大熊猫等8种野生哺乳动物蛔虫的线粒体COXⅠ和COXⅡ基因的亲缘关系分析 被引量：2

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作者 牛李丽 陈世界 +9 位作者 汪涛 古小彬 严玉宝 余华 邓家波 严慧娟 余星明 陈维刚 王淑贤 杨光友 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1645-1650,共6页

为了探讨寄生于大熊猫、小熊猫、北极熊、棕熊东北亚种、棕熊西藏亚种、黑熊四川亚种、黑猩猩和白眉长臂猿体内蛔虫的分类地位,采用PCR技术扩增了这些野生动物体内寄生蛔虫的线粒体COXⅠ、COXⅡ基因序列,并与GenBank中注册的同源性序列... 为了探讨寄生于大熊猫、小熊猫、北极熊、棕熊东北亚种、棕熊西藏亚种、黑熊四川亚种、黑猩猩和白眉长臂猿体内蛔虫的分类地位,采用PCR技术扩增了这些野生动物体内寄生蛔虫的线粒体COXⅠ、COXⅡ基因序列,并与GenBank中注册的同源性序列进行了分析。序列分析结果显示:扩增的8种野生哺乳动物蛔虫的COXⅠ、COXⅡ基因长度均分别为393和582bp,其中大熊猫与小熊猫及4种熊科动物蛔虫COXⅠ和COXⅡ基因的相似性分别为94.8%～95.0%和94.9%～95.5%;黑猩猩和白眉长臂猿蛔虫的COXⅠ、COXⅡ基因的相似性分别为99.8%和99.5%。分子系统树(NJ/MP/ML)表明,寄生在大熊猫、小熊猫和4种熊科动物体内的蛔虫均为贝蛔属(Baylisascaris)蛔虫;而黑猩猩和白眉长臂猿体内寄生的蛔虫应为蛔属(Ascaris)蛔虫。同时,分析结果也揭示了蛔虫与宿主之间存在协同进化关系。 展开更多

关键词 大熊猫 野生哺乳动物 蛔虫 线粒体 coxⅰ coxⅡ 亲缘关系

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基于COXⅠ及ITS基因粪类圆线虫PCR鉴定方法的建立

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作者 芦亚君 邢维媚 夏乾峰 《实验与检验医学》 CAS 2021年第2期267-270,共4页

目的探讨以COXⅠ及ITS基因作为分子标记的PCR技术在粪类圆线虫病诊断中的应用。方法收集粪类圆线虫病患者的粪便作为检验物,离心沉淀法处理粪便,弃去粪渣,浓集、纯化粪便中的粪类圆线虫虫体,光学显微镜下观察虫体做形态学初判。PCR扩增... 目的探讨以COXⅠ及ITS基因作为分子标记的PCR技术在粪类圆线虫病诊断中的应用。方法收集粪类圆线虫病患者的粪便作为检验物,离心沉淀法处理粪便,弃去粪渣,浓集、纯化粪便中的粪类圆线虫虫体,光学显微镜下观察虫体做形态学初判。PCR扩增COXⅠ及ITS基因,1%琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段。结果琼脂糖凝胶电泳紫外成像显示,COXⅠ和ITS基因目的条带单一、清晰,大小分别约为1500bp和900bp。COXⅠ基因的退火温度为48℃、ITS退火温度为50℃时有清晰的特异性条带。COX I基因条带与Genebank中其他线虫COX I基因片段大小一致,可作为粪类圆线虫虫种鉴定的分子标记。而在Genebank中检索到不同线虫的ITS基因,分别含有18S、5.8S和28S的部分或完全序列,因此碱基长度变化较大,若以ITS鉴别虫种需进一步做Blast分析。结论基于COXⅠ及ITS基因的粪类圆线虫分子检验方法应用于临床上,可有效提高粪类圆线虫病诊断的特异性和敏感性。 展开更多

关键词 粪类圆线虫 coxⅰ基因 ITS基因

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香螺线粒体COXⅠ和CYTB基因遗传多样性研究 被引量：2

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作者 张旦旦 王煜 +6 位作者 李卓 田莹 王荦 毛俊霞 王许波 常亚青 郝振林 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期612-619,共8页

