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失活X染色体基因逃逸与系统性红斑狼疮的性别二态性
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作者 马茜 周少岚 +2 位作者 党洁 霍正浩 马占兵 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期18-33,共16页
X染色体失活可平衡女性中两条X染色体的基因剂量。越来越多的证据表明,失活X染色体上存在许多能够逃逸失活的基因。逃逸的机制涉及到DNA、RNA、组蛋白的表观修饰以及众多的调控蛋白和染色质的空间结构。失活X染色体基因逃逸的研究为人... X染色体失活可平衡女性中两条X染色体的基因剂量。越来越多的证据表明,失活X染色体上存在许多能够逃逸失活的基因。逃逸的机制涉及到DNA、RNA、组蛋白的表观修饰以及众多的调控蛋白和染色质的空间结构。失活X染色体基因逃逸的研究为人类疾病(特别是自身免疫性疾病)性别二态性的研究开辟了新的途径。目前已证实包括TLR7、CD40L、IRAK-1、CXCR3、CXorf21等失活X染色体基因逃逸是系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)女性好发的重要原因。本文主要综述了失活X染色体上基因逃逸以及与SLE性别二态性形成的分子机制。阐明SLE性别二态性形成的分子机制,不仅对疾病的诊断、治疗具有重要意义,而且对深入揭示人类免疫系统的发育及调控机理也有重要的理论意义。 展开更多
关键词 失活x染色体 基因 逃逸 性别二态性 系统性红斑狼疮
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5个牛种X染色体单纯型微卫星分布规律及其差异研究
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作者 徐宇辉 徐东辉 +3 位作者 曹萍 孙永刚 李瑞哲 马志杰 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期176-183,共8页
为探究牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛X染色体基因组序列中单纯型微卫星(Perfect Microsatellites)的分布规律及其差异,本研究利用Krait v 1.4.0软件对以上5个牛种X染色体基因组中的单纯型SSRs序列进行了检测,并对其分布特征进行... 为探究牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛X染色体基因组序列中单纯型微卫星(Perfect Microsatellites)的分布规律及其差异,本研究利用Krait v 1.4.0软件对以上5个牛种X染色体基因组中的单纯型SSRs序列进行了检测,并对其分布特征进行了综合分析。结果表明,在牦牛、普通牛、瘤牛、水牛和印度野牛的X染色体基因组序列中分别筛选到41321、44200、44075、45206个和45701个单纯型SSRs;普通牛X染色体中的单纯型SSRs相对频率最高(317.96 loci/Mb),其次是水牛(315.70 loci/Mb)、印度野牛(312.74 loci/Mb)和牦牛(303.08 loci/Mb),而瘤牛最低(296.16 loci/Mb);水牛X染色体中单纯型SSRs序列总长度占比最高(0.58%),普通牛(0.57%)、牦牛(0.57%)和印度野牛(0.56%)次之,瘤牛最低(0.53%)。5个牛种的X染色体中,单碱基重复类型的SSRs相对频率均最高,其次是两碱基、三碱基、五碱基、四碱基和六碱基重复类型,且单碱基、两碱基、三碱基、四碱基和五碱基重复类型中单纯型SSRs数量最多的重复拷贝类别相同,分别是A、AC、AGC、AAAT和AACTG,普通牛六碱基重复类型中AACCCT重复拷贝类别的SSRs数量最多,牦牛、瘤牛、水牛和印度野牛则是AAAAAC重复拷贝类别的SSRs数量最多。各牛种间相同重复类型的SSRs其重复单元的拷贝数集中的范围基本一致,6种重复类型的SSRs其重复单元的拷贝数分别集中在12~28次(单碱基)、7~24次(两碱基)、5~13次(三碱基)、4~8次(四碱基)、4~7次(五碱基)和4~10次(六碱基)。5个牛种X染色体上单纯型SSRs的分布模式均为非随机分布,部分单纯型SSRs(如重复基序为AT、ATCC、AACCCG的SSRs)倾向于聚集在X染色体的某一个区域,各牛种X染色体中发生聚集的SSRs类别和区域存在差异,显示单纯型SSRs在各牛种X染色体中拥有独特的分布模式。本研究结果为深入了解各牛种X染色体基因组序列中单纯型SSRs的组成和分布特征提供了参考,并为进一步探讨各牛种X染色体基因组中重复序列的进化规律和生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 牛种 x染色体 微卫星 频率 密度
