外泌体hsa-miR-522-3p通过调节CDK6参与卵巢癌进程

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作者 李亚 张芳 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第23期4334-4340,共7页

目的:探讨外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生发展中的作用及其潜在机制。方法:采用荧光实时定量PCR检测hsa-miR-522-3p在组织和细胞中的表达水平。使用EdU、Transwell和流式细胞术检测外泌体hsa-miR-522-3p对卵巢癌细胞增殖、迁移、侵... 目的:探讨外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生发展中的作用及其潜在机制。方法:采用荧光实时定量PCR检测hsa-miR-522-3p在组织和细胞中的表达水平。使用EdU、Transwell和流式细胞术检测外泌体hsa-miR-522-3p对卵巢癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。通过荧光素酶测定和蛋白质印迹评估hsa-miR-522-3p对CDK6表达的调控作用。进一步构建裸鼠成瘤模型验证外泌体hsa-miR-522-3p对肿瘤生长的影响。结果:本研究发现hsa-miR-522-3p在卵巢癌组织、血浆外泌体及卵巢癌细胞的外泌体中表达显著升高。与NC组比较,hsa-miR-522-3p模拟物组细胞的迁移和侵袭能力显著增高且差异具有统计学意义(P<0.05)。此外,hsa-miR-522-3p抑制剂组可以促进caspase3和Bax的表达并抑制Bcl2的表达。荧光素酶报告结果显示,hsa-miR-522-3p能够靶向结合CDK6的3′-非翻译区(3′-UTR)来抑制其表达。裸鼠成瘤结果表明,外泌体hsa-miR-522-3p可增加瘤的体积及重量。结论:外泌体hsa-miR-522-3p通过调节CDK6参与卵巢癌的进程。本研究的发现将为外泌体hsa-miR-522-3p在卵巢癌发生中的机制提供新的见解。 展开更多

关键词 卵巢癌 外泌体 hsa-mir-522-3p CDK6

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hsa-miR-22-3p靶基因预测及功能分析

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作者 张伟 周涛 蒙国鑫 《中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生》 2024年第2期0196-0200,共5页

本研究旨在通过生物信息学分析,预测和验证hsa-miR-22-3p的靶基因,并探讨其在不同物种、组织和信号通路中的功能。方法 本研究利用了多种在线数据库和软件,如miRBase、ClustalOmega、Cytoscape3.6.1等,进行了对不同物种间的miR-22-3p保... 本研究旨在通过生物信息学分析,预测和验证hsa-miR-22-3p的靶基因,并探讨其在不同物种、组织和信号通路中的功能。方法 本研究利用了多种在线数据库和软件,如miRBase、ClustalOmega、Cytoscape3.6.1等,进行了对不同物种间的miR-22-3p保守性分析。预测hsa-miR-22-3p的靶基因,绘制Venn图,得到交集靶基因集合。对交集靶基因进行GO功能注释和KEGG Pathway富集分析,探索其在生物过程和信号通路中的作用。预测交集靶基因编码蛋白质之间的相互作用关系,构建蛋白蛋白互作网络图谱,筛选出核心基因。结果 miR-22-3p是一种在多种生物中高度保守的miRNA,与心肌细胞分化和心血管疾病密切相关。hsa-miR-22-3p的36个交集靶基因在肿瘤、淋巴和腹腔等组织中表达较高,参与了组蛋白修饰、染色质重构、低氧应答等276个生物学过程,在乳腺癌、雌激素、FoxO、破骨细胞分化、肿瘤、PI3KAkt等8个信号通路中显著富集。hsa-miR-22-3p的10个核心基因ESR1、SIRT1、PTEN、CREB1、SP1、HDAC4、MECP2、YWHAZ、MAPK14、SNAI1在多种疾病中发挥重要作用,如肿瘤、糖尿病、神经退行性疾病、炎症、衰老、心肌肥厚、心肌缺血再灌注、心房纤维化、动脉粥样硬化等。结论 本研究为hsa-miR-22-3p在肿瘤、心血管等多种疾病中的关键调控机制提供了新的理解,也为肿瘤、心血管等疾病的早期诊疗提供了新的思路。 展开更多

关键词 hsa-mir-22-3p 靶基因 生物信息学

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hsa-miR-877-3p通过靶向MCM10调控卵巢癌细胞迁移和活性氧产生 被引量：1

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作者 彭琴 崔小波 +3 位作者 孙冰纯 罗辉 莫坚 吴斌华 《广东医科大学学报》 2023年第3期259-265,共7页

