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RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用机制
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作者 叶棣文 张炳杨 +2 位作者 张丹彤 马万山 逯素梅 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期132-140,共9页
目的:探讨RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用及机制。方法:收集2型糖尿病患者术中赘余皮下脂肪组织,以非2型糖尿病患者同样组织为对照,检测组间RNA m^(6)A水平。高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠构建胰岛素抵抗(in⁃sulin resis... 目的:探讨RNA m^(6)A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用及机制。方法:收集2型糖尿病患者术中赘余皮下脂肪组织,以非2型糖尿病患者同样组织为对照,检测组间RNA m^(6)A水平。高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠构建胰岛素抵抗(in⁃sulin resistance,IR)模型(HFD组,n=5,60%高脂饲料喂养16周),对照组10%低脂饲料喂养16周(CD组,n=5)。模型构建成功后,取附睾周围脂肪组织行表观转录组学m^(6)A甲基化修饰芯片检测,并借助MeRIP-qPCR实验、RT-qPCR以及RNA结合蛋白免疫沉淀测定(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RIP)实验验证胰岛素信号转导相关基因变化;进一步观察METTL3小分子抑制剂STM2457对高脂饮食诱导下小鼠胰岛素信号转导基因的影响。结果:2型糖尿病患者和小鼠IR模型脂肪组织中总体m^(6)A修饰水平均升高(患者200 ng RNA t=-8.375,P<0.001;患者100 ng RNA t=-3.722,P=0.006;患者50 ng RNA t=-4.937;P=0.001;小鼠100 ng RNA t=-3.590,P=0.023;小鼠50 ng RNA t=-2.760,P=0.025)。表观转录组学检测证实IR的脂肪组织中1175个基因发生高m^(6)A修饰,55个基因发生低m^(6)A修饰,同时有182个基因呈现高m^(6)A修饰且低表达,包括AKT2、INSR、PIK3R1、ACACA、SREBF1等5个胰岛素信号转导关键基因,其中AKT2、INSR、ACACA、SREBF1等4个基因被确证并证实其与METTL3存在直接结合,其m^(6)A修饰水平受METTL3正向调控。STM2457作用下,胰岛素敏感性提高,且AKT2、INSR、ACACA、SREBF1转录水平上调,提示IR表型改善明显。结论:高脂饮食通过METTL3诱导脂肪细胞胰岛素信号转导基因AKT2、INSR、ACACA、SREBF1发生m^(6)A高甲基化修饰,诱导其低表达,阻滞胰岛素信号转导,进而参与诱发IR。 展开更多
关键词 高脂饮食 胰岛素抵抗 RNA m^(6)a甲基修饰 胰岛素信号转导通路
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日本脑炎病毒感染宿主后m^(6)A甲基化相关蛋白的表达和定位研究
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作者 欧宇达 李晓晗 +5 位作者 陈婧 赵炳枢 陈健芃 毛玎懿 周江飞 周斌 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第2期62-68,共7页
为了研究日本脑炎病毒(JEV)感染宿主后在体内外对m^(6)A甲基化相关蛋白表达和定位的影响,本试验建立了JEV感染的C57BL/6小鼠模型及乳仓鼠肾细胞(BHK-21)模型,检测JEV感染后小鼠的脑、肾及BHK-21细胞的m^(6)A修饰水平,通过蛋白免疫印迹... 为了研究日本脑炎病毒(JEV)感染宿主后在体内外对m^(6)A甲基化相关蛋白表达和定位的影响,本试验建立了JEV感染的C57BL/6小鼠模型及乳仓鼠肾细胞(BHK-21)模型,检测JEV感染后小鼠的脑、肾及BHK-21细胞的m^(6)A修饰水平,通过蛋白免疫印迹检测小鼠脑、肾以及JEV感染不同时间点的细胞中m^(6)A相关蛋白的表达水平,共聚焦显微镜观察JEV感染细胞的m^(6)A相关蛋白的亚细胞定位变化。结果显示:与对照组相比,感染JEV后m^(6)A修饰水平极显著上升(P<0.01);感染JEV的小鼠脑、肾中m^(6)A甲基转移酶样蛋白(METTL)3表达量大幅上升,细胞中METTL3表达量随感染时间推移而逐渐增加;METTL3和METTL14的亚细胞定位发生改变,大量由细胞核转移至细胞质。综上所述,JEV可使体内外的m^(6)A水平和METTL3的表达水平上升,细胞中METTL3和METTL14的亚细胞定位改变,表明JEV的感染与m^(6)A修饰具有较强的关联性,为进一步研究m^(6)A及其相关蛋白调控JEV复制的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 日本脑炎病毒 m^(6)a甲基 甲基转移酶样蛋白3 亚细胞定位
