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Expansin Genes Expressed Differentially in Peduncle Elongation of Near-Isogenic Wheat Rht Lines
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作者 WANG Jia-li LIU Dong-cheng +2 位作者 GUO Xiao-li YANG Wen-long ZHANG Ai-min 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第10期2091-2101,共11页
The introduction of reduced height (Rht) genes Rht-Blb and Rht-Dlb led to impressive increases in wheat (Triticum aestivum L.) yields during the Green Revolution. In the present study, the dynamic elongation of pe... The introduction of reduced height (Rht) genes Rht-Blb and Rht-Dlb led to impressive increases in wheat (Triticum aestivum L.) yields during the Green Revolution. In the present study, the dynamic elongation of peduncle in a set ofnear-isogenic lines (NILs) carrying different Rht alleles (Rht-Blb, Rht-Dlb, Rht-Blc, Rht-Dlb+Rht-Blb, and Rht-Dlb+Rht-Blc) were investigated. The reduction of the final length of peduncle in NILs was dependent mainly on the elongation rate, which was reduced by Rht genes, during rapid elongation phase. Resin sections showed that Rht genes strongly reduced the cell extension in peduncle. The expression of expansin genes, which mediate cell wall loosening and leading to cell expansion, were analysed by using real- time quantitative PCR (qPCR). Among the 23 possible wheat expansin genes, 17 were expressed in the peduncle. The spatial distribution of expression was further analysed for five expansins that showed high expression levels in the peduncles of Rht lines. Compared to wild type plants, the incorporation of Rht-Dlb allele decreased about 37 and 80% of the expression levels of ExpA 7 and ExpA3 in elongation zone, respectively. The presence Rht-Blc dwarfing genes, however, produced 53% reduction in the expression level of ExpA7, and seriously decreased about 70% of ExpB9 expression. Although the expression levels of five genes exhibited variability among the lines, an expansin gene, ExpB2, showed its expression level highly associated with the cell elongation rate in peduncle of different Rht lines. 展开更多
关键词 expansin peduncle gene expression dwarfing gene
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Cloning and expression analysis of a homologous expansin gene EXP2 in Picea wilsonii 被引量:1
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作者 Tong Zhang Yanfang Li +1 位作者 Yanni Zhou Lingyun Zhang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期247-255,共9页