目的探讨has-miR-877-3p调控卵巢癌细胞迁移和活性氧(ROS)产生的作用机制。方法运用生物信息学分析hsa-miR-877-3p在卵巢癌组织中表达,RT-qPCR检测卵巢癌细胞株中hsa-miR-877-3p表达。构建hsa-miR-877-3p过表达及抑制SKOV3细胞,RNA干扰... 目的探讨has-miR-877-3p调控卵巢癌细胞迁移和活性氧(ROS)产生的作用机制。方法运用生物信息学分析hsa-miR-877-3p在卵巢癌组织中表达,RT-qPCR检测卵巢癌细胞株中hsa-miR-877-3p表达。构建hsa-miR-877-3p过表达及抑制SKOV3细胞,RNA干扰技术敲低SKOV3细胞中MCM10基因,划痕实验及流式细胞术分别检测细胞迁移、ROS水平。结果hsa-miR-877-3p在卵巢癌中表达低于正常组织(P<0.01),其在卵巢癌细胞株SKOV3、A2780、A1847和8910中表达也降低(P<0.01)。hsa-miR-877-3p过表达抑制SKOV3细胞迁移、增加ROS水平(P<0.01),而抑制hsa-miR-877-3p表达增加SKOV3细胞迁移(P<0.01)。MCM10基因沉默抑制SKOV3细胞迁移、促进ROS表达(P<0.01)。结论hsa-miR-877-3p可以通过调控MCM10基因抑制SKOV3细胞迁移并提高其活性氧水平。 展开更多

关键词 卵巢癌 hsa-mir-877-3p MCM10 活性氧

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肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平及其临床诊断价值分析

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作者 罗兴红 杨柳 +2 位作者 董琪 田爱霞 龙丹 《临床外科杂志》 2023年第9期852-855,共4页

目的检测肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2(lncRNA BSN-AS2)、hsa-miR-4782-3p表达水平,并分析两者在肝癌中的临床诊断价值。方法选取2018年3月~2020年3月在我院诊治的肝癌病人100例为研究组,另取同期体检健康者90例为对照组。采用... 目的检测肝癌病人血清中长链非编码RNA BSN-AS2(lncRNA BSN-AS2)、hsa-miR-4782-3p表达水平,并分析两者在肝癌中的临床诊断价值。方法选取2018年3月~2020年3月在我院诊治的肝癌病人100例为研究组,另取同期体检健康者90例为对照组。采用实时定量聚合酶链式反应法(qRT-PCR)检测病人血清中lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p的表达水平;采用Spearman等级相关分析血清中lncRNA BSN-AS2与hsa-miR-4782-3p表达的相关性,同时分析二者与临床病理特征的关系;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平对肝癌的诊断效能。结果研究组血清lncRNA BSN-AS2的表达水平为(2.02±0.59),显著高于对照组的(1.05±0.25),研究组血清hsa-miR-4782-3p的表达水平为(0.69±0.15),低于对照组的(1.08±0.29),两组比较差异有统计学意义(P<0.05)。血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p表达水平与TNM分期、分化程度、甲胎蛋白(AFP)有关(P<0.05)。Spearman等级相关分析显示,肝癌病人血清lncRNA BSN-AS2与hsa-miR-4782-3p表达呈负相关(r=-0.536,P<0.05)。血清lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3单独及联合诊断肝癌的AUC分别是0.890、0.856和0.937,灵敏度分别为87.00%、93.00%和86.00%,特异度分别为78.89%、70.00%和92.22%;二者联合优于lncRNA BSN-AS2、hsa-miR-4782-3p各自单独预测(Z^(二者联合-lncRNA BSN-AS)=2.481、P=0.013,Z_(二者联合-hsa-miR-4782-3P)=3.503,P=0.001)。结论肝癌病人血清lncRNA BSN-AS2表达水平显著升高,hsa-miR-4782-3p水平显著降低,可作为诊断肝癌的潜在分子标志物。 展开更多

关键词 肝癌 长链非编码RNA BSN-AS2 hsa-mir-4782-3p 临床诊断

原文传递

Hsa-miR-98-5p/DKK3信号轴对乳腺癌细胞生物学行为的影响 被引量：3

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作者 姚嘉 李冠乔 +1 位作者 杨时平 苏慧銮 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期807-816,共10页

背景与目的:乳腺癌威胁着全世界女性的健康。虽然已发现大量微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,但仍需要构建一个完整的miRNA-信使RNA(messenger RNA,mRNA)网络。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据... 背景与目的:乳腺癌威胁着全世界女性的健康。虽然已发现大量微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,但仍需要构建一个完整的miRNA-信使RNA(messenger RNA,mRNA)网络。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载乳腺癌相关数据集,分析肿瘤组织与正常组织之间差异表达的miRNA。利用miRDB、miRTarBase和StarBase数据库分析差异miRNA靶向的基因。使用R语言中的ClusterProfiler包对靶基因进行富集分析。使用String数据库联合Cytoscape 3.6.2软件进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析及Hub基因的筛选;构建miRNA-Hub mRNA调控网络确定研究信号轴,然后通过细胞实验进行验证。结果:采用TCGA数据集识别出两个差异miRNAs。3个数据库取交集预测得到278个靶基因。共鉴定出10个Hub基因,从构建的miRNA-Hub基因网络图中发现,hsa-miR-98-5p/DKK3轴可能在乳腺癌的进展中起关键作用。细胞功能学实验证实hsa-miR-98-5p可抑制细胞凋亡,促进细胞的增殖、迁移和侵袭。双荧光素酶报告基因实验进一步验证了hsa-miR-98-5p与DKK3的结合作用。结论:本研究首先通过生物信息学分析鉴定出一个与乳腺癌进展相关的hsa-miR-98-5p/DKK3轴,初步证实hsa-miR-98-5p可通过靶向DKK3抑制乳腺癌细胞凋亡,促进细胞的增殖、迁移和侵袭。 展开更多

