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Critical Amino Acid Residues for Nicotine 5'-Hydroxylation in Human CYP2A Enzymes 被引量:1
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作者 Xiaoyang Hea Xu Xu +4 位作者 Jian Shen Li Sun Anthony Y. H. Lu Clifford Weisel Junyan Hong 《Journal of Nanjing Medical University》 2008年第6期338-345,共8页
Objective: We have continued previous work in which we demonstrated that #117 and #372 amino acids contributed to the high activities of human CYP2A13 in catalyzing 4-methylnitrosamino-1-(3-pyridyl)-1-butanone(NNK... Objective: We have continued previous work in which we demonstrated that #117 and #372 amino acids contributed to the high activities of human CYP2A13 in catalyzing 4-methylnitrosamino-1-(3-pyridyl)-1-butanone(NNK) and aflatoxin BI(AFB1) carcinogenic activation. The present study was designed to identify other potential amino acid residues that contribute to the different catalytic characteristics of two CYP2A enzymes, CYP2A6 and CYP2A13, in nicotine metabolism and provide insights of the substrate and related amino acid residues interactions. Methods: A series of reciprocally substituted mutants of CYP2A6lle^300→ Phe, CYP2A6Gly^301aAla, CYP2A6Ser^369 → Gly, CYP2A13Phe^300→ Ile, CYP2A13Ala^301 → Gly and CYP2A13Gly^369 → Set were generated by site-directed mutagenesis/baculovirus-Sf9 insect cells expression. Comparative kinetic analysis of nicotine 5'hydroxylatin by wild type and mutant CYP2A proteins was performed. Results:All amino acid residue substitutions at 300, 301 and 369 caused significant kinetic property changes in nicotine metabolism. While CYP2A6Ile^300→ Phe and CYP2A6Gly^301→Ala mutations had notable catalytic efficiency increases compared to that for the wild type CYP2A6, CYP2A13Phe^300→Ile and CYP2A13Ala^301→Gly replacement introduced remarkable catalytic efficiency decreases. In addition, all these catalytic efficiency alterations were caused by Vmax variations rather than Km changes. Substitution of #369 residue significantly affected both Km and Vmax values. CYP2A6Ser^369 → Gly increase the catalytic efficiency via a significant Km decrease versus Vmax enhancement, while the opposite effects were seen with CYP2A13Gly^369 → Ser. Conclusion:#300, #301 and #369 residues