Expansins are cell-wall-loosening proteins that have multiple roles during plant development and stress- related processes. In this study, a novel expansin gene PwEXP2 was cloned by rapid amplification of cDNA ends ba... Expansins are cell-wall-loosening proteins that have multiple roles during plant development and stress- related processes. In this study, a novel expansin gene PwEXP2 was cloned by rapid amplification of cDNA ends based on the cDNA library of Picea wilsonii and EST fragment of PwEXP2. It was found that PwEXP2 coded 253 amino acids, and putative signal peptides exist at the N-terminal, followed by 8 cysteines, a HFD (His-Phe-Asp) conserved domain, and 4 tryptophan residues at the C-terminal. PwEXP2 was located in cytoplasm and nucleus when transformed in an onion epidermal cell. Quantitative real-time PCR assays showed that PwEXP2 was expressed in various tissues with a relatively high level in needles and low level in mature pollen. The expression level of PwEXP2 dramatically increased after seed germination. Gene expression profiles in abiotic stresses showed that PwEXP2 was induced by high temperature and osmotic stress but not involved in ABA-dependent signaling path- way. These results display the important roles of the PwEXP2 in plant development and multiple adversity stresses. 展开更多
关键词 expansin Picea wilsonii Stress response gene expression
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苎麻expansin家族成员鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 石亚亮 钟意成 +4 位作者 黄坤勇 牛娟 孙志民 陈建华 栾明宝 《中国麻业科学》 2023年第4期145-151,共7页
苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究... 苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究首先在苎麻中苎1号基因组数据库挖掘到24个扩展蛋白基因家族成员,通过生物信息学方法对其分子量、等电点、信号肽、亚细胞定位、motif及基因结构进行分析和预测。系统进化树结果显示:扩展蛋白包括α亚族成员17个、β亚族4个、α类亚族1个和β类亚族2个,共分为3类;expansin家族同一进化支蛋白结构域比较保守且有一个特有的motif。然后,利用苎麻茎皮扩展蛋白基因家族成员转录组表达分析和qRT-PCR验证,发现两个基因在两个纤维细度差异显著的品种及其5个不同生长期表达量差异显著。该结果有助于了解苎麻expansin家族的进化,为影响苎麻纤维发育和纤维细度相关基因及其功能的研究奠定基础。 展开更多
关键词 苎麻 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
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Analysis of genes related to xylem cell wall development based on transcriptomics in Populus alba ‘Berolinensis’ tension wood
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作者 Lin Feng Youchao He +2 位作者 Xu Li Meiqi Zhou Chao Wang 《Journal of Forestry Research》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第6期328-343,共16页
Populus alba‘Berolinensis’is a fast-growing,high-yielding species with strong biotic and abiotic stress resistance,and widely planted for timber,shelter belts and aesthetic purposes.In this study,molecular developme... Populus alba‘Berolinensis’is a fast-growing,high-yielding species with strong biotic and abiotic stress resistance,and widely planted for timber,shelter belts and aesthetic purposes.In this study,molecular development is explored and the important genes regulating xylem forma-tion in P.alba‘Berolinensis’under artificial bending treat-ments was identified.Anatomical investigation indicated that tension wood(TW)was characterized by eccentric growth of xylem and was enriched