀及免疫荧光技术检测ORF7a的作用靶标蛋白。结果:报告基因试验表明ORF7a显著激活NF-κB启动子活性,并呈剂量依赖性(P<0.001),而对AP-1报告基因的激活无明显影响。ORF7a显著上调细胞因子TNF-α、IL-β及IL-8 mRNA表达(P<0.05)。Western blot结果显示ORF7a显著增强p65蛋白磷酸化(P<0.05)及p65的入核(P<0.01)。免疫共沉淀实验发现ORF7a与NF-κB信号通路分子IKKβ蛋白存在相互作用,免疫荧光实验也证实ORF7a与IKKβ具有共定位。结论:SARS-CoV-2 ORF7a通过靶向IKKβ激活NF-κB信号通路,进而促进细胞中炎症因子的释放。 展开更多
关键词 sars-cov-2 ORF7a NF-ΚB信号通路 炎症因子
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马铃薯三糖甘草次酸衍生物通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂
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作者 万欣 洪崇竣 +2 位作者 王进绅 宋高鹏 刘叔文 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期474-483,共10页
目的 研究马铃薯三糖甘草次酸衍生物能否通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞,作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂。方法 以天然SARS-CoV-2进入抑制剂甘草酸为先导化合物,利用活性亚结构的拼合原理等设计并合成了系列马铃薯三糖甘草次酸衍生... 目的 研究马铃薯三糖甘草次酸衍生物能否通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞,作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂。方法 以天然SARS-CoV-2进入抑制剂甘草酸为先导化合物,利用活性亚结构的拼合原理等设计并合成了系列马铃薯三糖甘草次酸衍生物。利用SARS-CoV-2假病毒体外细胞感染模型,检测该系列甘草次酸衍生物的体外抗SARS-CoV-2活性;利用表面等离子共振技术及假病毒模型寻找先导化合物1b的抗病毒作用靶点;利用SARS-CoV-2 S蛋白介导的细胞-细胞融合体系,检测先导化合物1b是否作用于SARS-CoV-2病毒入侵宿主的膜融合过程;基于分子对接与定点突变技术,确定先导化合物1b与S蛋白的作用模式等。结果 先导化合物1b对SARS-CoV-2奥密克戎假病毒有显著抑制作用,EC50值为3.28μmol/L(P<0.05),对其它SARS-CoV-2变异株假病毒有广谱抗病毒活性。细胞-细胞膜融合实验显示1b能够抑制合胞体的形成。分子对接预测先导化合物1b可与S1与S2亚基交界处的空腔中的Glu309、Ser305、Arg765、Lys964等多个保守氨基酸残基产生氢键作用,亲和力为-8.6 kcal/mol。化合物1b在10、5、2.5、1.25μmol/L时对Arg765、Lys964、Glu309和Leu303突变后的假病毒的抑制活性显著降低(P<0.01)。结论 马铃薯三糖甘草次酸衍生物能够靶向作用于S蛋白,特异性干扰病毒-细胞膜融合阶段,继而发挥抗SARS-CoV-2感染的作用,是一类结构新颖的小分子SARS-CoV-2融合抑制剂。 展开更多
关键词 sars-cov-2 小分子新冠病毒融合抑制剂 刺突蛋白 甘草次酸衍生物
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SARS-CoV-2广谱中和抗体性质鉴定
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作者 陈秀婷 汪毅祯 +2 位作者 商慧娴 王思令 郑子峥 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期693-697,共5页
目的:对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)广谱中和抗体XMA09进行性质鉴定,探究其广谱中和突变株的潜在机制,为SARS-CoV-2的疫苗设计与广谱中和抗体筛选提供参考。方法:通过ExpiCHO真核表达系统与Protein A层析柱表达纯化XMA09蛋... 目的:对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)广谱中和抗体XMA09进行性质鉴定,探究其广谱中和突变株的潜在机制,为SARS-CoV-2的疫苗设计与广谱中和抗体筛选提供参考。方法:通过ExpiCHO真核表达系统与Protein A层析柱表达纯化XMA09蛋白;冷冻电镜技术确定XMA09识别的受体结构域(RBD)上的关键氨基酸位点;间接ELISA与表面等离子共振(SPR)技术检测XMA09对SARS-CoV-2及其突变株Spike蛋白的亲和力;采用基于水疱性口炎病毒(VSV)的假病毒系统检测XMA09对SARS-CoV-2野生型及突变株的中和能力。结果:本研究发现XMA09识别的表位较为保守,对多种突变株Spike蛋白均具有强结合能力,能广谱中和关切突变株(VOCs),包括广泛流行的Omicron亚突变株BA.4/5。结论:XMA09是SARS-CoV-2广谱中和抗体,具有作为SARS-CoV-2治疗性抗体的潜力,并可为SARS-CoV-2的广谱疫苗设计与抗体药物开发提供参考意义。 展开更多
关键词 sars-cov-2 受体结合结构域(RBD) 广谱中和抗体
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黄芩苷对SARS-COV-2侵袭的抑制作用研究
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作者 耿雪 王雪 +3 位作者 周倩 苏昕宇 李水仙 祝清芬 《药学研究》 CAS 2024年第4期333-337,共5页
目的在体外研究黄芩苷对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)入侵细胞过程的抑制作用。方法利用构建有荧光素酶报告基因的SARS-CoV-2 S蛋白假病毒系统,通过荧光素酶试剂盒检测加入黄芩苷和假病毒后Huh-7细胞中的荧光素表达变化,进而绘制病毒抑制... 目的在体外研究黄芩苷对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)入侵细胞过程的抑制作用。方法利用构建有荧光素酶报告基因的SARS-CoV-2 S蛋白假病毒系统,通过荧光素酶试剂盒检测加入黄芩苷和假病毒后Huh-7细胞中的荧光素表达变化,进而绘制病毒抑制曲线。结果黄芩苷能显著抑制Huh-7细胞的病毒感染率,黄芩苷和病毒提前共孵育组与直接加入组在不同浓度下的病毒抑制曲线并无显著差别,表明黄芩苷并不能与病毒直接结合,而是通过作用于病毒S蛋白介导的细胞融合过程产生抑制作用;黄芩苷在0.125 mg·mL^(-1)浓度时,对病毒的抑制率在4 h组显著降低,在0 h和2 h组并无显著差别,表明黄芩苷可能在病毒入侵细胞(非吸附)阶段产生抑制作用,且介导的入侵抑制阶段发生在4 h内。结论黄芩苷可能通过介导抑制SARS-CoV-2病毒S蛋白与细胞表面受体的融合过程,在非吸附阶段抑制病毒的入侵,发挥抗新冠病毒活性。 展开更多
关键词 黄芩苷 新型冠状病毒 荧光素酶检测 sars-cov-2 S蛋白