in human CYP2A6/13 play important roles in nicotine 5' -oxidation. Switching #300 or #301 residues did not affect the CYP2A protein affinities toward nicotine, although these amino acids are located in the active center. Set369 to Gly substitution indirectly affected nicotine binding by creating more space and conformational flexibility for the nearby residues, such as Leu^370 which is crucial for many hydroxylations. 展开更多
关键词 CYP2A6 CYP2A13 nicotine 5'-hydroxylation site-directed mutagenesis crucial amino acid residue
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影响H9N2亚型禽流感病毒生物学特性的关键氨基酸位点分析
2
作者 周婉婷 彭程 +3 位作者 蒋文明 宋厚辉 刘朔 刘华雷 《中国动物检疫》 CAS 2024年第8期20-27,共8页
H9N2亚型禽流感病毒是在我国家禽中流行最为广泛的亚型,严重影响养禽业健康发展,具有感染哺乳动物的能力。可感染人类的H5N1、H7N9、H10N8和H3N8等新型流感病毒中多次发现H9N2亚型禽流感病毒的内部基因,而这些感染人类的新型流感病毒对... H9N2亚型禽流感病毒是在我国家禽中流行最为广泛的亚型,严重影响养禽业健康发展,具有感染哺乳动物的能力。可感染人类的H5N1、H7N9、H10N8和H3N8等新型流感病毒中多次发现H9N2亚型禽流感病毒的内部基因,而这些感染人类的新型流感病毒对公共卫生安全造成了巨大威胁。文章围绕H9N2亚型禽流感病毒,总结了影响该亚型病毒致病性、受体结合、复制能力以及在家禽或哺乳动物中与传播有关的关键功能氨基酸位点突变的研究进展,以期进一步解析H9N2亚型禽流感病毒及其内部基因在新型流感病毒产生过程中的机制和作用。 展开更多
关键词 禽流感病毒 H9N2 氨基酸位点 生物学特性 突变
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2019年潍坊地区一株登革病毒全基因组序列分析
3
作者 李东英 霍锡元 +3 位作者 孙玉红 聂清 张作栋 刘淑慧 《中华卫生杀虫药械》 CAS 2023年第3期255-259,共5页
目的 分析2019年潍坊市一株登革病毒(Weifang 2019)全基因组序列及关键性氨基酸位点的突变情况。方法 收集登革病毒感染病例的血清样本,对初检阳性样本进行病毒分离、全基因组测序,构建进化树,对该序列进行核苷酸/氨基酸相似性分析。结... 目的 分析2019年潍坊市一株登革病毒(Weifang 2019)全基因组序列及关键性氨基酸位点的突变情况。方法 收集登革病毒感染病例的血清样本,对初检阳性样本进行病毒分离、全基因组测序,构建进化树,对该序列进行核苷酸/氨基酸相似性分析。结果 本研究中,分别以登革病毒1型(DENV-1)参考毒株(NC_001477.1)和原型株(EU848545.1)为对照,Weifang 2019核苷酸基因组的全序列分别检出94个和95个氨基酸位点突变,其中有57个突变位点一致。其中,3个结构蛋白和7个非结构蛋白均存在突变,蛋白NS5、E和NS1位点突变占比前3位。核苷酸序列和氨基酸序列分析发现Weifang2019与Guangdong 2014(99.5%/99.3%)、Wenzhou 2014(99.6%/99.4%)、Guangdong 2016(99.4%/99.2%)、Henan 2014(99.5%/99.3%)处于同一进化分支,且相似性均大于99%。结论 2019年潍坊地区一株登革病毒Weifang 2019与Guangdong 2014(MN018287.1)、Wenzhou 2014(KR024708.1)、Guangdong 2016(MN018286.1)和Henan 2014(KP686070.1)的遗传距离较近、相似性较高,提示Weifang 2019可能由上述地区毒株遗传进化而来。 展开更多
关键词 登革热 登革1型病毒 E氨基酸位点 关键性氨基酸
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赭曲霉11α羟化酶的克隆表达及关键氨基酸位点分析 被引量:3
4
作者 艾露 陈文慧 +5 位作者 史京辉 任志远 沈文琦 杨嘉凝 骆健美 王敏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期114-123,共10页