in cellulose;the degree of ligni-fication was lower than for normal wood(NW)and oppo-site wood(OW).RNA-Seq-based transcriptome analysis was performed using developing xylem from three wood types(TW,OW and NW).A large number of differentially expressed genes(DEGs)were screened and 4889 counted.In GO and KEGG enrichment results,genes involved in plant hormone signal transduction,phenylpropanoid biosynthesis,and cell wall and secondary cell wall biogenesis play major roles in xylem development under artificial bending.Eight expansin(PalEXP)genes were identified from the RNA-seq data;four were differentially expressed during tension wood formation.Phylogenetic analysis indicated that PalEXLB1 belongs to the EXPB subfamily and that the other PalEXPs are members of the EXPA subfamily.A transcriptional regulatory network construction showed 10 transcription factors located in the first and second layers upstream of EXP,including WRKY,ERF and bHLH.RT‒qPCR analy-sis in leaves,stems and roots combined with transcriptome analysis suggests that PalEXPA2,PalEXPA4 and PalEXPA15 play significant regulatory roles in cell wall formation during tension wood development.The candidate genes involved in xylem cell wall development during tension wood formation marks an important step toward identifying the molecular regulatory mechanism of xylem development and wood property improvement in P.alba‘Berolinensis’. 展开更多
关键词 Populus alba‘Berolinensis’ Tension wood Differentially expressed genes expansin proteins
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Genome-wide analysis of expansins and their role in fruit spine development in cucumber(Cucumis sativus L.) 被引量:5
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作者 Xiaoping Liu Shaoyun Dong +5 位作者 Han Miao Kailiang Bo Caixia Li Yingying Yang Xingfang Gu Shengping Zhang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2022年第6期757-768,共12页
Cucumber is one of the most widely consumed vegetables worldwide,and the fruit spine is an important fruit quality trait.Expansins play critical roles in fruit development;however,the regulation of expansins in cucumb... Cucumber is one of the most widely consumed vegetables worldwide,and the fruit spine is an important fruit quality trait.Expansins play critical roles in fruit development;however,the regulation of expansins in cucumber fruit spine development has not been reported.In this study,33 expansin genes were identified in the cucumber genome V3;additionally,expansin genes in Citrullus lanatus,Cucumis melo,Cucurbita maxima,Lagenaria siceraria,and Benincasa hispida were also identified.Phylogenetic analysis of expansin proteins in Cucurbitaceae and Arabidopsis showed that they evolved separately in each plant species.Phylogenetic analysis showed that C.maxima was derived earlier