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基于CRISPR/Cas9技术构建猪KLF4基因敲除细胞系及其对细胞活性的影响分析
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作者 董娇 陆繁 +3 位作者 方晓敏 陈瑜哲 包文斌 王海飞 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期893-902,共10页
【目的】试验旨在利用CRISPR/Cas9技术构建Krüppel样因子4(Krüppel-like factor 4,KLF4)基因敲除的猪小肠上皮细胞,并探究KLF4基因敲除对于细胞活性和细胞周期的影响。【方法】在猪KLF4基因转录本第1外显子区域设计3条sgRNAs(... 【目的】试验旨在利用CRISPR/Cas9技术构建Krüppel样因子4(Krüppel-like factor 4,KLF4)基因敲除的猪小肠上皮细胞,并探究KLF4基因敲除对于细胞活性和细胞周期的影响。【方法】在猪KLF4基因转录本第1外显子区域设计3条sgRNAs(sgRNA1、sgRNA2和sgRNA3),经退火形成的双链DNA与线性化pGK1.1载体连接,产物转化大肠杆菌Top10感受态细胞进行鉴定,并将重组载体转染至猪小肠上皮细胞(IPEC-J2)。PCR扩增敲除位点附近序列,并通过测序判断sgRNA敲除效率;利用CruiserTMEnzyme酶切鉴定阳性细胞克隆,通过TA克隆测序鉴定敲除序列;利用Western blotting检测基因敲除细胞中KLF4蛋白表达情况。利用CCK-8和流式细胞术检测KLF4基因敲除后细胞活性和细胞周期的变化。【结果】重组载体测序结果显示,sgRNAs与pGK1.1成功连接。分析敲除效率发现,3个sgRNAs均可对靶序列进行敲除,其中sgRNA3有较高的敲除效率。PCR产物经CruiserTMEnzyme酶切筛选出2个阳性单克隆细胞。TA克隆测序分析发现,KLF4基因2个等位基因序列分别缺失116和137 bp。Western blotting结果表明,KLF4基因敲除细胞中未见KLF4蛋白表达。细胞活性及细胞周期分析显示,敲除KLF4基因极显著抑制了细胞活性(P<0.01),并导致G0/S细胞周期阻滞。【结论】本研究利用CRISPR/Cas9技术构建了KLF4基因敲除的IPEC-J2细胞,且KLF4基因敲除可抑制细胞活性,并引起G0/S细胞周期阻滞。KLF4基因敲除细胞可为进一步探究KLF4基因功能及分子机制提供材料。 展开更多
关键词 KLF4基因 CRISPR/Cas9技术 细胞活性 细胞周期
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双能CT联合血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4诊断卵巢癌效能
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作者 梁俊明 黄健威 符立辉 《中国计划生育学杂志》 2024年第2期337-342,共6页
目的:探究双能CT联合血清拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质(PIVKA-Ⅱ)、抑癌基因N-myc下游调节因子4(NDRG4)检测在诊断卵巢癌中的应用价值。方法:2020年2月-2023年5月本院接受治疗的卵巢癌患者105例为卵巢癌组,同期收治的良性卵巢肿瘤患者100例为... 目的:探究双能CT联合血清拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质(PIVKA-Ⅱ)、抑癌基因N-myc下游调节因子4(NDRG4)检测在诊断卵巢癌中的应用价值。方法:2020年2月-2023年5月本院接受治疗的卵巢癌患者105例为卵巢癌组,同期收治的良性卵巢肿瘤患者100例为良性组,健康体检者90例为对照组。所有受试者均行双能CT检查,测量双能CT参数标准化碘浓度(NIC)和能谱曲线斜率(k)值,检测血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析双能CT参数联合血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4的诊断卵巢癌价值;Pearson法分析血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4与双能CT参数的相关性。结果:对照组、良性组、卵巢癌组NIC、k值、血清PIVKA-Ⅱ水平依次升高,NDRG4依次降低;双能CT参数NIC、k及血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4诊断卵巢癌的曲线下面积(AUC)分别为0.785、0.696、0.832、0.799,4项联合诊断卵巢癌的AUC(0.937)显著提高(均P<0.05)。卵巢癌患者血清PIVKA-Ⅱ水平与NIC、k呈正相关,血清NDRG4水平与NIC、k呈负相关;双能CT参数NIC、k、血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4水平与患者FIGO分期、淋巴结转移、分化程度有关(均P<0.05)。结论:双能CT、血清PIVKA-Ⅱ、NDRG4对卵巢癌诊断具有一定价值,且联合诊断价值更高。 展开更多
关键词 卵巢癌 拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质 抑癌基因N-myc下游调节因子4 双能CT 诊断
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LIPI-3和LIPI-4共存对致病性单核细胞增生李斯特菌毒力的影响
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作者 钱瑞宣 李楠 +11 位作者 康立超 马勋 刘彩霞 史唯地 寇丽君 任慧杰 祁亚涛 殷中科 刘璐 王静 王正荣 蒋建军 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2027-2036,共10页
【目的】探究单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)毒力岛3(LIPI-3)和LIPI-4共存对LM毒力的影响,揭示它们对细菌毒力的潜在调节作用,为进一步研究LM的致病机制提供依据。【方法】以LM928(存在LIPI-4)和LM873(同时存在LIPI-3... 【目的】探究单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)毒力岛3(LIPI-3)和LIPI-4共存对LM毒力的影响,揭示它们对细菌毒力的潜在调节作用,为进一步研究LM的致病机制提供依据。【方法】以LM928(存在LIPI-4)和LM873(同时存在LIPI-3和LIPI-4)2个LM菌株为研究对象,通过侵染HCMEC/D3细胞监测2种菌株对HCMEC/D3细胞的黏附和侵袭情况;通过鸡胚感染试验评估2株菌对鸡胚半数致死量(LD 50)的影响;采用溶血试验来测定菌株的溶血活性;通过流式细胞仪分析HCMEC/D3细胞凋亡情况,以评估菌株诱导细胞凋亡的能力;利用实时荧光定量PCR技术比较2株菌在BHI培养条件下及感染HCMEC/D3细胞后毒力基因的转录水平差异。