11α,17α-双羟基黄体酮是甾体激素类药物的重要中间体,工业上主要利用霉菌对17α-羟基黄体酮的11α羟化反应制备。对赭曲霉的11α羟化酶及其关键氨基酸位点展开研究,为深入解析酶的催化机理提供基础数据。利用底物转化实验探究了10个... 11α,17α-双羟基黄体酮是甾体激素类药物的重要中间体,工业上主要利用霉菌对17α-羟基黄体酮的11α羟化反应制备。对赭曲霉的11α羟化酶及其关键氨基酸位点展开研究,为深入解析酶的催化机理提供基础数据。利用底物转化实验探究了10个羟化反应常用霉菌对17α-羟基黄体酮的转化能力,考察了赭曲霉来源的11α羟化酶CYP68J5在不同表达系统中的活性,借助结构预测、分子对接和定点突变等手段对CYP68J5的关键氨基酸位点进行解析。结果表明,赭曲霉的转化能力最强,转化时间60 h的摩尔产率达到最大值,为78.55%;其羟化酶CYP68J5在酿酒酵母中的表达活性最高;位于底物结合口袋附近的D118、F216、M488是CYP68J5的关键氨基酸位点,这些位点在维持酶的结构稳定性上发挥重要作用,是后续分子改造的潜在重要靶点。 展开更多
关键词 11α 17α-双羟基黄体酮 17α-羟基黄体酮 赭曲霉 11α羟化酶 关键氨基酸位点
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4型禽腺病毒分离株SDLC202011的致病性及全基因组序列分析
5
作者 王凯莉 刘成 +5 位作者 杜旭升 陈乐乐 曹胜亮 李玉保 路建彪 司振书 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第5期95-102,共8页
为了掌握4型禽腺病毒(FAdV-4)山东聊城分离株SDLC202011的致病特点及遗传变异情况,对其进行了致病性试验和全基因测序分析。结果表明:该分离株对21日龄SPF鸡的致死率为100%,感染鸡的心脏、肝脏、肾脏等器官均具有典型的病理变化,免疫组... 为了掌握4型禽腺病毒(FAdV-4)山东聊城分离株SDLC202011的致病特点及遗传变异情况,对其进行了致病性试验和全基因测序分析。结果表明:该分离株对21日龄SPF鸡的致死率为100%,感染鸡的心脏、肝脏、肾脏等器官均具有典型的病理变化,免疫组化显示肝脏、胰腺和肾脏中均检测到该病毒的抗原;全基因组序列长度为43826 bp,编码34个开放阅读框。与国外参考毒株相比,该毒株和国内其他毒株在35473~37439 bp均有1966 bp的缺失,该区域包含ORF19、ORF48和ORF27;与非致病性毒株相比,高致病力毒株在hexon、fiber1和fiber2分别有1、3和12个氨基酸位点突变,突变主要集中在fiber2。本研究结果表明分离株SDLC202011为高致病力毒株,可在肝脏、胰腺和肾脏等脏器中增殖,为进一步研究FAdV-4的致病机制及疫苗研发奠定了基础。 展开更多
关键词 FAdV-4 致病性 全基因组 开放阅读框 氨基酸位点
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影响猪流感病毒致病性和传播性的关键氨基酸位点的研究进展
6
作者 赵玉仲 王彦哲 +4 位作者 考国鑫 桑浩田 韩乐斌 刘思当 肖一红 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第6期194-201,共8页
猪流感病毒(SIV)在猪群中广泛传播,给养猪业造成重大的经济影响。流感病毒主要是通过病毒基因组的突变和不同来源流感病毒基因组的重新组合来完成自身的进化。通过以上两种方式产生的流感病毒对动物的致病性和传播性会出现显著改变。在... 猪流感病毒(SIV)在猪群中广泛传播,给养猪业造成重大的经济影响。流感病毒主要是通过病毒基因组的突变和不同来源流感病毒基因组的重新组合来完成自身的进化。通过以上两种方式产生的流感病毒对动物的致病性和传播性会出现显著改变。在这篇综述中,我们对影响SIV致病性和传播性的关键氨基酸位点的突变进行了归纳和分析,为进一步研究SIV的致病机制等方面奠定了基础。 展开更多
关键词 猪流感病毒 致病性 传播性 关键氨基酸位点
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2021年中国部分地区鸡传染性贫血病毒VP1基因遗传变异分析 被引量:2
7
作者 吕钊 马国明 +7 位作者 牛登云 史秋颖 段宝敏 马利芳 李颖 耿晨阳 周佳伟 冯敬敬 《中国家禽》 北大核心 2023年第4期64-68,共5页
为全面了解鸡传染性贫血病毒(CIAV)在我国的流行情况和VP1基因遗传变异情况,研究对2021年全国25个省市421份疑似CIAV或其他病原感染的临床样本进行鉴定。结果显示,共有64份临床样本的VP1基因PCR鉴定为阳性,序列对分析发现有59株VP1基因... 为全面了解鸡传染性贫血病毒(CIAV)在我国的流行情况和VP1基因遗传变异情况,研究对2021年全国25个省市421份疑似CIAV或其他病原感染的临床样本进行鉴定。结果显示,共有64份临床样本的VP1基因PCR鉴定为阳性,序列对分析发现有59株VP1基因位于基因A型分支,5株VP1基因位于基因C型分支,氨基酸位点分析发现第394位氨基酸为谷氨酰胺(Q),与3-1株、CAV-10株等高致病性CIAV一致,且第75、89、125、139、141、144位氨基酸位点也出现了不同程度的变异。研究表明目前我国鸡群流行的CIAV以A型为主,且VP1基因存在变异,结果为了解CIAV在我国的变异情况及传染性贫血防控提供了数据参考。 展开更多