than the other five Cucurbitaceae species.The expression of CsEXPA2,CsEXPA14,and CsEXLA3 varied in cucumber lines with different fruit spine densities.A yeast two-hybrid assay showed that a putative auxin transporter encoded by numerous spine gene(ns)interacts with CsEXLA2,which may be involved in the development of the numerous spines in cucumber.These results provide novel insights into the expansins related to plant development and fruit spine development in cucumber. 展开更多
关键词 CUCUMBER expansinS Phylogenetic analysis COLLINEARITY gene expression Fruit spine
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Effect of Ethylene on Polygalacturonase,Lipoxygenase and Expansin in Ripening of Tomato Fruits 被引量:2
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作者 薛照辉 寇晓虹 +2 位作者 罗云波 朱本忠 许文涛 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2009年第3期173-177,共5页
Fruit ripening is a complex process and is regulated by many factors. Ethylene and polygalacturonase (PG), lipoxygenase (LOX), expansin (EXP) are all critical regulating factors in fruit ripening and softening p... Fruit ripening is a complex process and is regulated by many factors. Ethylene and polygalacturonase (PG), lipoxygenase (LOX), expansin (EXP) are all critical regulating factors in fruit ripening and softening process. With antisense ACS tomato, Nr mutant tomato and cultivated tomato as materials, Northern blot hybridization showed that PG, LeEXP1 and LOXexpressed differently in different parts of cultivated tomato fruit during ripening, which was related to fruit ripening. The ripening process of columella and radial pericarp was faster than pericarp. In both Nr mutant and antisense ACS transgenic tomato fruit, expression levels ofPG, LeEXPI and LOXwere generally lower than those in cultivated fruit but still related to fruit ripening. The expression levels ofPG, LeEXP1 and LOX increased in the mature green tomato fruits after 0.5 h treatment with ethylene (100 μL/L). These results indicate that gene expression ofPG, LeEXP1 and LOXwere positively regulated by ethylene. The time and cumulative effect of the concentration exists in the expression of PG regulated by ethylene. The regulation of LOX expression mainly depended on the fruit development after great amount of ethylene was produced. PG played a major role in ripening and softening of tomato fruit, and cooperated with the regulation of EXP and LOX. 展开更多
关键词 TOMATO ripening and softening ETHYLENE expansin LIPOXYGENASE POLYGALACTURONASE gene expression
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三七Expansin家族基因的鉴定及生物信息分析 被引量:1
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作者 李雪娇 早浩龙 +4 位作者 卢迎春 赵雁 向贵生 范伟 杨生超 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第19期6365-6375,共11页
