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甘蓝型冬油菜VDAC1基因的克隆、表达分析与亚细胞定位
被引量:
1
1
作者
张娜
武军艳
+8 位作者
祁伟亮
马骊
曾瑞
陶肖蕾
杨雯昕
刘丽君
李学才
杨刚
孙万仓
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期694-703,共10页
为研究甘蓝型冬油菜VDAC1基因在低温胁迫下的功能,以弱抗寒性甘蓝型油菜天油2288和强抗寒性甘蓝型油菜16NTS309为材料,分别以天油2288和16NTS309的cDNA为模板,克隆得到BnVDAC1基因CDS区。生物信息学分析发现,两基因编码区氨基酸数目都为...
为研究甘蓝型冬油菜VDAC1基因在低温胁迫下的功能,以弱抗寒性甘蓝型油菜天油2288和强抗寒性甘蓝型油菜16NTS309为材料,分别以天油2288和16NTS309的cDNA为模板,克隆得到BnVDAC1基因CDS区。生物信息学分析发现,两基因编码区氨基酸数目都为276,等电点分别是7.28和8.46,是稳定性蛋白(<40为稳定),二级结构以无规则卷曲为主,三级结构都是由β-折叠环绕组成两个β-桶状结构。构建pBI121-BnVDAC1-GFP融合表达载体,进行烟草叶片亚细胞定位发现,BnVDAC1主要定位于线粒体或质膜。联系定量结果表明,低温处理下两个品种叶片的相对电导率、叶片相对含水量、H_(2)O_(2)和O_(2)^(⋅-)含量有差异,且与BnVDAC1的表达量有相关关系,BnVDAC1基因具有明显的品种特异性和组织表达特异性。
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关键词
甘蓝型冬油菜
低温胁迫
活性氧
vdac1
基因
表达分析
亚细胞定位
下载PDF
职称材料
鸡gga-miR-7b靶基因VDAC1-3’UTR双荧光素酶报告基因质粒的构建
被引量:
1
2
作者
肖春婷
廉传江
+1 位作者
易诚
陈洪岩
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期533-538,共6页
本研究以鸡gga-miR-7b作为研究对象,为了明确与肿瘤形成相关的关键基因VDAC1(Voltage-dependent anion channel 1)是否为gga-miR-7b的靶基因,深入研究gga-miR-7b对VDAC1基因的调控作用,本研究运用TargetScan和miRBD生物学软件预测了gga-...
本研究以鸡gga-miR-7b作为研究对象,为了明确与肿瘤形成相关的关键基因VDAC1(Voltage-dependent anion channel 1)是否为gga-miR-7b的靶基因,深入研究gga-miR-7b对VDAC1基因的调控作用,本研究运用TargetScan和miRBD生物学软件预测了gga-miR-7b与VDAC1 m RNA的3’端非编码区(3’UTR)存在种子结合位点(GTCTTCC),并使用PCR克隆以及同源重组突变的方法构建VDAC1-3’UTR野生型和突变型双荧光素酶报告基因重组质粒,经SacⅠ和XbaⅠ双酶切鉴定及测序结果显示,片段大小符合且序列正确;成功构建了VDAC1-3’UTR野生型和突变型双荧光素酶报告基因重组质粒并命名为pmirGLOVDAC1-wt3’UTR和pmirGLO-VDAC1-mut3’UTR。本研究结果进一步为gga-miR-7b候选靶基因VDAC1的鉴定以及功能研究提供理论依据。
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关键词
马立克氏病
gga-miR-7b
vdac1
基因
pmirGLO-
vdac1
-wt-3’UTR
pmirGLO-
vdac1
-mut-3’UTR
原文传递
题名
甘蓝型冬油菜VDAC1基因的克隆、表达分析与亚细胞定位
被引量:
1
1
作者
张娜
武军艳
祁伟亮
马骊
曾瑞
陶肖蕾
杨雯昕
刘丽君
李学才
杨刚
孙万仓
机构
甘肃农业大学农学院
干旱生境作物学国家重点实验室
陇东师范学院
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期694-703,共10页
基金
2021年现代丝路寒旱农业科技支撑项目(GSLK-2021-12)
甘肃省耕地质量建设保护总站横向经费(GSAU-JSYF-2021-020)