关键词 鸡传染性贫血 VP1基因 氨基酸位点
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Analysis of the binding sites with NL-101 to amino acids and peptides by HPLC/MS/MS 被引量:4
8
作者 Lingzi Dai Nian Guo +3 位作者 Yaqin Liu Shanshan Shen Qiufu Ge Yuanjiang Pan 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期103-106,共4页
The binding between NL-101, a novel nitrogen mustard anti-cancer drug, with amino acids and peptides has been investigated by high performance liquid chromatography electrospray tandem mass spectrometry(HPLC/ESI-MS/MS... The binding between NL-101, a novel nitrogen mustard anti-cancer drug, with amino acids and peptides has been investigated by high performance liquid chromatography electrospray tandem mass spectrometry(HPLC/ESI-MS/MS). This study offers supporting data of the interaction among drug and amino acids and peptides, which could potentially explain the cytotoxic and mutagenic effects of the drug. Collision-induced dissociation(CID) experiment demonstrated that under the same collision energy, the amino group combined with NL-101 adducts are sensitive and often produce more fragment ions; the carboxyl group combined with NL-101 adducts are hard to break and display fewer fragment ions. In addition, when other group(like sulfhydryl group) of amino acids binds to NL-101, CID spectra show different fragmentation pattern. These differences could display structural information about the drug adducts and be utilized as location of the authentic binding sites. 展开更多
关键词 High-performance liquid chromatography/ tandem mass SPECTROMETRY NL-101 amino acidS PEPTIDES Binding sites
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云南中缅边境登革1型病毒全基因组序列特征研究 被引量:12
9
作者 胡挺松 张海林 +7 位作者 刘永华 徐松淼 李华昌 邓波 尹小雄 黄瑛 张富强 范泉水 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期473-480,共8页
目的阐明云南省中缅边境地区2013-2015年14株登革1型病毒(DENV-1)全基因组序列特征。方法采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-1的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物信息学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列... 目的阐明云南省中缅边境地区2013-2015年14株登革1型病毒(DENV-1)全基因组序列特征。方法采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-1的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物信息学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列同源性及系统进化分析。