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中国汉族儿童TIRAP基因单核苷酸多态性分析未显示其与结核病的易感相关 被引量:3
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作者 肖婧 谢兰品 +4 位作者 董雅坤 王晓明 孙琳 綦辉 申阿东 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2015年第4期622-629,共8页
目的探讨中国汉族儿童TIRAP基因Tag SNP位点的多态性与结核病易感性相关关系,以明确TIRAP基因在儿童结核病发病中的作用。方法本课题组收集339名汉族儿童结核病患者,以同期查体的392名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量Mass AR... 目的探讨中国汉族儿童TIRAP基因Tag SNP位点的多态性与结核病易感性相关关系,以明确TIRAP基因在儿童结核病发病中的作用。方法本课题组收集339名汉族儿童结核病患者,以同期查体的392名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量Mass ARRAY技术对于TIRAP基因的SNP位点进行基因分型研究。使用的是改进的盐析法进行基因组DNA的提取。结果 TIRAP基因的5个Tag SNPs(rs563011、rs8177400、rs1786704、rs8177375、rs8177352),除了1个SNP位点(rs563011)等位基因检出率<95%及1个(rs8177400)AA基因型在人群中的分布为0,另外3个SNPs位点(rs1786704、rs8177375、rs8177352)的等位基因、基因型以及单体型在结核病组和对照组的分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 TIRAP基因多态性与中国汉族儿童结核病易感不存在相关性。 展开更多
关键词 tirap 多态性 结核病 中国汉族儿童 易感性
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TIRAP基因多态性与河北地区肺结核易感性的相关性研究 被引量:1
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作者 孙红梅 刘相 +3 位作者 孔祥龙 杜月菊 徐美丽 邸红芹 《河北医药》 CAS 2018年第2期170-174,共5页
目的探讨含Tou-白细胞介素1受体C(TIR)功能区的接头蛋白(TIR domain-containing adapter protein,TIRAP)基因的单核苷酸多态性(SNP)与肺结核遗传易感性之间的相关性。方法利用SNa Pshot技术分析法检测河北地区205例正常人(对照组)和214... 目的探讨含Tou-白细胞介素1受体C(TIR)功能区的接头蛋白(TIR domain-containing adapter protein,TIRAP)基因的单核苷酸多态性(SNP)与肺结核遗传易感性之间的相关性。方法利用SNa Pshot技术分析法检测河北地区205例正常人(对照组)和214例肺结核患者(均为汉族人,结核组)TIRAP基因的rs595209,rs7932766,rs8177374和rs8177400位点的多态性,并进行基因型频率和等位基因频率的比较,通过统计学方法分析这些基因的多态性与肺结核易感性之间的相关性。结果选取的214例结核患者和205例正常人年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05),rs595209,rs7932766,rs8177374和rs8177400位点的基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律,结核组的rs595209位点的基因型及等位基因、rs7932766位点的基因型及等位基因、rs8177374位点的基因型及等位基因与对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。对四个位点的等位基因和基因型的频率分布进行统计分析,发现在rs8177374位点等位基因A相对于等位基因G患结核的风险增加了10.9%(OR=1.109,95%CI:0.521~2.361,P=0.788)。进一步通过分析发现rs595209位点的GT基因型相对于GG基因型患结核的风险增加了31.4%(OR=1.314,95%CI:0.868~1.987),rs8177374位点的GA基因型相对于GG基因型患结核的风险增加了11.3%(OR=1.113,95%CI:0.516~2.401),但因为带有GT和GA基因型的人数较少,需要进一步通过加大样本量来进行验证。结论 TIRAP基因的rs595209,rs7932766,rs8177374和rs8177400位点多态性与河北地区汉族人的结核易感性没有显著的相关性。 展开更多
关键词 tirap 单核苷酸多态性 SNA Pshot分析 结核 遗传易感性
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鸡MyD88、TRIF和TIRAP基因荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 周作勇 聂奎 +3 位作者 王芝英 秦波 郭智莉 周雪梅 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期66-69,共4页