关键词 乳腺癌 hsa-mir-98-5p DKK3 双荧光素酶活性报告实验

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Hsa-miR-21-3p对食管癌细胞运动与侵袭能力的影响 被引量：1

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作者 石亚娟 刘辉 刘冉 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2013年第6期422-425,共4页

目的:研究hsa-miR-21-3p对人食管癌细胞Eca9706侵袭和迁移能力的影响。方法:采用终浓度为30 nmol/L的寡核苷酸hsa-miR-21-3p mimics和阴性对照转染Eca9706细胞48 h后,用实时荧光定量PCR检测转染后hsa-miR-21-3p的表达水平,通过Transwel... 目的:研究hsa-miR-21-3p对人食管癌细胞Eca9706侵袭和迁移能力的影响。方法:采用终浓度为30 nmol/L的寡核苷酸hsa-miR-21-3p mimics和阴性对照转染Eca9706细胞48 h后,用实时荧光定量PCR检测转染后hsa-miR-21-3p的表达水平,通过Transwell体外侵袭试验和划痕愈合试验分别观察hsa-miR-21-3p对Eca9706细胞侵袭和迁移能力的影响。结果:与阴性对照组相比4较,hsa-miR-21-3p mimics转染组细胞中hsa-miR-21-3p表达明显升高(P<0.01),是阴性对照的1.1×10倍;Transwell体外侵袭试验结果显示镜下每个视野穿膜细胞数试验组(76.67±6.11)较阴性对照组(42.33±2.52)增加了81.1%(P<0.01),表明hsa-miR-21-3p的过表达显著增强食管癌细胞的侵袭能力;划痕愈合试验结果显示,hsa-miR-21-3p试验组的划痕宽度较对照组窄,在相同的时间点,试验组的划痕愈合能力均大于对照组(P<0.01),说明转染了hsa-miR-21-3p mimics的试验组细胞的迁移能力大于对照组。结论:Hsa-miR-21-3p的高表达可以使人食管癌细胞Eca9706的侵袭和迁移能力增强,提示其可能参与了食管癌进程中的浸润和转移。 展开更多

关键词 食管癌细胞 hsa-mir-21-3p 侵袭 迁移

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hsa-miR-342-3p 生物信息学分析 被引量：1

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作者 马占兵 耿芝 +1 位作者 焦海燕 霍正浩 《生物信息学》 2015年第4期212-219,共8页

通过生物信息学方法预测hsa-miR-342-3p靶基因及其功能机制。检索Pub Med有关hsa-miR-342-3p的研究报道并进行功能分析;检索miRBase获取hsa-miR-342-3p序列;通过Target Scan,Pictar和PITA数据库预测靶基因并取交集,对其进行组织和疾病... 通过生物信息学方法预测hsa-miR-342-3p靶基因及其功能机制。检索Pub Med有关hsa-miR-342-3p的研究报道并进行功能分析;检索miRBase获取hsa-miR-342-3p序列;通过Target Scan,Pictar和PITA数据库预测靶基因并取交集,对其进行组织和疾病特异性表达谱分析、功能富集分析(GO enrichment analysis)、信号转导通路富集分析(Pathway enrichment analysis)和蛋白质相互作用网络分析(PPI analysis)。结果发现:hsa-miR-342-3p序列在多物种间具有高度保守性;hsa-miR-342-3p在肾脏组织和急性淋巴细胞性白血病、乳腺癌疾病中表达水平较高(RPM≥1 000);预测得到14个hsa-miR-342-3p靶基因;靶基因分子功能分别富集于转化生长因子活性、DNA结合和蛋白激酶激活等(P<0.05);hsa-miR-342-3p靶基因GO生物学过程主要集中于大分子代谢抑制,肺部组织发育、呼吸系统发育及管状组织发育建成(P<0.05);细胞信号通路主要富集于TGF-Beta信号通路、细胞因子、受体作用信号通路及前列腺疾病信号通路(P<0.01)。hsa-miR-342-3p在体内分布广泛,预测的靶向TGF-Beta信号通路可能在疾病发生中发挥重要调控作用,是具有潜在研究价值的生物学靶标。 展开更多

关键词 hsa-mir-342-3p 靶基因 基因本体 信号通路 生物信息学

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hsa-miR-192-3p的靶基因预测及功能分析 被引量：2

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作者 刘超群 张新生 张越 《生物信息学》 2018年第4期262-268,共7页