结果从登革热患者血清中分离到14株DENV-1,其中瑞丽市9株,临沧市3株,昆明市2株。经RT-PCR和序列测定,获得这14株DENV-1的全基因组序列(10 735nt),其开放读码框(95-10 271)编码3 392个氨基酸。系统进化和同源性分析表明,13株为基因I型(G-I),其中瑞丽和临沧本地病例7株,缅甸输入性病例6株;1株为G-III(昆明的印度输入性病例)。云南13株G-I可分为2个进化群,但均与缅甸、泰国等东南亚流行株具有较近的亲缘关系。云南13株G-I的E基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.02%-100%和98.78%-100%,它们与6株东南亚G-I参考株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.53%-99.53%和97.33%-100%,与DENV-1原型株US_Hawaii核苷酸和氨基酸同源性分别为93.76%-94.45%和95.86%-96.91%。所有云南株和东南亚参考株与US_Hawaii株在结构蛋白或非结构蛋白的氨基酸位点分别存在44和150个位点差异。结论云南中缅边境地区2013-2015年流行的DENV-1均为G-I,并具有基因多样性特点但均为来自缅甸的多个传播来源。 展开更多
关键词 登革1型病毒 全基因组 系统进化分析 同源性分析 氨基酸位点分析
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云南省登革4型病毒全基因组序列特征研究 被引量:5
10
作者 胡挺松 张海林 +6 位作者 刘永华 邓波 尹小雄 徐松淼 李萍 范泉水 张富强 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期859-867,881,共10页
目的阐明云南省2015年5株登革4型病毒(DENV-4)流行株的全基因组序列特征及分子流行病学特点。方法采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-4的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物信息学软件进行核苷酸和推导氨... 目的阐明云南省2015年5株登革4型病毒(DENV-4)流行株的全基因组序列特征及分子流行病学特点。方法采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-4的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物信息学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列同源性及系统进化分析。结果从2015年云南省瑞丽市登革热患者血清中分离到5株DENV-4(本地病例2株,来自缅甸腊戍和南坎市输入性病例3株)。经RT-PCR和序列测定,获得这5株DENV-4的全基因组序列(10 661nt),其开放读码框(103-10 264)编码3 386个氨基酸。全基因组或结构蛋白和非结构蛋白基因序列的系统进化和同源性分析表明,云南分离株间高度同源并聚集为一个进化支,并与泰国不同年代DENV-4基因I型(G-I)流行株具有较近的进化关系和较高的同源性,同属G-I。云南株和泰国株均与同基因型的DENV-4原型株(H241,1956年菲律宾)和中国广州1990年B5株亲缘性和同源性都较低。云南株与H241株在结构蛋白或非结构蛋白中分别存在21和45个氨基酸位点差异。结论首次获得云南省DENV-4分离株的全基因组序列并发现它们与近期东南亚DENV-4G-I流行株亲缘关系较近。首次证实云南省存在DENV-4本地流行,传播来源为相邻缅甸北部边境地区。云南分离株某些氨基酸位点的改变是否与其抗原性和毒力有关尚需进一步研究。 展开更多
关键词 登革4型病毒 全基因组 系统进化分析 同源性分析 氨基酸位点分析
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H9N2亚型猪流感病毒山东分离株的分离鉴定及其HA、NP、NS基因序列分析 被引量:15
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作者 许传田 赵宏坤 范伟兴 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期528-530,共3页