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MeRIP-qPCR技术检测RNA m^(6)A甲基化修饰对t(8;21)AML细胞中KDM4B基因表达的调控作用
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作者 李雨晴 邵杨柳 +2 位作者 李梦月 王莉莉 高晓宁 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期382-388,共7页
目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t... 目的:通过MeRIP联合逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术,证明WTAP介导的RNA m^(6)A修饰对伴t(8;21)急性髓系白血病(AML)细胞中KDM4B基因的直接调控作用。方法:采用靶向WTAP或KDM4B基因的短发夹RNA(small hairpin RNA,shRNA)慢病毒载体沉默t(8;21)AML细胞系Kasumi-1和SKNO-1中WTAP或KDM4B基因表达,以转染随机打乱序列(scramble)的shRNA的细胞为对照。用超纯RNA提取试剂盒(DNaseⅠ)提取细胞RNA,Magna MeRIP^(TM)m^(6)A Kit试剂盒富集甲基化修饰片段,并通过RT-qPCR检测m^(6)A甲基化修饰的RNA区域;采用蛋白免疫印迹实验(Western blot)和逆转录实时定量PCR(RT-qPCR)技术检测细胞中WTAP、KDM4B蛋白和mRNA的表达水平。采用克隆形成实验检测细胞体外克隆形成能力。结果:沉默Kasumi-1细胞中WTAP的表达后,m^(6)A甲基化修饰在KDM4B mRNA 3’UTR的富集程度显著下降(P<0.01),沉默Kasumi-1和SKNO-1细胞中WTAP的表达可显著抑制KDM4B蛋白(P<0.001)和mRNA表达水平(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)、细胞体外克隆形成能力下降(Kasumi-1:P<0.001;SKNO-1:P<0.01)。结论:t(8;21)AML细胞系中,WTAP通过调控KDM4B基因mRNA 3’UTR的m^(6)A修饰调控KDM4B的表达,沉默KDM4B表达可以抑制t(8;21)AML细胞增殖。 展开更多
关键词 MeRIP-qPCR 急性髓系白血病 t(8 21)染色体易位 KDM4B RNA m^(6)a甲基修饰
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m^(6)A甲基化修饰调控肿瘤免疫的研究进展
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作者 周海霞 张靖 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期137-144,共8页
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是一种调控真核细胞基因表达最常见的修饰方式,影响RNA的剪接、降解、稳定性以及蛋白翻译等过程。研究表明m^(6)A甲基化修饰与肿瘤发生发展密切相关,在肿瘤免疫应答的相关过程中也发挥着重要的... N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是一种调控真核细胞基因表达最常见的修饰方式,影响RNA的剪接、降解、稳定性以及蛋白翻译等过程。研究表明m^(6)A甲基化修饰与肿瘤发生发展密切相关,在肿瘤免疫应答的相关过程中也发挥着重要的调控作用。m^(6)A修饰参与调节免疫细胞的分化、成熟过程以及相关的抗肿瘤免疫反应。在肿瘤微环境中,m^(6)A修饰也可影响免疫细胞的募集、活化和极化等,从而促进或抑制肿瘤细胞的增殖与转移,起到重塑肿瘤免疫微环境的重要作用。近年来肿瘤的免疫治疗逐渐应用于临床,如免疫检查点抑制剂治疗、过继性细胞免疫治疗等,都取得了较好的临床效果。通过靶向m^(6)A修饰来干预机体免疫系统,如通过小分子抑制剂靶向失调的m^(6)A调控因子、诱导免疫细胞重编程等,可提高抗肿瘤免疫反应,加强免疫细胞对肿瘤细胞的识别和杀伤能力。m^(6)A修饰是肿瘤免疫治疗的一个新方向,具有潜在的临床应用价值。该文围绕m^(6)A甲基化修饰对免疫细胞及肿瘤免疫应答的调控作用进行综述,探讨其免疫治疗的新思路。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基 肿瘤免疫 免疫治疗
