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广州地区耐多药结核分枝杆菌MIRU-VNTR位点与耐药性变迁的关联研究
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作者 刘振宁 刘志辉 《国际医药卫生导报》 2023年第22期3259-3264,共6页
目的探讨广州地区耐多药结核分枝杆菌散在重复单元-数目可变串联重复序列(ycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat,MIRU-VNTR)与耐药性变迁的关系。方法对2011至2015年广州市胸科医院收治的36例耐多... 目的探讨广州地区耐多药结核分枝杆菌散在重复单元-数目可变串联重复序列(ycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat,MIRU-VNTR)与耐药性变迁的关系。方法对2011至2015年广州市胸科医院收治的36例耐多药结核病患者在治疗期间的多次分离培养株105株(2~8株不等)进行MIRU-VNTR分型,分析在治疗期间异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、阿米卡星、左氧氟沙星和莫西沙星等耐药性有变化者与16个MIRU-VNTR位点多态性之间的相关性。耐药表型和VNTR位点之间的相关性使用χ^(2)检验。结果61.1%(22/36)的患者(69株)发生了耐药性变迁,其中异烟肼耐药表型变迁结核菌4株(5.8%),乙胺丁醇耐药表型变迁结核菌18株(26.1%),链霉素耐药表型变迁结核菌8株(11.6%),阿米卡星耐药表型变迁结核菌8株(11.6%),左氧氟沙星耐药表型变迁结核菌21株(30.4%),莫西沙星耐药表型变迁结核菌25株(36.2%)。耐药表型变迁百分率顺序:莫西沙星>左氧氟沙星>乙胺丁醇>链霉素/阿米卡星>异烟肼,6种耐药表型均存在菌株由敏感变为耐药或耐药变为敏感的情况。耐多药结核分枝杆菌的耐药变迁表型与VNTR位点的整体关联差异无统计学意义(P>0.05),耐药变迁表型无变化与具有4种耐药变迁表型变化的VNTR位点关联差异有统计学意义(P<0.05)。乙胺丁醇耐药表型-VNTR4348、链霉素耐药表型-VNTR0595、莫西沙星耐药表型-VNTR1907和莫西沙星耐药表型-VNTR1895差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论耐多药结核病患者病原菌耐药性变迁与MIRU-VNTR多态性存在关联,具体机制尚待进一步研究。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐多药 耐药性变迁 MIRU-vntr 基因分型
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中国人eNOS基因VNTR多态性的基因型与等位基因频率(英文) 被引量:5
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作者 路萍 吕星 +5 位作者 邢瑞云 孙琪云 韩莉 吴苏华 蓝红 郑晓飞 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第12期1093-1097,共5页
一氧化氮合酶 (nitricoxidesynthase ,NOS)催化L 精氨酸的氧化反应生成L 瓜氨酸和一氧化氮 (nitricoxide,NO)。NO可通过cGMP依赖的信号传导途径介导平滑肌细胞舒张 ,是调节血管张力的重要信使分子。NO尚可抑制血小板凝集 ,对血栓形成起... 一氧化氮合酶 (nitricoxidesynthase ,NOS)催化L 精氨酸的氧化反应生成L 瓜氨酸和一氧化氮 (nitricoxide,NO)。NO可通过cGMP依赖的信号传导途径介导平滑肌细胞舒张 ,是调节血管张力的重要信使分子。NO尚可抑制血小板凝集 ,对血栓形成起重要调节作用。目前在哺乳动物中已发现细胞来源、表达方式和活性调节不同的 3种NOS同工酶 ,分别为神经元型NOS(neuronalNOS ,nNOS)、诱导型NOS(inducibleNOS ,iNOS)和内皮细胞型NOS(endothelialNOS ,eNOS)。人的eNOS基因位于第 7号染色体长臂 (7q36) ,全长约 2 1kb ,含有 2 6个外显子和 2 5个内含子。eNOS基因存在多个与心脑血管疾病相关的基因多态性位点。其中位于第 4内含子的一个以 2 7bp为核心的数目可变性串联重复序列(variablenumberoftandemrepeat,VNTR)多态性位点 ,已被证实与原发性高血压、心肌梗死和静脉血栓形成有关。目前在我国尚缺乏NOS基因多态性在正常人群中基因型及等位基因频率分布的统计资料。为此 ,我们从 31 6名健康中国人的基因组DNA检测了eNOS基因第 4内含子VNTR多态性的基因型和等位基因 ,鉴定出重复 6次、5次和 4次的 3种等位基因 ,以及 6/ 5杂合、5/ 5纯合、5/ 4杂合和 4 / 4纯合的 4种基因型。同时我们将正常中国人eNOS基因VNTR多态性的基因? 展开更多