【结果】LM928和LM873株的黏附率无显著差异(P>0.05),LM928株的侵袭率极显著高于LM873株(P<0.01)。LM873株的LD 50是LM928株的约1000倍;LM928和LM873株的溶血价分别为24和23。LM928株感染24和48 h后诱导的细胞凋亡率显著或极显著高于LM873株(P<0.05;P<0.01),而LM873株的凋亡率与对照组间无显著差异(P>0.05)。LM928和LM873株在BHI培养基中培养时,与LM928株相比,LM873株毒力基因mpl、inlB、inlC、inlP、actA、plcA、plcB和sigB的转录水平均显著或极显著上调(P<0.05;P<0.01),毒力基因hly、inlA和iap的转录水平均极显著或显著下调(P<0.01;P<0.05)。LM928和LM873株侵染HCMEC/D3细胞后,与LM928株相比,LM873株毒力基因inlP、actA、plcA、plcB和prfA的转录水平均显著或极显著上调(P<0.05;P<0.01);毒力基因hly、mpl、inlA、inlB、inlC和iap的转录水平均极显著下调(P<0.01)。【结论】LIPI-3和LIPI-4共存降低了LM的毒力,该结果对进一步研究LIPI-3和LIPI-4在细菌毒力调控中的分子机制和复杂的相互作用具有重要意义。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌(LM) LIPI-3 LIPI-4 毒力 毒力基因
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三角梅二氢黄酮醇-4-还原酶基因的克隆及表达特异性分析
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作者 孙蓉 刘桃 +3 位作者 潘凯越 刘姗 刁毅 曾道萍 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期33-39,共7页
【目的】克隆分析三角梅(Bougainvillea spectabilis)二氢黄酮醇-4-还原酶(Dihydroflavonol-4-reductase,DFR)基因(BsDFR),探讨其在三角梅苞片呈色中的作用。【方法】基于三角梅转录组数据,利用PCR技术克隆BsDFR基因,并通过生物信息学... 【目的】克隆分析三角梅(Bougainvillea spectabilis)二氢黄酮醇-4-还原酶(Dihydroflavonol-4-reductase,DFR)基因(BsDFR),探讨其在三角梅苞片呈色中的作用。【方法】基于三角梅转录组数据,利用PCR技术克隆BsDFR基因,并通过生物信息学工具分析其分子特性;通过分子对接技术预测BsDFR底物特异性;采用实时荧光定量PCR分析该基因在不同颜色三角梅中的表达量差异。【结果】三角梅BsDFR基因(GenBank ID:ON417750)编码区全长987 bp,编码328个氨基酸。BsDFR理论相对分子质量为36.48 kDa,等电点pI为6.33;具有DFR特有的NADPH及底物特异结合位点,属于Asn型DFR;不具有跨膜结构及信号肽,定位于细胞质中;二级结构中α螺旋占比最多,三级结构预测显示为二聚体蛋白。底物对接模拟预测BsDFR对二氢山柰酚(Dihydrokaempferol,DHK)、二氢槲皮素(Dihydroquercetin, DHQ)和二氢杨梅素(Dihydromyricetin, DHM)3种底物均具有催化活性,与结构分析相吻合。进化树分析其与石竹目(Centrospermae)植物聚为一类。qRT-PCR分析发现其在橙色系三角梅中含量较高,进一步推测其主要底物为DHK,催化生成橙色系花青素(天竺葵素)的前体物质——无色天竺葵素苷元。【结论】BsDFR基因是一个典型的植物二氢黄酮醇-4-还原酶基因,主要与橙色系三角梅苞片色素合成有关。 展开更多
关键词 三角梅 BsDFR基因 生物信息学 表达量分析
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LncRNA SNHG4调控牙周膜干细胞成骨分化过程中的miR-152-3p
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作者 周明华 胡晓宇 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第1期38-43,共6页
背景:研究表明长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因4(LncRNA SNHG4)参与了多种炎症性疾病的进展,而关于LncRNA SNHG4对牙周炎治疗过程中人牙周膜干细胞成骨分化的影响尚不明确。目的:探讨LncRNA SNHG4通过调节miR-152-3p对人牙周膜干细胞成... 背景:研究表明长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因4(LncRNA SNHG4)参与了多种炎症性疾病的进展,而关于LncRNA SNHG4对牙周炎治疗过程中人牙周膜干细胞成骨分化的影响尚不明确。目的:探讨LncRNA SNHG4通过调节miR-152-3p对人牙周膜干细胞成骨分化的影响。方法:从因正畸需要而拔除的前磨牙牙周膜组织中分离出人牙周膜干细胞,将其进行成骨诱导分化0,7,14 d后,qRT-PCR检测Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4及miR-152-3p表达。取第3代人牙周膜干细胞,将其分为NC组、pcDNA组、pcDNA-SNHG4组、inhibitor NC组、miR-152-3p inhibitor组、pcDNA-SNHG4+mimic NC组、pcDNA-SNHG4+miR-152-3p mimic组,qRT-PCR检测各组人牙周膜干细胞中LncRNA SNHG4、miR-152-3p表达,CCK-8法检测细胞增殖情况;比色法检测碱性磷酸酶活性;茜素红染色检测矿化结节形成情况;Western blot检测Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验验证LncRNA SNHG4与miR-152-3p的关系。结果与结论:①与成骨诱导0 d比较,成骨诱导7,14 d后人牙周膜干细胞中Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4表达升高,miR-152-3p表达降低(P<0.05);②过表达LncRNA SNHG4或抑制miR-152-3p均可提高人牙周膜干细胞的增殖能力及碱性磷酸酶活性、矿化结节形成量和Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶的蛋白表达(P<0.05);miR-152-3p mimic减弱了过表达LncRNA SNHG4对人牙周膜干细胞成骨分化的促进作用;LncRNA SNHG4与miR-152-3p存在靶向关系;③结果表明,过表达LncRNA SNHG4可能通过抑制miR-152-3p促进人牙周膜干细胞成骨分化。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 核仁小RNA宿主基因4 牙周膜干细胞 成骨分化