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X染色体失活偏移与反复自然流产关系的meta分析
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作者 王璐 杨梦怡 +2 位作者 赵璐璐 霍正浩 王永军 《中国计划生育学杂志》 2024年第4期730-737,共8页
目的:探讨X染色体失活偏移(SXCI)与反复自然流产(RSA)之间的关系。方法:计算机检索PubMed、Medline、Cochraene、CNKI、CBM及万方等数据库,搜集自建库至2023年6月有关SXCI与RSA关系的病例-对照研究文献。采用RevMan 5.3和Stata 16.0软... 目的:探讨X染色体失活偏移(SXCI)与反复自然流产(RSA)之间的关系。方法:计算机检索PubMed、Medline、Cochraene、CNKI、CBM及万方等数据库,搜集自建库至2023年6月有关SXCI与RSA关系的病例-对照研究文献。采用RevMan 5.3和Stata 16.0软件对严格筛选后纳入的15项研究中3706例女性(病例组1673例,对照组2033例)相关数据进行meta分析。结果:总体分析中,病例组SXCI比例显著高于对照组(OR=1.68,95%CI 1.29~2.18);不同程度分层分析中,中度SXCI比例在病例组和对照组间的差异无统计学意义(OR=1.11,95%CI 0.56~2.18),高度(OR=2.32,95%CI 1.31~4.11)和极端(OR=4.71,95%CI 1.77~12.52)SXCI比例在病例组均显著增高;不同流产次数分层分析中,流产≥2次(OR=5.06,95%CI 2.46~10.40)和流产≥3次(OR=2.48,95%CI 1.66~3.68)时,病例组高度和极端SXCI比例均显著高于对照组。结论:SXCI,尤其是高度和极端SXCI与RSA的发生风险增大显著关联,且流产次数越多,这种关联性可能越明显。 展开更多
关键词 反复自然流产 x染色体失活偏移 META分析
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策勒黑羊X染色体多胎性状的关联分析
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作者 彭玉薇 王尚龙 +5 位作者 王渊锋 王权锋 杨建礼 马正委 佐建明 刘书东 《黑龙江农业科学》 2024年第3期39-45,共7页
为促进多胎性状策勒黑羊品种的培育,以策勒黑羊多胎性状和X染色体分子标记为对象,探究策勒黑羊多胎性状在X染色体上的遗传解析。选择100只策勒黑羊进行基因分型,利用PLINKv1.90进行质量控制,同时对X染色体上的SNP位点和策勒黑羊的多胎... 为促进多胎性状策勒黑羊品种的培育,以策勒黑羊多胎性状和X染色体分子标记为对象,探究策勒黑羊多胎性状在X染色体上的遗传解析。选择100只策勒黑羊进行基因分型,利用PLINKv1.90进行质量控制,同时对X染色体上的SNP位点和策勒黑羊的多胎性状进行关联分析,选取P<0.01的SNP位点进行标记,将筛选出的SNP位点附近的基因进行注释和分析,获得X染色体多胎性的候选基因。结果表明,有14个SNPs与策勒黑羊X染色体多胎性状在全基因组范围内显著相关。共筛选出20个候选基因,对20个候选基因进行生物学功能分析,多胎性状相关联的候选基因6个,其中,FTH1基因已有文献报道是多胎性状的候选基因。 展开更多
关键词 策勒黑羊 多胎性状 x染色体 候选基因
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嵌合型环状X染色体Turner综合征的产前诊断与遗传咨询1例
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作者 杨文霞 李佳 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第7期950-952,共3页
特纳综合征(Turner syndrome)是最常见的染色体异常疾病之一,以X染色体整体或部分缺失或结构异常为遗传学特征。Turner综合征的发生率约为新生女婴的1/300 ~1/2 500 [1] ,特纳嵌合现象在患有Turner综合征的女孩中占30% ,其中2% ~5%的患... 特纳综合征(Turner syndrome)是最常见的染色体异常疾病之一,以X染色体整体或部分缺失或结构异常为遗传学特征。Turner综合征的发生率约为新生女婴的1/300 ~1/2 500 [1] ,特纳嵌合现象在患有Turner综合征的女孩中占30% ,其中2% ~5%的患者发现环状X染色体(ring X chromosome)。嵌合环状X染色体的Turner综合征相关表型可能为精神障碍、学习困难、自闭症、颅面异常、心血管疾病和骨骼问题,以及与Turner综合征相关的其他表现,具体表型的严重程度与环染色体上缺失区域的大小和嵌合体的数量相关 [2-4] 。环状染色体可以通过染色体两条臂的末端断裂及其重新连接而形成,从而导致遗传物质的损失,它们也可能由端粒-端粒融合而形成,没有缺失,从而形成完整的环。镶嵌环状X染色体非常罕见,具有高度可变的表型。本文中,将常规染色体核型分析与染色体微阵列(chromonsomal microarray analysis,CMA)检测技术联合应用,产前诊断1例罕见的环状X染色体嵌合型Turner综合征胎儿,并提供遗传咨询。 展开更多