为探明香螺Neptunea cumingii遗传多样性水平及其种质资源背景,采用分子生物学技术对中国黄、渤海海域6个不同地理群体香螺COXⅠ和CYTB基因的遗传多样性进行比较分析。结果表明:COXⅠ基因序列长度为1536 bp,多态性位点141个,共定义COX... 为探明香螺Neptunea cumingii遗传多样性水平及其种质资源背景,采用分子生物学技术对中国黄、渤海海域6个不同地理群体香螺COXⅠ和CYTB基因的遗传多样性进行比较分析。结果表明:COXⅠ基因序列长度为1536 bp,多态性位点141个,共定义COXⅠ单倍型11个,大连市大连湾群体(DL)的单倍型COXⅠ-10变异位点数最多(115个),群体内遗传多样性分析显示,大连湾群体的平均核苷酸差异数(K)和遗传多样性指数(P i)最高,分别为31.133和0.02121,群体间比较结果显示,烟台市八角港群体(YT)与蓬莱市长岛群体(PL)间的K值最低(2.094),大连湾群体与大连市旅顺盐场群体(LS)间的K值最高(24.971);CYTB基因序列全长为1140 bp,多态性位点34个,共定义单倍型14种,群体内遗传多样性分析显示,大连市獐子岛群体(ZZ)和大连市旅顺盐场群体的K和P i值最高,分别为13.444和0.01236,群体间比较结果显示,烟台市八角港群体与蓬莱市长岛群体间K值最低(1.395),大连湾群体与旅顺盐场群体间的K值最高(11.497);聚类分析结果显示,6个不同群体香螺的线粒体COXⅠ和CYTB基因有显著性差异,分子方差分析(AMOVA)显示,群体内变异远大于群体间差异。研究表明,不同海域香螺未出现明显的群体间差异,且群体内变异远大于群体间差异,不同海域间香螺未达到亚种分化。 展开更多

关键词 香螺 coxⅰ基因 CYTB基因 遗传多样性

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捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因序列测定及进化分析 被引量：4

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作者 白鹏霞 郝宝成 +1 位作者 陈长江 项海涛 《中兽医医药杂志》 2016年第5期13-16,共4页

为了对捻转血矛线虫进行分子鉴定,并且探寻其与毛圆科内不同属线虫存在差异的分子水平关联性,对采自牦牛体内的捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因部分序列进行扩增与进化分析,扩增出的序列登录到GenBank,登录号：KU314701。进化分析结果显示... 为了对捻转血矛线虫进行分子鉴定,并且探寻其与毛圆科内不同属线虫存在差异的分子水平关联性,对采自牦牛体内的捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因部分序列进行扩增与进化分析,扩增出的序列登录到GenBank,登录号：KU314701。进化分析结果显示,捻转血矛线虫H-yak线粒体COXⅠ基因与毛圆科不同属线虫的线粒体COXⅠ基因同源性在85.5%～97.4%之间,其中与KJ724363.1的同源性最高,达到97.4%;其编码的蛋白氨基酸序列与血矛属线虫的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ蛋白的氨基酸序列完全相同,同源性为100%,且与长刺属线虫的同源性极高,同为100%,但与古柏属和奥斯特属的线虫蛋白同源性均为98.7%。该研究在基因和蛋白两个层面间接印证了毛圆科内不同属线虫在形态和生活史方面有较多相似和不同之处。 展开更多

关键词 捻转血矛线虫 线粒体 coxⅰ基因 序列测定 进化分析

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中国近海铜藻ITS与coxⅠ序列相似性分析 被引量：5

5

作者 吕芳 郭文 +3 位作者 丁刚 刘玮 詹冬梅 吴海一 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2018年第6期141-146,共6页