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槲皮素通过抑制ACE2治疗SARS-CoV-2所致心肌损伤的研究进展
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作者 万敬强 郭振东 +1 位作者 马永霞 谢萍 《心脏杂志》 CAS 2024年第2期215-219,共5页
2019年底,由重症急性呼吸道综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒病肺炎(COVID-19)在全球迅速蔓延,由于其潜伏期长、传播性强、突变率高,因此,COVID-19的防治已成为全球卫生领域的焦点问题。由于人体呼吸道黏膜表面血管紧张... 2019年底,由重症急性呼吸道综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒病肺炎(COVID-19)在全球迅速蔓延,由于其潜伏期长、传播性强、突变率高,因此,COVID-19的防治已成为全球卫生领域的焦点问题。由于人体呼吸道黏膜表面血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)含量丰富,而SARS-CoV-2表面的刺突蛋白(S蛋白)具有介导受体识别和结合功能,其受体结构域可特异性结合ACE2的肽酶结构域。因此,ACE2是作为SARS-CoV-2感染的宿主的途径,在SARS-CoV-2感染机体过程中发挥至关重要的作用。与此同时,心肌组织ACE2含量较丰富,且COVID-19合并心肌损伤患者心肌组织ACE2呈现表达异常。而我国传统中医药六大处方防治COVID-19疗效显著,其中,共有中药单体成分槲皮素备受关注,防治机制可能与槲皮素抑制ACE2密切相关。迄今为止,少有SARS-CoV-2所致心肌损伤药物治疗的相关报道。因此,本文旨在通过文献汇总和生信预测探讨槲皮素是否通过抑制ACE2在心肌组织中的高表达从而改善COVID-19所致心肌损伤,从而降低COVID-19患者心源性死亡率及心血管并发症。 展开更多
关键词 槲皮素 sars-cov-2 ACE2 COVID-19 心肌损伤
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SARS-CoV-2主蛋白酶的表达、纯化和一种新型晶体结构的研究
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作者 刘雪静 赵文聪 +7 位作者 高欣欣 陈思旭 张博涛 王君帅 李朝阳 温一帆 高靓 曹鹏 《生物医学》 2024年第2期229-239,共11页
新型冠状病毒SARS-CoV-2的主蛋白酶(Main Protease, Mpro),也称为3-糜蛋白酶样蛋白酶(3CLpro),在病毒复制的过程中发挥核心作用。Mpro的结构和功能在β-冠状病毒中相对保守,在人体内没有同源蛋白,因此是抗病毒药物开发的关键靶点。本研... 新型冠状病毒SARS-CoV-2的主蛋白酶(Main Protease, Mpro),也称为3-糜蛋白酶样蛋白酶(3CLpro),在病毒复制的过程中发挥核心作用。Mpro的结构和功能在β-冠状病毒中相对保守,在人体内没有同源蛋白,因此是抗病毒药物开发的关键靶点。本研究完成了SARS-CoV-2 Mpro的原核表达与纯化,获得具有高纯度和高均一性的蛋白质样品。利用气相扩散坐滴法开展了Mpro的结晶筛选,获得单晶体后将其浸泡在由谷胱甘肽包裹的金团簇纳米材料溶液中,成功解析了仅有第156位半胱氨酸结合一个金离子的一个新型X射线衍射晶体结构。结构分析发现,Mpro蛋白的Cys156结合金离子后Asp153~Cys156区域的构象发生了~0.6 Å的偏移,推测该构象变化进一步通过变构效应抑制Mpro的生物功能,为新冠病毒的纳米型抑制剂的研发提供了新的信息。 展开更多
关键词 sars-cov-2 Mpro 金团簇 蛋白质表达与纯化 X射线晶体结构
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COVID-19 vaccination produces exercise-responsive SARS-CoV-2 specific T-cells regardless of infection history
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作者 Kyle A.Smith Tiffany M.Zúñiga +6 位作者 Forrest L.Baker Helena Batatinha Charles R.Pedlar Shane C.Burgess Michael P.Gustafson Emmanuel Katsanis Richard J.Simpson 《Journal of Sport and Health Science》 SCIE CSCD 2024年第1期99-107,共9页
Background:The mobilization and redistribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)specific T-cells and neutralizing antibodies(nAbs)during exercise is purported to increase immune surveillan... Background:The mobilization and redistribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)specific T-cells and neutralizing antibodies(nAbs)during exercise is purported to increase immune surveillance and protect against severe coronavirus disease 2019(COVID-19).We sought to determine if COVID-19 vaccination would elicit exercise-responsive SARS-CoV-2 T-cells and transiently alter nAb titers.Methods:Eighteen healthy participants completed a 20-min bout of graded cycling exercise before and/or after receiving a COVID-19 vaccine.All major leukocyte subtypes were enumerated before,during,and after exercise by flow cytometry,and immune responses to SARS-CoV-2 were determined using whole blood peptide stimulation assays,T-cell receptor(TCR)-βsequencing,and SARS-CoV-2 nAb serology.Results:COVID-19 vaccination had no effect on the mobilization or egress of major leukocyte subsets in response to intensity-controlled graded exercise.However,non-infected participants had