关键词 特纳综合征 环状x染色体 核型分析 染色体微阵列分析 产前诊断 遗传咨询
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X染色体基因组对奶牛生产性状影响的研究进展
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作者 王世康 江奇锋 +4 位作者 张强 李道全 杨志强 苏衍菁 杨卫兵 《中国奶牛》 2024年第7期41-45,共5页
寻找影响哺乳动物目标性状的数量性状位点(QTL)通常仅限于常染色体,X染色体变异尚未被纳入用于估计动物育种值的基因组预测方程中。而X染色体作为牛第二大的染色体,具有重要的生物学意义。随着基因组工作的深入,对X染色体上遗传变异的... 寻找影响哺乳动物目标性状的数量性状位点(QTL)通常仅限于常染色体,X染色体变异尚未被纳入用于估计动物育种值的基因组预测方程中。而X染色体作为牛第二大的染色体,具有重要的生物学意义。随着基因组工作的深入,对X染色体上遗传变异的功能性研究也越来越多,分析包含X染色体基因组标记信息可以改善基因组育种值的预测。本研究综述了X染色体上的基因与奶牛产奶、繁殖、健康、体型和生产寿命等性状关联分析的研究进展,以期为提高奶牛生产性能的研究提供帮助。 展开更多
关键词 奶牛 x染色体 关联分析 生产性能 基因组
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长链非编码RNA X染色体失活特异转录物和微小RNA-146-5p在甲状腺癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 郝润梅 刘竟 +1 位作者 刘洁 张婷 《实用临床医药杂志》 CAS 2023年第5期72-75,81,共5页
目的探讨甲状腺癌组织中长链非编码RNA(LncRNA)X染色体失活特异转录物(XIST)、微小RNA-146-5p(miR-146-5p)的表达及其诊断价值。方法选取甲状腺癌患者92例为研究对象,均行手术切除术,术中收集甲状腺癌组织和癌旁正常组织。分析LncRNA X... 目的探讨甲状腺癌组织中长链非编码RNA(LncRNA)X染色体失活特异转录物(XIST)、微小RNA-146-5p(miR-146-5p)的表达及其诊断价值。方法选取甲状腺癌患者92例为研究对象,均行手术切除术,术中收集甲状腺癌组织和癌旁正常组织。分析LncRNA XIST、miR-146-5p水平与患者临床病理特征之间的关系。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估LncRNA XIST、miR-146-5p单独及联合对甲状腺癌的诊断价值。结果甲状腺癌组织中LncRNA XIST表达水平为(0.65±0.17),低于癌旁组织的(1.02±0.18),miR-146-5p表达水平为(2.56±0.87),高于癌旁组织的(1.07±0.25),差异有统计学意义(P<0.05)。临床分期Ⅲ~Ⅳ期、发生颈部淋巴结转移的甲状腺癌患者肿瘤组织中LncRNA XIST表达水平低于临床分期Ⅰ~Ⅱ期、未发生颈部淋巴结转移的甲状腺癌患者,miR-146-5p表达水平高于临床分期Ⅰ~Ⅱ期、未发生颈部淋巴结转移的甲状腺癌患者,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线结果显示,LncRNA XIST、miR-146-5p二者联合诊断甲状腺癌的曲线下面积(AUC)大于LncRNA XIST、miR-146-5p单独诊断,差异有统计学意义(P<0.05)。结论甲状腺癌组织中LncRNA XIST表达下调,miR-146-5p表达上调,二者与临床分期、颈部淋巴结转移有关,并对甲状腺癌有一定的诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺癌 长链非编码RNA x染色体失活特异转录物 微小RNA-146-5p
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缺氧诱导因子-1α与X染色体连锁凋亡抑制蛋白在人卵巢癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 肖贵华 彭星辰 《实用医院临床杂志》 2023年第6期104-108,共5页