扩展蛋白(Expansins)作为细胞壁松弛蛋白,是调控细胞壁延展的重要调节因子,参与调控植物细胞壁松弛、细胞膨大与胁迫反应等过程。本研究从三七基因组中共鉴定到24个Expansins基因,其中,EXPA亚家族成员17个,EXPB亚家族成员3个,EXLA亚家... 扩展蛋白(Expansins)作为细胞壁松弛蛋白,是调控细胞壁延展的重要调节因子,参与调控植物细胞壁松弛、细胞膨大与胁迫反应等过程。本研究从三七基因组中共鉴定到24个Expansins基因,其中,EXPA亚家族成员17个,EXPB亚家族成员3个,EXLA亚家族成员1个,EXLB亚家族成员3个,系统进化分析显示它们与不同物种间有一定亲缘关系,表明该家族基因具有一定保守性。通过分析6个生长时期的三七主根中Expansins家族基因表达热图,发现Pn EXP15、Pn EXP17、Pn EXP22、Pn EXP24在三七主根发育过程中显著高表达,可能参与调控细胞壁松弛来调节三七主根的发育,以促进三七主根的膨大。本研究为深入探索三七扩展蛋白家族基因的功能、物种间的进化关系和三七分子育种提供科学参考依据。 展开更多
关键词 三七 expansin 生物信息 基因表达
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枯草芽孢杆菌Expansin蛋白的原核表达及活性分析 被引量:1
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作者 叶凯霞 朱华琛 +1 位作者 赵庆新 陈洪生 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期977-982,共6页
目的原核表达枯草芽孢杆菌Expansin蛋白,并分析其促进多糖糖化的活性。方法以过夜培养的Bacillus subtilis subsp. Subtilis subtilis str. 168基因组为模板合成expansin基因;在引物的N-端添加6-his tag,PCR合成融合基因6his-expansin,... 目的原核表达枯草芽孢杆菌Expansin蛋白,并分析其促进多糖糖化的活性。方法以过夜培养的Bacillus subtilis subsp. Subtilis subtilis str. 168基因组为模板合成expansin基因;在引物的N-端添加6-his tag,PCR合成融合基因6his-expansin,构建重组质粒6his-expansin-6his-p ET28a(+)[heh-pET28a(+)],转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达融合蛋白6His-Expansin-6His(HEH);并对表达条件进行优化。产物经Ni-NTA纯化,检测其与多糖降解酶(polysaccharide degrading enzyme,PDE)(纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶)及多糖复合酶(polysaccharide complex enzyme,PCE)制剂的协同活性(synergistic activity,SA)。结果经双酶切鉴定,重组质粒heh-p ET28a(+)构建正确;融合蛋白HEH在0. 05 mmol/L IPTG 30℃诱导30 h的最适表达条件下,表达量约为1. 2 mg/m L,其相对分子质量为26 400,目的蛋白纯度达95%;该蛋白与纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶的SA分别为171. 53%、61. 95%、230. 00%,与PCE降解滤纸(filter paper)、秸秆(rice straw)的SA分别为312. 83%、356. 59%。结论重组的融合蛋白HEH与PDE均具有较高的协同作用,为Expansin在生物质木质纤维素糖化领域的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 expansin 原核细胞 基因表达 多糖糖化 协同活性
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巨桉扩展蛋白EgrEXPA8和EgrEXPA10基因的克隆和表达特性分析 被引量:1
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作者 罗萍 王晓萍 +3 位作者 张昊楠 范春节 王玉娇 徐建民 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期827-834,共8页
为探讨扩展蛋白在桉树生长发育中的作用,以在桉树初生生长到次生生长转换转录组测序中筛选出的差异表达基因EgrEXPA8和EgrEXPA10为基础,从巨桉(Eucalyptusgrandis)中克隆了2个扩展蛋白基因EgrEXPA8和EgrEXPA10,分别编码249和244个氨基酸... 为探讨扩展蛋白在桉树生长发育中的作用,以在桉树初生生长到次生生长转换转录组测序中筛选出的差异表达基因EgrEXPA8和EgrEXPA10为基础,从巨桉(Eucalyptusgrandis)中克隆了2个扩展蛋白基因EgrEXPA8和EgrEXPA10,分别编码249和244个氨基酸,属于亲水蛋白,但Egr EXPA8稳定性高于Egr EXPA10。q RT-PCR分析表明,Egr EXPA8和Egr EXPA10基因均在幼叶和茎尖组织中表达量较高,在木质部和韧皮部表达量较低;且在茎顶端初生生长阶段表达量较高,而在下部次生生长节间表达量较低,可能其主要参与巨桉的初生生长或者负调控次生生长;另外在盐胁迫、茉莉酸甲酯处理下其均被抑制表达;而在水杨酸、缺硼、缺磷处理下均上调表达。这说明EgrEXPA8和EgrEXPA10在巨桉响应逆境胁迫时起到重要作用,且呈现出相似的调控方式。 展开更多
关键词 巨桉 扩展蛋白 基因克隆 基因表达 非生物胁迫
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玉米矮秆基因d15的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 赵长云 白光庭 +5 位作者 何少勇 余学杰 李仁飞 夏伟 许秀兰 柯永培 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1141-1150,共10页