通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsamiR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3. 0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的... 通过生物信息学方法预测hsa-miR-192-3p的靶基因及其靶基因的可能功能。首先通过miRbase在线数据库对hsamiR-192-3p的碱基序列及序列在各物种间的保守性进行分析,再通过miRGator v3. 0在线数据库查看hsa-miR-192-3p在各个组织器官中的表达丰富度情况;其次,应用Target Scan和miRanda在线数据库预测hsa-miR-192-3p的靶基因;最后,将预测得到的两个数据库的靶基因交集用DAVID在线数据库进行功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果表明:hsa-miR-192-3p在人、家鼠、猕猴等生物中存在高度保守性; hsa-miR-192-3p在胃肠道、肾脏、肝胆系统、干细胞、鼻、脾、胸腺中表达丰富度较高;通过两个靶基因预测软件预测的靶基因取交集后共有190个;功能富集分析发现hsa-miR-192-3p靶基因富集在细胞质、细胞核、质膜、高尔基体等15个细胞组件(p<0. 05),参与蛋白结合、GTP酶活性、锌离子跨膜转运蛋白活性等7个分子功能(p<0. 05),涉及金属离子运输、RNA聚合酶II启动子的转录阳性调控、基因表达调节、钙离子跨膜运输、胚胎发育等18个生物过程(p<0. 05);预测靶基因集合显著富集于癌症通路与催乳素信号通路中(p<0. 05)。得出结论:hsa-miR-192-3p预测的靶基因集合富集于多个生物过程,与肿瘤密切相关,生物信息预测为今后的研究奠定了一定的理论基础,为后续实验验证提供了研究方向。 展开更多

关键词 hsa-mir-192-3p 信号转导通路 功能富集分析 癌症

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Hsa-miR-6841-3p对宫颈癌细胞系Caski增殖及侵袭转移的影响 被引量：5

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作者 裴桂华 殷复粉 +5 位作者 王宁 孙欣 于啸 孙业武 于风胜 王言奎 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第8期566-570,共5页

目的:探讨miRNA-6841-3p对宫颈癌细胞生物学行为的影响。方法:将miRNA-6841-3p模拟物、miRNA-6841-3p抑制物转染至宫颈癌细胞系Caski。实时荧光定量PCR检测宫颈癌细胞系Caski转染后miRNA-6841-3p mRNA以及其预测靶基因TFF3的转录表达。C... 目的:探讨miRNA-6841-3p对宫颈癌细胞生物学行为的影响。方法:将miRNA-6841-3p模拟物、miRNA-6841-3p抑制物转染至宫颈癌细胞系Caski。实时荧光定量PCR检测宫颈癌细胞系Caski转染后miRNA-6841-3p mRNA以及其预测靶基因TFF3的转录表达。CCK-8法检测细胞增殖能力。Transwell小室检测细胞体外侵袭转移能力。划痕实验检测细胞迁移能力。结果:实时荧光定量PCR显示,miRNA-6841-3p模拟物转染组与miRNA-6841-3p模拟物对照组相比,miRNA-6841-3p mRNA表达明显上调(P<0.01),miRNA-6841-3p抑制物转染组miRNA-6841-3p mRNA转录表达明显受抑制,差异有统计学意义(P<0.01)。其预测靶基因TFF3 mRNA转录表达在miRNA-6841-3p模拟物转染组明显低于抑制物转染组(P<0.01)。与miRNA-6841-3p抑制物转染组比较,转染miRNA-6841-3p模拟物后,宫颈癌细胞系Caski细胞活性、迁移侵袭能力明显减弱(P<0.05)。结论:上调miRNA-6841-3p表达可明显抑制宫颈癌细胞系Caski增殖,抑制其迁移、侵袭能力,其作用机制可能通过抑制预测靶基因TFF3表达实现。 展开更多

关键词 hsa-mir-6841-3p 宫颈癌 CASKI细胞 增殖 侵袭 转移

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以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对NCI-H446细胞生物学特性的影响 被引量：3

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作者 官士珍 付玉荣 +3 位作者 伊正君 李猛 裴景亮 高昆山 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期171-176,共6页