目的探讨缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)与X染色体连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)在人卵巢癌中的表达及意义。方法用免疫组织化学技术法检测人正常卵巢组织标本10例、良性卵巢肿瘤标本10例、交界性卵巢肿瘤标本10例及恶性卵巢癌组织标本30例中HIF-... 目的探讨缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)与X染色体连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)在人卵巢癌中的表达及意义。方法用免疫组织化学技术法检测人正常卵巢组织标本10例、良性卵巢肿瘤标本10例、交界性卵巢肿瘤标本10例及恶性卵巢癌组织标本30例中HIF-1α和XIAP的表达情况;培养人卵巢癌细胞系SKOV3,向细胞培养瓶中加入HIF-1α激动剂和抑制剂,提取细胞总RNA,用RT-PCR技术观察XIAP和HIF-1α基因表达变化。结果XIAP、HIF-1α在恶性上皮性卵巢癌组及交界性肿瘤组表达率均明显高于良性卵巢肿瘤组(P<0.05)。恶性上皮性卵巢癌组织中HIF-1α与XIAP在临床分期晚期(Ⅲ期和Ⅳ期)组的阳性表达率明显高于临床分期早期(Ⅰ期和Ⅱ期)组(P<0.05),与患者年龄、病理分型和淋巴结转移无关(P>0.05)。在恶性上皮性卵巢癌中HIF-1α与XIAP呈正相关(P<0.05)。随缺氧时间延长,SKOV3细胞系中HIF-1αmRNA表达量渐增;低氧24 h时HIF-1αmRNA表达量达高峰,36 h时HIF-1αmRNA表达量有所回落;添加HIF-1α抑制剂雷帕酶素后,HIF-1αmRNA表达量明显减少,XIAPmRNA亦减少。SKOV3细胞系中XIAP mRNA随HIF-1αmRNA而变化。结论HIF-1α和XIAP可能参与了恶性卵巢肿瘤的发生;HIF-1α和XIAP的高表达可能提示预后不良;HIF-1α对XIAP可能存在调控作用,两者可能协同促进卵巢癌的发生。 展开更多
关键词 缺氧诱导因子-1Α x染色体连锁凋亡抑制蛋白 人卵巢癌
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X染色体缺陷与卵巢早衰 被引量:1
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作者 刁飞扬 刘嘉茵 《国外医学(妇产科学分册)》 2002年第3期160-163,共4页
卵巢早衰是一种多基因病,目前的研究热点集中在用细胞和分子遗传学方法研究其发病的细胞和分子机制,寻找可能的候选基因,其中研究最多的是X染色体的异常及其相关基因缺陷,如ZFX,DIA,XIST,FMR1,AT2等。对其发病机制的阐明有助于对该病的... 卵巢早衰是一种多基因病,目前的研究热点集中在用细胞和分子遗传学方法研究其发病的细胞和分子机制,寻找可能的候选基因,其中研究最多的是X染色体的异常及其相关基因缺陷,如ZFX,DIA,XIST,FMR1,AT2等。对其发病机制的阐明有助于对该病的检测,预测可能发病人群,帮助加深对卵细胞发生、迁移、增殖、成熟和卵巢功能维持机制的了解。 展开更多
关键词 x染色体缺陷 卵巢早衰 x染色体 分子遗传学 POF 脆性x染色体综合征
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人X染色体长臂(Xq)和短臂(Xp)基因组学比较分析(英文) 被引量:1
10
作者 吕占军 宋淑霞 +3 位作者 翟羽 侯杰 韩丽枝 王秀芳 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第1期1-10,共10页
X染色体发生X染色体失活 ,但是Xp基因有 30 %表现为逃逸 ,而Xq仅不到 3%。为了研究X染色体基因失活和表达逃逸发生和维持的分子机制 ,比较了Xq和XpDNA序列的RNA模拟结合强度。X染色体的核苷酸序列被分为 5 0kb一段 ,对每一段DNA做 7碱基... X染色体发生X染色体失活 ,但是Xp基因有 30 %表现为逃逸 ,而Xq仅不到 3%。为了研究X染色体基因失活和表达逃逸发生和维持的分子机制 ,比较了Xq和XpDNA序列的RNA模拟结合强度。X染色体的核苷酸序列被分为 5 0kb一段 ,对每一段DNA做 7碱基 (7nt)字符串组合分析 (共有 4 7=16 384种组合 ) ,记录每段 5 0kbDNA中每种 7nt字符串的频率。选择生发中心B细胞中的 12 0个高表达基因 ,计算这些基因的内含子 7nt字符串的出现频率 ,称为intron 7nt,以此作为RNAs(RNA群 ,模拟细胞中RNA在小片段的总和 )。已知一段DNA序列的 7nt频率值和intron 7nt,即可以计算该DNA段与intron 7nt的结合强度。每段 5 0kbDNA与intron 7nt的结合强度取决于该DNA段与intron 7nt互补核苷酸的频率 ,互补的核苷酸序列越多 ,结合强度就越大。DNA段与intron 7nt的模拟结合强度称为RNA结合强度 ,试图模拟该段DNA可以结合的RNA小片段的总量。之所以采用 7nt字符串组合分析是考虑到连续 7个核苷酸互补则可以形成相对稳定的结合。研究发现 :1)Xp各DNA段的RNA结合强度均值显著大于Xq (P <0 0 0 1) ;2 )Xp上高结合RNA的DNA段数目显著高于Xq (P <0 0 0 1) ;3)RNA高结合DNA段形成的簇与X染色体基因表达逃逸区关联。有证据表明 。 展开更多