关键词 一氧化氮合酶 基因多态性 vntr ENOS 等位基因 基因频率 中国人
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利用VNTR分子标记鉴定蜜蜂群内蜂王交配次数和雄蜂母系来源 被引量:7
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作者 谢宪兵 苏松坤 +1 位作者 黄康 曾志将 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期20-25,共6页
如何准确测定蜂王交配次数和雄蜂母系来源,是研究蜜蜂亚家系行为生物学的关键。本研究利用王浆主蛋白(MRJPs)的串联重复序列多态性(VNTR)分子标记分别鉴定了蜂王单雄人工授精、双雄人工授精和自然交尾的中华蜜蜂Apis cerana cerana蜂群... 如何准确测定蜂王交配次数和雄蜂母系来源,是研究蜜蜂亚家系行为生物学的关键。本研究利用王浆主蛋白(MRJPs)的串联重复序列多态性(VNTR)分子标记分别鉴定了蜂王单雄人工授精、双雄人工授精和自然交尾的中华蜜蜂Apis cerana cerana蜂群中的蜂王交配次数和雄蜂母系来源。结果表明:在蜂王单雄人工授精和双雄人工授精蜂群中,蜂王的交配次数分别为1和2;在蜂王自然交尾的2个蜂群中,蜂王的交配次数分别为8和5。另外,经鉴定发现:在以上实验蜂群中,所有雄蜂都是由蜂王产的未受精卵发育而来。因此,作为一种分子标记,蜜蜂MRJPs VNTR能简单、有效地鉴定蜂群内蜂王的交配次数和雄蜂母系来源。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 王浆主蛋白 vntr分子标记 蜂王交配次数 雄蜂 母系来源
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河南汉族人群eNOS基因27bpVNTR、G894T多态性与冠心病的相关性研究 被引量:6
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作者 贺颖 杨冬之 +2 位作者 于辉 赵洛沙 郑红 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期523-527,共5页
目的探讨内皮细胞型一氧化氮合酶(eNOS)基因27bpVNTR,G894T基因多态性与冠心病(CHD)的相关关系。方法运用PCR-RFLP方法对207例CHD患者和264例健康对照进行eNOS基因27bpVNTR,G894T多态性的检测分析,并进行基因型频率及等位基因频率的比... 目的探讨内皮细胞型一氧化氮合酶(eNOS)基因27bpVNTR,G894T基因多态性与冠心病(CHD)的相关关系。方法运用PCR-RFLP方法对207例CHD患者和264例健康对照进行eNOS基因27bpVNTR,G894T多态性的检测分析,并进行基因型频率及等位基因频率的比较以及单倍型分析。结果4a/4a基因型频率以及4a等位基因频率的分布在CHD组与对照组差异有统计学意义(P<0.05);G894T多态的T等位基因频率在CHD组与对照组差异具有统计学意义(P<0.05)。4a-G、4b-G两种单倍型组合在CHD组与对照组差异具有统计学意义(P<0.05)。结论提示27bpVNTR基因多态与冠心病相关,4a等位基因,T等位基因可能是河南汉族人冠心病发生的遗传性危险因子。4a-G可能是河南汉族人冠心病发生的风险单倍型,而4b-G可能对河南汉族人冠心病的发生具有某种保护作用。 展开更多
关键词 一氧化氮合酶 基因多态性 vntr
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中国汉族群体vWF基因40内含子VNTR 被引量:5
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作者 倪星群 郭景元 +1 位作者 夏家辉 李麓芸 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1996年第1期1-10,共10页