背景与目的:miRNAs是一类小分子RNA,参与转录后调控。前期研究结果显示,hsa-miR-491-3p在肺癌和肾癌组织中高表达,目前鲜见其功能研究的报道。本研究旨在探讨以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对人小细胞肺癌NCI-H446细胞生物学特... 背景与目的:miRNAs是一类小分子RNA,参与转录后调控。前期研究结果显示,hsa-miR-491-3p在肺癌和肾癌组织中高表达,目前鲜见其功能研究的报道。本研究旨在探讨以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸对人小细胞肺癌NCI-H446细胞生物学特性的影响。方法:合成以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸和随机对照序列,转染NCI-H446细胞。实验分4组:空白对照组(组1)、空白转染组(组2)、随机对照组(组3)和反义寡核苷酸组(组4)。用四甲基偶氮唑蓝(MTT)法筛选最佳作用浓度,Hoechst33258染色检测细胞核的形态变化,流式细胞术检测细胞凋亡和周期变化,划痕实验检测细胞的迁移能力。结果:转染反义寡核苷酸后细胞生长受到抑制,最佳作用浓度为0.5μmol/L。Hoechst33258染色各组的凋亡率分别为(6.67±0.58)%、(7.00±1.00)%、(6.67±1.53)%和(26.33±1.53)%,组4的凋亡率明显高于前3组,差异有统计学意义(P<0.001)。流式细胞仪检测各组的凋亡率分别为(2.44±0.60)%、(2.59±0.85)%、(2.62±1.11)%和(5.22±0.40)%,组4的凋亡率明显高于前3组,差异有统计学意义(P<0.01),且G1期细胞增多,S期细胞减少。划痕实验显示各组细胞24 h的迁移距离分别为(196.88±39.13)、(163.06±21.28)、(225.49±23.42)和(77.41±6.07)μm,组4细胞的迁移距离小于前3组(P<0.05),迁移能力减弱。结论:以hsa-miR-491-3p为靶标的反义寡核苷酸能够抑制NCI-H446细胞增殖,诱导其凋亡,并降低其侵袭能力。 展开更多

关键词 hsa-mir-491-3p 反义寡核苷酸 细胞凋亡 NCI-H446细胞

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hsa-miR-367-3p靶基因预测及功能分析 被引量：2

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作者 张新生 郭琳琳 +4 位作者 刘超群 许何丽 窦文静 刘梦瑶 张越 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期393-397,共5页

目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase在线数据库、miRGator v3.0在线数据库TargetScan、miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高... 目的通过生物信息学方法预测hsa-miR-367-3p的靶基因及其靶基因的功能。方法运用miRbase在线数据库、miRGator v3.0在线数据库TargetScan、miRDB在线数据库和DAVID在线数据库进行预测和分析。结果 hsa-miR-367-3p在多个物种之间具有高度保守性;在干细胞中表达丰富度较高;功能富集分析发现,hsa-miR-367-3p的靶基因涉及心室发育、转录调节等38个生物过程(P <0.05),富集在神经元等21个细胞组分(P <0.05)。结论 hsa-miR-367-3p个别预测出来的靶基因与通路已经被证实,更多的预测结果需要进一步的研究加以验证。本研究为将来验证hsa-miR-367-3p的靶基因和可能调控的通路指明了方向。 展开更多

关键词 hsa-mir-367-3p 靶基因 功能富集分析

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糖尿病相关hsa-miR-223-3p靶基因预测及生物信息学分析 被引量：5

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作者 余梦娜 杨标 仰礼真 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1477-1484,共8页

目的·分析人类mi R-223-3p(hsa-miR-223-3p)的靶基因及其参与的生物学过程,并寻找与糖尿病相关的生物标志物。方法·利用starBase数据库筛选hsa-miR-223-3p靶基因,并对其行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)富集分析、京都基... 目的·分析人类mi R-223-3p(hsa-miR-223-3p)的靶基因及其参与的生物学过程,并寻找与糖尿病相关的生物标志物。方法·利用starBase数据库筛选hsa-miR-223-3p靶基因,并对其行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)和Reactome通路分析。通过构建蛋白-蛋白相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络获得中枢基因,筛选最有意义的模块,并利用Venn图对糖尿病相关的中枢基因进行分析。结果·共筛选出870个hsa-miR-223-3p靶基因。GO、KEGG和Reactome富集分析显示,靶基因主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子的调节、细胞对胰岛素刺激的反应、RNA结合等相关,且主要富集于胰岛素分泌、泛素介导的蛋白水解、雌激素依赖型基因表达等通路。PPI网络共得31个中枢基因,且中枢基因PRKACB参与胰岛素分泌通路;共筛选出3个最有意义的基因模块,其中模块1参与泛素介导的蛋白水解作用,模块2参与RNA转运和细胞周期,模块3参与内吞作用。结论·Hsa-miR-223-3p可能通过靶基因参与多种生物学过程,中枢基因PRKACB或可为糖尿病发生机制的探索提供帮助。 展开更多

关键词 糖尿病 hsa-mir-223-3p 生物信息学 模块化 基因

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乳腺癌中hsa-miR-24-3p的表达及临床意义 被引量：1

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作者 吴锦 丁克硕 +1 位作者 王浩 吴正升 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期514-517,521,共5页