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玉米赤霉烯酮对湖羊睾丸间质细胞毒性及m^(6)A甲基化修饰相关基因表达的影响 被引量:1
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作者 刘亮 苏晓彤 +4 位作者 李慧贤 胡康瑶 陆宏辉 许新松 万永杰 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期772-779,共8页
[目的]本文旨在探究玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEA)对湖羊睾丸间质细胞(leydig cells, LC)的毒性作用。[方法]用200μmol·L^(-1)ZEA处理湖羊LC 8 h,通过EdU法检测细胞增殖情况,RT-qPCR和Western blot分别检测与细胞增殖和凋亡、... [目的]本文旨在探究玉米赤霉烯酮(zearalenone, ZEA)对湖羊睾丸间质细胞(leydig cells, LC)的毒性作用。[方法]用200μmol·L^(-1)ZEA处理湖羊LC 8 h,通过EdU法检测细胞增殖情况,RT-qPCR和Western blot分别检测与细胞增殖和凋亡、氧化应激、m^(6)A甲基化修饰相关基因和蛋白的表达变化。[结果]与对照组相比,ZEA处理组LC活性和增殖数量极显著下降(P<0.01);细胞增殖相关基因pcna及其蛋白表达水平均极显著下降(P<0.01);促凋亡基因表达水平(bax、caspase3,P<0.01;tp53、caspase9,P<0.05)均显著升高,相对应蛋白表达水平(TP53、CASPASE9,P<0.01)极显著升高;抗凋亡基因bcl-2及蛋白表达水平显著降低(P<0.05);氧化应激相关基因相对表达水平(cat,P<0.05;gsh-px、sod2,P<0.01)显著或极显著上升,其相关蛋白表达水平(SOD2,P<0.01)极显著上升;m^(6)A相关基因alkbh5的相对表达水平显著降低(P<0.05),mettl3和ythdc1水平极显著升高(P<0.01),ythdf3水平显著升高(P<0.05)。[结论]ZEA可抑制湖羊LC增殖,促进湖羊LC凋亡,导致LC发生氧化损伤,产生毒性作用,且其毒性作用可能跟m^(6)A甲基化修饰相关。 展开更多
关键词 玉米赤霉烯酮 湖羊 睾丸间质细胞 增殖 凋亡 应激 m^(6)a甲基修饰
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m^(6)A RNA甲基化修饰相关酶的研究进展
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作者 钱晓芬 曾平(指导) +3 位作者 刘金富 陈财 范思奇 农焦 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1073-1084,共12页
N6-甲基腺苷(m^(6)A)RNA甲基化是RNA转录组中最广泛的修饰,也是调节各种生物学过程的重要机制,目前研究重点为其编码器、消码器和读码器。过去几年中,这些蛋白功能研究促进了研究者对m^(6)A调控和功能的认识。本文总结了m^(6)A相关酶的... N6-甲基腺苷(m^(6)A)RNA甲基化是RNA转录组中最广泛的修饰,也是调节各种生物学过程的重要机制,目前研究重点为其编码器、消码器和读码器。过去几年中,这些蛋白功能研究促进了研究者对m^(6)A调控和功能的认识。本文总结了m^(6)A相关酶的最新研究进展,并阐述了这些新发现如何重塑对m^(6)A在转录组中调控的理解,以及m^(6)A修饰对相关疾病诊疗的价值和意义。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基 编码器 消码器 读码器
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m^(6)A甲基化修饰在动脉粥样硬化中的作用
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作者 李胜昆 程道宾 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2023年第3期271-276,共6页
N6-甲基嘌呤(m^(6)A)是真核生物中最常见的转录后RNA修饰类型,涉及多种类型RNA。m^(6)A甲基化修饰是动态可逆的,主要由多种酶和蛋白进行调控,包括甲基转移酶、去甲基化酶和m^(6)A相关结合蛋白。动脉粥样硬化是心脑血管疾病的主要原因。... N6-甲基嘌呤(m^(6)A)是真核生物中最常见的转录后RNA修饰类型,涉及多种类型RNA。m^(6)A甲基化修饰是动态可逆的,主要由多种酶和蛋白进行调控,包括甲基转移酶、去甲基化酶和m^(6)A相关结合蛋白。动脉粥样硬化是心脑血管疾病的主要原因。近期研究发现m^(6)A甲基化修饰与动脉粥样硬化密切相关。该文总结了目前对m^(6)A甲基化修饰机制的认识,并阐述了与动脉粥样硬化相关细胞中m^(6)A甲基化修饰的机制及最新进展,为动脉粥样硬化的诊断和防治提供新靶点。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基修饰 甲基转移酶 甲基 m^(6)A结合蛋白 动脉粥样硬