关键词 x染色体长臂 x染色体短臂 失活逃逸 内含子RNA 核苷酸字符串
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西安汉族X染色体上6个STR位点的遗传多态性 被引量:20
11
作者 余兵 秦群霞 +2 位作者 闫金成 张洪波 李生斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第3期188-191,共4页
目的调查西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423的基因及基因型频率分布。方法应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测结果。结果在120例女性无关个体中,DXS8378、D... 目的调查西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423的基因及基因型频率分布。方法应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测结果。结果在120例女性无关个体中,DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423分别检出5、6、11、10、8和4个等位基因;分别检出10、17、29、32、22和7种基因型;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此6个X染色体STR位点均有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义。 展开更多
关键词 x染色体 短串联重复序列 遗传多态性 汉族
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人X染色体含有一个黑色素瘤抗原基因亚家族 被引量:9
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作者 张成岗 邢桂春 +2 位作者 魏汉东 鱼咏涛 贺福初 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第3期197-203,共7页
肿瘤相关基因的研究是肿瘤基因形成学说的核心内容。肿瘤相关基因家族的研究则是其中的重点和难点.从4~6月孕龄人胎肝。DNA文库中克隆到1个黑色素瘤抗原基因(MAGE-D1)。随后发现了一个黑色素瘤抗原基因亚家族,称为M... 肿瘤相关基因的研究是肿瘤基因形成学说的核心内容。肿瘤相关基因家族的研究则是其中的重点和难点.从4~6月孕龄人胎肝。DNA文库中克隆到1个黑色素瘤抗原基因(MAGE-D1)。随后发现了一个黑色素瘤抗原基因亚家族,称为MAGE-D亚家族,其成员包括3个直系同源体(人MAGE-D1、大鼠SNERG-1和小鼠DLXIN-1)和2个旁系同源体(人MAGE-D和人KIAA1114)。该家族的3个人类成员均定位于染色体Xp11.21-p11.23,同时具有独特的基因组结构。分子进化树分析表明,该家族与已知MAGE-A、-B和-C 3个亚家族之间具有明显的进化上分歧。该亚家族的发现为研究肿瘤相关基因新功能提供了重要线索。 展开更多
关键词 x染色体 黑色素瘤抗原基因 基因家族 肿瘤
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成都地区汉族人群X染色体3个STR基因座的遗传多态性及其法医学应用 被引量:11
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作者 石美森 应斌武 +5 位作者 邓建强 李英碧 吴谨 颜静 张霁 侯一平 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期473-476,共4页
目的 了解 X染色体 3个 STR基因座在中国成都汉族群体的遗传多态性及其法医学应用价值。方法 利用 PCR和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对中国成都地区无亲缘关系汉族个体 X染色体 3个 STR基因座进行分型 ,自动激光荧光测序仪测定 DNA序列 ... 目的 了解 X染色体 3个 STR基因座在中国成都汉族群体的遗传多态性及其法医学应用价值。方法 利用 PCR和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对中国成都地区无亲缘关系汉族个体 X染色体 3个 STR基因座进行分型 ,自动激光荧光测序仪测定 DNA序列 ,并检验女性基因型频率分布是否符合 Hardy- Weinberg平衡 ,计算法医学常用各种概率。结果  3个 STR基因座在成都地区汉族群体均具有遗传多态性 ,χ2检验表明女性的基因型频率分布符合 Hardy- Weinberg平衡。结论 为人类群体研究提供了 X染色体 3个 STR基因座的中国成都汉族群体数据 。 展开更多
