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蒲公英TmRAV1基因克隆及其响应脱落酸信号表达分析
1
作者
吴志清
亓希武
+5 位作者
房海灵
于盱
李莉
柏杨
刘群
梁呈元
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期47-58,共12页
根据脱落酸处理的蒲公英(Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz.)的转录组数据,在蒲公英中克隆获得1个编码RAV转录因子的基因序列,命名为TmRAV1。TmRAV1的开放阅读框(ORF)长度为1026 bp,编码342个氨基酸。TmRAV1的理论相对分子质量为38229,...
根据脱落酸处理的蒲公英(Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz.)的转录组数据,在蒲公英中克隆获得1个编码RAV转录因子的基因序列,命名为TmRAV1。TmRAV1的开放阅读框(ORF)长度为1026 bp,编码342个氨基酸。TmRAV1的理论相对分子质量为38229,理论等电点为pI 9.20。TmRAV1为不稳定蛋白,具有亲水性,没有跨膜结构域和信号肽,含有44个磷酸化位点。氨基酸序列比对结果显示:TmRAV1与莴苣(Lactuca sativa Linn.)LsRAV1氨基酸序列的同源性最高(一致性为85.88%),具有高度保守的AP2和B3结构域。系统发育分析结果表明TmRAV1与其他5种植物的RAV转录因子聚在一起。TmRAV1在蒲公英叶中的相对表达量显著(P<0.05)高于根和花。TmRAV1受100μmol·L^(-1)脱落酸和250 mmol·L^(-1)NaCl的显著诱导。TmRAV1能够显著上调脱落酸敏感型转录因子基因TmAREB1的表达。TmRAV1是核定位转录因子,与脱落酸信号核心蛋白家族成员TmSnRK2.6互作。综上所述,蒲公英TmRAV1响应脱落酸等多种信号,其编码蛋白与TmSnRK2.6互作,并调控TmAREB1的表达。
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关键词
蒲公英
tmrav1
基因克隆
表达
脱落酸信号响应
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职称材料
题名
蒲公英TmRAV1基因克隆及其响应脱落酸信号表达分析
1
作者
吴志清
亓希武
房海灵
于盱
李莉
柏杨
刘群
梁呈元
机构
南京中医药大学
江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期47-58,共12页
基金
国家自然科学基金项目(32200299)
江苏省自然科学基金项目(BK20220753)
江苏省植物资源研究与利用重点实验室开放基金项目(JSPKLB202201,JSPKLB202310)。
文摘
根据脱落酸处理的蒲公英(Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz.)的转录组数据,在蒲公英中克隆获得1个编码RAV转录因子的基因序列,命名为TmRAV1。TmRAV1的开放阅读框(ORF)长度为1026 bp,编码342个氨基酸。TmRAV1的理论相对分子质量为38229,理论等电点为pI 9.20。TmRAV1为不稳定蛋白,具有亲水性,没有跨膜结构域和信号肽,含有44个磷酸化位点。氨基酸序列比对结果显示:TmRAV1与莴苣(Lactuca sativa Linn.)LsRAV1氨基酸序列的同源性最高(一致性为85.88%),具有高度保守的AP2和B3结构域。系统发育分析结果表明TmRAV1与其他5种植物的RAV转录因子聚在一起。TmRAV1在蒲公英叶中的相对表达量显著(P<0.05)高于根和花。TmRAV1受100μmol·L^(-1)脱落酸和250 mmol·L^(-1)NaCl的显著诱导。TmRAV1能够显著上调脱落酸敏感型转录因子基因TmAREB1的表达。TmRAV1是核定位转录因子,与脱落酸信号核心蛋白家族成员TmSnRK2.6互作。综上所述,蒲公英TmRAV1响应脱落酸等多种信号,其编码蛋白与TmSnRK2.6互作,并调控TmAREB1的表达。
关键词
蒲公英
tmrav1
基因克隆
表达
脱落酸信号响应
Keywords
Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz.
tmrav1
gene cloning
expression
response to abscisic acid signaling
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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题名
作者
出处
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1
蒲公英TmRAV1基因克隆及其响应脱落酸信号表达分析
吴志清
亓希武
房海灵
于盱
李莉
柏杨
刘群
梁呈元
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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