本文将Amp-FLP与RFLP结合起来,检测vWF基因40内含子VNTR(variablenumberoftandemrepeats)。调查长沙地区156名无亲缘关系汉族人,发现vWF基因40内含子VNTR基因136... 本文将Amp-FLP与RFLP结合起来,检测vWF基因40内含子VNTR(variablenumberoftandemrepeats)。调查长沙地区156名无亲缘关系汉族人,发现vWF基因40内含子VNTR基因136个。基因型153个,全部为杂合子,分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。此VNTR的杂合率为0.9884,PIC为0.9883,是现已检出Amp-FLP中多态性最高的遗传标记。家系分析显示VNTR无遗传重组,依照常染色体共显性遗传。用高分辨聚丙烯酰胺凝胶电解质梯度电泳,分离扩增的杂合子个体vWF基因40内含子VNTR两条DNA,回收后再次扩增,AluI消化,电泳直接检测了VNTR基因型,解决了Amp-FLP-RFLP分析中无法判定基因型的难题。首次将SSCP应用于微卫星DNA亚型的检测,检出一个VNTR亚型。 展开更多
关键词 人类遗传学 汉族 VWF基因 内含子 vntr亚型
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HSP65-MUC1 VNTR_2融合蛋白的表达、纯化及其抗肿瘤作用 被引量:4
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作者 郑玉玲 江华 +1 位作者 王希良 姜永强 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1014-1016,1024,共4页
目的:通过基因工程手段在大肠杆菌中表达HSP65-MUC1VNTR2融合蛋白、鉴定和纯化,并研究其在动物体内的肿瘤生长抑制活性。方法:通过PCR获得结核分支杆菌HSP65基因,以重叠PCR获得人MUC1基因VNTR的2个重复序列,构建原核重组表达载体HSP65-M... 目的:通过基因工程手段在大肠杆菌中表达HSP65-MUC1VNTR2融合蛋白、鉴定和纯化,并研究其在动物体内的肿瘤生长抑制活性。方法:通过PCR获得结核分支杆菌HSP65基因,以重叠PCR获得人MUC1基因VNTR的2个重复序列,构建原核重组表达载体HSP65-MUC1VNTR2-pET28a(+),在大肠杆菌BL21(DE3)中利用IPTG诱导表达;利用单克隆抗体(mAb)进行Westernblot鉴定,以Q柱和凝胶过滤纯化获得纯化蛋白。通过建立转染人MUC1基因的B16黑色素瘤小鼠肿瘤模型,在C57BL/6小鼠体内研究HSP65-MUC1VNTR2融合蛋白的肿瘤生长抑制活性。结果:获得的结核分支杆菌HSP65基因和人MUC1基因VNTR区的2个重复片段,经测序证明分别与GenBank中结核杆菌HSP65基因和人MUC1基因的VNTR完全相符;构建的原核表达载体HSP65-MUC1VNTR2-pET28a(+)可稳定的可溶性表达HSP65-MUC1VNTR2蛋白;经Q柱和凝胶过滤纯化,纯化的目的蛋白纯度达95%以上;利用鼠抗人MUC1mAb对表达蛋白进行验证,结果阳性;小鼠肿瘤预防免疫实验表明,实验组小鼠抑瘤率大于对照组,且具有明显性差异。结论:成功地利用原核表达系统实现了对HSP65-MUC1VNTR2蛋白的可溶性表达,并对其体内预防实验进行了初步研究,证明该融合蛋白能明显抑制表达MUC1的肿瘤生长。为进一步评价其作为肿瘤疫苗可能性的研究打下了基础。 展开更多
关键词 热休克蛋白65 MUC1 vntr 纯化 预防免疫
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食管癌中DCC基因VNTR位点多态性研究 被引量:13
7
作者 秦鸿雁 舒青 +1 位作者 王栋 马群风 《世界华人消化杂志》 CAS 2000年第7期782-785,共4页
目的探讨 DCC 基因 VNTR 位点多态性在陕西人群中的分布规律及与食管癌的遗传易感性关系.方法利用 PCR 方法对陕西正常人群个体(56例),食管癌组织(鳞癌49例).食管癌癌旁组织(34例)的 DCC 基因 VNTR位点多态性进行群体遗传学研究,并就该... 目的探讨 DCC 基因 VNTR 位点多态性在陕西人群中的分布规律及与食管癌的遗传易感性关系.方法利用 PCR 方法对陕西正常人群个体(56例),食管癌组织(鳞癌49例).食管癌癌旁组织(34例)的 DCC 基因 VNTR位点多态性进行群体遗传学研究,并就该位点与食管癌的关系进行了关联分析.结果在陕西正常人群中 DCC 基因 VNTR 位点存在11种等位基因(A_1~A_(11)),扩增长度为167 bp~210 bp,其等位基因频率介于0.009~0.188,其中以扩增长度为205 bp(A_3),201 bp(A_4),185 bp(A_7),177 bp(A_9)较为常见,分布符合 Hardy-Weinberg 遗传平衡定律;DCC 基因 VNTR 位点在陕西正常人群中的多态信息量(PIC)为0.879,杂合度(H)为73.2%.在食管癌人群 DCC 基因 VNTR 位点中共检出10种等位基因,比正常人群少等位基因 A_2,其等位基因频率分布在0.01~0.25.癌组织与癌旁组织等位基因频率分布经比较无显著差异(x^2=3.16,P>0.05).食管癌人群 ECC 基因 VNTR 位点多态分布与正常人群有显著差异(P<0.01).其中 A_5在食管癌人群中等位基因频率明显高于正常人群,而 A_7等位基因频率则明显低于正常人群,提示 A_5和 A_7可能是食管癌易感因素.结论推测 DCC 基因 VNTR 位点多态性的改变可能在食管癌的形成中起重要作用,该位点多态性与食管癌的遗传易感性相关. 展开更多