a significantly reduced mobilization of CD4+and CD8+naive T-cells,as well as CD4+central memory T-cells,after vaccination(synthetic immunity group);this was not seen after vaccination in those with prior SARS-CoV-2 infection(hybrid immunity group).Acute exercise after vaccination robustly mobilized SARS-CoV-2 specific T-cells to blood in an intensity-dependent manner.Both groups mobilized T-cells that reacted to spike protein;however,only the hybrid immunity group mobilized T-cells that reacted to membrane and nucleocapsid antigens.nAbs increased significantly during exercise only in the hybrid immunity group.Conclusion:These data indicate that acute exercise mobilizes SARS-CoV-2 specific T-cells that recognize spike protein and increases the redistribution of nAbs in individuals with hybrid immunity. 展开更多
关键词 ANTI-VIRAL COVID-19 Exercise immunology sars-cov-2 T-CELLS Vaccine
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SARS-CoV-2 S蛋白引起呼吸道上皮细胞炎症反应的研究进展
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作者 刘兴健 张华华 张锐钢 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期112-118,共7页
严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的肺炎对人类生命健康产生威胁,对社会经济造成巨大损失。病毒的结构蛋白刺突蛋白(S蛋白)一直被认为主要介导病毒侵入宿主细胞。S蛋白可独立于病毒引起多种细胞产生炎症反应,因此,了... 严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的肺炎对人类生命健康产生威胁,对社会经济造成巨大损失。病毒的结构蛋白刺突蛋白(S蛋白)一直被认为主要介导病毒侵入宿主细胞。S蛋白可独立于病毒引起多种细胞产生炎症反应,因此,了解S蛋白本身对呼吸道的影响能够为防治新型冠状病毒感染提供新视角。本文对SARS-CoV-2结构蛋白S蛋白引起呼吸道上皮细胞炎症反应的可能机制、临床表现等方面的研究进展进行了梳理,以期为疾病的预防和治疗提供参考。 展开更多
关键词 sars-cov-2 S蛋白 ACE2 呼吸道炎症
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用于中和抗体评价和进入抑制剂筛选的多变异株SARS-CoV-2假病毒体系构建与评估
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作者 李静璇 刘峰 +3 位作者 王莹 程军平 肖智勇 周文霞 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期811-817,共7页
目的:构建一种高滴度SARS-CoV-2假病毒(PsV)体系,用于中和抗体体外评价与病毒进入抑制剂的筛选。方法:共转染慢病毒载体质粒psPAX2、pCDH-Luc与SARS-CoV-2 Spike(S)蛋白表达质粒,收获的假病毒上清感染ACE2-293T细胞。通过测定p24蛋白含... 目的:构建一种高滴度SARS-CoV-2假病毒(PsV)体系,用于中和抗体体外评价与病毒进入抑制剂的筛选。方法:共转染慢病毒载体质粒psPAX2、pCDH-Luc与SARS-CoV-2 Spike(S)蛋白表达质粒,收获的假病毒上清感染ACE2-293T细胞。通过测定p24蛋白含量反映PsV滴度,Western blot检测S蛋白在PsV中的表达。利用原始株、D614G、Gamma、Delta、Omicron PsV亚型对1株S蛋白单克隆抗体的中和能力进行评价。采用两种已报道的病毒进入抑制剂氯喹、角叉菜胶检测对Omicron PsV进入的影响。结果:慢病毒载体成功掺入了S蛋白,Western blot结果显示665Y位突变的S蛋白表现出与野生型全长S蛋白(180 kD)不同的切割形式(90 kD)。三质粒体系包装出的PsV滴度更高,S蛋白表达质粒、转移质粒与包装质粒比例在1∶3∶3时为原始株PsV包装的最佳条件。该条件下包装出的5种PsV滴度均在20 ng/ml以上。PsV可有效感染ACE2-293T细胞,双报告基因GFP与萤火虫荧光素酶表达明显,化学发光数值高达106。基于原始株S蛋白的单克隆抗体可有效中和原始株PsV,对原始株PsV的中和作用是对变异株PsV的10~30倍。病毒进入抑制剂氯喹与ι-角叉菜胶可显著抑制Omicron PsV进入宿主细胞。结论:成功构建了高滴度的SARS-CoV-2 PsV进入体系,该体系以荧光素酶报告基因为指示,包含原始株和D614G、PsV Gamma、Delta、Omicron 4种变异株PsV,可有效评价中和抗体与病毒进入抑制剂活性,区分二者对不同变异株的敏感性差异对抗SARS-CoV-2药物研发有重要意义。 展开更多
关键词 sars-cov-2 假病毒 S蛋白 中和抗体 病毒进入抑制剂
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SARS-CoV-2 S蛋白主要结构与突变及S蛋白引起疾病的潜在机制
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作者 刘兴健 张锐钢 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期857-861,共5页
严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)对人类生命健康构成威胁,备受研究者的关注。研究发现,病毒的刺突蛋白(S蛋白)被认为是病毒感染的关键结构蛋白,该蛋白与靶细胞受体结合导致组织器官发生炎症反应。因此研究S蛋白引起疾病的潜... 严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)对人类生命健康构成威胁,备受研究者的关注。研究发现,病毒的刺突蛋白(S蛋白)被认为是病毒感染的关键结构蛋白,该蛋白与靶细胞受体结合导致组织器官发生炎症反应。因此研究S蛋白引起疾病的潜在机制对于疾病的治疗至关重要,然而病毒的演变进化给研究工作增加了一定的难度。本文总结了SARS-CoV-2 S蛋白的主要结构以及从Alpha到Omicron突变,及其引起多种疾病的潜在机制,从而为疾病的预防和治疗提供参考。 展开更多
关键词 sars-cov-2 S蛋白 ACE2 呼吸道炎症