本研究分别对2016和2017年中国近海10个铜藻(Sargassumhorneri)漂浮地理种群以及3个定生种群的51个采集样本进行了ITS和coxⅠ序列分析及相似性比对。结果显示,51个样本的coxⅠ序列完全一致,ITS序列存在2个变异位点,按基因型的异同可分为... 本研究分别对2016和2017年中国近海10个铜藻(Sargassumhorneri)漂浮地理种群以及3个定生种群的51个采集样本进行了ITS和coxⅠ序列分析及相似性比对。结果显示,51个样本的coxⅠ序列完全一致,ITS序列存在2个变异位点,按基因型的异同可分为4个类型,其中大连龙王塘、烟台大钦岛和南隍城岛的漂浮铜藻基因型相同,青岛金沙滩漂浮型、烟台大钦岛和大连獐子岛的定生铜藻基因型相同,威海俚岛和温州洞头的漂浮铜藻基因型相同,青岛雕塑园、王哥庄、大珠山、威海乳山的漂浮型和枸杞岛定生铜藻基因型相同,而同一种群内部即便是不同年份的个体间基因型并没有差异。基于ITS序列构建的系统树显示,来自中国的所有铜藻样本聚为一支,与来自韩国的铜藻样本有一定的遗传距离。以上结果说明,我国近海漂浮和定生铜藻的不同地理株间ITS和coxⅠ的遗传变异水平较低,漂浮铜藻可能具有不同的来源,为进一步探明中国近海海域铜藻的分子遗传背景提供依据。 展开更多

关键词 铜藻 漂浮 定生 ITS coxⅰ 序列相似性

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云南兰坪地区带绦虫mtCOXⅠ片段测定分析

6

作者 张辉 林春榕 +1 位作者 钟国梁 杨毅梅 《中国热带医学》 CAS 2009年第8期1404-1405,共2页

目的对云南兰坪地区带绦虫种类进行鉴定。方法选取成虫样本,进行基因组抽提,扩增线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(mtCOXⅠ)部分基因片段,序列测定后,用生物学软件DNA MAN进行同源性分析并构建系统发育树。结果LP1和LP4同源性达99.8%,LP1-4与BZ... 目的对云南兰坪地区带绦虫种类进行鉴定。方法选取成虫样本,进行基因组抽提,扩增线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(mtCOXⅠ)部分基因片段,序列测定后,用生物学软件DNA MAN进行同源性分析并构建系统发育树。结果LP1和LP4同源性达99.8%,LP1-4与BZ2-3的同源性均在95%以上,而与BZ1的同源性较远,低于88%。亚洲带绦虫与牛带绦虫较接近,远离猪带绦虫。结论云南兰坪地区带绦虫株与亚洲带绦虫标准株相似,同属于亚洲带绦虫。mtCOXⅠ片段可用于带绦虫分类鉴定。 展开更多

关键词 兰坪 带绦虫 coxⅰ 鉴定

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基于coxⅠ、ITS和rbcL基因序列的马尾藻系统进化分析 被引量：2

7

作者 姚丹丹 陈佐 +3 位作者 朱军 邹潇潇 穆丹 鲍时翔 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第4期1153-1162,共10页

本研究以海南省青葛港马尾藻属(Sargassum spp.)为研究对象,利用coxⅠ(细胞色素C氧化酶亚基I)、ITS(内转录间隔区)序列及rbcL(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基)3种DNA条形码分析马尾藻属遗传进化关系。结果表明,(1)基于形态鉴定及... 本研究以海南省青葛港马尾藻属(Sargassum spp.)为研究对象,利用coxⅠ(细胞色素C氧化酶亚基I)、ITS(内转录间隔区)序列及rbcL(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基)3种DNA条形码分析马尾藻属遗传进化关系。结果表明,(1)基于形态鉴定及利用coxⅠ、ITS和rbcL三种DNA条形码进行分子鉴定的方式鉴定出9种海南省青葛港常见马尾藻属物种;(2)利用rbc L基因扩增出DNA序列的GC含量最低(32%),ITS基因扩增的DNA序列GC含量最高(59%),且在不同样本间ITS扩增的DNA序列GC含量差异最大,在57%~59%之间;(3)coxⅠ条形码序列可聚为两类,其中6个几乎不存在遗传距离,且5个样本间的遗传距离均小于50;从rbcL条形码序列的聚类结果看来,除了RQL3之外,其他样品聚为一类,6个样本间的遗传距离均小于50。ITS条形码序列聚类的结果显示,9种马尾藻样本可聚为两类,马尾藻样本之间均存在一定的遗传距离。研究认为,青葛港海域马尾藻种内变异丰富,同一属的样品表现出很好的属内种间多样性;在分析青葛港马尾藻的遗传进化时利用ITS基因比其他两种基因能发现更多的遗传变异,能有效分析马尾藻的遗传进化关系。该研究结果对研究马尾藻种群生长和遗传进化具有重要现实意义,可为人工培育优异马尾藻属及其选育打下基础。 展开更多