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MRI联合血清TSGF、NDRG4在上皮性卵巢癌诊断中的作用
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作者 柯楠 刘凯 +1 位作者 陈娇 汪晶 《中国CT和MRI杂志》 2024年第4期119-121,共3页
目的探讨血清肿瘤特异性生长因子(TSGF)、N-Myc下游调节基因4(NDRG4)在上皮性卵巢癌血清中的表达以及联合磁共振成像(MRI)在上皮性卵巢癌诊断中的作用。方法收集本院2021年1月~2022年8月期间进行手术的60例上皮性卵巢癌患者(卵巢癌组)... 目的探讨血清肿瘤特异性生长因子(TSGF)、N-Myc下游调节基因4(NDRG4)在上皮性卵巢癌血清中的表达以及联合磁共振成像(MRI)在上皮性卵巢癌诊断中的作用。方法收集本院2021年1月~2022年8月期间进行手术的60例上皮性卵巢癌患者(卵巢癌组)作为研究对象,同时选取与上皮性卵巢癌患者临床资料一致的妇科良性肿瘤患者(良性组)和健康体检者(对照组)各60例。比较各组血清TSGF、NDRG4水平;ROC曲线分析血清TSGF、NDRG4分别对上皮性卵巢癌的诊断效能;四表格法分析MRI联合血清TSGF、NDRG4对上皮性卵巢癌的诊断效能。结果卵巢癌组血清TSGF水平显著高于良性组和对照组(P<0.05),血清NDRG4水平显著低于良性组和对照组(P<0.05);良性组血清TSGF水平显著高于对照组(P<0.05),血清NDRG4水平显著低于对照组(P<0.05)。MRI联合血清TSGF、NDRG4诊断上皮性卵巢癌的准确率为93.33%,敏感性为95.00%,特异性为91.67%。其中,三项联合诊断的特异性高于NDRG4、MRI单独诊断(P<0.05),三项联合诊断的准确率和敏感性高于TSGF、NDRG4单独诊断(P<0.05)。结论上皮性卵巢癌患者血清TSGF的表达水平显著升高,NDRG4的表达水平显著降低,MRI联合血清TSGF、NDRG4对上皮性卵巢癌具有一定的诊断价值。 展开更多
关键词 磁共振成像 肿瘤特异性生长因子 N-Myc下游调节基因4 上皮性卵巢癌 诊断
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血清4型禽腺病毒感染LMH细胞后干扰素刺激基因在转录水平表达量的动态变化
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作者 万丽军 王盛 +12 位作者 谢芝勋 任红玉 谢丽基 范晴 罗思思 李孟 张艳芳 曾婷婷 黄娇玲 张民秀 谢志勤 李小凤 韦悠 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2081-2090,共10页
【目的】了解鸡肝癌细胞(LMH)感染血清4型禽腺病毒(FAdV-4)后干扰素(IFN)和干扰素刺激基因(ISGs)的表达量变化,为研究FAdV-4与ISGs的相互作用提供参考依据。【方法】试验将FAdV-4感染LMH细胞,观察不同时间点细胞病变,并收集感染0、12、2... 【目的】了解鸡肝癌细胞(LMH)感染血清4型禽腺病毒(FAdV-4)后干扰素(IFN)和干扰素刺激基因(ISGs)的表达量变化,为研究FAdV-4与ISGs的相互作用提供参考依据。【方法】试验将FAdV-4感染LMH细胞,观察不同时间点细胞病变,并收集感染0、12、24、36、48、60、72、84和96 h的细胞样品,通过实时荧光定量PCR技术检测感染病毒后不同时间点IFN-α和IFN-β及ISGs基因在转录水平上表达量的动态变化规律。【结果】LMH细胞感染FAdV-448 h时出现典型的细胞病变;在感染12 h后,FAdV-4快速增殖,60 h时达到峰值;感染病毒后各时间点,与对照组相比,IFN-α基因转录水平表达量均显著下调(P<0.05);与对照组相比,在感染后12和24 h,IFN-β基因表达量显著下调(P<0.05),在36 h时迅速上调表达至峰值(P<0.05),在48 h时仍维持在较高水平,之后时间点的表达量有所下降且趋于稳定,但仍显著高于对照组(P<0.05);ISG 12、IFIT 5及DDIT 4基因在感染前期变化不大,在感染后36 h时迅速上调,在感染后96 h达到峰值(P<0.05);ZFP 313、IFITM 3及Viperin基因在感染前期表达量变化不大,随后在36 h迅速上调表达至峰值(P<0.05),在48 h时仍维持在较高水平,之后时间点的表达量有所下降,但仍显著高于对照组(P<0.05);与对照组相比,CD 47、OAS和PKR基因均呈现下调表达。【结论】在FAdV-4感染LMH细胞后,IFN及多种ISGs在转录水平呈现规律性变化,与病毒在LMH细胞中复制存在一定的联系,表明这些天然免疫因子可能在抗FAdV-4反应中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 血清4型禽腺病毒(FAdV-4) LMH细胞 干扰素 干扰素刺激基因 转录
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老年COPD并发PI患者血清lncRNA SNHG16和SMAD4表达及其临床意义
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作者 徒功兵 张殿福 +3 位作者 尹立平 黄超 毛萍静 黄刚 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第2期213-218,共6页
目的探讨老年慢性阻塞性肺病(COPD)并发肺部感染(PI)患者血清长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因16(lncRNA SNHG16)和母亲抗生物皮肤生长因子同源物4(SMAD4)表达及其临床意义。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的237例老年COPD患者为... 目的探讨老年慢性阻塞性肺病(COPD)并发肺部感染(PI)患者血清长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因16(lncRNA SNHG16)和母亲抗生物皮肤生长因子同源物4(SMAD4)表达及其临床意义。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的237例老年COPD患者为研究对象,将其中并发PI的117例患者归为并发组,120例未并发PI患者归为COPD组。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测患者血清lncRNA SNHG16相对表达水平。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测患者血清SMAD4水平。采用简化临床肺部感染评分(sCPIS)评价并发组患者PI程度。采用多因素Logistic回归分析模型分析老年COPD患者并发PI的影响因素;采用Spearman相关性分析老年COPD并发PI患者的血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平与sCPIS之间的相关性;并通过受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平对老年COPD患者并发PI的诊断价值。