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WD40重复蛋白43在肺腺癌中的表达及其对细胞紫杉醇耐药的影响
1
作者 赵雪 董春燕 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1656-1665,共10页
目的·分析WD40重复蛋白43 (WD 40 repeat protein 43, WDR43) mRNA在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)细胞中的表达及其与LUAD患者预后的相关性,并探讨WDR43对LUAD细胞发生紫杉醇耐药的影响。方法·通过癌症治疗反应门户网站(... 目的·分析WD40重复蛋白43 (WD 40 repeat protein 43, WDR43) mRNA在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)细胞中的表达及其与LUAD患者预后的相关性,并探讨WDR43对LUAD细胞发生紫杉醇耐药的影响。方法·通过癌症治疗反应门户网站(Cancer Therapeutics Response Portal,CTRP),下载LUAD细胞的紫杉醇敏感性与其基因表达的相关性系数,筛选紫杉醇耐药相关基因,行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)通路分析,并以相关基因WDR43作为研究对象行后续分析及验证。检索人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库,分析WDR43蛋白在LUAD组织中的表达和定位。检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,分析WDR43 mRNA在LUAD组织和正常肺组织中的表达差异、LUAD患者的WDR43突变情况以及WDR43 mRNA与不同临床病理因素的相关性。检索CaArray数据库,分析WDR43 mRNA与LUAD患者预后之间的相关性。检索肿瘤浸润性免疫细胞分析(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库,分析WDR43表达与LUAD组织中免疫细胞浸润水平的相关性。通过癌症细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)数据库比较不同LUAD细胞中WDR43基因表达,构建差异表达WDR43的LUAD细胞,并采用MTT实验和平板克隆形成实验验证WDR43表达对紫杉醇耐药性的影响。结果·通过CTRP筛选出了LUAD细胞紫杉醇敏感性相关基因WDR43。GO功能分析和KEGG通路分析的结果显示,WDR43等基因与rRNA合成、细胞形态调控等相关,且主要富集在单纯疱疹病毒1感染信号通路和胞浆DNA感受器信号通路。HPA数据库的分析结果显示,WDR43蛋白主要表达于LUAD细胞的细胞核、细胞质及细胞膜中。TCGA数据库的分析结果显示,WDR43 mRNA在LUAD组织中的表达明显高于正常肺组织(P=0.000),在LUAD吸烟患者的癌组织中的表达明显高于非吸烟者(P=0.000),在TP53突变型患者中的表达亦高于TP53野生型患者(P=0.000)。CaArray数据库的分析结果显示,WDR43 mRNA高表达的LUAD患者的预后较差(均P=0.000)。TIMER数据库的分析结果显示,WDR43表达可促进LUAD组织中的中性粒细胞、CD8^(+)T细胞、骨髓来源的抑制性细胞、巨噬细胞的浸润,抑制CD4^(+)T细胞的浸润。体外实验证实,过表达WDR43可增强LUAD细胞对紫杉醇的耐药能力。结论·WDR43在LUAD组织中的表达显著增加且与患者预后呈负相关,WDR43的过表达可增强LUAD细胞的紫杉醇耐药能力。 展开更多
关键词 wd40重复蛋白43 肺腺癌 紫杉醇 化疗耐药 预后
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紫色番茄SlWD40-like基因克隆与表达分析 被引量：2
2
作者 张园 徐绍忠 +2 位作者 毛自朝 林春 刘正杰 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期586-593,共8页
WD-重复蛋白(WD-repeat protein)是一类含有WD40基序的蛋白,在植物响应非生物逆境胁迫的过程中具有重要调控作用。为揭示紫色番茄中WD40重复蛋白的功能,从富含花青素紫色番茄品种‘砚紫1号’中克隆 SlWD40-like基因,并对该基因在不同组... WD-重复蛋白(WD-repeat protein)是一类含有WD40基序的蛋白,在植物响应非生物逆境胁迫的过程中具有重要调控作用。为揭示紫色番茄中WD40重复蛋白的功能,从富含花青素紫色番茄品种‘砚紫1号’中克隆 SlWD40-like基因,并对该基因在不同组织部位和不同胁迫条件下的表达模式进行分析。结果表明, SlWD40-like基因编码1个含有460个氨基酸的蛋白质。蛋白序列分析显示,SlWD40-like蛋白含有6个WD40基序,是典型的WD40重复蛋白。预测分析发现,该蛋白为亲水性蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主;该蛋白序列在物种间具有高度的保守性,系统发生进化树分析表明紫番茄SlWD40-like氨基酸序列与潘那利番茄蛋白亲缘关系最近,其次是胡萝卜。应用qRT-PCR分析 SlWD40-like基因组织特异表达发现,该基因在叶和紫色果实中表达量最高。qRT-PCR分析表明, SlWD40-like基因受到盐胁迫、干旱胁迫脱落酸(ABA)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导表达,推测该基因可能参与紫色番茄逆境胁迫应答。该研究为后续进一步分析紫色番茄 SlWD40-like基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 紫色番茄 wd40重复蛋白 Slwd40-like 克隆 非生物胁迫