关键词 马尾藻(Sargassum) 遗传进化 coxⅰ ITS RBCL

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COX Ⅰ和COX Ⅲ在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

8

作者 王行宏 房修椢 《中国继续医学教育》 2015年第6期184-184,共1页

目的：统计结直肠癌中COXⅠ和COX Ⅲ的表达情况，分析COXⅠ和COX Ⅲ表达意义。方法随机选取2009年3月份～2013年12月份我院外科手术治疗的60例结直肠癌病患者为实验对象，术中留取结直肠癌组织60例，正常结直肠粘膜58例，应用免疫组化... 目的：统计结直肠癌中COXⅠ和COX Ⅲ的表达情况，分析COXⅠ和COX Ⅲ表达意义。方法随机选取2009年3月份～2013年12月份我院外科手术治疗的60例结直肠癌病患者为实验对象，术中留取结直肠癌组织60例，正常结直肠粘膜58例，应用免疫组化法对两种组织中COXⅠ和COX Ⅲ的表达情况进行检测分析。结果正常结直肠黏膜中 COXⅠ和COXⅢ阳性表达率（73.33%和68.33%）显著高于结直肠癌组织（29.31和24.48%）。结论 COXⅠ和COX Ⅲ在结直肠癌组织呈低表达，其有望成为评估预后的早期预测指标。 展开更多

关键词 结直肠癌 coxⅰ cox Ⅲ

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大熊猫细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的克隆及生物信息学分析

9

作者 凌珊珊 王平峰 +4 位作者 黄晓宇 黄炎 屈元元 叶刚 杨福兴 《四川畜牧兽医》 2023年第1期24-26,共3页

细胞色素氧化酶(COX)作为一种线粒体呼吸链中的限速酶,在物种进化和能量代谢的研究中具有重要价值。本研究利用基因克隆技术及生物信息学方法开展了COX Ⅰ的核苷酸序列和氨基酸序列比对,系统发育分析,亲、疏水性分析及蛋白质结构预测等... 细胞色素氧化酶(COX)作为一种线粒体呼吸链中的限速酶,在物种进化和能量代谢的研究中具有重要价值。本研究利用基因克隆技术及生物信息学方法开展了COX Ⅰ的核苷酸序列和氨基酸序列比对,系统发育分析,亲、疏水性分析及蛋白质结构预测等。结果显示:大熊猫COX Ⅰ基因编码的蛋白由514个氨基酸组成,等电点为6.22,分子质量为56.9 ku;COX Ⅰ蛋白是疏水性蛋白质,氨基酸含量最高的是亮氨酸;二级结构预测结果显示COX Ⅰ蛋白以无规则卷曲为主。本研究结果为进一步开展大熊猫进化及COX Ⅰ的功能研究提供了参考。 展开更多

关键词 大熊猫 coxⅰ 生物信息学 能量代谢

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基于COX I基因的太平洋西岸文昌鱼地理种群分析 被引量：5

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作者 李伟业 钟婧 王义权 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期375-380,共6页

