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Identification of suitable reference genes for quantitative gene expression analysis in clam Cyclina sinensis under salinity stress and Vibrio infection
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作者 Fengjuan JIANG Qingyao WANG +3 位作者 Jingjing DU Fu LÜ Qing NIE Weihong ZHAO 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期352-363,共12页
The appropriate reference gene is a prerequisite for accurate normalization of gene expression level,and research on suitable reference genes in clam Cyclina sinensis is scarce.To improve the situation,we selected fiv... The appropriate reference gene is a prerequisite for accurate normalization of gene expression level,and research on suitable reference genes in clam Cyclina sinensis is scarce.To improve the situation,we selected five commonly used housekeeping genes,including β-actin,Elongation factor 1-α(EF1-α),Glyceraldehyde-3-pho sphate dehydrogenase(GAPDH),40S ribosomal protein S18(RPS18),and Tubulin a(TUB-α),then evaluated their expression stability in different adult tissues and under different experimental treatments(salinity stress and Vibrio parahaemolyticus infection).Their expression stability was analyzed by three frequently used programs,geNorm,NormFinder,and BestKeeper.This analysis indicated that multiple genes should be used for normalization,and we concluded that the reference gene combination GAPDH-RPS18-β-actin,should be used for qRT-PCR analysis in different tissues of C.sinensis under normal physiological conditions.For the clams under salinity stress and Vibrio infection,EF1-α-GAPDHRPS18 was recommended as the gene combination for qRT-PCR normalization.TUB-αwas generally poorly ranked by all programs,and should not be used in future studies.This study should provide fundamental support for accurate quantitative gene expression analysis of this species. 展开更多
关键词 cyclina sinensis reference gene different tissues salinity stress Vibrio infection
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Effects of clam size, food type, sediment characteristic, and seawater carbonate chemistry on grazing capacity of Venus clam Cyclina sinensis (Gmelin, 1791) 被引量:2
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作者 林听听 周凯 +3 位作者 刘鑫 来琦芳 张东 施利燕 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2017年第5期1239-1247,共9页
Aquaculture in saline-alkaline water has a major problem: microalgal blooming causes the pH of water to increase dramatically, thereby causing damage to the reared organisms. To solve this problem, we set out to find... Aquaculture in saline-alkaline water has a major problem: microalgal blooming causes the pH of water to increase dramatically, thereby causing damage to the reared organisms. To solve this problem, we set out to find a candidate filter-feeding bivalve species suitable for saline-alkaline water to graze on microalgae and to control the pH. In the current study, we investigated the effect of carbonate alkalinity (CA, 2.5, 10.0, and 20.0 meq/L) and pH (8.0, 8.5, and 9.0) on the grazing capacity (GC) of the clam Cyclina sinensis. Additionally, the effect of clam size (small, medium, and large) and microalgae species (Nannochloropsis oculata, Chaetoceros miielleri, and lsochrysis galbana), and the effect of bottom sediment characteristic (mud, sandy mud, and muddy sand) and thickness (3 and 6 