关键词 DCC基因 vntr 食管肿瘤 易感性
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5个VNTR位点用于我国三省65株结核分支杆菌菌株基因分型的研究 被引量:4
8
作者 刘敬华 万康林 +5 位作者 刘志广 张媛媛 赵秀琴 王庆 谭云洪 许卫国 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第8期653-657,共5页
目的初步探讨我国结核分支杆菌的数目可变串联重复位点 (VariableNumberofTandemRepeat ,VNTR)的分布特征及其在基因分型中的应用。方法 选取结核分支杆菌基因组中的 5个VNTR位点 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术 ,并应用BioNumerics(Ver... 目的初步探讨我国结核分支杆菌的数目可变串联重复位点 (VariableNumberofTandemRepeat ,VNTR)的分布特征及其在基因分型中的应用。方法 选取结核分支杆菌基因组中的 5个VNTR位点 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术 ,并应用BioNumerics(Version3.0 )软件进行处理 ,分析结核分支杆菌DNA中VNTR分布多态性。结果 检测分析的 6 5株结核分支杆菌具有明显的多态性 ,共分成 12个不同的型别 ,其中大部分菌株属于一个型 ,占 6 4 .6 % ,其他菌株呈散在分布。结论 我国结核分支杆菌的VNTR具有明显的多态性。VNTR分型技术具有简便、快速、特异、重复性好等优点 ,可广泛用于结核病的分子流行病学研究。 展开更多
关键词 vntr位点 结核分支杆菌 菌株 基因分型
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应用多位点VNTR分析进行铜绿假单胞菌院内感染溯源的研究 被引量:4
9
作者 李艳君 李妍妮 +3 位作者 钱扬会 丁赔赔 丁毅伟 赵强元 《检验医学与临床》 CAS 2015年第19期2811-2813,共3页
目的:应用多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析方法进行多重耐药铜绿假单胞菌分子分型,为由铜绿假单胞菌引发的院内感染的溯源和流行病学调研提供依据。方法从铜绿假单胞菌基因组中筛选12个VNTR位点,设计合成引物;对98株多重耐... 目的:应用多位点可变数目串联重复序列(VNTR)分析方法进行多重耐药铜绿假单胞菌分子分型,为由铜绿假单胞菌引发的院内感染的溯源和流行病学调研提供依据。方法从铜绿假单胞菌基因组中筛选12个VNTR位点,设计合成引物;对98株多重耐药铜绿假单胞菌进行PCR扩增,产物毛细管电泳;根据产物大小计算各VNTR位点的重复数,构建系统发育树,进行数据分析。结果12个位点的多态性指数(DI)为0.45~0.88,将98株铜绿假单胞菌分成5个群,88个基因型,同病区分离的菌株具有一定的同源性。结论多位点VNTR分析具有很高的分辨率,适用于铜绿假单胞菌基因分型和溯源研究,具有很好的应用前景。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 vntr 基因分型 同源性
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天津地区汉族人血小板膜糖蛋白Ib_α基因VNTR多态性的分布 被引量:5
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作者 江雁 黄繁嫱 +2 位作者 刘丽 穆红 刘蓉 《天津医药》 CAS 北大核心 2004年第2期65-67,共3页
目的 :探讨血小板膜糖蛋白Ibα基因VNTR多态性在天津地区汉族人群中的分布。方法 :聚合酶链反应扩增目的片断 ,根据产物的长度判断VNTR基因型。结果 :天津地区汉族人群等位基因A、B、C、D的频率分别为0.43 % ,3.33 % ,60.14%和36.10 %... 目的 :探讨血小板膜糖蛋白Ibα基因VNTR多态性在天津地区汉族人群中的分布。方法 :聚合酶链反应扩增目的片断 ,根据产物的长度判断VNTR基因型。结果 :天津地区汉族人群等位基因A、B、C、D的频率分别为0.43 % ,3.33 % ,60.14%和36.10 %。结论 :天津地区汉族人群GPIbα基因VNTR多态性分布以等位基因C和D为主。 展开更多
关键词 天津 汉族 血小板膜糖蛋白Iba vntr 基因多态性 小卫星重复 基因分布 基因型