文昌鱼是进化发育研究的重要模式动物,目前实验材料均采自野外。因此,对其进行正确的物种鉴定和地理种群的遗传分化分析十分必要。该研究扩增并测定了COXⅠ基因部分序列,结合NCBI数据库中的COXΙ序列信息,对太平洋西岸文昌鱼的种类和地... 文昌鱼是进化发育研究的重要模式动物,目前实验材料均采自野外。因此,对其进行正确的物种鉴定和地理种群的遗传分化分析十分必要。该研究扩增并测定了COXⅠ基因部分序列,结合NCBI数据库中的COXΙ序列信息,对太平洋西岸文昌鱼的种类和地理种群分化情况进行了分析。结果表明,马来文昌鱼(Branchiostoma malayanum)、白氏文昌鱼(B.belcheri)和日本文昌鱼(B.japonicum)这3个种之间的遗传差异很大,再次证实3个物种的有效性,同时提出应当审慎对待NCBI数据库中文昌鱼的种名标注;太平洋西岸文昌鱼属Branchiostoma的3种文昌鱼群体遗传多样性均处于较高水平,同一物种的不同地理种群间没有出现明显的遗传分化,反映了海洋动物的基因交流较容易,不同海域隔离较弱。 展开更多

关键词 文昌鱼 coxⅰ基因 地理种群 物种

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黑熊蛔虫线粒体cox1基因序列进化分析研究

11

作者 邱启官 张浪 +3 位作者 武娜 吴希有 严霞晖 宋平 《兽医导刊》 2020年第6期209-210,221,共3页

本研究主要针对采自长沙生态动物园和长沙市天心区希有动物驯养中心的4个黑熊蛔虫样本进行线粒体DNA中细胞色素Ⅰ(cox1)基因序列通过PCR方法扩增,利用DNA分析软件DNASTar 5.0将测得的序列分别与GenBank中登录的蛔虫序列和本地其他野生... 本研究主要针对采自长沙生态动物园和长沙市天心区希有动物驯养中心的4个黑熊蛔虫样本进行线粒体DNA中细胞色素Ⅰ(cox1)基因序列通过PCR方法扩增,利用DNA分析软件DNASTar 5.0将测得的序列分别与GenBank中登录的蛔虫序列和本地其他野生动物蛔虫序列,进行比较分析。结果显示:来自长沙生态动物园和长沙市天心区希有动物驯养中心的蛔虫cox1基本一致,长度约为400~414 bp;与采自荷兰株登录号KC543477.1贝氏蛔虫同源性最高达96.3~97.5%;4个黑熊蛔虫样本与KC543477.1贝氏蛔虫在同一分枝上。结果表明:采自长沙生态动物和长沙市天心区希有动物驯养中心黑熊蛔虫与熊贝氏蛔虫同源性最大,为熊贝氏蛔虫;pcox1序列在本研究中表现种间差异大,种内相对保守,说明cox1基因可以作为熊贝氏蛔虫和狮弓蛔虫的分子分类学及种群遗传关系研究的分子遗传标记。 展开更多

关键词 黑熊 贝氏蛔虫 细胞色素ⅰ(cox1) 基因序列分析

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建立一种快速鉴定大西洋鳕鱼及其制品的SYBR Green荧光PCR方法 被引量：10

12

作者 孙晓飞 蒋丹 +2 位作者 万超 刘淑艳 吴斌 《东北师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期127-130,共4页

通过大西洋鳕鱼CoxI序列的比对分析,在序列的差异处设计了大西洋鳕鱼的特异性引物,建立了一种大西洋鳕鱼SYBR Green荧光PCR定性检测方法,并进行了引物特异性和灵敏度分析.结果表明:检测的大西洋鳕鱼样品和49份其他动、植物样品DNA中,只... 通过大西洋鳕鱼CoxI序列的比对分析,在序列的差异处设计了大西洋鳕鱼的特异性引物,建立了一种大西洋鳕鱼SYBR Green荧光PCR定性检测方法,并进行了引物特异性和灵敏度分析.结果表明:检测的大西洋鳕鱼样品和49份其他动、植物样品DNA中,只有大西洋鳕鱼样本出现显著扩增,6次平行反应的Ct值为23.216±0.113,5份大西洋鳕鱼同属鳕鱼样品和44种常见其他动、植样品均无明显扩增曲线.模拟样品灵敏度检测实验显示,该特异性引物可用于检测质量分数为0.01%的大西洋鳕鱼肉粉,灵敏度可达0.06ng/μL.通过对市售鳕鱼片检测的验证,该方法特异性强,灵敏度高,可用于食品中大西洋鳕鱼成分真实性的鉴别. 展开更多