关键词 成都地区 汉族 x染色体 STR基因座 遗传多态性 法医学
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X染色体上16个STR基因座的分型检测和多态性分析 被引量:13
14
作者 李莉 赵书民 +4 位作者 张素华 李成涛 柳燕 林源 刘俊宏 《法医学杂志》 CAS CSCD 2012年第1期36-40,43,共6页
目的研制16个X-STR基因座的多重PCR检测试剂盒,调查各个基因座的遗传多态性。方法从X染色体上选择GATA165B12、DXS101、GATA172D05、HPRTB、DXS981、DXS8378、DXS6795、GATA31E08、DXS6809、DXS6803、DXS9902、DXS6807、DXS7423、DXS713... 目的研制16个X-STR基因座的多重PCR检测试剂盒,调查各个基因座的遗传多态性。方法从X染色体上选择GATA165B12、DXS101、GATA172D05、HPRTB、DXS981、DXS8378、DXS6795、GATA31E08、DXS6809、DXS6803、DXS9902、DXS6807、DXS7423、DXS7133、DXS6810和DXS7132共16个STR基因座,用Primer Premier 5.0设计多重PCR引物,用4种荧光素(FAM、HEX、TAMRA、ROX)进行标记,建立多重PCR体系,对中国汉族进行群体遗传学调查。结果成功地研制出X-STR基因座的多重PCR检测试剂盒IDtyperX-16。所检测的16个X-STR基因座中,DXS7133和DXS7423具有中度多态性,其余14个基因座均具有高度多态性(PIC>0.5,H>0.5),这16个X-STR基因座在女性群体的累积个人识别率为0.999 999 999 999 97,在男性群体的累积个人识别率为0.999 999 993,在三联体中的累积非父排除率为0.999 999 93,在二联体中的累积非父排除率为0.999 990。结论 IDtyper X-16试剂盒达到了法医物证学应用的要求,可为疑难复杂亲权案件的鉴定提供有效的手段。 展开更多
关键词 法医遗传学 x染色体 多态现象 遗传 STR
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达斡尔民族X染色体遗传多态性与亲缘的关系 被引量:6
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作者 侯巧芳 高放 +3 位作者 桂宏胜 马懿 Allah-Rakha 李生斌 《第四军医大学学报》 CAS 北大核心 2007年第11期1045-1048,共4页
目的:研究达斡尔民族X染色体遗传结构与亲属关系.方法:选择9个X-STR(DXS6804,DXS7133,DXS101,DXS6789,DXS6799,DXS7423,HPRTB,DXS8378,DXS7132),分析其多态性分布及与其他群体间的遗传距离和聚类关系.结果:研究群体中共检出51种等位基因... 目的:研究达斡尔民族X染色体遗传结构与亲属关系.方法:选择9个X-STR(DXS6804,DXS7133,DXS101,DXS6789,DXS6799,DXS7423,HPRTB,DXS8378,DXS7132),分析其多态性分布及与其他群体间的遗传距离和聚类关系.结果:研究群体中共检出51种等位基因,频率分布在0.0161~0.6935;基因型频率、杂合度、个体识别率、多态性信息量等群体遗传学指标分析显示,9个STR位点可用于群体遗传学研究和法医学应用;聚类分析和系统进化关系分析发现达斡尔和鄂伦春族有较近的遗传距离.结论:此9个X-STR位点具有较高的个体识别率和多态性信息量,可用于群体遗传学研究、法医学应用和疾病连锁分析. 展开更多
关键词 x染色体 短串联重复序列 遗传多态现象 遗传距离 达斡尔族 亲属关系
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十二个X染色体STR基因座荧光标记复合扩增体系的法医学应用 被引量:7
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作者 任峥 曾祥培 +4 位作者 陈文静 吴晓洁 童大跃 李建金 孙宏钰 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期109-115,共7页