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基于微流控平台的SARS-CoV-2核酸检测的研究进展
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作者 杨帆 王兰 +4 位作者 邱红 孔成 张薇薇 顾畅 朱月蓉 《医疗卫生装备》 CAS 2024年第1期101-107,共7页
介绍了微流控技术的检测原理,综述了基于微流控平台的实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)、数字PCR、等温扩增、成簇规律间隔短回文重复序列及其相关... 介绍了微流控技术的检测原理,综述了基于微流控平台的实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)、数字PCR、等温扩增、成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白等技术应用于的SARS-CoV-2核酸检测的研究现状,分析了基于微流控平台的SARS-CoV-2核酸检测的局限性,指出了基于微流控的SARS-CoV-2核酸检测系统在特异度、敏感度、检测限、重复性、信息化、质量控制及试剂成本等方面仍需要进一步的优化改进和临床验证。 展开更多
关键词 微流控 sars-cov-2 核酸检测 RT-QPCR 数字PCR 等温扩增 CRISPR/Cas
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Molecular mechanisms underlying SARS-CoV-2 hepatotropism and liver damage
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作者 Jorge Quarleri M Victoria Delpino 《World Journal of Hepatology》 2024年第1期1-11,共11页
In coronavirus disease 2019(COVID-19),severe acute respiratory syndrome coronavirus-2(SARS-CoV-2)primarily targets the respiratory system,but evidence suggests extrapulmonary organ involvement,notably in the liver.Vir... In coronavirus disease 2019(COVID-19),severe acute respiratory syndrome coronavirus-2(SARS-CoV-2)primarily targets the respiratory system,but evidence suggests extrapulmonary organ involvement,notably in the liver.Viral RNA has been detected in hepatic tissues,and in situ hybridization revealed virions in blood vessels and endothelial cells.Electron microscopy confirmed viral particles in hepatocytes,emphasizing the need for understanding hepatotropism and direct cytopathic effects in COVID-19-related liver injury.Various factors contribute to liver injury,including direct cytotoxicity,vascular changes,inflammatory responses,immune reactions from COVID-19 and vaccinations,and druginduced liver injury.Although a typical hepatitis presentation is not widely documented,elevated liver biochemical markers are common in hospitalized COVID-19 patients,primarily showing a hepatocellular pattern of elevation.Long-term studies suggest progressive cholestasis may affect 20%of patients with chronic liver disease post-SARS-CoV-2 infection.The molecular mechanisms underlying SARS-CoV-2 infection in the liver and the resulting liver damage are complex.This“Editorial”highlights the expression of the Angiotensin-converting enzyme-2 receptor in liver cells,the role of inflammatory responses,the impact of hypoxia,the involvement of the liver's vascular system,the infection of bile duct epithelial cells,the activation of hepatic stellate cells,and the contribution of monocyte-derived macrophages.It also mentions that pre-existing liver conditions can worsen the outcomes of COVID-19.Understanding the interaction of SARS-CoV-2 with the liver is still evolving,and further research is required. 展开更多
关键词 sars-cov-2 COVID-19 Hepatotropism Angiotensin-converting enzyme-2
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Effects of SARS-CoV-2 infection on incidence and treatment strategies of hepatocellular carcinoma in people with chronic liver disease
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作者 Lung-Yi Mak Matthew Shing Hin Chung +12 位作者 Xue Li Francisco Tsz Tsun Lai Eric Yuk Fai Wan Celine Sze Ling Chui Franco Wing Tak Cheng Esther Wai Yin Chan Ching Lung Cheung Ivan Chi Ho Au Xi Xiong Wai-Kay Seto Man-Fung Yuen Carlos King Ho Wong Ian Chi Kei Wong 《World Journal of Hepatology》 2024年第2期211-228,共18页
