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题名草石蚕块茎膨大相关SSH文库构建及分析
被引量：2
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作者
耿广东
杨祎
张素勤
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机构
贵州大学农学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第17期5650-5657,共8页
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基金
贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑(2018)2330号)
贵州省科技厅重大专项计划(黔科合重大专项字(2016)3002号)共同资助。
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文摘
为挖掘草石蚕块茎膨大的关键基因,研究其分子机理,以快速膨大的草石蚕块茎为测验方,幼嫩块茎为驱动方,构建了草石蚕块茎膨大相关正向SSH文库。从文库中随机挑选阳性单克隆,利用引物Nest-1和Nest-2R对其进行验证,获得400个克隆,插入片段的大小为200~1 500 bp,主要集中在500 bp左右片段。随机挑取65个阳性克隆测序后得到60条ESTs,经过聚类、拼接和冗余去除后获得单拷贝序列33条,其中序列最长的片段为1 037 bp,最短片段为182 bp。通过序列比对,发现33条单拷贝序列中来源于蚕豆萎蔫病毒基因占39.4%,植物基因占36.4%,其它未知基因占24.2%。根据同源基因的来源分析,来源于茄科植物的基因所占比例最大(41.67%)。序列编号20 (632 bp)的EST与clone cSTB39G13 CENP-C mRNA基因有63%同源性;序列编号25 (378 bp)的EST与光敏色素A基因有84%同源性,这两个ESTs可能与草石蚕块茎膨大相关。
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关键词
草石蚕(stachys
sieboldii
miq.)
块茎膨大
SSH文库
表达序列标签
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Keywords
Chinese artichoke(stachys sieboldii miq.)
Tuber enlargement
SSH library
Express sequence tag
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分类号
S644.5
[农业科学—蔬菜学]
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