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m^(6)A甲基化修饰在肿瘤免疫中的作用及干预策略
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作者 彭彦茜 易诚 +1 位作者 陶丽君 王红胜 《广州医药》 2023年第2期1-8,37,共9页
N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰是真核生物信使RNA中最丰富的表观遗传修饰,其失调会导致mRNA异常生物学行为如翻译和降解紊乱,从而调控肿瘤发生发展。近期研究表明m^(6)A在免疫调控过程中可发挥重要作用,其不仅可调... N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)修饰是真核生物信使RNA中最丰富的表观遗传修饰,其失调会导致mRNA异常生物学行为如翻译和降解紊乱,从而调控肿瘤发生发展。近期研究表明m^(6)A在免疫调控过程中可发挥重要作用,其不仅可调节免疫细胞的活化,还在肿瘤微环境中免疫应答发挥重要调控作用,从而影响免疫治疗效果。越来越多的证据表明m^(6)A修饰可能是肿瘤免疫治疗的重要潜在干预靶点。本文阐述了免疫细胞中m^(6)A修饰调控及其在肿瘤免疫微环境中相关调节作用,并进一步探讨了靶向m^(6)A调控蛋白在肿瘤免疫治疗中的干预策略及潜在治疗价值。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基 肿瘤免疫 肿瘤微环境 靶向治疗
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m^(6)A-RNA甲基化YTHDF1结合蛋白在胶质瘤中作用的研究进展
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作者 朱琳 于涛 +1 位作者 郑法康 龚海东 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第13期2512-2518,共7页
胶质瘤是最常见的原发性颅内恶性肿瘤,占颅脑恶性肿瘤的45%,目前临床对胶质瘤主要采取手术治疗,但其浸润生长、复发率高等特性导致其预后较差。目前RNA修饰尤其是m^(6)A甲基化是肿瘤研究的热点,随着高通量测序方法的不断进步,对转录表... 胶质瘤是最常见的原发性颅内恶性肿瘤,占颅脑恶性肿瘤的45%,目前临床对胶质瘤主要采取手术治疗,但其浸润生长、复发率高等特性导致其预后较差。目前RNA修饰尤其是m^(6)A甲基化是肿瘤研究的热点,随着高通量测序方法的不断进步,对转录表观遗传学的研究也在不断的深入。m^(6)A(N6-甲基腺苷)甲基化是真核细胞中最多见的修饰方式,尤其在信使RNA(message ribonucleic acid,mRNA)中。m^(6)A甲基化可以从RNA的转录、核输出、翻译、衰变等诸多方面影响RNA的代谢,参与生物体的胚胎发育,昼夜节律,应激反应,甚至肿瘤的发生,而YTHDF1是脑胶质瘤中表达最高的一种m^(6)A甲基化的识别蛋白,能够识别并诱导目标的翻译。本文将结合近期的研究进展,重点对m^(6)A结合蛋白YTHDF1的作用方式、生物学特性、胶质瘤的发展、现有的潜在影响等方面进行综述。 展开更多
关键词 YTHDF1 胶质瘤 m^(6)a甲基 肿瘤干细胞
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脊髓损伤后m^(6)A甲基化修饰在神经干细胞自发分化中的调控作用
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作者 徐徐 王泽坤 陈柏如 《同济大学学报(医学版)》 2023年第3期305-312,共8页
目的探讨脊髓损伤后mRNA m^(6)A甲基化修饰对神经干细胞自发分化的调控作用。方法8周龄C57小鼠构建脊髓钳夹损伤模型,采用后肢运动功能评分(basso mouse scale,BMS)评价小鼠脊髓钳夹损伤模型构建情况;脊髓组织冰冻切片免疫荧光染色检测... 目的探讨脊髓损伤后mRNA m^(6)A甲基化修饰对神经干细胞自发分化的调控作用。方法8周龄C57小鼠构建脊髓钳夹损伤模型,采用后肢运动功能评分(basso mouse scale,BMS)评价小鼠脊髓钳夹损伤模型构建情况;脊髓组织冰冻切片免疫荧光染色检测脊髓损伤1、3 d后,损伤位点周围神经干细胞的数量及m^(6)A甲基化水平;microRNA干扰技术敲低神经干细胞内的METTL14蛋白表达,并利用细胞免疫荧光检测神经干细胞自发分化后,神经元细胞、少突胶质细胞及星形胶质细胞数量;Western印迹法及Northern印迹法检测髓鞘碱性蛋白(myelin basic protein,MBP)与神经干细胞共培养后神经干细胞内METTL3、METTL14、FTO及ALKBH5蛋白表达情况及细胞内m^(6)A甲基化水平。结果BMS评分结果表明小鼠脊髓钳夹损伤模型构建成功。免疫蛋白印迹结果显示,脊髓损伤后组织内脊髓损伤后星形胶质细胞的细胞标志蛋白GFAP显著增加,神经元标志蛋白NeuN和少突胶质细胞标志蛋白MBP表达显著降低。组织免疫荧光结果表明,损伤早期受损位点周围神经干细胞标志蛋白NESTIN达量增加,但m^(6)A水平减少。细胞免疫荧光结果表明,m^(6)A甲基化水平降低可促进神经干细胞神经向星形胶质细胞的自发分化。免疫蛋白印迹结果显示,MBP处理神经干细胞可使细胞内METTL3/METTL14表达量及细胞整体m^(6)A甲基化水平降低。结论脊髓损伤后mRNA m^(6)A甲基化降低可促进神经干细胞向星形胶质细胞分化。 展开更多