发掘矮秆基因并解析其调控机制,为玉米矮化育种提供基因资源和理论依据。利用形态观察和石蜡切片方法,研究了玉米矮秆突变体K15d与野生型K15的矮化特征差异;通过等位性鉴定并利用PCR扩增克隆了矮秆基因d15,分析了3个时期茎节间中d15的... 发掘矮秆基因并解析其调控机制,为玉米矮化育种提供基因资源和理论依据。利用形态观察和石蜡切片方法,研究了玉米矮秆突变体K15d与野生型K15的矮化特征差异;通过等位性鉴定并利用PCR扩增克隆了矮秆基因d15,分析了3个时期茎节间中d15的表达模式。与野生型K15比较,突变体K15d的株高、穗位高和穗下节间数分别降低39.22%、69.75%和38.83%,差异均达显著或极显著水平;茎秆横切面细胞大小差异不明显,纵切面细胞变短,排列不规则。矮秆基因d15与br2等位,第5外显子5485~5685 bp区间缺失200 bp,编码区全长3983 bp。d15编码蛋白的跨膜结构域为10个,比D15编码蛋白的跨膜结构域减少2个,负责底物结合和转运功能的第2个保守功能域缺失。d15启动子较br2仅有2个SNPs差异。在拔节前、拔节期和拔节后3个时期,突变体中d15基因的表达量与野生型间均无显著差异。由此可见,矮秆基因d15的矮化特征及表达模式均与br2相似,是1个新的br2等位基因,丰富了玉米矮秆基因资源。 展开更多
关键词 玉米 矮秆 br2基因 等位突变 基因表达
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芋扩展蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在球茎膨大中的表达分析
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作者 李必聪 李慧英 +4 位作者 肖遥 罗莎 周庆红 黄英金 朱强龙 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第7期1604-1616,共13页
扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8... 扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8条染色体及2个重叠群上。在芋和拟南芥、水稻、马铃薯等4个物种中的扩展蛋白基因进行系统发育树分析中,所有的扩展蛋白基因划分到4个亚家族中,其中EXPA有23个,EXPB有5个,EXLA有1个,EXLB有2个。共线性分析表明,芋和拟南芥之间存在7对共线性扩展蛋白基因。基因表达分析发现,芋扩展蛋白基因家族不同成员在不同组织中有不同的表达模式,其中CeEXPA 2、CeEXPA 11、CeEXPA 13、CeEXPA 23和CeEXLA 1等5个基因在球茎膨大过程中高表达且差异显著,表明它们可能对芋球茎的膨大发挥了重要的调控作用。本研究结果将有助于了解芋扩展蛋白基因家族的特征及其在球茎膨大中的分子功能,为揭示芋球茎生长发育的分子调控机理提供理论依据。 展开更多
关键词 扩展蛋白基因家族 球茎膨大 基因表达分析
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低温条件下相关关键酶活性对棉纤维比强度形成的影响 被引量:19
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作者 卞海云 王友华 +2 位作者 陈兵林 束红梅 周治国 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1235-1241,共7页
【目的】研究低温对纤维比强度形成的影响。【方法】通过设置大田分期播种试验,使相同果枝部位棉铃可以处于不同的温度条件下发育,研究低温对棉纤维发育关键酶活性及相关基因表达的影响。【结果】低温影响纤维素的累积速率并最终影响纤... 【目的】研究低温对纤维比强度形成的影响。【方法】通过设置大田分期播种试验,使相同果枝部位棉铃可以处于不同的温度条件下发育,研究低温对棉纤维发育关键酶活性及相关基因表达的影响。【结果】低温影响纤维素的累积速率并最终影响纤维比强度的形成,其原因是在不同水平上影响了纤维发育关键酶的活性。在生化水平上,低温(铃龄0~50d日均温<23.0℃,铃龄25~50d日均温<21.0℃)提高了纤维中β-1,3-葡聚糖酶的活性、降低了蔗糖合成酶的活性,且前者对温度更为敏感。在基因表达水平上,低温使Expansin、蔗糖合成酶基因的表达量增加,β-1,3-葡聚糖酶基因的表达与此相反,低温下Expansin到达表达峰值时间推后且维持高表达的时间延长,低温可导致15d铃龄纤维β-1,3-葡聚糖酶基因表达量显著降低,而蔗糖合成酶基因表达量显著升高。【结论】在纤维品质形成上,低温导致棉纤维伸长期及伸长高峰推后,低温下纤维素累积量、纤维比强度的变化特征与纤维蔗糖合成酶活性及β-1,3-葡聚糖酶基因表达的变化特征高度一致,与β-1,3-葡聚糖酶活性及蔗糖合成酶基因表达受低温影响的规律相反。 展开更多
关键词 低温 expansin β-1 3-葡聚糖酶 蔗糖合成酶 基因表达 纤维发育 纤维比强度
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赤霉素(GA_3)和脱落酸(ABA)对不同水稻品种生长和生理特性及GA20ox2、GA3ox2基因表达的影响 被引量:27
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作者 杨艳华 张亚东 +4 位作者 朱镇 赵凌 陈涛 赵庆勇 王才林 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期433-437,共5页
以5个水稻品种4叶1心期的幼苗为材料,比较研究了1μmol/LGA3和10mg/LABA处理对不同水稻品种生长发育、生理特性及基因表达的影响。结果表明,GA3处理能够促进水稻地上部分伸长生长,抑制根伸长生长;同时,5个品种叶片的叶绿素含量、可溶性... 以5个水稻品种4叶1心期的幼苗为材料,比较研究了1μmol/LGA3和10mg/LABA处理对不同水稻品种生长发育、生理特性及基因表达的影响。结果表明,GA3处理能够促进水稻地上部分伸长生长,抑制根伸长生长;同时,5个品种叶片的叶绿素含量、可溶性蛋白质含量和细胞膜透性呈上升趋势。10mg/LABA处理则严重抑制种子萌发和地上部伸长生长;5个品种叶片的叶绿素含量、可溶性蛋白质含量和细胞膜透性则呈现下降趋势。用RT-PCR方法对GA20ox2和GA3ox2基因表达水平的变化进行检测,结果表明GA3处理后,日本晴GA20ox2基因表达略微下调,其余4个品种的GA20ox2基因表达上调。ABA处理抑制GA20ox2基因表达。GA3ox2基因表达也受GA3和ABA调控。在南粳44、关东194和日本晴中,GA3诱导GA3ox2表达,ABA显著抑制GA3ox2表达。 展开更多