为对鸡髓样分化因子88(MyD88)、包含TIR结构域的IFN诱导连接蛋白(TRIF)和包含Toll/IL-1的接头蛋白(TIRAP)基因的进行定量检测,本研究参考鸡MyD88、TRIF和TIRAP基因序列,设计并合成特异性引物,以β-actin为内参基因,建立检测对应基因的... 为对鸡髓样分化因子88(MyD88)、包含TIR结构域的IFN诱导连接蛋白(TRIF)和包含Toll/IL-1的接头蛋白(TIRAP)基因的进行定量检测,本研究参考鸡MyD88、TRIF和TIRAP基因序列,设计并合成特异性引物,以β-actin为内参基因,建立检测对应基因的实时荧光定量PCR方法。结果表明,4个基因的扩增效率为96.7%~102%,相关系数均在0.997以上;特异性强,扩增产物均形成单一的特异性熔解峰;敏感性高,可以检测到对应基因达10-13 g/mL;重复性好,变异系数均在1.5%以下。本研究所建立的荧光定量PCR方法可用于鸡MyD88、TRIF和TIRAP基因表达研究。 展开更多
关键词 MYD88 TRIF tirap 实时荧光定量PCR
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尼罗罗非鱼TIRAP基因克隆、组织表达及其在无乳链球菌、脂多糖和聚肌胞苷酸刺激下的免疫应答 被引量:3
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作者 刘洁 高风英 +5 位作者 卢迈新 陈刚 曹建萌 刘志刚 王淼 韩雪晴 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期857-865,共9页
为研究包含TIR结构域的接头蛋白(TIR domain-containing adaptor protein,TIRAP)基因在TLR信号介导的先天免疫中的调控作用,通过反转录-聚合酶链式反应和分段扩增获得了尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus TIRAP基因的cDNA全长,并对其生... 为研究包含TIR结构域的接头蛋白(TIR domain-containing adaptor protein,TIRAP)基因在TLR信号介导的先天免疫中的调控作用,通过反转录-聚合酶链式反应和分段扩增获得了尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus TIRAP基因的cDNA全长,并对其生物信息学进行分析,利用RT-qPCR法分析TIRAP在健康鱼各组织中的表达情况,以及在无乳链球菌Streptococcus agalactiae、脂多糖(LPS)和聚肌胞苷酸(Poly I:C)刺激后不同组织不同时间点的表达量变化。结果表明:TIRAP cDNA全长2900 bp,开放阅读框为816 bp,可编码291个氨基酸;系统进化分析显示,尼罗罗非鱼与快乐东方鲷Astatotilapia calliptera TIRAP的亲缘关系较近;TIRAP在尼罗罗非鱼11个组织(肝、皮肤、心脏、肾、胃、鳃、脑、脾、肠、血液和肌肉)中均有表达,其中肌肉中表达量最高(P<0.05),胃中表达量相对较低;人工感染无乳链球菌引起TIRAP基因在肠和肾中上调表达,均在注射后1 d时表达量达到最大值;LPS和Poly I:C刺激引起TIRAP基因在肝、脾和肾中上调表达,但在肠中表达量均低于对照组(0 h)。研究表明,无乳链球菌、LPS和Poly I:C均能诱导TIRAP基因表达,TIRAP基因参与了尼罗罗非鱼免疫应答反应,暗示TIRAP在先天免疫中发挥作用。 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 包含TIR结构域的接头蛋白(tirap) 克隆 mRNA表达分析
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TIRAP rs8177374 gene polymorphism increased the risk of pulmonary tuberculosis in Zahedan,southeast Iran 被引量:8
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作者 Mohammad Naderi Mohammad Hashemi +3 位作者 Zahra Pourmontaseri Ebrahim Eskari-Nasab Gholamreza Bahari Mohsen Taheri 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2014年第6期451-455,共5页