BACKGROUND Chronic liver disease(CLD)was associated with adverse clinical outcomes among people with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)infection.AIM To determine the effects of SARS-CoV-2 infe... BACKGROUND Chronic liver disease(CLD)was associated with adverse clinical outcomes among people with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)infection.AIM To determine the effects of SARS-CoV-2 infection on the incidence and treatment strategy of hepatocellular carcinoma(HCC)among patients with CLD.METHODS A retrospective,territory-wide cohort of CLD patients was identified from an electronic health database in Hong Kong.Patients with confirmed SARS-CoV-2 infection[coronavirus disease 2019(COVID-19)+CLD]between January 1,2020 and October 25,2022 were identified and matched 1:1 by propensity-score with those without(COVID-19-CLD).Each patient was followed up until death,outcome event,or November 15,2022.Primary outcome was incidence of HCC.Secondary outcomes included all-cause mortality,adverse hepatic outcomes,and different treatment strategies to HCC(curative,non-curative treatment,and palliative care).Analyses were further stratified by acute(within 20 d)and post-acute(21 d or beyond)phases of SARS-CoV-2 infection.Incidence rate ratios(IRRs)were estimated by Poisson regression models.RESULTS Of 193589 CLD patients(>95%non-cirrhotic)in the cohort,55163 patients with COVID-19+CLD and 55163 patients with COVID-19-CLD were included after 1:1 propensity-score matching.Upon 249-d median follow-up,COVID-19+CLD was not associated with increased risk of incident HCC(IRR:1.19,95%CI:0.99-1.42,P=0.06),but higher risks of receiving palliative care for HCC(IRR:1.60,95%CI:1.46-1.75,P<0.001),compared to COVID-19-CLD.In both acute and post-acute phases of infection,COVID-19+CLD were associated with increased risks of allcause mortality(acute:IRR:7.06,95%CI:5.78-8.63,P<0.001;post-acute:IRR:1.24,95%CI:1.14-1.36,P<0.001)and adverse hepatic outcomes(acute:IRR:1.98,95%CI:1.79-2.18,P<0.001;post-acute:IRR:1.24,95%CI:1.13-1.35,P<0.001),compared to COVID-19-CLD.CONCLUSION Although CLD patients with SARS-CoV-2 infection were not associated with increased risk of HCC,they were more likely to receive palliative treatment than those without.The detrimental effects of SARS-CoV-2 infection persisted in post-acute phase. 展开更多
关键词 sars-cov-2 infection Chronic liver disease Long COVID Post-COVID-19 syndrome CIRRHOSIS Hepatocellular carcinoma
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Prevalence and features of SARS-CoV-2 infection in prisons in Tuscany
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作者 Cristina Stasi Martina Pacifici +3 位作者 Caterina Milli Francesco Profili Caterina Silvestri Fabio Voller 《World Journal of Experimental Medicine》 2024年第1期70-77,共8页