结果并发组血清lncRNA SNHG16相对表达水平高于COPD组,但血清SMAD4水平低于COPD组(P<0.05)。并发组年龄≥70岁、有吸烟史、并发糖尿病、COPD病程≥5年者占比及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、干扰素-γ(INF-γ)水平均高于COPD组(P<0.05),1秒用力呼气量/用力肺活量(FEV 1/FVC)、白细胞介素-10(IL-10)水平均低于COPD组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析模型结果表明,年龄≥70岁、并发糖尿病、COPD病程≥5年、高TNF-α水平、高INF-γ水平、高lncRNA SNHG16相对表达水平均是导致老年COPD患者并发PI的危险因素(P<0.05),高FEV 1/FVC、高血清SMAD4水平、高IL-10水平是保护因素(P<0.05)。Spearman相关性分析表示,血清lncRNA SNHG16相对表达水平与COPD并发PI患者的sCPIS呈正相关(r=0.505,P<0.001),SMAD4水平与sCPIS呈负相关(r=-0.550,P<0.001)。血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平联合诊断老年COPD患者并发PI的曲线下面积(AUC)均大于各项单独诊断(Z=2.416,P=0.016;Z=2.375,P=0.018)。结论老年COPD并发PI患者血清lncRNA SNHG16相对表达水平上升,SMAD4水平下降,二者均为老年COPD患者并发PI的影响因素,均与患者PI程度相关,均对老年COPD患者并发PI具有诊断价值,且二者联合诊断效能更好。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺病 肺部感染 长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因16 母亲抗生物皮肤生长因子同源物4
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Potential functions of esophageal cancer-related gene-4 in the cardiovascular system 被引量:2
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作者 Rui Zhou Yuanshu Liu +1 位作者 Wenjun Huang Xitong Dan 《Frontiers of Medicine》 SCIE CAS CSCD 2019年第6期639-645,共7页
Esophageal cancer-related gene-4(Ecrg4)is cloned from the normal epithelium of the esophagus.It is constitutively expressed in quiescent epithelial cells and downregulated during tumorigenesis,and Ecrg4 expression lev... Esophageal cancer-related gene-4(Ecrg4)is cloned from the normal epithelium of the esophagus.It is constitutively expressed in quiescent epithelial cells and downregulated during tumorigenesis,and Ecrg4 expression levels are inversely correlated with the malignant phenotype of tumor cells,validating that Ecrg4 is a real tumor suppressor gene.Unlike other tumor suppressor genes that usually encode membrane or intracellular proteins,Ecrg4 encodes a 148-amino acid pre-pro-peptide that is tethered on the cell surface in epithelial cells,specialized epithelial cells,and human leukocytes,where it can be processed tissue dependently into several small peptides upon cell activation.Ecrg4 is expressed in a wide variety of other cells/tissues,including cardiomyocytes and conduction system of the heart,,the glomus cells of the carotid body,adrenal glands,choroid plexus,and leukocytes among others,where it exerts distinct functions,such as promoting/suppressing inflammation,inducing neuron senescence,stimulating the hypothalamus--pituitary--adrenal axis,maintaining the stemness of stem cells,participating in the rhythm and rate control of the heart,and possibly gauging the responsiveness of the cardiovascular system(CVS)to hypoxia,in addition to tumor suppression.Here,we briefly review the latest discoveries on Ecrg4 and its underlying molecular mechanisms as a tumor suppressor and focus on the emerging roles of Ecrg4 in the CVS. 展开更多
关键词 tumor suppressor gene esophageal cancer-related gene-4 cardiovascular disease HYPOXIA
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SALL4和DNMT3b在子痫前期胎盘组织中的表达及临床意义
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作者 王晓辉 张彩丽 +3 位作者 刘艳丽 陶玲玲 罗晓华 刘月华 《海南医学》 CAS 2023年第24期3582-3586,共5页
