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基于accD基因序列的牛至遗传多样性研究
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作者 卓维 刘艳 +4 位作者 卢圣鄂 朱晓富 黄红燕 陈双扣 任风鸣 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2023年第4期1191-1198,共8页
目的基于acc D基因序列分析不同产地牛至的遗传结构与分化,考察其遗传多样性。方法以8个居群69份样品为材料,试剂盒法提取植物基因组DNA,同源克隆法获得acc D序列,Sanger测序法双向测序,利用DNAsp、Arlequin等软件进行多态性分析,MEGA... 目的基于acc D基因序列分析不同产地牛至的遗传结构与分化,考察其遗传多样性。方法以8个居群69份样品为材料,试剂盒法提取植物基因组DNA,同源克隆法获得acc D序列,Sanger测序法双向测序,利用DNAsp、Arlequin等软件进行多态性分析,MEGA软件计算遗传距离并构建NJ发育树。结果牛至acc D长度为1432-1436 bp,存在10个单倍型与16个变异位点,单倍型多态性为0.595,核苷酸多样性为0.15750;牛至居群遗传分化较高(Gst=0.36751,Nst=0.46976,Fst=0.67627),基因流较低(Nm=0.43),居群间变异(67.62%)是主要的变异来源。系统发育关系显示10种单倍型形成3大分支,主要以H2为中心形成发散状的系统结构,种群未发生扩张。结论牛至居群存在较高的遗传多样性与遗传分化,可能主要与生境片段化、种群隔离及生活史特征相关,本研究为牛至种质资源的保护和开发利用提供理论基础。 展开更多
关键词 牛至 accd基因 单倍型 遗传多样性
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CAC3基因转运肽序列和accD基因融合植物表达载体的构建 被引量:5
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作者 张煜星 崔燕 +2 位作者 武寒雪 祝建波 周鹏 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第5期26-29,共4页
采用PCR方法分别从陆地棉和拟南芥基因组中扩增出Accase羧基转移酶-βCT亚基编码基因accD,Accase羧基转移酶-αCT亚基编码基因CAC3的定位于叶绿体的转运肽序列。分析结果与NCBI公布的氨基酸同源性分别为100%,99%。将CAC3基因转运肽序列... 采用PCR方法分别从陆地棉和拟南芥基因组中扩增出Accase羧基转移酶-βCT亚基编码基因accD,Accase羧基转移酶-αCT亚基编码基因CAC3的定位于叶绿体的转运肽序列。分析结果与NCBI公布的氨基酸同源性分别为100%,99%。将CAC3基因转运肽序列与accD基因进行体外重组,构建了融合植物表达载体pBI-CAC3tp-accD,为下一步作物的遗传转化打下了基础。 展开更多
关键词 陆地棉 拟南芥 accd基因 CAC3基因 转运肽
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棉花accD基因植物表达载体的构建与遗传转化的研究 被引量:4
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作者 张煜星 崔燕 +1 位作者 祝建波 周鹏 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第18期36-40,共5页
乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)催化脂肪酸合成的第一步,是脂肪酸合成的限速酶。采用PCR方法分别从陆地棉和拟南芥基因组中扩增出ACCase羧基转移酶β-CT亚基编码基因accD,ACCase羧基转移酶α-CT亚基编码基因CAC3的定位于叶绿体的转运肽序列。... 乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)催化脂肪酸合成的第一步,是脂肪酸合成的限速酶。采用PCR方法分别从陆地棉和拟南芥基因组中扩增出ACCase羧基转移酶β-CT亚基编码基因accD,ACCase羧基转移酶α-CT亚基编码基因CAC3的定位于叶绿体的转运肽序列。将CAC3基因转运肽序列与accD基因进行体外重组,构建融合植物表达载体pBI-CAC3tp-accD。重组质粒通过冻融法转化根癌农杆菌GV3101。渗透法转化拟南芥,收种子,在含卡那霉素的MS培养基中发芽筛选。用叶盘法转化烟草,经不定芽诱导、生根培养,获转基因烟草植株。T1代转基因拟南芥和转基因烟草植株经卡那霉素检测、PCR、RT-PCR检测后,初步表明目的基因已在植株中转化成功,并可以正常转录。 展开更多
关键词 陆地棉 拟南芥 accd基因
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石栗accD基因全长cDNA的克隆及序列分析 被引量:1
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作者 王磊 禤维言 +2 位作者 张艳 冯斗 刘紫戈 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1602-1606,共5页