【目的】评估DXS10103等12个X染色体STR基因座(X-STR)复合扩增体系的法医学应用价值。【方法】采集广东汉族人群272名无关个体(男性144名,女性128名)血样,提取基因组DNA,使用Investigator Argus X-12复合扩增系统通过五色荧光标记引物... 【目的】评估DXS10103等12个X染色体STR基因座(X-STR)复合扩增体系的法医学应用价值。【方法】采集广东汉族人群272名无关个体(男性144名,女性128名)血样,提取基因组DNA,使用Investigator Argus X-12复合扩增系统通过五色荧光标记引物进行复合扩增,采用毛细管电泳技术进行产物分离和基因分型,统计相关法医学应用参数。【结果】272个个体均获得明确的基因分型。共检出153种等位基因,等位基因频率分布无男女间的差异。经Bonferroni法校正后各基因座均符合Hardy-Weinberg平衡。DXS10103与DXS10101基因座间存在连锁不平衡。各基因座个体识别力(DP)为0.518 7~0.989 2,平均非父排除率(MEC)为0.287 7~0.919 1,多态信息含量(PIC)为0.421 9~0.919 1。男性累积个体识别力(DP)达0.999 999 999,女性累积DP达0.999 999 999,二联体累积非父排除率(MECduo)达0.999 998 336,三联体累积非父排除率(MECtrio)达0.999 999 991。【结论】DXS10103等12个X-STR基因座是中国广东汉族群体个体识别和亲子鉴定高效的检测系统,尤其对特殊的亲权鉴定案件具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 x染色体 短串联重复 复合扩增 法医学
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X染色体上18个InDel多重PCR系统的建立 被引量:5
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作者 孙宽 赵书民 +1 位作者 张素华 李成涛 《法医学杂志》 CAS CSCD 2014年第2期101-109,共9页
目的对X染色体上的插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)遗传标记进行研究,筛选18个基因座建立可用于中国汉族人群法医DNA鉴定的辅助分型系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选得到18个X-InDel基因座,用Primer 3软件包设计... 目的对X染色体上的插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)遗传标记进行研究,筛选18个基因座建立可用于中国汉族人群法医DNA鉴定的辅助分型系统。方法采用人类基因组浏览器和dbSNP数据库筛选得到18个X-InDel基因座,用Primer 3软件包设计多重复合扩增PCR引物,依据扩增片段长度分为3组,分别用FAM、HEX和TAMRA三种荧光素标记,建立多重PCR体系。对中国汉族和主要的四大少数民族(回族、维族、蒙古族和藏族)进行群体遗传学调查及对比分析。结果成功研制了一个包含18个X-InDel基因座和Amelogenin性别鉴定基因座的复合荧光多重PCR扩增体系,命名为InDel X-18PLEX系统。多态性调查显示这18个X-InDel基因座在5个主要民族中等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡,但各等位基因的频率分布差异具有统计学意义。在中国汉族人群中,该系统在女性群体和男性群体的累积个人识别率分别为0.999999 4、0.99988,在三联体和二联体的累积平均排除率分别为0.999992和0.99。结论 InDel X-18PLEX系统能够满足成为法医DNA鉴定辅助性试剂盒的要求,可以成为部分疑难案件的补充分析工具。 展开更多
关键词 法医遗传学 多态现象 遗传 x染色体 插入 缺失
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利用高密度SNP检测不同猪品种间X染色体选择信号 被引量:10
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作者 马云龙 张勤 丁向东 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1251-1260,共10页
在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因。X染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中... 在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因。X染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中许多针对常染色体的方法往往不适用,需要采取特殊的方法,选择信号检测可以作为一种行之有效的方法对X染色体进行分析。文章利用长白、松辽黑猪和大白3个猪品种,通过品种间选择信号检测方法 XP-EHH,利用高密度SNP标记对X染色体进行选择信号检测,并通过生物信息学分析寻找选择信号区域内重要基因。在长白、松辽黑猪和大白3个品种中分别检测出29、13和15个选择信号区域,每个选择信号区域平均包含3.59、4.92、4.07个SNPs,长白和松辽黑猪、长白和大白有部分重叠选择信号区域,大白和松辽黑猪没有发现重叠选择信号区域。生物信息学分析发现各品种选择信号区域内有与繁殖、免疫等性状相关基因,其中部分在猪中尚未见报道,可作为研究猪相关性状的重要候选基因。 展开更多