目的探究人类婆罗双树样基因4(SALL4)、DNA甲基转移酶3b(DNMT3b)在子痫前期(PE)患者胎盘组织中的表达水平及其临床意义。方法选取2019年5月至2020年8月于郑州大学第三附属医院行剖宫产的88例PE孕妇作为PE组,按PE孕妇病情将其分为轻度组5... 目的探究人类婆罗双树样基因4(SALL4)、DNA甲基转移酶3b(DNMT3b)在子痫前期(PE)患者胎盘组织中的表达水平及其临床意义。方法选取2019年5月至2020年8月于郑州大学第三附属医院行剖宫产的88例PE孕妇作为PE组,按PE孕妇病情将其分为轻度组51例和重度组37例,另纳入同期行剖宫产的正常妊娠孕妇88例作为对照组。比较三组孕妇的一般资料,收集孕妇分娩后的胎盘组织,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法测定并比较三组孕妇胎盘组织中SALL4、DNMT3b mRNA表达水平;采用Pearson法分析胎盘组织SALL4、DNMT3b mRNA表达水平与PE孕妇舒张压、24 h尿蛋白、收缩压及新生儿体质量的关系,及SALL4 mRNA表达水平与DNMT3b mRNA的关系。结果轻度组、重度组和对照组孕妇的舒张压[(11.36±1.44)kPa vs(12.36±1.77)kPa vs(9.83±1.31)kPa]、24 h尿蛋白[(2.07±0.68)g/24 h vs(3.21±1.11)g/24 h vs(0.12±0.04)g/24 h]、收缩压[(17.65±1.53)kPa vs(18.77±2.20)kPa vs(15.37±1.53)kPa]、胎盘组织SALL4(1.48±0.49 vs 2.31±0.77 vs 1.04±0.35)、DNMT3b mRNA(1.53±0.51 vs 2.41±0.80 vs 1.01±0.34)表达水平比较,轻度组、重度组明显高于对照组,而新生儿体质量[(3058.61±378.73)g vs(2922.73±356.66)g vs(3412.54±437.36)g]比较,轻度组、重度组明显低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05),而重度组孕妇的舒张压、24 h尿蛋白、收缩压、胎盘组织SALL4、DNMT3b mRNA表达水平明显高于轻度组,差异均有统计学意义(P<0.05);经Pearson分析结果显示,胎盘组织SALL4 mRNA表达水平与PE孕妇舒张压、24 h尿蛋白、收缩压水平呈正相关(r=0.552、0.496、0.573,P<0.05),与新生儿体质量呈负相关(r=-0.397,P<0.05);胎盘组织DNMT3b mRNA表达水平与PE孕妇舒张压、24 h尿蛋白、收缩压呈正相关(r=0.478、0.394、0.501,P<0.05),与新生儿体质量呈负相关(r=-0.415,P<0.05)。结论PE孕妇胎盘组织SALL4、DNMT3b mRNA表达水平较高,两者呈正相关,SALL4、DNMT3b可能是治疗PE的靶点。 展开更多
关键词 人类婆罗双树样基因4 子痫前期 DNA甲基转移酶3B 胎盘组织 临床意义
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再生基因4(REG4)真核表达载体的构建及其蛋白在HEK293T细胞中的表达、纯化
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作者 徐杨 杜惠芬 +4 位作者 李克生 柴丹丹 石晓玲 连晓雯 张学良 《现代检验医学杂志》 CAS 2023年第4期35-39,共5页
目的构建再生基因4(regenerating gene 4,REG4)的真核表达载体,转染人胚肾细胞293T(human embryonic kidney 293T cells,HEK 293T),获得重组人再生胰岛衍生蛋白IV(regenerating islet-derived protein IV,Reg IV)。方法根据NCBI数据库R... 目的构建再生基因4(regenerating gene 4,REG4)的真核表达载体,转染人胚肾细胞293T(human embryonic kidney 293T cells,HEK 293T),获得重组人再生胰岛衍生蛋白IV(regenerating islet-derived protein IV,Reg IV)。方法根据NCBI数据库REG4基因序列进行基因优化、合成,将其克隆至pCDNA3.4载体并进行双酶切和测序鉴定,通过转染试剂聚乙烯亚胺(polyethylenimine,PEI)将pCDNA3.4-REG4质粒瞬时转染至HEK 293T细胞(实验组),同时以pEGFP-C1质粒作为转染对照组,未转染重组质粒的HEK 293T细胞作为空白对照组。荧光显微镜观察转染对照组转染效率,分别收集实验组及空白对照组细胞和细胞培养液上清,十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)与免疫印迹试验(Western-Blot,WB)检测Reg IV蛋白表达水平。通过镍柱及丙烯葡聚糖凝胶S-400(Sephacryl S-400)柱进行蛋白纯化,SDS-PAGE及WB对纯化后重组蛋白进行鉴定。结果经测序和双酶切鉴定,重组质粒pCDNA3.4-REG4构建成功。转染对照组(pEGFP-C1质粒)荧光显微镜观察结果显示转染效率约50%,表明转染成功。WB结果显示仅在实验组(pCDNA3.4-REG4质粒)的细胞中检测到RegIV蛋白。镍柱纯化时目的蛋白无法与镍柱填料有效结合,SephacrylS-400凝胶柱层析纯化获得了此重组蛋白。结论成功构建了REG4基因真核表达载体并在HEK 293T细胞中成功表达,为深入研究Reg IV蛋白的作用机理及开发潜在的抗癌靶向药物奠定了基础。 展开更多
关键词 再生基因4 再生胰岛衍生蛋白Ⅳ 真核表达 人胚肾细胞293T 瞬时转染 蛋白纯化
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BTLA、CTLA-4基因多态性与肝癌TACE联合靶向治疗疗效及预后相关性
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作者 陆小华 袁洪新 《昆明医科大学学报》 CAS 2023年第9期126-135,共10页
目的探讨B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)、细胞毒性T淋巴细胞抗原-4(CTLA-4)基因多态性与肝癌经动脉插管化疗栓塞(TACE)联合靶向治疗疗效及预后相关性。方法选取2021年1月至2021年12月期间南通大学附属医院介入放射科收治的新发85例肝癌患... 目的探讨B及T淋巴细胞弱化因子(BTLA)、细胞毒性T淋巴细胞抗原-4(CTLA-4)基因多态性与肝癌经动脉插管化疗栓塞(TACE)联合靶向治疗疗效及预后相关性。方法选取2021年1月至2021年12月期间南通大学附属医院介入放射科收治的新发85例肝癌患者作为研究对象,均行TACE联合靶向治疗,根据RECIST实体瘤疗效评价标准将患者分为治疗有效组(n=58)、疾病进展组(n=27),比较2组临床资料、BTLA、CTLA-4基因多态性,分析BTLA、CTLA-4基因多态性与疗效的相关性,并于治疗后18个月电话随访生存状况,对比不同基因型患者生存状况,分析其与生存预后的相关性。