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河南省结核分枝杆菌MIRU-VNTR和间隔区寡核苷酸分型分析 被引量:5
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作者 石洁 郑丹薇 +4 位作者 朱岩昆 马晓光 王少华 李辉 张国龙 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第3期425-430,共6页
目的:调查河南省结核分枝杆菌分子流行病学的结构特征。方法:共纳入河南地区668株结核分枝杆菌,进行间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和26位点分枝杆菌散在重复单元-数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)分型分析,评估不同MIRU-VNTR位点... 目的:调查河南省结核分枝杆菌分子流行病学的结构特征。方法:共纳入河南地区668株结核分枝杆菌,进行间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和26位点分枝杆菌散在重复单元-数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)分型分析,评估不同MIRU-VNTR位点组合的分辨效能。结果与结论:北京家族基因型菌株有558(83. 53)株,是河南省最流行的结核分枝杆菌,其中典型北京家族基因型(SIT1)是最具优势的基因型(512株,88. 89%)。26位点MIRU-VNTR可将668株菌分成567种基因型,其中含有38个基因簇和529种独立的基因型。累积Hunter-Gaston分辨力指数表明10个分辨力最强VNTR位点组合的分辨效力接近26位点组合。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 MIRU-vntr 间隔区寡核苷酸分型 河南省
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载脂蛋白B基因3’-VNTR多态与长沙地区脑血管病的关系研究 被引量:6
12
作者 张乐 曾艺 +5 位作者 杨期东 杜小平 周艳宏 夏健 刘运海 许宏伟 《实用预防医学》 CAS 2005年第1期57-59,共3页
目的 探讨载脂蛋白B基因 (apolipoproteinB ,apoB) 3’端可变数目串联重复序列 (variablenumbleoftandemre peats ,3’ -VNTR)多态与长沙地区脑血管病的关系。  方法 采用聚合酶链式反应 (PCR)结合聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 13 0例脑... 目的 探讨载脂蛋白B基因 (apolipoproteinB ,apoB) 3’端可变数目串联重复序列 (variablenumbleoftandemre peats ,3’ -VNTR)多态与长沙地区脑血管病的关系。  方法 采用聚合酶链式反应 (PCR)结合聚丙烯酰胺凝胶电泳分析 13 0例脑梗死患者、13 0例脑出血患者、10 0例对照组人群apoB基因 3’ -VNTR多态 ;并采用氧化酶法测定血清甘油三脂 (TG)、总胆固醇 (TC)、高密度脂蛋白 (HDL)、低密度脂蛋白 (LDL) ,运用酶联免疫吸附法测定LP(a)浓度 ,免疫比浊法测定apoB -10 0及apoAI浓度。  结果 脑梗死组的apoB基因 3’ -VNTR的B等位基因频率 (0 .15 0 )高于对照组(0 .0 80 ) (P <0 .0 5 ) ;脑出血组apoB基因 3’ -VNTR的B等位基因频率 (0 .0 77)与对照组无显著差别。脑梗死组中 ,B/S或B/B基因型亚组的TC、TG、LDL -C水平明显高于S/S基因型 (P <0 .0 5 ) ;脑出血组中 ,B/S或B/B基因型亚组的各项血脂水平与S/S基因型无显著差别。 结论  1、长沙地区脑梗死可能与apoB基因 3’ -VNTR多态有关 ,而脑出血与之无关。 2、apoB基因 3’ -VNTR多态B等位基因可能通过影响血脂水平增加脑梗死易感性。 展开更多
关键词 载脂蛋白B 3’-vntr 脑梗死 脑出血
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河南汉族动脉硬化性脑梗死人群血小板膜糖蛋白Iba基因VNTR多态性检测 被引量:2
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作者 李涛 尚迎辉 +4 位作者 白峻瑜 石聪聪 封青川 贺颖 郑红 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2012年第4期466-469,共4页
