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肺癌患者外周血和胸腔积液T细胞受体组库特征分析
1
作者 宋娟 王林林 +2 位作者 胡洁 宋元林 童琳 《中国临床医学》 2024年第1期60-67,共8页
目的 比较肺癌患者外周血和胸腔积液的T细胞受体(TCR)组库的免疫学特征。方法 收集2020年7月至2021年1月在复旦大学附属中山医院就诊的5例合并恶性胸腔积液肺癌患者的外周血和胸腔积液,分离外周血单个核细胞(PBMC)和胸腔积液单个核细胞(... 目的 比较肺癌患者外周血和胸腔积液的T细胞受体(TCR)组库的免疫学特征。方法 收集2020年7月至2021年1月在复旦大学附属中山医院就诊的5例合并恶性胸腔积液肺癌患者的外周血和胸腔积液,分离外周血单个核细胞(PBMC)和胸腔积液单个核细胞(PEMC),提取基因组DNA,采用Illumina MiSeq平台对TCR进行高通量测序,分析TCR组库的多样性等特征。结果 PBMC和PEMC中的TCR克隆型、VJ pairs和互补决定区3(CDR3)序列的多样性和相关性差异均无统计学意义。PBMC中检测到的TCR克隆数量高于PEMC(P<0.05),VJ pairs和CDR3数量与PEMC差异无统计学意义。PBMC和PEMC配对样本的共有VJ pairs数量占总VJ pairs的比例高于共有克隆型和CDR3序列的数量比例(P<0.05),后两者差异无统计学意义。PEMC中高扩增克隆(HEC)数量和占比均高于PBMC。同时鉴定了36个在PBMC和PEMC中差异表达的VJ pairs,其中25个在PEMC中表达升高、9个在PEMC中表达降低。结论 肺癌患者外周血和胸腔积液的TCR组库表现出不同的特征性变化,可能为肺癌重要的免疫病理学特征。 展开更多
关键词 肺癌 恶性胸腔积液 t细胞受体组库 外周血单个核细胞 胸腔积液单个核细胞 多样性
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TCR组库检测方法及应用的研究进展
2
作者 周健(综述) 任秀宝 颜次慧(审阅) 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期956-961,共6页
近年来以T细胞为基础的肿瘤免疫治疗发展迅速,但仅对部分肿瘤患者有效,因此亟待探索有效的检测方法和预测指标。T细胞受体(TCR)是T细胞抗原识别的关键分子。T细胞在胸腺成熟过程中经历了TCR基因重排,形成了TCR高度多样性,体内所有TCR类... 近年来以T细胞为基础的肿瘤免疫治疗发展迅速,但仅对部分肿瘤患者有效,因此亟待探索有效的检测方法和预测指标。T细胞受体(TCR)是T细胞抗原识别的关键分子。T细胞在胸腺成熟过程中经历了TCR基因重排,形成了TCR高度多样性,体内所有TCR类型与数量组成TCR组库。借助免疫组库测序技术可得到特定时期肿瘤患者TCR组库的信息,如TCR多样性、克隆性等特点,为个体化肿瘤免疫治疗方案的选择以及疗效预测提供了新线索。二代测序技术和单细胞测序技术的发展极大地扩展了TCR组库研究的深度与广度,极大地促进其在肿瘤免疫治疗领域的应用。本文通过对TCR组库测序应用领域、测序方法及其统计学评估指标进行综述,展示了TCR组库检测作为新型生物标志物来预测及评估患者预后的潜能,为个体精准化肿瘤免疫治疗提供新策略。 展开更多
关键词 t细胞受体 t细胞受体组库 单细胞测序 免疫检查点 肿瘤免疫
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TCR CDR3组库及HLA等位基因与新型冠状病毒肺炎关系的研究概况和进展
3
作者 周得维 李俊 +1 位作者 李洋洋 姚新生 《现代免疫学》 CAS 2024年第2期152-157,169,共7页
新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致。机体抗病毒的适应性免疫应答主要依赖T细胞选择性地清除病毒感... 新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致。机体抗病毒的适应性免疫应答主要依赖T细胞选择性地清除病毒感染宿主细胞,而T细胞受体(T cell receptor,TCR)的结构决定其对病毒抗原决定簇的特异性识别,感染者TCR互补决定区3(complementarity determining region 3,CDR3)组库的特征在COVID-19的发生与发展中有重要的提示意义。此外,人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)是不同个体对抗原引起免疫应答差异的主要原因,在人体的免疫应答中发挥着重要作用。文章重点概述TCR CDR3组库的特征和HLA等位基因的组成与COVID-19之间关系的研究概况和进展。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 t细胞受体互补决定区3组库 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型 人类白细胞抗原
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Graves病和Graves眼病患者T细胞受体谱系研究 被引量：2
4
作者 王悦 刘宇峰 +2 位作者 伍丽萍 郭辉 施秉银 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期938-942,共5页
目的通过对Graves病(Graves′disease,GD)和Graves眼病(thyroid associated ophthalmopathy,TAO)患者的T细胞受体(T cell receptor,TCR)测序,鉴定GD和TAO特异性TCR家族,为临床早期精确诊断提供依据。方法于西安交通大学第一附属医院门... 目的通过对Graves病(Graves′disease,GD)和Graves眼病(thyroid associated ophthalmopathy,TAO)患者的T细胞受体(T cell receptor,TCR)测序,鉴定GD和TAO特异性TCR家族,为临床早期精确诊断提供依据。方法于西安交通大学第一附属医院门诊收集9例GD和6例TAO患者。对GD和TAO患者于诊断时采集外周血。收集20例与患者年龄和性别相匹配的健康对照外周血。分离外周血单个核细胞并提取RNA进行TCR免疫组库测序,并进行后续高通量数据挖掘分析。结果GD和TAO患者TCR多样性显著低于健康对照。挖掘TCR高通量测序数据,可分别构建GD和TAO两种疾病的特征性TCR数据库,分别包含157和116个VJ家族。这些VJ家族中存在两种疾病共有的家族,也存在两种疾病各自特有的家族。结论GD和TAO存在共同的发病基础,但是在某种程度上还是拥有不同的优势T细胞克隆,从而介导不同的免疫应答。因此,GD和TAO患者的特征性TCR可作为一种潜在的分子标志物。 展开更多
关键词 GRAVES病 GRAVES眼病 t细胞受体免疫组库 高通量测序
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免疫组库的临床应用 被引量：2
5
作者 付钰 杨国胜 吴松 《国际免疫学杂志》 CAS 2014年第5期411-414,423,共5页
免疫组库是指在任何指定时间内,某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞或者T细胞的多态性总和.免疫组库测序技术就是通过5＇ RACE或者多重PCR技术将免疫球蛋白重链（IGH）或者T细胞受体beta区多态性最高的互补决定区（CDR3）捕获下来... 免疫组库是指在任何指定时间内,某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞或者T细胞的多态性总和.免疫组库测序技术就是通过5＇ RACE或者多重PCR技术将免疫球蛋白重链（IGH）或者T细胞受体beta区多态性最高的互补决定区（CDR3）捕获下来,然后进行高深度测序,研究B细胞或者T细胞的多态性,是当今一大研究亮点.免疫组库测序可以应用于医药和疫苗的研发、生物标志物的发现、微小残留病（MRD）检测、自身免疫性疾病的研究以及移植后监测等领域,因而具有重大意义. 展开更多
关键词 t细胞受体组库 高通量测序
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