Objective:To evaluate the possible association between Toll-interleukin 1 receptor(TIR) domain containing adaptor protein(TIRAP;also known as MAI.) rsl893352 and rs8l77374(S180L) gene polymorphisms and pulmonary tuber... Objective:To evaluate the possible association between Toll-interleukin 1 receptor(TIR) domain containing adaptor protein(TIRAP;also known as MAI.) rsl893352 and rs8l77374(S180L) gene polymorphisms and pulmonary tuberculosis(PTB) in a sample of Iranian population.Methods:This case-control study was performed on 174 PTB and 177 healthy subjects.Tetra amplification refractory mutation systetn-polymerase chain reaction(T-AKMS-PCR) was used to detect the polymorphisms.Results:Our finding showed that neither the overall Ckisqaare comparison of PTB and control subjects nor the logistic regression analysis indicated any association between rsl893352 polymorphism and PTB.Regarding rs8l77374 polymorphism,the CT genotype as well as CT+TT increased the risk of PTB in comparison with CC genotype(OR=4.73,95%CI=2.65-8.45,P<0.0001 and OR=6.47,95%C1=3.68-11.38,P<0.0001.respectively).The rs8177374 T allele increased the risk of PTB in comparison with C allele(OR=4.21.95%CI=2.43-7.26,P<0.0001).Conclusions:Our finding indicates that TIRAP rs8177374 polymorphism is associated with PTB in a sample of Iranian population. 展开更多
关键词 TUBERCULOSIS tirap MAL Single NUCLEOTIDE POLYMORPHISM
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TIRAP对上皮性卵巢癌细胞增殖和凋亡能力的影响
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作者 王杰 钱景荣 +1 位作者 卢莹莹 李文辉 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第22期3908-3913,共6页
目的:研究TIRAP在上皮性卵巢癌细胞中的表达情况,及其对上皮性卵巢癌细胞增殖和凋亡能力的影响。方法:通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot检测各组细胞中TIRAP的表达。利用CCK-8法、流式细胞技术探究TIRAP的表达对人上皮性卵... 目的:研究TIRAP在上皮性卵巢癌细胞中的表达情况,及其对上皮性卵巢癌细胞增殖和凋亡能力的影响。方法:通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot检测各组细胞中TIRAP的表达。利用CCK-8法、流式细胞技术探究TIRAP的表达对人上皮性卵巢癌细胞增殖和凋亡的影响。利用Western blot、ELISA法探究TIRAP的表达对p-NF-κB p65及下游免疫分子IL-6、TNF-α水平的影响。结果:与正常卵巢上皮细胞(IOSE-80)相比,上皮性卵巢癌细胞(SKOV-3,OVCAR3,A2780)中TIRAP的mRNA和蛋白表达显著升高。转染TIRAP siRNA后,SKOV-3细胞中TIRAP的表达显著降低;CCK-8实验显示:转染培养第96 h时,si-TIRAP组OD值(1.85±0.06)较Blank组(2.42±0.16)及Scramble control组(2.50±0.10)明显降低;细胞凋亡检测显示:si-TIRAP组凋亡率明显高于对照组;Western blot实验显示:LPS+si-TIRAP组p-NF-κB p65的表达与对照组相比显著降低;ELISA实验显示:LPS+si-TIRAP组IL-6、TNF-α的含量与对照组相比显著下降。结论:TIRAP在上皮性卵巢癌细胞中的表达升高,可能是上皮性卵巢癌细胞增殖的机制之一;下调TIRAP的表达可以抑制上皮性卵巢癌细胞增殖,促进细胞凋亡,并且通过抑制NF-κB通路的活化降低其下游免疫分子的表达。 展开更多
关键词 上皮性卵巢癌 tirap NF-ΚB通路 增殖 凋亡
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牛TIRAP基因编码区分离及其结构与功能分析
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作者 王兴平 罗仍卓么 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第12期20-22,共3页