目的:探讨河南汉族人群中血小板膜糖蛋白Iba(GPIba)基因VNTR多态性与动脉硬化性脑梗死(ABI)的相关性。方法:采用聚合酶链扩增反应检测434例河南汉族ABI患者(ABI组)和500例正常对照者(对照组)GPIba基因VNTR的多态性,比较ABI组和对照组各... 目的:探讨河南汉族人群中血小板膜糖蛋白Iba(GPIba)基因VNTR多态性与动脉硬化性脑梗死(ABI)的相关性。方法:采用聚合酶链扩增反应检测434例河南汉族ABI患者(ABI组)和500例正常对照者(对照组)GPIba基因VNTR的多态性,比较ABI组和对照组各基因型频率的差异。结果:在河南汉族人群中,ABI组GPIba基因CD基因型频率(44.5%)和BC基因型频率(2.3%)明显高于正常对照组(37.0%和0.4%)[χ2=5.381和6.642,P<0.05;OR(95%CI)=1.364(1.049~1.773)和5.873(1.280~26.950)],DD基因型频率(13.1%)低于正常对照组(20.2%)[χ2=8.254,P=0.004;OR(95%CI)=0.597(0.419~0.851)]。结论:VNTR多态性中CD和BC杂合基因型可能是河南地区汉族人群ABI发生的遗传危险因子,而DD基因型可能是遗传保护因子。 展开更多
关键词 血小板膜糖蛋白Iba vntr多态性 动脉硬化性脑梗死 河南 汉族
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新疆牛分枝杆菌MIRU-VNTR基因分型的初步研究 被引量:3
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作者 曹瑞 张喜悦 +7 位作者 孙照刚 呼西旦 田苗 李妍 胡文婷 李传友 范伟兴 胡桂学 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期524-528,共5页
为了解牛分枝杆菌的基因型特点,初步建立适合新疆地区的MIRU-VNTR基因分型方法,本研究利用24个MIRU-VNTR位点,对30株牛分枝杆菌新疆分离株进行基因分型研究。结果显示,在24个MIRU-VNTR位点中,有9个位点(ETR-A、B、D、E;MIRU24;QUB11a、... 为了解牛分枝杆菌的基因型特点,初步建立适合新疆地区的MIRU-VNTR基因分型方法,本研究利用24个MIRU-VNTR位点,对30株牛分枝杆菌新疆分离株进行基因分型研究。结果显示,在24个MIRU-VNTR位点中,有9个位点(ETR-A、B、D、E;MIRU24;QUB11a、11b、1895、26)具有多态性,可将30株菌分为7个基因型,分型指数为0.611。而国际通用的5个ETRs位点(ETR-A~E)可将该30株菌分为4个基因型,分型指数为0.712。多态性位点中多态性指数较高的5个位点(ETR-B、ETR-D、MIRU24、QUB11a、QUB26)具有与9个位点相似的分型能力,分型指数为0.715。研究表明,新疆地区与其他地区或国家的牛分枝杆菌在基因分型方面存在差异。5个多态性较高的位点均具有良好的分型能力,表明MIRU-VNTR基因分型方法可以作为新疆地区牛分枝杆菌分子流行病学研究的辅助方法。 展开更多
关键词 牛分枝杆菌 MIRU-vntr 基因分型
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陕西人群Rb1.20位点的VNTR多态性与食管癌遗传易感性相关 被引量:5
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作者 秦鸿雁 舒青 +1 位作者 刘素英 马群风 《第四军医大学学报》 2000年第2期135-137,共3页
目的 探讨陕西人群 Rb1 .2 0位点 VNTR多态性是否与食管癌遗传易感性有关 .方法 应用 PCR方法对陕西正常个体外周血 (5 0例 )、食管癌组织 (36例 )、食管癌癌旁组织(2 7例 ) Rb基因 2 0内含子 VNTR区进行了检测 .结果 共检出 5个等... 目的 探讨陕西人群 Rb1 .2 0位点 VNTR多态性是否与食管癌遗传易感性有关 .方法 应用 PCR方法对陕西正常个体外周血 (5 0例 )、食管癌组织 (36例 )、食管癌癌旁组织(2 7例 ) Rb基因 2 0内含子 VNTR区进行了检测 .结果 共检出 5个等位基因片段 :385 bp(A) ,370 bp(B) ,35 5 bp(C) ,330 bp(D)和 32 5 bp(E) .在正常人群中 ,其等位基因频率分别为 :A0 .31 ,B0 .1 5 ,C0 .0 7,D0 .0 5 ,E0 .42 ,杂合性为 72 % ,PIC为 0 .70 ;在食管癌癌组织中 ,其等位基因频率分别为 :A0 .1 5 ,B0 .1 7,C0 .1 7,D0 .36和 E0 .1 5 ,PIC为 0 .77;在食管癌癌旁组织中 ,其等位基因频率分别为 :A0 .1 1 ,B0 .30 ,C0 .1 1 ,D0 .43和 E0 .0 6 ,杂合性为 2 2 % ,PIC为 0 .70 .Rb1 .2 0位点 VNTR多态性在不同群体中有显著差异 .结论 推测Rb1 .2 0位点的 展开更多