目的观察hsa-miR-24-3p在乳腺癌组织中的表达及与乳腺癌临床病理特征的关系,探索其发挥作用的具体机制。方法采用组织原位杂交实验检测乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的原位表达,针对112例乳腺癌临床病理参数和相应hsa-mi... 目的观察hsa-miR-24-3p在乳腺癌组织中的表达及与乳腺癌临床病理特征的关系,探索其发挥作用的具体机制。方法采用组织原位杂交实验检测乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的原位表达,针对112例乳腺癌临床病理参数和相应hsa-miR-24-3p的表达水平进行相关性分析;预测hsa-miR-24-3p下游靶基因,通过荧光素酶报告实验和实时荧光定量PCR实验进行验证。结果在乳腺癌组织和乳腺良性病变组织中hsa-miR-24-3p的阳性率分别为36.6%(41/112)和66.7%(14/21)。hsa-miR-24-3p表达与乳腺癌患者的腋窝淋巴结转移数以及肿瘤的TNM分期呈负相关(P <0.05),与患者年龄、肿瘤直径、组织学分级、ER、PR和HER-2的表达均无显著相关性(P >0.05)。hsa-miR-24-3p表达与乳腺癌患者的无复发生存期和总体生存期呈正相关(P =0.025,P =0.019)。hsa-miR-24-3p靶向抑制RNF2的表达。结论 hsa-miR-24-3p在乳腺癌中具有抑癌功能,其可作为乳腺癌的潜在靶向治疗药物。 展开更多

关键词 乳腺肿瘤 hsa-mir-24-3p 病理意义 QRT-pCR

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早期胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及ITGA9、VEGF mRNA表达变化 被引量：2

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作者 张树红 覃超喜 孙燕 《山东医药》 CAS 2018年第42期43-45,共3页

目的观察胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及整合素9(ITGA9)、血管内皮生长因子(VEGF)mRNA表达变化,并分析其相关性。方法收集正常早孕及胚胎停育行人工流产患者各30例,采用实时荧光定量PCR法检测绒毛组织中的hsa-miR-2276-3p及IT... 目的观察胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p及整合素9(ITGA9)、血管内皮生长因子(VEGF)mRNA表达变化,并分析其相关性。方法收集正常早孕及胚胎停育行人工流产患者各30例,采用实时荧光定量PCR法检测绒毛组织中的hsa-miR-2276-3p及ITGA9、VEGF mRNA,并行Pearson相关分析法分析其相关性。结果与正常早孕者比较,胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p表达增高,而ITGA9、VEGF mRNA均表达降低(P均<0. 05)。在胚胎停育患者绒毛组织中,has-miR-2276-3p与ITGA9、VEGF mRNA的表达均呈负相关(r分别为-0. 679、-0. 528,P均<0. 05)。结论在胚胎停育患者绒毛组织中hsa-miR-2276-3p高表达而ITGA9、VEGF mRNA低表达,hsa-miR-2276-3p与ITGA9、VEGF mRNA表达呈负相关; hsa-miR-2276-3p可能负向调节ITGA9、VEGF表达,从而导致绒毛组织中血管生成减少,引起胚胎停育的发生。 展开更多

关键词 胚胎停育 绒毛组织 hsa-mir-2276-3p 整合素9 血管内皮生长因子

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miR-522-3p通过靶向调节SMAD2促进前列腺癌恶性进展 被引量：1

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作者 叶大文 关翰 +4 位作者 毛溧凯 程涛 宁晶 方文革 徐卫强 《齐齐哈尔医学院学报》 2022年第9期801-806,共6页

目的探讨miR-522-3p作为促癌基因,通过调控SMAD2促进前列腺癌恶性进展可能的机制。方法生物信息学工具筛选前列腺癌中差异表达的miRNA,预测下游调控靶点;分别在前列腺癌细胞和前列腺上皮细胞中利用荧光定量PCR检测内源性miR-522-3p表达... 目的探讨miR-522-3p作为促癌基因,通过调控SMAD2促进前列腺癌恶性进展可能的机制。方法生物信息学工具筛选前列腺癌中差异表达的miRNA,预测下游调控靶点;分别在前列腺癌细胞和前列腺上皮细胞中利用荧光定量PCR检测内源性miR-522-3p表达量;敲低前列腺癌细胞中的miR-522-3p水平后,细胞功能实验检测增殖、克隆、侵袭和迁移生物学功能的变化;敲低miR-522-3p后,利用荧光定量PCR检测前列腺癌细胞中SMAD2水平,功能实验检测细胞增殖、克隆、侵袭和迁移生物学功能的变化。结果前列腺癌细胞PC3与前列腺上皮细胞RWPE-1相比,miR-522显著高表达;敲低miR-522-3p后的PC3细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭功能显著下降;公用在线预测软件预测miR-522-3p下游靶基因交集于SMAD2,敲低miR-522-3p后PC3细胞中SMAD2水平上调;在PC3中敲低miR-522-3p的基础上再次转染si-SMAD2,SMAD2低水平的癌细胞增殖、克隆、迁移和侵袭能力均得到恢复。结论miR-522-3p通过抑制SMAD2的表达促进前列腺癌恶性进展。 展开更多

关键词 前列腺癌 miR-522-3p SMAD2

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Hsa-miR-139-3p靶基因预测及生物信息学分析 被引量：1

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作者 何楚琦 钟浩 龙鼎新 《中国现代医学杂志》 CAS 2019年第17期22-28,共7页