【目的】克隆石栗幼嫩叶片accD基因的全长cDNA序列,为今后利用该基因和提高油料作物种子含油量提供参考。【方法】根据已知植物麻疯树、蓖麻等accD基因的保守区域设计简并引物,以石栗幼嫩叶片为材料,利用简并PCR和RACE技术克隆accD基因... 【目的】克隆石栗幼嫩叶片accD基因的全长cDNA序列,为今后利用该基因和提高油料作物种子含油量提供参考。【方法】根据已知植物麻疯树、蓖麻等accD基因的保守区域设计简并引物,以石栗幼嫩叶片为材料,利用简并PCR和RACE技术克隆accD基因的全长cDNA序列,扩增其编码序列。【结果】扩增获得的石栗accD基因全长cDNA序列长1789 bp,包含1509 bp的开放阅读框,可编码503个氨基酸,GenBank登录号为KC255250,并命名为amaccD。石栗accD基因序列经BLASTx比对后,发现其与巴西橡胶树、蓖麻和麻疯树氨基酸序列的同源性分别为90%、90%和89%。【结论】克隆获得的石栗accD基因全长cDNA序列与巴西橡胶树、蓖麻和麻疯树等具有较高同源性。 展开更多
关键词 石栗 乙酰辅酶A羧化酶 accd基因 克隆 序列分析
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油菜β-CT亚基编码基因accD的SNPs分析及其分子进化 被引量:2
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作者 付三雄 张洁夫 +7 位作者 陈锋 顾慧 陈松 浦惠明 龙卫华 胡茂龙 高建芹 戚存扣 《江西农业学报》 CAS 2011年第12期7-11,共5页
以含油量不同的32份甘蓝型油菜自交纯合系为材料,用直接测序法筛查β-CT亚基的accD编码基因DNA序列的单核苷酸多态性,包括98%的编码区序列共1380 bp。在32份材料中只在材料18和20两个材料中发现了一个相同的SNP,SNP频率为1/1380,单倍型... 以含油量不同的32份甘蓝型油菜自交纯合系为材料,用直接测序法筛查β-CT亚基的accD编码基因DNA序列的单核苷酸多态性,包括98%的编码区序列共1380 bp。在32份材料中只在材料18和20两个材料中发现了一个相同的SNP,SNP频率为1/1380,单倍型多态性指数Hd=0.121;核苷酸多态性π=0.00009,θ=0.00018。Tajima’s D值为不显著负值,Fu&Li’s检测,各个参数均为不显著正值,Z检验结果中(dN-dS)值也为不显著正值,说明accD基因没有偏离中性进化。系统发育树表明,accD基因在所选的32个油菜材料中是高度保守的,与拟南芥的序列相似度高达95.7%,说明accD基因在物种间也是高度保守的。暗示其在种子油脂合成过程中起着不可替代的作用,此外说明,仅用β-CT亚基编码基因的单核苷酸多态性还不能解释含油量复杂的表现型,还需在更大的群体资源中扩增accD编码基因和其它亚基编码基因进行单核苷酸多态性与含油量表型的相关性研究。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 accd基因 单核苷酸多态性
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植物乙酰辅酶A羧化酶β亚基accD在因研究进展 被引量:2
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作者 崔燕 祝建波 张煜星 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第13期5255-5256,5463,共3页
综述了乙酰辅酶A羧化酶及其催化域羧基转移酶(Carboxyltransferase,CT)的β亚基(β-CT)的分布和生理功能、β-CT编码基因accD的分子生物学特征及乙酰辅酶A羧化酶在脂肪酸代谢工程中的应用研究进展。
关键词 乙酰辅酶A羧化酶 羧基转移酶β亚基 accd基因 脂肪酸代谢工程
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Cloning of Acetyl-CoA Carboxylase accD Subunit Gene from Brassica campestris and Effect of Its Expression on Oil Content
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作者 龚莹 彭少丹 +4 位作者 曲晓言 陈升位 王学军 官春云 林良斌 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第2期206-210,234,共6页