关键词 聚合酶链反应 食管癌 遗传易感性 vntr多态性
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牛分枝杆菌Spoligotyping和VNTR-MIRU的基因分型研究 被引量:1
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作者 杜艳芬 林靖凯 +5 位作者 刘思国 王春来 刘慧芳 司微 王聃 赵海玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期114-116,126,共4页
为了探讨间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在分布重复单元(VNTR-MIRU)基因分型法用于国内牛分枝杆菌的基因分型研究,初步了解我国牛分枝杆菌基因型种类、分布以及2种方法在我国应用的可行性。... 为了探讨间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在分布重复单元(VNTR-MIRU)基因分型法用于国内牛分枝杆菌的基因分型研究,初步了解我国牛分枝杆菌基因型种类、分布以及2种方法在我国应用的可行性。本研究收集东北、西北、华北、华南4个地区分离的10株牛分枝杆菌分离株,分别采用Spoligotyping和VNTR-MIRU对这些分离株进行基因分型,比较两种方法的分型效果,评价其在牛分枝杆菌基因分型中的应用。结果表明,使用Spoligotyping方法,10株牛分枝杆菌呈现出4种基因型,使用VNTR-MIRU方法,10株分离株也呈现4种基因型;当两种方法联合使用时,可以分为5种基因型,其中的2个菌株具有独特的基因型,显示来自不同地区的牛分枝杆菌存在主要的流行型为BCG家族。将Spoligotyping和VNTR-MIRU联合使用,可有效提高牛结核病的分子流行病学调查和病原学的监测效果。 展开更多
关键词 牛分枝杆菌 SPOLIGOTYPING vntr MIRU 基因分型
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内皮型一氧化氮合酶基因VNTR多态性与肝硬化门脉高压症的相关性研究 被引量:4
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作者 程元桥 王文琦 +1 位作者 林菊生 熊平 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2004年第3期294-298,共5页
目的 探讨内皮型一氧化氮合酶(eudnthelial nitric oxide synthase,eNOS)基因第4内含子数目可变性串联重复序列(variable number of tandem repeats polymorphism VNTR) 态性与肝硬化门脉高压症的相关性。方法 采用病例对照和聚合酶链反... 目的 探讨内皮型一氧化氮合酶(eudnthelial nitric oxide synthase,eNOS)基因第4内含子数目可变性串联重复序列(variable number of tandem repeats polymorphism VNTR) 态性与肝硬化门脉高压症的相关性。方法 采用病例对照和聚合酶链反应(PCR)及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法,检测106例乙肝后肝硬化患者和108名健康对照者eNOS基因第4内含子的VNTR多态性及外周血NO2-/NO3-含量,并进行统计分析。结果 乙肝后肝硬化患者a等位基因频率高于对照组(13.21%VS 8.8%),但差异无显著性意义;然而,在门脉高压a等位基因频率明显高于对照组,差异有显著性意义(14.62%VS 8.8,P<0.05),相关分析呈正相关(r=0.16)。携带a等位基因者发生门脉高压症的危险性高于非a等位基因携带者1.2倍(OR=2.2)。结论 eNOS基因第4内含子的VNTR多态性与肝硬化门脉高压症形成相关,a等位基因可能是中国人群门脉高压症的遗传易感性的基因标志之一。 展开更多
关键词 内皮型一氧化氮合酶基因 ENOS 基因vntr多态性 肝硬化 门脉高压症 遗传易感性
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PCR检测大肠癌YNZ22位点VNTR的杂合性丢失 被引量:1
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作者 房殿春 罗元辉 +2 位作者 柳风轩 梁智勇 刘为纹 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第1期20-21,共2页