关键词 大西洋鳕鱼成分 SYBR Green荧光PCR coxⅰ

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云南部分地区牛羊体表寄生蜱的形态及分子鉴定

13

作者 陈俊蓉 徐翠蓉 +3 位作者 谢昕言 邹丰才 贺君君 杨建发 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第10期56-60,共5页

为了解云南部分地区牛羊体表寄生蜱的种类,对云南6个地区采集的445只蜱的形态进行观察,并采用PCR技术对虫体的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(coxⅠ)基因序列进行扩增,于NCBI-BLAST在线比对有效序列,利用MEGA 6.0软件构建系统进化树。结果显示:... 为了解云南部分地区牛羊体表寄生蜱的种类,对云南6个地区采集的445只蜱的形态进行观察,并采用PCR技术对虫体的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(coxⅠ)基因序列进行扩增,于NCBI-BLAST在线比对有效序列,利用MEGA 6.0软件构建系统进化树。结果显示:经形态学特征初步鉴定,采集的蜱属为扇头蜱属(Rhipicephalus)。coxⅠ基因序列比对分析显示,研究中所获分离株与微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus)同源性达100%,系统进化分析显示分离株与微小扇头蜱处于同一分支。本研究可为云南牛羊体表寄生蜱的种类鉴定和防治提供参考。 展开更多

关键词 细胞色素C氧化酶亚基ⅰ 微小扇头蜱 云南 牛 羊 种属鉴定

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菲律宾蛤仔及其制品的Taqman荧光PCR鉴定方法

14

作者 刘淑艳 万超 +2 位作者 尹祺 杨宇 蒋丹 《食品安全质量检测学报》 CAS 2017年第9期3461-3465,共5页

目的建立菲律宾蛤仔成分Taqman荧光PCR定性检测方法。方法根据菲律宾蛤仔线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守基因序列设计一对菲律宾蛤仔特异性引物,通过Taqman荧光PCR法进行PCR扩增反应,对菲律宾蛤仔成分进行特异性检测。结果该方... 目的建立菲律宾蛤仔成分Taqman荧光PCR定性检测方法。方法根据菲律宾蛤仔线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守基因序列设计一对菲律宾蛤仔特异性引物,通过Taqman荧光PCR法进行PCR扩增反应,对菲律宾蛤仔成分进行特异性检测。结果该方法的引物对于菲律宾蛤仔成分的特异性良好;菲律宾蛤仔DNA检出限为0.04 ng/μL,可达菲律宾蛤仔肉粉质量分数的0.001%。通过对市售菲律宾蛤仔制品的检测,该方法可检测出制品中的菲律宾蛤仔成分。结论该检测方法特异性强,灵敏度高,能够用于食品中菲律宾蛤仔成分的真实性鉴别。 展开更多

关键词 菲律宾蛤仔成分 Taqman荧光PCR coxⅰ

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基于线粒体COX Ⅰ基因犬复孔绦虫的分子鉴定及功能分析 被引量：2

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作者 张彩虹 殷慧敏 +3 位作者 杨丽侨 邢维媚 张锐 芦亚君 《疾病预防控制通报》 2018年第4期14-18,共5页

目的探讨从犬复孔绦虫的固定标本和新鲜虫体中扩增保守序列线粒体COXⅠ鉴定虫种并分析功能。方法从犬小肠内获取犬复孔绦虫成虫节片提取DNA,PCR扩增线粒体COXⅠ,进行电泳鉴定并测序;用BLAST比对序列、构建进化树并预测生物信息学功能。... 目的探讨从犬复孔绦虫的固定标本和新鲜虫体中扩增保守序列线粒体COXⅠ鉴定虫种并分析功能。方法从犬小肠内获取犬复孔绦虫成虫节片提取DNA,PCR扩增线粒体COXⅠ,进行电泳鉴定并测序;用BLAST比对序列、构建进化树并预测生物信息学功能。结果固定标本和新鲜标本中DNA扩增产物电泳后均显示特异性明显的条带,测序显示COXⅠ基因总长为415 bp,其编码的蛋白为疏水性蛋白,具有3个典型的跨膜螺旋,7个B细胞抗原表位。结论虫体经70%乙醇固定处理后,不影响犬复孔绦虫的基因组提取和COXⅠ序列扩增,且线粒体COXⅠ适合作为犬复孔绦虫虫种鉴别的分子标记。 展开更多

