目的:明确山西陈醋中的小分子肽类化学成分,并进一步探讨其针对心血管等疾病的潜在作用机制。方法:采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术结合GNPS分子网络技术分析山西陈醋中的小分子肽类成分。运用Genecards...目的:明确山西陈醋中的小分子肽类化学成分,并进一步探讨其针对心血管等疾病的潜在作用机制。方法:采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术结合GNPS分子网络技术分析山西陈醋中的小分子肽类成分。运用Genecards、Drugbank 5.0、DAVID等数据库对小分子肽类化合物靶点及通路进行分析,并通过Cytoscape软件构建“成分-靶点-信号通路-疾病”网络。使用Autodock Dock 1.5.6和PyMol 2.5.5进行山西陈醋核心靶点与关键成分的分子对接。结果:共鉴定出41个小分子肽类化合物,其中包括27个环二肽、10个直链二肽和4个三肽类化合物。其发挥心血管和肥胖等保健作用的“成分-靶点-信号通路-疾病”网络包含14个活性成分和109个药物靶点。通路富集分析得到59条信号通路。分子对接结果表明Cyclo(Leu-Pro)、Val-Val、Pro-Phe、Cyclo(His-Pro)等成分可能与核心靶点F2、MAPK1,MMP9、VCAM1等具有较好的结合能力,初步验证了网络药理学预测结果的准确性。结论:山西陈醋可能通过多成分、多靶点、多通路协同发挥预防调节心血管疾病和肥胖等疾病的保健作用。展开更多
目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术和网络药理学探讨柔肝方治疗肝纤维化的作用机制。方法:将8只C57BL/J小鼠随机分成空白血清组和柔肝方含药血清组,每组4只。利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术结合Xcalibur软...目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术和网络药理学探讨柔肝方治疗肝纤维化的作用机制。方法:将8只C57BL/J小鼠随机分成空白血清组和柔肝方含药血清组,每组4只。利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术结合Xcalibur软件分析空白血清和柔肝方含药血清数据,结合二级谱图鉴定柔肝方的入血成分。通过Swiss Target Prediction数据库和中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索柔肝方入血成分的靶点。利用GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank Online和Therapeutic Target Database数据库检索肝纤维化的靶点。采用Cytoscape软件构建“疾病-化合物-靶点”网络,并筛选柔肝方抗肝纤维化的关键成分。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,通过拓扑分析筛选柔肝方抗肝纤维化的核心靶点。采用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果:柔肝方入血成分主要包括氧化槐果碱、槐果碱、高黄芩素、新补骨脂异黄酮等。通过检索获取柔肝方入血成分相关靶点303个,肝纤维化相关靶点6 331个,两者的交集靶点250个。柔肝方抗肝纤维化的关键成分包括槲皮素、芹菜素、山柰酚、芒柄花黄素等。柔肝方抗肝纤维化的核心靶点包括原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(protein kinase B,PKB,又称AKT1)等。GO分析主要涉及细胞因子介导的信号通路、凋亡过程的负调控、炎症反应、蛋白激酶活性等。KEGG分析主要涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、白细胞介素(interleukin,IL)-17信号通路、HIF-1信号通路等。结论:柔肝方可能通过槲皮素、芹菜素、山柰酚等化合物调控PI3K-Akt、MAPK、IL-17等信号通路,作用于SRC、STAT3、MAPK1等靶点,从而发挥抗肝纤维化的作用,体现了多成分、多途径、多靶点的药理特征。展开更多
文摘目的:明确山西陈醋中的小分子肽类化学成分,并进一步探讨其针对心血管等疾病的潜在作用机制。方法:采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术结合GNPS分子网络技术分析山西陈醋中的小分子肽类成分。运用Genecards、Drugbank 5.0、DAVID等数据库对小分子肽类化合物靶点及通路进行分析,并通过Cytoscape软件构建“成分-靶点-信号通路-疾病”网络。使用Autodock Dock 1.5.6和PyMol 2.5.5进行山西陈醋核心靶点与关键成分的分子对接。结果:共鉴定出41个小分子肽类化合物,其中包括27个环二肽、10个直链二肽和4个三肽类化合物。其发挥心血管和肥胖等保健作用的“成分-靶点-信号通路-疾病”网络包含14个活性成分和109个药物靶点。通路富集分析得到59条信号通路。分子对接结果表明Cyclo(Leu-Pro)、Val-Val、Pro-Phe、Cyclo(His-Pro)等成分可能与核心靶点F2、MAPK1,MMP9、VCAM1等具有较好的结合能力,初步验证了网络药理学预测结果的准确性。结论:山西陈醋可能通过多成分、多靶点、多通路协同发挥预防调节心血管疾病和肥胖等疾病的保健作用。
