目的采用定量蛋白质组学串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)技术筛选少精子症患者精子差异表达蛋白质,初步寻找少精子症的潜在生物学标志物,阐释相关的生物学过程及代谢通路,为少精子症的分子机制研究提供新的思路。方法随机选取少精子...目的采用定量蛋白质组学串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)技术筛选少精子症患者精子差异表达蛋白质,初步寻找少精子症的潜在生物学标志物,阐释相关的生物学过程及代谢通路,为少精子症的分子机制研究提供新的思路。方法随机选取少精子症患者和正常人精子样本,各30例。应用TMT技术寻找并鉴定差异表达蛋白质,对差异蛋白进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG通路分析。结果共鉴定1050种差异表达蛋白质,其中561种蛋白质上调表达,489种蛋白质下调表达。GO功能富集分析发现上述差异表达蛋白质参与了终止翻译和核转录mRNA分解代谢过程等生物过程;且主要分布在部分胞质和胞质核糖体中;分子功能是核糖体结构成分和结构分子活性等。KEGG信号通路分析涉及代谢通路、核糖体信号通路、氧化磷酸化信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论差异表达蛋白质的生物信息学有助于少精子症发病机制研究,可作为其分子机制研究的参考和补充。展开更多
目的：采用同位素相对标记与绝对定量技术（TMT）联合二维液相色谱-串联质谱（2D-LC-MS/MS）,筛选系统性红斑狼疮（Systemic Lupus Erythematosus,SLE）合并激素性股骨头坏死（steroid induced osteonecrosis of the femoral head,SONF...目的：采用同位素相对标记与绝对定量技术（TMT）联合二维液相色谱-串联质谱（2D-LC-MS/MS）,筛选系统性红斑狼疮（Systemic Lupus Erythematosus,SLE）合并激素性股骨头坏死（steroid induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH）筋脉瘀滞证、肝肾亏虚证患者与健康人之间的血清差异蛋白质,初步寻找出两种不同证型的潜在生物学标志物。方法：分别收集SONFH筋脉瘀滞证患者、肝肾亏虚证患者及健康人各5例血清,应用TMT联合2D-LC-MS/MS检测技术,寻找并鉴定差异表达的蛋白质。结果：共筛选出IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA SAA1、ACTB、CRP共10个表达差异倍数在两倍以上显著表达的蛋白质。其中IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA筋脉瘀滞组中显著表达;SAA1、ACTB、CRP肝肾亏虚组中显著表达。结论：IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA可能是SLE合并SONFH筋脉瘀滞证潜在的血清特异性蛋白标志物;SAA1、ACTB、CRP可能是SLE合并SONFH肝肾亏虚证潜在的血清特异性蛋白标志物。展开更多
该文探讨人皮肤成纤维细胞(NCF)和脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)分泌蛋白的差异,从而初步阐明脐带间充质干细胞分泌蛋白对于治疗退行性疾病的可能分子机理。基于串联质谱(LC-MS/MS)的方法,收集用无血清培养基培养48 h的NCF和hUC-MSCs上清...该文探讨人皮肤成纤维细胞(NCF)和脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)分泌蛋白的差异,从而初步阐明脐带间充质干细胞分泌蛋白对于治疗退行性疾病的可能分子机理。基于串联质谱(LC-MS/MS)的方法,收集用无血清培养基培养48 h的NCF和hUC-MSCs上清样品,进行TMT(tandem mass tags for relative and absolute quantitation)检测,从而对蛋白质酶解之后的肽段进行同位素标记,之后对分泌蛋白的表达差异进行精确的鉴定和定量。通过生物信息学分析,建立NCF和hUC-MSCs分泌蛋白谱图,并通过GO(gene ontology)对这些分泌蛋白进行功能分析,对于在蛋白分子互作图中处于中心位置的CCL2、COL4A1、TGFβ1、SERPINE1、SEMA7A我们进行了Real-time PCR定量分析。通过TMT以及生物信息学分析,该文鉴定出1000多种共有蛋白,其中有704种蛋白在hUC-MSCs中的表达量比NCF中高。通过Real-time PCR,我们证实了CCL2、COL4A1在hUC-MSCs中的分泌量的确高于其在NCF中的分泌量,且差异具有显著性。通过检索文献以及Uniprot的相应数据库数据,该文发现,这两种分子在炎症的消除方面起到十分重要的作用,而炎症反应在帕金森病等退行性疾病的发生与发展过程中起到重要作用。通过对NCF和hUC-MSCs培养基中分泌的蛋白进行检测分析,该研究为探讨脐带间充质干细胞分泌蛋白治疗神经退行性疾病的可能分子机制提供启示。展开更多