关键词 脊髓损伤 m^(6)a甲基 神经干细胞 自发分
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m^(6)A相关基因在激素性股骨头坏死中的生物信息学分析
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作者 令狐熙涛 桂佳琦 +2 位作者 梁卓智 瓦庆德 黄帅 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第36期5811-5816,共6页
背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并... 背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并下载与激素性股骨头坏死相关的mRNA表达谱数据集(GSE123568),通过R软件对数据集进行差异基因筛选及GO功能、KEGG通路富集分析。识别差异基因中的m^(6)A差异表达基因(m^(6)A-DEGs)并对其进行GO功能与KEGG通路富集分析,比较m^(6)A-DEGs的表达量并分析它们之间的相关性。最后通过Cytoscape构建m^(6)A-DEGs的PPI互作网络及筛选核心基因。使用TargetScan,miRTarBase和miRBD数据库预测m^(6)A-DEGs相关的潜在miRNAs,同时使用ChIPBase及hTFtarget数据库预测7个核心基因潜在转录因子,然后分别构建m^(6)A-miRNA与转录因子m^(6)A调控网络。最后使用数据集GSE74089验证7个核心m^(6)A-DEGs的表达水平。结果与结论:①从数据集中共筛选出2460个差异表达的基因,其中1455个上调,1005个下调。②从数据集中筛选出了14个m^(6)A-DEGs,包括3个下调和11个上调基因,m^(6)A-DEGs在激素性股骨头坏死中的表达具有显著差异(P<0.05),Spearman分析表明它们之间具有一定相关性。③m^(6)A-DEGs的GO和KEGG富集分析主要集中在骨髓细胞分化与发育、免疫受体与细胞因子受体活性、破骨细胞分化、AMPK与白细胞介素17信号通路。④m^(6)A-DEGs前7个核心基因包括YTHDF3,YTHDF1,YTHDF2,ALKBH5,METTL3,HNRNPA2B1及HNRNPC,它们在miRTarBase,miRDB和TargetScan数据库中共有44个miRNA重叠,在ChIPBase及hTFtarget数据库中共有79个重叠转录因子。⑤在GSE74089数据集中有6个核心m^(6)A-DEGs的表达水平与GSE123568数据集一致。⑥结果证实,根据生物信息学方法筛选的7个m^(6)A-DEGs可能通过调控多个miRNA、转录因子和AMPK及白细胞介素17信号通路表达,进而影响激素性股骨头坏死中骨髓细胞分化发育与破骨细胞分化,为进一步深入研究激素性股骨头坏死的发病机制和靶向治疗提供了数据支持和研究方向。 展开更多
关键词 激素性股骨头坏死 m^(6)a甲基 微小RNA 转录因子 生物信息学 差异基因 基因调控网络 核心基因
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m^(6)A和miRNA协同调控北京鸭胚胎期骨骼肌发育的研究
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作者 李盈 郭旭 +1 位作者 蒋启程 顾丽红 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期470-481,共12页
[目的]试验旨在研究胚胎期miRNA和N6-甲基腺嘌呤(m^(6)A)在北京鸭胸肌发育中的调控作用,以期为了解北京鸭胸肌发育规律奠定基础。[方法]收集E13和E27两个阶段的北京鸭胚胎胸肌,利用甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(MeRIP-Seq)和小RN... [目的]试验旨在研究胚胎期miRNA和N6-甲基腺嘌呤(m^(6)A)在北京鸭胸肌发育中的调控作用,以期为了解北京鸭胸肌发育规律奠定基础。[方法]收集E13和E27两个阶段的北京鸭胚胎胸肌,利用甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(MeRIP-Seq)和小RNA高通量测序(miRNA-Seq)来鉴定在北京鸭胚胎胸肌细胞分化过程中可能存在的受m^(6)A调控的相关差异基因,再联合miRNA及其靶基因分析其功能。