关键词 犬复孔绦虫 线粒体coxⅰ 分子鉴定 固定标本

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太平洋无须鳕鱼及其制品的PCR鉴定 被引量：6

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作者 万超 蒋丹 +2 位作者 吕泉 丁健 林长军 《食品安全质量检测学报》 CAS 2017年第1期71-75,共5页

目的建立一种SYBR Green荧光PCR法定性检测太平洋无须鳕鱼成分的分析SYBR Green荧光PCR定性检测方法。方法根据太平洋无须鳕鱼线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守基因序列设计一对太平洋无须鳕鱼特异性引物,通过SYBR Green荧光PCR... 目的建立一种SYBR Green荧光PCR法定性检测太平洋无须鳕鱼成分的分析SYBR Green荧光PCR定性检测方法。方法根据太平洋无须鳕鱼线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守基因序列设计一对太平洋无须鳕鱼特异性引物,通过SYBR Green荧光PCR法进行PCR扩增反应,可对DNA提取试剂盒提取的太平洋无须鳕鱼成分DNA进行特异性检测。结果该SYBR Green荧光PCR定性检测方法的引物对于太平洋无须鳕鱼成分的检测特异性良好;方法的灵敏度分别为0.06 ng/μL太平洋无须鳕鱼DNA和质量分数为0.01%太平洋无须鳕鱼肉粉。通过对市售太平洋无须鳕鱼片、太平洋鳕鱼片和太平洋无须鳕鱼肝油的检测,该方法可检测出鱼片中的太平洋无须鳕成分。结论该检测方法特异性强,灵敏度高,能够用于食品中太平洋无须鳕鱼成分的真实性鉴别。 展开更多

关键词 太平洋无须鳕鱼成分 SYBR Green荧光PCR 线粒体细胞色素氧化酶

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TaqMan荧光PCR法快速检测太平洋鳕鱼源性成分 被引量：3

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作者 万超 王雷 +1 位作者 王贵滨 杨宇 《食品安全质量检测学报》 CAS 2019年第7期2012-2015,共4页

目的建立TaqMan荧光PCR法检测太平洋鳕鱼源性成分的方法。方法以太平洋鳕鱼线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ检测靶标,设计特异性引物和探针,进行特异性和灵敏度试验,并对市售样品进行检测。结果该方法引物探针特异性和灵敏度较好,可以良好区... 目的建立TaqMan荧光PCR法检测太平洋鳕鱼源性成分的方法。方法以太平洋鳕鱼线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ检测靶标,设计特异性引物和探针,进行特异性和灵敏度试验,并对市售样品进行检测。结果该方法引物探针特异性和灵敏度较好,可以良好区分近属鳕鱼和其他科鱼类,灵敏度达到0.04 ng/μL。市售样品中, 90.9%太平洋鳕鱼切片及71.4%太平洋鳕鱼罐头中检出太平洋鳕鱼成分。结论该方法的特异性和灵敏度较好,适合用于大多数制品中太平洋鳕鱼成分的真实性甄别。 展开更多

关键词 coxⅰ 荧光PCR 太平洋鳕鱼

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南盘江破碎生境中子陵吻虾虎鱼的遗传多样性 被引量：2

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作者 丁雪梅 颜岳辉 +2 位作者 李强 罗旭 唐利洲 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期852-862,共11页