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宫颈癌组织中FBW7和c-Myc的表达及相关性分析 被引量：2
3
作者 邱卫芳 《海南医学院学报》 CAS 2014年第1期34-37,共4页
目的:检测F盒/WD40重复域蛋白7(FBW7)和c-Myc在宫颈癌组织中的表达情况及临床意义,并分析两者表达的相关性。方法:收集我院2008年1月～2012年12月病理科存档的宫颈癌和正常宫颈组织标本70例,采用免疫组化SP法分别检测46例宫颈癌及24例... 目的:检测F盒/WD40重复域蛋白7(FBW7)和c-Myc在宫颈癌组织中的表达情况及临床意义,并分析两者表达的相关性。方法:收集我院2008年1月～2012年12月病理科存档的宫颈癌和正常宫颈组织标本70例,采用免疫组化SP法分别检测46例宫颈癌及24例正常宫颈组织中FBW7及cMyc的表达情况。结果:FBW7和c-Myc在宫颈癌组织中的阳性表达率分别为30.4%(14/46)和69.6%(32/46),在正常宫颈组织中的阳性表达率分别为66.7%(16/24)和25.0%(6/24),两组比较差异有统计学意义(χ2=8.454,P=0.004;χ2=12.622,P=0.000)。FBW7表达与宫颈癌临床分期(P=0.036)和病理学分级(P=0.023)显著相关,c-Myc表达与宫颈癌临床分期(P=0.036)、淋巴结转移(P=0.003)和病理学分级(P=0.003)也显著相关。宫颈癌组织中FBW7与c-Myc蛋白表达呈显著负相关(r=-0.667,χ2=6.694,P=0.010)。结论:宫颈癌组织中FBW7低表达,且与c-Myc表达呈负相关,提示FBW7可能通过调控c-Myc泛素化降解参与肿瘤发生、发展。 展开更多
关键词 F盒 wd40重复域蛋白7(FBW7) C-MYC 宫颈癌
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WDR1在肝癌组织中的表达及其与长期预后的关系
4
作者 曾海涛 石伟 常磊 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2018年第3期463-468,共6页
目的:探究WD40重复包含蛋白1(WDR1)在原发性肝癌组织中的表达以及临床价值。方法:免疫组织化学法检测106例肝细胞癌(HCC)患者的肝癌组织标本中WDR1的表达情况,统计分析WDR1与病理资料的关系及其与HCC患者长期预后的关系。结果:较之于癌... 目的:探究WD40重复包含蛋白1(WDR1)在原发性肝癌组织中的表达以及临床价值。方法:免疫组织化学法检测106例肝细胞癌(HCC)患者的肝癌组织标本中WDR1的表达情况,统计分析WDR1与病理资料的关系及其与HCC患者长期预后的关系。结果:较之于癌旁组织,WDR1在肝癌组织中为阳性高表达。HCC中WDR1的高低表达情况与甲胎蛋白(AFP)、肝硬化、微血管侵犯、Child-Pugh分级、TNM分期等临床病理特征存在显著的相关性(P<0.05),而和肿瘤大小、性别等其余临床病理特征的相关性不明显(P>0.05)。COX回归分析表明WDR1是HCC患者总体生存预后的独立影响因素(HR=1.764,95%CI:1.270-2.841,P<0.05),也是HCC患者无瘤生存预后的独立影响因素(HR=1.803,95%CI:1.328-2.755,P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析结果显示WDR1高表达组的总体生存率和无瘤生存率均显著低于WDR1低表达组。结论:WDR1是HCC患者的独立预后危险因素,且WDR1高表达者预后差。 展开更多
关键词 wd40重复包含蛋白1 肝细胞癌 无瘤生存率 总体生存率
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靶向MYC小分子抑制剂的研究进展
5
作者 徐俊杰 尤启冬 郭小可 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1689-1701,共13页
MYC基因由3个旁系同源基因C-MYC、N-MYC和L-MYC组成,是人类癌症中最常见的失调驱动基因之一,在超过一半的癌症类型中被异常激活。由于MYC在癌症的形成、维持和发展中起着重要的作用,因此,靶向MYC蛋白是治疗癌症的一种有效的策略。但由... MYC基因由3个旁系同源基因C-MYC、N-MYC和L-MYC组成,是人类癌症中最常见的失调驱动基因之一,在超过一半的癌症类型中被异常激活。由于MYC在癌症的形成、维持和发展中起着重要的作用,因此,靶向MYC蛋白是治疗癌症的一种有效的策略。但由于缺乏适合小分子配体进行结合的口袋,MYC蛋白被认为是“不可成药”的抗癌靶点。然而,近年来,相关蛋白质结构信息愈加丰富以及越来越多新型计算工具出现,衍生了许多间接靶向抑制MYC的策略,并在肿瘤模型中展现了不错的抗肿瘤效果。本文根据其作用机制,将目前的间接靶向MYC的小分子分为作用于MYC PPI(protein-protein interaction,蛋白-蛋白相互作用)的抑制剂和调控MYC作用的靶点抑制剂,并针对不同机制的化合物分别进行了介绍和评述,以期为MYC抑制剂的进一步研究提供参考。 展开更多
关键词 MYC 抑制剂 MYC相关因子X 鸟嘌呤四链体 wd40重复蛋白5
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