[结果]miRNA-Seq结果显示,差异显著miRNAs有181个,通过靶基因预测到11 176个靶标,包括m6A相关基因以及肌肉发育相关基因。MeRIP-Seq在E13和E27组分别检测到14 344和14 016个m^(6)A峰,分别映射到8 248和7 763个已知基因。E13与E27时期m6A共3 240个,映射到2 767个差异甲基化基因(differentially methylated genes, DMGs)。DMGs的GO和KEGG分析显示,DMGs主要富集于肌肉发育、脂肪沉积相关通路,同时也富集到很多和肌肉发育相关的基因,如MTPN、MYF6和MYF5。miRNA-Seq检测到5 556个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),GO和KEGG通路分析结果表明,这些DEGs在Wnt信号通路、代谢途径、脂肪酸显著富集,提示DEGs可能参与了脂肪细胞分化和脂肪代谢过程。miRNA-Seq和m6A-Seq关联分析显示,共检测到1 517个差异甲基化和表达相关基因(differential expression and methylation genes, DEMGs),对这些DEMGs的GO和KEGG分析显示,DEMGs主要富集在肌肉发育相关通路中。[结论]m^(6)A甲基化修饰和miRNA对北京鸭骨骼肌发育和脂肪沉积有重要影响。 展开更多
关键词 MIRNA m^(6)a甲基修饰 高通量测序 北京鸭
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m^(6)A甲基化修饰及其影响动物脂肪生成的分子机制研究进展 被引量:5
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作者 宋兴亚 彭巍 +5 位作者 刘贤 姚治 张子敬 雷初朝 王二耀 黄永震 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第10期53-58,共6页
N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是一种动态的由甲基转移酶复合体、去甲基化酶以及结合蛋白作用产生的一种在生物体大量组织中存在的RNA表观遗传修饰,在多种生命过程中起到重要的调控作用。脂肪作为影响畜禽肉质评定的关... N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)是一种动态的由甲基转移酶复合体、去甲基化酶以及结合蛋白作用产生的一种在生物体大量组织中存在的RNA表观遗传修饰,在多种生命过程中起到重要的调控作用。脂肪作为影响畜禽肉质评定的关键因素之一,其对于畜牧业的重要性不言而喻。本文概述了m^(6)A甲基化修饰和脂肪生成的基本过程,并总结了m^(6)A甲基化修饰影响脂肪生成的机制,以期为研究动物脂肪调控提供新思路。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基修饰 动物 脂肪生成 分子机制
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m^(6)A甲基化在病毒感染中的作用研究进展 被引量:3
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作者 李晓晗 陈婧 +1 位作者 钟翔 周斌 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期812-822,共11页
RNA分子上存在着多种修饰方式,如5-甲基胞嘧啶(m 5C)、6-甲基腺嘌呤(m^(6)A)、1-甲基腺嘌呤(m 1A)和假尿嘧啶(Ψ)等。而其中RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生的甲基化修饰,即m^(6)A(N 6-methyladenosine)是一种非常重要的表观遗传修饰方... RNA分子上存在着多种修饰方式,如5-甲基胞嘧啶(m 5C)、6-甲基腺嘌呤(m^(6)A)、1-甲基腺嘌呤(m 1A)和假尿嘧啶(Ψ)等。而其中RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生的甲基化修饰,即m^(6)A(N 6-methyladenosine)是一种非常重要的表观遗传修饰方式,在干细胞命运决定、肌肉发育、精子形成以及肿瘤发生中都起着重要的作用。在40多年前已经发现病毒RNA中含有m^(6)A修饰,m^(6)A功能的行使主要在甲基转移酶(编码器“Writers”)、去甲基化酶(消码器“Erasers”)和结合蛋白(读码器“Readers”)的参与下进行,他们共同调控m^(6)A的发生。不同种类的病毒,在不同的细胞和组织中产生不同的m^(6)A修饰。而m^(6)A修饰对病毒和宿主RNA的调控机制不尽相同。m^(6)A修饰对宿主的影响在一定程度上与宿主的免疫系统有关。MeRIP-Northern blot和MeRIP-seq等技术的发展帮助加深对该领域的研究。