目的对hsa-miR-139-3p 的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p 靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法采用3 种软件预测hsa-miR-139-3p 的靶基因并对结果进行功能注释(GO)和信号通路富集分析(KEGG)。结果 hs... 目的对hsa-miR-139-3p 的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p 靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法采用3 种软件预测hsa-miR-139-3p 的靶基因并对结果进行功能注释(GO)和信号通路富集分析(KEGG)。结果 hsa-miR-139-3p 成熟序列在各物种间高度保守。获得的133 个靶基因存在于细胞各个组分,主要有转录调控、基因表达调控和蛋白连接等分子功能,并富集于发育生物学过程,涉及黏着斑信号转导以及基因信息处理等信号通路。结论 hsa-miR-139-3p 通过调控靶基因参与人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其生长发育和癌症过程是值得进一步研究的方向。 展开更多

关键词 hsa-mir-139-3p 靶基因预测 生物信息学

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miR-522-3p通过靶向结合PTEN促进心肌肥厚 被引量：1

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作者 张营 吴晟 +1 位作者 鲍海龙 刘兴德 《贵州医科大学学报》 CAS 2019年第4期406-411,共6页

目的:探讨miR-522-3p对心肌肥厚的影响及机制。方法:运用生物信息学分析GEO数据库中心力衰竭病人和正常对照人中miRNA的表达差异,采用实时定量聚合酶连反应(Real-time PCR)检测主动脉弓缩窄模型(TAC)小鼠和假手术(sham)小鼠心肌组织中... 目的:探讨miR-522-3p对心肌肥厚的影响及机制。方法:运用生物信息学分析GEO数据库中心力衰竭病人和正常对照人中miRNA的表达差异,采用实时定量聚合酶连反应(Real-time PCR)检测主动脉弓缩窄模型(TAC)小鼠和假手术(sham)小鼠心肌组织中差异表达miRNA miR-522-3p和磷酸酶及张力蛋白同源基因(PTEN)的mRNA表达;选取HEK293T细胞分别转染(miR-522-3p)类似物(miR-522-3p mimic)及类似物对照剂(mimic control)48 h,然后进行荧光报告基因实验;选取H9C2细胞分别转染miR-522-3p类似物(miR-522-3p mimic)及类似物对照剂(mimic control)48 h,利用Real-time PCR与Western blot法检测PTEN-AKT-mTOR通路相关基因的表达;将H9C2细胞分为对照组(不做处理)、AngII组(加用AngII干预细胞24 h)、miR-522-3p mimic+AngII组(转染miR-522-3p mimic 24 h后,加用AngII干预24 h)及mimic control+AngII组(转染mimic control 24 h后,加用AngII干预24 h),利用Real-time PCR与Western blot法检测心房利钠肽(ANP)、脑利钠肽(BNP)、β型肌球蛋白重链(βMHC)的表达。结果:芯片数据显示(GSE61741),在缺血性心力衰竭和非缺血性心力衰竭病人中,血液循环miR-522-3p表达明显增加,差异有统计学意义(P<0.0001);TAC小鼠中,miR-522-3p表达升高,PTEN表达下降,miR-522-3p的表达与PTEN负相关,差异有统计学意义(P<0.01);MiR-522-3p可调控PTEN/AKT-mTOR通路,过表达miR-522-3p明显使ANP、BNP、βMHC表达升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:上调miR-522-3p可通过靶向结合PTEN使心肌肥厚加重,为治疗心力衰竭提供了一个新靶标。 展开更多

关键词 miR-522-3p 心力衰竭 心肌肥厚 pTEN AKT

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LINC00261和miR-522-3p在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系 被引量：2

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作者 赖志亨 邹江 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第8期991-995,共5页

目的检测长链非编码RNA LINC00261、微小RNA-522-3p(miR-522-3p)在结直肠癌组织中的表达水平,并探讨两者的相关性及其与患者预后的关系。方法收集2013年1月至2014年12月在该院行手术切除治疗的68例结直肠癌组织及其配对的癌旁组织,应用... 目的检测长链非编码RNA LINC00261、微小RNA-522-3p(miR-522-3p)在结直肠癌组织中的表达水平,并探讨两者的相关性及其与患者预后的关系。方法收集2013年1月至2014年12月在该院行手术切除治疗的68例结直肠癌组织及其配对的癌旁组织,应用实时荧光定量PCR检测结直肠癌和癌旁组织中LINC00261、miR-522-3p的表达水平;分析LINC00261、miR-522-3p的表达与结直肠癌患者临床病理参数的关系;Kaplan-Meier生存模型分析LINC00261、miR-522-3p表达对结直肠癌患者生存率的影响;多因素Cox回归分析影响结直肠癌患者预后的独立危险因素;Pearson相关分析检测LINC00261与miR-522-3p在结直肠癌组织中表达水平的相关性。结果LINC00261在结直肠癌组织中表达水平低于其在癌旁组织中的表达水平(P<0.05),miR-522-3p在结直肠癌组织中表达水平高于其在癌旁组织中的表达水平(P<0.05)。LINC00261在结直肠癌组织中的表达水平与分化程度、临床分期和淋巴结转移情况相关(P<0.05),miR-522-3p在结直肠癌组织中的表达水平与临床分期和淋巴结转移情况相关(P<0.05)。LINC00261低表达组的预后比LINC00261高表达组预后更差(P<0.05),miR-522-3p高表达组的预后比miR-522-3p低表达组的预后更差(P<0.05)。高临床分期、低分化程度、淋巴结转移、LINC00261低表达和miR-522-3p高表达是结直肠癌患者预后不良的独立危险因素(P<0.05)。结直肠癌组织中LINC00261与miR-522-3p的表达呈负相关(P<0.05)。结论结直肠癌组织中LINC00261表达下调、miR-522-3p表达上调,二者表达呈负相关,且均与结直肠癌患者的不良病理参数和预后相关。LINC00261、miR-522-3p可能是结直肠癌潜在的预后标志物和治疗靶标。 展开更多