文摘目的采用定量蛋白质组学串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)技术筛选少精子症患者精子差异表达蛋白质,初步寻找少精子症的潜在生物学标志物,阐释相关的生物学过程及代谢通路,为少精子症的分子机制研究提供新的思路。方法随机选取少精子症患者和正常人精子样本,各30例。应用TMT技术寻找并鉴定差异表达蛋白质,对差异蛋白进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG通路分析。结果共鉴定1050种差异表达蛋白质,其中561种蛋白质上调表达,489种蛋白质下调表达。GO功能富集分析发现上述差异表达蛋白质参与了终止翻译和核转录mRNA分解代谢过程等生物过程;且主要分布在部分胞质和胞质核糖体中;分子功能是核糖体结构成分和结构分子活性等。KEGG信号通路分析涉及代谢通路、核糖体信号通路、氧化磷酸化信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论差异表达蛋白质的生物信息学有助于少精子症发病机制研究,可作为其分子机制研究的参考和补充。
文摘目的：采用同位素相对标记与绝对定量技术（TMT）联合二维液相色谱-串联质谱（2D-LC-MS/MS）,筛选系统性红斑狼疮（Systemic Lupus Erythematosus,SLE）合并激素性股骨头坏死（steroid induced osteonecrosis of the femoral head,SONFH）筋脉瘀滞证、肝肾亏虚证患者与健康人之间的血清差异蛋白质,初步寻找出两种不同证型的潜在生物学标志物。方法：分别收集SONFH筋脉瘀滞证患者、肝肾亏虚证患者及健康人各5例血清,应用TMT联合2D-LC-MS/MS检测技术,寻找并鉴定差异表达的蛋白质。结果：共筛选出IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA SAA1、ACTB、CRP共10个表达差异倍数在两倍以上显著表达的蛋白质。其中IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA筋脉瘀滞组中显著表达;SAA1、ACTB、CRP肝肾亏虚组中显著表达。结论：IGHV3-7、IGHV1OR15-1、ABCB9、FGB、F13A1、FGG、FGA可能是SLE合并SONFH筋脉瘀滞证潜在的血清特异性蛋白标志物;SAA1、ACTB、CRP可能是SLE合并SONFH肝肾亏虚证潜在的血清特异性蛋白标志物。
文摘该文探讨人皮肤成纤维细胞(NCF)和脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)分泌蛋白的差异,从而初步阐明脐带间充质干细胞分泌蛋白对于治疗退行性疾病的可能分子机理。基于串联质谱(LC-MS/MS)的方法,收集用无血清培养基培养48 h的NCF和hUC-MSCs上清样品,进行TMT(tandem mass tags for relative and absolute quantitation)检测,从而对蛋白质酶解之后的肽段进行同位素标记,之后对分泌蛋白的表达差异进行精确的鉴定和定量。通过生物信息学分析,建立NCF和hUC-MSCs分泌蛋白谱图,并通过GO(gene ontology)对这些分泌蛋白进行功能分析,对于在蛋白分子互作图中处于中心位置的CCL2、COL4A1、TGFβ1、SERPINE1、SEMA7A我们进行了Real-time PCR定量分析。通过TMT以及生物信息学分析,该文鉴定出1000多种共有蛋白,其中有704种蛋白在hUC-MSCs中的表达量比NCF中高。通过Real-time PCR,我们证实了CCL2、COL4A1在hUC-MSCs中的分泌量的确高于其在NCF中的分泌量,且差异具有显著性。通过检索文献以及Uniprot的相应数据库数据,该文发现,这两种分子在炎症的消除方面起到十分重要的作用,而炎症反应在帕金森病等退行性疾病的发生与发展过程中起到重要作用。通过对NCF和hUC-MSCs培养基中分泌的蛋白进行检测分析,该研究为探讨脐带间充质干细胞分泌蛋白治疗神经退行性疾病的可能分子机制提供启示。