关键词 水稻 赤霉素 脱落酸 矮秆基因 基因表达 生长 生理特性
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梨矮化砧木中矮1号GA20-氧化酶基因克隆与表达分析 被引量:12
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作者 宣利利 欧春青 +4 位作者 王斐 王志刚 程飞飞 李振茹 姜淑苓 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期883-887,共5页
中矮1号是中国农业科学院果树研究所选育的梨优良矮化砧木,为研究其矮化机理,利用RT-PCR结合RACE方法克隆了梨矮化砧木中矮1号的1个GA20-氧化酶基因,并对该基因及其氨基酸序列以及该基因在不同生长类型梨品种中不同时期新梢叶片中的表... 中矮1号是中国农业科学院果树研究所选育的梨优良矮化砧木,为研究其矮化机理,利用RT-PCR结合RACE方法克隆了梨矮化砧木中矮1号的1个GA20-氧化酶基因,并对该基因及其氨基酸序列以及该基因在不同生长类型梨品种中不同时期新梢叶片中的表达进行了分析。结果表明,该基因全长1 179 bp,推导编码392个氨基酸,其编码的蛋白质具有GA20-氧化酶基因家族所具有的功能活性位点和特征保守单元,该基因与苹果GA20-氧化酶基因氨基酸序列一致性达91.58%,因此确定该基因为中矮1号GA20-氧化酶基因,将其命名为PcGA20ox1(Gen-Bank登录号为HQ833589)。PcGA20ox1基因在中矮1号、亲本锦香和对照早酥3个品种不同发育阶段新梢叶片中的表达强度均为中矮1号<锦香<早酥,与植株高矮表现一致,表明PcGA20ox1基因的表达强弱与植株高矮相关。 展开更多
关键词 矮化砧木 赤霉素 GA20-氧化酶基因 基因表达
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萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析 被引量:14
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作者 荆赞革 柳李旺 +3 位作者 龚义勤 姜立娜 孙新菊 周艳孔 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期801-805,共5页
本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR... 本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR获得长度为898bp的cDNA,开放读码框(ORF)为29~820bp,推导编码263个氨基酸,含有1个组氨酸(His-Phe-Asp,HFD)功能域,ORF和推导蛋白序列与拟南芥AtEXPB3(GenBank accession No.NM118965)同源性分别为87%、92%。半定量RT-PCR检测到该基因主要在萝卜生育前期的幼叶、肉质根木质部和韧皮部中表达,且表达丰度可能与该部位细胞生长分裂状态相关,差异较明显。 展开更多
关键词 萝卜(Raphanus SATIVUS L.) 扩展蛋白 基因克隆 表达特征
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梨内根-贝壳杉烯合酶基因克隆及表达分析 被引量:13
16
作者 程飞飞 欧春青 +3 位作者 姜淑苓 王斐 马力 李连文 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期677-682,共6页
中矮1号(Pyrus communis)是中国农业科学院果树研究所选育的梨优良矮化砧木,为研究其矮化机理,应用同源克隆的方法从中矮1号叶片总RNA中克隆赤霉素合成过程中的关键酶——内根-贝壳杉烯合酶(KS)基因的cDNA全长序列,并对该基因在不同梨... 中矮1号(Pyrus communis)是中国农业科学院果树研究所选育的梨优良矮化砧木,为研究其矮化机理,应用同源克隆的方法从中矮1号叶片总RNA中克隆赤霉素合成过程中的关键酶——内根-贝壳杉烯合酶(KS)基因的cDNA全长序列,并对该基因在不同梨品种中的表达进行分析。结果表明:基于苹果基因组序列设计的特异引物从中矮1号的总RNA中扩增出了1个编码框全长为2214 bp的cDNA序列,其编码737个氨基酸残基,推断分子量为83.63 kD,等电点为5.37。其氨基酸序列与报道的其他植物KS氨基酸序列的相似性为53.61%~72.63%,其中,与板栗(AEF32083.1)的相似性最高,其氨基酸序列中包含植物KS基因所共有的YDTAWVAWVP和DDXXD保守结构域,因此,将分离到的基因命名为PcKS。早酥、锦香和中矮1号等不同梨品种的PcKS基因的cDNA序列仅有个别碱基差异,但编码的氨基酸序列完全一致,品种间不存在结构差异。RT-PCR表达分析结果表明,PcKS基因在早酥中的表达量低于同时期的锦香和中矮1号,与植株高度相反,初步表明该基因的表达有与梨植株生长势呈负相关的趋势。 展开更多
关键词 内根-贝壳杉烯合酶 赤霉素 矮化 基因表达
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地黄扩展蛋白基因RgExpA1的克隆与表达分析 被引量:10
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作者 臧亚超 孙鹏 +1 位作者 杨太新 李先恩 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期69-73,共5页