结果CTLA-4 rs231775、rs733618、rs3087243、rs4553808位点、BTLA rs2171513、rs3112270、rs1982809、rs16859629位点基因型均符合HardyWeinberg遗传平衡定律;治疗有效组BTLA rs3112270位点AG、GG基因型比例、rs1982809位点GA、AA比例、rs16859629位点CC基因型、CTLA-4 rs231775位点AA基因型比例、rs3087243位点GA、AA基因型低于疾病进展组,BTLA rs3112270位点AA基因型比例、rs1982809位点GG比例、rs16859629位点TT基因型、CTLA-4 rs231775位点GG基因型比例、rs3087243位点GG基因型高于疾病进展组(P<0.05);单因素、多因素分析显示,BTLA rs3112270 A>G、rs1982809 G>A、rs16859629 T>C、CTLA-4 rs231775 A>G、rs3087243 G>A与疗效相关(P<0.05);BTLA rs3112270位点AA、AG基因型患者18个月生存率高于GG基因型患者,rs1982809位点GG、GA基因型患者18个月生存率高于AA基因型患者,rs16859629位点TT基因型患者18个月生存率高于TC、CC基因型患者(P<0.05);CTLA-4 rs231775位点GG、GA基因型患者18个月生存率高于AA基因型患者、rs3087243位点GG基因型18个月生存率高于GA、AA基因型患者(P<0.05);单因素、多因素分析显示,BTLA rs3112270 A>G、rs1982809 G>A、rs16859629 T>C、CTLA-4 rs231775 A>G、rs3087243G>A与生存预后相关(P<0.05)。结论BTLA基因rs3112270、rs1982809、rs16859629、CTLA-4基因rs231775、rs3087243位点多态性与肝癌TACE联合靶向治疗疗效、预后密切相关,以期为预估TACE治疗提供参考。 展开更多
关键词 BTLA CTLA-4 基因多态性 肝癌 TACE 靶向治疗 疗效 预后 相关性
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哮喘患儿外周血炎症因子及肺功能水平与TLR4基因多态性的相关性研究
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作者 刘洋 王爽 +1 位作者 李权伦 张超 《广东医学》 CAS 2023年第10期1273-1278,共6页
目的分析儿童哮喘患者外周血炎症因子及肺功能水平与Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因多态性的相关性。方法收集近3年收治急性发作期哮喘患儿172例作为实验组,并根据哮喘患儿发病的严重程度将哮喘分为轻度、中度、重度和危重... 目的分析儿童哮喘患者外周血炎症因子及肺功能水平与Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因多态性的相关性。方法收集近3年收治急性发作期哮喘患儿172例作为实验组,并根据哮喘患儿发病的严重程度将哮喘分为轻度、中度、重度和危重级,选取同期健康体检儿童136例作为对照组,测定各组受试者肺功能指标第1秒用力呼气容积(FEV1)占用力肺活量(FVC)百分比(FEV1/FVC%)和呼出气一氧化氮(FeNO)水平比,采集研究对象的外周静脉血,应用ELISA法检测白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)、γ干扰素(interferon-γ,IFN-γ)表达水平,采用血球计数仪检测外周血嗜酸性粒细胞百分率(Eos),利用化学发光发检测血清总IgE,聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RELP)技术检测TLR4基因Asp299Gly(A/G)和Thr399Ile(C/T)位点单核苷酸多态性,分析以上基因多态性与儿童哮喘的相关性。结果哮喘患儿外周血中IL-4、Eos、IgE及FeNO水平比显著高于对照组,IFN-γ和肺功能指标FEV1/FVC%的水平显著低于对照组(均P<0.05)。实验组及对照组TLR4基因Asp299Gly基因型和等位基因分布相比,差异无统计学意义(P>0.05),而Thr399Ile基因型和等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05),其中实验组T等位基因分布频率显著高于对照组(P<0.05)。TLR4基因Thr399Ile多态性与哮喘患儿外周血Eos、IgE的水平、肺功能指标FEV1/FVC%无相关性(P>0.05),但携带Thr399Ile TT基因型哮喘患儿的IL-4和FeNO水平比高于CC和CT基因型,IFN-γ的水平低于CC和CT基因型(P<0.05)。有序logistic回归分析显示携带Thr399Ile TT基因型哮喘患儿比携带CC和TC基因型者哮喘发病程度更严重,二元logistic回归分析结果显示TLR4基因Thr399Ile多态性与儿童哮喘具有相关性。结论TLR4 SNPs与哮喘患儿体内免疫球蛋白IgE、Eos、肺功能指标FEV1/FVC(%)水平无关,但与哮喘严重程度及IL-4、IFN-γ、FeNO水平比相关,TLR4、IL-4、IFN-γ参与儿童哮喘的过程,并可能是哮喘由轻症进展成重症的关键因子,同时TLR4基因Thr399Ile位点多态性与儿童哮喘存在较大关联。 展开更多
关键词 儿童哮喘 TOLL样受体4 基因多态性 肺功能 IL-4 IFN-Γ
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lncRNA SNHG1靶向miR-145-5p/PDCD4轴对缺氧/复氧诱导的心肌细胞凋亡的影响
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作者 李红英 张会军 +2 位作者 王军 穆秀娥 李红方 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第10期904-909,916,共7页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)核内小RNA宿主基因1(SNHG1)靶向miR-145-5p/程序性细胞死亡因子4(PDCD4)轴对缺氧/复氧(H/R)诱导的心肌细胞凋亡的影响。方法将H9c2细胞分为对照组(NC组)、H/R组、si-NC组、si-SNHG1组、mimic NC组、miR-14... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)核内小RNA宿主基因1(SNHG1)靶向miR-145-5p/程序性细胞死亡因子4(PDCD4)轴对缺氧/复氧(H/R)诱导的心肌细胞凋亡的影响。方法将H9c2细胞分为对照组(NC组)、H/R组、si-NC组、si-SNHG1组、mimic NC组、miR-145-5p mimic组、si-SNHG1+inhibitor NC组、si-SNHG1+miR-145-5p inhibitor组。除NC组外,其他组H9c2细胞均需转染对应物质后构建H/R模型。实时定量PCR(qRT-PCR)检测H9c2细胞中SNHG1、miR-145-5p表达;CCK-8法、流式细胞术分别检测细胞增殖、凋亡;试剂盒检测H9c2细胞中超氧化物歧化酶(SOD)活性、丙二醛(MDA)含量;Western blotting检测H9c2细胞中PDCD4、caspase 3、Bcl-2、Bax蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验验证SNHG1与miR-145-5p、miR-145-5p与PDCD4的关系。结果沉默SNHG1或过表达miR-145-5p可促进H/R诱导的H9c2细胞中miR-145-5p表达和细胞增殖,抑制PDCD4蛋白表达、细胞凋亡和氧化应激。miR-145-5p inhibitor减弱了沉默SNHG1对H/R诱导的H9c2细胞中miR-145-5p表达和细胞增殖的促进作用,以及对PDCD4蛋白表达、细胞凋亡、氧化应激的抑制作用。SNHG1靶向调控miR-145-5p/PDCD4轴。结论沉默SNHG1可能通过调控miR-145-5p/PDCD4轴抑制H/R诱导的H9c2细胞凋亡。 展开更多