BACKGROUND Prisons can be a reservoir for infectious diseases,including severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2),due to the very intimate nature of the living spaces and the large number of people f... BACKGROUND Prisons can be a reservoir for infectious diseases,including severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2),due to the very intimate nature of the living spaces and the large number of people forced to share them.AIM To investigate the SARS-CoV-2 epidemiology in prisons,this study evaluated the infection incidence rate in prisoners who underwent nasopharyngeal swabs.METHODS This is an observational cohort study.Data collection included information on prisoners who underwent nasopharyngeal swab testing for SARS-CoV-2 and the results.Nasopharyngeal swab tests for SARS-CoV-2 were performed between 15 February 2021 and 31 May 2021 for prisoners with symptoms and all new arrivals to the facility.Another section included information on the diagnosis of the disease according to the International Classification of Diseases,Ninth Revision,and Clinical Modification.RESULTS Up until the 31 May 2021,79.2%of the prisoner cohort(n=1744)agreed to a nasopharyngeal swab test(n=1381).Of these,1288 were negative(93.3%)and 85 were positive(6.2%).A significant association[relative risk(RR)]was found only for the risk of SARS-CoV-2 infection among foreigners compared to Italians[RR=2.4,95%confidence interval(CI):1.2-4.8].A positive association with SARS-CoV-2 infection was also found for inmates with at least one nervous system disorder(RR=4,95%CI:1.8-9.1).The SARS-CoV-2 incidence rate among prisoners is significantly lower than in the general population in Tuscany(standardized incidence ratio 0.7,95%CI:0.6-0.9).CONCLUSION In the prisoner cohort,screening and rapid access to health care for the immigrant population were critical to limiting virus transmission and subsequent morbidity and mortality in this vulnerable population. 展开更多
关键词 sars-cov-2 Epidemiology PRISON PREVALENCE FOREIGNERS Swab tests
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Seroprevalence of SARS-COV-2 Exposure among “High-Risk” Populations (Healthcare Workers, People Who Attend Markets, and School Children) in Zanzibar
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作者 Ame Masemo Solomon Mwakasungula +11 位作者 Khamis Kheir Erick Mgina Nahya Khamis Irabi Kassim Bihila Bakar Khamis Salim Sarah Mswata Kibwana Omar Theckla Kazimoto Linzy Elton Honorati Masanja Mayassa Ally 《Advances in Infectious Diseases》 CAS 2024年第1期34-55,共22页
In Zanzibar, from the start of the pandemic in March 2020 to the time of sampling in December 2020, SARS-CoV-2 seroprevalence data was limited. We conducted a seroprevalence study to evaluate the magnitude of SARS-CoV... In Zanzibar, from the start of the pandemic in March 2020 to the time of sampling in December 2020, SARS-CoV-2 seroprevalence data was limited. We conducted a seroprevalence study to evaluate the magnitude of SARS-CoV-2 exposure among healthcare workers, school children, and people who attended general markets in Zanzibar. The objectives of the study were to analyse the total antibodies from selected higher-risk population groups in order to determine magnitude in SARS CoV-2 exposure. Blood samples were collected from eligible and consented participants (adults and children), and their serum was analyzed for total antibodies against SARS-CoV-2 using ELISA. A questionnaire was used to collect participants’ demographic and clinical data. The overall SARS-CoV-2 seroprevalence across all age groups was 33%, and a higher seroprevalence was observed in the 40 - 49 years’ age group relative to other ages as well as in those who attended markets. A runny nose (18.8% of participants) was the most frequently reported SARS-CoV-2 