从山东地区疑似流感发病猪分离到 10株流感病毒 ,经国家流感中心鉴定均为 A型流感病毒 H9N2亚型。将其中 1株 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )的血凝素基因 (HA)、核蛋白基因 (NP)和非结构蛋白基因 (NS)进行克隆与测序 ,与Gen Bank收录的其... 从山东地区疑似流感发病猪分离到 10株流感病毒 ,经国家流感中心鉴定均为 A型流感病毒 H9N2亚型。将其中 1株 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )的血凝素基因 (HA)、核蛋白基因 (NP)和非结构蛋白基因 (NS)进行克隆与测序 ,与Gen Bank收录的其他猪流感和禽流感 H9N2亚型的相关基因进行比较 ,推测 Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3(H9N2 )可能源于禽流感病毒 H9N2亚型和 H5 N1亚型的重组病毒 ;Sw/ SD/ 1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点与其他 H9N2亚型不同 ,Sw/ SD/1/ 2 0 0 3的 HA氨基酸裂解位点是 R- S- L- R- G,而其他猪流感和禽流感 H9N2亚型都是 R- S- S- R- G。 展开更多
关键词 H9N2亚型 流感病毒 山东分离株 分离鉴定 HA NP NS基因 序列分析
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抗氧化肽的构效关系研究进展 被引量:54
12
作者 张晖 唐文婷 +2 位作者 王立 钱海峰 齐希光 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期673-679,共7页
综述了不同来源抗氧化肽的氨基酸组成、序列、可能的活性位点和抗氧化机制,以及目前主要的抗氧化肽构效关系研究方法。
关键词 抗氧化肽 氨基酸组成 序列 活性位点 构效关系
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普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析 被引量:1
13
作者 梁成刚 陈晴晴 +3 位作者 石桃雄 陈其皎 孟子烨 陈庆富 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期90-96,共7页
【目的】比较普通荞麦Fagopyrum esculentum种内丝裂原活化蛋白激酶基因(MAPK)序列的差异,研究MAPK基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的9个栽培品种和3个落花落果野生种质为材料,PCR特异性扩增获得MAPK基因... 【目的】比较普通荞麦Fagopyrum esculentum种内丝裂原活化蛋白激酶基因(MAPK)序列的差异,研究MAPK基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的9个栽培品种和3个落花落果野生种质为材料,PCR特异性扩增获得MAPK基因的保守片段,对基因片段序列进行差异分析和蛋白结构预测。【结果】荞麦MAPK基因cDNA全长为2 835 bp,开放阅读框1 827 bp,编码609个氨基酸,含有TDY的三肽模块,为植物D组MAPK蛋白。PCR扩增获得12个供试材料的MAPK序列,其单型不变位点为723个,多态位点为70个。9个栽培品种间开放阅读框(ORF)区域无序列差异,3个野生种质间ORF区域也无序列差异。栽培品种与野生品种的ORF区域序列含有8个差异位点,编码3个差异氨基酸。其中,ORF区域第13位点组氨酸(H)→酪氨酸(Y)发生置换,导致1个α-螺旋构象发生变化。【结论】普通荞麦MAPK基因序列高度保守,栽培驯化对ORF区域第13位点差异氨基酸的选择具有高度一致性。 展开更多
关键词 普通荞麦 丝裂原活化蛋白激酶 序列分析 氨基酸位点 蛋白结构
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定点突变提高碱性果胶酶热稳定性 被引量:3
14
作者 刘松 汪明星 +1 位作者 堵国成 陈坚 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1-6,共6页
碱性果胶酶(PGL,E.C.4.2.2.2)是一种重要的工业酶,在碱性条件下催化聚半乳糖醛酸的α-1,4糖苷键裂解,广泛应用于食品、纺织和造纸等行业。为提高酶热稳定性,将Bacillus sp.WSHB04-02 PGL与3种耐热酶进行氨基酸序列比对,确定7个在耐热酶... 碱性果胶酶(PGL,E.C.4.2.2.2)是一种重要的工业酶,在碱性条件下催化聚半乳糖醛酸的α-1,4糖苷键裂解,广泛应用于食品、纺织和造纸等行业。为提高酶热稳定性,将Bacillus sp.WSHB04-02 PGL与3种耐热酶进行氨基酸序列比对,确定7个在耐热酶中保守但在PGL中不保守的位点(158、N189、G191、S229、K314、S315和I325)作为改造的目标位点,单独突变为耐热酶中的保守氨基酸。酶学性质分析显示,PGL突变体热稳定性均有提高。与野生酶相比,N189E、S229K和I325F的55℃半衰期分别提高2.32倍、2.11倍和1.89倍;I58V和K314M 55℃半衰期分别提高19.4%和38.9%,比酶活分别提高65%和91%。结构分析显示,除S315G外的PGL突变体的分子内的多种作用力数量均发生改变。上述结果表明,定点突变能有效提高PGL热稳定性,分子间作用力的变化可能是酶学性质变化的重要原因之一。 展开更多