众多的水利设施和附属高原湖泊引起南盘江流域出现严重的生境破碎。以子陵吻虾虎鱼作为研究对象,探讨南盘江流域破碎化的生境对鱼类种群遗传多样性的影响。子陵吻虾虎鱼因经济价值低而未被人工驯化,可作为评估生境破碎化影响的理想物种... 众多的水利设施和附属高原湖泊引起南盘江流域出现严重的生境破碎。以子陵吻虾虎鱼作为研究对象,探讨南盘江流域破碎化的生境对鱼类种群遗传多样性的影响。子陵吻虾虎鱼因经济价值低而未被人工驯化,可作为评估生境破碎化影响的理想物种。以线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(COXⅠ)基因作为分子标记,对来自南盘江水系13个隔离种群子陵吻虾虎鱼的遗传多样性和遗传结构进行分析。在13个种群194尾子陵吻虾虎鱼的COXⅠ基因、Cyt b基因及联合线粒体基因中观察到了27、22、49个变异位点和11、13、26个单倍型,平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.691、0.813、0.881和0.0053、0.0060、0.0056。系统发育树结果均显示,子陵吻虾虎鱼的13个群体聚类为2个进化分支,但并未出现明显的地理聚类现象。分子方差分析结果表明,子陵吻虾虎鱼群体的遗传变异主要来自种群间。上述结果表明,南盘江破碎生境中的子陵吻虾虎鱼群体呈现出了较高的遗传多样性和显著的遗传分化。可能因较强的生存适应能力及稳定的有效种群大小,子陵吻虾虎鱼呈现出了较高的遗传多样性水平,同时又在较弱的迁移能力和破碎化生境的隔离效应的共同影响下,导致了子陵吻虾虎鱼种群间显著的遗传分化。 展开更多

关键词 子陵吻虾虎鱼 细胞色素B基因 细胞色素氧化酶ⅰ基因 遗传多样性 遗传结构

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玉米S组CMS胞质与正常胞质育性相关基因基于SSP-PCR的遗传多型性研究

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作者 李镭 郑用琏 张方东 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期681-686,共6页

利用 SSP- PCR技术对 S组 CMS与正常胞质线粒体胞质育性相关基因 cox ,cox 的 5′上游、 3′下游以及基因编码区与正常 N胞质进行了遗传多型性的比较研究。结果表明在所选用的 (特异引物 +随机引物 )的引物组合中 ,未能在 cox 基因的 ... 利用 SSP- PCR技术对 S组 CMS与正常胞质线粒体胞质育性相关基因 cox ,cox 的 5′上游、 3′下游以及基因编码区与正常 N胞质进行了遗传多型性的比较研究。结果表明在所选用的 (特异引物 +随机引物 )的引物组合中 ,未能在 cox 基因的 5′上游和 3′下游区发现变异 ,但其基因内含子中存在基于 SSP- PCR的遗传多型性。在 S组不育系的 cox 基因 5′上游调控区内 ,由于复杂的重组事件而导致翻译起始密码 ATG和富含 AT的核糖体结合区域的缺失。讨论了 SSP- PCR技术作为揭示和分析某一目的基因的遗传变异的有效性与准确性 ,以及 cox 基因在表达水平上的变异可能与玉米 展开更多

关键词 玉米 CMS cox SSP-PCR 遗传多型性

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建立一种快速鉴定欧鳇及其制品的SYBR Green荧光PCR方法 被引量：1

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作者 刘淑艳 孙晓飞 +3 位作者 万超 蒋丹 吴斌 林长军 《食品科技》 CAS 北大核心 2016年第11期259-261,共3页

根据欧鳇线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守序列设计欧鳇特异性引物,建立欧鳇成分SYBR Green荧光PCR定性检测方法。该方法的引物对于欧鳇成分的特异性良好,方法的灵敏度为0.04 ng/μL欧鳇DNA和质量分数0.01%欧鳇肉粉。通过对市售... 根据欧鳇线粒体细胞色素氧化酶CoxⅠ基因中的保守序列设计欧鳇特异性引物,建立欧鳇成分SYBR Green荧光PCR定性检测方法。该方法的引物对于欧鳇成分的特异性良好,方法的灵敏度为0.04 ng/μL欧鳇DNA和质量分数0.01%欧鳇肉粉。通过对市售鱼子酱检测,显示该方法可检测出鱼子酱中的欧鳇成分。结果表明,该检测方法特异性强、灵敏度高,能够用于食品中欧鳇源性成分的真实性鉴别。 展开更多

关键词 欧鳇成分 SYBR Green荧光 PCR coxⅰ

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