关键词 结直肠癌 LINC00261 miR-522-3p 相关性 预后

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肺癌组织中lncRNA ZFAS1和hsa-miR-372-3p的表达与患者恶性特征及预后的关系 被引量：3

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作者 杨晔 党荣广 +2 位作者 张静 董超 宋雪晶 《基础医学与临床》 2022年第12期1861-1866,共6页

目的探究肺癌组织中长链非编码RNA锌指结构反义转录本1(lncRNA ZFAS1)、hsa-miR-372-3p表达水平及与患者恶性特征及预后的关系。方法选取2015年3月至2016年10月在石家庄市人民医院诊治的82例肺癌患者。RT-qPCR检测肿瘤组织和癌旁组织ZF... 目的探究肺癌组织中长链非编码RNA锌指结构反义转录本1(lncRNA ZFAS1)、hsa-miR-372-3p表达水平及与患者恶性特征及预后的关系。方法选取2015年3月至2016年10月在石家庄市人民医院诊治的82例肺癌患者。RT-qPCR检测肿瘤组织和癌旁组织ZFAS1和miR-372-3p的表达,分析ZFAS1、miR-372-3p水平与肺癌患者恶性特征的关系;Pearson分析肿瘤组织中ZFAS1和miR-372-3p的关系;用Kaplan-Meier分析ZFAS1、miR-372-3p水平与肺癌患者预后生存期的关系;COX回归分析对肺癌患者预后产生影响的因素。结果与癌旁组织相比,肿瘤组织中ZFAS1、miR-372-3p表达水平均显著升高(P<0.05)。肿瘤组织ZFAS1、miR-372-3p表达水平与TNM分期、浸润胸膜、是否发生淋巴结转移、肿瘤分化程度有关(P<0.05)。肿瘤组织中ZFAS1和miR-372-3p表达水平呈显著正相关(r=0.477,P<0.001)。ZFAS1和miR-372-3p高表达组患者5年内生存率均明显低于低表达组(P<0.05)。TNM分期、淋巴结转移、ZFAS1、miR-372-3p是肺癌患者发生不良预后的独立危险因素(P<0.05)。结论肿瘤组织中ZFAS1、miR-372-3p呈异常高表达,其高水平与肺癌患者恶性特征及预后不良有关,是肺癌患者预后不良的独立危险因素。 展开更多

关键词 肺癌 长链非编码RNA 锌指结构反义转录本1 hsa-mir-372-3p

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血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义 被引量：1

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作者 宋珊珊 孙婷婷 +1 位作者 陆晓芳 杜合娟 《海南医学院学报》 CAS 2019年第3期217-220,共4页

目的:研究血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义。方法:选取我院收治的丙肝患者100例为观察组,另选我院同期体检正常者100例为对照组,观察两组研究对象血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA水平、不... 目的:研究血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测在丙肝疾病诊断中的意义。方法:选取我院收治的丙肝患者100例为观察组,另选我院同期体检正常者100例为对照组,观察两组研究对象血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA水平、不同HCV-RNA组别患者的血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p水平、HCV-RNA与血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p相关性以及联合检测与单独检测对丙肝诊断效能之间的差异。结果:观察组的hsa-miR-17-5p表达量明显高于对照组,25(OH)D_3表达水平低于对照组,HCV-RNA阳性组的hsa-miR-17-5p高于HCV-RNA阴性组,25(OH)D_3低于HCV-RNA阴性组,观察组的HCV-RNA与血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p分别呈现正、负相关,通过对联合检测和单独检测对丙肝患者诊断效能评估,发现血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p以及HCV-RNA的临界值分别为24.23μg/L,1.89相对表达量,1.22×10~3 IU/mL。hsa-miR-17-5p+25(OH)D_3+HCV-RNA联合检测的AUC面积大于单独检测。结论:血清25(OH)D_3、hsa-miR-17-5p与HCV-RNA联合检测对于丙型肝炎诊断效能较高,灵敏度较好,建议在临床应用。 展开更多

关键词 25羟基维生素D3 血清核酸序列hsa-mir-17-5p 丙型肝炎RNA 丙型肝炎 联合检测

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