本文综述了m^(6)A甲基化在甲型流感病毒(influenza A virus,IAV)、人类免疫缺陷病毒1型(Human immunodeficiency virus 1,HIV-1)、猴空泡病毒(Simian vacuolating virus 40/Simian virus 40,SV40)、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)、丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)、乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)、肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)、呼吸道合胞病毒(Rous sarcoma virus,RSV)和植物病毒感染中的作用,探讨该甲基化修饰在病毒与宿主相互作用中扮演的重要角色。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基 病毒 复制 相互作用
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皮肤疾病中m^(6)A甲基化修饰的作用研究进展 被引量:1
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作者 张喆 李舒丽 李春英 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期381-384,共4页
目前已知mRNA上存在>100种不同形式的表观遗传修饰方式,这些化学修饰能够调控基因产物表达,影响多种生物学过程。其中m^(6)A甲基化修饰是真核生物mRNA上最普遍的转录后修饰方式,广泛调控mRNA的剪切、加工、出核,翻译及降解等过程,近... 目前已知mRNA上存在>100种不同形式的表观遗传修饰方式,这些化学修饰能够调控基因产物表达,影响多种生物学过程。其中m^(6)A甲基化修饰是真核生物mRNA上最普遍的转录后修饰方式,广泛调控mRNA的剪切、加工、出核,翻译及降解等过程,近些年越来越多研究证实异常m^(6)A甲基化与皮肤肿瘤、病毒感染、系统性红斑狼疮、银屑病及皮肤光老化等多种皮肤疾病密切相关。该文主要综述m^(6)A甲基化修饰概念、作用机制以及在相关皮肤疾病中研究进展。 展开更多
关键词 表观遗传修饰 m^(6)a甲基修饰 皮肤肿瘤 皮肤免疫
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m^(6)A甲基化修饰与消化道恶性肿瘤关系的研究进展 被引量:3
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作者 张璐瑶 汪丽钰 +1 位作者 陈乾 时建明 《医学综述》 CAS 2021年第9期1753-1758,共6页
N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)甲基化修饰是RNA分子上一种最普遍的表观遗传修饰,该修饰过程可逆,多种酶参与了m^(6)A甲基化修饰的动态过程。随着高通量检测技术的发展,目前用于检测m^(6)A甲基化修饰位点的方法较多,m^(6)A甲基化修饰可导致... N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)甲基化修饰是RNA分子上一种最普遍的表观遗传修饰,该修饰过程可逆,多种酶参与了m^(6)A甲基化修饰的动态过程。随着高通量检测技术的发展,目前用于检测m^(6)A甲基化修饰位点的方法较多,m^(6)A甲基化修饰可导致多种恶性肿瘤的发生、发展、侵袭,而相关调节剂或抑制剂可能为恶性肿瘤的治疗提供潜在策略。如胰腺癌细胞中甲基转移酶样蛋白(METTL)3的表达明显增多,通过敲除METTL3可提高患者对放化疗的敏感性。同时,肥胖相关蛋白抑制剂甲氯芬酸可以增加m 6A甲基化修饰,进而达到抑制肿瘤进展的目的。 展开更多
关键词 道恶性肿瘤 m^(6)a甲基修饰 甲基转移酶样蛋白3 肿瘤发生 肿瘤治疗
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m^(6)A甲基化修饰在肝癌中的研究进展 被引量:1
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作者 金松 朱小年 谭盛葵 《世界华人消化杂志》 CAS 2021年第13期720-725,共6页
RNA修饰在许多生物学功能中起到至关重要的作用,其调控异常与癌症的进展有关.N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)甲基化修饰是最普遍最重要的RNA修饰,在几乎所有重要的生物过程中发挥关键作用.m^(6)A甲基化是由甲基转移酶(m^(6)A... RNA修饰在许多生物学功能中起到至关重要的作用,其调控异常与癌症的进展有关.N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)甲基化修饰是最普遍最重要的RNA修饰,在几乎所有重要的生物过程中发挥关键作用.m^(6)A甲基化是由甲基转移酶(m^(6)A writers)、去甲基化酶(m^(6)A erasers)和m^(6)A识别蛋白(m^(6)A readers)介导的动态可逆过程.本文主要对m^(6)A甲基化修饰及其相关调节蛋白进行综述,并重点介绍m^(6)A甲基化在肝癌发生发展过程中的作用. 展开更多