采用RT-PCR方法对9个地黄扩展蛋白基因在地黄不同组织器官、不同发育时期的表达特点进行了分析,在此基础上用RACE方法克隆了主要在根中表达的RgExpA1基因的全长,并对该基因编码氨基酸的功能位点、拼接方式以及与同源基因的进化关系作了... 采用RT-PCR方法对9个地黄扩展蛋白基因在地黄不同组织器官、不同发育时期的表达特点进行了分析,在此基础上用RACE方法克隆了主要在根中表达的RgExpA1基因的全长,并对该基因编码氨基酸的功能位点、拼接方式以及与同源基因的进化关系作了初步分析。 展开更多
关键词 扩展蛋白 地黄(Rehmannia glutinousa) 基因克隆 表达分析
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水稻GA20ox-2基因mRNA的TaqMan荧光定量RT-PCR检测 被引量:4
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作者 高东 何霞红 +2 位作者 王云月 李成云 朱有勇 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期309-314,共6页
成功建立了一项基于TaqMan实时荧光定量的RT-PCR技术,定量分析水稻半矮化关键基因之一GA20ox-2转录水平。该技术体系中重组质粒标准品的制备方法具有很好的实用性;质粒标准品对基因GA20ox-2表达的实时定量准确、可靠、便捷。标准曲线表... 成功建立了一项基于TaqMan实时荧光定量的RT-PCR技术,定量分析水稻半矮化关键基因之一GA20ox-2转录水平。该技术体系中重组质粒标准品的制备方法具有很好的实用性;质粒标准品对基因GA20ox-2表达的实时定量准确、可靠、便捷。标准曲线表明,所建立的GA20ox-2基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,特异性好,灵敏度高,可达102拷贝;线性范围广,可达102~107拷贝;扩增效率高(E=100.3%);稳定性、重复性好,可靠性高,批内和批间变异系数仅分别为0.12%~0.31%和0.21%~0.34%;循环阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系(r=0.999),可对GA20ox-2基因表达进行准确实时定量。 展开更多
关键词 水稻 矮秆基因 基因表达 实时定量 逆转录-聚合酶链式反应 探针
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转基因枳橙中GA20ox1与rol基因互作关系的研究 被引量:3
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作者 袁飞荣 李芳 +3 位作者 蒋巧巧 Alessandra Gentile 严佳文 邓子牛 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第19期214-221,共8页
为分析转rolABC基因枳橙GA20ox1基因与rol基因表达的互作关系,进一步阐释其矮化性状形成的分子机制。以转rol基因枳橙实生苗为试验材料,研究其对赤霉素的敏感反应,用荧光定量RT-PCR分析GA20ox1基因和rol基因的表达,并检测幼芽中过氧化... 为分析转rolABC基因枳橙GA20ox1基因与rol基因表达的互作关系,进一步阐释其矮化性状形成的分子机制。以转rol基因枳橙实生苗为试验材料,研究其对赤霉素的敏感反应,用荧光定量RT-PCR分析GA20ox1基因和rol基因的表达,并检测幼芽中过氧化物酶活性和植物内源激素含量的变化。结果表明转rol基因枳橙既不属于GA缺陷型,也不属于GA不敏感型,喷施GA3能促进其茎伸长生长,但恢复不到野生型水平,幼芽中IAA(P<0.01)、GA1和GA4(P<0.05)显著降低,POD酶活性显著提高(P<0.01)。转rol基因枳橙幼芽中GA20ox1基因mRNA水平相比对照显著下调(P<0.01)。B、D系与野生型嫩茎中无明显差异,B、D系老叶中明显降低,E系中嫩茎和老叶中均明显增加。B、D和E系嫩叶中GA20ox1基因转录表达均较野生型高。在幼芽、嫩茎中,rolC基因与GA20ox1表达负相关。rol基因通过在幼芽中的高表达下调了GA20ox1基因转录表达,进而抑制了活性GAs在幼芽中的合成,顶端分生组织较低量的活性GAs限制植物茎伸长,在转rolABC基因枳橙矮化性状建成中发挥重要作用。 展开更多
关键词 枳橙 rolABC基因 GA20ox1基因 基因表达 植物激素 矮化机理
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水稻矮缩病毒基因组第八号片段的cDNA克隆序列分析及在大肠杆菌中的表达 被引量:7
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作者 李玮 李毅 +2 位作者 张旭 储瑞银 陈章良 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第1期56-62,共7页
从水稻矮缩病毒(RDV)中国福建分离物中分离出基因组第八号片段dsRNA,经逆转录合成cDNA,应用聚合酶链式反应技术扩增了编码区cDNA,并克隆在pGEM3Zf(一)载体上。该片段编码病毒外层外壳蛋白。对重组子进行... 从水稻矮缩病毒(RDV)中国福建分离物中分离出基因组第八号片段dsRNA,经逆转录合成cDNA,应用聚合酶链式反应技术扩增了编码区cDNA,并克隆在pGEM3Zf(一)载体上。该片段编码病毒外层外壳蛋白。对重组子进行限制性内切酶分析,亚克隆及全序列测定,结果表明,克隆片段全长135bp含有一个1266bp的阅读框架,编码一个含有421个氨基酸的多肽。与日本流行株相应片段比较,核苷酸和氨基酸水平的同源率分别为94.4%和97.9%。另外,我们所克隆的片段在距起始密码子532一534处较日本株系多了3个核苷酸,导致RDV中国福建分离物外层外壳蛋白比日本株多出一个氨基酸。将该编码区cDNA克隆到原核表达载体pTrcHisA上,经IPTG诱导,用RDV抗体进行蛋白Westem印迹分析表明,该基因在大肠杆菌中得到高效表达。这项工作为以后进一步开展水稻抗矮缩病基因工程,研究RDV与传毒介体昆虫之间的识别关系奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻矮缩病毒 第八号片段 序列分析 CDNA
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