cm) were analyzed as well. The results show that the GC on L galbana was the highest and small size had the maximum GC/W (W: wet weight including body and shells). No significant differences were observed between sediment type and thickness. Regarding CA and pH, a significant decrease in GC by the pH or by their interaction was found. The GC ofC. sinensis was not greatly reduced in the treatments ofpH≤8.5 and CA≤20.0, and also not affected by bottom sediment type, indicating that this clam is capable to manage microalgal concentrations and might be a candidate species for pH reduction in saline-alkaline water ponds. 展开更多
关键词 Venus clam cyclina sinensis carbonate alkalinity pH grazing capacity saline-alkaline water
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不同月龄青蛤形态性状对活体质量的影响分析 被引量:14
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作者 张雷雷 滕爽爽 +2 位作者 李腾腾 邵艳卿 方军 《海洋科学》 CAS 北大核心 2019年第12期74-80,共7页
随机选取5月龄、10月龄、15月龄的青蛤(Cyclina sinensis)混合家系各220枚作为研究对象,通过测定其壳长(SL)、壳高(SH)、壳宽(SW)和活体质量(W),并采用相关性、通径和决定系数的统计分析探讨青蛤形态性状对活体质量的影响效力。结果表明... 随机选取5月龄、10月龄、15月龄的青蛤(Cyclina sinensis)混合家系各220枚作为研究对象,通过测定其壳长(SL)、壳高(SH)、壳宽(SW)和活体质量(W),并采用相关性、通径和决定系数的统计分析探讨青蛤形态性状对活体质量的影响效力。结果表明:各性状与活体质量间的相关性均达极显著水平(P<0.01),其中5月龄、10月龄和15月龄相关系数最大的均为壳高;通径分析结果显示,对不同月龄的活体质量的直接影响最大的均是壳高、其次壳宽、最后壳长;5月龄和15月龄的壳高和壳宽共同决定系数最大,分别为0.269和0.262,10月龄的壳高决定系数最大为0.338。利用逐步回归的方法分别建立5月龄、10月龄、15月龄青蛤活体质量的最优回归方程分别是:W5=0.564+0.061SH+0.051SW,R2=0.933;W10=2.585+0.040SL+0.149SH+0.101SW,R2=0.934;W15=7.359+0.123SL+0.210SH+0.273SW,R2=0.957。本研究结果可为青蛤高产新品系阶段选优和良种选育提供基础数据。 展开更多
关键词 青蛤(cyclina sinensis) 形态性状 活体质量 通径分析
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不同饵料对两种帘蛤科贝类生长性能的影响研究 被引量:2
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作者 冯森磊 梁夏菲 +3 位作者 徐晔 严维鑫 葛红星 董志国 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期47-54,共8页
为探讨不同饵料对青蛤(Cyclina sinensis)与文蛤(Meretrix meretrix)生长和存活的影响,本实验选用紫菜(Pyropia)、浒苔(Enteromorpha prolifera)、海带(Laminaria japonica)、小球藻(Chlorella vulgaris)和人工配合饲料5种饵料,采用单... 为探讨不同饵料对青蛤(Cyclina sinensis)与文蛤(Meretrix meretrix)生长和存活的影响,本实验选用紫菜(Pyropia)、浒苔(Enteromorpha prolifera)、海带(Laminaria japonica)、小球藻(Chlorella vulgaris)和人工配合饲料5种饵料,采用单一饵料投喂方式进行饲养。结果表明:小球藻组中特定生长率、存活率及饲料转换率与各饵料组均有显著性差异(P<0.05),青蛤的增质量率显著低于紫菜组、海带组及人工配合饲料组(P>0.05)。在人工配合饲料组中青蛤与文蛤的特定生长率与各饵料组均有显著性差异(P<0.05),青蛤的增质量率与各饵料组无显著性差异(P>0.05),文蛤的增质量率显著高于紫菜组、浒苔组及人工配合饲料组(P<0.05)。在3组大型藻中,海带组中青蛤的特定生长率为0.07%,增质量率为4.59%,饵料转换率为7.09%,存活率为74%;文蛤的特定生长率0.13%,增质量率为8.36%,饵料转换率为1.41%,存活率为55.6%。综上,小球藻和人工配合饲料有利于青蛤和文蛤的生长,在3组大型藻中,投喂海带有利于文蛤和青蛤的生长和存活。 展开更多
关键词 青蛤(cyclina sinensis) 文蛤(Meretrix meretrix) 大型海藻 生长性能 饵料转换率
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青蛤贝壳与内部组织间连接观察
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作者 王亦我 仉佳文 +7 位作者 刘玉 魏敏 张明月 吴雨晨 仇攀 宋杰 郑伟 董志国 《江苏海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第1期1-8,共8页
青蛤作为我国沿海地区的重要经济型贝类,具有广阔的养殖和消费市场。对青蛤个体进行解剖及形态观察,探究双壳贝类贝壳形态及贝壳与组织之间的作用方式。结果显示,在外部形态观察中,发现青蛤具有圆形且左右对称贝壳一对,通过铰合部及韧... 青蛤作为我国沿海地区的重要经济型贝类,具有广阔的养殖和消费市场。对青蛤个体进行解剖及形态观察,探究双壳贝类贝壳形态及贝壳与组织之间的作用方式。结果显示,在外部形态观察中,发现青蛤具有圆形且左右对称贝壳一对,通过铰合部及韧带连接,内有数目不等排列不一的异齿型绞合齿;在内部结构观察中,解剖软体部发现,内包含有外套膜、足及内脏团,其中外套膜在青蛤组织连接中起到承上启下的作用,并分化出闭壳肌;鳃与外套膜及内脏团直接连接在一起;内脏团顶部为斧足,受足收缩肌控制完成运动;外套膜和闭壳肌通过生物粘附机制完成了与贝壳的有机相—无机相连接,并在贝壳内面留有外套线、外套湾和闭壳肌痕等机体痕迹,达到在壳内固定软体部目的。通过详细探究青蛤的形态、组织间连接方式、组织与贝壳间的连接方式,认为外套膜在青蛤组织生长过程中起到了至关重要的作用。该研究可为双壳贝类形态及解剖学提供并补充可靠资料。 展开更多
关键词 青蛤(cyclina sinensis) 贝壳 形态特征 组织连接
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