关键词 RNA修饰 m^(6)a甲基 肝细胞肝癌
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RNA m^(6)A甲基化修饰在代谢综合征中的研究进展 被引量:1
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作者 叶棣文 马万山 逯素梅 《临床检验杂志》 CAS 2022年第9期691-694,共4页
代谢综合征是以肥胖、糖尿病、高血压以及心脑血管疾病聚集发病的临床症候群。近年来,随着人民生活水平的逐渐提高,代谢综合征的发病人数也在逐年增长,寻找新的诊断和治疗代谢综合征的方法已成为医学研究领域亟待解决的问题之一。N6-甲... 代谢综合征是以肥胖、糖尿病、高血压以及心脑血管疾病聚集发病的临床症候群。近年来,随着人民生活水平的逐渐提高,代谢综合征的发病人数也在逐年增长,寻找新的诊断和治疗代谢综合征的方法已成为医学研究领域亟待解决的问题之一。N6-甲基腺嘌呤甲基化(m^(6)A)作为常见的表观遗传修饰,其动态化的可逆修饰影响着被修饰基因的表达,与机体代谢调控关系密切。该文总结了RNA m^(6)A修饰在代谢综合征中的作用及调控机制的研究进展,为m^(6)A修饰及相关的甲基化酶、去甲基化酶成为诊断和治疗代谢综合征的新靶点提供理论依据。 展开更多
关键词 代谢综合征 m^(6)a甲基修饰 表观转录组学
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m^(6)A甲基化在肿瘤中修饰非编码RNA的最新研究进展
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作者 易佑财 张靖 +1 位作者 陈晓宇 朱金水 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第10期1825-1828,共4页
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)在细胞分化、血管生成、免疫应答、炎症反应以及肿瘤发生发展中具有重要作用。m^(6)A(N6-methyladenosine)甲基化是真核生物中最常见的RNA修饰方式之一,主要见于信使RNA(messenger RNA,mRNA)。m^(6)A甲... 非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)在细胞分化、血管生成、免疫应答、炎症反应以及肿瘤发生发展中具有重要作用。m^(6)A(N6-methyladenosine)甲基化是真核生物中最常见的RNA修饰方式之一,主要见于信使RNA(messenger RNA,mRNA)。m^(6)A甲基化修饰主要有三种酶参与完成,包括甲基转移酶、去甲基化酶和甲基化识别酶,并且在昼夜节律调控、基因表达、细胞分化、胚胎发育、应激反应及肿瘤发生中发挥作用。目前已有研究证实m^(6)A甲基化通过调控ncRNAs在肿瘤生长、侵袭和转移中具有重要作用。本文将对m^(6)A甲基化在肿瘤中修饰ncRNAs的最新研究进展进行综述。 展开更多
关键词 m^(6)a甲基 非编码RNA 肿瘤
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环状RNA m^(6)A甲基化修饰的生物功能研究进展
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作者 李雨函 曲俊彦 +1 位作者 王华 申红星 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2021年第6期479-483,共5页
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是存在于真核生物中最普遍的RNA修饰,可以调节RNA转录、出核和翻译等生理过程。环状RNA(circRNA)是一类单链共价闭合的非编码RNA分子,相对于线性RNA而言,其更稳定,并保持高度同源性。研究表明,m^... N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是存在于真核生物中最普遍的RNA修饰,可以调节RNA转录、出核和翻译等生理过程。环状RNA(circRNA)是一类单链共价闭合的非编码RNA分子,相对于线性RNA而言,其更稳定,并保持高度同源性。研究表明,m^(6)A在circRNA的生物功能发挥中起不可或缺的作用。本文针对m^(6)A修饰的相关蛋白及其对circRNA翻译及出核定位等功能的影响,以及m^(6)A修饰的circRNA参与先天性免疫调节过程的机制进展作一综述。 展开更多
关键词 环状RNA m^(6)a甲基 翻译 先天性免疫 m^(6)A修饰的环状RNA 癌症 内部核糖体进入位点
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