关键词 核内小RNA宿主基因1 miR-145-5p 程序性细胞死亡因子4 凋亡 心肌细胞
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绵羊SMAD 4基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
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作者 王丹 张新玉 +5 位作者 付佳棋 贾琪 张双双 崔成都 张立春 孙福亮 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期4783-4792,共10页
【目的】克隆绵羊SMAD同源物4(SMAD4)基因并探究其在绵羊中的生物学功能,为研究SMAD 4基因在毛囊生长发育过程中的调控作用提供依据。【方法】以小尾寒羊皮肤组织cDNA为模板,PCR扩增SMAD 4基因CDS区并克隆测序,对其进行生物信息学分析;... 【目的】克隆绵羊SMAD同源物4(SMAD4)基因并探究其在绵羊中的生物学功能,为研究SMAD 4基因在毛囊生长发育过程中的调控作用提供依据。【方法】以小尾寒羊皮肤组织cDNA为模板,PCR扩增SMAD 4基因CDS区并克隆测序,对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR检测SMAD 4基因在小尾寒羊和新吉细毛羊心脏、肝脏、脾脏、肾脏、皮肤和肌肉中的表达量。【结果】试验成功克隆小尾寒羊SMAD 4基因CDS区,长1662 bp,编码553个氨基酸。系统进化树分析显示,绵羊SMAD 4基因核苷酸序列与山羊和牦牛的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。生物信息学分析发现,SMAD4蛋白为不含信号肽的非跨膜蛋白,存在磷酸化和糖基化位点,属于亲水性蛋白,主要存在于细胞核中;SMAD4蛋白二级结构以无规则卷曲为主,与三级结构预测结果一致;蛋白互作分析显示,SMAD4蛋白与SMAD2、SMAD1、TGFBR1、TGFBR2、SMAD3等蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示,SMAD 4基因在绵羊中广泛表达;与新吉细毛羊相比,小尾寒羊心脏、脾脏和皮肤中SMAD 4基因表达量均显著上升(P<0.05),而肺脏和肌肉中SMAD 4基因表达量均显著下降(P<0.05)。【结论】试验成功克隆绵羊SMAD 4基因CDS区,该基因在绵羊各组织中均有表达,且在小尾寒羊和新吉细毛羊心脏、脾脏、皮肤、肺脏和肌肉中存在显著差异。试验结果为进一步探究绵羊SMAD 4基因调控毛囊发育提供理论依据。 展开更多
关键词 绵羊 SMAD 4基因 克隆 生物信息学 表达
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Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9和周期素依赖性激酶4在结直肠息肉、结直肠癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 赵玉红 张磊 +2 位作者 古彩喆 张东姣 杨卫振 《安徽医药》 CAS 2023年第6期1170-1174,共5页
目的 探究Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9(SOX9)和周期素依赖性激酶4(CDK4)在结直肠息肉、结直肠癌中的表达及意义。方法 选取中国人民解放军第八十二集团军医院2015年1月至2017年6月收治的结直肠癌病人病理组织标本(结直肠癌... 目的 探究Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9(SOX9)和周期素依赖性激酶4(CDK4)在结直肠息肉、结直肠癌中的表达及意义。方法 选取中国人民解放军第八十二集团军医院2015年1月至2017年6月收治的结直肠癌病人病理组织标本(结直肠癌组)94例及癌旁正常结直肠组织(正常结直肠组)39例,另取同时期结直肠息肉病人结直肠息肉组织(结直肠息肉组)51例。采用免疫组织化学SP染色法检测SOX9、CDK4的表达情况,分析SOX9、CDK4表达与结直肠癌病人临床病理参数之间的关系;对结直肠癌病人进行术后复查随访,分析结直肠癌病人生存情况。结果 SOX9在正常结直肠组织、结直肠息肉组织和结直肠癌组织中的阳性表达率分别为10.26%(4/39)、27.45%(14/51)、76.59%(72/94),差异有统计学意义(P<0.05);CDK4在正常结直肠组织、结直肠息肉组织和结直肠癌组织中的阳性表达率分别为7.69%(3/39)、21.57%(11/51)、54.84%(51/94),差异有统计学意义(P<0.05);正常结直肠组织中SOX9、CDK4蛋白表达水平低于结直肠息肉组织、结直肠癌组织(P<0.05),结直肠息肉组织中SOX9、CDK4蛋白表达水平低于结直肠癌组织(P<0.05)。结直肠癌病人病理组织SOX9、CDK4表达与肿瘤分化程度、临床分期、是否合并淋巴结转移有关(P<0.05);结直肠癌组织SOX9与CDK4表达呈正相关(r=0.58,P<0.001),由TCGA数据库检索结直肠癌组织SOX9、CDK4基因表达相关性显示,二者之间亦呈正相关(r=0.40,P<0.001);SOX9高表达、低表达病人术后3年累积生存率分别为44.6%、72.4%,两组比较Log-rank检验差异有统计学意义(χ^(2)=8.31,P=0.004);CDK4高表达、低表达病人术后3年累积生存率分别为25.6%、76.5%,两组比较Log-rank检验差异有统计学意义(χ^(2)=36.36,P<0.001)。结论 SOX9和CDK4在结直肠癌组织、结直肠息肉组织、正常结直肠组织中的阳性表达率逐渐降低,与结直肠癌肿瘤分化程度、临床分期、淋巴结转移情况及预后有关,可能参与结直肠癌的发生发展过程。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 Y染色体性别决定区相关高速泳动族框因子9 周期素依赖性激酶4 基因表达 细胞分化 淋巴转移
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CTLA-4基因多态性及其相关蛋白与原发性胆汁性胆管炎的相关性
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作者 冯婧 黄祎 +1 位作者 王琴 黄山 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第2期244-248,共5页