为了探讨牛乳房炎的分子机制,试验采用RT-PCR和测序相结合的方法克隆了牛TIRAP基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了TIRAP基因及其所编码蛋白质的结构和功能。结果表明:获得TIRAP基因的cDNA序列,其1~699 bp为编码区(CDS区),编... 为了探讨牛乳房炎的分子机制,试验采用RT-PCR和测序相结合的方法克隆了牛TIRAP基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了TIRAP基因及其所编码蛋白质的结构和功能。结果表明:获得TIRAP基因的cDNA序列,其1~699 bp为编码区(CDS区),编码232个氨基酸,其蛋白质的分子质量为24 433.5 u,等电点为6.95,含有TIR结构域(95~179aa),位于细胞核、细胞质、线粒体、细胞骨架等多种细胞器上;该蛋白与人、小鼠、大鼠和狗蛋白的同源性分别为76%、65%、64%和76%,TIR结构域的同源性均达到85%左右。结合人、小鼠TIRAP在TLRs信号转导中的重要作用,说明牛TIRAP蛋白可作为牛TLRs信号转导中的重要信息分子,在乳房炎等受病原体感染所致疾病抗性的分子机制中发挥重要功能。 展开更多
关键词 tirap基因 基因克隆 生物信息学
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外周血中TLR4、TIRAP表达与脓毒症相关性研究 被引量:9
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作者 齐眀禄 杨敬平 +2 位作者 银雪 陈偲 徐喜媛 《临床肺科杂志》 2015年第1期19-22,共4页
目的探讨外周血中TOLL样受体4(TLR4)及TOLL/白介素-1受体相关蛋白(TIRAP)水平与脓毒症严重程度的相关性。方法 30例正常健康体检者为正常组,53例脓毒症患者,进行APACHEⅡ评分,APACHEⅡ≤20患者40例为脓毒症低评分组,APACHEⅡ>20患者1... 目的探讨外周血中TOLL样受体4(TLR4)及TOLL/白介素-1受体相关蛋白(TIRAP)水平与脓毒症严重程度的相关性。方法 30例正常健康体检者为正常组,53例脓毒症患者,进行APACHEⅡ评分,APACHEⅡ≤20患者40例为脓毒症低评分组,APACHEⅡ>20患者13例为脓毒症高评分组。所有研究对象应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测静脉血清总TLR4、TIRAP浓度。结果血清中TLR4及TIRAP浓度:正常组为0.886±0.058 ng/ml及5.216±0.410 ng/ml、脓毒症低评分组为2.253±0.379 ng/ml及9.540±2.294ng/ml、脓毒症高评分组为4.494±0.709 ng/ml及19.206±1.755 ng/ml,脓毒症低评分组及脓毒症高评分组与正常组相比均有显著性差异(P均=0.000),脓毒症低评分组与脓毒症高评分组相比存在显著性差异(P均=0.000)。以APACHEⅡ评分等于20分为界,即脓毒症低评分组为低危患者,脓毒症高评分组为高危患者,来区分脓毒症严重程度。经Pearson相关分析,TLR4浓度与脓毒症严重程度呈正相关(r=0.931,P<0.05),TIRAP浓度与脓毒症严重程度也呈正相关(r=0.972,P<0.05),TLR4浓度与TIRAP浓度呈正相关(r=0.936,P<0.05)。结论脓毒症患者血清总TLR4、TIRAP水平可以预测及判断脓毒症严重程度。 展开更多
关键词 脓毒症 TOLL样受体4 TOLL/白介素-1受体相关蛋白
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藻蓝色素蛋白诱导非小细胞肺癌H1299细胞凋亡的机制
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作者 郝帅 李前程 +3 位作者 李爽 刘媛璞 王静 王成涛 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第12期8-15,共8页
藻蓝色素蛋白是一种被广泛认可的天然食品着色剂,也是一种重要的功能性食品,具有优良的抗炎、抗氧化及抗肿瘤特性。前期试验表明:藻蓝蛋白能够诱导非小细胞肺癌H1299细胞的凋亡。本研究以高通量转录组技术为手段,对藻蓝蛋白处理前、后的... 藻蓝色素蛋白是一种被广泛认可的天然食品着色剂,也是一种重要的功能性食品,具有优良的抗炎、抗氧化及抗肿瘤特性。前期试验表明:藻蓝蛋白能够诱导非小细胞肺癌H1299细胞的凋亡。本研究以高通量转录组技术为手段,对藻蓝蛋白处理前、后的H1299细胞进行差异基因的筛选,探究藻蓝蛋白在非小细胞肺癌中的调控机制。转录组分析显示:藻蓝蛋白能够显著降低H1299细胞内toll-白介素1受体域接头蛋白(TIRAP)基因的表达;采用siRNA干预TIRAP的表达后,H1299细胞出现凋亡,细胞形态发生非正常改变,细胞增殖能力显著降低,促凋亡蛋白Bax表达上调,抑凋亡蛋白Bcl-xL表达下调;同时,沉默TIRAP的表达能够显著降低H1299细胞中NF-κB信号通路的活性。本研究表明:藻蓝蛋白能够抑制TIRAP的表达,通过降低NF-κB信号通路的活性而诱导H1299细胞的凋亡。此结果揭示了藻蓝蛋白在非小细胞肺癌中的作用机制,为肺癌的潜在治疗和藻蓝类功能性食品添加剂的开发和利用提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 藻蓝蛋白 H1299细胞 转录组 toll-白介素1受体域接头蛋白(tirap) 细胞凋亡
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