关键词 x染色体 选择信号
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湖南土家族群体X染色体10个STR位点的遗传多态性及法医学应用价值评估 被引量:3
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作者 韩卫 杨丽 +3 位作者 桂宏胜 余兵 卫洁 李生斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期568-574,共7页
摘要:对198名湖南土家族健康无关个体抽取静脉血,提取DNA,经PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染进行等位基因分型;软件SPSS13.0计算各位点基因型频率和等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡检验,并检验基因分布差异有无统计学意义;Fs... 摘要:对198名湖南土家族健康无关个体抽取静脉血,提取DNA,经PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染进行等位基因分型;软件SPSS13.0计算各位点基因型频率和等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡检验,并检验基因分布差异有无统计学意义;Fstat软件计算基因多态性及固定指数;Powerstats软件计算各种法医学应用指标。在湖南土家族群体中,共检出65个等位基因,频率分布在0.0048~0.6170之间;10个X-STR位点中DXS6789、DXS6799、HPRTB位点的多态性和分化程度较低;DXS7133、DXS7423位点的法医学应用价值较低;位点比较中,湖南土家族群体与德国、意大利群体的差异最明显。DXS6804、DXS7132、DXS7130、DXS8378、DXS6789、DXS6799、DXS7424、HPRTB等8个位点在湖南土家族群体的个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义;差异性检验结果揭示高加索人种与蒙古人种间存在着较大的差异性。 展开更多
关键词 土家族 x染色体 短串联重复序列 遗传多态性 差异性
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注意缺损多动障碍的X染色体基因组扫描分析 被引量:3
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作者 江三多 何玫 +7 位作者 钱伊萍 汪栋祥 张野 李飞 田红军 忻仁娥 汤国梅 吴晓东 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期26-30,共5页
注意缺损多动障碍(attention defic it hyperactivity d isorder,ADHD)是儿童期多见行为障碍。男孩发病多于女孩。家系、双生儿和寄养子研究显示该障碍发生具有遗传基础。但是病因尚不清楚。分子遗传学和药理学研究表明ADHD涉及到多巴... 注意缺损多动障碍(attention defic it hyperactivity d isorder,ADHD)是儿童期多见行为障碍。男孩发病多于女孩。家系、双生儿和寄养子研究显示该障碍发生具有遗传基础。但是病因尚不清楚。分子遗传学和药理学研究表明ADHD涉及到多巴胺和去甲肾上腺素等神经递质系统,一系列报告发现ADHD与多巴胺D4受体(DRD4)、多巴胺转运体(DAT1)和儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)等基因相关联。以往研究表明ADHD与X染色体上DXS7位点和MAOA基因相关联,而DXS7是紧密连锁于MAO基因。依此假设,应用基因组扫描技术探讨ADHD在X染色体上易感位点。采用TDT方法分析X染色体上48个DNA标志的多态性与中国人群中84个ADHD核心家系间的连锁关系,ADHD诊断依据DSM-Ⅲ-R标准。TDT分析结果观察到如下位点与ADHD相连锁,DXS1214(TDT:χ2=18.1,df=7,P<0.01),DXS8102(TDT:χ2=7.9,df=3,P<0.05),DXS1068(TDT:χ2=21.9,df=9,P<0.01),DXS8015(TDT:χ2=14.6,df=7,P<0.05),DXS1059(TDT:χ2=27.8,df=10,P<0.01)和DXS8088(TDT:χ2=20.4,df=3,P<0.01)。研究资料提示X染色体上Xp11.4-p21和Xq23区域可能存在ADHD的易感基因。 展开更多
关键词 注意缺损多动障碍 x染色体 基因组扫描
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