目的 研究细胞毒性T淋巴细胞抗原4(CTLA-4)基因多态性及其相关蛋白与原发性胆汁性胆管炎(PBC)的关系,为诊断PBC寻找新的血清学指标。方法 选取2019年10月至2021年10月重庆市中医院PBC患者共78例为病例组,选择同时期本院的健康体检者60... 目的 研究细胞毒性T淋巴细胞抗原4(CTLA-4)基因多态性及其相关蛋白与原发性胆汁性胆管炎(PBC)的关系,为诊断PBC寻找新的血清学指标。方法 选取2019年10月至2021年10月重庆市中医院PBC患者共78例为病例组,选择同时期本院的健康体检者60例为对照组,检测两组的rs231775、rs3087243单核苷酸多态性(SNP),及外周血全CTLA-4、可溶性CTLA-4(sCTLA-4)的浓度,并分析CTLA-4、sCTLA-4与ALT、AST、GGT、ALP的相关性。结果 rs231775、rs3087243经PCR扩增后目的基因为分别为534 bp、283 bp。病例组rs231775的AG基因型比例、GG基因型比例、G等位基因频率及rs3087243的GA基因型比例均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),且四者与PBC患病风险存在差异无统计学意义(P<0.05),两组rs3087243等位基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05);病例组外周血CTLA-4、sCTLA-4浓度明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);相关性分析显示CTLA-4水平与GGT水平成负相关(P<0.05),sCTLA-4与ALT、AST、GGT、ALP差异无统计学意义(P>0.05);ROC曲线显示CTLA-4诊断为PBC的的敏感度为85.00%、特异度为71.40%,曲线下面积(AUC)为0.827。结 论rs231775的AG基因型、GG基因型、G等位基因与PBC患病风险存在明显相关性;CTLA-4与GGT存在明显相关性,并且能够对PBC做出较准确诊断。 展开更多
关键词 CTLA-4 基因多态性 原发性胆汁性胆管炎 SCTLA-4
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下调糖磺基转移酶4基因表达对食管癌细胞增殖和侵袭的影响
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作者 李慧 褚菲菲 +1 位作者 张勇 吴慧丽 《河南医学研究》 CAS 2023年第5期773-777,共5页
目的探讨糖磺基转移酶4(CHST4)基因对食管癌细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法通过基因表达谱在线分析平台(GEPIA)分析CHST4基因在食管癌患者和正常人中的表达。通过shRNA技术干扰CHST4在食管癌细胞中的表达,然后通过实时荧光定量聚合... 目的探讨糖磺基转移酶4(CHST4)基因对食管癌细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。方法通过基因表达谱在线分析平台(GEPIA)分析CHST4基因在食管癌患者和正常人中的表达。通过shRNA技术干扰CHST4在食管癌细胞中的表达,然后通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测CHST4的干扰效果。采用CCK-8、克隆形成、划痕、Transwell、流式细胞和Western blot等技术分析阴性对照组和sh-CHST4组食管癌细胞的增殖、迁移、侵袭、凋亡和相关蛋白的表达。结果通过GEPIA分析发现CHST4在食管癌患者中的表达高于正常人(P<0.05);CHST4在食管癌细胞中的表达高于正常食管上皮细胞(P<0.05);相比阴性对照组,sh-CHST4组细胞的增殖和克隆形成能力降低,细胞的迁移和侵袭能力降低,细胞凋亡增加,细胞迁移相关蛋白的表达降低(P<0.05)。结论CHST4基因在食管癌的发生和发展中起促进作用,除此之外,CHST4基因能够成为治疗食管癌的理想靶点。 展开更多
关键词 食管癌 糖磺基转移酶4基因 迁移 侵袭 增殖 凋亡
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疣鼻天鹅TLR4基因克隆及生物信息学分析
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作者 于鑫 胡玉苗 +4 位作者 李芳兵 杨亚东 赵金 冯亚莉 张莹 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3469-3479,共11页
【目的】克隆疣鼻天鹅Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步探索疣鼻天鹅TLR4蛋白抗病原微生物免疫机制提供重要参考依据。【方法】利用PCR扩增并克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS序列,应用NC... 【目的】克隆疣鼻天鹅Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因,并对其编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步探索疣鼻天鹅TLR4蛋白抗病原微生物免疫机制提供重要参考依据。【方法】利用PCR扩增并克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS序列,应用NCBI-BLAST、Mega-X软件进行序列比对并构建系统进化树;利用ProtParam、SWISS-MODEL等软件预测TLR4基因编码蛋白的结构、功能及与宿主蛋白的相互作用关系,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】试验成功克隆疣鼻天鹅TLR4基因CDS区序列,全长2550 bp,已提交至NCBI,登录号为:OP908241。疣鼻天鹅TLR4基因CDS区序列中存在79个稀有密码子,其中含6段连续稀有密码子,编码849个氨基酸,与灰雁和鸿雁相似度较高,亲缘关系最近。TLR4蛋白的跨膜结构域位于第647―667位氨基酸处,N-端包含由36个氨基酸组成的信号肽,信号肽切割位点在第36―37位氨基酸之间,置信度为67.85%,含有10个N-糖基化位点和85个磷酸化位点,是亲水性蛋白,主要存在于细胞质中,与人TLR4蛋白有相似的三级结构,相似率为45.48%。TLR4蛋白共存在10个主要互作蛋白,富集得到96个GO功能条目和7条KEGG通路,其中GO功能条目包括物种间相互作用、免疫反应、应激反应、信号转导等;KEGG通路包括甲型流感、单纯疱疹病毒Ⅰ型感染及沙门氏菌感染等。【结论】疣鼻天鹅TLR4基因与灰雁和鸿雁亲缘关系最近,有明显的密码子种属选择性,含有6段连续稀有密码子,其蛋白存在跨膜结构域和信号肽,并与天然免疫应答、信号转导和应激反应密切相关。 展开更多
关键词 疣鼻天鹅 TLR4基因 克隆 蛋白相互作用网络 GO功能 KEGG通路
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