+3 种基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-12)
甘肃省教育科技创新基金项目(2022B-209)
庆阳市创新基地和人才计划项目(QY2021BF003)
陇东学院博士基金项目(901110050311)。
文摘
为研究甘蓝型冬油菜VDAC1基因在低温胁迫下的功能,以弱抗寒性甘蓝型油菜天油2288和强抗寒性甘蓝型油菜16NTS309为材料,分别以天油2288和16NTS309的cDNA为模板,克隆得到BnVDAC1基因CDS区。生物信息学分析发现,两基因编码区氨基酸数目都为276,等电点分别是7.28和8.46,是稳定性蛋白(<40为稳定),二级结构以无规则卷曲为主,三级结构都是由β-折叠环绕组成两个β-桶状结构。构建pBI121-BnVDAC1-GFP融合表达载体,进行烟草叶片亚细胞定位发现,BnVDAC1主要定位于线粒体或质膜。联系定量结果表明,低温处理下两个品种叶片的相对电导率、叶片相对含水量、H_(2)O_(2)和O_(2)^(⋅-)含量有差异,且与BnVDAC1的表达量有相关关系,BnVDAC1基因具有明显的品种特异性和组织表达特异性。
关键词
甘蓝型冬油菜
低温胁迫
活性氧
vdac1
基因
表达分析
亚细胞定位
Keywords
Brassica napus
low temperature stress
reactive oxygen species
vdac1 gene
expression analy-sis
subcellular localization
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
鸡gga-miR-7b靶基因VDAC1-3’UTR双荧光素酶报告基因质粒的构建
被引量:
1
2
作者
肖春婷
廉传江
易诚
陈洪岩
机构
东北农业大学生命科学学院
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
东北林业大学生命科学学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期533-538,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.31500997)资助。
文摘
本研究以鸡gga-miR-7b作为研究对象,为了明确与肿瘤形成相关的关键基因VDAC1(Voltage-dependent anion channel 1)是否为gga-miR-7b的靶基因,深入研究gga-miR-7b对VDAC1基因的调控作用,本研究运用TargetScan和miRBD生物学软件预测了gga-miR-7b与VDAC1 m RNA的3’端非编码区(3’UTR)存在种子结合位点(GTCTTCC),并使用PCR克隆以及同源重组突变的方法构建VDAC1-3’UTR野生型和突变型双荧光素酶报告基因重组质粒,经SacⅠ和XbaⅠ双酶切鉴定及测序结果显示,片段大小符合且序列正确;成功构建了VDAC1-3’UTR野生型和突变型双荧光素酶报告基因重组质粒并命名为pmirGLOVDAC1-wt3’UTR和pmirGLO-VDAC1-mut3’UTR。本研究结果进一步为gga-miR-7b候选靶基因VDAC1的鉴定以及功能研究提供理论依据。
关键词
马立克氏病
gga-miR-7b
vdac1
基因
pmirGLO-
vdac1
-wt-3’UTR
pmirGLO-
vdac1
-mut-3’UTR
Keywords
Marek’s disease
gga-miR-7b
vdac1 gene
pmirGLO-
vdac1
-wt-3’UTR
pmirGLO-
vdac1
-mut-3’UTR
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝型冬油菜VDAC1基因的克隆、表达分析与亚细胞定位
张娜
武军艳
祁伟亮
马骊
曾瑞
陶肖蕾
杨雯昕
刘丽君
李学才
杨刚
孙万仓
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
鸡gga-miR-7b靶基因VDAC1-3’UTR双荧光素酶报告基因质粒的构建
肖春婷
廉传江
易诚
陈洪岩
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
原文传递
已选择
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