infection-related symptom. Multivariable analysis showed significantly higher odds of infection in people living in urban districts. The findings provide insight into SARS-CoV-2 infection among school children, health workers, and people who attended markets in Zanzibar in the early stages of the pandemic. Exposure in these groups might have been influenced by infection and prevention strategies taken by the government, as well as shopping behavior, school overcrowding, and population density in urban settings. The study had methodological limitations, including cross-sectional design. Further, well-designed, longitudinal studies are recommended to understand exposure and transmission at a population level. 展开更多
关键词 sars-cov-2 SEROPREVALENCE ZANZIBAR ELISA COVID-19
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Isolation and Characterization of SARS-CoV-2 in Kenya
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作者 Albina Makio Robinson Mugasiali Irekwa +9 位作者 Matthew Mutinda Munyao Caroline Wangui Njoroge Peter Kipkemboi Rotich Tonny Teya Nyandwaro Joanne Jepkemei Yego Anne Wanjiru Mwangi James Hungo Kimotho Ronald Tanui Vincent Rutto Samson Muuo Nzou 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2024年第2期66-83,共18页
The discovery of Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) in Wuhan, Hubei province, China, in December 2019 raised global health warnings. Quickly, in 2020, the virus crossed borders and infected i... The discovery of Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) in Wuhan, Hubei province, China, in December 2019 raised global health warnings. Quickly, in 2020, the virus crossed borders and infected individuals across the world, evolving into the COVID-19 pandemic. Notably, early signs of the virus’s existence were observed in various countries before the initial outbreak in Wuhan. As of 12<sup>th</sup> of April, the respiratory disease had infected over 762 million people worldwide, with over 6.8 million deaths recorded. This has led scientists to focus their efforts on understanding the virus to develop effective means to diagnose, treat, prevent, and control this pandemic. One of the areas of focus is the isolation of this virus, which plays a crucial role in understanding the viral dynamics in the laboratory. In this study, we report the isolation and detection of locally circulating SARS-CoV-2 in Kenya. The isolates were cultured on Vero Cercopithecus cell line (CCL-81) cells, RNA extraction was conducted from the supernatants, and reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Genome sequencing was done to profile the strains phylogenetically and identify novel and previously reported mutations. Vero CCL-81 cells were able to support the growth of SARS-CoV-2 in vitro, and mutations were detected from the two isolates sequenced (001 and 002). Genome sequencing revealed the circulation of two isolates that share a close relationship with the Benin isolate with the D614G common mutation identified along the S protein. These virus isolates will be expanded and made available to the Kenya Ministry of Health and other research institutions to advance SARS-CoV-2 research in Kenya and the region. 展开更多
关键词 sars-cov-2 COVID-19 Whole Genome Sequencing Phylogenetic Analysis Nucleotide Substitutions Amino Acid Changes
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