文摘目的采用超高液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术与网络药理学探讨人参黄精杏麦饮抗疲劳的药效物质及作用机制。方法通过UPLC-Q-TOF-MS技术鉴定人参黄精杏麦饮化学成分,并利用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库预测化学成分相关靶点;利用Disgenet、Genecards数据库检索疲劳靶点,利用韦恩图绘制平台获取共有靶点,并将信息导入Cytoscope3.7.1软件和STRING在线分析平台,进行网络拓扑学分析,构建药物-活性成分-关键靶点网络。最后,通过DAVID数据库进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)通路富集分析。结果通过UPLC-Q-TOF-MS分析鉴定出35个药物活性成分,主要为黄酮类;对药物和疾病靶标集进行拓扑分析,获得14个关键成分和39个核心靶点;通过KEGG富集到癌症、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt、脂质与动脉粥样硬化和糖尿病并发症中的AGE-RAGE等信号通路。结论人参黄精杏麦饮的活性成分通过作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、磷酸甘油醛脱氢酶、白细胞介素-6、肿瘤坏死因子等靶标改善机体氧化应激反应、减轻免疫介导的炎症和感染以及调控细胞增殖、分化、凋亡等多种细胞功能发挥抗疲劳作用,初步阐明人参黄精杏麦饮抗疲劳的作用,为后续深入研究提供参考。
文摘分析补骨脂醇提物(Psoraleae Fructus alcohol extract,PFE)化学成分并探讨其促黑色素生成作用机制。采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)对PFE化学成分进行鉴定;观察PFE对斑马鱼黑色素生成的影响;通过实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)考察PFE、补骨脂素和异补骨脂素对小鼠黑色素瘤细胞B16-F10中酪氨酸酶(tyrosinase,Tyr)、酪氨酸酶相关蛋白1(Tyr-related protein 1,Tyrp1)和相关蛋白2(Tyr-related protein 2,Tyrp2)mRNA表达的影响。结果在PFE中共鉴定47个化学成分,其中黄酮类27个,香豆素类10个,单萜酚类8个和其他类2个;发现PFE作用斑马鱼18 hpf(受精后小时,hours post fertilization)后,能明显增加其体内黑色素水平;qRT-PCR结果显示,与对照组相比,PFE能显著增加Tyr和Tyrp2 mRNA的表达,其他给药组均能不同程度地增加Tyr、Tyrp1和Tyrp2 mRNA的表达。
文摘目的:基于超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术和网络药理学探讨柔肝方治疗肝纤维化的作用机制。方法:将8只C57BL/J小鼠随机分成空白血清组和柔肝方含药血清组,每组4只。利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术结合Xcalibur软件分析空白血清和柔肝方含药血清数据,结合二级谱图鉴定柔肝方的入血成分。通过Swiss Target Prediction数据库和中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索柔肝方入血成分的靶点。利用GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank Online和Therapeutic Target Database数据库检索肝纤维化的靶点。采用Cytoscape软件构建“疾病-化合物-靶点”网络,并筛选柔肝方抗肝纤维化的关键成分。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,通过拓扑分析筛选柔肝方抗肝纤维化的核心靶点。采用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果:柔肝方入血成分主要包括氧化槐果碱、槐果碱、高黄芩素、新补骨脂异黄酮等。通过检索获取柔肝方入血成分相关靶点303个,肝纤维化相关靶点6 331个,两者的交集靶点250个。柔肝方抗肝纤维化的关键成分包括槲皮素、芹菜素、山柰酚、芒柄花黄素等。柔肝方抗肝纤维化的核心靶点包括原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(protein kinase B,PKB,又称AKT1)等。GO分析主要涉及细胞因子介导的信号通路、凋亡过程的负调控、炎症反应、蛋白激酶活性等。KEGG分析主要涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、白细胞介素(interleukin,IL)-17信号通路、HIF-1信号通路等。结论:柔肝方可能通过槲皮素、芹菜素、山柰酚等化合物调控PI3K-Akt、MAPK、IL-17等信号通路,作用于SRC、STAT3、MAPK1等靶点,从而发挥抗肝纤维化的作用,体现了多成分、多途径、多靶点的药理特征。