[Objective] This study aimed to clone accD gene from Brassica campestris (Yunnan small rapeseed) with different oil content and analyze the effect of accD gene expression level on rapeseed oil content. [Method] The ... [Objective] This study aimed to clone accD gene from Brassica campestris (Yunnan small rapeseed) with different oil content and analyze the effect of accD gene expression level on rapeseed oil content. [Method] The accD gene encoding β-CT Ⅱsubunit of acetyl-CoA carboxylase was cloned from Yunnan small rapeseeds with different oil content. Then, sequence alignment and the influence upon seed oil content by the expression of accD gene were analyzed. [Result] There were a few base pair substitutes among the accD genes from different Yunnan small rapeseeds, and their homology was up to 98.6%. The expression of accD gene was increased with reproduction development, and reached peak in late-stage siliques. The seed oil content was positively influenced by the expression of accD gene in middle-stage and late-stage siliques. [Conclusion] This study provides a certain theoretical basis for illustrating the molecular mechanism about rapeseed oil content and breeding new high-oil rapeseed cultivars. 展开更多
关键词 Yunnan small rapeseed accd gene CLONING EXPRESSION Oil content
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甘薯质体中的乙酰辅酶A羧化酶亚基基因accD的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 王玉华 郝建国 贾敬芬 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2009年第11期1065-1069,共5页
依据烟草质体全基因组序列设计引物,以甘薯质体基因组DNA为模板,PCR扩增包含质体accD基因完整编码区在内的一段序列(GenBank登录号为GQ395771)。序列分析表明:该片段全长为2209bp,包括1548bp的accD基因编码序列,推测编码515个氨基酸的... 依据烟草质体全基因组序列设计引物,以甘薯质体基因组DNA为模板,PCR扩增包含质体accD基因完整编码区在内的一段序列(GenBank登录号为GQ395771)。序列分析表明:该片段全长为2209bp,包括1548bp的accD基因编码序列,推测编码515个氨基酸的蛋白质,该蛋白序列具有异质型β-CT中保守的锌指结构和C末端5个基元。同时绘制了该DNA片段的限制性酶切图谱。相似性比较显示,甘薯accD基因与大豆、马铃薯、拟南芥、人参、莴苣、葡萄、海岛棉、甘蓝、辣椒、菠菜、番茄和烟草的accD基因核苷酸相似性为72%~87%,氨基酸相似性为58%~83%。 展开更多
关键词 甘薯 乙酰辅酶A羧化酶(ACCase) accd基因 克隆
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小茴香及其常见混伪品的分子标记鉴定 被引量:2
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作者 王锐莹 于巧宁 +2 位作者 王洪涛 申京宇 尹花仙 《食品科技》 CAS 北大核心 2021年第5期260-264,共5页
小茴香与孜然、莳萝子、葛缕子、蛇床子在外观形态上相似,存在掺假及混淆使用的现象。准确鉴别小茴香及其混伪品对维护小茴香产品质量和保护消费者利益具有重要意义。针对传统的形态学和理化鉴别方法的不足,文章通过比较小茴香及其混伪... 小茴香与孜然、莳萝子、葛缕子、蛇床子在外观形态上相似,存在掺假及混淆使用的现象。准确鉴别小茴香及其混伪品对维护小茴香产品质量和保护消费者利益具有重要意义。针对传统的形态学和理化鉴别方法的不足,文章通过比较小茴香及其混伪品的叶绿体全基因组,在accD基因中发掘了小茴香可区别于其他混伪品的单核苷酸多态性位点,并分别设计了小茴香及其混伪品的位点特异性引物。在建立的多重位点PCR体系下,小茴香产生了336 bp的特异性条带,其混伪品则产生了168 bp的特异性条带。方法同时验证了小茴香及其混伪品的2个SNP位点,可以在一个反应体系中同时将小茴香与其4种混伪品区分,鉴定结果准确可靠。因此,文章建立的多重PCR体系为小茴香鉴定提供了新的DNA分子标记方法,也为其他香辛料产品来源的鉴定提供了方法借鉴。 展开更多
关键词 小茴香 混伪品 accd基因 单核苷酸多态性 多重PCR
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