目的:探讨YNZ22位点串联重复序列(VNTR)的杂合性丢失在大肠癌发生发展中的作用。方法:应用多聚酶链反应技术对41例大肠癌YNZ22位点的VNTR区进行了分析。结果:大肠癌YNZ22位点杂合缺失(LOH)率为43... 目的:探讨YNZ22位点串联重复序列(VNTR)的杂合性丢失在大肠癌发生发展中的作用。方法:应用多聚酶链反应技术对41例大肠癌YNZ22位点的VNTR区进行了分析。结果:大肠癌YNZ22位点杂合缺失(LOH)率为43.3%。分析LOH与临床病理参数间的关系发现,大肠癌YNZ22位点杂合缺失与肿瘤大小,组织学类型,淋巴结转移,浸润深度和临床分期无关。结论:YNZ22位点杂合缺失参与了大肠癌发生与发展。 展开更多
关键词 PCR 大肠癌 vntr 杂合丢失
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载脂蛋白B基因3'-VNTR多态性与家族聚集性脑出血的关系 被引量:2
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作者 刘宝琼 张乐 +6 位作者 杨期东 胡中扬 许宏伟 杜小平 周艳宏 刘运海 夏健 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期269-272,共4页
目的探讨载脂蛋白B(apolipoproteins B,apoB)基因3′端可变数目串联重复序列(3′-variable numble of tandem repeats,3′-VNTR)多态性与长沙地区汉族人群家族聚集性脑出血的关系。方法应用聚合酶链式反应结合聚丙烯酰胺凝胶电泳分析... 目的探讨载脂蛋白B(apolipoproteins B,apoB)基因3′端可变数目串联重复序列(3′-variable numble of tandem repeats,3′-VNTR)多态性与长沙地区汉族人群家族聚集性脑出血的关系。方法应用聚合酶链式反应结合聚丙烯酰胺凝胶电泳分析长沙地区汉族15个家族聚集性脑出血家系的117例成员、93例散发脑出血患者和100名正常对照者的apoB基因3′-VNTR多态性分布。结果家系组脑出血患者组及其Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级亲属组、散发脑出血组和对照组apoB基因3′-VNTR多态性B等位基因频率分别为0.081、0.076、0.077、0.071、0.067、0.080;家系组脑出血患者组及其Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ级亲属组、散发脑出血组apoB基因3′-VNTR多态性B等位基因频率与对照组比较均无统计学差异(P>0.05)。结论ApoB基因3′-VNTR多态性可能与长沙地区汉族人群家族聚集性脑出血无关。 展开更多
关键词 载脂蛋白B 3'-vntr多态性 家族聚集性脑出血
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多位点VNTR用于异基因骨髓移植植入存活检定研究 被引量:1
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作者 石宁 兰炯采 +2 位作者 郑世荣 羊裔明 贾永前 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第3期144-146,共3页
目的:探讨多位点可变数串联重复序列( V N T R)—— D17 S30、 P A H、 V S17、 M L O W 1 在异基因骨髓移植存活检定中的应用。方法:以聚合酶链反应( P C R)扩增4 个位点 V N T R, P C R 产... 目的:探讨多位点可变数串联重复序列( V N T R)—— D17 S30、 P A H、 V S17、 M L O W 1 在异基因骨髓移植存活检定中的应用。方法:以聚合酶链反应( P C R)扩增4 个位点 V N T R, P C R 产物以聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染法检测,对2 名异基因骨髓移植( Allo B M T)患者作移植物成活检定研究。结果:受者获得了供者源性细胞植入存活的证据。结论:多位点 V N T R个体特异性强、识别力高,可作为 Allo B M T 植活的可靠指标,尤其是用于血型、性别、 H L A 表型全相合的 Allo B M T,移植后 15 天便可获得植入证据。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 vntr 骨髓移植 ALLO-BMT
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