关键词 碱性果胶酶 氨基酸序列比对 定点突变 热稳定性 作用力
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新城疫病毒阳性选择区域氨基酸与毒力相关性研究 被引量:1
15
作者 汪宏才 温国元 +6 位作者 张腾飞 卢琴 罗玲 张蓉蓉 王红琳 邵华斌 罗青平 《中国家禽》 北大核心 2018年第21期26-30,共5页
为研究新城疫病毒(NDV)不同蛋白在进化过程中是否受到阳性选择,以及阳性位点附近氨基酸与病毒毒力之间的联系,通过分子生物学方法,采用Codeml模式对23株NDV开展选择压力研究。结果在F蛋白检测出2个阳性选择位点(9I、20V),L蛋白检测出1... 为研究新城疫病毒(NDV)不同蛋白在进化过程中是否受到阳性选择,以及阳性位点附近氨基酸与病毒毒力之间的联系,通过分子生物学方法,采用Codeml模式对23株NDV开展选择压力研究。结果在F蛋白检测出2个阳性选择位点(9I、20V),L蛋白检测出1个阳性选择位点(1686S)。对正选择压力位点附近氨基酸进一步分析显示,F蛋白信号肽区第19位氨基酸与病毒毒力呈现一定的相关性,该位点为异亮氨酸(I)的毒株多为强毒株,而弱毒株以丙氨酸(A)和缬氨酸(V)为主。研究结果为NDV毒力的快速鉴定、疫苗株的抗原性筛选等提供了参考。 展开更多
关键词 新城疫病毒 阳性选择 氨基酸位点 病毒毒力
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A型猪流感病毒山东分离株鉴定及其HA基因序列分析 被引量:8
16
作者 许传田 范伟兴 赵宏坤 《中国病毒学》 CSCD 2004年第1期27-31,共5页
从山东各地疑似流感发病猪分离到10株流感病毒,经国家流感中心鉴定均为A型流感病毒H9N2亚型。将其中一株Sw/SD/1/2003(H9N2)的血凝素全基因(HA)进行克隆与测序,与GenBank收录的其它猪流感和禽流感H9N2亚型的HA基因进行比较,发现Sw/SD/1/... 从山东各地疑似流感发病猪分离到10株流感病毒,经国家流感中心鉴定均为A型流感病毒H9N2亚型。将其中一株Sw/SD/1/2003(H9N2)的血凝素全基因(HA)进行克隆与测序,与GenBank收录的其它猪流感和禽流感H9N2亚型的HA基因进行比较,发现Sw/SD/1/2003(H9N2)的血凝素基因在核苷酸序列方面同广西1999年分离的禽流感毒株Ck/GX/99(H9N2)和2000年云南分离的禽流感毒株Ck/YN/2000(H9N2)的同源性最高;进化树分析表明Sw/SD/1/2003(H9N2)起源于禽源的H9N2亚型流感病毒;Sw/SD/1/2003的HA氨基酸裂解位点与其他H9N2亚型不同,Sw/SD/1/2003的HA氨基酸裂解位点是R-S-L-R-G,而其它猪流感和禽流感H9N2亚型都是R-S-S-R-G。 展开更多
关键词 猪流感病毒 氨基酸裂解化点 HA基因 序列分析
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生淀粉糖化酶催化位点氨基酸及酶合成调控的初步研究 被引量:10
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作者 诸葛斌 姚惠源 诸葛健 《工业微生物》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期24-27,共4页
通过对Rhizopus OR-1UVN菌种所产生淀粉糖化酶在不同底物不同缓冲溶液条件下酶最适pH的测定,推测出该生淀粉糖化酶活力中心催化位点氨基酸是天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)。实验证明5~50mg/mL浓度葡萄糖对生淀粉糖化酶没有抑制作用。分... 通过对Rhizopus OR-1UVN菌种所产生淀粉糖化酶在不同底物不同缓冲溶液条件下酶最适pH的测定,推测出该生淀粉糖化酶活力中心催化位点氨基酸是天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)。实验证明5~50mg/mL浓度葡萄糖对生淀粉糖化酶没有抑制作用。分别以浓度<5mg/mL葡萄糖和淀粉为碳源的培养基进行不同碳源发酵实验,发现以淀粉为碳源的培养基Ⅰ发酵15h开始产生淀粉糖化酶,以葡萄糖为碳源的培养基Ⅱ发酵35h开始产酶(葡萄糖浓度<8mg/mL),而且前者菌体较后者少,由此可知葡萄糖对产酶有阻遏作用。实验还发现解阻遏熟淀粉糖化酶的葡萄糖浓度(15mg/mL)比生淀粉糖化酶的要高。由于葡萄糖的阻遏作用不发生在翻译水平,而发生在转录水平上,而且生淀粉糖化酶(G1)与熟淀粉糖化酶(G2)来自同一条DNA链,可以推测存在mRNA的拼接。通过以生淀粉为碳源的比较实验,发现生淀粉对生淀粉糖化酶形成的诱导作用可能主要是通过mRNA拼接的调节来实现的。 展开更多
关键词 菌种 生淀粉糖化酶 催化位点 氨基酸 酶合成 调控
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家蚕酪氨酸羟化酶的氨基酸序列分析和重组表达 被引量:1
