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山羊ESR1·TENM1和THEM4多态性及其与繁殖性状相关性研究 被引量：1
1
作者 李昆谕 刘玉芳 +4 位作者 陶林 江炎庭 欧阳依娜 储明星 洪琼花 《安徽农业科学》 CAS 2023年第1期79-84,共6页
[目的]分析ESR1、TENM1和THEM4单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的相关性。[方法]采用MassARRAY SNP分型技术对ESR1、TENM1和THEM4 SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊3个群体中的遗传学特征,并对其多态... [目的]分析ESR1、TENM1和THEM4单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的相关性。[方法]采用MassARRAY SNP分型技术对ESR1、TENM1和THEM4 SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊3个群体中的遗传学特征,并对其多态性与山羊繁殖性状(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行相关性分析。[结果]群体遗传学分析结果表明,ESR1 g.76097125C>T位点在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态(PIC<0.25),在云上黑山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.50);ESR1 g.76139051A>G在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25<PIC<0.50)。TENM1 g.17333655C>T和g.17372494A>G位点在3个山羊群体中表现为低度多态(PIC<0.25);TENM 1 g.17236451G>C和g.17586866T>C位点在3个山羊群体中的多态性(PIC)为0.05~0.36。THEM4 g.101275605G>A位点在3个山羊群体中为低度多态(PIC<0.25)。卡方检验结果表明,ESR1 g.76139051 A>G、THEM4 g.101275605G>A位点在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。相关分析结果表明,ESR1 g.76097125C>T位点CT和TT型山羊的初生窝重显著高于CC型(P<0.05);TENM1 g.17236451G>C位点GC型山羊的产羔数和断奶窝重显著高于GG型(P<0.05),g.17333655C>T位点CC型山羊产羔数显著高于CT型(P<0.05);其余位点多态性与云上黑山羊产羔数、初生窝重和断奶窝重无显著相关(P>0.05)。[结论]TENM1 g.17236451G>C位点可作为云上黑山羊产羔数和断奶窝重选择的潜在分子标记;TENM1 g.17333655C>T位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记;ESR1 g.76097125C>T位点可作为云上黑山羊初生窝重选择的潜在分子标记。该研究结果可为山羊分子育种和标记辅助选择提供理论基础。 展开更多
关键词 山羊 SNPS 繁殖性状 ESR1 tenm1 THEM4
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Teneurin跨膜蛋白1的生物信息学分析及其对乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖和迁移的影响
2
作者 厉雅婷 房林 《包头医学院学报》 CAS 2024年第7期9-14,共6页
目的:基于生物信息学分析TENM1在乳腺癌中的表达和预后价值和探究其对乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖和迁移的影响。方法:从TCGA数据库下载乳腺癌组织样本的TENM1表达谱进行差异表达分析;生存分析、单因素和多因素Cox回归分析以及构建Nomog... 目的:基于生物信息学分析TENM1在乳腺癌中的表达和预后价值和探究其对乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖和迁移的影响。方法:从TCGA数据库下载乳腺癌组织样本的TENM1表达谱进行差异表达分析;生存分析、单因素和多因素Cox回归分析以及构建Nomogram预测模型,以确认TENM1的独立预后价值;基因集富集分析评估与TENM1表达相关的失调信号通路;在乳腺癌MDA-MB-231细胞中干扰以及过表达TENM1后,CCK8与集落克隆实验检测细胞的增殖能力,Transwell实验检测细胞的迁移能力。结果:与正常样本相比,TENM1在乳腺癌组织中表达下调。生存分析、单因素和多因素Cox回归分析以及Nomogram预测模型提示TENM1可能是乳腺癌的独立预后因素。GSEA分析显示TENM1相关的信号通路在细胞分裂和细胞周期等差异富集。CCK8、集落克隆实验和Transwell实验结果显示沉默TENM1促进MDA-MB-231细胞的增殖和迁移能力,过表达TENM1则抑制其增殖和迁移能力。结论:TENM1在乳腺癌组织中表达下调,其可抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖和迁移。TENM1可能作为乳腺癌的潜在预后分子标志物,并成为未来乳腺癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 tenm1 乳腺癌 增殖 迁移 生物信息学
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