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作者 刘春 周梦婷 +4 位作者 谭祥 吕金凤 李栋 聂红毅 夏庆友 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期467-473,共7页
酪氨酸羟化酶参与昆虫体色和斑纹黑色素合成以及免疫黑化反应等重要生理过程。为了研究家蚕(Bombyx mori)酪氨酸羟化酶的生物学功能,采用生物信息学方法对家蚕与其它物种的酪氨酸羟化酶氨基酸序列进行比对分析,结果显示不同物种之间的... 酪氨酸羟化酶参与昆虫体色和斑纹黑色素合成以及免疫黑化反应等重要生理过程。为了研究家蚕(Bombyx mori)酪氨酸羟化酶的生物学功能,采用生物信息学方法对家蚕与其它物种的酪氨酸羟化酶氨基酸序列进行比对分析,结果显示不同物种之间的酪氨酸羟化酶具有保守性,在昆虫物种之间尤其保守;家蚕酪氨酸羟化酶含有保守的功能位点,如铁原子结合位点His331、His336、Glu376,底物蝶呤结合位点Gly293、Leu294、Leu295、Phe300、Glu332、Tyr371和Glu376。构建重组质粒p29-Bmth,利用原核表达系统实现了家蚕酪氨酸羟化酶蛋白的重组表达,通过高效液相色谱分析证明纯化获得的重组家蚕酪氨酸羟化酶蛋白具有酪氨酸羟化活性,测定其活性为0.81 U,比活性为0.13 U/mg。研究结果为深入研究家蚕酪氨酸羟化酶的生理功能奠定了基础。 展开更多
关键词 家蚕 酪氨酸羟化酶 氨基酸序列 功能位点 原核表达 纯化 酶活性
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牛血清白蛋白与十二烷基硫酸钠作用的机理 被引量:6
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作者 宁爱民 孟磊 +2 位作者 赵仲麟 郑先福 宛新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第12期2639-2646,共8页
利用电动势法得到了牛血清白蛋白(BSA)与十二烷基硫酸钠(SDS)相互作用的结合等温线.通过四阶导数紫外光谱法和荧光光谱法研究了相互作用过程中芳香族氨基酸残基微环境极性的变化.通过研究发现,随着SDS浓度的逐渐增大,SDS在BSA上的平均... 利用电动势法得到了牛血清白蛋白(BSA)与十二烷基硫酸钠(SDS)相互作用的结合等温线.通过四阶导数紫外光谱法和荧光光谱法研究了相互作用过程中芳香族氨基酸残基微环境极性的变化.通过研究发现,随着SDS浓度的逐渐增大,SDS在BSA上的平均结合数(ν)逐渐增大,色氨酸(Trp)残基所处微环境的极性在减弱后保持基本不变,酪氨酸残基所处微环境的极性在明显增强后稍有减弱,苯丙氨酸残基所处微环境的极性略有增强.结果表明,当ν由0增大到14时,SDS主要结合在BSA的Trp-213附近并逐渐形成聚集体,从而诱导BSA由结构域IIA开始逐渐展开.此后,SDS呈正协同作用的特点与BSA结合,ν急剧增大.当ν约为302时,SDS在BSA上的结合基本达到饱和,BSA的构象趋于稳定. 展开更多
关键词 电动势 四阶导数紫外光谱 荧光光谱 芳香族氨基酸残基 微环境 极性 结合位点
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引入中性氨基酸对木聚糖酶XynZF-2热稳定性的影响 被引量:3
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作者 陈亚文 周晨妍 +3 位作者 谢晶晶 索婧琪 魏阳阳 李同彪 《中国酿造》 CAS 北大核心 2015年第10期27-31,共5页
通过对黑曲霉(Aspergillus niger) XZ-3S木聚糖酶XynZF-2进行生物信息学分析,在N-端区域引入半胱氨酸,定点突变E27C,构建突变基因xyn-E27C,并在大肠杆菌BL21 (DE3)中表达.酶学性质分析发现,突变酶Xyn-E27C的最适温度为45℃,与原酶Xy... 通过对黑曲霉(Aspergillus niger) XZ-3S木聚糖酶XynZF-2进行生物信息学分析,在N-端区域引入半胱氨酸,定点突变E27C,构建突变基因xyn-E27C,并在大肠杆菌BL21 (DE3)中表达.酶学性质分析发现,突变酶Xyn-E27C的最适温度为45℃,与原酶XynZF-2相比提高了5℃.在40℃条件下,突变酶Xyn-E27C的半衰期t1/2^40℃为100 min,相比原酶XynZF-2 (t1/2^45℃=55 min)提高了45 min.在45℃条件下,突变酶Xyn-E27C的半衰期t1/2^45℃为24 min,相比原酶XynZF-2(t1/2^45℃=7 min)提高了17 min;突变酶Xyn-E27C的最适pH值由5.0提高至5.5,而pH稳定范围均为5.0-9.0.因此,定点突变E27C对木聚糖酶XynZF-2的热稳定性以及最适pH值均有重要影响. 展开更多
关键词 木聚糖酶 热稳定性 定点突变 中性氨基酸
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